專利名稱：用于分析復雜混合物中小分子成分的設備和相關方法
技術領域：
本公開內(nèi)容涉及測定復雜混合物中小分子成分的領域，更具體而言，涉及用于分析復雜混合物中小分子成分的設備和相關方法，這種小分子分析包括代謝物組學(metabolomics),其是指對有機體的新陳代謝過程所產(chǎn)生的小分子的研究,或者對通過新陳代謝所產(chǎn)生的小分子的其它分析。
背景技術：
代謝物組學是指對細胞、組織或器官(包括流體)中所包含的以及參與初級代謝和中間代謝的小分子或代謝物的研究。術語“代謝物組(metabolome)”是指在有機體中存在的代謝物集合。人類代謝物組包括天然的小分子(可天然生物合成的非聚合化合物)，這些天然的小分子為普通代謝反應中的參與物，并且是細胞維持、生長和正常功能所必需的。因此，代謝物組學是ー種對細胞生理狀態(tài)的直接觀察，并因此可對特定有機體中的疾病具有預見性。微妙的生化變化(包括選定代謝物的存在)在特定疾病中是固有的。因此，將這些變化精確映射到已知途徑上可使得研究者能夠?qū)膊〗⑵鹨环N生化假設?；谶@種假設，對該疾病關鍵的酶類和蛋白質(zhì)能夠是無包被的，使得疾病標靶可被識別出，以使用靶向藥物組合物或其它療法進行治療。未覆蓋疾病下的生化過程的分子生物技術著眼于基因組，其包括構成DNA的基因，DNA被轉錄成RNA，并然后被轉譯成蛋白質(zhì)，蛋白質(zhì)則構成了人類代謝物組的小分子。雖然基因組學(genomics)(研究DNA級別的生物化學)、轉錄體表達概況分析(transcriptprofiling)(研究RNA級別的生物化學)，以及蛋白質(zhì)組學(proteomics)(研究蛋白質(zhì)級別的生物化學)對于疾病途徑的識別是有用的，但是由于在人類細胞中存在超過25，000種基因、100，000至200，000種RNA轉錄物以及高達1，000, 000種蛋白質(zhì)，這些方法是非常復雜的。然而，據(jù)估計在人類代謝物組中可能僅有2，500種小分子。因此，代謝物組學技術提供了超越基因組學、轉錄體表達概況分析和/或蛋白質(zhì)組學的巨大飛躍。借助代謝物組學，代謝物和它們在代謝中的作用可被易于識別出來。在這種背景下，可以比其它已知方法更高的準確性來加速處理對疾病標靶的識別。正如在例如 Metabolon，Inc 的第 7，005，255 和 7，329，489 號，名稱分別為 “Methods for DrugDiscovery”和“Diagnosis Using Metabolomics”的美國專利中大體上所描述的那樣,在本領域中，用于識別疾病途徑的代謝物組學數(shù)據(jù)集合通常是已知的。代謝物組學的其他應用在其中進行了描述，并且包括，例如，測定對于治療劑(即，藥品)或其它外源物的反應、監(jiān)控藥物反應、測定藥物安全性和藥物的發(fā)現(xiàn)。但是，對取自各種樣本(例如，來自患者種群)的代謝物組學數(shù)據(jù)的收集和分類耗費了大量的時間和運算量。例如，依據(jù)ー些已知的代謝物組學技術，用于某些樣本的光譜測定數(shù)據(jù)被收集，以三維的形式被描繪出，并被存儲在與每ー個樣本對應的單獨文件中。然后通過單獨文件，將該數(shù)據(jù)與對應于多種已知代謝物的數(shù)據(jù)進行比較，以便識別出可能是疾病標靶的已知代謝物。該數(shù)據(jù)還可用于識別有毒物質(zhì)和/或藥物代謝物。此外，這樣的數(shù)據(jù)還可用于監(jiān)控外源物的作用，和/或用于監(jiān)控/測量/、識別外源物以及處理(代謝)這些外源物而產(chǎn)生的相關代謝物。但是，這種常規(guī)的“基于文件”的方法(涉及針對每一種樣本生成的単獨數(shù)據(jù)文件)需要使用大量的運算カ和能夠處理對大量已知代謝物進行篩選的內(nèi)存。而且，“基于文件”的數(shù)據(jù)處理可能不適合于在許多祥本中來編譯樣本種群數(shù)據(jù)，這是因為，依據(jù)已知的代謝物組學數(shù)據(jù)處理技術，每ー個樣本被獨立地分析，而沒有將可更易于在樣本種群中檢測的代謝物組成的微小變化考慮在內(nèi)。而且，現(xiàn)有的“基于文件”的方法可能有其它限制，這包括有限的可靠性和可審查性；并且，在多文件副本中的數(shù)據(jù)設置的一致性較差。此外，単獨的文件可能不支持多索引(S卩，毎日收集、樣本id、對照對已治療、藥物劑量，等)，使得在僅需要特定子集的時候，所有文件都必須掃描。當前代謝物組學數(shù)據(jù)分析技術中的這些限制可能導致丟棄可用于識別和分類作為疾病標靶的特定代謝物的潛在相關和/或有價值的代謝物組學數(shù)據(jù)。特別是，與許多樣本對應的光譜測定數(shù)據(jù)通常形成與每ー個樣本對應的大的數(shù)據(jù)文件，其中每ー個數(shù)據(jù)文件則必須經(jīng)歷相對于已知代謝物庫的単獨篩選過程。然而，常 規(guī)系統(tǒng)不易于對來自許多祥本的光譜測定數(shù)據(jù)進行合井，以便對通過光譜測定過程生成的數(shù)據(jù)進行主觀評價。因此，雖然對應于單獨樣本的單個文件可能是非決定性的，但是，在相對于樣本種群中的其它樣本以簡潔的格式進行主觀觀察的情況下，這樣的數(shù)據(jù)可能是更說明問題的。當前代謝物組學數(shù)據(jù)分析技術中的限制的ー個特定實例涉及對多個樣本的每ー個中的代謝物進行識別和量化。在某些情況下，對代謝物進行識別涉及分析每ー個樣本的數(shù)據(jù)文件，以確定在相應的數(shù)據(jù)文件之內(nèi)是否存在該代謝物的指征(即，在特定保留時間所觀察到的特定質(zhì)量成分的強度峰)。如果測定出這樣的指征，則對該代謝物的量化可包括對該指征所呈現(xiàn)的面積(即，在該強度峰下的面積)進行積分。然而，正如前面所提到的，在“基于文件”的數(shù)據(jù)處理方法中，要跨越所述樣本驗證所確定的指征是否一致可能是困難的。例如，可能很難確定所識別的強度峰是否在全部樣品中已經(jīng)針對保留時間進行了校正。而且，可能存在在一個或更多個樣本的數(shù)據(jù)文件內(nèi)未清楚地限定出這種指征(即，強度峰)的情況。在那些情況下，用于計算由該指征所呈現(xiàn)的面積的積分步驟可能基于例如所用的假設或結合計算所進行的估計而不同，尤其是特定強度峰的起始點和終止點不是非常明顯的情況下。還可能存在以下這些情況，即，該指征(即，強度峰)可能實際上反映出了多于ー種樣本成分的存在，并且，同樣地，將那些強度峰作為整體進行的任何分析可能都是明顯不準確的。同樣地，在使用基于文件的數(shù)據(jù)處理方法時，可能很難針對單獨樣本進行分析的各種假設和估計可能導致對多個樣本中存在的代謝物(或多種代謝物)數(shù)量的指示不準確。在這ー點上，在這樣的早期階段被引入代謝物組學分析中的這種定量不準確性可能導致在后續(xù)步驟或分析中更大的不準確性。