本發(fā)明涉及生物,具體涉及生物檢測(cè),更具體的涉及鑒定飼用燕麥品種的snp組合及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、燕麥(avena?sativa?l.)是一種一年生草本植物,屬于禾本科。其籽實(shí)營養(yǎng)價(jià)值高,含有豐富的膳食纖維和抗氧化劑,有助于降低餐后血糖。燕麥草能夠增加乃產(chǎn)量和奶品質(zhì),是奶牛的重要日糧組成。近年來,燕麥因其營養(yǎng)豐富而受到重視,燕麥新品種的選育研究取得了飛速發(fā)展,迫切需要一種能夠快速鑒定燕麥新品種的方法,以便能夠及時(shí)進(jìn)行品種確認(rèn)并實(shí)施保護(hù)。傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)鑒定方法通過不同品種間表型性狀差異對(duì)不同品種進(jìn)行鑒定,雖然直觀可靠,但鑒定過程繁瑣費(fèi)力,所需時(shí)間長,而且對(duì)表型性狀相近的品種鑒別困難;dna分子標(biāo)記能夠利用不同品種在dna分子水平上的差異來對(duì)不同品種進(jìn)行鑒定,其中dna指紋圖譜因其多位點(diǎn)性、高變異性、簡單而穩(wěn)定的遺傳性而廣泛用于鑒定個(gè)體,這對(duì)研究動(dòng)植物群體遺傳結(jié)構(gòu)、生態(tài)與進(jìn)化、分類等很有價(jià)值的遺傳標(biāo)記。
2、鑒于此,本發(fā)明提供一種能夠鑒定飼用燕麥品種dna指紋圖譜。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、為滿足當(dāng)前燕麥品種研究以及農(nóng)業(yè)生產(chǎn)上對(duì)燕麥品種鑒定的需求,本發(fā)明提供了一種鑒定飼用燕麥品種dna指紋圖譜及其應(yīng)用,利用本發(fā)明提供的dna指紋圖譜信息,能夠快速準(zhǔn)確的鑒定燕麥品種,能夠用于品種篩選、品種溯源、育種,有利于種質(zhì)資源收集、保護(hù)以及種質(zhì)資源改良,耗時(shí)短、成本低、市場(chǎng)效益廣闊。
2、為實(shí)現(xiàn)本發(fā)明的技術(shù)目的,本發(fā)明提供以下技術(shù)方案:
3、第一方面,本發(fā)明提供一種鑒定飼用燕麥品種dna指紋圖譜,其包括21個(gè)snp位點(diǎn),其物理位置及序列信息如表1所示,具體的,所述序列如seq?id?no.1-seq?id?no.21所示:
4、表1?21個(gè)位點(diǎn)組合的位置及序列信息
5、
6、
7、第二方面提供鑒定燕麥品種的方法,將待測(cè)燕麥品種的基因組dna的21個(gè)snp位點(diǎn)基因型與所述21個(gè)snp位點(diǎn)形成的指紋圖譜進(jìn)行比較;
8、其中,所述21個(gè)snp位點(diǎn)為表1所述的21個(gè)snp位點(diǎn)。
9、第三方面提供鑒定燕麥品種的引物組合,所述引物組合能夠擴(kuò)增待測(cè)樣品中表1中所述的snp位點(diǎn)序列。
10、第四方面提供鑒定燕麥品種的分子探針組合,所述分子探針組合能夠檢測(cè)待測(cè)樣品中如表1中所述的snp位點(diǎn)組合。
11、第五方面提供鑒定燕麥品種的基因芯片,所述基因芯片負(fù)載有上述的引物組合或分子探針組合。
12、第六方面提供鑒定燕麥品種的試劑盒,其具有上述的引物組合或分子探針組合或基因芯片。
13、第七方面提供鑒定燕麥品種的方法,應(yīng)用上述的引物組合或分子探針組合或基因芯片或試劑盒對(duì)待測(cè)樣品進(jìn)行檢測(cè)。
14、第八方面提供鑒定飼用燕麥品種dna指紋圖譜在如下任一中的應(yīng)用:
15、(a1)鑒定或輔助鑒定飼用燕麥品種;
16、(a2)鑒定或輔助鑒定飼用燕麥種質(zhì)資源;
17、(a3)飼用燕麥育種。
18、有益效果:
19、本發(fā)明提供的鑒定飼用燕麥的dna指紋圖譜能夠?qū)崿F(xiàn)用盡量少的標(biāo)記鑒別多品種以達(dá)到簡單、高效經(jīng)濟(jì)的目。能夠在燕麥作物血緣關(guān)系和遺傳基礎(chǔ)、品種審定定、假冒偽劣種子鑒別管理檢測(cè)遺傳育及作物圖等方面發(fā)揮著重要作用。
1.鑒定飼用燕麥品種dna指紋圖譜,包括21個(gè)snp位點(diǎn)組合,其物理位置如下表所示,其序列如seq?id?no.1-seq?id?no.21所示:
2.鑒定燕麥品種的方法,將待測(cè)燕麥品種的基因組dna的21個(gè)snp位點(diǎn)基因型與所述21個(gè)snp位點(diǎn)形成的指紋圖譜進(jìn)行比較;
3.鑒定燕麥品種的引物組合,所述引物組合能夠擴(kuò)增待測(cè)樣品中如權(quán)利要求1中所述的snp位點(diǎn)序列。
4.鑒定燕麥品種的分子探針組合,所述分子探針組合能夠檢測(cè)待測(cè)樣品中如權(quán)利要求1中所述的snp位點(diǎn)組合。
5.鑒定燕麥品種的基因芯片,所述基因芯片負(fù)載有權(quán)利要求3所述的引物組合或權(quán)利要求4所述的分子探針組合。
6.鑒定燕麥品種的試劑盒,其具有權(quán)利要求3所述的引物組合或權(quán)利要求4所述的分子探針組合或權(quán)利要求5所述的基因芯片。
7.鑒定燕麥品種的方法,應(yīng)用權(quán)利要求3所述的引物組合或權(quán)利要求4所述的分子探針組合或權(quán)利要求5所述的基因芯片或權(quán)利要求6所述的試劑盒對(duì)待測(cè)樣品進(jìn)行檢測(cè)。
8.鑒定飼用燕麥品種dna指紋圖譜在如下任一中的應(yīng)用: