本發(fā)明涉及分子標記領(lǐng)域,特別涉及影響豬頭長度的豬1號染色體上的snp標記。
背景技術(shù):
1、豬種的選育在養(yǎng)殖業(yè)具有重要的意義,較高的產(chǎn)肉量正不斷被養(yǎng)殖工作者選育。與產(chǎn)肉量相關(guān)的其他性狀的選育在養(yǎng)殖業(yè)中同樣具有重要意義,比如豬頭長度性狀。
2、1)豬頭長度與產(chǎn)肉量特征正相關(guān)聯(lián),長頭豬擁有更多的肌肉,因此在屠宰后可以獲得更多的肉量,比如豬頭肉;
3、2)豬頭在中國傳統(tǒng)文化中的地位非常高,代表著富貴,福氣和好運。豬頭在人們飲食方面也有重要作用,長大頭豬是人們更偏愛喜愛選擇的對象,預(yù)示著來年有更多的好運和福氣。
4、所以,豬頭長度的選育在生產(chǎn)實際和傳統(tǒng)文化傳承中有著重要意義。因而探索出影響豬頭長度的分子標記并對育種群體加以改良顯得很有必要。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明之一提供了一種豬的snp標記,所述snp標記的核酸序列如seq?id?no.1所示,所述snp標記的位點位于如seq?id?no.1所示的核酸上的從5’端起的第301位,對應(yīng)于11.1版本國際豬基因組的1號染色體上的從5’端起的第51602938位點,為t或c。
2、本發(fā)明之二提供了一種snp標記在輔助鑒定豬頭長度的應(yīng)用。即可以先通過snp標記高通量篩選出豬頭長度較長的t/t基因型或t/c基因型(或者也可以描述為c/t基因型,兩者含義相同),再基于常規(guī)方法對t/t基因型或t/c基因型的豬頭長度進行定量測定;或省略定量測定步驟,僅基于snp標記的基因型作出選擇,例如僅選擇t/t基因型的個體,或選擇t/t基因型和t/c基因型的個體。
3、在一個具體實施方式中,基于所述豬頭長度,所述seq?id?no.1上的從5’端起的第301位點基因型的優(yōu)選順序依次為:t/t基因型、t/c基因型和c/c基因型。
4、在一個具體實施方式中,所述豬為杜洛克、大白、長白、皮特蘭、二花臉、萊蕪、巴馬香和藏豬的雜交嵌合豬。
5、在一個具體實施方式中,所述豬為杜洛克、大白、長白、皮特蘭、二花臉、萊蕪、巴馬香和藏豬的雜交嵌合f6代。
6、本發(fā)明之三提供了一種輔助豬遺傳改良的方法,所述方法包括:確定種豬核心群中的種豬的一種snp標記;所述snp標記的位點位于如seq?id?no.1所示的核酸上的從5’端起的第301位,對應(yīng)于11.1版本國際豬基因組的1號染色體上的從5’端起的第51602938位點,為t或c;根據(jù)所述snp標記做出相應(yīng)的選擇:在所述種豬核心群中選擇在所述seq?idno.1上的從5’端起的第301位點為t/c基因型和/或t/t基因型種豬個體,淘汰在該位點為c/c基因型的種豬個體,以逐代提高等位基因t的頻率。
7、在一個具體實施方式中,在所述種豬核心群中選擇在所述seq?id?no.1上的從5’端起的第301位點為t/t基因型的種豬個體,淘汰在該位點為t/c基因型和c/c基因型的種豬個體,以逐代提高等位基因t的頻率。
8、在一個具體實施方式中,利用分析所述種豬的核酸的序列來確定所述種豬的snp標記,其中所述核酸的序列如seq?id?no.1所示。
9、在一個具體實施方式中,所述豬的來源為杜洛克、大白、長白、皮特蘭、二花臉、萊蕪、巴馬香和藏豬的雜交嵌合豬。
10、在一個具體實施方式中,所述豬的來源為杜洛克、大白、長白、皮特蘭、二花臉、萊蕪、巴馬香和藏豬的雜交嵌合f6代。
11、在一個具體實施方式中,所述豬遺傳改良的性狀為豬頭長度。
12、本發(fā)明的有益效果:
13、本發(fā)明的1_51602938snp標記與豬頭長度顯著相關(guān),因此可以通過本發(fā)明的snp標記對豬群該位點進行判型,并通過該snp標記對豬的頭長進行輔助鑒定或?qū)ωi群進行頭長的遺傳改良。
14、通過改良1_51602938snp位點,提高該位點等位基因t的頻率,降低等位基因c的頻率,可以提高豬頭長度,進而提高產(chǎn)肉量,這不但可以提升生產(chǎn)效率,還能增強養(yǎng)殖企業(yè)在市場上的競爭力。
1.一種豬的snp標記,所述snp標記的核酸序列如seq?id?no.1所示,所述snp標記的位點位于如seq?id?no.1所示的核酸上的從5’端起的第301位,對應(yīng)于11.1版本國際豬基因組的1號染色體上的從5’端起的第51602938位點,為t或c。
2.一種snp標記在輔助鑒定豬頭長度的應(yīng)用,所述snp標記的位點位于如seq?idno.1所示的核酸上的從5’端起的第301位,對應(yīng)于11.1版本國際豬基因組的1號染色體上的從5’端起的第51602938位點,為t或c。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用,其特征在于,基于所述豬頭長度,所述seq?id?no.1上的從5’端起的第301位點基因型的優(yōu)選順序依次為:t/t基因型、t/c基因型和c/c基因型。
4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用,其特征在于,所述豬為杜洛克、大白、長白、皮特蘭、二花臉、萊蕪、巴馬香和藏豬的雜交嵌合豬。
5.一種輔助豬遺傳改良的方法,所述方法包括:確定種豬核心群中的種豬的一種snp標記;所述snp標記的位點位于如seq?id?no.1所示的核酸上的從5’端起的第301位,對應(yīng)于11.1版本國際豬基因組的1號染色體上的從5’端起的第51602938位點,為t或c;根據(jù)所述snp標記做出相應(yīng)的選擇:
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的方法,其特征在于,在所述種豬核心群中選擇在所述seq?idno.1上的從5’端起的第301位點為t/t基因型的種豬個體,淘汰在該位點為t/c基因型和c/c基因型的種豬個體,以逐代提高等位基因t的頻率。
7.根據(jù)權(quán)利要求5或6所述的方法,其特征在于,利用分析所述種豬的核酸的序列來確定所述種豬的snp標記,其中所述核酸的序列如seq?id?no.1所示。
8.根據(jù)權(quán)利要求5或6所述的方法,其特征在于,所述豬的來源為杜洛克、大白、長白、皮特蘭、二花臉、萊蕪、巴馬香和藏豬的雜交嵌合豬。
9.根據(jù)權(quán)利要求5或6所述的方法,其特征在于,所述豬遺傳改良的性狀為豬頭長度。