因此，目前對用于解決以上所列出的與常規(guī)代謝物組學數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)相關聯(lián)的技術問題的改進的設備和方法存在需求。更具體而言，對能夠在所述樣本中分析光譜測量數(shù)據(jù)的設備和方法存在需求，其可選地，但不是必須的是，針對每ー個樣本生成単獨的數(shù)據(jù)文件。還對能夠允許使用者主觀評估多個樣本中的光譜測量數(shù)據(jù)從而識別出選定代謝物的設備和方法存在需求，以便使得使用者能夠驗證或另外測定該識別該選定代謝物時的置信度，使得使用者能夠例如為了分類、分組和/或校正的目的，檢驗與所選定代謝物的識別相關聯(lián)的數(shù)據(jù)，以及使得使用者能夠例如為了質(zhì)量控制和一致性驗證的目的，確定與已識別的選定代謝物相關的其他信息。還對能夠根據(jù)所獲得的光譜測量數(shù)據(jù)，跨越樣本更精確地識別和量化樣本成分的改進的設備和方法存在需求。

發(fā)明內(nèi)容
通過本公開內(nèi)容的方面滿足了以上的和其它的需求，在一方面，本公開內(nèi)容提供了分析從成分分離和質(zhì)譜儀(mass spectrometer)系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)的第一方法。這樣的方法包括確定在多個ニ維數(shù)據(jù)組的每ー個中的選定強度峰，其中，該ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個是根據(jù)各自的三維數(shù)據(jù)組確定的，該三維數(shù)據(jù)組包括針對多個樣本中的每ー個樣本，從成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)所獲得的數(shù)據(jù)。然后，針對ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー組，使用多種積分步驟中的ー種，確定與選定強度峰相關聯(lián)的面積。然后，確定與兩維數(shù)據(jù)組的選定強度峰相關的第一樣品成分的身份，其中，與該第一樣本成分相關聯(lián)的每ー個選定強度峰的面積還對應于在各樣本中該第一樣本成分的相對量。然后，跨越多個ニ維數(shù)據(jù)組比較該選定強度峰，以 確定是否將在這些積分步驟中預先確定的ー種積分步驟用于確定與該ニ維數(shù)據(jù)組中選定強度峰的第一部分的第一樣本成分相關聯(lián)的面積，其中，該ニ維數(shù)據(jù)組的選定強度峰的第一部分表示除該第一樣本成分以外與其相關聯(lián)的第二樣本成分。用于確定與該第一樣本成分相關聯(lián)的第一部分的每ー個選定強度峰的面積的這些積分步驟中的預定積分步驟還包括第一樣本成分掩蔽積分步驟(mask integration procedure)。如果將積分步驟中預定的這ー種用于確定與選定強度峰的第一部分中的第一樣本成分相關聯(lián)的面積，則，使用第二樣本成分掩蔽積分步驟，針對該ニ維數(shù)據(jù)組中選定強度峰的第一部分，確定每ー個選定強度峰的面積，其對應于第二樣本成分的相對量。然后，將該第一和第二樣本成分掩蔽積分步驟應用于該ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分中的選定強度峰，以便相對于經(jīng)確定為在樣本中對應于該ニ維數(shù)據(jù)組的第一部分的第一和第二樣本成分的相對量，調(diào)整經(jīng)確定為在樣本中對應于該ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的第一和第二樣本成分的相對量，其中該ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分先前已獲得由積分步驟中除第一樣本成分掩蔽積分步驟以外的ー種積分步驟確定的其選定強度峰的面積。本公開內(nèi)容的另ー個方面提供了第一設備，以用于分析從成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)，所述設備包括處理器和內(nèi)存，該內(nèi)存存儲可執(zhí)行指令，該可執(zhí)行指令響應于處理器的執(zhí)行，使該設備至少執(zhí)行本公開內(nèi)容的第一方法方面的步驟。本公開內(nèi)容的進ー步的方面提供了具有存儲在其中的計算機可讀程序代碼部分的第一計算機可讀存儲介質(zhì)，該計算機可讀程序代碼部分響應于處理器的執(zhí)行，使設備至少執(zhí)行本公開內(nèi)容的第一方法方面的步驟。本公開內(nèi)容的又另ー個方面提供了分析從成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)的第二方法。這樣的方法包括確定在包括從成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)在內(nèi)的多個ニ維數(shù)據(jù)組的每ー個中的選定離子峰，其中，該ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個是針對多個樣本中每ー個從各自的三維數(shù)據(jù)組確定的，這些三維數(shù)據(jù)組包括從成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)。使用多種積分步驟中的ー種，針對ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個確定與該選定離子峰相關聯(lián)的面積。然后確定與ニ維數(shù)據(jù)組的選定離子峰相關聯(lián)的樣本成分，其中，與每ー個選定離子峰相關聯(lián)的面積進ー步對應于各自樣本中的樣本成分的相對量。在該多個ニ維數(shù)據(jù)組中比較選定離子峰，以確定積分步驟中的ー種，其用于確定針對ニ維數(shù)據(jù)組的第一部分的選定離子峰的面積，其中，積分步驟中所確定的那個包括模板積分步驟(templateintegration procedure)。該模板積分步驟被應用于所述ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分中的選定離子峰，以便相對于經(jīng)確定為在樣本中對應于該ニ維數(shù)據(jù)組的第一部分的樣本成分的相對量，調(diào)整經(jīng)確定為在樣本中對應于該ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的樣本成分的相對量，其中，該ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分先前已獲得由積分步驟中除模板積分步驟以外的一種步驟確定的其選定離子峰的面積。本公開內(nèi)容的另ー個方面提供了第二設備，用于分析從成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)，所述設備包括處理器和內(nèi)存，該內(nèi)存存儲可執(zhí)行指令，該可執(zhí)行指令響應于處理器的執(zhí)行，使該設備至少執(zhí)行本公開內(nèi)容的第二方法方面的步驟。本公開內(nèi)容進ー步的方面提供了具有在其中存儲計算機可讀程序代碼部分的第ニ計算機可讀存儲介質(zhì)，該計算機可讀程序代碼部分響應于處理器的執(zhí)行，使該設備至少執(zhí)行本公開內(nèi)容的第二方法方面的步驟。因此，依據(jù)本公開內(nèi)容的方面用于分析從成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)的設備和方法提供了這些以及其它優(yōu)點，正如在此進ー步詳細介紹的。重要的是，這些優(yōu)點包括跨越樣本種群橫越“四維”的緊湊格式，由此提供了提高的分析結果質(zhì)量和一致性。這些優(yōu)點還包括識別其他的樣本成分的能力，以及，改進的確定由所述強度峰指示的這些樣本成分中的ー個或更多個成分的相對量的能力。


因此已經(jīng)概括地描述了本公開內(nèi)容，現(xiàn)在將對附圖進行參考，這些附圖沒有必要按比例描繪，且其中圖I說明了依據(jù)本公開內(nèi)容的ー個方面的系統(tǒng)，其包括具有數(shù)據(jù)庫、處理裝置和用戶接ロ的內(nèi)存裝置，該內(nèi)存裝置與光譜測定裝置通信；圖2是對與一個示范性樣本相關聯(lián)的光譜測定數(shù)據(jù)的三維圖形的說明；圖3是對ー個示范性樣本的ニ維圖形的說明，該ニ維圖形可依據(jù)本公開內(nèi)容的一些方面確定，并可跨越多個樣本與另ー個示范性樣本的類似的ニ維繪圖進行比較；圖4是對可由本公開內(nèi)容的ー些方面生成的圖形的說明，其示出了對所選定的強度峰的比較；圖5是對可由本公開內(nèi)容的ー些方面生成的另ー個圖形的說明，其示出了在多個樣本中對所選定的強度峰的比較，其還可指示在與其相關聯(lián)的ニ維數(shù)據(jù)組之間所選定強度峰的校準(alignment)；圖6a至圖6c說明了針對由本公開內(nèi)容的ー些方面生成的不同的ニ維數(shù)據(jù)組的選定強度峰的不同圖形，還指示出可能需要不同的積分步驟以確定其面積的條件；圖7是對本公開內(nèi)容的一個示范性方面的設備、方法和計算機程序產(chǎn)品的操作流程的說明；圖8說明了由本公開內(nèi)容的ー些方面生成的代表不同樣本的不同ニ維數(shù)據(jù)組的選定強度峰的各種圖形，其指示出除對代表現(xiàn)有強度峰的后續(xù)重新積分外的強度峰的初始 積分，指不了除該第一樣本成分外來自于肩峰或第二峰的第二樣本成分的存在和相對量；以及
圖9是對本公開內(nèi)容的另ー個示范性方面的設備、方法，和計算機程序產(chǎn)品的操作流程的說明。
具體實施例方式現(xiàn)在下文中將參考附圖更完整地描述本公開內(nèi)容，在這些附圖中示出了本公開內(nèi)容的ー些方面，但不是所有的方面。確實，本公開內(nèi)容可以許多不同的形式被實施，不應被解釋成限制在此處所闡述的方面；而是，提供這些方面，使得本公開內(nèi)容將滿足可應用的合理要求。貫穿附圖，相同的數(shù)字指示相同的元件。在此更加詳細地描述了以上所提及的本公開內(nèi)容的不同部分，以及本公開內(nèi)容的許多其它方面。在某些情況下，示范性地公開了結合適當?shù)姆治鲅b置的與本公開內(nèi)容的方面相關聯(lián)的所述設備和方法，在某些情況下，分析裝置包括分離器部分(即，色譜儀(chromatograph))和/或檢測器部分(即，光譜儀)。但是，本領域技術人員將意識到，這樣的公開內(nèi)容只是為了示范性的目的，以說明對本公開內(nèi)容不同方面的實現(xiàn)。尤其地，與本公開內(nèi)容的方面相關聯(lián)的所述設備和方法可適用于，被用于跨越在本質(zhì)上無論生物的、化學的還是生化的多個樣本的生成復雜數(shù)據(jù)組的任意數(shù)目的處理。例如，本公開內(nèi)容的方面可與各種不同的分析裝置和處理一起使用，包括但不限于分析裝置，其包括分離器部分(或“成分分離器”部分)，其包括液相色譜(LC)和氣相色譜(GC)之一；協(xié)同檢測器部分(或“質(zhì)譜儀”部分)，其包括核磁共振成像(NMR)裝置、質(zhì)譜儀(MS)和電化學陣列(EC)中的一種；和/或其組合。在這一點上，本領域技術人員將理解，如在此所公開的本公開內(nèi)容的方面并不限于代謝物組學分析。例如，如在此所公開的本公開內(nèi)容的方面可在需要對樣本或復雜混合物內(nèi)的存在小分子進行表征或分析的其它應用中來實施，不考慮樣本或復雜混合物的起源。例如，如在此所描述的本公開內(nèi)容的方面還可在生物過程優(yōu)化步驟中來實施，在這種情況下，目標是使細胞生長，以生產(chǎn)藥物或添加物，或者，在藥物代謝物概況分析步驟中來實施，在這種情況下，目標是識別出作為所施用的外源物生物轉化結果的所有代謝物。正如本領域技術人員將意識到的，這些示范性應用可能與代謝物組學分析完全不同，在代謝物組學分析的情況中目標僅是檢查內(nèi)源代謝物。其它應用的一些其它非限制性示例可包 括關于消費品制造的質(zhì)量保證程序，在這種情況中，目標可能是有目的地保證，在大量樣本成分可引起特殊屬性(諸如，味道或口味(例如，奶酪、果酒或啤酒)，或者香氣/氣味(例如，香水))的步驟中，所期望的產(chǎn)品特性需滿足。因此，如在此所公開的本公開內(nèi)容的方面所展示的ー個共同的主題是，可使用在此所公開的各種設備和方法方面來分析在樣本中的小分子。圖I說明了依據(jù)本公開內(nèi)容的ー個方面的系統(tǒng)的示例，其中，該系統(tǒng)與分析裝置110 (諸如，組合的色譜儀(成分分離器)/質(zhì)譜儀)通信。但是，本領域技術人員應理解，在此呈現(xiàn)的分析裝置110的配置僅用于示范性的目的，而非意圖對根據(jù)在此所公開的原理也同樣可應用的適用且適當?shù)姆治鲅b置的范圍構成限制。如圖所示，樣本100(無論本質(zhì)上是生物的、化學的，還是生化的)可被引入該分析裝置110的分離器部分，并使用本領域技術人員應理解的例如通過檢測器部分所應用的適當?shù)募夹g進行分析。例如，特定樣本100的成分可以不同的速度通過與分離器部分相關聯(lián)的柱，并經(jīng)由檢測器部分根據(jù)樣本特定的特性而展示出不同的光譜響應。