本發(fā)明涉及α-淀粉酶的變體、編碼這些變體的多核苷酸和產(chǎn)生這些變體的方法。
背景技術(shù):
1、α-淀粉酶(α-1,4-葡聚糖-4-葡聚糖水解酶,e.c.3.2.1.1)由一組酶構(gòu)成,這些酶催化淀粉以及其他直鏈和支鏈1,4-糖苷寡糖和多糖的水解。
2、α-淀粉酶在工業(yè)上用于若干種已知應(yīng)用的用途具有悠久歷史,這些應(yīng)用如洗滌劑、烘焙、釀造、淀粉液化和糖化,例如在高果糖糖漿的制備中或用作從淀粉生產(chǎn)乙醇的一部分。α-淀粉酶的這些應(yīng)用和其他應(yīng)用是已知的并且利用了衍生自微生物的α-淀粉酶,特別是細菌α-淀粉酶。
3、屬于首先被使用的細菌α-淀粉酶是來自地衣芽孢桿菌(b.licheniformis)的α-淀粉酶,還稱作termamyl,該termamyl已經(jīng)被充分表征并且這種酶的晶體結(jié)構(gòu)已經(jīng)被確定。堿性淀粉酶(如aa560)形成已經(jīng)發(fā)現(xiàn)用于洗滌劑中的一個特定組的α-淀粉酶。這些已知的細菌淀粉酶中許多已經(jīng)經(jīng)修飾以改善它們在特定應(yīng)用中的功能性。
4、芽孢桿菌屬淀粉酶,如termamyl、aa560(wo?2000/060060)和sp707(由tsukamoto等人,1988,biochem.biophys.res.comm.[生物化學和生物物理研究通訊]151:25-31描述)形成已經(jīng)發(fā)現(xiàn)用于洗滌劑中的一個特定組的α-淀粉酶。已經(jīng)對這些淀粉酶進行修飾以改進其在洗滌劑中的穩(wěn)定性。例如wo?96/23873披露了缺失sp707(wo?96/23873的seq?id?no:7)的氨基酸181+182或氨基酸183+184以改進此淀粉酶的穩(wěn)定性。wo?96/23873進一步披露了通過用例如亮氨酸取代m202來修飾sp707淀粉酶以使該分子對氧化保持穩(wěn)定。因而,修飾淀粉酶來改進某些特性是已知的。
5、出于環(huán)境原因,在洗滌、餐具洗滌和/或清潔過程中降低溫度已經(jīng)日益重要。然而,大多數(shù)酶(包括淀粉酶)具有在低溫洗滌中通常所用的溫度以上的最適溫度。α-淀粉酶是用于洗滌劑組合物中的關(guān)鍵酶并且對于衣物洗滌或餐具洗滌期間去除淀粉污漬,其用途已經(jīng)變得日益重要。因此,重要的是找到如下α-淀粉酶變體,它們在溫度降低時保留其洗滌性能、污漬去除作用和/或活性。然而,盡管當前洗滌劑酶組合物的效率,仍然存在著難以完全去除的許多污漬。這些問題因低(例如,冷水)洗滌溫度的增加使用和較短的洗滌周期而加劇。因而,需要獲得這樣的淀粉分解酶,這些酶可以在低溫下發(fā)揮功能并同時保留或增加其他所希望的特性如比活性(淀粉分解活性)、穩(wěn)定性和/或洗滌性能。
6、因此,本發(fā)明的一個目的是提供可在低溫如在5℃-40℃用于洗滌、餐具洗滌和/或清潔過程中的α-淀粉酶變體。本發(fā)明的另一個目的是提供與親本α-淀粉酶相比或與seq?idno:1、2、3、4、5、6、7或8中任一項的α-淀粉酶相比在低溫具有改進的洗滌性能的α-淀粉酶變體。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明涉及親本α-淀粉酶的變體,其中該變體包含(i)在對應(yīng)于seq?id?no:1中所示的氨基酸序列的109、1、7、280、284、320、323和391的一個或多個位置處的修飾,以及任選地在對應(yīng)于seq?id?no:1中所示的氨基酸序列的位置140、181、182、183、184、195、206、243、260、304和476的一個或多個位置中的修飾,(ii)該變體與seq?id?no:1、2、3、4、5、6、7或8中所示的氨基酸序列具有至少80%,如至少90%、如至少95%、如至少97%,但小于100%的序列同一性,并且(iii)該變體具有α-淀粉酶活性。
2、本發(fā)明還涉及編碼根據(jù)本發(fā)明的變體的多核苷酸、包含編碼根據(jù)本發(fā)明的變體的多核苷酸的核酸構(gòu)建體、包含編碼根據(jù)本發(fā)明的變體的多核苷酸的表達載體、和包含編碼根據(jù)本發(fā)明的變體的多核苷酸的宿主細胞。
3、本發(fā)明還涉及產(chǎn)生α-淀粉酶變體的方法,該方法包括:(a)在適合于該變體表達的條件下培養(yǎng)本發(fā)明的宿主細胞;和(b)回收該變體。
