一種來自淀粉酶產(chǎn)色鏈霉菌的l-谷氨酸氧化酶基因及其制備方法和應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明屬于微生物基因工程領(lǐng)域,具體涉及一種來自淀粉酶產(chǎn)色鏈霉菌的L-谷 氨酸氧化酶基因及其制備方法和應(yīng)用。
【背景技術(shù)】
[0002] L-谷氨酸氧化酶(LGOX)是一種以黃素腺嘌呤二核苷酸(FAD)為輔基的黃素蛋白 酶類,能專一地催化谷氨酸氧化成α -酮戊二酸、氨和過氧化氫,通過過氧化氫含量的變化 可以方便地測定谷氨酸的含量,利用L-谷氨酸氧化酶研制出谷氨酸檢測試劑盒和生物傳 感器,在食品工業(yè)和臨床生化檢測領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用(李玲等.L-谷氨酸氧化酶的分離 純化及酶學(xué)性質(zhì)的研宄.中國釀造.2012, 31(1) :140-143)。
[0003] 1983 年,Kusakabe 等從一株鏈霉菌 X-119-6 (Streptomyces sp. X-119-6)菌株 中分離出底物特異性的L-谷氨酸氧化酶,以L-谷氨酸為底物的Km值僅為0. 2mM,該酶 耐熱性較強(qiáng),除催化L-谷氨酸氧化外,僅對L-天冬氨酸有微弱的催化作用(Kusakabe H et al. Purification and purification of a new enzyme,1-glutamate oxidase,from Streptomycessp. X-119-6grown on wheat bran. Agric Biol Chem. 1983,47 :1323-1328), 2006年日本Yamasa公司構(gòu)建了鏈霉菌X-119-6基因組文庫,通過探針篩選獲得了 LGOX基 因,該基因長2103bp,編碼701個氨基酸,含有14個信號肽序列,成熟的蛋白也是由α、β、 γ三個亞基組成,一般組成二聚體形式,分子量大約為140KDa。他們構(gòu)建大腸桿菌強(qiáng)啟動 子調(diào)控LGOX基因表達(dá)的載體,轉(zhuǎn)化到大腸桿菌中,實(shí)現(xiàn)了 LGOX前體蛋白在大腸桿菌的高效 表達(dá),表達(dá)的前體蛋白經(jīng)過內(nèi)切蛋白酶處理后可以變成活性蛋白(US patent7109008)。目 前該產(chǎn)品轉(zhuǎn)由Kikkoman公司生產(chǎn)并壟斷了市場。
[0004] 由于LGOX生產(chǎn)被國外企業(yè)控制,我國在上述領(lǐng)域研宄相對滯后,而至今所篩選到 的L-谷氨酸氧化酶產(chǎn)生菌的產(chǎn)酶能力大多很低,即使經(jīng)過誘變,產(chǎn)酶能力也不高,因此獲 得新型LGOX基因并實(shí)現(xiàn)基因工程化生產(chǎn)成為解決該酶來源的根本途徑。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0005] 本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題在于提供一種來自淀粉酶產(chǎn)色鏈霉菌的L-谷氨酸氧 化酶基因及其制備方法和應(yīng)用,利用基因合成法制備淀粉酶產(chǎn)色鏈霉菌L-谷氨酸氧化酶 基因,并對該基因進(jìn)行表達(dá)和酶的底物譜分析,以證明其能特異性催化L-谷氨酸,具有作 為L-谷氨酸含量檢測用酶的前景。
[0006] 本發(fā)明是通過如下技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)的:
[0007] 所述的來自淀粉酶產(chǎn)色鏈霉菌的L-谷氨酸氧化酶基因,其核苷酸序列如SEQ ID No. 1,其編碼的蛋白質(zhì)序列如SEQ ID No. 2。
[0008] 所述的淀粉酶產(chǎn)色鏈霉菌的L-谷氨酸氧化酶基因的獲取方法如下:
[0009] 利用含50ppm重鉻酸鉀的高氏一號培養(yǎng)基(高氏一號培養(yǎng)基:可溶性淀粉20g/L, KN03lg/L,K2HPO4O. 5g/L,MgSO4 · 7Η200· 5g/L,NaClO. 5g/L,F(xiàn)eSO4 · 7Η200· Olg/L,瓊脂 20g/L, pH = 7. 4),從土壤微生物中篩選產(chǎn)L-谷氨酸氧化酶的菌株,菌株在顯色液(0.1 M磷酸鹽緩 沖液(PH6. 5),0. 07 %的4-氨基安替吡啉,0. 8 %的L-谷氨酸,0. 1 %的苯酚,2000U/L的辣 根過氧化物酶)中顯紅色即為產(chǎn)L-谷氨酸氧化酶。
[0010] 將篩選得到的菌落提取總DNA,根據(jù)L-谷氨酸氧化酶保守盒子序列設(shè)計引物
[0011] Primer A :5' -AGTACGCGGAGGCCGGCGCCAT-3' 和 Primer B :
[0012] 5'-GCTGAACTCCAGCAGCACCTTGGT-3'為擴(kuò)增引物,以總 DNA 為模板,獲得一段 984bp 的PCR片段。以此序列為基礎(chǔ),采用Genome Walking Kit試劑盒(大連寶生物公司)獲取 其兩側(cè)的未知序列,查找完整的開放閱讀框,從而獲得該L-谷氨酸氧化酶基因的全序列。
[0013] 所述的堿基序列如序列表中SEQ ID No. 1所示的L-谷氨酸氧化酶基因可通過化 學(xué)合成方法得到。即采用大量重疊的引物通過兩步PCR進(jìn)行全基因的合成(PTDS) (Nucleic Acids Research,2004, 32 :e98)〇
[0014] 具體合成方法包括以下步驟:
[0015] 引物設(shè)計:設(shè)計長度大概為60bp左右的覆蓋整個L-谷氨酸氧化酶基因的寡核苷 酸的序列49個,其中每相鄰的兩個寡核苷酸序列有20個堿基的重復(fù)。
[0016] PCR擴(kuò)增:利用PCR進(jìn)行L-谷氨酸氧化酶基因擴(kuò)增。以SLG1-SLG12 ;SLG13-SLG24 ; SLG25-SLG36 ;SLG37-SLG48 為引物,利用 PCR 進(jìn)行擴(kuò)增 SLG1、SLG2、SLG3、SLG4 片段,在 50 μ 1 反應(yīng)體系中,其中內(nèi)側(cè)引物 SLG2-SLG11、SLG14-SLG23、SLG26-SLG35、SLG38-SLG47 引 物的添加量為 2ng,外側(cè)引物 SLG1、SLG12、SLG13、SLG24、SLG25、SLG36、SLG37、SLG48 個引 物添加量為30ng(引物序列見實(shí)施例4),擴(kuò)增條件為:94°C預(yù)熱lmm;94°C,30S,50°C,30s, 72°C,lmin。共25個循環(huán)。擴(kuò)增片斷通過瓊脂糖凝膠回收,然后作為模版進(jìn)行拼接,擴(kuò)增小 片段SLG1、SLG2、SLG3、SLG4各1 μ g,以SLGl和SLG49為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增條件為: 94°〇預(yù)熱111^11;94°〇,3〇8,50°〇,3〇8,72°〇,31^11。共25個循環(huán)。轉(zhuǎn)化屮0?結(jié)束后,用1% 瓊脂糖膠回收片段,取10 μ 1直接與T/A克隆載體相連(大連寶生物公司)。4°C連接過夜, 在DH5a感受態(tài)中高效轉(zhuǎn)化,獲得長度為1974bp的SEQ ID No. 1序列的陽性克隆,即為本發(fā) 明的L-谷氨酸氧化酶基因,經(jīng)序列測定,其核苷酸序列如SEQ ID No.l所示。
[0017] 將上述獲得的陽性克隆利用BamH I和Sac I進(jìn)行雙酶切后,通過T4DNA連接酶將 該基因與載體pET-28a (NEB公司)4°C連接2小時,得到重組質(zhì)粒pET-pGOX,并將其轉(zhuǎn)化大 腸桿菌BL21 (DE3) (Novagen公司),將菌液涂布于含有50 μ g/mL氨芐青霉素的固體LB培 養(yǎng)基(15g/L瓊脂,10g/L胰蛋白胨,5g/L酵母提取物,10g/L NaCl,磷酸緩沖液pH = 7.0), 37°C過夜培養(yǎng)。次日,挑取單菌落,接種于50ml液體LB培養(yǎng)基(10g/L胰蛋白胨,5g/L酵 母提取物,l〇g/L NaCl,磷酸緩沖液pH = 7. 0)中,37°C搖床直到菌液的濃度達(dá)到0D_為 0. 6時加入終濃度為0. 5mM的IPTG,25°C誘導(dǎo)12h。9000rpm離心去上清,收集濕細(xì)胞。取 濕細(xì)胞用生理鹽水洗滌兩次,再懸浮于PH6. 5、IOOmM的磷酸-磷酸鈉緩沖液中(Ig濕細(xì)胞 /IOml緩沖液)得懸浮液,用超聲波處理懸浮液(功率為400W,超聲4s,間歇6s,重復(fù)99 輪),9000rpm離心取上清,即得粗酶液。用凝膠-蛋白純化試劑盒HisTrap HP(Amersham Biosciences公司)對其進(jìn)行蛋白表達(dá)純化,獲得L-谷氨酸氧化酶前體蛋白,然后加入千分 之一當(dāng)量的Factor Xa蛋白酶(New England Biolabs公司)在4°C下處理6h,即得本發(fā)明 的具有活性的L-谷氨酸氧化酶蛋白。
[0018] 本發(fā)明的有益效果在于:本發(fā)明從土壤中篩選獲得一株產(chǎn)L-谷氨酸氧化酶的淀 粉酶產(chǎn)色鏈霉菌,并通過培養(yǎng)、提取總DNA和PCR擴(kuò)增后,得到了如SEQ ID No.l所示的 L-谷氨酸氧化酶基因。該L-谷氨酸氧化酶底物專一性很強(qiáng),能特異性地催化L-谷氨酸,可 適用于L-谷氨酸含量檢測。
【附圖說明】
[0019] 圖1為本發(fā)明的L-谷氨酸氧化酶基因的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖。
[0020] 圖2為本發(fā)明的L-谷氨酸氧化酶的SDS-PAGE電泳圖,其中1為用FactorXa蛋白 酶處理過后的L-谷氨酸氧化酶蛋白,含亞基α、β、γ,2代表用HisTrap HP試劑盒純化的 在大腸桿菌BL21 (DE3)過量表達(dá)的L-谷氨酸氧化酶前體蛋白,3為蛋白分子量MARKER。
【具體實(shí)施方式】
[0021] 以下結(jié)合【具體實(shí)施方式】詳細(xì)描述本發(fā)明的技術(shù)方案。實(shí)施例僅用以說明本發(fā)明的 技術(shù)方案而非限制,盡管參照較佳實(shí)施例對本發(fā)明進(jìn)行了詳細(xì)說明,本領(lǐng)域的普通技術(shù)人 員應(yīng)當(dāng)理解,可以對發(fā)明的技術(shù)方案進(jìn)行修改或者等同替換,而不脫離本發(fā)明技術(shù)方案的 精神和范圍,其均應(yīng)涵蓋在本發(fā)明的權(quán)利要求范圍中。
[0022] 本發(fā)明所用的試劑若未經(jīng)說明,均購自西格瑪-奧德里奇(Sigma-Aldrich)公司。
[0023] 本發(fā)明涉及分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn),如沒有特別注明,均參考自《分子克隆》一書【J.薩 姆布魯克、E. F弗里奇、T.曼尼阿蒂斯著,1994,科學(xué)出版社】。
[0024] 實(shí)施例1菌種分離
[0025] 稱取土壤樣品lg,加入0· 9 % (w/v)氯化鈉溶液Iml,5000轉(zhuǎn)/分震蕩混勻,3000 轉(zhuǎn)/分輕離心,倒掉上清,再加入0. 9% (w/v)氯化鈉溶液lml,5000轉(zhuǎn)/分震蕩混勾,冰上 IOmin靜置,吸取100 μ L溶液涂布于含有50ppm重鉻酸鉀的高氏一號培養(yǎng)基中,30°C下培養(yǎng) 4天。根據(jù)菌落形態(tài)和大小挑取菌落分別對應(yīng)地接入對照與顯色兩種平皿中(平皿中均為 高氏一號培養(yǎng)基),30°C下培養(yǎng)3天,取顯色平皿,將顯色液浸過的濾紙置于其菌落上,標(biāo)記 顯色快、紅色深的菌落在對照平皿上對應(yīng)菌落,挑取該菌落在高氏一號培養(yǎng)基上劃線分離, 30°C下培養(yǎng)3天,挑取單菌落保藏備用。
[0026] 實(shí)施例2總DNA提取及菌種鑒定
[0027] 將分離獲得的菌株接種于20mL液體培養(yǎng)基(酵母粉3g/L,蛋白胨20g/L,葡萄糖 l〇g/L,可溶