正如本領域技術人員應理解的，該分析裝置110可生成與每ー個樣本100相對應的三維光譜數(shù)據(jù)組，其中，在該三維數(shù)據(jù)組中所包括的數(shù)據(jù)通常指示了樣本100的組成。但是，首先必須對這樣的數(shù)據(jù)進行適當?shù)胤治?，以便確定該樣本的組成。在圖2中大體上示出了這樣的三維光譜數(shù)據(jù)組的示例，并且可將其描繪在包括響應強度220、樣本成分質(zhì)量要素210，以及時間要素230(在本示例中尤其是指保留時間，或，特定成分在分析裝置110中分離器部分的柱中花費的時間)三個軸的三軸曲線圖上。涉及樣本成分質(zhì)量軸210的數(shù)據(jù)點位置可表示例如樣本100內(nèi)個體成分分子的數(shù)目，以及該樣本成分的相對質(zhì)量值。依據(jù)本公開內(nèi)容的其它方面，其它分析裝置可被用于生成與該樣本100相對應的三維分析數(shù)據(jù)組。例如，該分析裝置可包括，但不限于下述部分的各種組合分離部分，其包括液相色譜(LC)(正或負通道)以及氣相色譜(GC)中的ー種；以及協(xié)同檢測器部分，其包括核磁共振成像(NMR)裝置、質(zhì)譜儀(MS)和電化陣列(EC)中的ー種。本領域技術人員應理解，這樣的復雜三維數(shù)據(jù)組可通過其它適當?shù)姆治鲅b置生成，所述分析裝置可與本公開內(nèi)容的方面的成分通信，如在下面進ー步詳細描述的。從孔板120和/或從其它類型的樣本容器中可分別取出多個樣本100，并將其分別引入分析裝置110中，用于分析和生成相應的三維數(shù)據(jù)組(見例如圖2)。例如，個別樣本100可經(jīng)由滴管、注射器、由測試陣列定義的微流體通路，和/或在實驗室環(huán)境中用于轉移樣本的其它系統(tǒng)，從孔板120被轉移到分析裝置110中。正如在此所公開的，這些樣本的性質(zhì)可能在很大程度上有所不同，通常包括混合物或包括小分子的復雜混合物，其中，這樣的示例可示范性地包括，但不限干血樣、尿樣、細胞培養(yǎng)物、唾液樣本、植物組織和器官(例如，葉、根、莖、花等)、植物提取物、培養(yǎng)基、膜、細胞區(qū)室/細胞器、腦脊髓液(CSF)、乳汁、蘇打產(chǎn)品、食用產(chǎn)品(例如，酸奶、巧克力、果汁)，和/或其它類型的生物、化學和/或生化樣本，其中可存在感興趣的代謝物和/或化學/分子成分。
如圖I所示，本公開內(nèi)容的方面可包括數(shù)據(jù)庫(例如，相關數(shù)據(jù)庫)，其在內(nèi)存或內(nèi)存裝置140 (即，在那里存儲了具有計算機可讀程序代碼部分的計算機可讀存儲介質(zhì))中至少部分地被存儲成例如可執(zhí)行指令，其中，該內(nèi)存裝置140與處理器裝置130(例如，計算機裝置)通信，該處理器裝置130用于選擇性地執(zhí)行在該內(nèi)存裝置140中的指令/計算機可讀程序代碼部分，以使設備執(zhí)行特定的方法步驟和/或功能。在某些情況下，內(nèi)存裝置140和/或處理器裝置130可被配置成與分析裝置110通信，以便從那里自動地接收與多個樣本100中的每ー個相對應的三維數(shù)據(jù)組。該處理器裝置130可經(jīng)由導線(RS-232，和/或其它類型的導線連接)和/或無線(諸如，RF、IR或其它無線通信)技術與分析裝置110通信，使得與內(nèi)存裝置140/處理器裝置130相關聯(lián)(并且/或者與其通信的)的數(shù)據(jù)庫可從分析裝置110接收數(shù)據(jù)組，以便由此被存儲起來。而且，分析裝置110可經(jīng)由有線和/或無線計算機網(wǎng)絡與一個或更多個處理器裝置130 (以及相關聯(lián)的用戶接ロ 150)通信，該有線和/或無線計算機網(wǎng)絡包括，但不限于互聯(lián)網(wǎng)、局域網(wǎng)(LAN)、廣域網(wǎng)(WAN)，或者本領域技術人員了解的其它網(wǎng)絡類型和/或技木。該數(shù)據(jù)庫可使用可商用的軟件來構建，這樣的可商用軟件例如0racle、Sybase、DB2或其它數(shù)據(jù)庫軟件。如圖I所示，處理器裝置130可與內(nèi)存裝置140 (諸如硬盤、內(nèi)存芯片、閃存、RAM模塊、ROM模塊和/或其它內(nèi)存裝置140)通信，用于存儲/管理包括從分析裝置110自動接收的三維數(shù)據(jù)組的數(shù)據(jù)庫。此外，內(nèi)存裝置140還可用于存儲數(shù)據(jù)庫中其它的接收數(shù)據(jù)和/或由處理器裝置130另外操作的數(shù)據(jù)。在某些方面，處理器裝置130能夠?qū)⑼ㄟ^內(nèi)存裝置140接收的三維數(shù)據(jù)組中(見圖2)中的每ー個轉換成至少ー個對應的ニ維數(shù)據(jù)組(見圖3)，其中，該至少一個ニ維數(shù)據(jù)組包括，例如，特定樣本100在沿三個軸中的ー個軸(諸如樣本成分質(zhì)量軸210)上的特定點235處的ニ維成分“曲線”(其中，該得到的曲線圖解了從零點測量的作為時間函數(shù)而檢測的特定樣本成分質(zhì)量，該零點對應于樣本100被注入和/或以其他方式被引入該分析裝置110的時間)。例如，處理器裝置130可被配置成，針對特定樣本成分質(zhì)量點235，產(chǎn)生樣本成分(保留)時間對該樣本的強度曲線的比較(例如見圖3)。在某些情況下，圖2中的“X”軸(或時間軸230，例如)可被進ー步表征為保留指數(shù)和/或保留時間。因此，處理器裝置130還能夠,針對多個樣本中的每ー個,將三維數(shù)據(jù)組中的每ー個分解成與特定樣本成分質(zhì)量點(例如,要素235)相對應的一個或更多個單獨的ニ維曲線，從而將(例如，圖2中的)每ー個三維 數(shù)據(jù)組轉換成至少ー個相應的所選定樣本成分的ニ維數(shù)據(jù)組(其具有例如圖3中所示的曲線)，其可進ー步被描繪成相應的樣本成分質(zhì)量的強度響應220對樣本成分時間230。依據(jù)ー些方面，處理器裝置130可被配置成選擇性地執(zhí)行由內(nèi)存裝置140存儲的可執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以便根據(jù)描述選定樣本成分的ニ維數(shù)據(jù)組，完成對該多個樣本的每ー個中所選定樣本成分(即，代謝產(chǎn)物、分子或離子)的識別和量化。在進行此操作吋，首先通過選擇強度峰(見例如圖3中的要素225)確定要進行分析的樣本成分，該強度峰通常以足夠的質(zhì)量存在于多個代謝物組學數(shù)據(jù)的ニ維數(shù)據(jù)組的每ー個中(見例如圖5中的要素225，圖7中的步驟700)。