1.一種蛋白，其具有seq?id?no：1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12和13任一項(xiàng)所示的氨基酸序列或其直系同源物(ortholog)、同源物、變體或功能性片段；其中，所述直系同源物、同源物、變體或功能性片段基本保留了其所源自的序列的生物學(xué)功能；
2.權(quán)利要求1所述的蛋白，其包含選自下列的序列，或由選自下列的序列組成：
3.一種綴合物，其包含權(quán)利要求1或2所述的蛋白以及修飾部分；
4.一種融合蛋白，其包含權(quán)利要求1或2所述的蛋白以及另外的蛋白或多肽；
5.一種分離的核酸分子，其包含選自下列的序列，或由選自下列的序列組成：
6.一種復(fù)合物，其包含：
7.權(quán)利要求6所述的復(fù)合物，其中，所述導(dǎo)向序列連接于所述核酸分子的3’端；
8.一種分離的核酸分子，其包含：
9.一種載體，其包含權(quán)利要求8所述的分離的核酸分子。
10.一種宿主細(xì)胞，其包含權(quán)利要求8所述的分離的核酸分子或權(quán)利要求9所述的載體。
11.一種組合物，其包含：
12.一種組合物，其包含一種或多種載體，所述一種或多種載體包含：
13.權(quán)利要求11或12所述的組合物，其中，當(dāng)所述靶序列為dna時(shí)，所述靶序列位于原間隔序列臨近基序(pam)的3’端，并且所述pam具有5’-ntn所示的序列，其中，n各自獨(dú)立地選自a、g、t或c；
14.權(quán)利要求11-13任一項(xiàng)所述的組合物，其中，所述靶序列是來自原核細(xì)胞或真核細(xì)胞的dna或rna序列；或者，所述靶序列是非天然存在的dna或rna序列。
15.權(quán)利要求11-14任一項(xiàng)所述的組合物，其中，所述靶序列存在于細(xì)胞內(nèi)；或者，所述靶序列存在于體外的核酸分子(例如，質(zhì)粒)中；
16.權(quán)利要求11-15任一項(xiàng)所述的組合物，其中，所述蛋白連接有一個(gè)或多個(gè)nls序列，或者，所述綴合物或融合蛋白包含一個(gè)或多個(gè)nls序列；
17.一種試劑盒，其包括一種或多種選自下列的組分：權(quán)利要求1或2所述的蛋白、權(quán)利要求3所述的綴合物、權(quán)利要求4所述的融合蛋白、權(quán)利要求5所述的分離的核酸分子、權(quán)利要求6或7所述的復(fù)合物、權(quán)利要求8所述的分離的核酸分子、權(quán)利要求9所述的載體、權(quán)利要求10所述的宿主細(xì)胞、權(quán)利要求11-16任一項(xiàng)所述的組合物；
18.一種遞送組合物，其包含遞送載體，以及選自下列的一種或多種：權(quán)利要求1或2所述的蛋白、權(quán)利要求3所述的綴合物、權(quán)利要求4所述的融合蛋白、權(quán)利要求5所述的分離的核酸分子、權(quán)利要求6或7所述的復(fù)合物、權(quán)利要求8所述的分離的核酸分子、權(quán)利要求9所述的載體、權(quán)利要求10所述的宿主細(xì)胞、權(quán)利要求11-16任一項(xiàng)所述的組合物；
19.一種修飾靶基因的方法，其包括：將權(quán)利要求6或7所述的復(fù)合物或權(quán)利要求11-16任一項(xiàng)所述的組合物與所述靶基因接觸，或者遞送至包含所述靶基因的細(xì)胞中；所述靶序列存在于所述靶基因中；
20.一種改變基因產(chǎn)物的表達(dá)的方法，其包括：將權(quán)利要求6或7所述的復(fù)合物或權(quán)利要求11-16任一項(xiàng)所述的組合物與編碼所述基因產(chǎn)物的核酸分子接觸，或者遞送至包含所述核酸分子的細(xì)胞中，所述靶序列存在于所述核酸分子中；
21.權(quán)利要求18-20任一項(xiàng)所述的方法，其中所述的蛋白、綴合物、融合蛋白、分離的核酸分子、復(fù)合物、載體或組合物包含于遞送載體中；
22.權(quán)利要求18-21任一項(xiàng)所述的方法，其用于改變靶基因或編碼靶基因產(chǎn)物的核酸分子中的一個(gè)或多個(gè)靶序列來修飾細(xì)胞、細(xì)胞系或生物體。
23.一種由權(quán)利要求18-22任一項(xiàng)所述的方法獲得的細(xì)胞或其子代，其中所述細(xì)胞包含在其野生型中不存在的修飾。
24.權(quán)利要求23所述的細(xì)胞或其子代的細(xì)胞產(chǎn)物。
25.一種體外的、離體的或體內(nèi)的細(xì)胞或細(xì)胞系或它們的子代，所述細(xì)胞或細(xì)胞系或它們的子代包含：權(quán)利要求1或2所述的蛋白、權(quán)利要求3所述的綴合物、權(quán)利要求4所述的融合蛋白、權(quán)利要求5所述的分離的核酸分子、權(quán)利要求6或7所述的復(fù)合物、權(quán)利要求8所述的分離的核酸分子、權(quán)利要求9所述的載體、權(quán)利要求11-16任一項(xiàng)所述的組合物；
26.權(quán)利要求1或2所述的蛋白、權(quán)利要求3所述的綴合物、權(quán)利要求4所述的融合蛋白、權(quán)利要求5所述的分離的核酸分子、權(quán)利要求6或7所述的復(fù)合物、權(quán)利要求8所述的分離的核酸分子、權(quán)利要求9所述的載體、權(quán)利要求11-16任一項(xiàng)所述的組合物或權(quán)利要求18所述的試劑盒，在制備制劑中的用途，所述制劑用于核酸編輯(例如，體外或離體核酸編輯)；
27.權(quán)利要求1或2所述的蛋白、權(quán)利要求3所述的綴合物、權(quán)利要求4所述的融合蛋白、權(quán)利要求5所述的分離的核酸分子、權(quán)利要求6或7所述的復(fù)合物、權(quán)利要求8所述的分離的核酸分子、權(quán)利要求9所述的載體、權(quán)利要求11-16任一項(xiàng)所述的組合物或權(quán)利要求17所述的試劑盒，在制備制劑中的用途，所述制劑用于：(i)體外或離體dna檢測(cè)；和/或，(ii)編輯靶基因座中的靶序列來修飾生物或非人類生物。
28.一種檢測(cè)樣品中是否存在靶核酸的方法，其包括以下步驟：
29.權(quán)利要求28所述的方法，其中，所述靶核酸的序列為獲自病原物的序列；優(yōu)選地，所述病原物選自病毒、細(xì)菌、真菌、原生動(dòng)物、寄生蟲或其任意組合；