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一種亞型Ph?likeALL的檢測方法與流程

文檔序號:11506531閱讀:1138來源:國知局
一種亞型Ph?likeALL的檢測方法與流程

本發(fā)明涉及分子生物學(xué)領(lǐng)域,具體涉及一種亞型ph-likeall的檢測方法。



背景技術(shù):

急性淋巴細(xì)胞白血病(簡稱all)是兒童最常見的腫瘤,發(fā)病率隨年齡的增長而降低,目前重現(xiàn)性染色體改變是all的重要標(biāo)志,包括染色體重組、結(jié)構(gòu)改變等。多年來,臨床通過結(jié)合上述染色體變異特征,對all進(jìn)行危險(xiǎn)分層治療,使得all的治療效果得到了很大得改善,其中兒童all的5年生存率提高到了85%,然而仍有部分患者治療預(yù)后差,all的復(fù)發(fā)難治性使得該病依然是兒童及成人主要的致死疾病之一。

ph-likeall,是根據(jù)基因表達(dá)譜鑒定的一組疾病,其基因表達(dá)譜與bcr-abl1陽性all相似,但不表達(dá)bcr-abl1,所以稱之為bcr-abl1-likeall,又稱為ph-likeall。此類all主要見于急性前體b細(xì)胞淋巴細(xì)胞白血?。╞cp-all),一般缺少bcp-all中典型的基因及染色體變異(etv6-runx1、e2a-pbx1、erg和mll重排、超二倍體等)且經(jīng)常會(huì)伴有高風(fēng)險(xiǎn)臨床特征。研究發(fā)現(xiàn),ph-likeall約占sr(標(biāo)危)和hr(高危)兒童b-all的15%,在青年all中約為27.4%。與bcr-abl1陽性all相似,ph-likeall患者預(yù)后差,常規(guī)化療效果不佳,易復(fù)發(fā)。細(xì)胞株和人類白血病細(xì)胞表達(dá)的abl1,abl2,csf1r和pdgfrb融合基因在體外對達(dá)沙替尼(dasatinib)敏感,epor和jak2對磷酸魯索替尼(ruxolitinib)敏感,etv6–ntrk3融合基因?qū)诉蛱婺幔╟rizotinib)敏感。上述藥物僅針對個(gè)別異常的融合基因起到抑制作用,使用有一定的局限性;在檢測或者細(xì)胞過程時(shí),需要多種藥物多次檢測,操作繁瑣。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是,克服以上現(xiàn)有技術(shù)的缺陷,提供一種亞型ph-likeall的檢測方法,能夠簡單快速全面地檢測ph-likeall。

本發(fā)明的技術(shù)方案是:一種亞型ph-likeall的檢測方法,包括下列步驟:

1)分別配制乙醇溶液、預(yù)處理液、洗液和酶緩沖液,置2℃-8℃氮?dú)鈼l件儲(chǔ)存;

2)熒光探針溶解:向探針管內(nèi)加10~20μl水,加入150~200μl雜交液,超聲溶解30~60s,得到探針溶液;

3)將骨髓細(xì)胞固化,涂抹于玻片上,經(jīng)過預(yù)處理,制成涂片;所述固化為肝素化處理或經(jīng)edta-醋酸鈉處理;

4)將探針溶液預(yù)溫到室溫,漩渦混勻,離心2~3s,取5~15μl混勻的探針溶液滴加到雜交區(qū)域,蓋上蓋玻片,用封片膠密封;

5)設(shè)置程序:先70~80℃變性5~10分鐘,然后35~40℃雜交16~18h;

6)除去封片膠,置于考普林缸內(nèi)的室溫洗液中1~5min洗去蓋玻片,取出涂片,用已預(yù)熱至72~74℃的洗液漂洗1~3min,再用室溫65~75%乙醇溶液漂洗1~3min,避光自然風(fēng)干;

7)滴加復(fù)染液到雜交區(qū)域,蓋上蓋玻片,置-25~-15℃暗處復(fù)染20分鐘以上;所述復(fù)染液由以下重量份數(shù)的組分組成:革蘭氏染色液5~7份,氯化鎂1~3份,檸檬酸0.2~0.6份,熒光素0.5~0.7份,海藻酸鈉0.1~0.3份;

8)使用物鏡對樣本進(jìn)行掃描,確定樣本是否有異質(zhì)性。

具體的,所述乙醇溶液的體積分?jǐn)?shù)為70~85%;所述預(yù)處理液為0.9~1.1mol/l的硫氰酸鈉溶液;所述洗液由以下重量百分?jǐn)?shù)的組分組成:氯化鈉1.7~1.8%,檸檬酸鈉0.8~1%,乙基苯基聚乙二醇0.2~0.4%,余量為水;所述酶緩沖液為0.009~0.011mol/l的稀鹽酸。