正如前面所公開的，這樣的ニ維數(shù)據(jù)組通常是通過針對該三維數(shù)據(jù)組的維度/軸之ー來選擇或另外設計特定的值(即，保留時間或樣本成分質(zhì)量)，從而從多個樣本中每ー個的各自的代謝物組學數(shù)據(jù)的三維數(shù)據(jù)組而確定的(例如，圖7中的步驟700)。但是，本領域技術人員應意識到，在某些情況下，如果需要或期望，待分析的樣本成分可從三維數(shù)據(jù)組中選出，并且，對待分析樣本成分的這種選擇可進一歩根據(jù)對與其相對應的ニ維數(shù)據(jù)組的分析而進行改進。在某些情況下，例如通過分析三維數(shù)據(jù)組的圖形表達(即，經(jīng)由用戶接ロ 150)可促進對待分析樣本成分的選擇，并且，這種選擇可包括例如評估在各自的ニ維和/或三維數(shù)據(jù)組中樣本成分的表觀強度響應，以確定所選定的強度峰225。在某些情況下，處理器裝置130可被配置成執(zhí)行由內(nèi)存裝置140存儲的計算機可讀程序代碼部分，用于分析在多個樣本中的兩個或更多個樣本的ニ維和/或三維數(shù)據(jù)組，以便經(jīng)由與待被進ー步分析的適宜樣本成分相關聯(lián)的強度峰225(另外在此被稱為“選定強度峰”、“離子峰”，或“選定離子峰”)來確定該樣本成分，無論該樣本成分先前是否已經(jīng)被識別(即，作為特定分子、離子或代謝物)。也就是說，為了選擇用于分析的適宜樣本成分，處理器裝置130可被配置成例如通過樣本成分質(zhì)量和/或通過選定的時間，在所述多個樣本對強度/離子峰數(shù)據(jù)進行分類和/或分組。以這種方式，為了在確定所選定的強度峰225時減少變異和提供統(tǒng)計學更顯著的分析，處理器裝置130還可被配置成例如檢驗下述強度峰數(shù)據(jù)，該強度峰數(shù)據(jù)根據(jù)背景噪聲或其它不期望的數(shù)據(jù)矯作物(即，可適用的質(zhì)量)是可足以辨別的。一方面，為了確定所選定的強度峰，處理器裝置130可被配置成首先識別出在ニ維數(shù)據(jù)組的每一個中的多個候選強度峰，并且跨越該多個ニ維數(shù)據(jù)組對這些候選強度峰進行比較，其中，具有最低標準偏差的候選強度峰(即，在所有多個樣本中的最佳數(shù)據(jù)質(zhì)量)被選定為選定強度/離子峰225。但是，本領域技術人員應理解可以其它方式確定選定強度峰。例如，在跨越多個ニ維數(shù)據(jù)組對候選強度峰進行比較時，在該多個ニ維數(shù)據(jù)組中明顯且對應于化合物數(shù)據(jù)庫中的公認化合物的候選強度峰之一可被選擇作為選定離子峰。更具體而言，例如，可將跨越多個ニ維數(shù)據(jù)組的候選強度峰與公認的或另外已知的化合物文庫或數(shù)據(jù)庫中所包括的質(zhì)譜進行對比(即，在文庫或數(shù)據(jù)庫匹配過程中)，如果需要，隨后主觀區(qū)分或分辨該匹配處理。在這樣的情況下，與公認或已知化合物相匹配、相對應或最為相關的候選強度峰之一可被選擇為選定強度/離子峰225，正如例如圖6和圖8所示的，并且其可有利于或另外促進在多個樣本中的一致性積分(consistent integration)或重新積分。作為分類/分組步驟的一部分，在對這些數(shù)據(jù)進一歩分析之前，該處理器裝置130可被進ー步配置成跨越多個樣本對每ー個二位數(shù)據(jù)組中明顯的選定強度峰225校準(t匕對，align)，正如例如圖5所示出的。更具體而言，在跨越多個樣本分析光譜數(shù)據(jù)時，不同化合物(包括代謝物)在分離過程中可稍微不同的速率從ー個樣本轉移到另ー個，這樣可能不是完全清楚跨越多個樣本的哪些峰(例如，對應于經(jīng)洗脫的化合物)應該被認為是彼此對應的。同樣地，處理裝置130可被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以針對在跨越多個樣本的每ー個ニ維數(shù)據(jù)組中的選定強度峰實施強度峰比對校正方法。例如，一種這樣的方法包括阻止在光譜分析中已經(jīng)由保留時間(RT)表征的已知化合物進入每一個樣本中。 該組“被阻止(spiked)”的化合物將固定的保留指數(shù)(RI)值與漂移的RT相匹配。因此，該“被阻止”的化合物提供內(nèi)標(IS)，其可用于將來自多個樣本的數(shù)據(jù)在各研究之間進行對比和/或在研究與化學品文庫之間進行對比(align)。但是，本領域技術人員應理解，許多不同的方法可用于跨越多個樣本進行選定峰強度的強度峰對比，這是在本公開內(nèi)容的精神和范圍之內(nèi)的，并且，在此在這點上所提出的示例并不意圖以任何方式構成限制。一旦已經(jīng)選定了要被分析的示例成分，并且其已被分類/分組并經(jīng)由跨越多個樣本的對應的選定強度峰進行了校準，則處理器裝置130可被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以便使用多種積分步驟中的ー種，針對跨越多個樣本的ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個，實施確定與選定強度峰相關聯(lián)的面積的步驟(見例如圖5、圖6a至圖6c，以及圖7中的步驟710)。在這樣的情況下，選定強度峰225的面積可表示例如該樣本中相應樣本成分(SP，分子、離子或代謝物)的相對量，因為每ー個ニ維數(shù)據(jù)組被配置成表示在某ー維中的樣本性質(zhì)(即，樣本成分(保留)時間)與另ー維中作為時間函數(shù)的另ー個樣本性質(zhì)(即，樣本成分質(zhì)量)的選定值處的檢測強度的比較。在這樣的情況下，該強度可表示例如具有選定的樣本成分質(zhì)量值的分子、離子或代謝物的量，其作為(保留)時間的函數(shù)，從時間零點開始被檢測。在確定與每ー個ニ維數(shù)據(jù)組中的選定強度峰相關聯(lián)的面積時，首先必須確定該強度峰的邊界。在進行此操作吋，處理器裝置130可被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以確定沿ニ維數(shù)據(jù)組的樣本性質(zhì)維度(即，樣本成分時間軸230)的強度峰起始點500以及強度峰終止點550。在這一點上，可不必明確定義出強度峰起始點500和強度峰終止點550中的每ー個。也就是說，其它樣本成分、背景噪聲或其它不需要的數(shù)據(jù)矯作物有時可能以環(huán)繞表觀強度峰起始點500或表觀強度峰終止點550的“肩峰”或其它變遷形式，破壞或影響數(shù)據(jù)組中的選定強度峰225。這樣，對強度峰起始點500和/或強度峰終止點550的確定還可包括ー些近似的或主觀的分析，例如確定斜率的特定變化或其它閾值變化，其中，可容許在一定的容限之內(nèi)發(fā)生ー些不會明顯影響數(shù)據(jù)質(zhì)量(即，從統(tǒng)計學角度看)的變化。