能特異性結(jié)合黃曲霉毒素的納米抗體的制作方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及單域重鏈抗體技術(shù)(又稱納米抗體技術(shù)),以及基因工程抗體技術(shù),特 別是針對黃曲霉毒素的單域重鏈抗體或多肽。 技術(shù)背景
[0002] 黃曲霉毒素(Afiatoxin)是由黃曲霉(Aspergillus fIavus)、寄生曲霉 (Aspergillus parasiticus)、集蜂曲霉(Aspergillus nomius)和溜曲霉(Aspergillus tamarii)等真菌產(chǎn)生的次級代謝產(chǎn)物,具有強(qiáng)致癌性和強(qiáng)免疫抑制性。黃曲霉毒素是一類 化學(xué)結(jié)構(gòu)類似的二呋喃香豆素衍生物,主要包括黃曲霉毒素 B1 (AFB1)、B2(AFB2)、G1 (AFG1)、 G2(AFG1)和M1 (AFM1)等。在已發(fā)現(xiàn)的黃曲霉毒素中,黃曲霉毒素 B1的毒性最強(qiáng),被世界衛(wèi)生 組織的癌癥研究機(jī)構(gòu)劃定為I類致癌物。產(chǎn)毒真菌菌株廣泛存在于自然界中,糧食油料等 農(nóng)產(chǎn)品在生產(chǎn)、加工以及儲藏等過程中均可能受到污染,導(dǎo)致黃曲霉毒素超標(biāo)。我國是黃曲 霉毒素污染情況較為嚴(yán)重的地區(qū)。因此,開發(fā)穩(wěn)定、快速、高靈敏、高通量的黃曲霉毒素檢測 方法,對于保障我國食品安全、減少由此帶來的損失具有重要意義。
[0003] 現(xiàn)有的黃曲霉毒素檢測方法主要有免疫分析法、儀器分析法以及薄層層析法。其 中免疫分析法可避免其它兩類方法存在的一些缺陷,具有靈敏度高、成本低以及可現(xiàn)場檢 測等優(yōu)點。免疫分析法的原理是基于抗原抗體的特異性識別,抗體的性能是免疫分析方法 靈敏度、準(zhǔn)確度等指標(biāo)的決定性因素。因此獲得針對黃曲霉毒素的抗體是建立相關(guān)免疫學(xué) 檢測技術(shù)的前提和關(guān)鍵。
[0004] 單域重鏈抗體(又稱納米抗體)是由羊駝重鏈抗體的可變區(qū)組成,又稱為納米抗 體,具有耐酸堿、耐高溫以及易于生產(chǎn)等特性。這些特性對于黃曲霉毒素的低成本、可重復(fù) 使用的免疫學(xué)檢測方法有重要的實用價值。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0005] 本發(fā)明的目的是提供針對黃曲霉毒素的單域重鏈抗體,可以被用于制備檢測黃曲 霉毒素的試劑和工具。
[0006] 本發(fā)明提供一個針對黃曲霉毒素的單域重鏈抗體(即本發(fā)明能特異性結(jié)合黃 曲霉毒素的納米抗體,下同),具有SEQ ID NO. :1所示的氨基酸序列。其氨基酸序列的 IMGT編號和結(jié)構(gòu)域的劃分包括四個框架區(qū)(Framework region,F(xiàn)R)和三個互補(bǔ)決定區(qū) (Complementarity-determining region, CDR)〇
[0007] 本發(fā)明提供一個核酸分子,其特征是編碼SEQ ID NO. :1,通過遺傳密碼子可以隨 時獲得該核酸分子的具體序列。
[0008] 本發(fā)明還提供一個核酸分子,其特征是編碼SEQ ID NO. :1部分結(jié)構(gòu)域,通過遺傳 密碼子可以隨時獲得該核酸分子的具體序列??梢詾镾EQ ID NO. :2核酸分子。
[0009] 本發(fā)明所提供的核苷酸序列或者至少部分序列可以通過合適的表達(dá)系統(tǒng)進(jìn)行表 達(dá)以得到相應(yīng)的蛋白質(zhì)或多肽。這些表達(dá)系統(tǒng)包括細(xì)菌,酵母菌,絲狀真菌,動物細(xì)胞,昆蟲 細(xì)胞,植物細(xì)胞,或無細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)。