優(yōu)選地,所述熒光探針共12組,分別為abl1,abl2,csf1r,pdgfrb,crlf2,jak2,epor,il2rb,ntrk3,ptk2b,tslp和tyk2。

絕大部分ph-likeall患者有染色體重排或其他的遺傳改變,可激活細(xì)胞因子受體或激酶信號。重排基因包括abl1,abl2,crlf2,csf1r,epor,jak2,ntrk3,pdgfrb,ptk2b,il2rb,tslp或tyk2。abl1,abl2,csf1r,jak2表達(dá)和pdgfrb融合基因?qū)е录?xì)胞因子獨(dú)立性擴(kuò)增和磷酸化stat5激活。將上述重排基因進(jìn)行標(biāo)記得到熒光探針,與復(fù)染液制成試劑盒。

復(fù)染液在變性雜交后添加,其效果在復(fù)染及觀察過程中體現(xiàn)。復(fù)染液采用革蘭氏染色液為主要成分,熒光素增加熒光效果,添加氯化鎂可增加熒光探針的標(biāo)記顯色效果;海藻酸鈉有助于細(xì)胞均勻地分散和復(fù)染,檸檬酸則加快異常細(xì)胞的融合過程,細(xì)胞均勻分散復(fù)染的過程中,異常細(xì)胞相互間快速地融合。總之各組分相互有效地配合可以準(zhǔn)確快速的觀察樣本是否有異性。熒光探針囊括了目前已知的所有針對性用藥的ph-likeall類型,經(jīng)探針溶液與樣本變性雜交后,滴加復(fù)染液,能夠全面準(zhǔn)確地檢測ph-likeall。

優(yōu)選地,所述步驟2)熒光探針溶解還包括下列步驟:用移液槍沖洗探針管底部和管壁,振蕩混勻20~40s,離心20~40s,放35~40℃水浴保溫溶解5~15分鐘;重復(fù)上述過程2~3次,將配制好的探針溶液備用或分裝冰凍避光保存。

優(yōu)選地,所述步驟6)考普林缸還用于盛放預(yù)處理液、洗液和酶緩沖液,將所述洗液預(yù)熱至72~74℃,將所述預(yù)處理液預(yù)熱至75~85℃,將所述酶緩沖液預(yù)熱至36~38℃。

優(yōu)選地,所述洗液室溫下的ph值為7.0±0.2;所述酶緩沖液為0.01mol/l的稀鹽酸,室溫下的ph值為2.0±0.2。

具體地,所述步驟3)預(yù)處理包括如下步驟:a)將涂片60~70℃預(yù)熱5~10min,用浸蠟脫蠟透明液脫蠟2次每次10~20min,用無水乙醇脫水2次每次3~5min;b)依次在85%乙醇、70%乙醇、純化水中梯度復(fù)水,各0.5~2min,吸去殘余溶液;c)放在已經(jīng)預(yù)熱到75~85℃的預(yù)處理液中保溫20~40min,取出在純化水中浸泡1~2min,吸去殘余溶液;d)取40~60mg胃蛋白酶干粉溶解在已預(yù)熱至36~38℃的酶緩沖液中,浸入消化20~30min;e)在純化水中浸泡1~2min,依次在85%乙醇、70%乙醇、純化水中梯度脫水,各0.5~2min,干燥備用。

優(yōu)選地,所述步驟a)浸蠟脫蠟透明液為異構(gòu)烷烴型

優(yōu)選地,所述步驟c)中所述預(yù)處理液為0.9~1.1mol/l的硫氰酸鈉溶液。

優(yōu)選地,所述酶緩沖液為0.01mol/l的稀鹽酸,室溫下的ph值為2.0±0.2。

優(yōu)選地,所述掃描的結(jié)果中有異質(zhì)性的特征為有融合細(xì)胞。

本發(fā)明的有益效果是:

1)本檢測方法具有簡單、快速、成本低、靈敏度高、特異性強(qiáng)、檢測全面等優(yōu)點(diǎn),能夠簡單快速全面地檢測ph-likeall;

2)熒光探針囊括了目前已知的所有針對性用藥的ph-likeall類型,全面的檢測可以為臨床指導(dǎo)用藥提供有利依據(jù);

3)熒光探針具有很強(qiáng)的特異性,只結(jié)合特定位點(diǎn)的染色體,特異性強(qiáng);

4)采用熒光原位雜交技術(shù),熒光信號在顯微鏡下一目了然,靈敏度很高;