4、本發(fā)明進一步涉及獲得α-淀粉酶變體的方法,該方法包括:在對應(yīng)于seq?id?no:1中所示的氨基酸序列的109、7、1、391、280、284、320和323的一個或多個位置處,以及任選地在對應(yīng)于seq?id?no:1中所示的氨基酸序列的位置140、181、182、183、184、195、206、243、260、304和476的一個或多個位置中向親本α-淀粉酶引入修飾,其中各修飾獨立地為取代或缺失,且該變體具有α-淀粉酶活性;以及回收該變體。
5、本技術(shù)進一步涉及以下實施方案:
6、1.一種親本α-淀粉酶的變體,其中所述變體包含
7、(i)在對應(yīng)于seq?id?no:1中所示的氨基酸序列的位置109、1、7、280、284、320、323和391的一個或多個位置處的修飾,以及任選地在對應(yīng)于seq?id?no:1中所示的氨基酸序列的位置140、181、182、183、184、195、206、243、260、304和476的一個或多個位置中的修飾,
8、(ii)所述變體與seq?id?no:1、2、3、4、5、6、7或8中所示的氨基酸序列具有至少80%,如至少90%、如至少95%、如至少97%,但小于100%的序列同一性,并且
9、(iii)所述變體具有α-淀粉酶活性。
10、2.根據(jù)實施方案1所述的變體,其中該修飾是缺失或取代。
11、3.根據(jù)前述實施方案中任一項所述的變體,其中所述變體在對應(yīng)于seq?id?no:1中所示的氨基酸序列的位置109、1、7、280、284、320、323和391的至少一個位置中包含修飾。
12、4.根據(jù)前述實施方案中任一項所述的變體,其中所述變體在對應(yīng)于seq?id?no:1中所示的氨基酸序列的位置109、1、7、140、181、182、183、184、195、206、243、260、280、284、304、320、323、391和476的至少一個位置中包含修飾。
13、5.根據(jù)前述實施方案中任一項所述的變體,其中所述一個或多個修飾是取代。
14、6.根據(jù)實施方案1至4中任一項所述的變體,其中所述一個或多個修飾中的至少一個是缺失。
15、7.根據(jù)前述實施方案中任一項所述的變體,其中所述變體包含選自下組的至少兩個位置中的修飾,該組由以下組成:1、109和391。
16、8.根據(jù)前述實施方案中任一項所述的變體,其中所述一個或多個修飾選自下組,該組由以下組成:x1*、x1a、x7a、x7k、x7e、x7n、x7q、x7l、x7d、x109a、x109s、x140y、x181*、x182*、x183*、x184*、x195f、x206y、x243f、x260g、x280s、x284h、x284r、x284f、x304r、x320a、x320m、x320t、x320v、x320s、x323n、x323r、x323s、x323k、x391a、x391v和x476k。
17、9.根據(jù)前述實施方案中任一項所述的變體,其中所述變體具有改進的性能,如改進的洗滌性能。
18、10.根據(jù)前述實施方案中任一項所述的變體,其中所述變體與該親本α-淀粉酶的氨基酸序列具有至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%,但小于100%的序列同一性。
19、11.根據(jù)前述實施方案中任一項所述的變體,其中修飾的數(shù)目為1至30,例如1至20,例如1至10和1至5,如1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個修飾。
20、12.根據(jù)前述實施方案中任一項所述的變體,其中所述變體在選自下組位置的位置中包含修飾,該組由以下組成:x1+x7;x1+x109;x1+x280;x1+x284;x1+x320;x1+x323;x1+x391;x109+x280;x109+x284;x109+x320;x109+x323;x109+x391;x7+x109;x7+x280;x7+x284;x7+x320;x7+x323;x7+x391;x280+x284;x280+x320;x280+x323;x280+x391;x284+x320;x284+x323;x284+x391;x320+x323;x320+x391;和x323+x391,其中根據(jù)seq?id?no:1進行編號。
21、13.根據(jù)前述實施方案中任一項所述的變體,其中所述變體在對應(yīng)于seq?id?no:2中所示的氨基酸序列的位置的位置中包含修飾,這些修飾選自下組,該組由以下組成:
