一種光頭稗的gtb-hm基因及其應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明設(shè)及一種禾本科植物一-光頭碑編碼高蛋氨酸蛋白的GTB-HM基因,屬于分 子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域。
【背景技術(shù)】
[0002] 蛋白短缺尤其是優(yōu)質(zhì)蛋白的短缺,是21世紀(jì)全球性的嚴(yán)重問(wèn)題,在盡快提高作物 品種的蛋白質(zhì)含量的同時(shí),積極改善蛋白質(zhì)的氨基酸組成,提高限制性氨基酸的含量W增 強(qiáng)其營(yíng)養(yǎng)價(jià)值,具有重要意義。植物種子儲(chǔ)藏了豐富的蛋白質(zhì)、碳水化合物和脂類(lèi),其中膽 藏于蛋白質(zhì)體內(nèi)的膽藏蛋白是植物種子的主要成分,其功能不僅局限于為種子的正常萌發(fā) 和幼苗生長(zhǎng)提供營(yíng)養(yǎng)供給,而且也參與了種子萌發(fā)和發(fā)育過(guò)程的調(diào)控(趙文明,1995)。
[0003] 硫是僅次于氮、憐、鐘的植物必需的第4大營(yíng)養(yǎng)元素,缺硫時(shí)蛋白質(zhì)合成受阻,導(dǎo) 致非蛋白氮累積,不僅影響作物生長(zhǎng),而且降低農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì);植物含硫量為0. 1%~0. 5%, 其變幅明顯受植物種類(lèi)、品種、器官和生育期的影響。十字花科植物需硫最多,豆科、百合 科植物次之,禾本科植物較少(陸景陵,1994)。含硫氨基酸如甲硫氨酸(也稱為蛋氨酸, methionine,Met)、脫氨酸、半脫氨酸(cysteine,切S)等是合成蛋白質(zhì)的重要氨基酸;蛋白 質(zhì)中含硫氨基酸的含量與種子萌發(fā)、生長(zhǎng)和作物品質(zhì)均有密切關(guān)系。其中,Met作為人體和 單瘤胃動(dòng)物的必需氨基酸之一,在水稻、小麥、大麥、養(yǎng)麥,尤其是豆類(lèi)和花生等主要的糧食 作物和經(jīng)濟(jì)作物中含量極低,是主要的限制性氨基酸,因此提高運(yùn)些作物的Met含量顯得 尤為重要(趙文明,1995;MilntzK,1998)。
[0004] 隨著現(xiàn)代生物技術(shù)的發(fā)展,通過(guò)擴(kuò)大篩選獲得更多高含硫氨基酸的目的基因,利 用蛋白質(zhì)組學(xué)的方法掲示高M(jìn)et種子膽藏蛋白新的功能(王文軍等,2005),結(jié)合植物基因 工程的手段改良作物品質(zhì)、調(diào)節(jié)種子生長(zhǎng)發(fā)育等將更具實(shí)際意義化aftBΚ,2005)。
[0005]目前國(guó)際上已經(jīng)分離出來(lái)可供用來(lái)提高作物Met含量的高M(jìn)et植物種子膽藏蛋白 基因?yàn)閿?shù)不多,其主要來(lái)源是玉米(AltenbachSB,1990)和水稻(Masum-uraΤ,1989),此 外還有少部分來(lái)自己西栗6日日化日油1,1994)、花生度日3}1日8 1,1994)等,我國(guó)尤其落后, 因而充分利用我國(guó)豐富的種質(zhì)資源,合理與有效的發(fā)掘和利用植物資源,分離提取有價(jià)值 的高M(jìn)et植物種子膽藏蛋白基因是W提高作物Met含量為目的品質(zhì)改良基因工程領(lǐng)域迫切 需要的基礎(chǔ)性工作,也將為高M(jìn)et植物種子膽藏蛋白的研究開(kāi)辟新的領(lǐng)域。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0006] 本發(fā)明提供一種編碼高蛋氨酸蛋白的光頭碑基因GTB-HM及其編碼高蛋氨酸蛋白 的應(yīng)用;該基因能提高相關(guān)蛋白的表達(dá),尤其是能夠提高植物中蛋氨酸的含量。
[0007] 本發(fā)明通過(guò)設(shè)計(jì)出引物,W光頭碑DNA為模板,PCR擴(kuò)增得到該基因全長(zhǎng)序列,經(jīng) T載體克隆并測(cè)序,再轉(zhuǎn)入大豆進(jìn)行強(qiáng)表達(dá),表明運(yùn)是一條編碼高蛋氨酸蛋白的基因。該基 因編碼區(qū)為40化P,編碼135個(gè)氨基酸,其中含有13個(gè)蛋氨酸,并且在該蛋白中蛋氨酸的摩 爾百分含量達(dá)到9. 62%。
[0008] 因此,本發(fā)明第一個(gè)目的是提供一種編碼高蛋氨酸蛋白的光頭碑基因GTB-HM,其 屬于新的編碼高蛋氨酸蛋白基因,具有或選自SEQIDNO: 1的序列?;蚺cSEQIDNo: 1限 定的核巧酸序列具有90%W上同源性的核巧酸序列;在高嚴(yán)謹(jǐn)條件下可與SEQIDNo: 1限 定的DM序列雜交的核巧酸序列。
[0009] 本發(fā)明第二個(gè)目的是提供所述基因所編碼的功能蛋白,其具有或選自SEQID N0:2的蛋白序列,或具有或選自SEQIDNO: 1的基因序列所編碼的蛋白序列?;蚺cSEQID No:2的氨基酸殘基序列經(jīng)過(guò)一至十二個(gè)氨基酸殘基的取代或缺失或添加且對(duì)植物的生長(zhǎng) 發(fā)育具有調(diào)控作用的蛋白質(zhì)。
[0010] 本發(fā)明第Ξ個(gè)目的是提供所述基因或功能蛋白,在調(diào)控光頭碑高蛋氨酸蛋白表達(dá) 中的用途;利用該基因,開(kāi)發(fā)更高效、無(wú)毒的光頭碑來(lái)源的具有高蛋氨酸蛋白的功能型食用 蛋白乃至保健品。
[0011] 在具體實(shí)施方案中GTB-HM基因及其調(diào)控元件的表達(dá)載體。
[0012] 在具體實(shí)施方案中GTB-HM基因及其調(diào)控元件的轉(zhuǎn)基因細(xì)胞系。
[0013] 在具體實(shí)施方案中GTB-HM基因及其調(diào)控元件的工程菌。
[0014] 在具體實(shí)施方案中GTB-HM基因及其調(diào)控元件中任一片段的引物對(duì)。
[0015] 在具體實(shí)施方案中GTB-HM基因及其調(diào)控元件中在植物生長(zhǎng)發(fā)育中的應(yīng)用。
[0016] 在具體實(shí)施方案中GTB-HM基因及其蛋白可應(yīng)用于植物包括單子葉植物和雙子葉 植物。
【附圖說(shuō)明】
[0017] 圖1為PCR基因擴(kuò)增結(jié)果(1為光頭碑PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,Μ為DNAMarker)。圖2為 酶切結(jié)果(1為提取的重組質(zhì)粒,2為重組質(zhì)粒酶切產(chǎn)物,Μ為DNA
[001引Marker)。
[0019]圖3 pCAMBIA1390重組質(zhì)粒中連接示意圖(X. Japoni州SUbiquitin promoter PCAMBIA1390),其中GTB-HM為光頭碑高蛋氨酸基因。
[0020] 技術(shù)效果
[0021] 1、利用本發(fā)明的GTB-HM基因表達(dá)得到含有13個(gè)蛋氨酸的蛋白質(zhì),有助于蛋氨酸 在大豆中的含量。
[0022] 2、利用本發(fā)明的GTB-HM基因基因和蛋白,可用于已有局蛋氨酸蛋白的研究和應(yīng) 用中,W及開(kāi)發(fā)高效、無(wú)毒的高蛋氨酸蛋白的功能型的蛋白質(zhì)乃至保健品。
【具體實(shí)施方式】
[0023] 在本發(fā)明的下述實(shí)施例中,所用的實(shí)驗(yàn)材料均為光頭碑巧chinochloa crusgalli L. Be曰uv. )ο
[0024] 實(shí)施例1、光頭碑總RNA提取
[002引利用RNA提取分離試劑盒化vitrogen公司提供)提取光頭碑巷片中總RNA,其 具體方法是:收集光頭碑巷片lOOmg,立即置于液氮中研磨,加入1mlTrizol試劑,充分混 勻;室溫放置5min;加入0. 2ml新鮮氯仿,劇烈振搖15s,室溫溫育3min;4°C,12000g離屯、 15min;上清水相轉(zhuǎn)移到一個(gè)新的1. 5ml離屯、管中,加入0. 5ml異丙醇沉淀RNA;RNA沉淀用 1ml75%乙醇洗涂后溶于適量DEPC處理過(guò)的水中,-70°C保存?zhèn)溆谩?br>[0026]實(shí)施例2、光頭碑總RNA純化