5)獲得骨髓細(xì)胞后可迅速處理成涂片,一般可在2-5天內(nèi)出結(jié)果。

附圖說明

圖1為fish正常細(xì)胞示意圖,1、橙色,2、綠色。

圖2為fish異常細(xì)胞,1、橙色,2、綠色,3、融合。

具體實(shí)施方式

下面用具體實(shí)施例對本發(fā)明做進(jìn)一步詳細(xì)說明,但本發(fā)明不僅局限于以下具體實(shí)施例。

以下所提供的實(shí)施例并非用以限制本發(fā)明所涵蓋的范圍,所描述的步驟也不是用以限制其執(zhí)行順序。本領(lǐng)域技術(shù)人員結(jié)合現(xiàn)有公知常識對本發(fā)明做顯而易見的改進(jìn),亦落入本發(fā)明要求的保護(hù)范圍之內(nèi)。

實(shí)施例一

一種亞型ph-likeall的檢測方法,包括下列步驟:

1)分別配制乙醇溶液、預(yù)處理液、洗液和酶緩沖液,置2℃-8℃氮?dú)鈼l件儲(chǔ)存;所述乙醇溶液的體積分?jǐn)?shù)為70~85%;所述預(yù)處理液為0.9~1.1mol/l的硫氰酸鈉溶液;所述洗液由以下重量百分?jǐn)?shù)的組分組成:氯化鈉1.7~1.8%,檸檬酸鈉0.8~1%,乙基苯基聚乙二醇0.2~0.4%,余量為水;所述酶緩沖液為0.009~0.011mol/l的稀鹽酸;

2)熒光探針溶解:向探針管內(nèi)加10~20μl水,加入150~200μl雜交液,超聲溶解30~60s,得到探針溶液;所述熒光探針共12組,分別為abl1,abl2,csf1r,pdgfrb,crlf2,jak2,epor,il2rb,ntrk3,ptk2b,tslp和tyk2;

3)將骨髓細(xì)胞固化,涂抹于玻片上,經(jīng)過預(yù)處理,制成涂片;所述固化為肝素化處理或經(jīng)edta-醋酸鈉處理;

4)將探針溶液預(yù)溫到室溫,漩渦混勻,離心2~3s,取5~15μl混勻的探針溶液滴加到雜交區(qū)域,蓋上蓋玻片,用封片膠密封;

5)設(shè)置程序:先70~80℃變性5~10分鐘,然后35~40℃雜交16~18h;

6)除去封片膠,置于考普林缸內(nèi)的室溫洗液中1~5min洗去蓋玻片,取出涂片,用已預(yù)熱至72~74℃的洗液漂洗1~3min,再用室溫65~75%乙醇溶液漂洗1~3min,避光自然風(fēng)干;

7)滴加復(fù)染液到雜交區(qū)域,蓋上蓋玻片,置-25~-15℃暗處復(fù)染20分鐘以上;所述復(fù)染液由以下重量份數(shù)的組分組成:革蘭氏染色液5~7份,氯化鎂1~3份,檸檬酸0.2~0.6份,熒光素0.5~0.7份,海藻酸鈉0.1~0.3份;

8)使用物鏡對樣本進(jìn)行掃描,確定樣本是否有異質(zhì)性。

所述步驟2)熒光探針溶解還包括下列步驟:用移液槍沖洗探針管底部和管壁,振蕩混勻20~40s,離心20~40s,放35~40℃水浴保溫溶解5~15分鐘;重復(fù)上述過程2~3次,將配制好的探針溶液備用或分裝冰凍避光保存。

所述步驟6)考普林缸還用于盛放預(yù)處理液、洗液和酶緩沖液,將所述洗液預(yù)熱至72~74℃,將所述預(yù)處理液預(yù)熱至75~85℃,將所述酶緩沖液預(yù)熱至36~38℃。

所述洗液室溫下的ph值為7.0±0.2;所述酶緩沖液為0.01mol/l的稀鹽酸,室溫下的ph值為2.0±0.2。

所述步驟3)預(yù)處理包括如下步驟:a)將涂片60~70℃預(yù)熱5~10min,用浸蠟脫蠟透明液脫蠟2次每次10~20min,用無水乙醇脫水2次每次3~5min;所述浸蠟脫蠟透明液為異構(gòu)烷烴型;b)依次在85%乙醇、70%乙醇、純化水中梯度復(fù)水,各0.5~2min,吸去殘余溶液;c)放在已經(jīng)預(yù)熱到75~85℃的預(yù)處理液中保溫20~40min,取出在純化水中浸泡1~2min,吸去殘余溶液;d)取40~60mg胃蛋白酶干粉溶解在已預(yù)熱至36~38℃的酶緩沖液中,浸入消化20~30min;e)在純化水中浸泡1~2min,依次在85%乙醇、70%乙醇、純化水中梯度脫水,各0.5~2min,干燥備用。

