本發(fā)明屬于生物醫(yī)學(xué),尤其涉及一種近紅外光激活的蛋白臨近標(biāo)記的方法。
背景技術(shù):
1、臨近標(biāo)記技術(shù)可標(biāo)記接近目標(biāo)蛋白質(zhì)的生物分子(通常是蛋白質(zhì)或rna)。通過(guò)在活細(xì)胞中目標(biāo)蛋白質(zhì)和工程標(biāo)記酶之間創(chuàng)建基因融合,生物分子在空間上接近蛋白質(zhì)。然后可以用生物素選擇性地標(biāo)記感興趣的物質(zhì)以進(jìn)行下拉和分析。鄰近標(biāo)記已用于識(shí)別新型細(xì)胞結(jié)構(gòu)的成分和確定蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。
2、現(xiàn)有的臨近標(biāo)記技術(shù)中,apex臨近標(biāo)記技術(shù)需要將細(xì)胞與雙氧水共孵育,雙氧水的毒性會(huì)導(dǎo)致該技術(shù)的生物相容性較差;bioid臨近標(biāo)記技術(shù)因其低效的酶催化活性,導(dǎo)致該技術(shù)獲得有效標(biāo)記信號(hào)所需的時(shí)間很長(zhǎng),因此很難對(duì)瞬時(shí)的蛋白相互作用進(jìn)行有效標(biāo)記;rinid臨近標(biāo)記技術(shù)同樣是有活性氧介導(dǎo)的臨近標(biāo)記技術(shù),但是其光敏蛋白minisog所需的光照波長(zhǎng)位于400nm波段,這就導(dǎo)致了其較差的生物相容性以及較高的標(biāo)記信號(hào)背景。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本發(fā)明要解決的技術(shù)問(wèn)題是克服現(xiàn)有技術(shù)中存在的不足,提供一種近紅外光激活的蛋白臨近標(biāo)記的方法。
2、為了解決上述技術(shù)問(wèn)題,本發(fā)明提供了一種近紅外光激活的蛋白臨近標(biāo)記的方法,所述方法包括以下步驟:
3、(1)將dl5蛋白質(zhì)粒穩(wěn)定表達(dá)于mcf-7細(xì)胞中;
4、(2)將所述mcf-7細(xì)胞與mg2i底物以及間氨基苯乙炔共孵育,并對(duì)細(xì)胞施加660nm波段的光照;
5、所述dl5蛋白質(zhì)粒為定位于細(xì)胞核的dl5蛋白質(zhì)?;蚨ㄎ挥诰€粒體的dl5蛋白質(zhì)粒,所述定位于細(xì)胞核的dl5蛋白質(zhì)粒的dna序列如seq?id?no.1所示,所述定位于線粒體的dl5蛋白質(zhì)粒的dna序列如seq?id?no.2所示;
6、所述mg2i底物具有以下式ⅰ的結(jié)構(gòu)式;
7、
8、上述的方法,進(jìn)一步的,所述mg2i底物采用包括以下步驟的方法制備得到:
9、s1、將3,5-二碘-4-羥基苯甲醛、4-溴丁酸乙酯、碳酸鉀溶于有機(jī)溶液中,加熱反應(yīng)得到化合物a;
10、s2、將所述化合物a,n,n-二甲基苯胺,氯化鋅溶于無(wú)水乙醇中,加熱反應(yīng)得到化合物b;
11、s3、將所述化合物b,四氯苯醌溶于乙腈,加熱反應(yīng)得到mg2i;
12、所述化合物a具有以下式ⅱ的結(jié)構(gòu)式:
13、
14、所述化合物b具有以下式ⅱ的結(jié)構(gòu)式:
15、
16、上述的方法,進(jìn)一步的,所述s1中所述3,5-二碘-4-羥基苯甲醛、4-溴丁酸乙酯、碳酸鉀的摩爾濃度比為:1﹕1.2﹕1;
17、和/或,所述有機(jī)溶液為dmf;
18、和/或,所述攪拌反應(yīng)具體為:90℃攪拌反應(yīng)3~6小時(shí)。
19、上述的方法,進(jìn)一步的,所述s2中所述化合物a,n,n-二甲基苯胺,氯化鋅的摩爾濃度比為:1﹕2﹕1;
20、和/或,所述攪拌反應(yīng)具體為:80℃反應(yīng)24~48小時(shí)。
21、上述的方法,進(jìn)一步的,所述s3中化合物b和四氯苯醌的摩爾濃度比為:1﹕1;
22、和/或,所述攪拌反應(yīng)具體為:80℃反應(yīng)3~6小時(shí)。
23、上述的方法,進(jìn)一步的,所述(1)具體為:將所述dl5蛋白質(zhì)粒與pax、pmd、p3000進(jìn)行混合包裝獲得慢病毒;用所述慢病毒感染mcf-7細(xì)胞。
24、上述的方法,進(jìn)一步的,所述(2)具體為:將500nmol/l?mg2i以及1mmol/l間氨基苯乙炔與mcf-7細(xì)胞孵育一小時(shí);對(duì)mcf-7細(xì)胞施加660nm波段的光照20分鐘。
25、與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明的優(yōu)點(diǎn)在于:
26、(1)提供了一種由近紅外光激活的臨近標(biāo)記方法:fap-tap,由熒光激活蛋白dl5和特異性與其結(jié)合的底物mg2i組成。fap-tap介導(dǎo)的臨近標(biāo)記技術(shù)能有效解決當(dāng)前臨近標(biāo)記技術(shù)中存在的生物相容性差、標(biāo)記時(shí)間長(zhǎng)、標(biāo)記背景過(guò)高的問(wèn)題。在660nm的近紅外光照射下,能快速高效地產(chǎn)生單線態(tài)氧。其產(chǎn)生的單線態(tài)氧能氧化臨近蛋白的組氨酸殘基,這就使得一些胺類蛋白標(biāo)記探針能與被氧化的組氨酸殘基進(jìn)行共價(jià)反應(yīng),實(shí)現(xiàn)臨近蛋白標(biāo)記。綜上,fap-tap介導(dǎo)的臨近標(biāo)記技術(shù)能有效解決當(dāng)前臨近標(biāo)記技術(shù)中存在的生物相容性差、標(biāo)記時(shí)間長(zhǎng)、標(biāo)記背景過(guò)高的問(wèn)題。
1.一種近紅外光激活的蛋白臨近標(biāo)記的方法,其特征在于,所述方法包括以下步驟:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述mg2i底物采用包括以下步驟的方法制備得到:
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于,所述s1中所述3,5-二碘-4-羥基苯甲醛、4-溴丁酸乙酯、碳酸鉀的摩爾濃度比為:1﹕1.2﹕1;
4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于,所述s2中所述化合物a,n,n-二甲基苯胺,氯化鋅的摩爾濃度比為:1﹕2﹕1;
5.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于,所述s3中化合物b和四氯苯醌的摩爾濃度比為:1﹕1;
6.根據(jù)權(quán)利要求1至5中任一項(xiàng)所述的方法,其特征在于,所述(1)具體為:將所述dl5蛋白質(zhì)粒與pax、pmd、p3000進(jìn)行混合包裝獲得慢病毒;用所述慢病毒感染mcf-7細(xì)胞。
7.根據(jù)權(quán)利要求1至5中任一項(xiàng)所述的方法,其特征在于,所述(2)具體為:將500nmol/lmg2i以及1mmol/l間氨基苯乙炔與mcf-7細(xì)胞孵育一小時(shí);對(duì)mcf-7細(xì)胞施加660nm波段的光照20分鐘。