本發(fā)明涉及生物,尤其涉及煙草ntacs3基因及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、煙草是一種重要的經(jīng)濟(jì)作物,煙葉是卷葉工業(yè)的基本原料,煙葉質(zhì)量決定了其工業(yè)可用性。
2、二氯喹啉酸是主要用于防除稻田稗草,是我國(guó)稻田芽前苗后的主要除草劑品種,目前由于長(zhǎng)期大量的使用,在我國(guó)部分地區(qū)已經(jīng)陸續(xù)發(fā)生二氯喹啉酸藥害,造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。二氯喹啉酸積累造成煙草葉片卷曲畸形,使煙葉產(chǎn)量大幅度下降甚至絕收;同時(shí)導(dǎo)致煙葉煙堿含量上升,還原糖含量下降,影響煙草品質(zhì),進(jìn)一步影響煙葉的工業(yè)可用性和安全性。
3、可見,提高煙草對(duì)二氯喹啉酸抗性或減少二氯喹啉酸藥物的使用迫在眉睫;但目前二氯喹啉酸已經(jīng)在土壤中大量積累,因此進(jìn)行煙草育種,提高煙草對(duì)二氯喹啉酸抗性,是解決煙草二氯喹啉酸藥害的主要手段。所以,挖掘二氯喹啉酸抗性基因,利用基因工程手段,將其應(yīng)用于煙草育種,具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、有鑒于此,本發(fā)明要解決的技術(shù)問題在于提供煙草ntacs3基因及其應(yīng)用。
2、本發(fā)明提供了acs3作為靶標(biāo)在植物育種中和/或制備輔助植物育種的產(chǎn)品中的應(yīng)用;
3、本發(fā)明所述的應(yīng)用中,所述acs3包括如下a)~c)所示氨基酸序列中的至少一種:
4、a)、如seq?id?no:2所示的氨基酸序列;或
5、b)、將如a)所述的氨基酸序列經(jīng)取代、缺失或添加一個(gè)或多個(gè)氨基酸獲得的氨基酸序列,且與(a)所述的氨基酸序列功能相同的氨基酸序列;或
6、c)、與如(a)或(b)所述的氨基酸序列具有至少90%序列一致性的氨基酸序列。
7、進(jìn)一步的,
8、所述植物育種包括調(diào)控植物對(duì)二氯喹啉酸的抗性;
9、所述調(diào)控包括升高或降低;所述降低包括功能部分喪失或功能全部喪失;本發(fā)明的具體實(shí)施例中,acs3功能全部喪失,植物對(duì)二氯喹啉酸的抗性增強(qiáng)。
10、所述植物茄科植物;本發(fā)明的具體實(shí)施例中,為煙草。
11、本發(fā)明提供了植物育種或輔助育種的產(chǎn)品,其包括如下a)~c所示中的至少一種:
12、a)、以編碼所述acs3的核酸為模板的擴(kuò)增引物、檢測(cè)引物和/或靶向引物;
13、b)、靶向所述acs3的干擾片段;
14、c)、靶向所述acs3的grna;
15、d)、含有如b)所述干擾片段,或如c)所述grna的表達(dá)盒;
16、e)、含有如b)所述干擾片段,或如c)所述grna,或如d)所述干擾片段的重組載體;
17、f)、轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染如e)所述重組載體的宿主細(xì)胞;
18、g)、培養(yǎng)如f)所述的宿主細(xì)胞獲得的混合物。
19、進(jìn)一步的,本發(fā)明所述的產(chǎn)品中,
20、所述grna的靶標(biāo)核苷酸序列如seq?id?no:9所示;本發(fā)明中,將所述grna重組于crispr/cas9載體,其靶標(biāo)核苷酸序列如seq?id?no:9所示;然后轉(zhuǎn)化煙草,經(jīng)crispr/cas9系統(tǒng)基因編輯后獲得了煙草acs3變體,其在如seq?id?no:1所示核苷酸序列的第374和375bp之間插入一個(gè)堿基a,產(chǎn)生移碼突變,導(dǎo)致煙草acs3功能的喪失和/或降低。
21、編碼所述acs3的核酸包括如下i)~v)所示的核酸中的至少一種:
22、i)、具有如seq?id?no:1所示的核苷酸序列;或
23、ii)、與如i)所示的核酸分子中的至少一個(gè)互補(bǔ)核酸分子;或
24、iii)、與i)或ii)的核酸分子編碼相同蛋白質(zhì),但因遺傳密碼的簡(jiǎn)并性而與i)或ii)的核酸分子不同的核酸分子;或
25、iv)、與i)、ii)或iii)所示的核酸分子經(jīng)取代、缺失或添加一個(gè)或多個(gè)堿基獲得的核酸分子,且與i)、ii)或iii)所示的核酸分子功能相同或相似的核酸分子;或
26、v)、與i)、ii)、iii)或iv)所述核苷酸序列具有至少80%序列一致性的核酸分子。
27、本發(fā)明所述核酸,其可以是dna、rna或cdna。在本發(fā)明實(shí)施例中,所述核酸為dna或rna形式。所述dna形式包括cdna、基因組dna或人工合成的dna。所述dna可以是單鏈的或是雙鏈的;本發(fā)明對(duì)此不作限定。
28、本發(fā)明所述表達(dá)盒是指啟動(dòng)子開始至終止子結(jié)束的?dna序列。啟動(dòng)子和終止子兩側(cè)或之間還可包括調(diào)控片段,所述調(diào)控片段可以包括與核酸序列可操作地連接的啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)、多腺苷酸化序列、復(fù)制起點(diǎn)、核酸限制性位點(diǎn)、和同源重組位點(diǎn),例如啟動(dòng)子的增強(qiáng)子,poly(a)信號(hào)等。
29、本發(fā)明所述的重組載體為重組dna分子,其包含期望的編碼序列和對(duì)可操作連接的編碼基因在具體宿主生物內(nèi)的表達(dá)、復(fù)制或完成對(duì)目的操作所必不可少的合適的核酸序列或元件;本發(fā)明中,所述重組載體包括克隆載體、表達(dá)載體或行使功能干擾或功能缺失的載體;本發(fā)明的具體實(shí)施例中,包括克隆載體,其用于所述acs3基因的克隆和基因序列分析;本發(fā)明的另一些具體的實(shí)施例中,包括使功能缺失的crispr/cas9載體;根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康牡牟煌?,選擇合適的載體是本領(lǐng)域技術(shù)人源所采取的常規(guī)手段,本發(fā)明對(duì)此不作贅述。
30、在本說明書中,“質(zhì)?!焙汀拜d體”有時(shí)可以交換通用,因?yàn)橘|(zhì)粒是當(dāng)前最普遍使用的載體形式。然而,本發(fā)明意圖包括表達(dá)載體的這樣的其它形式,其發(fā)揮等價(jià)作用,其在本領(lǐng)域是已知的或?qū)⒆優(yōu)橐阎?,包括但不限于:質(zhì)粒,噬菌體顆粒,病毒載體和/或僅為潛在的基因組插入物。
31、本發(fā)明中,所述轉(zhuǎn)化的方法包括:化學(xué)轉(zhuǎn)化和電轉(zhuǎn)化;所述轉(zhuǎn)染的方法包括磷酸鈣共沉淀、人工脂質(zhì)體法、病毒轉(zhuǎn)染或農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)染。所述的病毒轉(zhuǎn)染包括腺病毒轉(zhuǎn)染、腺相關(guān)病毒轉(zhuǎn)染、慢病毒轉(zhuǎn)染等。本發(fā)明的具體實(shí)施粒中,采用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的葉盤法制備acs3基因功能缺失突變株用于acs3基因功能的研究。
32、本發(fā)明提供了試劑盒,其包括輔料和本發(fā)明所述的產(chǎn)品。
33、所述輔料用于保存所述產(chǎn)品、維持所述產(chǎn)品的活性、或輔助所述產(chǎn)品發(fā)揮作用,完成相應(yīng)的功能;本發(fā)明中,所述輔料包括:dna提取試劑、dna反轉(zhuǎn)錄試劑、緩沖液、轉(zhuǎn)染試劑、抗生素和/或培養(yǎng)基中的至少一種。
34、本發(fā)明提供了所述的產(chǎn)品或所述的試劑盒在植物育種或輔助植物育種中的應(yīng)用。
35、本發(fā)明提供了植物育種或輔助植物育種的方法,其包括利用本發(fā)明所述的產(chǎn)品或本發(fā)明所述的試劑盒進(jìn)行植物育種。
36、本發(fā)明提供了煙草ntacs3基因在提高煙草對(duì)二氯喹啉酸抗性中的應(yīng)用。敲除煙草ntacs3基因,能夠賦予煙草對(duì)二氯喹啉酸的抗性,從而消除或者減輕藥害給煙葉生產(chǎn)造成的損失。
1.acs3作為靶標(biāo)在植物育種中和/或制備輔助植物育種的產(chǎn)品中的應(yīng)用;
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的應(yīng)用,其特征在于,所述植物育種包括調(diào)控植物對(duì)二氯喹啉酸的抗性。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用,其特征在于,所述調(diào)控包括升高或降低。
4.根據(jù)權(quán)利要求1~3任一項(xiàng)所述的應(yīng)用,其特征在于,所述植物茄科植物。
5.植物育種或輔助育種的產(chǎn)品,其特征在于,包括如下a)~c所示中的至少一種:
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的產(chǎn)品,其特征在于,
7.試劑盒,其特征在于,包括輔料和權(quán)利要求5或6所述的產(chǎn)品。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的試劑盒,其特征在于,所述輔料包括:dna提取試劑、dna反轉(zhuǎn)錄試劑、緩沖液、轉(zhuǎn)染試劑、抗生素和/或培養(yǎng)基中的至少一種。
9.權(quán)利要求5或6所述的產(chǎn)品或權(quán)利要求7或8所述的試劑盒在植物育種或輔助植物育種中的應(yīng)用。
10.植物育種或輔助植物育種的方法,其特征在于,包括利用權(quán)利要求5或6所述的產(chǎn)品或權(quán)利要求7或8所述的試劑盒進(jìn)行植物育種。