Brca2的3′非翻譯區(qū)在制備腫瘤診斷、治療和預后試劑中的應用
【技術領域】
[000。 本發(fā)明設及BRCA2的3'UTR的新應用,特別設及BRCA2的3'UTR在制備腫瘤診斷、 治療和預后試劑中的應用。
【背景技術】
[0002] 世界衛(wèi)生組織的國際癌癥研究機構(InternationalAgencyforResearchon Cancer,lARC)發(fā)布的全球腫瘤流行病統(tǒng)計數(shù)據(jù)(GLOBOCAN)表明;2012年全球新增約 1,410萬例癌癥病例,癌癥死亡人數(shù)達820萬(相當于全年總死亡人數(shù)的14. 6%)。男性最常 見的癌癥包括肺癌、前列腺癌、大腸直腸癌、W及胃癌;女性最常見的則是乳腺癌、大腸直腸 癌、子宮頸癌和肺癌。由于DNA的損傷會隨著年齡而累積增加,人們生活方式的改變,W及 全球人口增長和老齡化,全球的罹癌率整體而言持續(xù)走高,預計至2025年癌癥新增發(fā)病將 高達1930萬例。癌癥的篩查、早期診斷及治療尤為迫切,而腫瘤相關的發(fā)病機制尚未完全 清楚,通過對癌癥相關基因改變的研究,尋找與癌癥發(fā)生相關的不穩(wěn)定基因,探究癌癥干細 胞與癌癥發(fā)生發(fā)展的相關機制。癌癥干細胞是指具有干細胞性質的癌細胞,即具有無限自 我更新潛能W及多細胞分化的能力,是造成癌癥轉移、復發(fā),是腫瘤產生耐藥性W及對放化 療法產生抗性的重要原因。針對癌癥干細胞標志物的研究可幫助探究更有效的癌癥早期診 斷和治療手段,是當前癌癥基因領域的一個重要研究方向,同時能夠為腫瘤藥物的研制提 供新的祀點。
[0003]BRCA2 基因(Breastcancer2,earlyonset,GenBank登錄號;NM_000059. 3); 編碼蛋白為腫瘤抑制因子BRCA2,該種蛋白主要設及基因組穩(wěn)定性的維持,特別是對雙鏈 DNA修復的同源重組通路的調節(jié)。BRCA2在多種腫瘤中,轉錄水平得到上調,蛋白表達卻被 抑制,提示可能是BRCA2-3'UTR,抑制了翻譯,且BRCA2的RNA過度表達提示了癌癥的預后 不佳,但目前其在腫瘤生長中的相關機制尚不明確。關于轉錄因子BRCA2設及癌癥發(fā)生發(fā) 展的報道日益增多,而BRCA2-3'UTR與癌癥相關的研究還是相對較少的,BRCA2-3'UTR所 促進癌癥生長發(fā)展的機制仍需進一步地闡明。
【發(fā)明內容】
[0004] 本發(fā)明的目的在于提供一種腫瘤檢測試劑盒。
[0005] 本發(fā)明的另一目的在于提供一種腫瘤預后試劑盒。
[0006] 本發(fā)明的再一目的在于提供一種腫瘤治療藥劑。
[0007] 本發(fā)明所采取的技術方案是: BRCA2的3'端非翻譯區(qū)作為腫瘤檢測、治療、預后祀點的應用。
[0008] -種腫瘤檢測試劑盒,該試劑盒中含有能夠定量檢測BRCA2的3'端非翻譯區(qū) BRCA2-3'UTR的試劑。
[0009] 進一步的,上述試劑盒中含有實時巧光定量PCR檢測BRCA2-3'UTR的引物序列。
[0010] 進一步的,上述試劑盒中含有實時巧光定量PCR檢測BRCA2-3' UTR的引物序列 5'-GCCCGATTCCGTATTGGTAT-3'(沈Q ID N0;1)和5'-CCCACCTCAGCTTCTCAAAG-3'(沈Q ID NO;2)〇
[0011] 進一步的,上述腫瘤為乳腺浸潤性癌,子宮內膜癌,宮頸鱗狀細胞癌和內膜腺癌, 肺腺癌,肺鱗癌,食管癌,胃腺癌,肝細胞癌,結腸腺癌,甲狀腺癌,腎臟腎透明細胞癌,腎臟 腎乳頭狀細胞癌,膀脫尿路上皮癌,頭頸部鱗狀細胞癌。
[001引進一步的,上述試劑盒中含有能夠定量PCR檢測BRCA2-3'UTR的試劑。
[0013] 進一步的,上述試劑盒中含有實時巧光定量檢測BRCA2-3'UTR的引物序列。
[0014] 進一步的,上述試劑盒中含有實時巧光定量PCR檢測BRCA2-3' UTR的引物序列 5'-GCCCGATTCCGTATTGGTAT-3'(沈Q ID N0;1)和5'-CCCACCTCAGCTTCTCAAAG-3'(沈Q ID NO;2)〇
[0015] 一種腫瘤治療藥劑,該藥劑中含有能夠特異性沉默BRCA2-3'UTR的試劑。
[0016] 進一步的,上述能夠特異性沉默BRCA2-3'UTR的試劑為鎖核酸序列11^-1;5'-^7TCCAGTC7TA-3'(SEQIDN0;3),其中斜體加粗所示核巧酸帶有LNA修飾;或者為鎖核酸 序列LNA-2 ;5' - ^TTCC乂iTCTTA-3'(SEQIDNO;4)其中斜體加粗所示核巧酸帶有LNA修 飾。
[0017] 進一步的,上述腫瘤為乳腺浸潤性癌,子宮內膜癌,宮頸鱗狀細胞癌和內膜腺癌, 肺腺癌,肺鱗癌,食管癌,胃腺癌,肝細胞癌,結腸腺癌,甲狀腺癌,腎臟腎透明細胞癌,腎臟 腎乳頭狀細胞癌,膀脫尿路上皮癌,頭頸部鱗狀細胞癌。
[0018] 本發(fā)明的有益效果是: 本發(fā)明首次發(fā)現(xiàn)BRCA2-3'UTR能夠增強癌癥干細胞自我更新能力,促進癌癥細胞呈現(xiàn) 癌癥干細胞樣表型,增強癌癥干細胞成球率升高及在體內成瘤的能力,而降低BRCA2-3'UTR 表達或抑制BRCA2-3'UTR發(fā)揮正常功能時,癌癥干細胞成球率下降和體內成瘤能力減弱, 故BRCA2-3'UTR的表達有望成為癌癥治療的潛在祀點,本發(fā)明對于更好地理解癌癥的發(fā)生 機理,制定癌癥風險評估和早期檢測的有效措施具有及其重要意義。
[0019] 本發(fā)明首次發(fā)現(xiàn)通過實時巧光定量PCR檢測BRCA2的3'端非翻譯區(qū) BRCA2-3'UTR,作為腫瘤檢測和預后的祀點;特異性沉默BRCA2-3'UTR的鎖核酸序列LNA用 作腫瘤治療藥劑。
【附圖說明】
[0020] 圖1為多種腫瘤細胞中BRCA2在轉錄水平的表達情況;TCGA數(shù)據(jù)分析BRCA2在16 種腫瘤中的轉錄表達情況,包括乳腺浸潤性癌炬RCA),子宮內膜癌扣CEC),宮頸鱗狀細胞 癌和內膜腺癌(CESC),前列腺癌(PRAD),肺腺癌(LUAD),肺鱗癌(LUSC),食管癌巧SCA),胃 腺癌(STAD),肝細胞癌(LIHC),膜腺癌(PAAD),結腸腺癌(C0AD),甲狀腺癌(THCA),腎臟腎 透明細胞癌化IRC),腎臟腎乳頭狀細胞癌化IRP),膀脫尿路上皮癌炬LCA),頭頸部鱗狀細 胞癌(HNSC);腫瘤組織(T)與非腫瘤組織(N)中BRCA2的mRNA表達量中位值的比值為T/ N,熱圖中顏色深淺代表的是log2(T/N)值; 圖2為BRCA2mRNA在多種腫瘤細胞中的表達水平,包括乳腺癌細胞系MCF7、MDA-MB-231,卵巢癌細胞系SK-0V-3、T0V-21G,肺癌細胞株A549、Calu3,肝癌細胞系 Bel-7402、HepG2,胃癌細胞系MKN28、MGC803,食管癌細胞系Ecal09、Eca9706 ;誤差線表示 =次獨立實驗產生的標準差(SD); 圖3為癌癥組織中BRCA2基因表達情況與患者總體生存的關系曲線;A為乳腺癌,BRCA2低表達(n=563)與BRCA2高表達(n=552) ;B為卵巢癌,BRCA2低表達(n=1166)與 BRCA2高表達(n=415);C為肺癌,BRCA2低表達(n=971)與BRCA2高表達(n=955);D為胃癌, BRCA2低表達(n=381)與BRCA2高表達(n=212),Log-rank檢驗進行BRCA2低表達(紅線)與 BRCA2高表達(黑線)兩組患者的生存曲線比較具有顯著性差異(乳腺癌,片0. 009 ;卵巢癌, 片0. 028 ;肺癌,K0. 001 ;胃癌,片0. 042); 圖4 A. TargetScan預測BRCA2-3'UTR的microRNA祀位點,位于BRCA2堿基位置10539-10545 ;B.為miR-145與BRCA2-3'UTR的結合作用,RIP實驗分析,沉淀下來的 microRNA由巧光定量PCR分析,U6作為內參; 圖5為BRCA2-3'UTR促進癌細胞的干細胞特性,A.利用antagomiR-145抑制MDA-MB-231細胞中miR-145的表達,實時巧光定量PCR分析BRCA2-3'UTR的表達水平, GAPDH用作管家基因化癌癥干細胞成球實驗分析,抑制miR-145的實驗組細胞的成球率 明顯高于對照組細胞;C.利用LNA結合MDA-MB-231細胞中的BRCA2-3'UTR,實時巧光定量 PCR分析BRCA2-3'UTR的表達水平,GAPDH用作管家基因;D.癌癥干細胞成球實驗分析,LNA 組細胞的成球率明顯低于對照組細胞;誤差線表示=次獨立實驗產生的標準差(SD) ;E為 在BRCA2-3'UTR的miR-145祀位點處設計LNA序列(其中粗斜體及下劃線的堿基為LNA修 飾); 圖6為BRCA2-3' UTR促進