所述步驟c)中所述預(yù)處理液為0.9~1.1mol/l的硫氰酸鈉溶液。

所述酶緩沖液為0.01mol/l的稀鹽酸,室溫下的ph值為2.0±0.2。

所述掃描的結(jié)果中有異質(zhì)性的特征為有融合細(xì)胞。

實(shí)施例二

一種亞型ph-likeall的檢測方法,包括下列步驟:

1)分別配制乙醇溶液、預(yù)處理液、洗液和酶緩沖液,置2℃-8℃氮?dú)鈼l件儲(chǔ)存;所述乙醇溶液的體積分?jǐn)?shù)為70~85%;所述預(yù)處理液為0.9~1.1mol/l的硫氰酸鈉溶液;所述洗液由以下重量百分?jǐn)?shù)的組分組成:氯化鈉1.7~1.8%,檸檬酸鈉0.8~1%,乙基苯基聚乙二醇0.2~0.4%,余量為水;所述酶緩沖液為0.009~0.011mol/l的稀鹽酸;

2)熒光探針溶解:向探針管內(nèi)加10~20μl水,加入150~200μl雜交液,超聲溶解30~60s,得到探針溶液;所述熒光探針共12組,分別為abl1,abl2,csf1r,pdgfrb,crlf2,jak2,epor,il2rb,ntrk3,ptk2b,tslp和tyk2;

3)將骨髓細(xì)胞固化,涂抹于玻片上,經(jīng)過預(yù)處理,制成涂片;所述固化為肝素化處理或經(jīng)edta-醋酸鈉處理;

4)將探針溶液預(yù)溫到室溫,漩渦混勻,離心2~3s,取5~15μl混勻的探針溶液滴加到雜交區(qū)域,蓋上蓋玻片,用封片膠密封;

5)設(shè)置程序:先70~80℃變性5~10分鐘,然后35~40℃雜交16~18h;

6)除去封片膠,置于考普林缸內(nèi)的室溫洗液中1~5min洗去蓋玻片,取出涂片,用已預(yù)熱至72~74℃的洗液漂洗1~3min,再用室溫65~75%乙醇溶液漂洗1~3min,避光自然風(fēng)干;

7)滴加復(fù)染液到雜交區(qū)域,蓋上蓋玻片,置-25~-15℃暗處復(fù)染20分鐘以上;所述復(fù)染液由以下重量份數(shù)的組分組成:革蘭氏染色液5~7份,氯化鎂1~3份,檸檬酸0.2~0.6份,熒光素0.5~0.7份,海藻酸鈉0.1~0.3份;

8)使用物鏡對樣本進(jìn)行掃描,確定樣本是否有異質(zhì)性。

所述步驟2)熒光探針溶解還包括下列步驟:用移液槍沖洗探針管底部和管壁,振蕩混勻20~40s,離心20~40s,放35~40℃水浴保溫溶解5~15分鐘;重復(fù)上述過程2~3次,將配制好的探針溶液備用或分裝冰凍避光保存。

所述步驟6)考普林缸還用于盛放預(yù)處理液、洗液和酶緩沖液,將所述洗液預(yù)熱至72~74℃,將所述預(yù)處理液預(yù)熱至75~85℃,將所述酶緩沖液預(yù)熱至36~38℃。

所述洗液室溫下的ph值為7.0±0.2;所述酶緩沖液為0.01mol/l的稀鹽酸,室溫下的ph值為2.0±0.2。

所述步驟3)預(yù)處理包括如下步驟:a)將涂片60~70℃預(yù)熱5~10min,用浸蠟脫蠟透明液脫蠟2次每次10~20min,用無水乙醇脫水2次每次3~5min;所述浸蠟脫蠟透明液為異構(gòu)烷烴型;b)依次在85%乙醇、70%乙醇、純化水中梯度復(fù)水,各0.5~2min,吸去殘余溶液;c)放在已經(jīng)預(yù)熱到75~85℃的預(yù)處理液中保溫20~40min,取出在純化水中浸泡1~2min,吸去殘余溶液;d)取40~60mg胃蛋白酶干粉溶解在已預(yù)熱至36~38℃的酶緩沖液中,浸入消化20~30min;e)在純化水中浸泡1~2min,依次在85%乙醇、70%乙醇、純化水中梯度脫水,各0.5~2min,干燥備用。