[0010] 本發(fā)明還提供一種載體,包含所述核酸序列。由于遺傳密碼子具有簡并性,該核酸 序列可以根據(jù)不同的應(yīng)用目的而不同。
[0011] 本發(fā)明還提供一種宿主細(xì)胞,包括所述蛋白質(zhì)或表達(dá)載體。
[0012] 本發(fā)明還提供一種檢測黃曲霉毒素的方法,含有本發(fā)明所述針對黃曲霉毒素 的單域重鏈抗體?;诒景l(fā)明提供的針對黃曲霉毒素的單域重鏈抗體與黃曲霉毒素特 異性結(jié)合的能力,建立黃曲霉毒素的檢測方法。其中,優(yōu)選的方法包括酶連免疫吸附法 (Enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA),焚光免疫法(Fluoroimmunoassay,F(xiàn)IA), 免疫芯片法,親和層析法和免疫層析法等。
[0013] 本發(fā)明所提供的氨基酸序列可以作為前體,通過隨機(jī)或定點突變技術(shù)進(jìn)行改造, 能夠獲得性質(zhì)(水溶性、穩(wěn)定性、親和力以及特異性等)更好的突變體。
[0014] 本發(fā)明還涉及前述針對黃曲霉毒素的單域重鏈抗體在免疫檢測、黃曲霉毒素富集 以及純化中的應(yīng)用。這些免疫檢測指的是非疾病診斷治療目的的免疫檢測。
[0015] 本發(fā)明所敘述的一些術(shù)語具有如下含義:
[0016] 結(jié)構(gòu)域:蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)的基本結(jié)構(gòu)單位,通常具有一定的功能。
[0017] IMGT 編號:IMGT 數(shù)據(jù)庫(The International ImMunoGeneTics Datbase)中的一 種已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的抗體氨基酸序列編號方法。具體編號方法可以參考文獻(xiàn)(Ehrenman,F(xiàn)., Q. Kaas,et. al. (2010). IMGT/3D structure-DB and IMGT/DomainGapAlign :a databaseand a tool for immunoglobulins or antibodies,T cell receptors, MHC,IgSF and MhcSF. Nucleic Acids Res 38 (Database issue) :D301_307.Lefranc,M.P.,C.Pommie,et al. (2003). IMGT unique numbering for immunoglobulin and T cell receptor variable domains and Igsuperfamily V-Iike domains Dev comp Tmmunol 27(1) :55-77.)中的描 述。
[0018] 密碼子(codon):又稱為三連體密碼子(triplet code),指對應(yīng)于某種氨基酸的 核苷酸三聯(lián)體。在轉(zhuǎn)譯過程中決定該種氨基酸插入生長中多肽鏈的位置。
【具體實施方式】
[0019] 下面通過單域重鏈抗體(多肽)的制備、分析及應(yīng)用,對本發(fā)明做進(jìn)一步說明,這 些具體實施例不應(yīng)以任何方式被解釋為限制本發(fā)明的應(yīng)用范圍。
[0020] 實施例1 :
[0021] 抗黃曲霉毒素單域重鏈抗體(即針對黃曲霉毒素的單域重鏈抗體)免疫文庫的構(gòu) 建
