本發(fā)明涉及分子育種，具體地，涉及用于嘉積鴨育種的分子標(biāo)記、檢測(cè)試劑、方法及其應(yīng)用。

背景技術(shù)：

1、載脂蛋白(apolipoprotein，apo)超家族是一組在脂質(zhì)代謝中起著關(guān)鍵作用的蛋白質(zhì)，能夠與血脂如膽固醇、甘油三酯等結(jié)合形成脂蛋白，從而將脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)到身體各個(gè)組織器官。根據(jù)apo超家族各成員的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)及脂質(zhì)結(jié)合特性又被劃分為apoa、apob、apoc、apoe、apoh家族。apoc3屬于apoc家族的成員，主要由肝臟合成并分泌，少部分在腸道合成，為小分子量的胞外蛋白，主要存在于血漿中的極低密度脂蛋白、高密度脂蛋白及乳糜微粒等富含甘油三酯的脂蛋白中。apoc3能通過抑制血管內(nèi)皮細(xì)胞表面的脂蛋白脂肪酶以及肝脂酶等酶的活性，降低機(jī)體對(duì)血漿中tc的水解，參與調(diào)控機(jī)體的脂代謝。用表達(dá)人apoc3的腺病毒感染c57bl/6小鼠后，發(fā)現(xiàn)apoc3能調(diào)節(jié)高密度脂蛋白結(jié)構(gòu)和功能，同時(shí)能選擇性地促進(jìn)機(jī)體激活棕色脂肪組織的能量代謝。對(duì)apoc3缺陷小鼠進(jìn)行高脂飲食誘導(dǎo)，發(fā)現(xiàn)比正常小鼠具有更高的肥胖敏感性。表明apoc3基因可作為治療肥胖癥及代謝相關(guān)疾病的潛在靶點(diǎn)之一。另外，在家畜上的研究表明，可樂豬肌內(nèi)脂肪沉積量與apoc3的轉(zhuǎn)錄水平呈線性正相關(guān)。山羊apoc3可通過上調(diào)srebp1、cebpβ、pparγ及下調(diào)pref-1來促進(jìn)imf細(xì)胞的分化。目前，對(duì)于apoc3基因的研究多集中于人的心血管疾病上，而在家禽上研究鮮有報(bào)道。

2、嘉積鴨是海南省的優(yōu)良肉用鴨種，具有耐濕熱、耐粗飼等抗逆性強(qiáng)的特點(diǎn)。它的肉質(zhì)風(fēng)味獨(dú)特，脯大、皮薄、骨軟、肉嫩，口感豐富。嘉積鴨深受海內(nèi)外消費(fèi)者喜愛，還被列為全球遺傳多樣性保護(hù)的品種之一。但同作為海南“四大名菜”，嘉積鴨與文昌雞相比其產(chǎn)業(yè)規(guī)模仍有較大差距，其年出欄量?jī)H有200多萬只。據(jù)市場(chǎng)調(diào)查，較大體重和良好體型的動(dòng)物往往更受歡迎，也更容易達(dá)到出欄標(biāo)準(zhǔn)。因此選育大體型、高繁殖率的嘉積鴨是未來品種選育的一個(gè)方向，而通過分子育種能加快選育進(jìn)程，因此篩選出合適的分子標(biāo)記具有重要意義。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、為克服現(xiàn)有技術(shù)中存在的上述缺陷與不足，本發(fā)明提供用于嘉積鴨育種的分子標(biāo)記、檢測(cè)試劑、方法及其應(yīng)用。

2、本發(fā)明的第一個(gè)目的是提供一種用于嘉積鴨育種的分子標(biāo)記。

3、本發(fā)明的第二個(gè)目的是提供上述的分子標(biāo)記的檢測(cè)試劑。

4、本發(fā)明的第三個(gè)目的是提供上述的分子標(biāo)記和/或檢測(cè)試劑在評(píng)估嘉積鴨生長(zhǎng)性狀中的應(yīng)用。

5、本發(fā)明的第四個(gè)目的是提供上述的分子標(biāo)記和/或檢測(cè)試劑在制備嘉積鴨育種產(chǎn)品中的應(yīng)用。

6、本發(fā)明的第五個(gè)目的是提供一種用于嘉積鴨育種的試劑盒。

7、本發(fā)明的第六個(gè)目的是提供一種評(píng)估嘉積鴨生長(zhǎng)性狀的方法。

8、因此，本發(fā)明要求保護(hù)以下內(nèi)容：

9、一種用于嘉積鴨育種的分子標(biāo)記，所述分子標(biāo)記由7個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)snp1、snp2、snp3、snp4、snp5、snp6和/或snp7組成：