[0027] 依據(jù)測(cè)aseI試劑盒(ThermoScientific公司提供)依次向?qū)嵤├?獲得的光 頭碑總RNA中加入6μ1DEPC處理水、10μ1 ΚΝΑ、2μ1面aseIBuffer、2yl面aseI,混 合均勻后,37°C30min,加入邸ΤΑ 2μ1,65ΓlOmin。
[002引實(shí)施例3、光頭碑RNA逆轉(zhuǎn)錄
[0029]第一鏈合成:依據(jù)PlantRT-PCRKit2.01aaKaRa,Japan)的用戶手冊(cè)進(jìn)行。 l-2ng總RNA(大約1-2μ1),和Kit的各種反轉(zhuǎn)錄試劑混合(MgCMμ1 ; 10XRNAPCR Buffer2μ1;RNaseInhibitor0.5μ1;RNasefreeWater8.5μ1;dNTPMi;rture2μ1; ReverseTranscriptase1μ1 ;01igodT-Adaptor1μ1)。勻后,42°C30min;99°C5min; 5° °C5min,完成反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。
[0030] 第二鏈合成:根據(jù)生物信息學(xué)提供的序列資料設(shè)計(jì)W下引物:
[0031] 5,端引物(SEQIDNO:3):5'-CGGGATCCCGATGGCAGCCAAGATGCTTGC-3';
[0032] 3,端引物(SEQIDNO:4):5'-CGAGCTCGCTAGAATGCAGCACCAACAAAGGG-3'。
[0033] 吸取1 μ 1反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,作為模板與DMTaq酶混合(反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物1 μ 1,上游引 物(沈QIDΝ0::3)0. 5μ1,下游引物(沈QIDΝ0:4)0. 5μ1,Taq0. 5μ1,10ΧBuffer2yl, Mg2+0. 5 μ l,d地2〇15 μ 1)進(jìn)行PCR反應(yīng):94°C 5min后進(jìn)入擴(kuò)增程序:94°C lmin、57°C Imin、 72°C Imin, 30個(gè)循環(huán)后,72°C 5min。
[0034] 實(shí)施例4、TA克隆
[003引將實(shí)施例3中所獲得的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,經(jīng)瓊脂糖電泳(圖2)分離目的DM片段, 采用膠回收DNA試劑盒(購(gòu)自上海生工生物工程有限公司)方法進(jìn)行回收DNA片段,將回 收的第二鏈合成產(chǎn)物與DNA克隆試劑混合(第二鏈產(chǎn)物6μ1,陽(yáng)G40001μ1,T載體1μ1, 10Χligationbuffer1μl,ligase1μ1),于 16°C連接過(guò)夜。
[0036] 實(shí)施例5、轉(zhuǎn)化大腸桿菌和目的DNA片段測(cè)序
[0037] 取連接產(chǎn)物5 μ 1與200 μ 1大腸桿菌D冊(cè)α感受態(tài)細(xì)胞(購(gòu)自上海生工生物工程 有限公司)混勻,冰上放置30min,42°C 90s,冰浴1-2分鐘,加入800 μ 1 LB培養(yǎng)基,于37°C, 250巧m震蕩培養(yǎng)45min,4000巧m離屯、5min,上清留下約150μ1,加入7μ1 IPTG,40yl x-gal混合均勻,涂布于預(yù)先加入Amp(氨節(jié)青霉素)的LB固體培養(yǎng)基上培養(yǎng)過(guò)夜,挑取白 色菌落于加有Amp的LB液體培養(yǎng)基中震蕩過(guò)夜,取1ml菌液送至上海生工生物工程有限公 司測(cè)序。測(cè)序結(jié)果表明:擴(kuò)增得到的序列SEQ ID NO: 1自起始密碼子到終止密碼子總長(zhǎng)390 堿基,編碼129個(gè)氨基酸,推測(cè)分子量為14. 2kD,等電點(diǎn)8.74,編碼蛋氨酸17個(gè),蛋氨酸的 百分摩爾含量為13. 18%。
[003引實(shí)施例6、將目的DNA片段導(dǎo)入大豆中進(jìn)行強(qiáng)表達(dá)
