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一種β?甘露聚糖酶工程菌的篩選方法與流程

文檔序號(hào):11380148閱讀:944來(lái)源:國(guó)知局

本發(fā)明涉及一種β-甘露聚糖酶突變體的原位快速半定量篩選方法,屬于生物工程領(lǐng)域。



背景技術(shù):

β-甘露聚糖酶(β-mannanase,ec3.2.1.78)屬于半纖維素酶,可以在β-1,4-d-甘露聚糖分子的主鏈內(nèi)部隨機(jī)切割β-1,4-d-甘露糖苷鍵,從而產(chǎn)生不同長(zhǎng)度的低聚甘露糖。低聚甘露糖作為添加劑在動(dòng)物飼料行業(yè)有廣泛的應(yīng)用,也是膳食纖維的重要成分,此外在造紙、紡織業(yè)、醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、食品及石油開(kāi)采等領(lǐng)域也具有重要的應(yīng)用價(jià)值。

大腸桿菌表達(dá)β-甘露聚糖酶具表達(dá)量高、培養(yǎng)周期短、成本低等優(yōu)勢(shì)。但由于重組的β-甘露聚糖酶多為胞內(nèi)表達(dá),而底物甘露聚糖屬于大分子化合物,無(wú)法自由進(jìn)出大腸桿菌細(xì)胞壁,酶活的檢測(cè)通常需要對(duì)細(xì)胞進(jìn)行繁瑣、耗時(shí)、耗能的破壁處理。特別的,當(dāng)對(duì)β-甘露聚糖酶引入隨機(jī)突變,而這種突變庫(kù)通常達(dá)到103以上數(shù)量級(jí),對(duì)每個(gè)突變體逐一進(jìn)行細(xì)胞破壁、重組酶純化、酶活檢測(cè),檢測(cè)周期以及人力、物力需要都非常巨大,無(wú)法高效的實(shí)現(xiàn)突變體庫(kù)的大規(guī)模篩選。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

本發(fā)明的目的是提供一種基于大腸桿菌重組表達(dá)β-甘露聚糖酶酶活的半定量篩選方法,該方法無(wú)需細(xì)胞破壁、蛋白純化,且可以批量處理,大大縮短了突變體的初篩時(shí)間,提高了效率,且操作簡(jiǎn)便、快速,成本低廉,有利于β-甘露聚糖酶突變體庫(kù)的高效篩選獲得候選突變體。

為實(shí)現(xiàn)發(fā)明目的采用如下技術(shù)方案:

一種β-甘露聚糖酶工程菌的篩選方法,包括如下步驟:

(1)將β-甘露聚糖酶的表達(dá)菌在含有臺(tái)酚藍(lán)的kt平板上培養(yǎng),直至平板上產(chǎn)生水解圈;

(2)測(cè)量水解圈直徑與微生物菌落直徑,以二者大小的比值作為β-甘露聚糖酶的酶活指數(shù)(ei),該指數(shù)與酶活正相關(guān)。

步驟(1)所述的培養(yǎng)包括三個(gè)階段:第一階段為37±2℃保溫6-12h;第二階段為25±2℃保溫1-3h;第三階段為30-60℃保溫8-20h。

所述第一階段為37℃保溫10h。

所述第二階段為25℃保溫2h。

所述第三階段的溫度為37℃~50℃。

所述第三階段的保溫時(shí)間為12h。

所述kt平板的原料組分為:1-2%蛋白胨、0.5-1%酵母提取物、1%氯化鈉、1-3%瓊脂和0.3-1%魔芋膠溶液。

所述kt平板的配制:將上述原料混合后115℃條件下高壓滅菌20min,冷卻后加入預(yù)先配制好的1%臺(tái)酚藍(lán)溶液至終濃度為0.02-0.05%。

所述β-甘露聚糖酶表達(dá)菌,其宿主菌為e.colibl21(de3)或e.colibl21。

所述β-甘露聚糖酶表達(dá)菌,其表達(dá)載體為pet30(a)。

本發(fā)明的基本原理是臺(tái)酚藍(lán)可結(jié)合甘露聚糖將其染成藍(lán)色,而β-甘露聚糖酶具有降解甘露聚糖的能力,從而在kt平板上產(chǎn)生透明水解圈,且透明圈直徑/微生物菌落直徑的比值(ei值)與酶活力正相關(guān)。

與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有如下有益效果:

(1)無(wú)需對(duì)工程菌裂解,即可實(shí)現(xiàn)胞內(nèi)β-甘露聚糖酶酶活的快速檢測(cè)。所需步驟簡(jiǎn)單,耗時(shí)短,成本低廉,且利于高通量篩選。

(2)通過(guò)透明圈直徑/微生物菌落直徑的比值(ei值)的檢測(cè),可以半定量檢測(cè)工程菌內(nèi)β-甘露聚糖酶酶活,有利于該酶突變體的高通量篩選的展開(kāi)。

