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用于克隆茶樹LOB基因的引物及其克隆方法和應(yīng)用與流程

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用于克隆茶樹LOB基因的引物及其克隆方法和應(yīng)用與流程

本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域,尤其是茶樹lob基因、用于克隆茶樹lob基因的引物及其克隆方法和應(yīng)用。



背景技術(shù):

高等植物的頂端生長(zhǎng)以及眾多側(cè)生器官的相繼分化和發(fā)育,是高等植物最基本的生長(zhǎng)發(fā)育問題,直接關(guān)系到植株各部分器官的組成、個(gè)體的大小和經(jīng)濟(jì)價(jià)值的高低,因而成為近年來(lái)植物功能基因組研究的一個(gè)重要熱點(diǎn)。

植物的莖尖分生組織(sam,shootapicalmeristem)是位于生長(zhǎng)點(diǎn)的一群細(xì)胞,它從胚胎的形態(tài)發(fā)生之初開始啟動(dòng),一直維持分生狀態(tài)并貫穿植物生長(zhǎng)發(fā)育的始終。莖尖分生組織的維持需要在中央?yún)^(qū)莖細(xì)胞和周邊區(qū)生成細(xì)胞之間保持一種平衡,這種平衡的打破往往導(dǎo)致側(cè)生器官原基的啟動(dòng)和形成。

高等植物的側(cè)枝、葉片、花序、花器官等均為側(cè)生器官。植物的側(cè)生器官邊界區(qū)(lateralorganboundariesdomain,lbd)將葉片等側(cè)生器官(分化細(xì)胞)與頂端分生組織(干細(xì)胞)分隔開,確保器官的形成和干細(xì)胞的維持。此外,器官邊界區(qū)產(chǎn)成側(cè)生分生組織,進(jìn)而形成側(cè)芽,影響植物株型的建成。lbd基因是最近在高等植物中發(fā)現(xiàn)的為植物所特有的一類新的基因,含有保守的lob(lateralorganboundaries)結(jié)構(gòu)域,lob基因是植物所特有的一個(gè)基因。但由于邊界區(qū)細(xì)胞數(shù)量較少,表型不易觀察,因此對(duì)邊界區(qū)形成的正反向遺傳學(xué)研究都很困難,使得我們對(duì)邊界區(qū)形成的調(diào)控機(jī)理知之甚少。

茶葉對(duì)現(xiàn)代疾病如高血壓、糖尿病、輻射病、心臟病、心血管病、帕金森病、癌癥和肥胖癥等有一定的藥理功效。茶多酚是茶樹中主要的次生代謝產(chǎn)物,兒茶素約占茶多酚總量的70%。兒茶素生物合成主要涉及的酶類有pal、c4h、4cl、chs、chi、f3h、f3’h、f3’5’h、dfr、lar、ans和anr等,已有研究結(jié)果表明,pal、f3h、lar和dfr的表達(dá)量隨葉片成熟度增加而逐漸下降:在新芽表達(dá)量最高,新葉次之,老葉最少。

研究發(fā)現(xiàn)擬南芥、甜橙、亞麻薺等植物的lob基因均對(duì)植物地上部、地下部的特定器官的形成與發(fā)育具有重要影響,但對(duì)茶樹中相關(guān)lob基因的研究以及l(fā)ob基因與兒茶素合成的關(guān)系的研究還沒有報(bào)道,因此對(duì)茶樹lob基因的克隆及其他分子研究尤為重要。

