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一種用于多種克隆策略并具有表達(dá)功能的質(zhì)粒載體及其構(gòu)建方法與流程

文檔序號(hào):11510538閱讀:2032來(lái)源:國(guó)知局
一種用于多種克隆策略并具有表達(dá)功能的質(zhì)粒載體及其構(gòu)建方法與流程

本發(fā)明涉及基因工程領(lǐng)域,具體的說(shuō)是一種具有廣泛的應(yīng)用的適用于多種克隆策略并具有表達(dá)功能的質(zhì)粒載體及其構(gòu)建方法。



背景技術(shù):

基因克隆是分子生物學(xué)的核心技術(shù),是研究基因結(jié)構(gòu)和功能的基礎(chǔ)??寺》椒煞譃閮深?lèi):連接酶依賴(lài)性克隆和連接酶非依賴(lài)性克隆。其中,連接酶依賴(lài)性克隆方法主要有三種,包括:粘性末端連接、平末端連接和ta克隆。近些年,各種連接酶非依賴(lài)性克隆方法也得到快速發(fā)展,比如:gateway、lic、user、slic、pipe、cpec、oec、fastcloning、slice和重組酶克隆等技術(shù)(yaos,hartdj,any.recentadvancesinuniversaltacloningmethodsforuseinfunctionstudies.proteinengdessel.2016;1-6.)。盡管連接酶非依賴(lài)性克隆方法有很多成功的應(yīng)用實(shí)例,但是仍然不能完全替代連接酶依賴(lài)性克隆方法成為主要的克隆策略。

連接酶依賴(lài)性克隆中效率最高的是粘性末端連接,該方法也是目前使用最為廣泛的分子克隆策略。但在某些情況下,該方法無(wú)法獲取合適的限制性酶切位點(diǎn),而這無(wú)疑增加了克隆的難度。相對(duì)而言,平末端產(chǎn)物比較容易獲得(比如通過(guò)酶切或者pcr獲得),兩條具有平末端的dna序列可以通過(guò)連接酶連接起來(lái)。平末端連接也是一種有效的連接方式,但是其連接效率比粘性末端連接要低。ta克隆技術(shù)(tacloning)利用taq聚合酶的末端轉(zhuǎn)移酶活性,可在pcr產(chǎn)物的3'端加上一個(gè)非模板依賴(lài)堿基“a”。而ta克隆載體(即t載體)的3'端有一個(gè)凸出的“t”,可以與上述pcr產(chǎn)物的3'-“a”互補(bǔ)配對(duì),實(shí)現(xiàn)ta克隆。ta克隆是目前克隆pcr產(chǎn)物最簡(jiǎn)便、快捷的方法之一。該方法不需要合適的酶切位點(diǎn),可用于克隆未知序列的dna片段,并且具有令人滿意的克隆效率。目前,用于ta克隆的載體(也就是t載體)的制備方法常見(jiàn)的有兩種。第一種方法是利用taq酶不依賴(lài)模板的末端轉(zhuǎn)移酶活性,將單個(gè)脫氧胸腺核苷酸(dttp)添加到線狀載體3'端(marchukd,drummm,saulinoa,collinsfs.constructionoft-vectors,arapidandgeneralsystemfordirectcloningofunmodifiedpcrproducts.nucleicacidsres.1991;19(5):1154.)。第二種方法是在質(zhì)粒載體的多克隆位點(diǎn)中引入特定的酶切位點(diǎn),用相應(yīng)的內(nèi)切酶酶切產(chǎn)生3'端具有單個(gè)t突出的線性t載體。前一種方法在制備t載體時(shí),會(huì)出現(xiàn)加尾效率較低和加尾過(guò)程中線性質(zhì)粒兩端的序列有時(shí)會(huì)被部分刪除等問(wèn)題(shumans.novelapproachtomolecularcloningandpolynucleotidesynthesisusingvacciniadnatopoisomerase.jbiolchem.1994dec23;269(51):32678-32684.)。與第一種方法相比,第二種方法更高效、更快捷并且更穩(wěn)定。

在連接酶非依賴(lài)性克隆策略中,基于重組酶的克隆方法是最近興起的,也是目前應(yīng)用最為廣泛的一種方法之一。采用該方法,插入片段和載體的分子末端僅需要15-20bp的重疊區(qū),即可在重組酶的作用下發(fā)生體外同源重組,然后轉(zhuǎn)化進(jìn)大腸桿菌中實(shí)現(xiàn)分子克隆。因此,采用重組酶克隆不需要尋找合適的限制性內(nèi)切酶位點(diǎn),不需要連接酶的作用,就可以實(shí)現(xiàn)高效的定向克隆。目前,市場(chǎng)上已經(jīng)有很多商業(yè)化試劑盒可用于基于重組酶的分子克隆。

盡管上述克隆方法都有很多成功的例子,但是無(wú)論使用哪種方法,在載體制備和克隆過(guò)程中都存在潛在的問(wèn)題:

1)現(xiàn)有的載體一般只適用于一種或者少數(shù)幾種克隆策略,使得在克隆方法的選擇上缺乏靈活性。2)在現(xiàn)有的克隆方法中,在載體的制備過(guò)程中,部分酶切的前載體混雜在載體中,會(huì)導(dǎo)致非重組轉(zhuǎn)化子的本底過(guò)高(harrisonj,molloypl,clarksj.directcloningofpolymerasechainreactionproductsinanxcmit-vector.analbiochem.1994;216(1):235-236.)。而在制備載體的過(guò)程中,雖然可以通過(guò)電泳和膠回收的方法幫助去除這些前載體污染,但是效果往往不夠理想,并且顯著增加了工作量。3)很多載體只適用于克隆,而實(shí)現(xiàn)插入基因的表達(dá)和純化則需要亞克隆到表達(dá)載體上,這無(wú)疑增加了工作量。4)目前絕大多數(shù)克隆載體的大小都在3kb甚至5kb以上。通常情況下,大片段的克隆效率較低。

綜上所述,現(xiàn)急需一種具有廣泛的應(yīng)用前景、適用于多種克隆策略并具有表達(dá)功能的質(zhì)粒載體及其構(gòu)建方法。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

本發(fā)明的目的在于提供一種具有廣泛的應(yīng)用前景、適用于多種克隆策略并具有表達(dá)功能的質(zhì)粒載體及其構(gòu)建方法。

為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用技術(shù)方案為:

一種用于多種克隆策略并具有表達(dá)功能的質(zhì)粒載體,載體包括啟動(dòng)子和終止子,載體為閉合環(huán)狀雙鏈dna,含有兩個(gè)能夠識(shí)別多種克隆策略的多克隆位點(diǎn)區(qū),兩個(gè)多克隆位點(diǎn)區(qū)之間為毒性蛋白標(biāo)記ccdb基因;其中,所述多克隆位點(diǎn)區(qū)之一(mcs-1)中的位點(diǎn)為bamhi、spei、stui、sali和ahdi位點(diǎn);另一多克隆位點(diǎn)區(qū)(mcs-2)中位點(diǎn)為sali、ahdi、stui、ncoi、saci和psti位點(diǎn)。

所述載體還包括抗性基因序列、pmb1復(fù)制子和his-tag編碼序列。

所述啟動(dòng)子為t7啟動(dòng)子,終止子為t7終止子。

所述載體為seqidno:1中所示的堿基序列;載體中所示的dna功能區(qū):特殊設(shè)計(jì)的多克隆位點(diǎn)區(qū)的stui位點(diǎn)用于制備平末端載體,進(jìn)行平末端克隆;ahdi位點(diǎn)用于制備t載體,進(jìn)行ta克??;bamhi、spei、sali、ncoi、saci和psti位點(diǎn)用于制備粘性末端載體,進(jìn)行粘性末端克隆;所有多克隆位點(diǎn)區(qū)的位點(diǎn)都可以用于制備線性片段,進(jìn)行重組酶克??;t7promoter和t7terminator使該質(zhì)粒具有蛋白表達(dá)功能;his-tag區(qū)使得表達(dá)后的蛋白能被鎳柱純化,而tev位點(diǎn)則可以將純化蛋白中的組氨酸尾巴從蛋白中切掉;ccdb基因序列編碼毒性蛋白,作為克隆過(guò)程的負(fù)篩選標(biāo)記,確??寺](méi)有假陽(yáng)性。

一種用于多種克隆策略并具有表達(dá)功能的質(zhì)粒載體的構(gòu)建方法,

1)以質(zhì)粒pyum6002為模板,bamhi-t-for和psti-t-rev為上下游引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物待用;bamhi-t-for:5’-tcgcggatcccccctgaaaatacaaattctcggtagttgg-3’和psti-t-rev:5’-tcatctgcagttggctgctgccaccgctgagcaataac-3’;

2)以質(zhì)粒phiskan5為模板,ccdb-for和ccdb-rev為上下游引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物待用;ccdb-for:5’-cgcggatccactagtaggcctgtcgacggtcagtccggcttactaaaagccagataacagtatgcg-3’和ccdb-rev:5’-catctgcaggagctcccatggaggcctgacggtcagtcgactggctgtgtataagggagcctgac-3’;

3)將步驟1)和2)獲得兩個(gè)pcr產(chǎn)物經(jīng)pcr純化后,同時(shí)用bamhi和psti雙酶切,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳后切膠,回收酶切產(chǎn)物;

4)將步驟3)得到的兩個(gè)片段于連接體系內(nèi)在室溫下進(jìn)行連接,而后轉(zhuǎn)化db3.1菌株,再經(jīng)抗性篩選即得質(zhì)粒載體pany1。

所述連接體系為含175ut4dna連接酶(takara),1×連接buffer,約30ng酶切產(chǎn)物(步驟3)得到的兩個(gè)片段)。

與現(xiàn)有的克隆和表達(dá)質(zhì)粒相比,pany1具有以下顯著優(yōu)勢(shì):

1)國(guó)內(nèi)外現(xiàn)有的載體一般只適用于一種或者少數(shù)幾種克隆策略,使得在克隆方法的選擇上缺乏靈活性。pany1由于該載體具有特別設(shè)計(jì)的多克隆位點(diǎn)區(qū),可以同時(shí)滿足平末端,粘性末端連接,ta克隆和重組酶克隆的需要。

2)在國(guó)內(nèi)外現(xiàn)有的克隆方法中,在載體的制備過(guò)程中,部分酶切的前載體混雜在載體中,會(huì)導(dǎo)致非重組轉(zhuǎn)化子的本底過(guò)高。而在制備載體的過(guò)程中,雖然可以通過(guò)電泳和膠回收的方法幫助去除這些前載體污染,但是效果往往不夠理想,并且顯著增加了工作量。而pany1在多克隆位點(diǎn)間隔區(qū)引入了毒蛋白基因ccdb。這樣,在載體制備過(guò)程中不需要膠回收等復(fù)雜步驟,就可以徹底清除前載體污染,實(shí)現(xiàn)零背景克隆。

3)目前國(guó)內(nèi)外多數(shù)克隆載體只適用于克隆,而實(shí)現(xiàn)插入基因的表達(dá)則需要亞克隆到表達(dá)載體上,這無(wú)疑增加了工作量。因此,既有克隆功能,又具有表達(dá)功能的載體將具有顯著的優(yōu)勢(shì)。而pany1包含本實(shí)驗(yàn)室自主合成的蛋白表達(dá)原件和組氨酸標(biāo)簽his-tag,因此既可以進(jìn)行分子克隆,又可以對(duì)克隆的片段進(jìn)行表達(dá)和純化。

4)目前國(guó)內(nèi)外絕大多數(shù)克隆載體的大小都在3kb甚至5kb以上。通常情況下,大片段的克隆效率較低。而pany1的載體部分小于2kb,使得該載體在克隆的過(guò)程中效率顯著優(yōu)于現(xiàn)在的克隆載體。

附圖說(shuō)明

圖1為本發(fā)明實(shí)施例提供的pany1質(zhì)粒圖譜及其功能區(qū)示意圖,其中a為pany1質(zhì)粒的圖譜;b為pany1質(zhì)粒的功能區(qū);其中histag:組氨酸尾巴;t7promotor:t7啟動(dòng)子;pmb1replicon:大腸桿菌pmb1型復(fù)制子;kana:卡那霉素抗性蛋白;t7terminator:t7終止子;mcs-1:多克隆位點(diǎn)1;mcs2:多克隆位點(diǎn)2;tev:tev酶切位點(diǎn);ccdb:編碼ccdb毒蛋白的基因序列,ccdb蛋白通過(guò)干擾大腸桿菌的dna促旋酶,抑制大多數(shù)大腸桿菌(如jm109)的生長(zhǎng)增殖,但是不抑制某些特殊大腸桿菌菌株(如db3.1)的生長(zhǎng)繁殖。

圖2為本發(fā)明實(shí)施例提供的pany1雙酶切(bamhi,psti雙酶切)電泳圖(m:dnaladder;1-5:pany1雙酶切)。

圖3為本發(fā)明實(shí)施例提供的pany1的ahdi酶切電泳圖(m:dnaladder;1:pany1酶切)。

圖4為本發(fā)明實(shí)施例提供的pany1-xynii雙酶切(bamhi,ecori雙酶切)電泳圖(m:dnaladder;1:pany1-xynii雙酶切)。

