專利名稱:氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法
專利說(shuō)明氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法 技術(shù)領(lǐng)域 本發(fā)明涉及一種氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,特別是“3′-脫氧-3′-氟代-胸腺嘧啶核苷在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法”。
該方法的實(shí)質(zhì)是基于腫瘤細(xì)胞增殖周期-S階段-細(xì)胞介質(zhì)中高濃度的胸腺嘧啶核苷激酶-1(TK1)的生物化學(xué),以3’-脫氧-3’-氟代-胸腺嘧啶核苷-5’-單磷酸衍生物(FLT-5’-MP)為例,對(duì)捕獲富集后的生存循環(huán)腫瘤細(xì)胞進(jìn)行的質(zhì)譜鑒定。
背景技術(shù) 原發(fā)腫瘤細(xì)胞經(jīng)自然、診療脫落后,可進(jìn)入外周血循環(huán)系統(tǒng)。部份能承受并逃脫免疫系統(tǒng)殺滅的循環(huán)腫瘤細(xì)胞,侵潤(rùn)上皮組織形成最終致命的轉(zhuǎn)移灶。外周血循環(huán)腫瘤細(xì)胞的捕獲、鑒定、計(jì)數(shù)對(duì)亞健康人群的早期普查,進(jìn)行腫瘤的臨床分期,手術(shù)化療放療的個(gè)體優(yōu)化方案具有獨(dú)特不可替代的意義。但是,由于外周血循環(huán)系統(tǒng)中腫瘤細(xì)胞的極低濃度,即每十億正常血液細(xì)胞僅含低達(dá)數(shù)個(gè)腫瘤細(xì)胞,由此產(chǎn)生對(duì)變異腫瘤細(xì)胞捕獲、鑒定、計(jì)數(shù)過(guò)程中的假陰-陽(yáng)性問(wèn)題。消除假陰-陽(yáng)性問(wèn)題對(duì)變異腫瘤細(xì)胞捕獲、鑒定和計(jì)數(shù)的影響是一個(gè)目前尚沒有解決好的世界性難題。
循環(huán)腫瘤細(xì)胞CTCs的定義1,腫瘤細(xì)胞密度小于1.077克/毫升,而血液正常細(xì)胞及粒細(xì)胞的細(xì)胞密度大于1.077克/毫升。2,細(xì)胞相對(duì)大小,腫瘤細(xì)胞的直經(jīng)一般為6至30微米,血液中最大白細(xì)胞的直徑為8至11微米。3,腫瘤細(xì)胞形態(tài)為不規(guī)則的圓形或卵圓形態(tài)。4,細(xì)胞核DAPI陽(yáng)性反應(yīng)(DAPI4’,6-diamidino-2-phenylidole)。5,細(xì)胞角蛋白8,18,19等呈陽(yáng)性,在上皮組織中成對(duì)表達(dá),細(xì)胞角蛋白的陽(yáng)性表達(dá)在蛋白質(zhì)水平被證明是上皮源性腫瘤細(xì)胞的較敏感和較特異的標(biāo)志物。6,由于CTCs不表達(dá)白細(xì)胞共同抗原CD45,CD45檢測(cè)為陰性。
目前用于腫瘤診斷的方法可歸為三大類病理學(xué),影像學(xué)和血清學(xué)。外周血CTCs的CellSearch檢測(cè)儀目前已是被FDA認(rèn)可的靈敏檢測(cè)手段之一。但其對(duì)捕獲富集后的CTCs鑒定法,可歸納為單克隆抗體對(duì)腫瘤表達(dá)蛋白的識(shí)別或以核酸為基礎(chǔ)的測(cè)定。CTCs質(zhì)譜鑒定法基于以下三個(gè)不同領(lǐng)域的技術(shù)支持背景。
1.捕獲富集鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞技術(shù) CTCs指自發(fā)或因診療操作進(jìn)入外周血循環(huán)的腫瘤細(xì)胞。自1869年發(fā)現(xiàn)CTCs以來(lái),其生物行為已漸為人們重視。腫瘤細(xì)胞有其特異的生長(zhǎng)周期。所有生存細(xì)胞或者處于休整G0態(tài),或者處于活性階段。腫瘤細(xì)胞的增殖是由G0態(tài)進(jìn)入第一階段的G1態(tài),在此準(zhǔn)備進(jìn)入合成階段的S態(tài),所謂S態(tài)指細(xì)胞核DNA的合成。隨后進(jìn)入滯后期的G2階段,然后進(jìn)入完成細(xì)胞的有絲分裂的M階段。在此DNA分離為兩相同的染色單體、整個(gè)細(xì)胞一分為二。細(xì)胞分裂周期中,DNA的合成不但在細(xì)胞介質(zhì)中進(jìn)行,同時(shí)也可在線粒體中合成。兩種不同的異構(gòu)酶胸苷激酶TK1與胸腺嘧啶核苷激酶-2(TK2),分別在細(xì)胞介質(zhì)與線粒體中對(duì)胸腺嘧啶核苷(下面簡(jiǎn)稱胸苷)的5’位羥基進(jìn)行磷酸化反應(yīng)。TK1的濃度可在G1-S轉(zhuǎn)變期增加10-20倍之多,并于G2及M階段繼續(xù)保持高濃度?;氐紾0和G1階段后,TK1則迅速降解回到正常水平。與此相反,線粒體中的TK2濃度及活性不隨細(xì)胞增殖周期的影響。由于TK1在腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)周期的S階段特征性的激酶表達(dá)方式,TK1成為腫瘤治療的靶點(diǎn)及檢測(cè)鑒定的可靠方法,目前被公認(rèn)為表征腫瘤細(xì)胞的黃金標(biāo)準(zhǔn)。CTCs的臨床應(yīng)用近5年獲得實(shí)質(zhì)進(jìn)展,主要取決以下領(lǐng)域的技術(shù)發(fā)展。
(1-1)免疫細(xì)胞化學(xué) 隨著腫瘤細(xì)胞的不斷增殖,85%的上皮屬性腫瘤細(xì)胞可以通過(guò)表達(dá)一種表皮細(xì)胞黏附分子的糖蛋白(EpCAM),以增加其相互識(shí)別,擴(kuò)散能力并使之與腫瘤母體脫離,進(jìn)而破壞周邊宿主結(jié)締組織,并進(jìn)入脈管系統(tǒng)形成轉(zhuǎn)移灶。與此相反,周血循環(huán)系統(tǒng)的細(xì)胞成分無(wú)表達(dá)該表皮細(xì)胞黏附分子的生物基礎(chǔ)。由此為相應(yīng)的抗體提供了識(shí)別、捕獲周血循環(huán)系統(tǒng)CTCs的笫一選擇性。
(1-2)捕獲富集技術(shù) 文獻(xiàn)數(shù)據(jù)表明,腫瘤脫離細(xì)胞的速度大致為1×10-5到3×10-6CTCs/天/克腫瘤組織。因此,測(cè)定周血循環(huán)系統(tǒng)的CTCs計(jì)數(shù),可用于腫瘤的早期診斷,腫瘤手術(shù)、化療評(píng)估的方法。但是,CTCs的濃度極低,大約為每10億分之1,或每毫升含5-1281CTCs。因此,有效的捕獲、富集CTCs為技術(shù)關(guān)鍵。有市場(chǎng)前景的兩項(xiàng)捕獲、富集技術(shù)為免疫磁珠流體的CellSearch和由78,000個(gè)帶抗體的微型柱組成的芯片CTC-Chip。目前美國(guó)FDA唯一批準(zhǔn)的CellSearch技術(shù),以及捕獲、富集CTCs潛力看好的美國(guó)麻省總醫(yī)院研制的芯片技術(shù)CTC-Chip都是基于識(shí)別腫瘤細(xì)胞特征EpCAM的免疫抗體。此外,聚碳酸酯膜過(guò)濾分離技術(shù),以及采用Ficoll-Paque為介質(zhì)的離心分離技術(shù),均可分離不同純度的CTCs。