主要的技術(shù)文獻(xiàn)有:bowmanj.l.,andeshedy.,2000,formationandmaintenanceoftheshootapicalmeristem,trendsplantsci.,5(3):110-115;aida,m.,ishida,t.,tasaka,m.,1999.shootapicalmeristemandcotyledonformationduringarabidopsisembryogenesis,interactionamongthecupshapedcotyledonandshootmeristemlessgenes.development126,1563–1570;clarks.e.,2001,meristems:startyoursignaling,curr.cpin.plantbiol.,4(1):28-32;iwakawah.,uenoy.,semiartie.,onouchih.,kojimas.,tsukayah.,hasebem.,somat.,ikezakim.,machidac.,andmachiday.,2002,theasymmetricleaves2geneofarabidopsisthaliana,requiredforformationofasymmet-ricflatleaflamina,encodesamemberofanovelfamilyofproteinscharacterizedbycysteinerepeatsandaleucinezipper,plantcellphysiol.,43(5):467-478;chalfun-juniora.,frankenj.,mesj.j.,marsch-martinezn.,pereiraa.,andangenentg.c.,2005,asymmetricleaves-like1gene,amemberoftheas2/lobfamily,controlsproximal-distalpatterninginarabidopsispetals,plantmol.biol.,57(4):559-575;liuh.j.,wangs.f.,yux.b.,yuj.,hex.w.,zhangs.l.,shouh.x.,andwup.,2005,arl1,alob-domainproteinrequiredforadventitiousrootformationinrice,plantj.,43(1):47-56;abe,m.,2003.regμulationofshootepidermalcelldifferentiationbyapairofhomeodomainproteinsinarabidopsis.development130,635-643.



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

本發(fā)明要解決的第一個(gè)技術(shù)問題是提供一種用于克隆茶樹lob基因保守域的引物及其克隆方法,其核苷酸序列為seqidno.1,氨基酸序列為seqidno.2。為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用以下技術(shù)方案:

首先利用ncbi的entrez檢索系統(tǒng),查找到一條擬南芥lob基因的氨基酸序列,具有seqidno.3所述的氨基酸序列。隨后利用這一序列使用blastp(通過(guò)蛋白查查找蛋白),在整個(gè)nr數(shù)據(jù)庫(kù)中查找與之相似的其它物種的氨基酸序列。

將搜索到的同一基因的不同氨基酸序列進(jìn)行多序列比對(duì),可選工具clustalw。通過(guò)序列比對(duì),確定兩個(gè)相距47個(gè)氨基酸的保守區(qū)域,氨基酸序列分別為seqidno.4和seqidno.5所述的氨基酸序列。得到保守區(qū)域后,利用primer5.0進(jìn)行簡(jiǎn)并引物的設(shè)計(jì)。將參與多序列比對(duì)的序列中的任一條導(dǎo)入primer5.0中,再將其翻譯成核苷酸序列,有密碼子簡(jiǎn)并性,其結(jié)果是有n多條彼此只相差一個(gè)核苷酸的序列群,該群可用一條有簡(jiǎn)并性的核苷酸鏈來(lái)表示(其中r=a/g,y=c/t,m=a/c,k=g/t,s=c/g,w=a/t,h=a/c/t,b=c/g/t,v=a/c/g,d=a/g/t,n=a/c/g/t),在primer5.0中修改參數(shù),令其在兩個(gè)距離合適的保守的nt區(qū)域內(nèi)尋找引物對(duì),要保證上下游引物都落在該簡(jiǎn)并鏈的保守區(qū)域內(nèi)。

基于上述步驟,本發(fā)明提供的克隆茶樹lob基因保守域的引物組為:

lob-degenerate-f:5’-tgygcbgcstgcaartt-3’

lob-degenerate-r:5’-gakatdgcdccdacrcagcc-3’

克隆茶樹lob基因保守域的方法包括如下步驟:提取龍井長(zhǎng)葉rna,按照takaraprimescripttmii1ststrandcdnasynthesiskit的方法將上述rna進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄得到cdna,以該cdna為模板,lob-degenerate-f為上游引物,lob-degenerate-r為下游引物進(jìn)行pcr。獲得茶樹lob基因保守域的核苷酸序列,即seqidno.1。

本發(fā)明要解決的第二個(gè)技術(shù)問題是提供擴(kuò)增茶樹lob基因5’末端、3’末端全長(zhǎng)的特異性引物組。根據(jù)已得到的茶樹lob基因保守序列核苷酸序列,設(shè)計(jì)得到5’和3’末端擴(kuò)增反應(yīng)所需的引物組,其特征如下:

5’raceouterprimer:5’-catggctacatgctgacagccta-3’

5’raceinnerprimer:5’-cgcggatccacagcctactgatgatcagtcgatg-3’

cslob-5’race-gsp1:5’-aggagttgactgcgtcttcacgttggtg-3’

cslob-5’race-gsp2:5’-gagcttcgtgacgttgcttgctccaaag-3’

3’raceouterprimer:5’-taccgtcgttccactagtgattt-3’

3’raceouterprimer:5’-cgcggatcctccactagtgatttcactatagg-3’

cslob-3’race-gsp1:5’-tgcaagtttcttcgccggaaatgcatgc-3’

cslob-3’race-gsp2:5’-gagccacacaaattcgccaacgtccac-3’

本發(fā)明要解決的第三個(gè)技術(shù)問題是提供一種用于克隆茶樹lob基因全長(zhǎng)序列的引物組及該基因的克隆方法,其特征在于用于該基因的引物分別為cslob-f(seqidno.6)和cslob-r(seqidno.7),該基因的核苷酸序列為seqidno.8。為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用以下技術(shù)方案:

(1)茶樹lob基因5’末端擴(kuò)增反應(yīng)

首先以takara5’-fullracekit提供的5’raceouterprimer和基因特異引物cslob-5’race-gsp1為引物,龍井長(zhǎng)葉cdna為模板,進(jìn)行5’末端outerpcr反應(yīng);然后再以5’raceinnerprime和基因特異引物cslob-5’race-gsp2為引物,以0.5μlouterpcr產(chǎn)物為模板,進(jìn)行茶樹lob基因5’末端innerpcr反應(yīng)。

(2)茶樹lob基因3’末端擴(kuò)增反應(yīng)

首先以takara3’-fullracekit提供的3’raceouterprimer和基因特異引物cslob-3’race-gsp1為引物,龍井長(zhǎng)葉cdna為模板,進(jìn)行3’末端outerpcr反應(yīng);然后再以3’raceinnerprimer和基因特異引物cslob-3’race-gsp2為引物,以0.5μlouterpcr產(chǎn)物為模板,進(jìn)行茶樹lob基因3’末端innerpcr反應(yīng)。

(3)茶樹lob基因全長(zhǎng)cdna擴(kuò)增

根據(jù)茶樹lob基因5’和3’末端測(cè)序結(jié)果分別設(shè)計(jì)了正向引物cslob-f和反向引物cslob-r,以龍井長(zhǎng)葉cdna為模板,擴(kuò)增茶樹lob基因全長(zhǎng)序列。

本發(fā)明要解決的第四個(gè)技術(shù)問題是提供一種用于lob基因熒光定量rt-pcr的引物組,其特征在于用于定量pcr的引物分別為cslob-qrt-f(seqidno.9)和cslob-qrt-r(seqidno.10),內(nèi)參基因引物分別為csgapdh-qrt-f(seqidno.11)和csgapdh-qrt-r(seqidno.12)。為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用以下技術(shù)方案:

提取龍井長(zhǎng)葉不同組織(芽,第一葉,第二葉,老葉)的rna,按照takaraprimescripttmii1ststrandcdnasynthesiskit的方法將上述rna進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄(20μl逆轉(zhuǎn)錄體系加入1μg的totalrna)得到cdna,以該cdna為模板,分別以cslob-qrt-f/cslob-qrt-r和csgapdh-qrt-f/csgapdh-qrt-r引物組,按照sybrpremixextaqii染料法熒光定量試劑盒的方法配制pcr反應(yīng)液,分析不同組織中l(wèi)ob的表達(dá)量。

本發(fā)明的有益效果是:本發(fā)明根據(jù)已知其它物種lob基因的氨基酸及核苷酸序列設(shè)計(jì)得到擴(kuò)增茶樹lob基因保守序列的引物,再根據(jù)擴(kuò)增得到的茶樹lob基因保守序列,擴(kuò)增茶樹lob基因的5’和3’末端序列,最終首次獲得茶樹lob基因全長(zhǎng)序列。通過(guò)克隆茶樹lob基因的引物組和克隆方法,它能快速準(zhǔn)確地克隆茶樹lob基因的全序列。已有研究表明,不同發(fā)育階段茶鮮葉中,新芽的兒茶素合成相關(guān)基因表達(dá)量最高,第一葉次之,成熟葉片中明顯低于第一葉。熒光定量pcr檢測(cè)結(jié)果表明,茶樹芽中l(wèi)ob的表達(dá)量最少,老葉中表達(dá)量相對(duì)較高,這一結(jié)果與兒茶素積累量是相反的,可能是由于lob對(duì)兒茶素的合成起負(fù)調(diào)控作用。本發(fā)明為后續(xù)茶樹lob基因的確切功能和參與的兒茶素代謝調(diào)控途徑等知識(shí)的研究奠定基礎(chǔ)。

附圖說(shuō)明

圖1為不同植物(擬南芥、亞麻薺、蕪菁、甜橙、甘藍(lán)型油菜等)lob氨基酸序列比對(duì)圖。

圖2為cslob3’-race末端擴(kuò)增的瓊脂糖凝膠電泳圖。

圖3為cslob5’-race末端擴(kuò)增的瓊脂糖凝膠電泳圖。

圖4為擴(kuò)增茶樹lob基因全長(zhǎng)cdna的瓊脂糖凝膠電泳圖。

圖5為茶樹不同組織(芽、第一葉、第二葉、老葉)中l(wèi)ob定量pcr圖。

具體實(shí)施方式

下面結(jié)合具體實(shí)施方案對(duì)本發(fā)明做進(jìn)一步的說(shuō)明,這些實(shí)施例應(yīng)被理解為僅為本發(fā)明的最佳實(shí)例,而非以任何方式限制本發(fā)明,凡在本發(fā)明原則之內(nèi)所做的任何改進(jìn)、修飾和等同替換,均應(yīng)包含在本發(fā)明的范圍之內(nèi)。

實(shí)施例1:龍井長(zhǎng)葉totalrna的提取

取龍井長(zhǎng)葉葉片組織2g于液氮中研磨,按照柱式小量植物組織抽提試劑盒說(shuō)明,提取totalrna,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)質(zhì)量符合要求后,凍存?zhèn)溆谩?/p>

實(shí)施例2:茶樹lob基因保守域擴(kuò)增反應(yīng)

根據(jù)已知其它物種lob基因的氨基酸及核苷酸序列設(shè)計(jì)得到擴(kuò)增茶樹lob基因保守序列的引物lob-degenerate-f和lob-degenerate-r,以龍井長(zhǎng)葉cdna為模板,擴(kuò)增茶樹lob基因保守域的序列。反應(yīng)程序?yàn)?4℃3min,94℃30s,58℃30s,72℃30s,35cycles,72℃10min。

根據(jù)已知其它物種lob基因的氨基酸及核苷酸序列設(shè)計(jì)得到擴(kuò)增茶樹lob基因保守序列的引物lob-degenerate-f和lob-degenerate-r具體是:首先利用ncbi的entrez檢索系統(tǒng),查找到一條擬南芥lob基因的氨基酸序列,具有seqidno.3所述的氨基酸序列。隨后利用這一序列使用blastp(通過(guò)蛋白查查找蛋白),在整個(gè)nr數(shù)據(jù)庫(kù)中查找與之相似的其它物種的氨基酸序列。