10、snp1位于nc_051796.1基因上第6555465位，為g或a多態(tài)，其存在gg、ga和aa三種基因型；

11、snp2位于nc_051796.1基因上第6555516位，為g或a多態(tài)，其存在gg、ga和aa三種基因型；

12、snp3位于nc_051796.1基因上第6555632位，為c或t多態(tài)，其存在cc、ct和tt三種基因型；

13、snp4位于nc_051796.1基因上第6555640位，為c或a多態(tài)，其存在cc、ca和aa三種基因型；

14、snp5位于nc_051796.1基因上第6555762位，為g或a多態(tài)，其存在gg、ga和aa三種基因型；

15、snp6位于nc_051796.1基因上第6555964位，為c或t多態(tài)，其存在cc、ct和tt三種基因型；

16、snp7位于nc_051796.1基因上第6555842位，為g或a多態(tài)，其存在gg、ga和aa三種基因型；

17、snp1位點(diǎn)ga基因型個(gè)體的龍骨長(zhǎng)顯著高于gg基因型個(gè)體；

18、snp2位點(diǎn)ga基因型個(gè)體的龍骨長(zhǎng)和脛長(zhǎng)顯著高于aa基因型個(gè)體；

19、snp3位點(diǎn)tt基因型個(gè)體的體重顯著高于cc或ct基因型個(gè)體；

20、snp4位點(diǎn)aa基因型個(gè)體的體重顯著高于ca基因型個(gè)體；

21、snp5位點(diǎn)aa基因型個(gè)體的胸深顯著高于gg或ga基因型個(gè)體；

22、snp6位點(diǎn)cc基因型個(gè)體的脛圍顯著高于ct基因型個(gè)體；

23、snp7位點(diǎn)gg基因型個(gè)體的胸深顯著高于ga或aa基因型個(gè)體，aa基因型個(gè)體的體斜長(zhǎng)顯著高于gg或ga基因型個(gè)體。

24、上述的分子標(biāo)記的檢測(cè)試劑，所述snp1、snp2、snp3和/或snp4的檢測(cè)試劑為核苷酸序列如seq?id?no：1～2所示的引物，所述snp5和/或snp7的檢測(cè)試劑為核苷酸序列如seqid?no：3～4所示的引物，所述snp6的檢測(cè)試劑為核苷酸序列如seq?id?no：5～6所示的引物。

25、上述的分子標(biāo)記和/或檢測(cè)試劑在評(píng)估嘉積鴨生長(zhǎng)性狀中的應(yīng)用。

26、一種用于嘉積鴨育種的試劑盒，含有上述的檢測(cè)試劑。

27、優(yōu)選地，所述試劑盒還含有2×pcr?supermix和ddh2o。

28、一種評(píng)估嘉積鴨生長(zhǎng)性狀的方法，用上述的檢測(cè)試劑檢測(cè)上述的分子標(biāo)記。

29、優(yōu)選地，包括以下步驟：

30、s1.提取待測(cè)嘉積鴨的基因組dna；

31、s2.用上述的檢測(cè)試劑對(duì)步驟s1得到的基因組dna進(jìn)行pcr擴(kuò)增，然后對(duì)pcr擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序，得到測(cè)序數(shù)據(jù)；