(1-3)捕獲細(xì)胞的鑒定 CellSearch和CTC-Chip的腫瘤細(xì)胞的鑒定法基于細(xì)胞形態(tài)學(xué)及生物標(biāo)記物分折。上皮細(xì)胞角蛋白陽(yáng)性,無(wú)論免疫細(xì)胞化學(xué)檢測(cè)還是轉(zhuǎn)錄多聚酶鏈反應(yīng)都存在著一定的局限性,不能排除假陽(yáng)性。DAPI陽(yáng)性,即鑒定DNA的AT部位蘭色熒光法、以及CD45顯色計(jì)數(shù)陰性,即CK+/DAPI+/CD45-。該組合鑒定法為目前鑒定CTCs細(xì)胞水平的第二選擇性,并為FDA批準(zhǔn)。且優(yōu)于Adams所報(bào)導(dǎo)的CTCs直接從微流控捕獲后電導(dǎo)計(jì)數(shù)法。
(1-4)假陽(yáng)性問(wèn)題 鑒定捕獲細(xì)胞的假陽(yáng)性問(wèn)題可歸于以下因素免疫磁珠流體捕獲的腫瘤細(xì)胞基本為死亡細(xì)胞,目前捕獲效力達(dá)106富集度的CTC-Chip技術(shù)的生存細(xì)胞純度為50%。變異中的基因型-表現(xiàn)型無(wú)疑對(duì)免疫細(xì)胞化學(xué)鑒定法,以核酸為基礎(chǔ)的PCR,RT-PCR鑒定法產(chǎn)生假陽(yáng)性反應(yīng)。有關(guān)單克隆抗體以及熒光鍵合化學(xué)的制備、提純、應(yīng)用在實(shí)驗(yàn)室之間存在校大誤差。假陽(yáng)性問(wèn)題是低濃度CTCs鑒定的首要問(wèn)題。
(1-5)外周血循環(huán)腫瘤細(xì)胞的捕獲、富集、鑒定技術(shù)現(xiàn)況評(píng)估 鑒定外周血循環(huán)腫瘤細(xì)胞的先決條件是捕獲后生存的CTCs。在此,本申請(qǐng)專利將以捕獲后腫瘤細(xì)胞的存活與否界定當(dāng)前該領(lǐng)域的技術(shù)效果。第一類,即捕獲后存活的腫瘤細(xì)胞技術(shù)。其代表技術(shù)為美國(guó)麻省總醫(yī)院研制,CELLective Dx公司發(fā)展的CTC-Chip,含CTCs的全血在精密控制的層流條件下,流經(jīng)芯片中78,000個(gè)帶抗體的微型柱,使得CTCs與表面化學(xué)鍵合的抗體均勻接觸,免疫識(shí)別后捕獲。CTC-Chip捕獲的生存腫瘤細(xì)胞精度為99%,純度50%。捕獲生存腫瘤細(xì)胞的意義在于提供了進(jìn)一步代謝組、蛋白質(zhì)組、基因組鑒定的基礎(chǔ)。如對(duì)肺癌的表皮細(xì)胞生長(zhǎng)蛋白受體基因突變的測(cè)定。CTC-Chip的鑒定屬于CD45-/DAPI+/CK+的螢光組合測(cè)定,即CD45-陽(yáng)性正常血液白細(xì)胞、DAPI用于DNA含量測(cè)定、CK+表皮細(xì)胞角質(zhì)蛋白陽(yáng)性。CTCs雙電泳法捕獲細(xì)胞的存活率為90%,生存細(xì)胞的鑒定基于蹤跡熒光測(cè)定。此外,還有細(xì)胞密度梯度離心分離及卵巢腫瘤高表述的葉酸鹽受體熒光測(cè)定法。上述三項(xiàng)捕獲富聚生存CTCs技術(shù)目前都還處實(shí)驗(yàn)室發(fā)展階段。第二類,即捕獲后非存活的腫瘤細(xì)胞技術(shù)。目前唯一用于臨床CellSearch技術(shù)基礎(chǔ)為識(shí)別EpCAM的免疫磁珠流體。經(jīng)一系列半自動(dòng)化的處理、分離、清洗后,捕獲為固化死亡的CTCs。其鑒定方法也與CTC-Chip相同CD45-/DAPI+/CK+的熒光組合測(cè)定。與CTC-Chip的主要區(qū)別在于捕獲方式以及CTCs的生存率。免疫磁珠流體還被用于表皮細(xì)胞角質(zhì)蛋白的識(shí)別、捕獲,配之以Ariol掃描鑒定技術(shù),其研制公司Genetix獲得優(yōu)于CellSearch的結(jié)果。需要指出的是由Adnagen開發(fā)的以EpCAM為基礎(chǔ)的捕獲技術(shù)配之靈敏的RT-PCR檢測(cè)。目前鑒定CTCs的主要方法都局限于CTCs變異中的基因型-表現(xiàn)型,也正是現(xiàn)有捕獲方法需加以多重交叉測(cè)定,以降底CTCs假陽(yáng)性的原因。以識(shí)別表皮細(xì)胞角質(zhì)蛋白的捕獲富聚技術(shù)稱為正向富聚技術(shù),而對(duì)紅細(xì)胞的選擇性溶血技術(shù)稱為負(fù)向富聚技術(shù)。
2.用于正電子發(fā)射計(jì)算機(jī)斷層掃描的[18氟]代示蹤劑(PET) PET示蹤劑技術(shù)使得細(xì)胞內(nèi)生化代謝可被直接進(jìn)行觀測(cè),但無(wú)法區(qū)分示蹤劑及其特定代謝產(chǎn)物的相對(duì)分布及相對(duì)定量用于能量代謝示蹤劑的2’-脫氧-2’-[18氟]-D葡萄糖([18氟]-FDG)、DNA代謝的3’-脫氧-3’-[18氟]代胸腺嘧啶核苷([18氟]-FLT)、抑制參與損壞RNA及DNA合成的5-[18氟]尿嘧啶(5-FU)。由于該三種示蹤劑的共同特點(diǎn)是腫瘤細(xì)胞吸收后的代謝中間體的磷酸酶化反應(yīng),帶負(fù)電荷的磷酸根則為串級(jí)質(zhì)譜測(cè)定提供了理想的分子結(jié)構(gòu)特征。本申請(qǐng)專利僅討論進(jìn)入細(xì)胞后抑制進(jìn)一步代謝的標(biāo)記物[18氟]-FDG、[18氟]-FLT及[18氟]-FU。并以FLT為例,進(jìn)行腫瘤細(xì)胞質(zhì)譜鑒定法的演示實(shí)例。作為PET用的放射性同位素18氟將以質(zhì)譜所用的穩(wěn)定同位素氟替代。
(2-1)2’-脫氧-2’-[18氟]-D葡萄糖能量代謝示蹤劑 腫瘤細(xì)胞的低效生“能”機(jī)制導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞對(duì)葡萄糖較高需求。FDG與普通葡萄糖化學(xué)性質(zhì)相似,可在人體中產(chǎn)生有標(biāo)記的代謝物,并且在人體中存留時(shí)間較長(zhǎng),便于測(cè)量。正常腦組織、心肌組織、腎臟及膀胱組織由于高糖代謝的需要因而對(duì)FDG攝取較多。其它一些組織如肝臟、肌肉和腸壁由于其糖代謝水平低,則對(duì)FDG的攝取量較少,顯示出的FDG活性水平也較低。作為一種葡萄糖類似物,F(xiàn)DG將為葡萄糖高利用率細(xì)胞所攝取,如腦、腎臟以及癌細(xì)胞。在此類細(xì)胞中,磷酸化過(guò)程將會(huì)阻止葡萄糖以原有的完整形式從細(xì)胞之中釋放出來(lái)。葡萄糖之中的2’位氧是隨后糖酵解所必需。因而,F(xiàn)DG與2-脫氧-D-葡萄糖類似,在細(xì)胞內(nèi)無(wú)法繼續(xù)代謝。因此,在放射性衰變之前,由六碳糖激酶作用所生成的FDG-6-磷酸將不會(huì)發(fā)生糖酵解。[18氟]-FDG的分布情況很好地反映體內(nèi)細(xì)胞對(duì)葡萄糖的攝取和磷酸化的總體信息。不過(guò),F(xiàn)DG發(fā)生放射性衰變之后,其中的18氟將轉(zhuǎn)變?yōu)?80。而且,在從環(huán)境中獲取一個(gè)H+之后,F(xiàn)DG的衰變產(chǎn)物就變成了葡萄糖-6-磷酸,而其2’位上的標(biāo)記則變?yōu)闊o(wú)害的非放射性重氧。這樣,該衰變產(chǎn)物通常就可以按照普通葡萄糖的方式進(jìn)行代謝。FDA己批準(zhǔn)[18氟]-FDG用于PET以評(píng)估其它技術(shù)持疑的腫瘤病人。[18氟]-FDG雖然靜態(tài)累積于腫瘤細(xì)胞內(nèi),但基于“能量代謝”機(jī)理的[18氟]-FDG用于低純度CTCs鑒定時(shí)將導(dǎo)致低撿出率,假陽(yáng)性。穩(wěn)定同位素FDG的代謝磷酸衍生物與相應(yīng)正常代謝磷酸衍生物之比可作腫瘤細(xì)胞的質(zhì)譜鑒定參數(shù)。