對于每一個ニ維數(shù)據(jù)組中的選定強度峰225，一旦確定出強度峰起始點500和強度峰終止點550，則肯定也確定了強度峰起始點500和強度峰終止點550中的每ー個相對于強度維度220中的基線強度575的關系。也就是說，為了確定與選定強度峰225相關聯(lián)的面積的目的，必須跨越多個樣本的ニ維數(shù)據(jù)組確定選定強度峰225的下邊界。因此，處理器裝置130還可被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以遍及多個樣本的ニ維數(shù)據(jù)組來確定選定強度峰225的適當?shù)幕€強度575。在某些情況下，這樣的基線強度575應該在與所收集的數(shù)據(jù)相關聯(lián)的任何背景噪聲之上定義或另外表征選定強度峰225的相對強度起始點。在確定適當?shù)幕€強度575吋，則可將處理器裝置130配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以確定強度峰起始點500和強度峰終止點550中的每ー個相對于強度維度220中的基線強度575的關系。在實施該操作時，處理器裝置130被配置成確定強度峰起始點500和強度峰終止點550中的每ー個是否對應于強度峰維度220中的基線強度575 (即，確定在樣本成分質(zhì)量維度210中，強度峰起始點500或強度峰終止點550是否具有對應于強度維度220中的已確定的基線強 度575的表觀強度)。如果是這樣，強度峰起始點500和/或強度峰終止點550可被指示為與基線強度575 “基線(base)”相關。處理器裝置130可進ー步被配置成確定強度峰起始點500和強度峰終止點550中的每ー個是否與強度維度220中的基線強度575間隔開(即，在樣本成分時間維度230中的強度峰起始點500或強度峰終止點550是否具有大于或小于在強度維度220中已確定的基線強度575的表觀強度)。如果是這樣，強度峰起始點500和/或強度峰終止點550可被指示為相對于基線強度575 “下降(drop)”相關。在“下降”相關的這種情況下，處理器裝置130可進ー步被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以使“下降”邊緣(見例如圖5和圖6b中的元素500，圖6c中的元素610)從該“下降”相關的強度峰起始點和/或該“下降”相關的強度峰終止點延伸到基線強度。在實施該操作吋，由此定義出了跨越多個樣本的每ー個ニ維數(shù)據(jù)組中的選定強度峰225的表觀相關面積。在某些情況下，依據(jù)強度峰起始點500和強度峰終止點550的性質(zhì)，即依據(jù)其中每ー個所體現(xiàn)的相關性，可指明選定強度峰225的所定義的面積。也就是說，每ー個選定強度峰可被指示為“基線-基線”相關(見例如圖6a)、“基線-下降”相關(見例如圖6c)、“下降-基線”相關(見例如圖6b)，或“下降-下降”相關。一旦定義出選定強度峰225的面積，處理器裝置130還可被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以便通過相對于選定強度峰225與強度維度中的基線強度575的關系(包括由“下降”邊界600或610所示的任意邊界)，積分樣本性質(zhì)維度中的強度峰起始點500和強度峰終止點550之間的選定強度峰225來量化該面積。因此，與選定強度峰225相關聯(lián)的確定的面積代表并對應于在各樣本中樣本成分的相對量,例如,就百分比標準偏差而目(％RSD)。以在此所公開的方式對跨越多個樣本的ニ維數(shù)據(jù)組的每一個中的選定強度峰225進行分析的過程中，處理器裝置130可進ー步被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，從而識別出與選定且經(jīng)分析的強度峰225相關聯(lián)的特定化合物(即，代謝物)或樣本成分(見例如圖7的步驟720)。該特定化合物/樣本成分可以是“已知已命名”的和/或“已知但未命名”的化學品/化合物。也就是說，例如，所識別出的特定化合物/樣本成分可對應于已有化學名稱的代謝物，或?qū)谙惹耙呀?jīng)被鑒定，但尚未分派化學名稱和/或類別的“已知但未命名”的代謝物。本領域技術人員應理解，這樣的化合物識別程序可以許多相對于選定強度峰225和/或在某些情況下在多個分析樣本中的對應的ニ維或三維數(shù)據(jù)組而言不同的方式完成。例如，在美國專利第7，433, 787號(System, Method, andComputer Program Product Using a Database in a Computing System to Compile andCompare Metabolomic Data Obtained From a Plurality of Samples)和第 7，561，945號(System, Method, and Computer Program Product for Analyzing Spectrometry Datato identify and Quantify Individual Components in a Sample),以及美國專利申請公開 US 2009-0093971 Al 號(System and Method for Analyzing Metabolomic Data)中公開了ー些化合物識別程序，所有上述轉讓于梅塔博隆有限公司(Metabolon，Inc.)，其也是本申請的受讓人。在此類化合物識別程序與本文公開內(nèi)容相關性方面來說，由美國專利第7，433，787號和第7，561，975號，以及美國專利申請公開US 2009/0093971 Al號所公開的此類化合物識別程序作為參考并入本文，并且在此為了簡潔的原因不進行另外的詳細討論如前面所公開的，在完成與跨越多個樣本的每ー個ニ維數(shù)據(jù)組中的選定強度峰225 (對應于已識別的樣本成分)相關聯(lián)的面積的確定之后，則每ー個被量化的面積可通過由處理器裝置130執(zhí)行、用于確定該面積的特定積分步驟進行表征。也就是說，在某些情況下，也可以依據(jù)強度峰起始點500和強度峰終止點550中的每ー個與基線強度575的關系，標明用于確定選定強度峰的面積所執(zhí)行的特定積分步驟。即，各種積分步驟可被命名為“基線-基線”積分(見例如圖6a)、“基線-下降”積分(見例如圖6c)、“下降-基線”積分(見例如圖6b)，或者“下降-下降”積分。但是，本領域技術人員應理解，依據(jù)由處理器裝置130所使用的特定積分步驟，通過各種不同積分步驟確定的選定強度峰225的面積可能改變。也就是說，在某些情況下，由“下降-下降”積分步驟確定的強度峰面積可能與由“基線-基線”積分步驟所確定的強度峰面積明顯不同(即，以統(tǒng)計學方式)，因為后者還可能包括在強度峰起始點500和強度峰終止點550周圍的峰“尾”部分的作用因素。由于針對跨越多個樣本的每ー個ニ維數(shù)據(jù)組的選定強度峰225的面積有時可以累積(或至少半累積)方式用于后續(xù)處理(即，確定對應于跨越多個樣本的選定強度峰225的樣本成分的“平均”相對量)中，在某些情況下，在特定積分步驟中這樣的變化，相對于在跨越多個樣本進行分析時由選定強度峰225表示的特定樣本成分的已確定的相對量，可變成統(tǒng)計學上顯著的。依據(jù)本申請進一歩的方面，處理器裝置130因此可被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以便根據(jù)已確定的強度峰起始點500與基線強度575的關系以及已確定的強度峰終止點550與基線強度575的關系的組合，確定多種積分步驟中的ー種，其用于確定與跨越多個樣本的ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個的選定強度峰225相關聯(lián)的面積。也就是說，該處理器裝置130還可被配置成，確定用于最初確定每一個強度峰的面積所應用的積分步驟是“基線-基線”積分、“基線-下降”積分、“下降-基線”積分，還是“下降-下降”積分。然后，可依據(jù)由處理器裝置130最初執(zhí)行的特定積分步驟，將已確定的選定強度峰的面積跨越ニ維數(shù)據(jù)組進行比較并分組。在實施該操作時，處理器裝置130還可被配置成，確定用于計算ニ維數(shù)據(jù)組的第一部分的選定強度峰225的面積的特定積分步驟(見例如圖7的步驟730)。在某些情況下，該第一部分可表示跨越多個樣本的大多數(shù)ニ維數(shù)據(jù)組。但是，在使用了多于兩種不同的積分步驟的情況下，第一部分可代表相比任意其它積分步驟更多情況下所執(zhí)行的特定積分步驟。在任何情況下，通過處理器裝置130確定的這些積分步驟中特定的積分步驟可被指定為跨越多個樣本的ニ維數(shù)據(jù)組中的選定強度峰的模板積分步驟。也就是說，處理裝置130還可被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以確定和指定模板積分步驟，并將該模板積分步驟應用于ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的選定強度峰，其中，該ニ維數(shù)據(jù)組中的第二部分先前具有通過積分步驟中除模板積分步驟以外的一種步驟確定的選定強度峰的面積(見例如圖7中的步驟740)。有效地，處理器裝置130可被配置成，針對每ー個ニ維數(shù)據(jù)組，重新計算選定強度峰225的面積，在這種情況下，選定強度峰225的面積最初是通過除模板積分步驟(即，最為普遍地應用的積分步驟)以外的積分步驟確定的。但是，本領域技術人員應理解，模板積分步驟可不必用于針對一些ニ維數(shù)據(jù)組來重新計算選定強度峰面積。例如，在某些情況下，將模板積分步驟應用于選定強度峰225(其具有最初確定的面積，該面積并非之前通過該積分步驟確定)的嘗試可能由于例如背景噪聲或其它不期望的數(shù)據(jù)矯作物(其使得在該特定兩維數(shù)據(jù)組中的選定強度峰225的強度峰起始點500或強度峰終止點550是不確定的)而成為不可能。因此，在某些情況下，應用模板積分步驟來重新計算某些選定強度峰的面積可經(jīng)歷由處理器裝置130執(zhí)行的適用性程序。但是，如果確實出現(xiàn)了這樣的情況，該模板積分步驟相應的不適用性在跨越多個樣本的任意后續(xù)累積或至少部分累積的分析中可能在統(tǒng)計學上受到關注。 在任意情況下，對先前未由模板積分步驟確定的選定強度峰面積的重新計算例如可用于，相對于經(jīng)確定為在樣本中對應于ニ維數(shù)據(jù)組的第一部分的樣本成分的相對量，調(diào)整被確定為在這些樣本中的特定樣本成分的相對量，其作為ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分中相應的選定強度峰的面積。以這種方式，處理器裝置130可被配置成，對跨越多個樣本的每ー個ニ維數(shù)據(jù)組的選定強度峰的面積應用更一致的確定，以便獲得提高的分析結果(即，跨越多個樣本的樣本成分的相對量)品質(zhì)和一致性，其在統(tǒng)計學上或另外在對數(shù)據(jù)的后續(xù)分析中可能是顯著的。在其它方面，處理器裝置130還可被配置成與內(nèi)存裝置140協(xié)同工作，以執(zhí)行用于進ー步分析跨越多個樣本的選定強度峰和/或?qū)磨司S和三維數(shù)據(jù)組的指令/計算機可讀程序代碼部分，從而確定跨越多個樣本的趨勢(trend)或其它關系。例如，在一些樣本100的情況中，圖3中所示出的曲線可對應于具有充分確定性的已知代謝物和/或已知但未命名的代謝物(其可顯示為如圖4示出的選定時間幀260、270中的數(shù)據(jù)點，其中，該數(shù)據(jù)點可表示例如在對應的ニ維數(shù)據(jù)組中的選定強度峰)。但是，由于樣本的變化、在樣本100內(nèi)的潛在污染物和/或本領域技術人員應理解的其它實驗因素，通過對ー些樣本100進行分析所生成的一些三維數(shù)據(jù)組，針對特定樣本成分質(zhì)量，可能導致相應的ニ維時間對響應強度曲線可能與具有此類充分確定性的已鑒定化合物不匹配，或者其相對于跨越多個樣本的選定強度峰未校準(align)。因此，本公開內(nèi)容的方面可進ー步包括用戶接ロ 150，其與所述處理器裝置130/內(nèi)存裝置140通信，用于顯示在時間軸240上跨越多個樣本100進行比較的視覺指示160(同樣見例如圖4)，該時間軸240指示出了時間265，在該時間點上，特定樣本成分質(zhì)量的選定強度峰由通過分析裝置110檢測的數(shù)據(jù)來確定。用戶接ロ 150能夠向用戶顯示例如樣本數(shù)250 (指示樣本100的身份)對時間240的顯示信息160，正如在圖4中大體上所示出的。更特定地，在某些方面，與數(shù)據(jù)庫/處理器裝置130通信的用戶接ロ 150可被配置成，顯示對跨越多個樣本的每ー個ニ維數(shù)據(jù)組的選定強度峰225數(shù)據(jù)進行比較的視覺指示信息160，用于以簡潔圖形格式促進跨越樣本的分析(S卩，促進強度峰比對)，該格式跨越樣本種群橫跨“第四維”。用戶接ロ 150可包括例如顯示裝置、個人計算機，和/或具有用于數(shù)據(jù)的圖形表達的顯示器的其它電子裝置。依據(jù)本公開內(nèi)容的另ー個方面，可存這樣的情況，其中，選定強度峰可表示或另外包括多于ー個的樣本成分。