將搜索到的同一基因的不同氨基酸序列進(jìn)行多序列比對(duì),可選工具clustalw,其結(jié)果圖如圖1所示。通過(guò)序列比對(duì),確定兩個(gè)相距47個(gè)氨基酸的保守區(qū)域,氨基酸序列分別為seqidno.4和seqidno.5所述的氨基酸序列。得到保守區(qū)域后,利用primer5.0進(jìn)行簡(jiǎn)并引物的設(shè)計(jì)。將參與多序列比對(duì)的序列中的任一條導(dǎo)入primer5.0中,再將其翻譯成核苷酸序列,有密碼子簡(jiǎn)并性,其結(jié)果是有n多條彼此只相差一個(gè)核苷酸的序列群,該群可用一條有簡(jiǎn)并性的核苷酸鏈來(lái)表示(其中r=a/g,y=c/t,m=a/c,k=g/t,s=c/g,w=a/t,h=a/c/t,b=c/g/t,v=a/c/g,d=a/g/t,n=a/c/g/t),在primer5.0中修改參數(shù),令其在兩個(gè)距離合適的保守的nt區(qū)域內(nèi)尋找引物對(duì),要保證上下游引物都落在該簡(jiǎn)并鏈的保守區(qū)域內(nèi)。

實(shí)施例3:茶樹lob基因5’末端擴(kuò)增反應(yīng)

a、totalrna去磷酸化處理

按照takara5’-fullracekit說(shuō)明,使用alkalinephosphatase(ciap)對(duì)totalrna中裸露的5’磷酸基團(tuán)進(jìn)行去磷酸反應(yīng)。去磷酸反應(yīng)液體系為茶樹totalrna(1μg/μl)1μl,rnaseinhibitor(40u/μl)1μl,10×alkalinephosphatasebuffer(mgcl2free)5μl,alkalinephosphatase(calfintestine)(16u/μl)0.6μl,rnasefreedh2o46.9μl。50℃反應(yīng)1小時(shí)后。向上述反應(yīng)液中加入20μl的3mch3coona(ph5.2),130μl的rnasefreedh2o,充分混勻。再加入200μl的苯酚/氯仿/異戊醇(25:24:1),充分混勻后13,000×g室溫離心5min,將上層水相轉(zhuǎn)移至新的microtube中。再加入200μl的氯仿,充分混勻后13,000×g室溫離心5min,將上層水相轉(zhuǎn)移至新的microtube中。加入2μl的nacarrier均勻混合后,加入200μl的異丙醇,冰上冷卻10min,13,000×g4℃離心20min,棄上清,加入500μl70%的乙醇漂洗,13,000×g4℃離心5min,棄上清后干燥,最后加入7μl的rnasefreedh2o溶解沉淀,得到ciap-treatedrna。

b、mrna“去帽子”反應(yīng)。

使用tobaccoacidpyrophosphatase(tap)去掉mrna的5’帽子結(jié)構(gòu),保留一個(gè)磷酸基團(tuán)。反應(yīng)體系為ciap-treatedrna7μl,rnaseinhibitor(40u/μl)1μl,10×tapreactionbuffer1μl,tobaccoacidpyrophosphatase(0.5u/μl)1μl,37℃反應(yīng)1小時(shí),得到ciap/tap-treatedrna。

c、5’raceadaptor的連接

首先配置下列溶液:ciap/tap-treatedrna5μl,5’raceadaptor(15μm)1μl,rnasefreedh2o4μl。上述溶液65℃反應(yīng)1小時(shí)后,加入20μl的3mch3coona(ph5.2),140μl的rnasefreedh2o,充分混勻。再加入200μl的苯酚/氯仿/異戊醇(25:24:1),充分混勻后13,000×g室溫離心5min,將上層水相轉(zhuǎn)移至新的microtube中。再加入200μl的氯仿,充分混勻后13,000×g室溫離心5min,將上層水相轉(zhuǎn)移至新的microtube中。加入2μl的nacarrier均勻混合后,加入200μl的異丙醇,冰上冷卻10min,13,000×g4℃離心20min,棄上清,加入500μl70%的乙醇漂洗,13,000×g4℃離心5min,棄上清后干燥,最后加入6μl的rnasefreedh2o溶解沉淀,得到ligatedrna。