(2-2)3’-脫氧-3’-[18氟]代胸腺嘧啶核苷DNA代謝示蹤劑 [18氟]-FLT經(jīng)由細(xì)胞膜核苷輸送蛋白進(jìn)入細(xì)胞,進(jìn)而為細(xì)胞介質(zhì)中的TK1對(duì)5’位羥基磷酸化。與[18氟]-FDG類似,3’-脫氧-3’-[18氟]代-胸腺嘧啶核苷-5’-磷酸衍生物僅累積于腫瘤細(xì)胞內(nèi),不能參與DNA的合成。需要指出的是DNA的合成涉及兩不同途經(jīng)攝取細(xì)胞外已有的胸腺嘧啶核苷衍生物,即補(bǔ)救合成途經(jīng);或直接攝取細(xì)胞內(nèi)的尿嘧啶核苷磷酸衍生物,即從頭合成途徑。經(jīng)由細(xì)胞外攝取的[18氟]-FLT水平直接反映了TK1的生化活性。文獻(xiàn)表明,在細(xì)胞生長(zhǎng)周期的S階段,腫瘤細(xì)胞的TK1生化活性通常為正常細(xì)胞的10-20倍。這就為本申請(qǐng)專利提供了鑒定周血循環(huán)腫瘤細(xì)胞生化特性的基礎(chǔ)。
(2-3)5-[18氟]尿嘧啶DNA及RNA代謝示蹤劑 自1957年以來(lái),5-FU用于直腸癌,乳腺癌治療。其作用及代謝主要有三途徑其一、5-FU代謝中間體5-氟代-2’-脫氧尿苷-5’-單磷酸抑制胸苷酸合酶;其二、5-氟代尿苷-5’-三磷酸參與損壞RNA的合成;其三、5-氟代-2’-脫氧尿苷-5’-三磷酸參與抑制和損壞DNA的合成。穩(wěn)定同位素5-氟尿嘧啶的代謝磷酸衍生物,與其結(jié)構(gòu)相應(yīng)的正常代謝磷酸衍生物之比可作腫瘤細(xì)胞的質(zhì)譜鑒定參數(shù)。
3.納升電噴霧負(fù)離子源用于四極桿飛行時(shí)間串聯(lián)質(zhì)譜儀 用于正電子發(fā)射計(jì)算機(jī)斷層掃描的[18氟]放射性示蹤劑,即上所述[18氟]-FDG與[18氟]-FLT,其共同點(diǎn)是代謝中間體不再參與能量代謝和DNA合成。而5-[18氟]FU則抑制、損壞DNA及RNA的合成。細(xì)胞內(nèi)的磷酸化衍生物的累積,為高分辨、高靈敏的質(zhì)譜鑒定提供了有利條件。由此為質(zhì)譜鑒定提供了天然化合物與其結(jié)構(gòu)極類似的人工合成化合物的腫瘤相關(guān)信息,以及有利于質(zhì)譜測(cè)定的磷酸根負(fù)電荷。另一方面,隨蛋白質(zhì)組學(xué)的開拓,采用先進(jìn)精密質(zhì)譜儀對(duì)分折物進(jìn)行離子化,根據(jù)待分折物的分子基團(tuán)結(jié)構(gòu)調(diào)節(jié)電場(chǎng)極性后,完成質(zhì)譜鑒定。代謝過(guò)程中產(chǎn)生的負(fù)離子分子導(dǎo)入第一級(jí)四極桿質(zhì)量過(guò)濾器,由待分折化合物的質(zhì)-荷比,選擇性地導(dǎo)入四極桿碰撞離解室,在高純充電氬氣碰撞下,被分折化合物據(jù)其分子結(jié)構(gòu)發(fā)生碎片裂解。反映特定結(jié)構(gòu)的碎片離子以其攜帶的質(zhì)-荷比在第二級(jí)飛行時(shí)間單元檢測(cè)記錄。對(duì)鑒定CTCs而論,四極桿飛行時(shí)間串聯(lián)質(zhì)譜儀Q-TOF的技術(shù)關(guān)鍵是負(fù)離子源的電離效率,以及飛行時(shí)間單元在低分子量100-500Da的范圍進(jìn)行精密校正。用于PET的[18氟]放射性示蹤劑,可以生命中不存在、抑制代謝的氟的穩(wěn)定同位素[19氟]替代。本申請(qǐng)中涉及的FLT,F(xiàn)DG,5-FU均指非放射性的穩(wěn)定氟代化合物。
一級(jí)質(zhì)譜由四極桿組成,主要起選擇離子的過(guò)濾作用,二級(jí)質(zhì)譜為飛行時(shí)間分折器,是該儀器的主要質(zhì)量分折單元。質(zhì)譜離子源及不同的串級(jí)質(zhì)譜儀還包括A.離子源的電離效率及干擾雜質(zhì);B.串級(jí)質(zhì)譜儀的質(zhì)譜分辨率及靈敏度。這些離子源包括基質(zhì)扶助激光解吸電離源MALDI,離子噴霧電離源IonSpray,快離子轟擊電離源FIB,快原子轟擊電離源FAB。而串級(jí)質(zhì)譜儀可由以下組成串級(jí)四極桿質(zhì)譜儀,其中的Q3可為離子捕獲質(zhì)譜分折器Iontrap,串級(jí)飛行時(shí)間-飛行時(shí)間質(zhì)譜儀TOF-TOF,分辨率極高的富利葉變換離子回旋共振質(zhì)譜儀FTICR-MS。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的是提出一種不受腫瘤異變影響,基于細(xì)胞生長(zhǎng)周期,新穎的質(zhì)譜鑒定法,即腫瘤細(xì)胞增殖周期的黃金鑒定法,簡(jiǎn)稱循環(huán)腫瘤細(xì)胞的質(zhì)譜鑒定法,迄今為止尚未見采用高靈敏、精確質(zhì)譜儀鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞的報(bào)導(dǎo)。
本發(fā)明所提出的氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,其特征在于 (1)對(duì)外周血循環(huán)系統(tǒng)中生存腫瘤細(xì)胞的捕獲,捕獲過(guò)程可分為單克隆抗體從大量紅細(xì)胞中識(shí)別極微量的腫瘤細(xì)胞的正富集過(guò)程,還可經(jīng)由降解紅細(xì)胞的負(fù)富集方法,以及過(guò)濾、離心等基于腫瘤細(xì)胞密度、大小的物理分離法; (2)在細(xì)胞培養(yǎng)條件下,迫使所捕獲的生存腫瘤細(xì)胞以補(bǔ)救合成途徑攝取氟代化合物; (3)對(duì)腫瘤細(xì)胞代謝產(chǎn)生并積累于細(xì)胞介質(zhì)中的氟代單磷酸產(chǎn)物進(jìn)行電噴霧負(fù)離子串級(jí)質(zhì)譜鑒定。
為獲得準(zhǔn)確鑒定結(jié)果,首先采用已知糖類化合物在負(fù)電離條件下對(duì)質(zhì)譜儀進(jìn)行校正,進(jìn)而獲取氟代單磷酸產(chǎn)物的分子負(fù)離子以及由此產(chǎn)生的特定負(fù)離子碎片,由該譜圖唯一地確定腫瘤細(xì)胞代謝氟代單磷酸產(chǎn)物。
氟代單磷酸代謝產(chǎn)物與正常代謝的單磷酸代謝產(chǎn)物之比值消除整個(gè)鑒定過(guò)程中的累積誤差,唯一地表征了所捕獲腫瘤細(xì)胞的惡性增殖程度。
氟代化合物,如3’-脫氧-3’-氟代-胸腺嘧啶核苷(FLT),其磷酸化產(chǎn)物阻礙DNA合成,不參與腫瘤細(xì)胞的代謝,從而累積于細(xì)胞內(nèi)形成有利腫瘤細(xì)胞鑒定的高濃度,提高質(zhì)譜檢測(cè)可靠性,降低或消除假陽(yáng)性。
腫瘤細(xì)胞內(nèi)氟代磷酸衍生物與正常代謝相應(yīng)的磷酸衍生物,二者經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化后的細(xì)胞攝取相對(duì)比值,消除測(cè)定過(guò)程中的系統(tǒng)誤差,真實(shí)地反映了細(xì)胞內(nèi)相關(guān)激酶的表達(dá)水平及活性。
串級(jí)質(zhì)譜鑒定法以四極桿-時(shí)間飛行串級(jí)質(zhì)譜儀為例。對(duì)不同檢測(cè)精度,高通量篩選,質(zhì)譜分辨率組合的串級(jí)質(zhì)譜儀還包括碳18反相高效液相色譜偶合四極桿-四極桿串級(jí)質(zhì)譜儀,飛行時(shí)間-飛行時(shí)間串級(jí)質(zhì)譜儀,四極桿-富利葉變換離子回旋共振質(zhì)譜儀。其中作為質(zhì)譜分折器的四極桿可由離子阱替代。
負(fù)離子質(zhì)譜測(cè)定細(xì)胞內(nèi)磷酸化代謝產(chǎn)物,除使用電噴霧負(fù)離子源外,還可由基質(zhì)扶助激光解吸電離源獲得有關(guān)負(fù)離子進(jìn)行質(zhì)譜鑒定。
