大效應值的宰前活重優(yōu)良基因芯片12，用以與肉?；蚱坞s交，獲得相應的SNP位點。
[0019]在本實施例中，所述宰前活重優(yōu)良基因1、所述胴體重優(yōu)良基因2、所述育肥期日增重通過所述Illumina770k SNP芯片4基于GWAS所得P值大小得出所述P值大的增重優(yōu)良基因芯片7、所述P值大的胴體重優(yōu)良基因芯片10、所述P值大的宰前活重優(yōu)良基因芯片13，用以與肉?；蚱坞s交，獲得相應的SNP位點。
[0020]在本實施例中，所述載片14與所述基因識別體15剛性連接，所述載片14用以承載其他部件的重量，所述基因識別體15用以識別具有類似優(yōu)良性狀的基因片段，促使生物芯片自行組成具有相應優(yōu)良性狀態(tài)的基因序列芯片，所述核酸探針膜16與所述探針移動軌道17密封連接，用以為核酸探針移動提供渠道。
[0021]在使用本發(fā)明過程中，針對宰前活重、胴體重和育肥期日增重三個性狀，將對應的基因片段制成樣本，研究中利用均勻抽取、基于BayesB所得效應值大小和基于GWAS所得P值大小三種不同篩選方式，分別篩選出三種不同類別的低密度芯片(均勻抽取的ELD芯片、根據效應值大小篩選的SLD芯片和根據P值大小篩選的PLD芯片)，進行低密度芯片的基因組選擇研究，并采用交叉驗證方法評價預測準確性。
[0022]在使用本發(fā)明過程中，將本16K生物芯片與所預測的肉牛的基因樣本進行雜交，芯片遇到類似所需基因的肉牛基因序列時會受到觸發(fā)，芯片中的靶核苷酸的探針會沿著軌道自行進行位置交換，排成具有所需性狀的肉牛基因序列，然后進行肉?；蚪M育種值的計算，對其進行遺傳評估。本芯片的發(fā)明為我國肉?；蚪M選擇的快速推廣和應用提供了芯片基礎，該生物小芯片使肉牛育種技術科學研究工作緊跟國際前沿，立足于國內領先地位；同時能夠盡快趕上發(fā)達國家的肉牛選種技術水平，為快速培育具有市場競爭力的肉牛新品種奠定基礎，為我國肉牛育種提供一個較為完善的技術體系，填補國內空白。加速我國肉牛育種進程，也將逐步降低我國肉牛對國際的依賴程度，對肉牛業(yè)的長期穩(wěn)定健康發(fā)展具有深遠意義。
[0023]以上顯示和描述了本發(fā)明的基本原理、主要特征和本發(fā)明的優(yōu)點。本行業(yè)的技術人員應該了解，本發(fā)明不受上述實施例的限制，上述實施例和說明書中描述的只是說明本發(fā)明的原理，在不脫離本發(fā)明精神和范圍的前提下，本發(fā)明還會有各種變化和改進，這些變化和改進都落入要求保護的本發(fā)明范圍內。本發(fā)明要求保護范圍由所附的權利要求書及其等效物界定。
【主權項】
1.一種智能配對基因序列生成的肉牛遺傳評估小芯片，其特征在于:包括Illumina770k SNP芯片、基因識別體、核酸探針膜、探針移動軌道，3個為一組的所述Illumina770k SNP芯片的前方依次是宰前活重優(yōu)良基因、胴體重優(yōu)良基因、育肥期日增重優(yōu)良基因，9個所述Illumina770k SNP芯片下方分別是均勻抽取的增重優(yōu)良基因芯片、大效應值的增重優(yōu)良基因芯片、P值大的增重優(yōu)良基因芯片，和均勻抽取的胴體重優(yōu)良基因芯片、大效應值的胴體重優(yōu)良基因芯片、P值大的胴體重優(yōu)良基因芯片，以及均勻抽取的宰前活重優(yōu)良基因芯片、大效應值的宰前活重優(yōu)良基因芯片、P值大的宰前活重優(yōu)良基因芯片，綜上所述生成的基因芯片中央是所述核酸探針膜，所述核酸探針膜之間是所述探針移動軌道，所述核酸探針膜周圍是所述基因識別體，所述基因識別體下方是載片。2.根據權利要求1所述的一種智能配對基因序列生成的肉牛遺傳評估小芯片，其特征在于:所述宰前活重優(yōu)良基因、所述胴體重優(yōu)良基因、所述育肥期日增重優(yōu)良基因依次與所述Illumina770k SNP芯片相接觸并且識別。3.根據權利要求1所述的一種智能配對基因序列生成的肉牛遺傳評估小芯片，其特征在于:所述宰前活重優(yōu)良基因、所述胴體重優(yōu)良基因、所述育肥期日增重通過所述Illumina770k SNP芯片利用均勻抽取得出均勻抽取的增重優(yōu)良基因芯片所述均勻抽取的胴體重優(yōu)良基因芯片、所述均勻抽取的宰前活重優(yōu)良基因芯片。4.根據權利要求1所述的一種智能配對基因序列生成的肉牛遺傳評估小芯片，其特征在于:所述宰前活重優(yōu)良基因、所述胴體重優(yōu)良基因、所述育肥期日增重通過所述Illumina770k SNP芯片基于BayesB所得效應值大小得出所述大效應值的增重優(yōu)良基因芯片、所述大效應值的胴體重優(yōu)良基因芯片、所述大效應值的宰前活重優(yōu)良基因芯片。5.根據權利要求1所述的一種智能配對基因序列生成的肉牛遺傳評估小芯片，其特征在于:所述宰前活重優(yōu)良基因、所述胴體重優(yōu)良基因、所述育肥期日增重通過所述Illumina770k SNP芯片基于GWAS所得P值大小得出所述P值大的增重優(yōu)良基因芯片、所述P值大的胴體重優(yōu)良基因芯片、所述P值大的宰前活重優(yōu)良基因芯片。6.根據權利要求1所述的一種智能配對基因序列生成的肉牛遺傳評估小芯片，其特征在于:所述載片與所述基因識別體剛性連接，所述核酸探針膜與所述探針移動軌道密封連接。
【專利摘要】本實用新型涉及一種智能配對基因序列生成的肉牛遺傳評估小芯片，包括Illumina770k？SNP芯片、基因識別體、核酸探針膜、探針移動軌道，3個為一組的所述Illumina770k？SNP芯片的前方依次是宰前活重優(yōu)良基因、胴體重優(yōu)良基因、育肥期日增重優(yōu)良基因，9個所述Illumina770k？SNP芯片下方分別是均勻抽取的增重優(yōu)良基因芯片、大效應值的增重優(yōu)良基因芯片、P值大的增重優(yōu)良基因芯片，和均勻抽取的胴體重優(yōu)良基因芯片、大效應值的胴體重優(yōu)良基因芯片、P值大的胴體重優(yōu)良基因芯片，以及均勻抽取的宰前活重優(yōu)良基因芯片、大效應值的宰前活重優(yōu)良基因芯片、P值大的宰前活重優(yōu)良基因芯片。本實用新型的有益效果在于：利用小芯片，大大降低了用于肉牛遺傳評估中利用高密度生物芯片獲得基因型成本。
【IPC分類】C12M1/34
【公開號】CN205115477
【申請?zhí)枴緾N201520872285
【發(fā)明人】李俊雅, 朱波, 張靜靜
【申請人】中國農業(yè)科學院北京畜牧獸醫(yī)研究所
【公開日】2016年3月30日
【申請日】2015年11月5日