32、s3.分析步驟s2獲得的測(cè)序數(shù)據(jù)，根據(jù)上述的分子標(biāo)記，判定待測(cè)嘉積鴨的生長(zhǎng)性狀。

33、優(yōu)選地，步驟s2所述測(cè)序?yàn)閟anger測(cè)序。

34、優(yōu)選地，步驟s3所述的生長(zhǎng)性狀包括龍骨長(zhǎng)、脛長(zhǎng)、體重、胸深、脛圍和/或體斜長(zhǎng)。

35、與現(xiàn)有技術(shù)相比，本發(fā)明具有如下有益效果：

36、本發(fā)明公開了用于嘉積鴨育種的分子標(biāo)記、檢測(cè)試劑、方法及其應(yīng)用。本發(fā)明分別在嘉積鴨apoc3基因的5'utr區(qū)、內(nèi)含子區(qū)和外顯子區(qū)篩選得到7個(gè)與嘉積鴨的生長(zhǎng)性狀顯著相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)，可作為嘉積鴨品種遺傳改良的分子標(biāo)記。采用這些分子標(biāo)記對(duì)嘉積鴨進(jìn)行選育，有利于提高嘉積鴨群體的生長(zhǎng)性狀。本發(fā)明還提供了檢測(cè)這些分子標(biāo)記的檢測(cè)引物、試劑盒及育種方法，可用于嘉積鴨育種的早期輔助選擇，對(duì)選育出更容易符合出欄標(biāo)準(zhǔn)的嘉積鴨具有重要意義。

技術(shù)特征：

1.一種用于嘉積鴨育種的分子標(biāo)記，其特征在于，所述分子標(biāo)記由7個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)snp1、snp2、snp3、snp4、snp5、snp6和/或snp7組成：

2.權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記的檢測(cè)試劑，其特征在于，所述snp1、snp2、snp3和/或snp4的檢測(cè)試劑為核苷酸序列如seq?id?no：1～2所示的引物，所述snp5和/或snp7的檢測(cè)試劑為核苷酸序列如seq?id?no：3～4所示的引物，所述snp6的檢測(cè)試劑為核苷酸序列如seq?id?no：5～6所示的引物。

3.權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記和/或權(quán)利要求2所述的檢測(cè)試劑在評(píng)估嘉積鴨生長(zhǎng)性狀中的應(yīng)用。

4.權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記和/或權(quán)利要求2所述的檢測(cè)試劑在制備嘉積鴨育種產(chǎn)品中的應(yīng)用。

5.一種用于嘉積鴨育種的試劑盒，其特征在于，含有權(quán)利要求2所述的檢測(cè)試劑。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒還含有2×pcrsupermix和ddh2o。

7.一種評(píng)估嘉積鴨生長(zhǎng)性狀的方法，其特征在于，用權(quán)利要求2所述的檢測(cè)試劑檢測(cè)權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記。

8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其特征在于，包括以下步驟：

9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的方法，其特征在于，步驟s2所述測(cè)序?yàn)閟anger測(cè)序。

10.根據(jù)權(quán)利要求8所述的方法，其特征在于，步驟s3所述的生長(zhǎng)性狀包括龍骨長(zhǎng)、脛長(zhǎng)、體重、胸深、脛圍和/或體斜長(zhǎng)。

技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開了用于嘉積鴨育種的分子標(biāo)記、檢測(cè)試劑、方法及其應(yīng)用。本發(fā)明分別在嘉積鴨APOC3基因的5'UTR區(qū)、內(nèi)含子區(qū)和外顯子區(qū)篩選得到7個(gè)與嘉積鴨的生長(zhǎng)性狀顯著相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)，可作為嘉積鴨品種遺傳改良的分子標(biāo)記。采用這些分子標(biāo)記對(duì)嘉積鴨進(jìn)行選育，有利于提高嘉積鴨群體的生長(zhǎng)性狀。本發(fā)明還提供了檢測(cè)這些分子標(biāo)記的檢測(cè)引物、試劑盒及育種方法，可用于嘉積鴨育種的早期輔助選擇，對(duì)選育出更容易符合出欄標(biāo)準(zhǔn)的嘉積鴨具有重要意義。

技術(shù)研發(fā)人員：徐鐵山,謝攀攀,張麗,顧麗紅
受保護(hù)的技術(shù)使用者：中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶作物品種資源研究所
技術(shù)研發(fā)日：
技術(shù)公布日：2025/1/9