本發(fā)明涉及黃瓜果形鑒定,尤其是涉及一種快速鑒定黃瓜果實(shí)橫徑的分子標(biāo)記、鑒定方法及應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、黃瓜(cucumissativus?l.)口感爽脆,富含多種人體所需的維生素,具有美容養(yǎng)顏、延緩衰老等功效,深受各年齡段消費(fèi)者的喜愛(ài),為葫蘆科甜瓜屬的重要經(jīng)濟(jì)作物,在世界范圍內(nèi)廣泛種植,其中,我國(guó)是世界上最大的黃瓜種植和生產(chǎn)國(guó)。
2、隨著人們生活水平的提高,對(duì)高品質(zhì)蔬菜的需求量越來(lái)越大,對(duì)蔬菜外觀品質(zhì)的重視程度也越來(lái)越高。果實(shí)形狀為黃瓜重要的外觀品質(zhì)性狀,通常由果形指數(shù)決定,果形指數(shù)=果實(shí)縱徑/果實(shí)橫徑,黃瓜的果實(shí)形狀會(huì)對(duì)黃瓜的商品性和產(chǎn)量產(chǎn)生重大影響,還會(huì)對(duì)其在市場(chǎng)上的等級(jí)劃分產(chǎn)生影響。
3、果實(shí)形狀為數(shù)量遺傳性狀,主效基因和多個(gè)微效基因協(xié)同作用,與質(zhì)量性狀不同,黃瓜果形不僅受遺傳因素影響,包括溫濕度、土壤條件、病蟲(chóng)害以及授粉等的外界環(huán)境條件同樣會(huì)對(duì)黃瓜果形造成影響,這進(jìn)一步增加了果形相關(guān)基因定位的難度,目前,關(guān)于黃瓜果形的研究大多停留在粗定位水平,只有少量相關(guān)基因被成功克隆。因此,開(kāi)發(fā)出與果實(shí)形狀緊密連鎖的分子標(biāo)記,在苗期即可實(shí)現(xiàn)黃瓜果實(shí)形狀的鑒定,對(duì)于簡(jiǎn)化黃瓜果形育種工作、促進(jìn)黃瓜果形育種進(jìn)程具有重要意義。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本發(fā)明的目的是提供一種快速鑒定黃瓜果實(shí)橫徑的分子標(biāo)記、鑒定方法及應(yīng)用,以實(shí)現(xiàn)黃瓜果形的苗期鑒定,大幅縮短鑒定時(shí)間和成本,進(jìn)而為簡(jiǎn)化黃瓜果形育種工作、促進(jìn)黃瓜果形育種進(jìn)程助力。
2、為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提供一種快速鑒定黃瓜果實(shí)橫徑的分子標(biāo)記,分子標(biāo)記為t6-1和w6-4;分子標(biāo)記w6-4的上游引物序列如seq?id?no.1所示,下游引物序列如seq?idno.2所示;分子標(biāo)記t6-1的上游引物序列如seq?id?no.13所示,下游引物序列如seq?idno.14所示。
3、優(yōu)選的,分子標(biāo)記t6-1和w6-4位于6號(hào)染色體,t6-1位于15.18mb,w6-4位于15.32mb,物理距離為141.89kb。
4、優(yōu)選的,細(xì)橫徑果實(shí)在分子標(biāo)記t6-1和w6-4之間發(fā)生交換,設(shè)定分子標(biāo)記t6-1和w6-4在長(zhǎng)果自交系的基因型為aa,圓果自交系的基因型為bb,細(xì)橫徑果實(shí)中分子標(biāo)記t6-1和w6-4的條帶為ab或ba,粗橫徑果實(shí)中為bb。
5、優(yōu)選的,細(xì)橫徑果實(shí)指果形指數(shù)大于1.10的果實(shí),粗橫徑果實(shí)指果形指數(shù)小于1.10的果實(shí)。
6、優(yōu)選的,果形指數(shù)=果實(shí)縱徑/果實(shí)橫徑,果實(shí)縱徑為黃瓜果柄與果實(shí)連接處到果實(shí)頂端的長(zhǎng)度數(shù)值,果實(shí)橫徑為黃瓜果實(shí)居中位置的直徑值。
7、一種快速鑒定黃瓜果實(shí)橫徑的方法,應(yīng)用上述分子標(biāo)記進(jìn)行鑒定,步驟如下:
8、s1、提取待測(cè)黃瓜植株的基因組dna;
9、s2、以步驟s1獲得的dna溶液為模板,配制反應(yīng)體系,進(jìn)行pcr擴(kuò)增;
10、s3、將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行電泳,讀取電泳條帶信息,確定待測(cè)黃瓜植株商品瓜時(shí)期的果實(shí)為細(xì)橫徑果實(shí)或粗橫徑果實(shí)。
11、優(yōu)選的,步驟s2中的反應(yīng)體系按taq酶所附說(shuō)明書(shū)進(jìn)行配制。