d、反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。

反應(yīng)體系為ligatedrna6μl,random9mers(50μm)0.5μl,dntp(10mmeach)1μl,rnaseinhibitor(40u/μl)0.25μl,reversetranscriptasem-mlv(rnaseh-)(200u/μl)0.25μl。反應(yīng)條件為30℃10min,42℃1hr,72℃15min,即可得到用于擴(kuò)增5’末端的龍井長(zhǎng)葉cdna。

e、outerpcr反應(yīng)。

以takara5’-fullracekit提供的5’raceouterprimer和基因特異引物cslob-5’race-gsp1為引物,龍井長(zhǎng)葉cdna為模板,進(jìn)行5’末端outerpcr反應(yīng);擴(kuò)增體系為龍井長(zhǎng)葉cdna2μl,1×cdnadilutionbufferii8μl,10×lapcrbuffer(mg2+free)4μl,mgcl2(25mm)3μl,takaralataq(5u/μl)0.25μl,cslob-5’race-gsp1(10μm)2μl,5’raceouterprimer(10μm)2μl,dh2o28.75μl。pcr反應(yīng)條件為94℃3min,94℃30s,55℃30s,72℃1min,20cycles,72℃10min。

f、innerpcr反應(yīng)。

以5’raceinnerprimer和基因特異引物cslob-5’race-gsp2為引物,以1μlouterpcr產(chǎn)物為模板,進(jìn)行茶樹lob基因5’末端innerpcr反應(yīng)。反應(yīng)體系和擴(kuò)增程序同outerpcr反應(yīng)。pcr產(chǎn)物經(jīng)電泳檢測(cè),結(jié)果如圖2所示。

實(shí)施例4:茶樹lob基因3’末端擴(kuò)增反應(yīng)

a、反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。

反應(yīng)體系為totalrna(500ng/μl)1μl,3’raceadaptor(5μm)1μl,5×primescriptbuffer2μl,dntpmixture(10mmeach)1μl,rnaseinhibitor(40u/μl)0.25μl,primescriptrtase(200u/μl0.25μl)0.25μl,rnasefreedh2o4.5μl。反應(yīng)條件42℃60min,70℃15min,反應(yīng)結(jié)束即得到用于擴(kuò)增3’末端的龍井長(zhǎng)葉cdna。

b、outerpcr反應(yīng)。

以takara3’-fullracekit提供的3’raceouterprimer和基因特異引物cslob-3’race-gsp1為引物,龍井長(zhǎng)葉cdna為模板,進(jìn)行3’末端outerpcr反應(yīng);擴(kuò)增體系為龍井長(zhǎng)葉cdna2μl,1×cdnadilutionbufferii8μl,10×lapcrbuffer(mg2+free)4μl,mgcl2(25mm)3μl,takaralataq(5u/μl)0.25μl,cslob-3’race-gsp1(10μm)2μl,3’raceouterprimer(10μm)2μl,dh2o28.75μl。pcr反應(yīng)條件為94℃3min,94℃30s,55℃30s,72℃1min,20cycles,72℃10min。

c、innerpcr反應(yīng)。

以3’raceinnerprimer和基因特異引物cslob-3’race-gsp2為引物,以1μlouterpcr產(chǎn)物為模板,進(jìn)行茶樹lob基因3’末端innerpcr反應(yīng)。反應(yīng)體系和擴(kuò)增程序同outerpcr反應(yīng)。pcr產(chǎn)物經(jīng)電泳檢測(cè),結(jié)果如圖3所示。

