本發(fā)明屬于腫瘤放療敏感性診斷,尤其涉及一種檢測腫瘤放療敏感性的菌群標(biāo)志物及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、結(jié)直腸癌約占全世界每年診斷的所有癌癥和癌癥相關(guān)死亡的10%,它是女性中第二常見的癌癥,男性中第三常見的癌癥。放射治療作為結(jié)直腸癌綜合治療的重要組成部分,術(shù)前放化療的治療策略仍是局部晚期直腸癌(ⅱ、ⅲ期)的標(biāo)準治療策略。然而放療給患者帶來治療益處的同時也增加了其治療的毒副作用,獲益人群占比較少,仍有較多問題亟待解決。
2、在放療領(lǐng)域,個體間臨床療效差異較大,即使接受同等方案及劑量的放療仍有約半數(shù)腫瘤未獲得明顯退縮,甚至存在進展的情況,結(jié)直腸癌(crc)細胞對放療的耐藥性在很大程度上導(dǎo)致了結(jié)直腸癌患者的不良臨床預(yù)后。但目前結(jié)直腸癌患者對放療高敏感(hs)、中度敏感(ms)和低敏感(ls)的鑒別仍然存在障礙。在對放射治療反應(yīng)的評估中,腫瘤消退反應(yīng)分級(tumorregression?grading,trg)被廣泛接受,既往研究表明ajcc-trg分級準確地預(yù)示直腸癌放化療后的預(yù)后。然而,trg分級未能在治療前對結(jié)直腸癌患者的放射反應(yīng)進行敏感度分級。因此獲得一種篩選腫瘤放療敏感性標(biāo)志物的方法用于放療敏感性的預(yù)測具有重要意義。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、鑒于此,本發(fā)明的目的在于提供一種檢測腫瘤放療敏感性的菌群標(biāo)志物及其應(yīng)用,本發(fā)明利用菌群標(biāo)志物能夠有效地檢測患者對腫瘤放療敏感性。
2、為了實現(xiàn)上述發(fā)明目的,本發(fā)明提供了以下技術(shù)方案:
3、本發(fā)明提供了一種檢測腫瘤放療敏感性的菌群標(biāo)志物,所述菌群標(biāo)志物包括s__schaalia_odontolytica,s__roseburia_inulinivorans,s__mogibacterium_diversum,s__campylobacter_gracilis,s__alistipes_obesi,s__bacterium_new,s__prevotella_nigrescens,s__clostridioides_difficile,s__bacteroides_clarus,s__enterobacter_cloacae,s__anaerostipes_unclassified,s__prevotella_stercorea中的一種或多種。
4、本發(fā)明還提供了一種根據(jù)上述的菌群標(biāo)志物在制備診斷腫瘤放療敏感性產(chǎn)品中的應(yīng)用。
5、本發(fā)明還提供了一種根據(jù)上述的菌群標(biāo)志物在制備診斷腫瘤放療敏感分級產(chǎn)品中的應(yīng)用。
6、優(yōu)選的,所述腫瘤放療敏感分級為腫瘤放療高度敏感和腫瘤放療中度敏感。
7、本發(fā)明還提供了一種利用上述的菌群標(biāo)志物預(yù)測腫瘤放療敏感性的系統(tǒng),包括,核酸樣本分離單元,用于從檢測樣本中分離糞便菌群核酸樣本;
8、數(shù)據(jù)處理單元,利用上述的菌群標(biāo)志物建立邏輯回歸模型,得到臨界值;
9、結(jié)果判定單元,用于將數(shù)據(jù)處理單元得到的臨界值與設(shè)定的診斷值進行比較。
10、優(yōu)選的,所述邏輯回歸模型為第一邏輯回歸模型和第二邏輯回歸模型;
11、所述第一邏輯回歸模型為待測糞便樣本vs放療不敏感的結(jié)直腸癌患者的糞便樣本構(gòu)建的邏輯回歸模型,當(dāng)臨界值<0.62,表明腫瘤患者對放療不敏感,當(dāng)臨界值≥0.62,表明腫瘤患者對放療中度敏感或?qū)Ψ暖煾叨让舾校?/p>
12、所述第二邏輯回歸模型為將臨界值≥0.62的待測糞便樣本vs放療中度敏感的結(jié)直腸癌患者的糞便樣本構(gòu)建的邏輯回歸模型,當(dāng)臨界值<0.48,表明腫瘤患者對放療中度敏感,當(dāng)臨界值≥0.48,表明腫瘤患者對放療高度敏感。