以D-(+)-棉子糖及其碎片產(chǎn)物負(fù)離子系列,對(duì)TOF質(zhì)譜分折器的有效飛行距離及有關(guān)磷酸衍生物實(shí)驗(yàn)測(cè)定范圍(100-550Da)進(jìn)行校正。
周血系統(tǒng)循環(huán)腫瘤細(xì)胞的分離可由精密控制的商品直經(jīng)為8微米的膜分離器進(jìn)行,所得細(xì)胞吸收FLT后,進(jìn)行串級(jí)質(zhì)譜鑒定。
周血系統(tǒng)循環(huán)腫瘤細(xì)胞的分離還可由商品Ficoll-Paque離心分離獲得,所得細(xì)胞吸收FLT后,進(jìn)行串級(jí)質(zhì)譜鑒定。
周血系統(tǒng)循環(huán)腫瘤細(xì)胞芯片鑒定為經(jīng)微流控抗體富聚后,再偶合串級(jí)質(zhì)譜儀,于微流控出口引入電噴霧裝置,與串級(jí)質(zhì)譜儀離子源電極形成引導(dǎo)測(cè)定代謝磷酸衍生物的完整裝置。微流控由識(shí)別表皮細(xì)胞特征生物標(biāo)記蛋白的抗體及鉑金電極組成,作為串級(jí)質(zhì)譜儀負(fù)電離電噴霧離子源。
周血系統(tǒng)循環(huán)腫瘤細(xì)胞可由簡(jiǎn)單的負(fù)向富聚技術(shù)獲取即大量的紅細(xì)胞經(jīng)商品溶劑選擇性地降解、清除。而腫瘤細(xì)胞則附著于膠原蛋白載體,經(jīng)吸收FLT后,進(jìn)行串級(jí)質(zhì)譜鑒定。
單獨(dú)或組合提取捕獲腫瘤細(xì)胞后,相關(guān)淬取磷酸衍生物的溶劑乙腈-水(50%)為最佳高通量測(cè)定溶劑。碳18反相高效液相色譜分離的最佳淬取溶劑為乙腈-水(2%)。其它乙腈替代有機(jī)溶劑,如甲醇,也可取得類似結(jié)果。
所述氟代化合物不限于DNA合成特定的FLT,還包括其它氟代化合物。包括抑制、損壞DNA及RNA合成的5-氟尿嘧啶(5-FU)以及細(xì)胞能量代謝的2’-氟代-2’-脫氧葡萄糖(FDG)。以上三種氟代化合物的單一或組合使用,均可在激酶作用下生成磷酸化代謝產(chǎn)物,遵循本專利規(guī)范的生化原理及基本操作流程,以質(zhì)譜法測(cè)定其磷酸化代謝產(chǎn)物,鑒定腫瘤細(xì)胞。
所述微流控電噴霧離子源,如權(quán)利要求十二所述溶血負(fù)向富聚技術(shù),權(quán)利要求十四所述三種氟代合物的單一或組合的生化試劑、組合配套構(gòu)成的循環(huán)腫瘤細(xì)胞診斷測(cè)試盒,可用于鄉(xiāng)、縣級(jí)衛(wèi)生所進(jìn)行當(dāng)?shù)伢w外腫瘤普查及建立個(gè)體化腫瘤信息。捕獲腫瘤細(xì)胞由串級(jí)質(zhì)譜中心評(píng)估診斷、治療效果。
本發(fā)明提出的CTCs鑒定基于以下原理A.鑒定基礎(chǔ)為捕獲生存細(xì)胞惡性增殖程度,具體以腫瘤細(xì)胞增殖過(guò)程中DNA的合成直接相關(guān)的激酶TK1為例詳述;B.FLT分子結(jié)構(gòu)中3’取代基氟具有穩(wěn)定分子免遭細(xì)胞內(nèi)降解,以及中止進(jìn)一步DNA的合成代謝雙重作用,導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)的累積,并由此提高質(zhì)譜鑒定的可靠性,降低CTCs的檢測(cè)假陰性。此外氟具有最小原子半經(jīng),因此為TK1的理想非天然基質(zhì);C.FLT-5’-MP的磷酸根所攜帶負(fù)電荷為負(fù)離子質(zhì)譜檢測(cè)提供了電離基團(tuán)及離子特征碎片;D.與天然胸苷-5’-單磷酸(胸苷-5’-MP)衍生物的細(xì)胞攝取比值,消除測(cè)定過(guò)程中的系統(tǒng)誤差,真實(shí)地反映了CTCs增殖過(guò)程中TK1的表達(dá)水平。C.負(fù)離子電噴霧源四極桿飛行時(shí)間串聯(lián)質(zhì)譜儀的高靈敏、高分辨提供了結(jié)構(gòu)確認(rèn)的唯一性,以及對(duì)TK1活性的準(zhǔn)確質(zhì)譜定量。上述基于CTCs惡性增殖的質(zhì)譜鑒定法顯然優(yōu)于FDA認(rèn)可的細(xì)胞生物標(biāo)記物組合鑒定法,即CD45-/DAPI+/CK+的熒光組合鑒定法。
(3-2)質(zhì)譜檢測(cè)FLT-5’-MP衍生物結(jié)構(gòu)的優(yōu)勢(shì) 穩(wěn)定同位素氟置換3’位的羥基對(duì)本專利發(fā)展的質(zhì)譜測(cè)定方法有以下三點(diǎn)結(jié)構(gòu)優(yōu)勢(shì)A.防止糖單元從胸苷單元降解,導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)FLT的高穩(wěn)定性;B.FLT對(duì)細(xì)胞介質(zhì)TK1的選擇優(yōu)于對(duì)線粒體內(nèi)的TK2,而只有TK1與細(xì)胞增殖期有關(guān);C.3’-氟取代基團(tuán)阻止了DNA的合成,因此累積于細(xì)胞介質(zhì)中。
(3-3)測(cè)定CTCs的負(fù)離子電噴霧串聯(lián)質(zhì)譜儀 所有待分折分子首先需在離子源進(jìn)行電離。對(duì)于測(cè)定CTCs的上述物質(zhì)對(duì)的標(biāo)準(zhǔn)吸收比值而言,即FLT-5’-MP與相應(yīng)的胸苷-5’-MP的吸收比值。該對(duì)磷酸衍生物帶有負(fù)電荷的磷酸根,在無(wú)需任何添加物,體積比為50%乙腈-水混合液中,直接施與1,600V電壓,用穩(wěn)定的注射泵,于20-100nl/min的流量,經(jīng)由直經(jīng)為10μm的電噴霧針頭于常溫常壓下,形成穩(wěn)定的羽狀電噴霧。帶負(fù)電離子經(jīng)90度角方向的錐形離子入口,于35V電壓下引入第一級(jí)四極桿質(zhì)譜過(guò)濾器。該過(guò)程即特殊的“Z-電噴霧”。中性分子、正離子等雜質(zhì)背景信號(hào)得予改善。本文采應(yīng)同位素12C=12.0000Da進(jìn)行具有確定元素組成負(fù)離子的m/z的單一同位素質(zhì)量計(jì)算。
(3-4)低分子量負(fù)離子質(zhì)譜儀的校正 由于磷酸化的FDG與FLT均屬于帶負(fù)電荷的小分子。飛行時(shí)間串聯(lián)質(zhì)譜儀的測(cè)量精度隨溫度以及質(zhì)譜儀內(nèi)部元件表面化合物的沉積而發(fā)生變化。室溫變化1℃通常導(dǎo)致50mDa的測(cè)定誤差。這就要求對(duì)飛行時(shí)間分折器進(jìn)行有效飛行距離以及100-500Da低分子量的負(fù)離子動(dòng)態(tài)范圍進(jìn)行校正。本申請(qǐng)采用木棉塘的負(fù)離子分子及其負(fù)離子碎片完成上述二項(xiàng)校正。上述各型質(zhì)譜儀主要用于生物聚合物的鑒定。如蛋白質(zhì)組學(xué)中對(duì)多肽的氨基酸序列的鑒定,通常以正離子電離方式在較大的分子量范圍測(cè)定,如150-1500Da。而FLT-5’-MP與相應(yīng)的胸苷-5’-MP分子結(jié)構(gòu)及產(chǎn)物碎片負(fù)離子范圍125-323Da小分子范圍內(nèi)。此范圍存在較多的溶劑加合離子的雜質(zhì)干擾,測(cè)量精度也受室溫影響。因此對(duì)串級(jí)Q-TOF的校正極為重要。本申請(qǐng)專利以D-(+)-棉子糖及其碎片產(chǎn)物負(fù)離子糸列,對(duì)TOF的有效飛行距離及上述實(shí)驗(yàn)測(cè)定范圍以三次方程進(jìn)行校正。