22、h1*+g109a+n280s+e391a;
23、h1*+g7k+g109a+n280s+e391a;
24、h1*+g7e+g109a+n280s+e391a;
25、h1*+g7n+g109a+n280s+e391a;
26、h1*+g7q+g109a+n280s+e391a;
27、h1*+g7l+g109a+n280s+e391a;
28、h1*+g7d+g109a+n280s+e391a;
29、h1*+g109a+n280s+k320a+e391a;
30、h1*+g109a+n280s+k320m+e391a;
31、h1*+g109a+n280s+k320t+e391a;
32、h1*+g109a+n280s+k320v+e391a;
33、h1*+g109a+n280s+m323r+e391a;
34、h1*+g109a+n280s+k320s+e391a;
35、h1*+g109a+n280s+e391v;
36、h1*+g109a+w284r+e391a;
37、h1*+g109a+w284f+e391a;
38、h1*+g109a+n280s+k320a+m323s+e391a;
39、h1*+g109a+n280s+w284f+e391a;
40、h1*+g109a+n280s+m323n+e391a;
41、h1*+g109a+n280s+m323k+e391a;
42、h1*+g109s+n280s+e391a;
43、h1*+g109a+w284h+e391a;
44、h1*+g109a+n280s+k320a+m323n+e391a;
45、h1*+g7a+g109a+n280s+e391a;
46、h1*+g7a+g109a+n280s+w284h+k320a+m323n+e391a;
47、g7a+w284h+k320a+m323n;
48、g7a+k320a+m323n;
49、k320a;
50、g7a+k320a;
51、h1*+g7a+g109a+n280s+e391a;
52、h1*+g109a+n280s+w284h+e391a;
53、h1*+g109a+n280s+m323s+e391a;
54、h1*+g7a+g109a+n280s+k320a+e391a;
55、h1*+g7a+g109a+n280s+m323s+e391a;
56、h1*+g7a+g109a+n280s+m323n+e391a;
57、h1*+g7a+g109a+n280s+w284f+e391a;
58、h1*+g7a+g109a+n280s+w284r+e391a;
59、h1*+g7a+g109a+n280s+k320a+m323s+e391a;
60、h1*+g7a+g109a+w284r+e391a;和
61、h1*+g7a+g109a+n280s+k320a+m323n+e391a。
62、14.根據(jù)前述實施方案中任一項所述的變體,其中所述親本α-淀粉酶選自seq?idno:1、2、3、4、5、6、7和8中所示的氨基酸序列,或與seq?id?no:1和2中所示的氨基酸序列中的任一項具有至少90%,如至少92%、如至少95%、如至少97%、如至少98%、如至少99%或100%的序列同一性的任何α-淀粉酶。
63、15.根據(jù)前述實施方案中任一項所述的變體,其中所述親本α-淀粉酶包含seq?idno:1和2中所示的氨基酸序列或由其組成。
64、16.一種多核苷酸,該多核苷酸編碼根據(jù)前述實施方案中任一項所述的變體。
65、17.一種核酸構(gòu)建體,該核酸構(gòu)建體包含根據(jù)實施方案16所述的多核苷酸。
66、18.一種表達載體,該表達載體包含根據(jù)實施方案16所述的多核苷酸。
67、19.一種宿主細胞,該宿主細胞包含根據(jù)實施方案16所述的多核苷酸。
68、20.一種產(chǎn)生α-淀粉酶變體的方法,該方法包括:
69、a.在適合于表達所述變體的條件下培養(yǎng)根據(jù)實施方案19所述的宿主細胞;和
70、b.回收所述變體。
71、21.一種用于獲得α-淀粉酶變體的方法,該方法包括在對應(yīng)于seq?id?no:1中所示的氨基酸序列的位置109、1、7、280、284、320、323和391的一個或多個位置處,以及任選地在對應(yīng)于seq?id?no:1中所示的氨基酸序列的位置140、181、182、183、184、195、206、243、260、304和476的一個或多個位置中向親本α-淀粉酶引入修飾,其中各修飾獨立地為取代或缺失,且所述變體具有α-淀粉酶活性;以及回收所述變體。