圖5為本發(fā)明實(shí)施例提供的pany1-xynii物理圖譜,其中histag:組氨酸尾巴;t7promotor:t7啟動(dòng)子;pmb1replicon:大腸桿菌pmb1型復(fù)制子;kanamycinxnsii:卡那霉素抗性蛋白;t7terminator:t7終止子;xyn-ii:編碼木聚糖酶基因序列。

圖6為本發(fā)明實(shí)施例提供的pany1-as雙酶切(bamhi,sali雙酶切)電泳圖(m:dnaladder;1-4:pany1-as雙酶切)。

圖7為本發(fā)明實(shí)施例提供的pany1-as物理圖譜,其中histag:組氨酸尾巴;t7promotor:t7啟動(dòng)子;pmb1replicon:大腸桿菌pmb1型復(fù)制子;kanamycinxnsii:卡那霉素抗性蛋白;t7terminator:t7終止子;mcs-1:多克隆位點(diǎn)1;iftase:編碼菊糖果糖基轉(zhuǎn)移酶基因序列。

圖8為本發(fā)明實(shí)施例提供的pany1-xynii-flat雙酶切(bamhi,ecori雙酶切)電泳圖(m:dnaladder;1-3:pany1-xynii-flat雙酶切)。

圖9為本發(fā)明實(shí)施例提供的pany1-xynii-flat物理圖譜,其中histag:組氨酸尾巴;t7promotor:t7啟動(dòng)子;pmb1replicon:大腸桿菌pmb1型復(fù)制子;kanamycinxnsii:卡那霉素抗性蛋白;t7terminator:t7終止子;xyn-ii:編碼木聚糖酶基因序列。

圖10為本發(fā)明實(shí)施例提供的pany1-pflama雙酶切(bamhi,psti雙酶切)電泳圖(m:dnaladder;1-3:pany1-pflama雙酶切)。

圖11為本發(fā)明實(shí)施例提供的pany1-pflama物理圖譜,其中histag:組氨酸尾巴;t7promotor:t7啟動(dòng)子;pmb1replicon:大腸桿菌pmb1型復(fù)制子;kanamycinxnsii:卡那霉素抗性蛋白;t7terminator:t7終止子;pf-lama:編碼昆布多糖酶基因序列。

圖12為本發(fā)明實(shí)施例提供的pany1質(zhì)粒表達(dá)功能驗(yàn)證圖,a.酶活性檢測(cè)圖(1:空白;2:pany1-xynii表達(dá)粗酶液;:3:pany1-xynii表達(dá)純酶液;4:petm11-xynii表達(dá)粗酶液;5:petm11-xynii表達(dá)純酶液);b.pany1-xyniisds-page電泳圖(m:proteinladder;1:pany1-xynii表達(dá)粗酶液;2:pany1-xynii表達(dá)純酶液;3:petm11-xynii表達(dá)粗酶液;4:petm11-xynii表達(dá)純酶液)。

具體實(shí)施方式

下面結(jié)合說(shuō)明書(shū)附圖對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步的解釋說(shuō)明。

目前通用的質(zhì)粒載體存在一些缺點(diǎn),比如在克隆策略的選擇方面不夠靈活多樣,或者克隆過(guò)程中無(wú)法保證無(wú)假陽(yáng)性克隆,或者不能兼具克隆和表達(dá)功能。與常用質(zhì)粒載體相比,本發(fā)明質(zhì)粒同時(shí)兼具以下顯著的特點(diǎn)和優(yōu)勢(shì):1)克隆策略更多樣:可用于ta克隆、粘性末端克隆、平末端克隆、重組酶克隆,而國(guó)內(nèi)外現(xiàn)有質(zhì)粒都不能兼具這些特點(diǎn);2)本質(zhì)粒載體部分dna片段長(zhǎng)度小于2000bp,具有非常高的克隆效率和成功率,也是已知目前最小的表達(dá)型質(zhì)粒之一;3)該質(zhì)粒的多克隆位點(diǎn)之間插入了ccdb毒蛋白編碼基因,可以實(shí)現(xiàn)無(wú)假陽(yáng)性克??;4)該質(zhì)粒既有目的基因克隆的功能,又能實(shí)現(xiàn)iptg誘導(dǎo)蛋白表達(dá),同時(shí)還能利用鎳柱對(duì)表達(dá)的蛋白進(jìn)行純化。在應(yīng)用實(shí)例中,本發(fā)明質(zhì)粒載體在分子克隆、蛋白表達(dá)和純化方面的功能得到了驗(yàn)證。本發(fā)明質(zhì)粒載體既可以應(yīng)用各種不同的克隆要求,而且可方便高效地進(jìn)行蛋白表達(dá)和純化,而不需要亞克隆步驟,因此本發(fā)明質(zhì)粒載體因其更方便、高效,將在基因工程領(lǐng)域發(fā)揮重要的作用。

實(shí)施例1

質(zhì)粒載體pany1的獲得:

1)以質(zhì)粒pyum6002(any,meressep,maspj,hartdj.coesprit:alibrary-basedconstructscreeningmethodforidentificationandexpressionofsolubleproteincomplexes.plosone.2011;6(2):e16261.)為模板,bamhi-t-for和psti-t-rev為上下游引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物待用;bamhi-t-for:5’-tcgcggatcccccctgaaaatacaaattctcggtagttgg-3’和psti-t-rev:5’-tcatctgcagttggctgctgccaccgctgagcaataac-3’;pcr擴(kuò)增的反應(yīng)體系為:20μl反應(yīng)體系中含10xpfubuffer2μl,引物各10μmol/l,2upfu酶,0.2mmol/ldntps,模板2ng左右,以滅菌的去離子水補(bǔ)齊;pcr擴(kuò)增的循環(huán)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性3min,(94℃,30s;63℃,30s;72℃,4min)×25,72℃最后延伸10min。該pcr產(chǎn)物為構(gòu)建質(zhì)粒pany1的載體部分。

2)以質(zhì)粒phiskan5(freulerf,stettlert,meyerhoferm,lederl,mayrlm.developmentofanovelgateway-basedvectorsystemforefficient,multiparallelproteinexpressioninescherichiacoli.proteinexprpurif.2008jun;59(2):232-241.)為模板,ccdb-for和ccdb-rev為上下游引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物待用;ccdb-for:5’-cgcggatccactagtaggcctgtcgacggtcagtccggcttactaaaagccagataacagtatgcg-3’和ccdb-rev:5’-catctgcaggagctcccatggaggcctgacggtcagtcgactggctgtgtataagggagcctgac-3’),進(jìn)行pcr擴(kuò)增。pcr擴(kuò)增的反應(yīng)體系為:20μl反應(yīng)體系中含10xpfubuffer2μl,引物各10μmol/l,2upfu酶,0.2mmol/ldntps,模板2ng左右,以滅菌的去離子水補(bǔ)齊;pcr擴(kuò)增的循環(huán)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性3min,(94℃,30s;63℃,30s;72℃,2min)×25,72℃最后延伸10min。該pcr片段含有ccdb基因序列及其兩側(cè)的多克隆位點(diǎn)區(qū)。多克隆位點(diǎn)功能區(qū)如圖1b所示。;

3)將步驟1)和2)獲得兩個(gè)pcr產(chǎn)物經(jīng)pcr純化后,同時(shí)用bamhi和psti雙酶切,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳后切膠,回收酶切產(chǎn)物(兩個(gè)大片段);

4)將步驟3)得到的兩個(gè)片段于連接體系內(nèi)在室溫下進(jìn)行連接16小時(shí),而后轉(zhuǎn)化db3.1菌株,經(jīng)kana抗性和雙酶切(bamhi和psti)驗(yàn)證篩選(電泳圖如圖2所示)得到陽(yáng)性菌落,陽(yáng)性菌落提取質(zhì)粒,經(jīng)測(cè)序鑒定正確后命名為pany1。該質(zhì)粒具有序列表中序列1所示的核苷酸序列。

所述連接體系為含175ut4dna連接酶(takara),1×連接buffer(takaraco.),約30ng酶切產(chǎn)物(步驟3)得到的兩個(gè)片段)。

seqidno:1pany1(2663bp):

actagtaggcctgtcgacggtcagtccggcttactaaaagccagataacagtatgcgtatttgcgcgctgatttttgcggtataagaatatatactgatatgtatacccgaagtatgtcaaaaagaggtatgctatgaagcagcgtattacagtgacagttgacagcgacagctatcagttgctcaaggcatatatgatgtcaatatctccggtctggtaagcacaaccatgcagaatgaagcccgtcgtctgcgtgccgaacgctggaaagcggaaaatcaggaagggatggctgaggtcgcccggtttattgaaatgaacggctcttttgctgacgagaacaggggctggtgaaatgcagtttaaggtttacacctataaaagagagagccgttatcgtctgtttgtggatgtacagagtgatattattgacacgcccgggcgacggatggtgatccccctggccagtgcacgtctgctgtcagataaagtctcccgtgaactttacccggtggtgcatatcggggatgaaagctggcgcatgatgaccaccgatatggccagtgtgccggtctccgttatcggggaagaagtggctgatctcagccaccgcgaaaatgacatcaaaaacgccattaacctgatgttctggggaatataaatgtcaggctcccttatacacagccagtcgactgaccgtcaggcctccatgggagctcctgcagttggctgctgccaccgctgagcaataactagcataaccccttggggcctctaaacgggtcttgaggggttttttgctgaaaggaggaactatatccggatatccctgactgcgttagcaatttaactgtgataaactaccgcattaaagcttatcgatgataagctgtcaaacatgagaattcttagaaaaactcatcgagcatcaaatgaaactgcaatttattcatatcaggattatcaataccatatttttgaaaaagccgtttctgtaatgaaggagaaaactcaccgaggcagttccataggatggcaagatcctggtatcggtctgcgattccgactcgtccaacatcaatacaacctattaatttcccctcgtcaaaaataaggttatcaagtgagaaatcaccatgagtgacgactgaatccggtgagaatggcaaaagtttgtgcatttctttccagacttgttcaacaggccagccattacgctcgtcatcaaaatcactcgcatcaaccaaaccgttattcattcgtgattgcgcctgagcgagacgaaatacgcgatcgctgttaaaaggacaattacaaacaggaatcgaatgcaaccggcgcaggaacactgccagcgcatcaacaatattttcacctgaatcaggatattcttctaatacctggaatgctgttttcccggggatcgcagtggtgagtaaccatgcgtcatcaggagtacggataaaatgcttgatggtcggaacaggcataaattccgtcagccagtttagtctgaccatctcatctgtaacatcattggcaacgctacctttgccatgtttcagaaacaactctggcgcatcgggcttcccatacaatcgatagattgtcgcacctgattgcccgacattatcgcgagcccatttatacccatataaatcagcatccatgttggaatttaatcgcggcctcgagcaagacgtttcccgttgaatatggctcataacaccccttgtattactgtttatgtaagcagacagttttattgttcatgaccaaaatcccttaacgtgagttttcgttccactgagcgtcagaccccgtagaaaagatcaaaggatcttcttgagatcctttttttctgcgcgtaatctgctgcttgcaaacaaaaaaaccaccgctaccagcggtggtttgtttgccggatcaagagctaccaactctttttccgaaggtaactggcttcagcagagcgcagataccaaatactgtccttctagtgtagccgtagttaggccaccacttcaagaactctgtagcaccgcctacatacctcgctctgctaatcctgttaccagtggctgctgccagtggcgataagtcgtgtcttaccgggttggactcaagacgatagttaccggataaggcgcagcggtcgggctgaacggggggttcgtgcacacagcccagcttggagcgaacgacctacaccgaactgagatacctacagcgtgagctatgagaaagcgccacgcttcccgaagggagaaaggcggacaggtatccggtaagcggcagggtcggaacaggagagcgcacgagggagcttccagggggaaacgcctggtatctttatagtcctgtcgggtttcgccacctctgacttgagcgtcgatttttgtgatgctcgtcaggggggcggagcctatggaaaaacgccagcaacgcggcctttttacggttcctggccttttgctggcctttggtaccagatctcgatcccgcgaaattaatacgactcactatagggagaccacaacggtttccctctagaaataattttgtttaactttaagaaggagatatacatatgggccaccatcatcaccaccatgattatgatattccaactaccgagaatttgtattttcaggggggatcc

實(shí)施例2、上述實(shí)例獲得pany1用于ta克隆的功能驗(yàn)證

1)用ahdi酶切上述獲得質(zhì)粒pany1(電泳圖如圖3所示),酶切反應(yīng)體系如下:120μl酶切體系中包含10uahdi內(nèi)切酶(newenglandbiolabs),1×buffer,大約4μg質(zhì)粒。37℃酶切6小時(shí)后,經(jīng)過(guò)酶切后的大片段即是t載體,命名為pany1-t,不需膠回收。

2)以質(zhì)粒pjexpress401-xynii(wanq,kovalevskya,zhangq,hamilton-brehms,uptonr,weisskl,mustyakimovm,grahamd,coatesl,langanp.heterologousexpression,purification,crystallizationandpreliminaryx-rayanalysisoftrichodermareeseixylanaseiiandfourvariants.actacrystallogrsectfstructbiolcrystcommun.2013;69(pt3):320-323.)為模板,用xyn2-for2(5’-acgatccaaccaggcacgggctacaac-3’)和xyn2-rev2(5’-ttagctaacggtgatgcttgcagaaccgctg-3’)引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增。pcr擴(kuò)增反應(yīng)體系如下:20μl反應(yīng)體系中含10×pcrbuffer(takara)2μl,引物各10μmol/l,2utaq酶,0.2mmol/ldntps,模板1ng左右,以滅菌的去離子水補(bǔ)齊;pcr擴(kuò)增的循環(huán)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性3min,(94℃,30s;63℃,30s;72℃,2min)×25,72℃最后延伸10min。將pcr產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳后切膠回收600bp左右的片段。

3)將上述步驟2得到的片段與pany1-t(即t載體)進(jìn)行連接,連接反應(yīng)體系如下:20μl連接體系中含175ut4dna連接酶(takara),1×連接buffer,約30ngpcr和酶切產(chǎn)物。室溫連接16小時(shí)。將連接產(chǎn)物按照常規(guī)方法轉(zhuǎn)化bl21(de3)菌株后,挑經(jīng)kana抗性篩選得到的菌落,提取質(zhì)粒進(jìn)行bamhi和ecori雙酶切驗(yàn)證(電泳圖如圖4所示),取陽(yáng)性克隆提取質(zhì)粒,進(jìn)行測(cè)序鑒定,將測(cè)序鑒定ta連接成功的質(zhì)粒命名為pany1-xynii(物理圖譜如圖5所示),該質(zhì)粒具有序列表中序列2核苷酸序列。結(jié)果表明,pany1可以有效的進(jìn)行t載體制備,并且用于ta克隆。

seqidno:2pany1-xynii(2558bp):

actagtaggcctgtcgacggtacgatccaaccaggcacgggctacaacaacggctatttctactcttactggaacgacggtcatggtggtgttacctatactaatggccctggtggccagttcagcgtcaattggagcaattccggcaacttcgttggtggtaaaggctggcagccgggcaccaagaataaggtgattaactttagcggttcctacaatccgaatggcaacagctacctgagcgtgtacggctggagccgtaatccgctgattgaatactatatcgtggagaactttggtacgtacaacccgtccaccggtgccaccaaactgggtgaggttactagcgatggtagcgtgtatgatatctatcgcacccagcgtgttaatcaaccgtcgattattggtacggcgaccttttatcaatactggagcgtgcgtcgcaaccaccgttctagcggcagcgtcaacaccgcaaaccactttaatgcgtgggctcagcagggtttgaccctgggtacgatggactaccaaatcgtcgcggtcgaaggttatttcagcagcggttctgcaagcatcaccgttagctaaaccgtcaggcctccatgggagctcctgcagttggctgctgccaccgctgagcaataactagcataaccccttggggcctctaaacgggtcttgaggggttttttgctgaaaggaggaactatatccggatatccctgactgcgttagcaatttaactgtgataaactaccgcattaaagcttatcgatgataagctgtcaaacatgagaattcttagaaaaactcatcgagcatcaaatgaaactgcaatttattcatatcaggattatcaataccatatttttgaaaaagccgtttctgtaatgaaggagaaaactcaccgaggcagttccataggatggcaagatcctggtatcggtctgcgattccgactcgtccaacatcaatacaacctattaatttcccctcgtcaaaaataaggttatcaagtgagaaatcaccatgagtgacgactgaatccggtgagaatggcaaaagtttgtgcatttctttccagacttgttcaacaggccagccattacgctcgtcatcaaaatcactcgcatcaaccaaaccgttattcattcgtgattgcgcctgagcgagacgaaatacgcgatcgctgttaaaaggacaattacaaacaggaatcgaatgcaaccggcgcaggaacactgccagcgcatcaacaatattttcacctgaatcaggatattcttctaatacctggaatgctgttttcccggggatcgcagtggtgagtaaccatgcgtcatcaggagtacggataaaatgcttgatggtcggaacaggcataaattccgtcagccagtttagtctgaccatctcatctgtaacatcattggcaacgctacctttgccatgtttcagaaacaactctggcgcatcgggcttcccatacaatcgatagattgtcgcacctgattgcccgacattatcgcgagcccatttatacccatataaatcagcatccatgttggaatttaatcgcggcctcgagcaagacgtttcccgttgaatatggctcataacaccccttgtattactgtttatgtaagcagacagttttattgttcatgaccaaaatcccttaacgtgagttttcgttccactgagcgtcagaccccgtagaaaagatcaaaggatcttcttgagatcctttttttctgcgcgtaatctgctgcttgcaaacaaaaaaaccaccgctaccagcggtggtttgtttgccggatcaagagctaccaactctttttccgaaggtaactggcttcagcagagcgcagataccaaatactgtccttctagtgtagccgtagttaggccaccacttcaagaactctgtagcaccgcctacatacctcgctctgctaatcctgttaccagtggctgctgccagtggcgataagtcgtgtcttaccgggttggactcaagacgatagttaccggataaggcgcagcggtcgggctgaacggggggttcgtgcacacagcccagcttggagcgaacgacctacaccgaactgagatacctacagcgtgagctatgagaaagcgccacgcttcccgaagggagaaaggcggacaggtatccggtaagcggcagggtcggaacaggagagcgcacgagggagcttccagggggaaacgcctggtatctttatagtcctgtcgggtttcgccacctctgacttgagcgtcgatttttgtgatgctcgtcaggggggcggagcctatggaaaaacgccagcaacgcggcctttttacggttcctggccttttgctggcctttggtaccagatctcgatcccgcgaaattaatacgactcactatagggagaccacaacggtttccctctagaaataattttgtttaactttaagaaggagatatacatatgggccaccatcatcaccaccatgattatgatattccaactaccgagaatttgtattttcaggggggatcc