12、優(yōu)選的,步驟s2中的pcr擴(kuò)增程序?yàn)?4℃,5min;94℃,30s,tm,30s,72℃,10s,35個(gè)循環(huán);72℃,10s;72℃,10min,tm均為50-60℃。
13、一種如上所述的快速鑒定黃瓜果實(shí)橫徑的分子標(biāo)記在黃瓜果形品種選育中的應(yīng)用。
14、因此,本發(fā)明提供的一種快速鑒定黃瓜果實(shí)橫徑的分子標(biāo)記、鑒定方法及應(yīng)用,其具體技術(shù)效果如下:
15、(1)本發(fā)明提供了兩個(gè)與黃瓜果實(shí)橫徑緊密連鎖的分子標(biāo)記——t6-1和w6-4,t6-1和w6-4位于6號(hào)染色體,物理距離為141.89kb;細(xì)橫徑果實(shí)在分子標(biāo)記t6-1和w6-4之間發(fā)生交換,設(shè)定分子標(biāo)記t6-1和w6-4在長(zhǎng)果自交系的基因型為aa,圓果自交系的基因型為bb,細(xì)橫徑果實(shí)中分子標(biāo)記t6-1和w6-4的條帶為ab或ba,粗橫徑果實(shí)中為bb;
16、(2)采用本發(fā)明提供的分子標(biāo)記及鑒定方法,在苗期即可實(shí)現(xiàn)對(duì)商品瓜時(shí)期黃瓜果實(shí)橫徑的快速檢測(cè),大幅降低鑒定時(shí)間、節(jié)約鑒定成本,且鑒定結(jié)果不受環(huán)境因素影響,穩(wěn)定可靠;對(duì)于簡(jiǎn)化黃瓜果形育種工作、促進(jìn)黃瓜果形育種進(jìn)程具有重要意義。
1.一種快速鑒定黃瓜果實(shí)橫徑的分子標(biāo)記,其特征在于:分子標(biāo)記為t6-1和w6-4;分子標(biāo)記w6-4的上游引物序列如seq?id?no.1所示,下游引物序列如seq?id?no.2所示;分子標(biāo)記t6-1的上游引物序列如seq?id?no.13所示,下游引物序列如seq?id?no.14所示。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種快速鑒定黃瓜果實(shí)橫徑的分子標(biāo)記,其特征在于:分子標(biāo)記t6-1和w6-4位于6號(hào)染色體,t6-1位于15.18mb,w6-4位于15.32mb,物理距離為141.89kb。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種快速鑒定黃瓜果實(shí)橫徑的分子標(biāo)記,其特征在于:細(xì)橫徑果實(shí)在分子標(biāo)記t6-1和w6-4之間發(fā)生交換,設(shè)定分子標(biāo)記t6-1和w6-4在長(zhǎng)果自交系的基因型為aa,圓果自交系的基因型為bb,細(xì)橫徑果實(shí)中分子標(biāo)記t6-1和w6-4的條帶為ab或ba,粗橫徑果實(shí)中為bb。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的一種快速鑒定黃瓜果實(shí)橫徑的分子標(biāo)記,其特征在于:細(xì)橫徑果實(shí)指果形指數(shù)大于1.10的果實(shí),粗橫徑果實(shí)指果形指數(shù)小于1.10的果實(shí)。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的一種快速鑒定黃瓜果實(shí)橫徑的分子標(biāo)記,其特征在于:果形指數(shù)=果實(shí)縱徑/果實(shí)橫徑,果實(shí)縱徑為黃瓜果柄與果實(shí)連接處到果實(shí)頂端的長(zhǎng)度數(shù)值,果實(shí)橫徑為黃瓜果實(shí)居中位置的直徑值。
6.一種快速鑒定黃瓜果實(shí)橫徑的方法,其特征在于,應(yīng)用權(quán)利要求1~5任一項(xiàng)中所述的分子標(biāo)記進(jìn)行鑒定,步驟如下:
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的一種快速鑒定黃瓜果實(shí)橫徑的方法,其特征在于:步驟s2中的反應(yīng)體系按taq酶所附說(shuō)明書(shū)進(jìn)行配制。
8.根據(jù)權(quán)利要求6所述的一種快速鑒定黃瓜果實(shí)橫徑的方法,其特征在于:步驟s2中的pcr擴(kuò)增程序?yàn)?4℃,5min;94℃,30s,tm,30s,72℃,10s,35個(gè)循環(huán);72℃,10s;72℃,10min,tm均為50-60℃。
9.一種如權(quán)利要求1~5任一項(xiàng)所述的快速鑒定黃瓜果實(shí)橫徑的分子標(biāo)記在黃瓜果形品種選育中的應(yīng)用。