本發(fā)明涉及基因診斷標志物,特別是涉及擴增生物學標志物的引物對及其在制備診斷心肌致密化不全的試劑或試劑盒中的應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、心肌致密化不全(noncompaction?of?ventricular?myocardium,nvm)是嚴重危害人類健康的的一種遺傳性心肌病,系心室肌在胚胎發(fā)育早期網(wǎng)織狀肌小梁致密化過程失敗,導致小梁化的心肌持續(xù)存在,以心室內(nèi)有許多突起的肌小梁、小梁間深陷的隱窩和心室收縮和舒張功能減退為特征??蓪е聬盒孕穆墒С!乐氐男牧λソ?、體循環(huán)栓塞以及猝死等,預后不良。2006年3月美國心臟病學會對心肌病的新定義和分類標準中nvm歸屬于遺傳性心肌病。nvm以常染色體顯性遺傳為主,超44%病例呈家族遺傳性。nvm表現(xiàn)為高度的遺傳異質(zhì)性,nvm可孤立存在,合并其他疾病(如先天性心臟病或原發(fā)性心肌病)共同存在者亦多見。但是,至今為止,nvm的發(fā)病機制尚不明確,人群中絕大部分nvm的致病基因仍未確認。目前nvm防治主要存在以下問題:診斷主要依靠影像學表現(xiàn),缺乏基因診斷標準;病理機制尚不清楚,缺乏可靠的精準治療干預靶點。因此尋求可靠的基因診斷標志物、闡明nvm發(fā)病機制是目前nvm領(lǐng)域亟待解決的科學問題。因此,通過nvm患者進行基因測序?qū)ふ倚碌目赡艿闹虏⊥蛔?,在家系中對新突變進行致病性驗證,以及在細胞學水平構(gòu)建疾病模型進行功能學驗證,對于nvm的精準診斷和治療具有重要的意義。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、為了解決上述問題,本發(fā)明提供了擴增生物學標志物的引物對及其在制備診斷心肌致密化不全的試劑或試劑盒中的應(yīng)用。本發(fā)明提供的引物對可擴增心肌致密化不全的生物學標志物,在目前已知的nvm致病突變的基礎(chǔ)上,補充了心肌致密化不全的致病突變譜,對于nvm的精準診斷和治療具有重要的意義。
2、為了實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提供如下技術(shù)方案:
3、本發(fā)明提供了突變堿基作為生物學標志物在制備診斷或預測心肌致密化不全的試劑或試劑盒中的應(yīng)用,所述突變堿基包括人tnn基因dna序列g(shù)enbank登錄號為63923的第6061位堿基,由c突變?yōu)閠。
4、本發(fā)明提供了以人ttn基因的c.c6061>t:p.r2021x為檢測靶在制備輔助診斷或輔助預測心肌致密化不全的試劑盒中的應(yīng)用。
5、本發(fā)明還提供了檢測生物學標志物的試劑或引物對在制備預測心肌致密化不全患者預后的試劑或試劑盒中的應(yīng)用,所述生物學標志物包括位于人tnn基因dna序列g(shù)enbank登錄號為63923的第6061位堿基,由c突變?yōu)閠。
6、本發(fā)明還提供了一種擴增心肌致密化不全的生物學標志物的引物對,所述引物對包括上游引物和下游引物;所述上游引物的核苷酸序列如seq?id?no.1所示,所述下游引物的核苷酸序列如seq?id?no.2所示。
7、優(yōu)選的,所述生物學標志物包括位于人ttn基因dna序列g(shù)enbank登錄號為63923的第6061位堿基,由c突變?yōu)閠。
8、本發(fā)明還提供了上述的引物對在制備診斷心肌致密化不全的試劑或試劑盒中的應(yīng)用。
9、本發(fā)明還提供了上述的引物對在制備預測心肌致密化不全患者預后的試劑或試劑盒中的應(yīng)用。
10、本發(fā)明還提供了上述的引物對在制備預測無癥狀基因突變攜帶者日后發(fā)展形成心肌致密化不全的風險的試劑或試劑盒中的應(yīng)用。
11、本發(fā)明還提供了一種診斷心肌致密化不全的試劑或試劑盒,所述試劑或試劑盒包括上述的引物對。
12、本發(fā)明還提供了一種預測心肌致密化不全患者預后的試劑或試劑盒,所述試劑或試劑盒包括上述的引物對。
13、本發(fā)明還提供了一種預測無癥狀基因突變攜帶者日后發(fā)展形成心肌致密化不全的風險的試劑或試劑盒,所述試劑或試劑盒包括權(quán)上述的引物對。
14、有益效果:
15、本發(fā)明提供了一種擴增心肌致密化不全的生物學標志物的引物對,所述引物對包括上游引物和下游引物;所述上游引物的核苷酸序列如seq?id?no.1所示,所述下游引物的核苷酸序列如seq?id?no.2所示。本發(fā)明提供的引物對可擴增心肌致密化不全的生物學標志物,所述生物學標志物包括位于人ttn基因dna序列g(shù)enbank登錄號為63923的第6061位堿基,由c突變?yōu)閠,是一種無義突變,本發(fā)明通過對臨床診斷心肌致密化不全的患者進行基因測序,在家系內(nèi)進行基因突變疾病共分離驗證,驗證了所述生物學標志物的致病性。因此所述生物學標志物可以作為一種新的心肌致密化不全基因診斷標志物,用于心肌致密化不全的輔助診斷。
1.以人ttn基因的c.c6061>t:p.r2021x為檢測靶在制備輔助診斷或輔助預測心肌致密化不全的試劑盒中的應(yīng)用。
2.突變堿基作為生物學標志物在制備診斷或預測心肌致密化不全的試劑或試劑盒中的應(yīng)用,其特征在于,所述突變堿基包括人ttn基因dna序列g(shù)enbank登錄號為63923的第6061位堿基,由c突變?yōu)閠。
3.檢測生物學標志物的試劑或引物對在制備預測心肌致密化不全患者預后的試劑或試劑盒中的應(yīng)用,其特征在于,所述生物學標志物包括位于人ttn基因dna序列g(shù)enbank登錄號為63923的第6061位堿基,由c突變?yōu)閠。
4.一種擴增心肌致密化不全的生物學標志物的引物對,其特征在于,所述引物對包括上游引物和下游引物;所述上游引物的核苷酸序列如seq?id?no.1所示,所述下游引物的核苷酸序列如seq?id?no.2所示;
5.權(quán)利要求4所述的引物對在制備診斷心肌致密化不全的試劑或試劑盒中的應(yīng)用。
6.權(quán)利要求4所述的引物對在制備預測心肌致密化不全患者預后的試劑或試劑盒中的應(yīng)用。
7.權(quán)利要求4所述的引物對在制備預測無癥狀基因突變攜帶者日后發(fā)展形成心肌致密化不全的風險的試劑或試劑盒中的應(yīng)用。
8.一種診斷心肌致密化不全的試劑或試劑盒,其特征在于,所述試劑或試劑盒包括權(quán)利要求4所述的引物對。
9.一種預測心肌致密化不全患者預后的試劑或試劑盒,其特征在于,所述試劑或試劑盒包括權(quán)利要求4所述的引物對。
10.一種預測無癥狀基因突變攜帶者日后發(fā)展形成心肌致密化不全的風險的試劑或試劑盒,其特征在于,所述試劑或試劑盒包括權(quán)利要求4所述的引物對。