實(shí)施例3、對(duì)上述實(shí)例獲得pany1用于粘性末端克隆的功能驗(yàn)證

1)分別用bamhi和sali對(duì)人工合成的arthrobactersp.的一段含有編碼菊糖果糖基轉(zhuǎn)移酶(iftase)基因片段進(jìn)行雙酶切。酶切反應(yīng)體系如下:162μl酶切體系中包含3μlbamhi和3μlsali(takara),1×buffer,大約4μg質(zhì)粒,去離子水補(bǔ)齊。37℃酶切6小時(shí)后經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳后切膠回收1200bp左右的片段。

pany1用上述相同的酶切體系進(jìn)行酶切,并用pcr純化試劑盒進(jìn)行純化。

2)建立如下的連接體系:20μl連接體系中含175ut4dna連接酶(takara),1×連接buffer,約30ng酶切產(chǎn)物。室溫連接16小時(shí)。將連接產(chǎn)物按照常規(guī)方法轉(zhuǎn)化bl21(de3)菌株,涂布在含有kana的平板上。對(duì)于陽(yáng)性克隆,提取質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切(bamhi和sali)驗(yàn)證(電泳圖如圖6所示)。經(jīng)測(cè)序鑒定正確的重組質(zhì)粒命名為pany1-as(物理圖譜如圖7所示)。該質(zhì)粒具有序列表中序列3核苷酸序列。結(jié)果表明,pany1可以有效的進(jìn)行粘性末端克隆。

seqidno:3pany1-as(3193bp):

ggatccgcggactctaccgaagaaaccaaccgttacgacgttacctcttggaaaatcaaaggtcgtccggaagttaccgcgcagatcgacatcggtgcggttatcaacgacatcatcgcggacgttaaaaaacgtcagaccaccgcggacgcgcgtccgggtgcggttatcaccatcccgccgggtgactacgacctgcgtacccaggttgttgttgacgtttcttacctgaccatcgcgggtttcggtcacggtttcttctctcgttctatcaaagacaacgttgacacctctggttggctggaactgcaaccgggtggttctcacatccgtgttctgaccccgtctaccgcgccgcaggcgttcctggttcgtcgtgcgggttctccgcgtctgtctggtgttgttttccgtgacttctgcctggacggtgttgaatttccgccggacggtaactcttaccgtaacggtcgtaccggtatcgaagttgcgtctgacaacgactctttccacatcaccggtatgggtttcgtttacctggaacacgcgctgatcgttcgtggtgcggacgcgctgcgtgttcacgacaacatgatcgcggaatgcggtaactgcgttgaactgaccggtgcgggtcaggcgaccatcgtttctaacaacctgatgggtgcgggtccggaaggtgcgaccctgctggcggaaaaccacgaaggtctgctgatcaccggtaacaacctgttcccgcgtggtcgttctctggttgaactgaccggttgcaaccgttgctctgttacctctaaccgtttccagggtttcttcccgggtatcatgcgtctgatcaacaactgcaaagaaaacctgatcaccggtaaccacttccgtcgtggtatggaaggtttcccgccgttcctgggcacctctaacggtctggacgacctgtacggtgttgttcacatcgcgggtgacaacaacttcttcgcgaacaacctgatcgcgtacgacgtttctccggaccgtatcgttccgccgaacgcgcagccgaccatgatcctggttgcgggtggtgactctaacgttgttgcgaccaaccacgttgtttctaacgttgaaacccagcacgttgttctggacgcgtctaccgttcgttctaaagttctggactctggtccggcgtctaaagttacctcttactctgcggacaccgcgatccgtccgaccccgtaggtcgactgaccgtcaggcctccatgggagctcctgcagttggctgctgccaccgctgagcaataactagcataaccccttggggcctctaaacgggtcttgaggggttttttgctgaaaggaggaactatatccggatatccctgactgcgttagcaatttaactgtgataaactaccgcattaaagcttatcgatgataagctgtcaaacatgagaattcttagaaaaactcatcgagcatcaaatgaaactgcaatttattcatatcaggattatcaataccatatttttgaaaaagccgtttctgtaatgaaggagaaaactcaccgaggcagttccataggatggcaagatcctggtatcggtctgcgattccgactcgtccaacatcaatacaacctattaatttcccctcgtcaaaaataaggttatcaagtgagaaatcaccatgagtgacgactgaatccggtgagaatggcaaaagtttgtgcatttctttccagacttgttcaacaggccagccattacgctcgtcatcaaaatcactcgcatcaaccaaaccgttattcattcgtgattgcgcctgagcgagacgaaatacgcgatcgctgttaaaaggacaattacaaacaggaatcgaatgcaaccggcgcaggaacactgccagcgcatcaacaatattttcacctgaatcaggatattcttctaatacctggaatgctgttttcccggggatcgcagtggtgagtaaccatgcgtcatcaggagtacggataaaatgcttgatggtcggaacaggcataaattccgtcagccagtttagtctgaccatctcatctgtaacatcattggcaacgctacctttgccatgtttcagaaacaactctggcgcatcgggcttcccatacaatcgatagattgtcgcacctgattgcccgacattatcgcgagcccatttatacccatataaatcagcatccatgttggaatttaatcgcggcctcgagcaagacgtttcccgttgaatatggctcataacaccccttgtattactgtttatgtaagcagacagttttattgttcatgaccaaaatcccttaacgtgagttttcgttccactgagcgtcagaccccgtagaaaagatcaaaggatcttcttgagatcctttttttctgcgcgtaatctgctgcttgcaaacaaaaaaaccaccgctaccagcggtggtttgtttgccggatcaagagctaccaactctttttccgaaggtaactggcttcagcagagcgcagataccaaatactgtccttctagtgtagccgtagttaggccaccacttcaagaactctgtagcaccgcctacatacctcgctctgctaatcctgttaccagtggctgctgccagtggcgataagtcgtgtcttaccgggttggactcaagacgatagttaccggataaggcgcagcggtcgggctgaacggggggttcgtgcacacagcccagcttggagcgaacgacctacaccgaactgagatacctacagcgtgagctatgagaaagcgccacgcttcccgaagggagaaaggcggacaggtatccggtaagcggcagggtcggaacaggagagcgcacgagggagcttccagggggaaacgcctggtatctttatagtcctgtcgggtttcgccacctctgacttgagcgtcgatttttgtgatgctcgtcaggggggcggagcctatggaaaaacgccagcaacgcggcctttttacggttcctggccttttgctggcctttggtaccagatctcgatcccgcgaaattaatacgactcactatagggagaccacaacggtttccctctagaaataattttgtttaactttaagaaggagatatacatatgggccaccatcatcaccaccatgattatgatattccaactaccgagaatttgtattttcagggg

實(shí)施例4、pany1用于平末端克隆的功能驗(yàn)證

1)以質(zhì)粒pjexpress401-xynii(來(lái)源同實(shí)施例2)為模板,用xyn2-for2和xyn2-rev2引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增。pcr擴(kuò)增反應(yīng)體系如下:20μl反應(yīng)體系中含10xpfubuffer2μl,引物各10μmol/l,2upfu酶,0.2mmol/ldntps,模板1ng左右,以滅菌的去離子水補(bǔ)齊;pcr擴(kuò)增的循環(huán)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性3min,(94℃,30s;63℃,30s;72℃,2min)×25,72℃最后延伸10min。將pcr產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳后切膠回收600bp左右的片段。