本發(fā)明首次提出分離富聚后生存循環(huán)腫瘤細(xì)胞的黃金鑒定法,該方法不受腫瘤細(xì)胞體內(nèi)發(fā)展,轉(zhuǎn)移,手術(shù),放療及化療過(guò)程中基因型-表現(xiàn)型生物標(biāo)記物變異的影響。以串級(jí)質(zhì)譜儀測(cè)定腫瘤細(xì)胞增殖過(guò)程中特征代謝化合物,準(zhǔn)確地反映了腫瘤細(xì)胞增殖周期的惡性程度與外周血正常細(xì)胞的本質(zhì)區(qū)別。
圖1是串級(jí)質(zhì)譜測(cè)定腫瘤細(xì)胞DNA增殖原理示意圖。
圖中通過(guò)DNA補(bǔ)救合成途徑進(jìn)入細(xì)胞介質(zhì)的高濃度FLT,在胸苷激酶(TK1)作用下生成FLT-5’-MP洐生物。并進(jìn)一步與其DP洐生物,TP洐生物,且形成動(dòng)態(tài)平衡。但以MP洐生物為主要成份(70%)。由于氟在戊糖3’位取代,DNA合成由此中斷,導(dǎo)致FLT-5’-MP洐生物累積于細(xì)胞內(nèi)。而胸苷激酶在腫瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)周期的G1/S階段合成上升可達(dá)10至20倍,作為酶基質(zhì)磷酸化的FLT-5’-MP洐生物唯一地表征腫瘤的惡性增殖程度。同時(shí)帶負(fù)電的磷酸根為負(fù)電子噴霧串級(jí)質(zhì)譜的測(cè)定提供了高靈敏結(jié)構(gòu)測(cè)定基礎(chǔ)。
圖2是腫瘤細(xì)胞鑒定的特異性結(jié)構(gòu)圖。
圖中細(xì)胞增殖周期S階段高表達(dá)胸苷激酶(TK1)對(duì)戊糖5’的磷酸化反應(yīng)的代謝產(chǎn)物FLT-5’-MP相對(duì)于胸苷-5’-MP的標(biāo)準(zhǔn)化吸收比值唯一地表征了腫瘤細(xì)胞的增殖屬性。FLT-5’-MP洐生物與正常代謝的胸苷-5’-MP洐生物分子濃度標(biāo)準(zhǔn)化吸收比值消除實(shí)驗(yàn)中產(chǎn)生的系統(tǒng)誤差,唯一地反映腫瘤細(xì)胞增殖的生化特征。
圖3是用于校正質(zhì)譜儀的D-(+)-棉子糖及其碎片產(chǎn)物負(fù)離子系列計(jì)算值圖。
圖中分子負(fù)離子計(jì)算值,[M-H]=503.1612,根據(jù)實(shí)驗(yàn)觀測(cè)值用于TOF分折器的有效飛行距離的校正。并以其碎片負(fù)離子于實(shí)驗(yàn)100-550Da測(cè)定范圍內(nèi)進(jìn)行三次方程對(duì)質(zhì)譜儀進(jìn)行校正。
圖4是FLT-5’-MP的分子結(jié)構(gòu)負(fù)離子裂解機(jī)理圖。
圖中分子負(fù)離子m/z=323.04;胸腺嘧啶負(fù)離子m/z=125.05;3’-氟代-脫氧核糖-5’-單磷酸負(fù)離子m/z=197.03;以及由m/z=197.03失去中性分子HF(20Da)的脫氧核糖-5’-單磷酸負(fù)離子m/z=177.02。
圖5是乳腺癌細(xì)胞內(nèi)代謝產(chǎn)物FLT-5’-MP與胸苷-5’-MP的質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)值圖。
圖中實(shí)驗(yàn)值m/z 323.00及m/z 321.16表明質(zhì)量差為2Da表明FLT-5’-MP與胸苷-5’-MP的分子負(fù)離子,此為該對(duì)分子結(jié)構(gòu)的第一判斷。帶有結(jié)構(gòu)確認(rèn)的碎片負(fù)離子3’-脫氧-3’-氟代-核糖-5’-單磷酸負(fù)離子與相應(yīng)的脫氧核糖-5’-單磷酸負(fù)離子對(duì)的實(shí)驗(yàn)測(cè)定質(zhì)分別為m/z 196.96與m/z 194.99,該對(duì)碎片負(fù)離子進(jìn)一步確定核糖-3’位上取代基的質(zhì)量差別(2Da)19氟(19Da)與羥基(17Da)。碎片負(fù)離子m/z 176.98是由3’-脫氧-3-氟代-核糖-5’-單磷酸負(fù)離子(m/z 196.96)失去中性分子HF(20Da)以及脫氧核糖-5’-單磷酸負(fù)離子失去中性分子H2O(18Da)的共同結(jié)果。碎片負(fù)離子m/z 125.02為FLT-5’-MP與胸苷-5’-MP分子結(jié)構(gòu)的共同特征,即胸腺嘧啶負(fù)離子,與核糖3’取代基無(wú)關(guān)。
圖6是乳腺癌細(xì)胞與正常人體全血細(xì)胞對(duì)FLT的吸收對(duì)比示意圖。
Y軸FLT-5’-MP洐生物與正常代謝的胸苷-5’-MP洐生物分子吸收比值;X軸細(xì)胞培養(yǎng)液中FLT的濃度測(cè)定范圍。FLT的補(bǔ)救合成及代謝產(chǎn)物由TK1的表達(dá)控制,即與細(xì)胞增殖惡性程度相關(guān)。
圖7是乳腺癌細(xì)胞內(nèi)代謝產(chǎn)物FLT-5’-MP與胸苷-5’-MP的吸收比值示意圖。
圖中累積于細(xì)胞內(nèi)的FLT-5’-MP相對(duì)于胸苷-5’-MP的比值達(dá)70,為正常全血細(xì)胞比值(約0.5)的上百倍。從而降低循環(huán)腫瘤細(xì)胞鑒定的假陽(yáng)性。
圖8是單克隆抗體芯片與串級(jí)質(zhì)譜儀對(duì)接示意圖。
圖中新穎結(jié)構(gòu)部件1,孔徑0.22微米芯片出口膜過(guò)濾器、2聯(lián)接芯片鉑金電極,PicoTip噴霧發(fā)射針及芯片出口毛細(xì)管采用死體積為零的T型聚四氟乙烯三通、3,PicoTip噴霧發(fā)射針內(nèi)徑為10微米,在20-75納升/分鐘流量,室溫,1,600伏電壓條件下,乙腈-水(50%)形成羽狀電噴霧,無(wú)需氮?dú)廨o助。
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合附圖進(jìn)一步說(shuō)明本發(fā)明的優(yōu)點(diǎn)和積極效果。
實(shí)施例1細(xì)胞培養(yǎng)及質(zhì)譜定性 將ATCC獲取的乳腺癌細(xì)胞MCF-7置于含有10%的牛胎血清RPMI1640培養(yǎng)液中。培養(yǎng)箱空氣二氧化碳的含量為5%,溫度37℃。每?jī)商旄鼡Q一次培養(yǎng)液,當(dāng)培養(yǎng)細(xì)胞達(dá)70%的單細(xì)胞融合度后,細(xì)胞培養(yǎng)更換為分別含F(xiàn)LT濃度為0.01,0.05,0.1,0.5,1,1.5mM的培養(yǎng)液。細(xì)胞于溫度37℃下攝取FLT,時(shí)間1小時(shí)。以PBS清洗細(xì)胞后,加入0.05%胰蛋白酶并保持于37℃約10分鐘。于5000g離心2分鐘回收脫落細(xì)胞,并將底部細(xì)胞小餅重懸浮于1ml的PBS中,輕微震蕩清洗后置于1.5ml的erppendorf離心管中。重復(fù)PBS清洗、5000rpm離心回收三次。加入體積比為50%乙腈-水細(xì)胞溶解液100微升于細(xì)胞小餅中,激烈震蕩5秒后,置于超聲波2分鐘。細(xì)胞經(jīng)三次-78℃深凍與4℃解凍后,于14,000rpm離心2分鐘,回收上層清洗并經(jīng)孔徑為0.22微米膜過(guò)濾。另一方面,于EDTA收集管采集的健康自愿者的全血100微升用于以上不同濃度FLT的對(duì)照實(shí)驗(yàn)。經(jīng)處理的乳腺癌細(xì)胞及全血FLT攝取直接用于串級(jí)Q-TOF定性定量測(cè)定。