實(shí)施例5:茶樹lob基因全長(zhǎng)cdna序列擴(kuò)增。

根據(jù)茶樹lob基因5’和3’末端測(cè)序結(jié)果分別設(shè)計(jì)了正向引物cslob-f和反向引物cslob-r,以龍井長(zhǎng)葉cdna為模板,擴(kuò)增茶樹lob基因全長(zhǎng)序列。反應(yīng)程序?yàn)?4℃3min,94℃30s,58℃30s,72℃30s,35cycles,72℃10min。pcr產(chǎn)物電泳結(jié)果如圖4所示。

實(shí)施例6:pcr產(chǎn)物的克隆純化與篩選。

pcr產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳后,用膠回收試劑盒對(duì)pcr產(chǎn)物進(jìn)行回收,經(jīng)純化后與takara公司t載體pmd18-tvector進(jìn)行連接,用熱激法導(dǎo)入大腸桿菌dh5α感受態(tài)中并在氨芐青霉素平板上篩選陽(yáng)性克隆。分子檢測(cè)確定后的陽(yáng)性克隆子送杭州擎科生物公司完成測(cè)序。

實(shí)施例7:熒光定量pcr檢測(cè)茶樹不同組織中l(wèi)ob的表達(dá)量

提取龍井長(zhǎng)葉不同組織(芽,第一葉,第二葉,老葉)的rna,按照takaraprimescripttmii1ststrandcdnasynthesiskit的方法將上述rna進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄(20μl逆轉(zhuǎn)錄體系加入1μg的totalrna)得到cdna,以該cdna為模板,利用本發(fā)明所述的引物cslob-qrt-f、cslob-qrt-r、csgapdh-qrt-f和csgapdh-qrt-r為引物,按照下列組分配制pcr反應(yīng)液:premixextaqtmii10μl,pcrforwardprimer(10μm)0.8μl,reverseprimer(10μm)0.8μl,cdna1μl,dh2o7.4μl。

pcr擴(kuò)增程序如下:94℃3min,94℃20s,58℃20s,72℃20s,40cycles,72℃收集熒光,結(jié)果如圖5所示。

seqidno.1:

tgcgcggcgtgcaagtttcttcgccggaaatgcatgccgggatgcatattcgcgccatattttccaccggaggagccacacaaattcgccaacgtccacaaaatctttggagcaagcaacgtcacgaagctcctcaacgagctcctccctcaccaacgtgaagacgcagtcaactccttagcctatgaggccgaggcacgtgtccgtgaccccgtctatggctgcgtaggcgccatctc

seqidno.2:

caackflrrkcmpgcifapyfppeephkfanvhkifgasnvtkllnellphqredavnslayeaearvrdpvygcvgai

seqidno.3:

masssnsynspcaackflrrkcmpgcifapyfppeephkfanvhkifgasnvtkllnellphqredavnslayeaearvrdpvygcvgaisylqrqvhrlqkeldaanadlahyglstsaagapgnvvdlvfqpqplpsqqlpplnpvyrlsgaspvmnqmprgtggsygtflpwnnghdqqggnm

seqidno.4:spcaackflrrkc

seqidno.5:slayeaearv

seqidno.6:atggcgtcgtcatcaaactcatacaac

seqidno.7:tcaaatatttcctccagaagggctattg

seqidno.8:

atggcgtcgtcatcaaactcatacaactcaacatgcgcggcgtgcaagtttcttcgccggaaatgcatgccgggatgcatattcgcgccatattttccaccggaggagccacacaaattcgccaacgtccacaaaatcttcggcgcaagcaacataagtaagctcctcaatgaaatcctccctcaccaaagagatgatgcagtgagttccctcgcctacgaagccgaagcacgagtgcgagatccagtgtacggttgtgttggtgctatctccttcctccaaagacaggttgagaagctccagaaagatctagaagtcgccaatgccaatttgattcactga

seqidno.9:5’-gaaatcctccctcaccaaagag-3’

seqidno.10:5’-aggagatagcaccaacacaac-3’

