本發(fā)明涉及食品檢測(cè),涉及一種特異組合物及試劑盒、檢測(cè)方法,具體涉及一種快速檢測(cè)食品中蠟樣芽孢桿菌、蘇云金芽胞桿菌和蕈狀芽胞桿菌的特異組合物及試劑盒、檢測(cè)方法。
背景技術(shù):
1、人們通常所說(shuō)的蠟樣芽孢桿菌是一種狹義的、革蘭氏陽(yáng)性的條件致病菌。蠟樣芽孢桿菌感染常見(jiàn)的臨床表現(xiàn)為嘔吐型或腹瀉型的消化系統(tǒng)中毒,但其也可能引起更為嚴(yán)重的疾病,如腦膜炎、人工瓣膜心內(nèi)膜炎和主動(dòng)脈膿腫等,甚至致人死亡。蘇云金芽胞桿菌因其良好的殺蟲(chóng)效果而被當(dāng)做生物殺蟲(chóng)劑廣泛應(yīng)用。近期的研究表明,蘇云金芽孢桿菌對(duì)多種害蟲(chóng)的防治效果均較為理想,尤其是線蟲(chóng)、昆蟲(chóng)、螨類(lèi)等。對(duì)于蕈狀芽孢桿菌的研究較少,主要用于土壤修復(fù),增強(qiáng)小鼠免疫力。三種目標(biāo)菌基因組同源分析結(jié)果表明它們?cè)赿na同源性極高,生化特性也較為接近,但蠟樣芽孢桿菌(bc)被認(rèn)為是一種致病菌,蘇云金芽孢桿菌(bt)作為有益的生物殺蟲(chóng)劑而被廣泛應(yīng)用。因此,建立一種快速、準(zhǔn)確的檢測(cè)方法區(qū)分這三種菌,尤其是蠟樣芽孢桿菌(bc)十分有必要。
2、目前,國(guó)標(biāo)法gb?4789.14-2014主要采用生化培養(yǎng)的方法進(jìn)行蠟樣芽孢桿菌、蘇云金芽胞桿菌和蕈狀芽胞桿菌的鑒定,雖然這種方法能夠直觀明確的觀察到菌體的各種特征,技術(shù)要求不高,成本低,但這種方法費(fèi)時(shí)費(fèi)力,需要進(jìn)行菌株的分離、培養(yǎng)和鑒定,過(guò)程可能需要幾天到幾周,并且靈敏度低,難以檢測(cè)低濃度的蠟樣芽孢桿菌、蘇云金芽胞桿菌和蕈狀芽胞桿菌,主觀性強(qiáng),菌落形態(tài)鑒定依賴(lài)操作者的經(jīng)驗(yàn),存在誤判風(fēng)險(xiǎn)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)存在的上述不足,本發(fā)明的目的在于提供一種特異組合物及試劑盒、檢測(cè)方法,具體為能夠快速檢測(cè)食品中蠟樣芽孢桿菌、蘇云金芽胞桿菌和蕈狀芽胞桿菌的特異組合物及試劑盒、檢測(cè)方法,以解決現(xiàn)有技術(shù)鑒定蠟樣芽孢桿菌、蘇云金芽胞桿菌和蕈狀芽胞桿菌耗時(shí)長(zhǎng)、靈敏度低、主觀判定性強(qiáng)、過(guò)于依賴(lài)操作者的經(jīng)驗(yàn)存在誤判風(fēng)險(xiǎn)的問(wèn)題。
2、為了解決上述技術(shù)問(wèn)題,本發(fā)明采用如下技術(shù)方案:
3、一種特異組合物,所述特異組合物能夠用于檢測(cè)食品中蠟樣芽孢桿菌、蘇云金芽胞桿菌和蕈狀芽胞桿菌;所述特異組合物包括多個(gè)引物和探針;
4、當(dāng)目標(biāo)菌株為蠟樣芽孢桿菌時(shí),
5、前向引物gyrb-f的序列為:gtaaattagctgattgctcttcgaaa;
6、后向引物gyrb-r的序列為:cgatcgcgtccttgttttg;
7、探針gyrb-p的序列為:hex-ttacatcgtagagggtgactc-tamrar;
8、當(dāng)目標(biāo)菌株為蘇云金芽胞桿菌時(shí),
9、前向引物cry-f的序列為:gattcatgcggcagataaacgt;
10、后向引物cry-r的序列為:ttcttcaaaaatagccgcattg;
11、探針cry-p的序列為:fam-cttatctgcctgagctgtctgtgattccg-tamrar;
12、當(dāng)目標(biāo)菌株為蕈狀芽胞桿菌時(shí),
13、前向引物n451-2-f的序列為:aggcgtcatgaaaccaattcc;
14、后向引物n451-2-r的序列為:ccaggagcagcacaactatcag;
15、探針n451-2-p的序列為:rox-ttcaaagcgttgatattgatacg-eclipse。
16、優(yōu)選地,所述特異組合物能夠單獨(dú)用于一種目標(biāo)菌株的檢測(cè);或者同時(shí)用于檢測(cè)1~3種目標(biāo)菌株的檢測(cè)。
17、本發(fā)明提供了一種試劑盒,所述試劑盒包括上述特異組合物。具體為:包括上述所有特異組合物;或者包括至少一種上述目標(biāo)菌株所對(duì)應(yīng)的引物和探針。