FLT對(duì)DNA合成過(guò)程的抑制機(jī)理參見圖-1。作為DNA合成的基本單元,胸苷-5’-MP衍生物可由細(xì)胞內(nèi)脫氧尿苷單磷酸在胸苷酸合酶作用下獲得,即細(xì)胞內(nèi)從頭合成途徑;或者攝取細(xì)胞外胸苷的補(bǔ)救合成途徑。作為磷酸基團(tuán)施主的ATP,其細(xì)胞內(nèi)具較高的mM水平的生理濃度,因此,本專利采用磷酸基團(tuán)受主濃度為1mM的FLT作為對(duì)CTCs測(cè)定。以期取得對(duì)極少量CTCs達(dá)到更靈敏的檢測(cè)極限。圖-2表明細(xì)胞增殖周期S階段高表達(dá)激酶TK1對(duì)戊糖5’的磷酸化反應(yīng)的代謝產(chǎn)物FLT-5’-MP的理論計(jì)算為m/z=323.04,胸苷-5’-MP的理論計(jì)算為m/z=321.05。該對(duì)化合物的標(biāo)準(zhǔn)化吸收比值唯一地表征了腫瘤細(xì)胞的增殖屬性。獲得對(duì)細(xì)胞內(nèi)該對(duì)化合物的精確測(cè)定之前,需要以D-(+)-棉子糖對(duì)串級(jí)質(zhì)譜儀在小分子負(fù)離子范圍內(nèi)進(jìn)行校正。D-(+)-棉子糖的負(fù)電離碎片產(chǎn)物的單一同位素計(jì)算值參見圖-3,其中負(fù)分子離子m/z=503.1612,碎片負(fù)離子C6H11O6m/z=179.0556,碎片負(fù)離子C8H13O7m/z=221.0661,碎片負(fù)離子C10H19O9m/z=281.0873,碎片負(fù)離子C12H20O10m/z=323.0978作為校正內(nèi)標(biāo)。當(dāng)D-(+)-棉子糖的濃度為5ng/μl時(shí),TOF的有效飛行距離實(shí)測(cè)值為503.161+/-0.05Da。小分子實(shí)驗(yàn)測(cè)定范圍由D-(+)-棉子糖的分子負(fù)離子及電離碎片上述產(chǎn)物糸列的實(shí)測(cè)值與理論計(jì)算值之間的殘余誤差分布小于10mDa作為通過(guò)校正的標(biāo)準(zhǔn)。
經(jīng)校正的質(zhì)譜儀可實(shí)施上述相關(guān)代謝物的測(cè)定。四極桿質(zhì)譜過(guò)濾器根據(jù)負(fù)離子FLT-5’-MP與相應(yīng)的胸苷-5’-MP的質(zhì)-電荷比,導(dǎo)入四極桿碰撞單元。在此由高純氬氣于22V電壓下,與負(fù)離子m/z=323.04及m/z=321.05發(fā)生碰撞,形成碎片產(chǎn)物離子。碎片產(chǎn)物離子的信號(hào)強(qiáng)度由第二級(jí)飛行時(shí)間質(zhì)譜分折器準(zhǔn)確測(cè)定。FLT 5’-MP的負(fù)離子系列理論計(jì)算值參見圖-4分子負(fù)離子m/z=323.04;胸腺嘧啶負(fù)離子m/z=125.05;3’-氟代-脫氧核糖-5’-單磷酸負(fù)離子m/z=197.03;以及由m/z=197.03失去中性分子分子量為20Da的HF,即脫氧核糖-5’-單磷酸負(fù)離子m/z=177.02。與此負(fù)離子系列相應(yīng)的胸苷-5’-MP結(jié)構(gòu)為脫氧核糖-5’-單磷酸負(fù)離子m/z=195.03。需要指出的是3’-氟代-脫氧核糖-5’-單磷酸負(fù)離子m/z=197.03與脫氧核糖-5’-單磷酸負(fù)離子m/z=195.03的質(zhì)量差為2Da。此2Da的質(zhì)量差由核糖3’位質(zhì)量17Da羥基為質(zhì)量19Da氟原子取代所致。圖-5顯示FLT-5’-MP與胸苷-5’-MP的質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)測(cè)定值。m/z 323.00及m/z 321.16質(zhì)譜對(duì)表明質(zhì)量差為2Da的FLT-5’-MP與胸苷-5’-MP的分子負(fù)離子,此為結(jié)構(gòu)確認(rèn)的第一判斷。帶有結(jié)構(gòu)確認(rèn)的碎片負(fù)離子3’-脫氧-3’-氟代-核糖-5’-單磷酸負(fù)離子與相應(yīng)的脫氧核糖-5’-單磷酸負(fù)離子對(duì)的實(shí)驗(yàn)測(cè)定質(zhì)分別為m/z 196.96與m/z 194.99,該對(duì)碎片負(fù)離子進(jìn)一步確定核糖-3’位上取代基的質(zhì)量為2Da差別19氟(19Da)與羥基(17Da)之差。碎片負(fù)離子m/z 176.98是由3’-脫氧-3’-氟代-核糖-5’-單磷酸負(fù)離子(m/z 196.96)失去中性分子HF(20Da)以及脫氧核糖-5’-單磷酸負(fù)離子失去中性分子H2O(18Da)的共同結(jié)果。最后,碎片負(fù)離子m/z 125.02為FLT-5’-MP與胸苷-5’-MP分子結(jié)構(gòu)的共同特征,即胸腺嘧啶負(fù)離子,與核糖3’取代基無(wú)關(guān)。所有觀測(cè)到的質(zhì)譜特征無(wú)疑證實(shí)FLT在腫瘤細(xì)胞中為TK1在核糖5’羥基發(fā)生磷酸化反應(yīng)。表1為FLT-5’-MP與胸苷-5’-MP的Q-TOF計(jì)算值與測(cè)定值對(duì)比結(jié)果。
表1.FLT-5’-MP與胸苷-5’-MP分子結(jié)構(gòu)的Q-TOF串級(jí)質(zhì)譜鑒定 FLT-5’-MP 胸苷-5’-MP 實(shí)施例2細(xì)胞培養(yǎng)及質(zhì)譜定量 上述乳腺癌細(xì)胞MCF-7與新鮮采集的健康人體靜脈全血對(duì)FLT的攝取對(duì)比實(shí)驗(yàn)按實(shí)施例1條件進(jìn)行。鑒定CTCs對(duì)FLT的攝取條件的選擇基礎(chǔ)為A,由于ATP mM的細(xì)胞內(nèi)高濃度,因此FLT的培養(yǎng)液濃度上限設(shè)為1.5mM。B,F(xiàn)LT的代謝研究表明FLT攝取于60分鐘達(dá)峰值,并繼續(xù)保持2小時(shí)。C,F(xiàn)LT磷酸洐生物的細(xì)胞內(nèi)分布以FLT-5’-MP為主,約占70%。D,培養(yǎng)液高濃重的FLT有利于“補(bǔ)救合成途徑”,即乳腺癌細(xì)胞中高濃度的TK1。E,F(xiàn)LT-5’-MP并非脫氧核糖核酸酶的良好基質(zhì)化合物,即核糖5’位去磷酸化相對(duì)緩慢。F,F(xiàn)LT-5’-MP的磷酸根負(fù)電荷阻礙其由細(xì)胞內(nèi)向細(xì)胞外的擴(kuò)散。標(biāo)準(zhǔn)化吸收比值m/z 323.04m/z 321.05,即FLT-5’-MP胸苷-5’-MP的比值表征TK1對(duì)該對(duì)化合物的選擇性及核糖5’位羥基的磷酸化反應(yīng)。表達(dá)了二者在細(xì)胞內(nèi)的相對(duì)定量關(guān)系FLT-5’-MP于細(xì)胞內(nèi)中止代謝,累積形成高濃度,而胸苷-5’-MP處于正常代謝,保持動(dòng)態(tài)低濃度。FLT的徑由補(bǔ)救合成途徑的凈吸收劑量關(guān)系,此種吸收差異完全由TK1隨腫瘤細(xì)胞的增殖而唯一確定。因此,標(biāo)準(zhǔn)化吸收比值表征了腫瘤細(xì)胞的的增殖程度。本法與FDA批準(zhǔn)的CTCs當(dāng)今流行的腫瘤細(xì)胞熒光組合鑒定法截然不同。乳腺癌細(xì)胞的標(biāo)準(zhǔn)化吸收比值隨初始劑量為0.001mM的0.6增加到1mM劑量的70,參見圖-6。即兩個(gè)數(shù)量級(jí)的增加。與此相反,新鮮抽取的健康全血細(xì)胞在同樣FLT培養(yǎng)液的條件下,其標(biāo)準(zhǔn)化吸收比值<1。即正常全血細(xì)胞由TK1支配的補(bǔ)救合成途徑在實(shí)驗(yàn)條件下活性效果幾乎為零。圖-7表明質(zhì)譜測(cè)定的標(biāo)準(zhǔn)化吸收比值m/z 322.99m/z 320.98即FLT-5’-MP胸苷-5’-MP的比值準(zhǔn)確靈敏地反映了腫瘤細(xì)胞的惡性程度。
實(shí)施例3循環(huán)腫瘤細(xì)胞溶血反向富聚串級(jí)質(zhì)譜鑒定法 新鮮采集一期乳腺癌病人10毫升靜脈血收集于含EDTA試管中并于8小時(shí)內(nèi)實(shí)施紅細(xì)胞溶血降解。商品氯化銨紅細(xì)胞溶血降解緩沖液組成155mM氯化銨、10mM KHCO3、0.1mM EDTA,pH=7.4,50毫升。將溶血降解緩沖液預(yù)熱至室溫并置于100毫升離心管中,將收集的2毫升靜脈血加入,上蓋密封。于搖動(dòng)盤上輕盈溶血10分鐘左右。將離心管于室溫下,于300g離心分離5分鐘,去降上層紅色懸浮液。于離心管底部應(yīng)獲得白細(xì)胞與腫瘤細(xì)胞沉降物,若仍有分層可重復(fù)上述步驟。將沉降物重溶于0.5毫升PBS/EDTA溶液,EDTA的濃度為2mM。加入內(nèi)表面涂有膠原蛋白的96孔細(xì)胞培養(yǎng)皿,于37℃過(guò)夜附著。經(jīng)PBS/EDTA洗滌后,加入含有1mM FLT的RPMI1640培養(yǎng)液0.5毫升,靜置于37℃培養(yǎng)箱1小時(shí)。經(jīng)PBS洗滌,加入體積比為50%乙腈-水細(xì)胞溶解液100微升提取相關(guān)磷酸衍生物。并遵照實(shí)施例1所述進(jìn)行循環(huán)腫瘤細(xì)胞串級(jí)質(zhì)譜鑒定。本法選擇性地對(duì)紅細(xì)胞進(jìn)行溶血降解,保留完整的白細(xì)胞及腫瘤細(xì)胞,即對(duì)紅細(xì)胞進(jìn)行負(fù)向富聚。精密質(zhì)譜測(cè)定的標(biāo)準(zhǔn)化吸收比值m/z 323.04m/z 321.05大于5為確診。
實(shí)施例4循環(huán)腫瘤細(xì)胞過(guò)濾分離串級(jí)質(zhì)譜鑒定法 聚碳酸酯(polycarbonate)膜過(guò)濾分離循環(huán)腫瘤細(xì)胞基于精密加工的膜孔直徑。周血循環(huán)糸統(tǒng)中體積較大的表皮腫瘤細(xì)胞可與體積較小的血液正常細(xì)胞分離。新鮮采集體積為2毫升一期乳腺癌病人全血經(jīng)相同體積PBS/EDTA稀釋后,過(guò)Millipore Isopore商品膜分離器。膜直徑13毫米,孔直徑8微米,8-20%孔徑誤差。稀釋全血可于5分鐘左右通過(guò)分離器,而循環(huán)腫瘤細(xì)胞留于分離器內(nèi)。經(jīng)兩次體積為7.5毫升PBS/EDTA洗滌后,加入含有濃度為1mM FLT的RPMI 1640培養(yǎng)液1毫升,靜置于37℃培養(yǎng)箱1小時(shí)。經(jīng)PBS洗滌并離心分離后,加入1毫升體積比為50%乙腈-水,超聲波2分鐘后置于-80℃。細(xì)胞溶解液徑-80℃深凍4℃解凍后回收于eppendorf離心管,徑14,000rpm離心2分鐘,上層清洗轉(zhuǎn)入另一eppendorf離心管。置于-80℃深凍后,于室溫下Speed-Vac至干。重溶于50微升體積比為50%乙腈-水后,于Q-TOF測(cè)定標(biāo)準(zhǔn)化吸收比值。精密質(zhì)譜測(cè)定的標(biāo)準(zhǔn)化吸收比值m/z 323.04m/z 321.05大于5為確診。
實(shí)施例5循環(huán)腫瘤細(xì)胞離心分離串級(jí)質(zhì)譜鑒定法 本方法基于商品化的分離CTCs的產(chǎn)品RosetteSep。將350微升RosetteSep離心液加入新鮮采集體積為7.5毫升一期乳腺癌病人全血,混勻,置于室溫20分鐘。用7.5毫升PBS稀釋后,輕勻。將稀釋后全血均勻置于Ficoll-Paque 50毫升離心管上部,仔細(xì)盡量避免兩者互混。室溫下1200g離心分離20分鐘。離心前關(guān)閉離心機(jī)止動(dòng)剎閘。在Ficoll-Paque與血清界面回收富聚后的腫瘤細(xì)胞,并以1毫升PBS于enppendorf離心管清洗兩次。加入含有濃度為1mM FLT的RPMI 1640培養(yǎng)液1毫升,靜置于37℃培養(yǎng)箱1小時(shí)。經(jīng)PBS 7.5毫升洗滌后。加入1毫升體積比為50%乙腈-水,超聲波2分鐘后置于-80℃。細(xì)胞溶解液徑-80℃深凍4℃解凍后回收于eppendorf離心管,徑14,000rpm離心2分鐘,上層清洗轉(zhuǎn)入另一eppendorf離心管。置于-80℃深凍后,于室溫下Speed-Vac至干。重溶于50微升體積比為50%乙腈-水后,于Q-TOF測(cè)定標(biāo)準(zhǔn)化吸收比值。精密質(zhì)譜測(cè)定的標(biāo)準(zhǔn)化吸收比值m/z323.04m/z 321.05大于5為確診。
實(shí)施例6循環(huán)腫瘤細(xì)胞微流控富聚串級(jí)質(zhì)譜鑒定法 改進(jìn)后的微流控芯片及附帶含1mM FLT的RPMI 1640培養(yǎng)液試劑,可用于鄉(xiāng)、縣級(jí)衛(wèi)生所及醫(yī)院腫瘤檢測(cè)的方法,經(jīng)處理后的芯片郵寄至質(zhì)譜中心后,于芯片出口組裝一次性電噴霧裝置進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化吸收比值的測(cè)定。微流控芯片制作結(jié)構(gòu)為改進(jìn)的Adams裝置,優(yōu)點(diǎn)是對(duì)1毫升未經(jīng)處理的一期乳腺癌病人全血經(jīng)37分鐘后完成CTCs的捕獲,該裝置采用嵌入鉑金電極可作為質(zhì)譜儀離子源電極。圖8為識(shí)別EpCAM芯片與串級(jí)質(zhì)譜儀對(duì)接示意圖。其中改進(jìn)后的關(guān)鍵部件包括1,芯片出口孔徑為0.22微米膜過(guò)濾器、2聯(lián)接芯片外鉑金電極,PicoTip噴霧發(fā)射針及芯片出口毛細(xì)管的死體積為零的T型三通、3,PicoTip噴霧發(fā)射針口內(nèi)徑為10微米,在納升/分鐘流量室溫條件下形成羽狀電噴霧,無(wú)需氮?dú)廨o助?;厥崭痪酆蟮哪[瘤細(xì)胞,以PBS(0.5毫升)清洗兩次。通入含有1mM FLT的RPMI 16400.5毫升培養(yǎng)液1小時(shí)。經(jīng)0.5毫升的PBS洗滌后,通入0.5毫升體積比為50%乙腈-水置換PBS,芯片經(jīng)超聲波2分鐘后可進(jìn)行串級(jí)質(zhì)譜儀對(duì)接。本方法在Adams裝置的基礎(chǔ)上,在其微流控芯片出口引入一次性電噴霧裝置(PicoTip emitter,部件號(hào)FS360-20-10-D-20-C7,New Objective,Woburn,MA.USA)。電噴霧裝置為外徑20微米,發(fā)射空心針頭內(nèi)徑為10微米。微流控芯片出口由絕緣塑膠密封。鉑金電極與Q-TOF離子源電極于1,600伏電壓下,形成羽狀電噴霧,從而在高靈敏狀態(tài)下對(duì)帶負(fù)電磷酸化的-FLT-5’-MP與胸苷-5’-MP的標(biāo)準(zhǔn)化吸收比值進(jìn)行相對(duì)定量測(cè)定。精密質(zhì)譜測(cè)定的標(biāo)準(zhǔn)化吸收比值m/z 323.04m/z 321.05大于5為確診。
權(quán)利要求
1.一種氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,其特征在于
(1)對(duì)外周血循環(huán)系統(tǒng)中生存腫瘤細(xì)胞的捕獲,捕獲過(guò)程分為單克隆抗體從大量紅細(xì)胞中識(shí)別極微量的腫瘤細(xì)胞的正富集過(guò)程,經(jīng)由降解紅細(xì)胞的負(fù)富集方法,以及過(guò)濾、離心等基于腫瘤細(xì)胞密度、大小的物理分離法;
(2)在細(xì)胞培養(yǎng)條件下,迫使所捕獲的生存腫瘤細(xì)胞以補(bǔ)救合成途徑攝取氟代化合物;
