本發(fā)明涉及小麥遺傳學(xué)及其分子育種,具體涉及一種快速鑒定粗山羊草中白粉病抗性的kasp標(biāo)記及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、小麥白粉病菌是由禾谷藍(lán)霉( blumeriagraminis?f. sp.)引起的子囊菌亞門布氏白粉菌屬真菌,是一種破壞性疾病,嚴(yán)重威脅小麥的產(chǎn)量和食品安全。近年來(lái),隨著氣候的變化,在我國(guó)主要麥區(qū),如西南、西北、華北、東北麥區(qū),均有發(fā)病日益嚴(yán)重的趨勢(shì)。因此,防治小麥白粉病對(duì)改善小麥品質(zhì)、提高小麥產(chǎn)量具有重要意義。而鑒定抗性基因是開(kāi)發(fā)抗病品種和控制該病的最環(huán)保、有效的策略。
2、迄今為止,小麥及其近緣野生種質(zhì)中已鑒定超110個(gè)pm基因,克隆了18個(gè)。雖已將部分近緣種屬的抗病基因如 pm2b、 pm4、 pm50等導(dǎo)入小麥。但連鎖的有害性狀和雜種劣勢(shì)會(huì)降低產(chǎn)量和品質(zhì),如 pm16導(dǎo)致15%產(chǎn)量損失。此外,現(xiàn)有pm基因如 pm1至 pm5和 pm8等正逐漸失去對(duì) bgt分離株的抗性,即使是最有效的基因 pm21,也面臨著強(qiáng)大的選擇壓力和失去抗性的風(fēng)險(xiǎn)。因此,尋找能平衡廣譜抗性和農(nóng)藝性狀的新型抗白粉病基因是提升小麥高產(chǎn)多抗的關(guān)鍵。
3、粗山羊草( aegilopstauschii,?2n=14,?dd),是異源六倍體小麥d基因組的供體,其蘊(yùn)含著豐富的抗性基因,并且有容易轉(zhuǎn)移到小麥中利用的特點(diǎn)。
4、分子標(biāo)記作為一種簡(jiǎn)單、低成本的技術(shù),在小麥與其近緣種遠(yuǎn)緣雜交材料的分子鑒定中也起著至關(guān)重要的作用。若想實(shí)現(xiàn)多抗病基因高效聚合,同時(shí)優(yōu)化農(nóng)藝性狀的目標(biāo),可直接通過(guò)分子輔助選擇將功能互補(bǔ)的多基因聚合,在不犧牲其他農(nóng)藝性狀的前提下增強(qiáng)小麥廣譜持久抗性。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的缺陷,本專利提供了一種快速鑒定粗山羊草中白粉病抗性的kasp標(biāo)記及其應(yīng)用。
2、粗山羊草ku-2013經(jīng)過(guò)白粉病抗性鑒定,發(fā)現(xiàn)其是小麥白粉病持久免疫的抗源。小麥白粉病抗病性鑒定及遺傳分析表明,?ku-2013的2d染色體上攜帶一個(gè)單顯性抗病基因,暫時(shí)將其命名為 pmku-2013。
3、本發(fā)明提供了一套針對(duì)小麥白粉病抗性的分子標(biāo)記體系及應(yīng)用策略,以期填補(bǔ)當(dāng)前育種技術(shù)中在利用高效分子標(biāo)記輔助選育小麥白粉病抗性品種方面的空白。為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提供了以下技術(shù)方案:
4、發(fā)明人在對(duì)dhku-2013(粗山羊草ku-2013與硬粒小麥langdon雜交的人工合成六倍體小麥)抗白粉病基因進(jìn)行初步定位在其2d染色體5.9m的基礎(chǔ)上(圖1),在定位區(qū)間內(nèi)設(shè)計(jì)了一組親本間抗、感多態(tài)性kasp標(biāo)記。利用該標(biāo)記,對(duì)隨機(jī)挑選的、來(lái)自國(guó)內(nèi)各地的40份常用于小麥育種的品種和硬粒小麥langdon進(jìn)行了基因型分析。分析結(jié)果顯示,這40份小麥品種的基因型均和硬粒小麥langdon都與感病對(duì)照dh2147(粗山羊草2147與硬粒小麥langdon雜交的人工合成六倍體小麥)的基因型相吻合。這一發(fā)現(xiàn)表明,所設(shè)計(jì)的kasp標(biāo)記在 pmku-2013基因向小麥育種轉(zhuǎn)移的過(guò)程中,具有潛在的分子輔助選擇作用。所述kasp標(biāo)記名稱為 sdau-kasppm2013,其引物組核苷酸序列分別為:
5、fam(seq?id?no:1):
6、gaaggtgaccaagttcatgctcgaagctggtgaaaaatgatcgcc(感病位點(diǎn)結(jié)合);
7、hex(seq?id?no:2):
8、gaaggtcggagtcaacggattccgaagctggtgaaaaatgatcgct(抗病位點(diǎn)結(jié)合);
9、com(seq?id?no:3):
10、caccccagtctcagtttctgctaa。
11、利用粗山羊草抗白粉病基因 pmku-2013的連鎖標(biāo)記 sdau-kasppm2013,其使用方法分別如下:
12、(1)以小麥或粗山羊草dna為pcr擴(kuò)增模板,以sdau-kasppm2013為引物,進(jìn)行pcr擴(kuò)增,反應(yīng)體系約為5μl。上述反應(yīng)體系具體包括:80ng/μl的dna?1μl,2×kasp?mix?2.5μl,kasp?primer?mix?0.35μl,ddh2o補(bǔ)至5μl.
13、(2)pcr擴(kuò)增程序?yàn)?94℃預(yù)變性15min;94℃變性20s,65退火和延伸1min(每循環(huán)降低0.8℃),10個(gè)循環(huán);94℃變性20s,57℃復(fù)性1min,28個(gè)循環(huán);
14、(3)pcr結(jié)束后,置于384孔多熒光通道定量?pcr?儀上進(jìn)行熒光讀取以及檢測(cè)pcr分型結(jié)果;
15、(4)分析鑒定,分型若集中在y軸,則屬于抗病基因型,分型若集中在x軸,則屬于感病基因型,位于原點(diǎn)的分型則表示為陰性對(duì)照。
16、本研究與現(xiàn)有技術(shù)相比有以下優(yōu)點(diǎn):
17、本發(fā)明獲得pmku-2013的連鎖kasp標(biāo)記:sdau-kasppm2013;sdau-kasppm2013屬于kasp標(biāo)記,具有高通量、操作簡(jiǎn)便等特點(diǎn),可以用于大規(guī)模分離群體的高通量篩選,對(duì)pmku2013進(jìn)行精細(xì)定位;sdau-kasppm2013檢測(cè)隨機(jī)選取的40份小麥品種均為感病基因型,因此在小麥育種中可作為pmku2013抗性輔助選擇的分子標(biāo)記。
1.一種快速鑒定粗山羊草中白粉病抗性的kasp標(biāo)記,所述的標(biāo)記為sdau-kasppm2013,其特征在于:用于擴(kuò)增所述的標(biāo)記sdau-kasppm2013的引物組合及其對(duì)應(yīng)的引物序列如下:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的標(biāo)記在精細(xì)定位基因并克隆pmku-2013的應(yīng)用。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的標(biāo)記在鑒定粗山羊草種質(zhì)中抗白粉病基因pmku-2013的應(yīng)用。
4.根據(jù)權(quán)利要求1中所述的標(biāo)記,在篩選將粗山羊草的抗白粉病基因pmku-2013轉(zhuǎn)移至小麥分子輔助育種中的應(yīng)用。