[0039] 從上述含有GTB-HM基因的菌液中提取質(zhì)粒,用甜aI和BamHI進(jìn)行雙酶切,酶切 產(chǎn)物經(jīng)回收后,與同樣經(jīng)甜aI和BamHI雙酶切回收的PCAMBIA1390質(zhì)粒進(jìn)行連接,構(gòu)建 重組質(zhì)粒(如圖3);將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化根癌農(nóng)桿菌AGL1,通過(guò)Kan和Rif篩選出轉(zhuǎn)化成功的 AGL1菌株,并將其侵染大豆(購(gòu)自南京農(nóng)業(yè)大學(xué)國(guó)家大豆種質(zhì)資源中屯、)子葉節(jié),利用潮霉 素篩選獲得GTB-HM基因轉(zhuǎn)染成功的大豆幼苗,并經(jīng)培養(yǎng)獲得大豆種子,通過(guò)氨基酸分析儀 檢測(cè)大豆種子Met含量,發(fā)現(xiàn)其Met含量由對(duì)照的0. 651%提高至3. 968%,表明GTB-HM基 因在大豆中得到了強(qiáng)表達(dá)。
[0040] 沈Q ID NO: 1基因序列表如下:
[0041]
[0042] 沈Q ID NO:2氨基酸序列表如下:
[0043]
[0044]
【主權(quán)項(xiàng)】
1. 一種光頭稗的GTB-HM基因及其應(yīng)用,其特征在于為下述核苷酸序列之一的基因: (1)SEQIDNo:l; (2) 與SEQIDNo: 1限定的核苷酸序列具有90%以上同源性的核苷酸序列; (3) 在高嚴(yán)謹(jǐn)條件下可與SEQIDNo: 1限定的DNA序列雜交的核苷酸序列。2. 權(quán)利要求1所述GTB-HM基因表達(dá)的蛋白質(zhì),其特征在于為下述氨基酸殘基序列之 (1)SEQIDNo:2 ; (2)SEQIDNo:2的氨基酸殘基序列經(jīng)過(guò)一至十二個(gè)氨基酸殘基的取代或缺失或添加 且對(duì)植物的生長(zhǎng)發(fā)育具有調(diào)控作用的蛋白質(zhì)。3. 含有權(quán)利要求1所述的GTB-HM基因及其調(diào)控元件的表達(dá)載體。4. 含有權(quán)利要求1所述的GTB-HM基因及其調(diào)控元件的轉(zhuǎn)基因細(xì)胞系。5. 含有權(quán)利要求1所述的GTB-HM基因及其調(diào)控元件的工程菌。6. 擴(kuò)增權(quán)利要求1所述的GTB-HM基因及其調(diào)控元件中任一片段的引物對(duì)。7. 權(quán)利要求1所述的GTB-HM基因及其調(diào)控元件中在植物生長(zhǎng)發(fā)育中的應(yīng)用。8. 根據(jù)權(quán)利要求7所述的應(yīng)用,所述的植物包括單子葉植物和雙子葉植物。9. 根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的應(yīng)用,在調(diào)控光頭稗高蛋氨酸蛋白表達(dá)中的用途;利用 該基因,開(kāi)發(fā)更高效、無(wú)毒的光頭稗來(lái)源的具有高蛋氨酸蛋白的功能型食用蛋白乃至保健 品。
【專(zhuān)利摘要】本發(fā)明屬于生物工程技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種編碼光頭稗高蛋氨酸蛋白的基因GTB-HM及其編碼蛋白與應(yīng)用。該基因能大大促進(jìn)蛋白質(zhì)合成,降低非蛋白氮含量,不僅促進(jìn)作物生長(zhǎng),而且提高農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì),具有較高的實(shí)際應(yīng)用價(jià)值。
【IPC分類(lèi)】C12N15/11, C12N15/82, A01H5/00, C12N1/21, C12N15/63, C12N15/29, C07K14/415, C12N15/70
【公開(kāi)號(hào)】CN105368845
【申請(qǐng)?zhí)枴緾N201510922400
【發(fā)明人】陳宏偉
【申請(qǐng)人】向華
【公開(kāi)日】2016年3月2日
【申請(qǐng)日】2015年12月11日