本發(fā)明涉及植物基因工程與遺傳改良,具體涉及一種oshcrf2功能蛋白及其編碼基因在水稻育種中的應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、近年來(lái),水稻功能基因組研究的快速發(fā)展,為我國(guó)水稻遺傳育種鑒定了大量的有重要利用價(jià)值的基因,水稻育種正邁向設(shè)計(jì)育種的新時(shí)代(中國(guó)稻米,周正平等,2019)。水稻育種的創(chuàng)新發(fā)展為我國(guó)口糧安全提供了重要保障,提高單產(chǎn)仍是未來(lái)一段時(shí)期內(nèi)我國(guó)水稻育種的主攻方向。因此仍要繼續(xù)重視發(fā)掘、克隆和鑒定新的水稻重要農(nóng)藝性狀調(diào)控基因,為設(shè)計(jì)育種提供元件,服務(wù)于新時(shí)期水稻育種的精準(zhǔn)化、數(shù)據(jù)化和智能化戰(zhàn)略需求(中國(guó)稻米,周正平等,2019)。
2、根據(jù)維基百科(https://en.wikipedia.org/wiki/homeodomain),典型的dna結(jié)合homeodomain由60個(gè)氨基酸長(zhǎng)的hth(helix-turn-helix)結(jié)構(gòu)組成,而tale(three?aminoacid?loop?extension)homeodomain由63個(gè)氨基酸組成。根據(jù)這些homeodomain蛋白保守的內(nèi)元-外元結(jié)構(gòu)以及獨(dú)特的codomain,分為hd-zip?i-iv,?bel,?knox,?plinc,?wox,?phd等14個(gè)不同類(lèi)型。
3、水稻中 oshcrf2的同源基因 oshcrf1可調(diào)控水稻株高、穗長(zhǎng)、葉綠體發(fā)育和葉綠素含量等重要農(nóng)藝性狀(專(zhuān)利zl202010110531?.1)。
4、 oshcrf2編碼homeodomain-like?containing?protein,還未見(jiàn) oshcrf2調(diào)控水稻重要農(nóng)藝性狀的相關(guān)報(bào)道。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、為解決上述問(wèn)題,本發(fā)明提供了水稻oshcrf2功能蛋白、編碼基因及其在水稻育種中的應(yīng)用。
2、本發(fā)明提供的技術(shù)方案是:通過(guò)基因編輯技術(shù)創(chuàng)制 oshcrf2功能缺失突變體,通過(guò)轉(zhuǎn)基因過(guò)表達(dá)技術(shù)創(chuàng)制 oshcrf2過(guò)表達(dá)材料,研究其在調(diào)控水稻重要農(nóng)藝性狀方面的功能。
3、從 oshcrf2編碼序列(seq?id?no:1)選取了一條19?bp的特異編輯靶序列(seq?idno:2),利用t4?dna?ligase?(neb,?ipswich,?ma,?usa)構(gòu)建敲除載體phun4c12- oshcrf2。通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化獲得了靶序列插入1個(gè)a或t堿基的多個(gè)水稻株系。突變的靶序列如seq?id?no:3和id?no:4所示。突變1產(chǎn)生移碼,從n端第80個(gè)氨基酸開(kāi)始與野生型(seq?idno:5)不同,并在第87個(gè)氨基酸后提前終止。突變后氨基酸序列如seq?id?no:6所示。突變2產(chǎn)生移碼,從n端第79個(gè)氨基酸開(kāi)始與野生型(seq?id?no:5)不同,并在第87個(gè)氨基酸后提前終止。突變后氨基酸序列如seq?id?no:7所示。
4、將 oshcrf2編碼序列(seq?id?no:1),刪去終止密碼子,通過(guò)同源重組方法整合進(jìn)改造的并經(jīng) bamhi?(neb)和 saci?(neb)雙酶切的pcambia1303載體,使其處于 ubi-1啟動(dòng)子之3’端,受其驅(qū)動(dòng)。利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化獲得粳稻品種kitaake為背景的 oshcrf2過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)基因株系。
5、本發(fā)明的有益效果是:1.?本發(fā)明發(fā)現(xiàn)一個(gè)新的調(diào)控水稻穗粒數(shù)、實(shí)粒數(shù)和穗長(zhǎng)的功能蛋白及其編碼基因 oshcrf2。通過(guò)基因編輯敲除,得到的 oshcrf2水稻突變體穗粒數(shù)和實(shí)粒數(shù)顯著增加,穗長(zhǎng)增加,為培育高產(chǎn)水稻品種提供了有重大潛在利用價(jià)值的基因和種質(zhì)材料。
6、2.?本發(fā)明發(fā)現(xiàn)一個(gè)新的調(diào)控水稻抽穗期和成熟期的功能蛋白及其編碼基因 oshcrf2。通過(guò)基因編輯敲除,得到的 oshcrf2水稻突變體抽穗和成熟均提前,為培育早熟水稻品種提供了有重大潛在利用價(jià)值的基因和種質(zhì)材料。
1.水稻oshcrf2功能蛋白及其編碼基因在水稻育種中的應(yīng)用,其特征在于,所述水稻oshcrf2功能蛋白的氨基酸序列如序列表seq?id?no:5所示,基因的核苷酸序列如序列表seq?id?no:1所示;