(3)對(duì)腫瘤細(xì)胞代謝產(chǎn)生并積累于細(xì)胞介質(zhì)中的氟代單磷酸產(chǎn)物進(jìn)行電噴霧負(fù)離子串級(jí)質(zhì)譜鑒定。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,其特征在于為獲得準(zhǔn)確鑒定結(jié)果,首先采用已知糖類化合物在負(fù)電離條件下對(duì)質(zhì)譜儀進(jìn)行校正,進(jìn)而獲取氟代單磷酸產(chǎn)物的分子負(fù)離子以及由此產(chǎn)生的特定負(fù)離子碎片,由該譜圖唯一地確定腫瘤細(xì)胞代謝氟代單磷酸產(chǎn)物。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,其特征在于氟代單磷酸代謝產(chǎn)物與正常代謝的單磷酸代謝產(chǎn)物之比值消除整個(gè)鑒定過(guò)程中的累積誤差,唯一地表征所捕獲腫瘤細(xì)胞的惡性增殖程度。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,其特征在于氟代化合物,如3’-脫氧-3’-氟代-胸腺嘧啶核苷(FLT),其磷酸化產(chǎn)物阻礙DNA合成,不參與腫瘤細(xì)胞的代謝,從而累積于細(xì)胞內(nèi)形成有利腫瘤細(xì)胞鑒定的高濃度,提高質(zhì)譜檢測(cè)可靠性,降低或消除假陽(yáng)性。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,其特征在于腫瘤細(xì)胞內(nèi)氟代單磷酸衍生物與正常代謝相應(yīng)的單磷酸衍生物,二者經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化后的細(xì)胞攝取相對(duì)比值,消除測(cè)定過(guò)程中的系統(tǒng)誤差,反映細(xì)胞內(nèi)相關(guān)激酶的表達(dá)水平及活性。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,其特征在于串級(jí)質(zhì)譜鑒定法以四極桿-時(shí)間飛行串級(jí)質(zhì)譜儀為例,對(duì)不同檢測(cè)精度,高通量篩選,質(zhì)譜分辨率組合的串級(jí)質(zhì)譜儀還包括碳18反相高效液相色譜偶合四極桿-四極桿串級(jí)質(zhì)譜儀,飛行時(shí)間-飛行時(shí)間串級(jí)質(zhì)譜儀,四極桿-富利葉變換離子迴旋共振質(zhì)譜儀,其中作為質(zhì)譜分折器的四極桿可由離子阱替代。
7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,其特征在于負(fù)離子質(zhì)譜測(cè)定細(xì)胞內(nèi)磷酸化代謝產(chǎn)物,除使用電噴霧負(fù)離子源外,還可由基質(zhì)扶助激光解吸電離源獲得有關(guān)負(fù)離子進(jìn)行質(zhì)譜鑒定。
8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,其特征在于以D-(+)-棉子糖及其碎片產(chǎn)物負(fù)離子系列,對(duì)TOF質(zhì)譜分折器的有效飛行距離及有關(guān)磷酸衍生物實(shí)驗(yàn)測(cè)定范圍(100-550Da)進(jìn)行校正。
9.根據(jù)權(quán)利要求1所述的氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,其特征在于周血系統(tǒng)循環(huán)腫瘤細(xì)胞的分離可由精密控制的商品直經(jīng)為8微米的膜分離器進(jìn)行,所得細(xì)胞吸收FLT后,進(jìn)行串級(jí)質(zhì)譜鑒定。
10.根據(jù)權(quán)利要求1所述的氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,其特征在于周血系統(tǒng)循環(huán)腫瘤細(xì)胞的分離還可由商品Ficoll-Paque離心分離獲得,所得細(xì)胞吸收FLT后,進(jìn)行串級(jí)質(zhì)譜鑒定。
11.根據(jù)權(quán)利要求1所述的氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,其特征在于周血系統(tǒng)循環(huán)腫瘤細(xì)胞芯片鑒定為經(jīng)微流控抗體富聚后,再偶合串級(jí)質(zhì)譜儀,于微流控出口引入電噴霧裝置,與串級(jí)質(zhì)譜儀離子源電極形成引導(dǎo)測(cè)定代謝磷酸衍生物的完整裝置。微流控由識(shí)別表皮細(xì)胞特征生物標(biāo)記蛋白的抗體及鉑金電極組成,作為串級(jí)質(zhì)譜儀負(fù)電離電噴霧離子源。
12.根據(jù)權(quán)利要求1所述的氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,其特征在于周血系統(tǒng)循環(huán)腫瘤細(xì)胞可由簡(jiǎn)單的負(fù)向富聚技術(shù)獲取即大量的紅細(xì)胞經(jīng)商品溶劑選擇性地降解、清除。而腫瘤細(xì)胞則附著于膠原蛋白載體,經(jīng)吸收FLT后,進(jìn)行串級(jí)質(zhì)譜鑒定。
13.根據(jù)權(quán)利要求1所述的氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,其特征在于單獨(dú)或組合提取捕獲腫瘤細(xì)胞后,相關(guān)淬取磷酸衍生物的溶劑乙腈-水(50%)為最佳高通量測(cè)定溶劑,碳18反相高效液相色譜分離的最佳淬取溶劑為乙腈-水(2%)。
14.根據(jù)權(quán)利要求1所述的氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,其特征在于氟代化合物不限于DNA合成特定的FLT,還包括其它氟代化合物,包括抑制、損壞DNA及RNA合成的5-氟尿嘧啶(5-FU)以及細(xì)胞能量代謝的2’-氟代-2’-脫氧葡萄糖(FDG),以上三種氟代化合物的單一或組合使用,均在激酶作用下生成磷酸化代謝產(chǎn)物,以質(zhì)譜法測(cè)定其磷酸化代謝產(chǎn)物,鑒定腫瘤細(xì)胞。
全文摘要
一種氟代化合物在鑒定循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的應(yīng)用方法,它包括對(duì)外周血循環(huán)系統(tǒng)中生存腫瘤細(xì)胞的捕獲,捕獲過(guò)程分為單克隆抗體從大量紅細(xì)胞中識(shí)別極微量的腫瘤細(xì)胞的正富集過(guò)程,經(jīng)由降解紅細(xì)胞的負(fù)富集方法,以及過(guò)濾、離心等基于腫瘤細(xì)胞密度、大小的物理分離法;在細(xì)胞培養(yǎng)條件下,迫使所捕獲的生存腫瘤細(xì)胞以補(bǔ)救合成途徑攝取氟代化合物;對(duì)腫瘤細(xì)胞代謝產(chǎn)生并積累于細(xì)胞介質(zhì)中的氟代單磷酸產(chǎn)物進(jìn)行電噴霧負(fù)離子串級(jí)質(zhì)譜鑒定;本發(fā)明首次提出分離富聚后生存循環(huán)腫瘤細(xì)胞周期的黃金鑒定法,該方法以串級(jí)質(zhì)譜儀測(cè)定腫瘤細(xì)胞增殖過(guò)程中特征代謝化合物,準(zhǔn)確地反映了腫瘤細(xì)胞增殖周期的惡性程度與外周血正常細(xì)胞的本質(zhì)區(qū)別。
文檔編號(hào)G01N30/72GK101769930SQ20101003913
公開日2010年7月7日 申請(qǐng)日期2010年1月8日 優(yōu)先權(quán)日2010年1月8日
發(fā)明者盧小明 申請(qǐng)人:盧小明