seqidno.11:5’-ttggcatcgttgagggtct-3’

seqidno.12:5’-cagtgggaacacggaaagc-3’

sequencelisting

<110>浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院

<120>用于克隆茶樹lob基因的引物及其克隆方法

<130>1

<160>12

<170>patentinversion3.3

<210>1

<211>239

<212>dna

<213>人工合成

<400>1

tgcgcggcgtgcaagtttcttcgccggaaatgcatgccgggatgcatattcgcgccatat60

tttccaccggaggagccacacaaattcgccaacgtccacaaaatctttggagcaagcaac120

gtcacgaagctcctcaacgagctcctccctcaccaacgtgaagacgcagtcaactcctta180

gcctatgaggccgaggcacgtgtccgtgaccccgtctatggctgcgtaggcgccatctc239

<210>2

<211>79

<212>prt

<213>人工合成

<400>2

cysalaalacyslyspheleuargarglyscysmetproglycysile

151015

phealaprotyrpheproproglugluprohislysphealaasnval

202530

hislysilepheglyalaserasnvalthrlysleuleuasngluleu

354045

leuprohisglnarggluaspalavalasnserleualatyrgluala

505560

glualaargvalargaspprovaltyrglycysvalglyalaile

657075

<210>3

<211>186

<212>prt

<213>人工合成

<400>3

metalaserserserasnsertyrasnserprocysalaalacyslys

151015

pheleuargarglyscysmetproglycysilephealaprotyrphe

202530

proproglugluprohislysphealaasnvalhislysilephegly

354045

alaserasnvalthrlysleuleuasngluleuleuprohisglnarg

505560

gluaspalavalasnserleualatyrglualaglualaargvalarg

65707580

aspprovaltyrglycysvalglyalailesertyrleuglnarggln

859095

valhisargleuglnlysgluleuaspalaalaasnalaaspleuala

100105110

histyrglyleuserthrseralaalaglyalaproglyasnvalval

115120125

aspleuvalpheglnproglnproleuproserglnglnleupropro

130135140

leuasnprovaltyrargleuserglyalaserprovalmetasngln

145150155160

metproargglythrglyglysertyrglythrpheleuprotrpasn

165170175

asnglyhisaspglnglnglyglyasnmet

180185

<210>4

<211>13

<212>prt

<213>人工合成

<400>4

serprocysalaalacyslyspheleuargarglyscys

1510

<210>5

<211>10

<212>prt

<213>人工合成

<400>5

serleualatyrglualaglualaargval

1510

<210>6

<211>27

<212>dna

<213>人工合成

<400>6

atggcgtcgtcatcaaactcatacaac27

<210>7

<211>28

<212>dna

<213>人工合成

<400>7

tcaaatatttcctccagaagggctattg28

<210>8

<211>342

<212>dna

<213>人工合成

<400>8

atggcgtcgtcatcaaactcatacaactcaacatgcgcggcgtgcaagtttcttcgccgg60

aaatgcatgccgggatgcatattcgcgccatattttccaccggaggagccacacaaattc120

gccaacgtccacaaaatcttcggcgcaagcaacataagtaagctcctcaatgaaatcctc180

cctcaccaaagagatgatgcagtgagttccctcgcctacgaagccgaagcacgagtgcga240

gatccagtgtacggttgtgttggtgctatctccttcctccaaagacaggttgagaagctc300

cagaaagatctagaagtcgccaatgccaatttgattcactga342

<210>9

<211>22

<212>dna

<213>人工合成

<400>9

gaaatcctccctcaccaaagag22

<210>10

<211>21

<212>dna

<213>人工合成

<400>10

aggagatagcaccaacacaac21

<210>11

<211>19

<212>dna

<213>人工合成

<400>11

ttggcatcgttgagggtct19

<210>12

<211>19

<212>dna

<213>人工合成

<400>12

cagtgggaacacggaaagc19

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