[0022] 將黃曲霉毒素隊與匙孔血藍(lán)蛋白(keyhole limpet hemocyanin,KLH)共價偶聯(lián), 得到黃曲霉毒素人工抗原AFB1-KLH,取300 μ g AFB1-KLH與弗氏完全佐劑乳化后,對羊駝 (Lama pacos)進(jìn)行皮下多點注射免疫。加強(qiáng)免疫采用150 μ g AFB1-KLH與弗氏不完全佐劑 乳化,間隔2周進(jìn)行,每次免疫7天后靜脈取血,采用間接ELISA法測定血清效價,選擇血清 效價最高的樣品分離淋巴細(xì)胞,提取RNA。
[0023] RNA的提取參照TAKARA公司RNAiso試劑說明書進(jìn)行。以RNA為模板,oligo dT 為引物,參照TAKARA公司反轉(zhuǎn)錄酶說明書合成cDNA第一鏈。
[0024] 采用PrimeSTAR高保真DNA聚合酶,經(jīng)巢式PCR獲得重鏈抗體的可變區(qū)編碼基因 (采用的引物見表1)。第一輪PCR分別以引物AlpVh-LD和CH2-R擴(kuò)增cDNA,反應(yīng)條件為, 98Γ,10s,55Γ,20s,72Γ,lmin,20 個循環(huán),98Γ,10s,68Γ,lmin,72Γ延伸 lOmin。
[0025] 將第一輪PCR產(chǎn)物用1. 2 %的瓊脂糖凝膠電泳,回收600bp~750bp的DNA片 段,作為第二輪PCR的模板,分別用引物AlpVh-SfiI和AlpVHHRl-Notl,AlpVh-SfiI和 八1口¥冊1?2-如《,進(jìn)行擴(kuò)增,反應(yīng)條件為,98°(:,1〇8,50°(:,2〇8,72°(:,4〇8,5個循環(huán),98°(:, 108,68°(:,408,30個循環(huán),72°(:延伸101^11。經(jīng)0嫩片段回收試劑盒回收、定量,于-20°(:保 存?zhèn)溆?。將噬菌粒pHENl和PCR擴(kuò)增產(chǎn)物分別用Sfi I、Not I雙酶切,經(jīng)瓊脂糖凝膠回收、 定量后,以1 : 3摩爾比,在16°C,過夜連接。
[0026] 表1文庫構(gòu)建及鑒定所用的引物
[0028] 注:下劃線表示限制性內(nèi)切酶識別序列
[0029] 連接產(chǎn)物經(jīng)乙醇沉淀后,溶于10 μ L無菌水,分十次進(jìn)行電穿孔轉(zhuǎn)化大腸桿菌 TGl。取IOyL電擊、培養(yǎng)后的菌液倍比稀釋,涂布氨芐青霉素2 X YT培養(yǎng)板,37°C,倒置 培養(yǎng)12~16h,采用引物M13-R和pHEN-R進(jìn)行菌落PCR,計算庫容;其余部分全部涂布于 24〇1^24〇11氨芐青霉素2\¥1'培養(yǎng)板,37°(:,倒置培養(yǎng)12~1611。用1〇1^,2\¥1'培養(yǎng)基將 培養(yǎng)板上的菌苔刮洗后,加入終濃度15~30%甘油,分裝,-80°C保存?zhèn)溆谩?br>[0030] 根據(jù)計算的庫容量結(jié)果,接種10倍庫容量的活細(xì)胞于20mL的2XYT(含2%葡萄 糖,lOOyg/mL氨芐青霉素),30°C,220r/min培養(yǎng)至0D600達(dá)0. 5胺感染復(fù)數(shù)20 : 1加入 輔助噬菌體,37°(:,22(^/11^11,6〇1^11。將培養(yǎng)物離心,用5〇1^的2\¥1'(含10(^8/1^氨芐 青霉素和50 μ g/mL卡那霉素)重懸沉淀,30°C,220r/min過夜培養(yǎng)后,3000g離心取上清, 加入5XPEG/NaCl溶液,冰上放置Ih或4°C過夜,12000rpm離心30min,重懸沉淀于含10% 甘油的磷酸緩沖液(PBS,0.01M,pH 7. 4),即得到抗黃曲霉毒素單域重鏈抗體免疫文庫,取 10 μ L測定滴度,其余分裝于-80°C保存?zhèn)溆谩?br>[0031] 實施例2:
[0032] 抗黃曲霉毒素單域重鏈抗體的淘選與鑒定