13、優(yōu)選的,利用上述的菌群標(biāo)志物建立第一邏輯回歸模型時,所述菌群標(biāo)志物為s__schaalia_odontolytica,s__roseburia_inulinivorans,s__mogibacterium_diversum,s__campylobacter_gracilis,s__alistipes_obesi,s__prevotella_nigrescens,s__clostridioides_difficile,s__bacteroides_clarus,s__enterobacter_cloacae,s__anaerostipes_unclassified,s__prevotella_stercorea。
14、優(yōu)選的,利用上述的菌群標(biāo)志物建立第二邏輯回歸模型時,所述菌群標(biāo)志物為s__roseburia_inulinivorans、s__prevotella_stercorea、s__anaerostipes_unclassified、s__clostridioides_difficile、s__prevotella_nigrescens、s__schaalia_odontolytica和s__alistipes_obesi。
15、相對于現(xiàn)有技術(shù),本發(fā)明具有如下有益效果:
16、本發(fā)明提供了一種檢測腫瘤放療敏感性的菌群標(biāo)志物及其應(yīng)用,本發(fā)明利用菌群標(biāo)志物能夠?qū)Π┌Y患者的腫瘤放療敏感性進行有效區(qū)分,還能用于癌癥患者對腫瘤放療敏感性分級鑒定,提高了判斷癌癥患者放療敏感程度的準確性,為高效地采用放療治療癌癥患者提供了重要的理論基礎(chǔ)。
1.一種檢測腫瘤放療敏感性的菌群標(biāo)志物,其特征在于,所述菌群標(biāo)志物包括s__schaalia_odontolytica,s__roseburia_inulinivorans,s__mogibacterium_diversum,s__campylobacter_gracilis,s__alistipes_obesi,s__bacterium_new,s__prevotella_nigrescens,s__clostridioides_difficile,s__bacteroides_clarus,s__enterobacter_cloacae,s__anaerostipes_unclassified,s__prevotella_stercorea中的一種或多種。
2.一種根據(jù)權(quán)利要求1所述的菌群標(biāo)志物在制備診斷腫瘤放療敏感性產(chǎn)品中的應(yīng)用。
3.一種根據(jù)權(quán)利要求1所述的菌群標(biāo)志物在制備診斷腫瘤放療敏感分級產(chǎn)品中的應(yīng)用。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的應(yīng)用,其特征在于,所述腫瘤放療敏感分級為腫瘤放療高度敏感和腫瘤放療中度敏感。
5.一種利用權(quán)利要求1所述的菌群標(biāo)志物預(yù)測腫瘤放療敏感性的系統(tǒng),其特征在于,包括,核酸樣本分離單元,用于從檢測樣本中分離糞便菌群核酸樣本;
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的系統(tǒng),其特征在于,所述邏輯回歸模型為第一邏輯回歸模型和第二邏輯回歸模型;
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的系統(tǒng),其特征在于,利用權(quán)利要求1所述的菌群標(biāo)志物建立第一邏輯回歸模型時,所述菌群標(biāo)志物為s__schaalia_odontolytica,s__roseburia_inulinivorans,s__mogibacterium_diversum,s__campylobacter_gracilis,s__alistipes_obesi,s__prevotella_nigrescens,s__clostridioides_difficile,s__bacteroides_clarus,s__enterobacter_cloacae,s__anaerostipes_unclassified,s__prevotella_stercorea。
8.根據(jù)權(quán)利要求6所述的系統(tǒng),其特征在于,利用權(quán)利要求1所述的菌群標(biāo)志物建立第二邏輯回歸模型時,所述菌群標(biāo)志物為s__roseburia_inulinivorans、s__prevotella_stercorea、s__anaerostipes_unclassified、s__clostridioides_difficile、s__prevotella_nigrescens、s__schaalia_odontolytica和s__alistipes_obesi。