本公開涉及生物,特別涉及一種用于鑒定水稻耐冷性的引物對(duì)及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、水稻(oryza?sativa?l.)是世界上最主要的糧食作物之一,全球一半以上人口以稻米為主食。水稻起源于熱帶和亞熱帶,相較于小麥和大麥等作物,水稻對(duì)低溫更加敏感。近年來(lái),全球水稻常年播種面積約為1.4億公頃,其中1500萬(wàn)公頃以上稻作面積受到低溫威脅。
2、目前,已克隆的影響水稻苗期耐冷性的自然變異基因還比較少。更多地挖掘出耐冷性基因,并利用分子標(biāo)記輔助選擇改良水稻的耐冷性,能夠使水稻避免低溫威脅,從而培育出抵御低溫冷害的優(yōu)良水稻品種。
3、公開內(nèi)容
4、為了解決現(xiàn)有技術(shù)的問(wèn)題,本公開實(shí)施例提供了一種用于鑒定水稻耐冷性的引物對(duì)及其應(yīng)用。所述技術(shù)方案如下:
5、一方面,本公開提供了一種用于鑒定水稻耐冷性的引物對(duì),所述引物對(duì)包括正向引物和反向引物,所述正向引物的序列如序列表中seq?id?no:1所示,所述反向引物的序列如序列表中seq?id?no:2所示。
6、另一方面,本公開提供了一種上述用于鑒定水稻耐冷性的引物對(duì)的應(yīng)用,所述應(yīng)用包括:
7、以待測(cè)樣本的dna作為模板,采用所述正向引物和所述反向引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增,得到擴(kuò)增產(chǎn)物;
8、采用凝膠電泳檢測(cè)所述擴(kuò)增產(chǎn)物中的條帶;
9、若所述擴(kuò)增產(chǎn)物中的條帶包括目的條帶,所述目的條帶為117bp,則所述待測(cè)樣本攜帶cold11優(yōu)良等位基因。
10、具體地,采用濃度為4%的聚丙烯酰胺凝膠進(jìn)行凝膠電泳。
11、具體地,每20μl?pcr擴(kuò)增的反應(yīng)體系包括:2×rapid?taq?plus?master?mix?10μl;濃度為10μm的所述正向引物0.3μl;濃度為10μm的所述反向引物0.3μl;模板dna?3μl;ddh2o?6.4μl。
12、本公開實(shí)施例提供的技術(shù)方案帶來(lái)的有益效果是:本公開實(shí)施例提供了一種用于鑒定水稻耐冷性的引物對(duì)及其應(yīng)用,該引物對(duì)用于鑒定cold11的功能變異位點(diǎn)indel標(biāo)記位點(diǎn),從而準(zhǔn)確獲知待測(cè)樣本是否攜帶cold11優(yōu)良等位基因,進(jìn)而準(zhǔn)確判斷水稻的耐冷性,為培育抵御低溫冷害的優(yōu)良水稻品種提供技術(shù)支持。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1.一種用于鑒定水稻耐冷性的引物對(duì),其特征在于,所述引物對(duì)包括正向引物和反向引物,所述正向引物的序列如序列表中seq?id?no:1所示,所述反向引物的序列如序列表中seq?id?no:2所示。
2.一種如權(quán)利要求1所述的用于鑒定水稻耐冷性的引物對(duì)的應(yīng)用,其特征在于,所述應(yīng)用包括:
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用,其特征在于,采用濃度為4%的聚丙烯酰胺凝膠進(jìn)行凝膠電泳。
4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用,其特征在于,每20μl?pcr擴(kuò)增的反應(yīng)體系包括:2×rapid?taq?plus?master?mix?10μl;濃度為10μm的所述正向引物0.3μl;濃度為10μm的所述反向引物0.3μl;模板dna?3μl;ddh2o?6.4μl。