所述步驟c)中所述預(yù)處理液為0.9~1.1mol/l的硫氰酸鈉溶液。

所述酶緩沖液為0.01mol/l的稀鹽酸,室溫下的ph值為2.0±0.2。

所述掃描的結(jié)果中有異質(zhì)性的特征為有融合細(xì)胞

實(shí)施例三

一種亞型ph-likeall的檢測方法,包括下列步驟:

1)分別配制乙醇溶液、預(yù)處理液、洗液和酶緩沖液,置2℃-8℃氮?dú)鈼l件儲(chǔ)存;所述乙醇溶液的體積分?jǐn)?shù)為70~85%;所述預(yù)處理液為0.9~1.1mol/l的硫氰酸鈉溶液;所述洗液由以下重量百分?jǐn)?shù)的組分組成:氯化鈉1.7~1.8%,檸檬酸鈉0.8~1%,乙基苯基聚乙二醇0.2~0.4%,余量為水;所述酶緩沖液為0.009~0.011mol/l的稀鹽酸;

2)熒光探針溶解:向探針管內(nèi)加10~20μl水,加入150~200μl雜交液,超聲溶解30~60s,得到探針溶液;所述熒光探針共12組,分別為abl1,abl2,csf1r,pdgfrb,crlf2,jak2,epor,il2rb,ntrk3,ptk2b,tslp和tyk2;

3)將骨髓細(xì)胞固化,涂抹于玻片上,經(jīng)過預(yù)處理,制成涂片;所述固化為肝素化處理或經(jīng)edta-醋酸鈉處理;

4)將探針溶液預(yù)溫到室溫,漩渦混勻,離心2~3s,取5~15μl混勻的探針溶液滴加到雜交區(qū)域,蓋上蓋玻片,用封片膠密封;

5)設(shè)置程序:先70~80℃變性5~10分鐘,然后35~40℃雜交16~18h;

6)除去封片膠,置于考普林缸內(nèi)的室溫洗液中1~5min洗去蓋玻片,取出涂片,用已預(yù)熱至72~74℃的洗液漂洗1~3min,再用室溫65~75%乙醇溶液漂洗1~3min,避光自然風(fēng)干;

7)滴加復(fù)染液到雜交區(qū)域,蓋上蓋玻片,置-25~-15℃暗處復(fù)染20分鐘以上;所述復(fù)染液由以下重量份數(shù)的組分組成:革蘭氏染色液5~7份,氯化鎂1~3份,檸檬酸0.2~0.6份,熒光素0.5~0.7份,海藻酸鈉0.1~0.3份;

8)使用物鏡對樣本進(jìn)行掃描,確定樣本是否有異質(zhì)性。

所述步驟2)熒光探針溶解還包括下列步驟:用移液槍沖洗探針管底部和管壁,振蕩混勻20~40s,離心20~40s,放35~40℃水浴保溫溶解5~15分鐘;重復(fù)上述過程2~3次,將配制好的探針溶液備用或分裝冰凍避光保存。

所述步驟6)考普林缸還用于盛放預(yù)處理液、洗液和酶緩沖液,將所述洗液預(yù)熱至72~74℃,將所述預(yù)處理液預(yù)熱至75~85℃,將所述酶緩沖液預(yù)熱至36~38℃。

所述洗液室溫下的ph值為7.0±0.2;所述酶緩沖液為0.01mol/l的稀鹽酸,室溫下的ph值為2.0±0.2。

所述步驟3)預(yù)處理包括如下步驟:a)將涂片60~70℃預(yù)熱5~10min,用浸蠟脫蠟透明液脫蠟2次每次10~20min,用無水乙醇脫水2次每次3~5min;所述浸蠟脫蠟透明液為異構(gòu)烷烴型;b)依次在85%乙醇、70%乙醇、純化水中梯度復(fù)水,各0.5~2min,吸去殘余溶液;c)放在已經(jīng)預(yù)熱到75~85℃的預(yù)處理液中保溫20~40min,取出在純化水中浸泡1~2min,吸去殘余溶液;d)取40~60mg胃蛋白酶干粉溶解在已預(yù)熱至36~38℃的酶緩沖液中,浸入消化20~30min;e)在純化水中浸泡1~2min,依次在85%乙醇、70%乙醇、純化水中梯度脫水,各0.5~2min,干燥備用。

所述步驟c)中所述預(yù)處理液為0.9~1.1mol/l的硫氰酸鈉溶液。

所述酶緩沖液為0.01mol/l的稀鹽酸,室溫下的ph值為2.0±0.2。

所述掃描的結(jié)果中有異質(zhì)性的特征為有融合細(xì)胞。

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