2)用stui酶切上述pany1,酶切反應(yīng)體系如下:30μl酶切體系中包含1μlstui(takara),1×buffer,大約1μg質(zhì)粒(pany1),去離子水補(bǔ)齊。將酶切產(chǎn)物用pcr純化試劑盒進(jìn)行純化。

3)建立如下的連接體系:20μl連接體系中含700ut4dna連接酶(takara),1×連接buffer,1×quickcutbuffer,1μlstui(takara),約30ng上述兩個(gè)dna片段。室溫連接16小時(shí)。將連接產(chǎn)物按照常規(guī)方法轉(zhuǎn)化bl21(de3)菌株,涂布在含有kana的平板上。對(duì)于陽(yáng)性克隆,提取質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切(bamhi和ecori)鑒定(電泳圖如圖8所示)。經(jīng)測(cè)序鑒定正確的重組質(zhì)粒命名為pany1-xynii-flat(物理圖譜如圖9所示)具有序列表中序列4核苷酸序列。結(jié)果表明,pany1可以有效的進(jìn)行平末端克隆。

seqidno:4pany1-xynii-flat(2537bp):

actagtaggacgatccaaccaggcacgggctacaacaacggctatttctactcttactggaacgacggtcatggtggtgttacctatactaatggccctggtggccagttcagcgtcaattggagcaattccggcaacttcgttggtggtaaaggctggcagccgggcaccaagaataaggtgattaactttagcggttcctacaatccgaatggcaacagctacctgagcgtgtacggctggagccgtaatccgctgattgaatactatatcgtggagaactttggtacgtacaacccgtccaccggtgccaccaaactgggtgaggttactagcgatggtagcgtgtatgatatctatcgcacccagcgtgttaatcaaccgtcgattattggtacggcgaccttttatcaatactggagcgtgcgtcgcaaccaccgttctagcggcagcgtcaacaccgcaaaccactttaatgcgtgggctcagcagggtttgaccctgggtacgatggactaccaaatcgtcgcggtcgaaggttatttcagcagcggttctgcaagcatcaccgttagctaacctccatgggagctcctgcagttggctgctgccaccgctgagcaataactagcataaccccttggggcctctaaacgggtcttgaggggttttttgctgaaaggaggaactatatccggatatccctgactgcgttagcaatttaactgtgataaactaccgcattaaagcttatcgatgataagctgtcaaacatgagaattcttagaaaaactcatcgagcatcaaatgaaactgcaatttattcatatcaggattatcaataccatatttttgaaaaagccgtttctgtaatgaaggagaaaactcaccgaggcagttccataggatggcaagatcctggtatcggtctgcgattccgactcgtccaacatcaatacaacctattaatttcccctcgtcaaaaataaggttatcaagtgagaaatcaccatgagtgacgactgaatccggtgagaatggcaaaagtttgtgcatttctttccagacttgttcaacaggccagccattacgctcgtcatcaaaatcactcgcatcaaccaaaccgttattcattcgtgattgcgcctgagcgagacgaaatacgcgatcgctgttaaaaggacaattacaaacaggaatcgaatgcaaccggcgcaggaacactgccagcgcatcaacaatattttcacctgaatcaggatattcttctaatacctggaatgctgttttcccggggatcgcagtggtgagtaaccatgcgtcatcaggagtacggataaaatgcttgatggtcggaacaggcataaattccgtcagccagtttagtctgaccatctcatctgtaacatcattggcaacgctacctttgccatgtttcagaaacaactctggcgcatcgggcttcccatacaatcgatagattgtcgcacctgattgcccgacattatcgcgagcccatttatacccatataaatcagcatccatgttggaatttaatcgcggcctcgagcaagacgtttcccgttgaatatggctcataacaccccttgtattactgtttatgtaagcagacagttttattgttcatgaccaaaatcccttaacgtgagttttcgttccactgagcgtcagaccccgtagaaaagatcaaaggatcttcttgagatcctttttttctgcgcgtaatctgctgcttgcaaacaaaaaaaccaccgctaccagcggtggtttgtttgccggatcaagagctaccaactctttttccgaaggtaactggcttcagcagagcgcagataccaaatactgtccttctagtgtagccgtagttaggccaccacttcaagaactctgtagcaccgcctacatacctcgctctgctaatcctgttaccagtggctgctgccagtggcgataagtcgtgtcttaccgggttggactcaagacgatagttaccggataaggcgcagcggtcgggctgaacggggggttcgtgcacacagcccagcttggagcgaacgacctacaccgaactgagatacctacagcgtgagctatgagaaagcgccacgcttcccgaagggagaaaggcggacaggtatccggtaagcggcagggtcggaacaggagagcgcacgagggagcttccagggggaaacgcctggtatctttatagtcctgtcgggtttcgccacctctgacttgagcgtcgatttttgtgatgctcgtcaggggggcggagcctatggaaaaacgccagcaacgcggcctttttacggttcctggccttttgctggcctttggtaccagatctcgatcccgcgaaattaatacgactcactatagggagaccacaacggtttccctctagaaataattttgtttaactttaagaaggagatatacatatgggccaccatcatcaccaccatgattatgatattccaactaccgagaatttgtattttcaggggggatcc

實(shí)施例5、pany1用于重組酶克隆的功能驗(yàn)證

1)將pany1轉(zhuǎn)化大腸桿菌db3.1菌株,并用質(zhì)粒提取試劑盒提取質(zhì)粒。用bamhi和saci對(duì)pany1質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切,并將酶切產(chǎn)物用pcr純化試劑盒進(jìn)行純化。

2)用ecori和sali對(duì)本實(shí)驗(yàn)構(gòu)建的pet9d-pflama(ilaria,fiorilloa,angelaccios,florior,chiaralucer,vanderoostj,consalviv.crystalstructureofafamily16endoglucanasefromthehyperthermophilepyrococcusfuriosus--structuralbasisofsubstraterecognition.febsj.2009;276(4):1048-1058.)質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切,將酶切產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳后切膠回收1700bp左右的片段。以上述膠回收片段為模板,用pflama-bamhi-czm(5’-tttgtattttcaggggggatccgtccctgaagtgatagaaatagatggaaaacagtgg-3’)和pflama-saci-czm(5’-gcagcagccaactgcaggagctctcaaccactaacgaatgagtaaacccttacataatc-3’)引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增,pcr擴(kuò)增反應(yīng)體系如下:20μl反應(yīng)體系中含10xpfubuffer2μl,引物各10μmol/l,2upfu酶,0.2mmol/ldntps,模板1ng左右,以滅菌的去離子水補(bǔ)齊;pcr擴(kuò)增的循環(huán)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性3min,(94℃,30s;63℃,30s;72℃,2min)×25,72℃最后延伸10min。將pcr產(chǎn)物進(jìn)行純化。