18、優(yōu)選地,在試劑盒的擴(kuò)增體系中,前向引物的濃度為0.04-0.2μmol/l,后向引物濃度為0.04-0.2μmol/l,探針的濃度為0.04-0.2μmol/l;目標(biāo)菌dna模板的濃度為0.00004-4ng/μl;所述特異組合物與目標(biāo)菌dna模板、以及熒光定量擴(kuò)增預(yù)混液和雙蒸水配置成25μl的反應(yīng)體系。此處,引物和探針的濃度是指單個(gè)引物和單個(gè)探針在整個(gè)擴(kuò)增體系中的濃度,實(shí)際使用時(shí),試劑盒中的擴(kuò)增體系可進(jìn)行提前配制以便于后續(xù)檢測(cè)使用,配制后使各個(gè)引物和探針的濃度滿(mǎn)足上述范圍即可。
19、本發(fā)明提供了一種快速檢測(cè)食品中蠟樣芽孢桿菌、蘇云金芽胞桿菌和蕈狀芽胞桿菌的方法,具體包括如下步驟:
20、步驟1:從待測(cè)樣品中提取dna模板;
21、步驟2:將步驟1提取出的dna模板放入上述試劑盒中進(jìn)行擴(kuò)增處理;
22、步驟3:實(shí)時(shí)熒光檢測(cè)系統(tǒng)記錄步驟2得到的擴(kuò)增產(chǎn)物的熒光信號(hào)強(qiáng)度變化,獲取熒光曲線,確定設(shè)定的時(shí)間內(nèi)達(dá)到設(shè)定閾值所需的擴(kuò)增循環(huán)數(shù)ct值,判斷待測(cè)樣品中是否含有蠟樣芽孢桿菌、蘇云金芽胞桿菌和蕈狀芽胞桿菌。
23、優(yōu)選地,在試劑盒的擴(kuò)增體系中,前向引物的濃度為0.04-0.2μmol/l,后向引物濃度為0.04-0.2μmol/l,探針的濃度為0.04-0.2μmol/l;目標(biāo)菌dna模板的濃度為0.00004-4ng/μl;所述特異組合物與目標(biāo)菌dna模板、以及熒光定量擴(kuò)增預(yù)混液和雙蒸水配置成25μl的反應(yīng)體系。此處,前向引物和后向引物的濃度為單個(gè)前向引物或者單個(gè)后向引物在擴(kuò)增體系中的濃度,探針的濃度為單個(gè)單針在擴(kuò)增體系中的濃度。
24、優(yōu)選地,在步驟2中,所述擴(kuò)增處理的反應(yīng)條件如下:
25、94.0℃保持30s;94.0℃保持5s,60.0℃保持30s;這一處理順序被認(rèn)為是1次循環(huán),以此循環(huán)40次。
26、與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有如下有益效果:
27、本發(fā)明設(shè)計(jì)并獲得了特異引物組,通過(guò)所述引物組能夠顯著提高對(duì)蠟樣芽孢桿菌、蘇云金芽胞桿菌和蕈狀芽胞桿菌鑒別的準(zhǔn)確率,將檢測(cè)時(shí)間由現(xiàn)有技術(shù)所需的3-10d,縮短至6h。本發(fā)明所述檢測(cè)方法能夠快速鑒別出食品中蠟樣芽孢桿菌、蘇云金芽胞桿菌和蕈狀芽胞桿菌,從而更好的從同源性極高的三種菌中區(qū)分食源性致病菌蠟樣芽孢桿菌,為監(jiān)管部門(mén)檢測(cè)食源性致病菌提供技術(shù)支持。
1.一種特異組合物,其特征在于,所述特異組合物能夠用于檢測(cè)食品中蠟樣芽孢桿菌、蘇云金芽胞桿菌和蕈狀芽胞桿菌;所述特異組合物包括多個(gè)引物和多個(gè)探針;
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述特異組合物,其特征在于,所述特異組合物能夠單獨(dú)用于一種目標(biāo)菌株的檢測(cè);或者同時(shí)用于檢測(cè)1~3種目標(biāo)菌株的檢測(cè)。
3.一種試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括權(quán)利要求1所述特異組合物。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述試劑盒,其特征在于,在試劑盒的擴(kuò)增體系中,前向引物的濃度為0.04-0.2μmol/l,后向引物濃度為0.04-0.2μmol/l,探針的濃度為0.04-0.2μmol/l;目標(biāo)菌dna模板的濃度為0.00004-4ng/μl;所述特異組合物與目標(biāo)菌dna模板、以及熒光定量擴(kuò)增預(yù)混液和雙蒸水配置成25μl的反應(yīng)體系。
5.一種快速檢測(cè)食品中蠟樣芽孢桿菌、蘇云金芽胞桿菌和蕈狀芽胞桿菌的方法,其特征在于,具體包括如下步驟:
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述方法,其特征在于,在試劑盒的擴(kuò)增體系中,前向引物的濃度為0.04-0.2μmol/l,后向引物濃度為0.04-0.2μmol/l,探針的濃度為0.04-0.2μmol/l;目標(biāo)菌dna模板的濃度為0.00004-4ng/μl;所述特異組合物與目標(biāo)菌dna模板、以及熒光定量擴(kuò)增預(yù)混液和雙蒸水配置成25μl的反應(yīng)體系。
7.根據(jù)權(quán)利要求5所述方法,其特征在于,在步驟2中,所述擴(kuò)增處理的反應(yīng)條件如下: