本申請(qǐng)涉及生物,具體涉及用于檢測(cè)畢氏腸微孢子蟲(chóng)的核酸組合、試劑和應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、畢氏腸微孢子蟲(chóng)(enterocyiozoon?bieneusi)?是一種人獸共患新發(fā)腸道原蟲(chóng),通過(guò)受污染的水源和食物等途徑傳播,可感染人和多種動(dòng)物,以腹瀉為主要臨床表現(xiàn)。
2、在畢氏腸微孢子蟲(chóng)的核酸檢測(cè)方法中,絕大多數(shù)都是采用巢氏pcr經(jīng)過(guò)兩輪擴(kuò)增后進(jìn)行跑膠。巢氏pcr方法的靈敏度、特異性較高,但操作過(guò)程相對(duì)繁瑣,時(shí)間約需4-5小時(shí),而且容易污染。本檢測(cè)方法時(shí)間較短,可在1小時(shí)內(nèi)完成檢測(cè)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、基于此,本申請(qǐng)一實(shí)施方式提供一種靈敏度高和特異性好的用于檢測(cè)畢氏腸微孢子蟲(chóng)的核酸組合、試劑及試劑盒;
2、本申請(qǐng)一實(shí)施方式還提供畢氏腸微孢子蟲(chóng)的檢測(cè)方法,該方法檢測(cè)靈敏且特異性好,操作簡(jiǎn)單、反應(yīng)時(shí)間短。
3、技術(shù)方案包括如下:
4、用于檢測(cè)畢氏腸微孢子蟲(chóng)的核酸組合,所述核酸組合包括rpa引物和crrna;所述rpa引物包括序列如seq?id?no:4和?seq?id?no:5所示的引物對(duì),所述crrna包括序列如seqid?no:7所示的crrna。
5、用于檢測(cè)畢氏腸微孢子蟲(chóng)的試劑,所述試劑包括所述的核酸組合。
6、在其中一個(gè)實(shí)施例中,所述試劑還包括rpa擴(kuò)增試劑,所述rpa擴(kuò)增試劑包括rpa酶、緩沖液和乙酸鎂中的一種或者多種。
7、在其中一個(gè)實(shí)施例中,所述試劑還包括crispr/cas12a檢測(cè)試劑;所述crispr/cas12a檢測(cè)試劑包括cas12a酶、緩沖液和ssdna熒光報(bào)告探針中的一種或者多種。
8、可選地,所述cas12a酶包括lbcas12a。
9、所述的核酸組合或所述的試劑在制備檢測(cè)畢氏腸微孢子蟲(chóng)的試劑盒中的用途。
10、用于檢測(cè)畢氏腸微孢子蟲(chóng)的試劑盒,包括所述的核酸組合或所述的試劑。
11、畢氏腸微孢子蟲(chóng)的檢測(cè)方法,包括:利用所述的試劑盒進(jìn)行檢測(cè)。
12、在其中一個(gè)實(shí)施例中,包括如下步驟:
13、以待測(cè)樣本的dna為模版,利用所述rpa引物進(jìn)行rpa恒溫?cái)U(kuò)增;
14、以所得的rpa擴(kuò)增產(chǎn)物為模版,加入所述crispr/cas12a檢測(cè)試劑進(jìn)行crispr反應(yīng),檢測(cè)熒光信號(hào);以及
15、根據(jù)檢測(cè)結(jié)果判斷待測(cè)樣本是否含有畢氏腸微孢子蟲(chóng)。
16、可選地,根據(jù)檢測(cè)結(jié)果判斷待測(cè)樣本是否含有畢氏腸微孢子蟲(chóng),包括:
17、當(dāng)待測(cè)樣本的熒光信號(hào)強(qiáng)度比陰性對(duì)照高出4倍及以上,則樣本中含有畢氏腸微孢子蟲(chóng);和/或,
18、選擇第1-5個(gè)循環(huán)中的任意一個(gè)的熒光值為起點(diǎn)熒光值,第60-64個(gè)循環(huán)中的任意一個(gè)的熒光值為終點(diǎn)熒光值,計(jì)算終點(diǎn)/起點(diǎn)的熒光值的比值,當(dāng)該比值大于4,則判定為陽(yáng)性結(jié)果。
19、在其中一個(gè)實(shí)施例中,rpa恒溫?cái)U(kuò)增滿(mǎn)足如下條件中的一個(gè)或多個(gè):
20、(1)rpa恒溫?cái)U(kuò)增的反應(yīng)體系包括25μl~35μl反應(yīng)緩沖液、10?μm引物各1μl~3μl、rpa酶干粉、dna模板2μl~6μl以及280?μmol/l乙酸鎂2μl?~3μl;以及
21、(2)rpa恒溫?cái)U(kuò)增的反應(yīng)條件包括溫度為37℃~40℃,時(shí)間為15min~30min。
22、在其中一個(gè)實(shí)施例中,所述crispr反應(yīng)滿(mǎn)足如下條件中的一個(gè)或多個(gè):
23、(1)crispr反應(yīng)的體系中,所述的crrna、cas12a酶和ssdna熒光報(bào)告探針的濃度分別為10nm~15nm、0.2μm?~1μm和0.2μm?~1μm;以及
24、(2)crispr反應(yīng)的條件包括溫度為36℃~38℃,時(shí)間為10min~30min。
25、相對(duì)于傳統(tǒng)技術(shù),本申請(qǐng)具備如下有益效果:
26、利用本申請(qǐng)的核酸組合檢測(cè)畢氏腸微孢子蟲(chóng)具有靈敏度高特異性好等優(yōu)點(diǎn);基于該核酸組合建立的畢氏腸微孢子蟲(chóng)的檢測(cè)方法同樣具有高靈敏和高特異性,且反應(yīng)時(shí)間短,在1小時(shí)內(nèi)可出檢測(cè)結(jié)果;此外,與實(shí)時(shí)熒光pcr方法比較,反應(yīng)過(guò)程在37℃~40℃的恒溫區(qū)間即可完成,對(duì)檢測(cè)設(shè)備的要求較低,能夠?qū)崿F(xiàn)快速檢測(cè)。
1.用于檢測(cè)畢氏腸微孢子蟲(chóng)的核酸組合,其特征在于,所述核酸組合包括rpa引物和crrna;
2.用于檢測(cè)畢氏腸微孢子蟲(chóng)的試劑,其特征在于,所述試劑包括權(quán)利要求1所述的核酸組合。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的試劑,其特征在于,所述試劑還包括rpa擴(kuò)增試劑,所述rpa擴(kuò)增試劑包括rpa酶、緩沖液和乙酸鎂中的一種或者多種。
4.根據(jù)權(quán)利要求2或3所述的試劑,其特征在于,所述試劑還包括crispr/cas12a檢測(cè)試劑;所述crispr/cas12a檢測(cè)試劑包括cas12a酶、緩沖液和ssdna熒光報(bào)告探針中的一種或者多種;
5.權(quán)利要求1所述的核酸組合或權(quán)利要求2至4中任一項(xiàng)所述的試劑在制備檢測(cè)畢氏腸微孢子蟲(chóng)的試劑盒中的用途。
6.用于檢測(cè)畢氏腸微孢子蟲(chóng)的試劑盒,其特征在于,包括權(quán)利要求1所述的核酸組合或權(quán)利要求2至4中任一項(xiàng)所述的試劑。
7.畢氏腸微孢子蟲(chóng)的檢測(cè)方法,其特征在于,包括:利用權(quán)利要求6所述的試劑盒進(jìn)行檢測(cè)。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的檢測(cè)方法,其特征在于,包括如下步驟:
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的檢測(cè)方法,其特征在于,rpa恒溫?cái)U(kuò)增滿(mǎn)足如下條件中的一個(gè)或多個(gè):
10.根據(jù)權(quán)利要求8或9所述的檢測(cè)方法,其特征在于,所述crispr反應(yīng)滿(mǎn)足如下條件中的一個(gè)或多個(gè):