3)按照一步法快速克隆試劑盒(翊圣生物)說(shuō)明進(jìn)行克隆。將重組產(chǎn)物按照常規(guī)方法轉(zhuǎn)化bl21(de3)菌株,涂布在含有kana的平板上。對(duì)于陽(yáng)性克隆,提取質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切(bamhi和psti)鑒定(電泳圖如圖10所示),篩選得到陽(yáng)性菌落。從陽(yáng)性克隆中提取質(zhì)粒,經(jīng)測(cè)序鑒定正確的重組質(zhì)粒命名為pany1-pflama(物理圖譜如圖11所示)。該質(zhì)粒具有序列表中序列5核苷酸序列。結(jié)果表明,pany1可以有效的進(jìn)行重組酶克隆。

seqidno:5pany1-pflama(2741bp):

gtccctgaagtgatagaaatagatggaaaacagtggagacttatttggcacgatgagtttgaaggttccgaagtaaataaagaatactggacatttgagaagggaaatggaatagcttatggaatcccgggatgggggaatggagagcttgaatactacacggaaaacaacacctatattgtaaatggcacccttgtcattgaggccagaaaagaaataattactgatcctaacgaaggaacgtttctctacacttcatcaagacttaagactgaaggtaaggtagaatttagccctccagtagttgttgaggctagaataaagcttccaaaaggtaaaggtttatggcctgcattctggatgttggggagcaacataagggaagtaggctggccaaattgtggagaaatagacataatggagttccttggccatgagccacggacaattcacggaactgttcatggcccaggttactcgggaagtaaaggaattactagggcctatacactccctgaaggtgttccagactttacagaagacttccatgtatttggaatagtttggtatccggataaaataaagtggtacgttgatggaactttttatcatgaggttacaaaagaacaagtggaggctatgggctatgagtgggtcttcgataagcccttctatataatccttaatcttgcagtgggtggttattggccaggaaaccccgatgctacaactccatttccagcaaagatggtggtggattatgtaagggtttactcattcgttagtggttgagagctcctgcagttggctgctgccaccgctgagcaataactagcataaccccttggggcctctaaacgggtcttgaggggttttttgctgaaaggaggaactatatccggatatccctgactgcgttagcaatttaactgtgataaactaccgcattaaagcttatcgatgataagctgtcaaacatgagaattcttagaaaaactcatcgagcatcaaatgaaactgcaatttattcatatcaggattatcaataccatatttttgaaaaagccgtttctgtaatgaaggagaaaactcaccgaggcagttccataggatggcaagatcctggtatcggtctgcgattccgactcgtccaacatcaatacaacctattaatttcccctcgtcaaaaataaggttatcaagtgagaaatcaccatgagtgacgactgaatccggtgagaatggcaaaagtttgtgcatttctttccagacttgttcaacaggccagccattacgctcgtcatcaaaatcactcgcatcaaccaaaccgttattcattcgtgattgcgcctgagcgagacgaaatacgcgatcgctgttaaaaggacaattacaaacaggaatcgaatgcaaccggcgcaggaacactgccagcgcatcaacaatattttcacctgaatcaggatattcttctaatacctggaatgctgttttcccggggatcgcagtggtgagtaaccatgcgtcatcaggagtacggataaaatgcttgatggtcggaacaggcataaattccgtcagccagtttagtctgaccatctcatctgtaacatcattggcaacgctacctttgccatgtttcagaaacaactctggcgcatcgggcttcccatacaatcgatagattgtcgcacctgattgcccgacattatcgcgagcccatttatacccatataaatcagcatccatgttggaatttaatcgcggcctcgagcaagacgtttcccgttgaatatggctcataacaccccttgtattactgtttatgtaagcagacagttttattgttcatgaccaaaatcccttaacgtgagttttcgttccactgagcgtcagaccccgtagaaaagatcaaaggatcttcttgagatcctttttttctgcgcgtaatctgctgcttgcaaacaaaaaaaccaccgctaccagcggtggtttgtttgccggatcaagagctaccaactctttttccgaaggtaactggcttcagcagagcgcagataccaaatactgtccttctagtgtagccgtagttaggccaccacttcaagaactctgtagcaccgcctacatacctcgctctgctaatcctgttaccagtggctgctgccagtggcgataagtcgtgtcttaccgggttggactcaagacgatagttaccggataaggcgcagcggtcgggctgaacggggggttcgtgcacacagcccagcttggagcgaacgacctacaccgaactgagatacctacagcgtgagctatgagaaagcgccacgcttcccgaagggagaaaggcggacaggtatccggtaagcggcagggtcggaacaggagagcgcacgagggagcttccagggggaaacgcctggtatctttatagtcctgtcgggtttcgccacctctgacttgagcgtcgatttttgtgatgctcgtcaggggggcggagcctatggaaaaacgccagcaacgcggcctttttacggttcctggccttttgctggcctttggtaccagatctcgatcccgcgaaattaatacgactcactatagggagaccacaacggtttccctctagaaataattttgtttaactttaagaaggagatatacatatgggccaccatcatcaccaccatgattatgatattccaactaccgagaatttgtattttcaggggggatcc

實(shí)施例6、pany1用于蛋白表達(dá)和蛋白純化的功能驗(yàn)證

1)將上述實(shí)施例2中所獲得的pany1-xynii轉(zhuǎn)化bl21(de3)感受態(tài)細(xì)胞,進(jìn)行iptg誘導(dǎo)表達(dá),提取木聚糖酶xynii的粗酶液。作為對(duì)照,將xynii克隆于通用載體petm11的重組質(zhì)粒petm11-xynii也轉(zhuǎn)化bl21(de3),并進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá)和酶的提取。

2)將步驟1)得到的兩份粗酶液進(jìn)行純化,根據(jù)1mlhisgravitrapni-nta蛋白純化試劑盒(starbio)進(jìn)行操作。

3)將步驟1)和2)得到的兩份粗酶液和兩份純化后的酶液以木聚糖為底物進(jìn)行反應(yīng),反應(yīng)過(guò)程如下列方程所示:

通過(guò)dns法測(cè)定酶催化反應(yīng)的結(jié)果,如圖12a所示。并同時(shí)進(jìn)行sds-page電泳檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果如圖12b所示。結(jié)果表明,pany1可以有效的進(jìn)行蛋白質(zhì)表達(dá)和純化。其蛋白表達(dá)水平優(yōu)于petm11。同時(shí),表達(dá)產(chǎn)物還能進(jìn)行有效的純化。

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