附圖說(shuō)明

圖1為β-甘露聚糖酶胞內(nèi)產(chǎn)生菌的篩選平板的應(yīng)用圖。a-c:平板在37℃培養(yǎng)10h,后繼續(xù)在25℃培養(yǎng)2h拍照;d-f:將a-c分別對(duì)應(yīng)轉(zhuǎn)移至50、37和25℃培養(yǎng)12h。其中“0”表示的是e.colibl21(de3),1、2、3、4、5標(biāo)號(hào)表示e.colibl21(de3)/pet30-man25。

具體實(shí)施方式

下面結(jié)合具體實(shí)施例對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步具體詳細(xì)描述,但本發(fā)明的實(shí)施方式不限于此,對(duì)于未特別注明的工藝參數(shù),可參照常規(guī)技術(shù)進(jìn)行。

實(shí)施例1

一、重組β-甘露聚糖酶活性初步原位驗(yàn)證

首先配制篩選用kt平板。配制1%臺(tái)酚藍(lán)溶液,過(guò)濾除菌以備用。配制含1%蛋白胨、0.5%酵母提取物、1%氯化鈉、1.5%瓊脂和0.5%魔芋膠溶液,于115℃滅菌20分鐘后加入一定量的1%臺(tái)酚藍(lán)溶液至終濃度為0.03%。每20ml培養(yǎng)基鋪制一塊90mm平板。臺(tái)酚藍(lán)與魔芋膠可以緊密結(jié)合,配制好的平板呈均勻藍(lán)色。

用無(wú)菌牙簽挑取本實(shí)驗(yàn)室保存的β-甘露聚糖酶表達(dá)菌株e.colibl21(de3)/pet30-man25與e.colibl21(de3)到新制備的kt平板上。其中,e.colibl21(de3)作為對(duì)照組,β-甘露聚糖酶表達(dá)菌株e.colibl21(de3)/pet30-man25是將β-甘露聚糖酶編碼基因插入到pet30a表達(dá)載體ndei和xhoi酶切位點(diǎn)中構(gòu)建獲得。

按照以下方案進(jìn)行β-甘露聚糖酶的表達(dá)和活性半定量篩選:

1.菌體培養(yǎng)。37℃培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)10h。

2.β-甘露聚糖酶表達(dá)。25℃培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)2h。

3.β-甘露聚糖酶催化反應(yīng)。將kt平板分別轉(zhuǎn)移到25、37或50℃培養(yǎng)箱內(nèi),繼續(xù)培養(yǎng)12h。

此時(shí)平板上呈現(xiàn)出不同大小、亮度的水解圈(圖1)。結(jié)果表明,在50℃條件下進(jìn)行酶解反應(yīng),水解圈直徑最大、最明顯。后續(xù)酶活半定量檢測(cè)將采用此條件進(jìn)行。

二、重組β-甘露聚糖酶紫外誘變

取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)中期的5mle.colibl21(de3)/pet30-man25菌液,添加至無(wú)菌培養(yǎng)皿中,將培養(yǎng)皿置于磁力攪拌器上,調(diào)整距離為30cm,紫外燈照射劑量為60s。照射的同時(shí)進(jìn)行磁力攪拌。隨后將菌液繼續(xù)在37℃條件下繼續(xù)培養(yǎng)6-8h后,涂布在lb/kan平板上,于37℃培養(yǎng)過(guò)夜,作為原始突變庫(kù)。最終共分離獲得167個(gè)單菌落。

三、重組β-甘露聚糖酶突變體的透明圈法在突變株篩選中的應(yīng)用

分別挑取步驟二所得的單克隆菌落至kt平板上,其中約9株透明圈較大。分別用游標(biāo)卡尺測(cè)定菌落直徑和透明圈直徑,并計(jì)算ei值。

測(cè)定結(jié)果如表1所示。其中uv15,uv22和uv101的ei值較大,選擇這3個(gè)菌株為優(yōu)良突變株進(jìn)行β-甘露聚糖酶酶活的驗(yàn)證測(cè)定。

表1e.colibl21(de3)/pet30-man25突變株臺(tái)酚藍(lán)法透明水解圈測(cè)定

將原始菌株和uv15,uv22和uv101四個(gè)菌株,按照常規(guī)大腸桿菌重組表達(dá)外源酶方法進(jìn)行蛋白的誘導(dǎo)表達(dá),對(duì)其進(jìn)行β-甘露聚糖酶酶活力測(cè)定結(jié)果見(jiàn)表2。透明圈大的突變株,其在液體培養(yǎng)基中β-甘露聚糖酶酶活也高,其中uv101的β-甘露聚糖酶酶活較原始菌株提高了1.9倍。

表2突變菌株β-甘露聚糖酶酶活測(cè)定

上述實(shí)施例為本發(fā)明較佳的實(shí)施方式,但本發(fā)明的實(shí)施方式并不受上述實(shí)施例的限制,其他的任何未背離本發(fā)明的精神實(shí)質(zhì)與原理下所作的改變、修飾、替代、組合、簡(jiǎn)化,均應(yīng)為等效的置換方式,都包含在本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。

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<110>華南理工大學(xué)

<120>一種β-甘露聚糖酶工程菌的篩選方法

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