在這樣的情況下，可實現(xiàn)對特定感興趣樣本成分以及第二成分或其它已識別成分的量化準確度，如在此進ー步公開的。更尤其地，正如先前所公開的，一旦在多個樣本中要被分析的選定強度峰已被識別(見例如圖9中步驟900)、被分類/分組，并進行校準，處理器裝置130可被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以便針對多個樣本中相應的ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個，使用多種積分步驟中的ー種，執(zhí)行用于確定與每一個選定強度峰相關聯(lián)的面積的程序(見圖9中的步驟9)。因此，在選定強度峰代表單ー樣本成分的前提下，確定出多個樣本中每ー個選定強度峰的面積。在這樣的情況下，因為每ー個ニ維數(shù)據(jù)組被配置成指示一個維度中選定樣本成分質(zhì)量的檢測強度與另ー維度中樣本成分時間的關系(因此已選定樣本成分質(zhì)量的強度被指示為時間的函數(shù))，選定強度峰225的面積可表示例如該單ー樣本成分在該樣本中的相對量。也就是說，正如先前所討論的，該強度可代表例如具有該樣本成分質(zhì)量選定值的分子、離子或代謝物的量，其從時間零點開始，作為(保留)時間的函數(shù)進行檢測。
在確定每一個ニ維數(shù)據(jù)組中與選定強度峰相關聯(lián)的面積時，必須首先確定該強度峰的邊界。在實施該操作吋，處理裝置130可被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以沿該ニ維數(shù)據(jù)組的樣本性質(zhì)維度(即，樣本成分時間軸230)確定強度峰起始點500和強度峰終止點550。在這一點上，可不必明確定義強度峰起始點500和強度峰終止點550中的每ー個。也就是說，其它樣本成分、背景噪聲或其它不期望的數(shù)據(jù)矯作物，有時可能以“肩峰”、“次峰”或在表觀強度峰起始點500或表觀強度峰終止點550周圍的其它躍遷形式，破壞或干擾數(shù)據(jù)組中的選定強度峰225。同樣地，對強度峰起始點500和/或強度峰終止點550的確定還可包括ー些近似或主觀分析，例如，確定斜率的特定變化或其它閾值變化，其中，在一定容限內(nèi)不會明顯影響數(shù)據(jù)質(zhì)量的某些變異是容許的(即，從統(tǒng)計學觀點而言)。一旦已經(jīng)確定出每一個ニ維數(shù)據(jù)組中已選定強度峰225的強度峰起始點500和強度峰終止點550，還必須確定強度峰起始點500和強度峰終止點550中每ー個相對于強度維度220中基線強度575的關系。也就是說，為了在多個樣本的所有ニ維數(shù)據(jù)組中確定與選定強度峰225相關聯(lián)的面積，必須確定選定強度峰225的下邊界。因此，處理器裝置130還可被配置成實現(xiàn)指令/計算機可讀程序代碼部分，以針對多個樣本的所有ニ維數(shù)據(jù)組中的選定強度峰225，確定適當?shù)幕€強度575。在某些情況下，這樣的基線強度575應該定義或另外表征與所收集的數(shù)據(jù)相關聯(lián)的任意背景噪聲上的選定強度峰225的相對強度起始點。在確定出適當?shù)幕€強度575后，處理器裝置130則可被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以確定強度峰起始點500和強度峰終止點550中的每ー個相對于強度維度220中的基線強度575的關系。在實施該操作時，定義了多個樣本的每ー個ニ維數(shù)據(jù)組中的選定強度峰225的表觀相對面積。在某些情況下，可依據(jù)強度峰起始點500和強度峰終止點500的性質(zhì)，即依據(jù)由每ー個所體現(xiàn)出的相關性，來指定選定強度峰225的限定面積。也就是說，每ー個選定強度峰可被稱為“基線-基線”相夫、“基線-下降”相夫、“下降-基線”相關，或者“下降-下降”相關。一旦定義出選定強度峰225的邊界，處理器裝置130還可被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以通過下述來量化該面積相對于強度峰起始點500和強度峰終止點550到在強度維度中基線強度575 (包括由“下降”邊界600或610所示的任意邊界)的關系，積分樣本性質(zhì)維度中強度峰起始點500和強度峰終止點550之間的選定強度峰225。因此，與選定強度峰225相關聯(lián)的已確定面積表示并對應于所述樣本成分在各自樣本中的相對量，例如，按照相對標準偏差的百分比(％RSD)。在以在此所公開的方式對多個樣本的ニ維數(shù)據(jù)組的每一個中的選定強度峰225進行分析的過程中，處理器裝置130可進ー步被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以便識別出特定化合物(即，代謝物)或與已選定和已分析出強度峰225相關聯(lián)的樣本成分(見例如圖9中步驟920)。該特定化合物/樣本成分可以是“已知且命名的”和/或“已知但未命名的”化學物質(zhì)/化合物。也就是說，例如，所識別出的特定化合物/樣本成分可對應于具有化學名稱的代謝物，或?qū)谙惹耙谚b定但尚未分派化學名稱和/或類別的“已知但未命名的”代謝物。本領域技術人員應理解，這樣的化合物識別程序可以許多相對于選定強度峰225和/或在某些情況下在多個分析樣本中的對應的ニ維或三維數(shù)據(jù)組而言不同的方式完成。本領域技術人員因此應理解，到目前為止，進ー步公開的方面和先前所公開的方面在例如下述方面類似確定選定強度峰的邊界，對選定強度峰的面積進行積分 以確定由此表示的樣本成分的相對量，以及識別出特定化合物/樣本成分(例如,根據(jù)庫匹配)。正如前面所討論的，依據(jù)本申請的某些方面，為了校驗和/或調(diào)整初始分析，處理器裝置130可被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以便根據(jù)已確定的強度峰起始點500與基線強度575的關系和已確定的強度峰終止點550與基線強度575的關系的組合，確定多種積分步驟中預定的那個積分步驟是否被用于確定與多個樣本中的任意ニ維數(shù)據(jù)組的選定強度峰225相關聯(lián)的面積。也就是說，該處理器裝置130還可被配置成，確定用于最初確定每一個強度峰的面積所應用的積分步驟是“基線-基線”積分、“基線-下降”積分、“下降-基線”積分，還是“下降-下降”積分。在一方面，包括“基線-基線”積分的應用積分步驟的特征為指示獨立的選定強度峰。在其它方面，“下降-下降”積分的特征為指示選定強度峰為“中間”峰。也就是說，在這些方面，“基線-基線”和“下降-下降”積分可指示出，選定強度峰孤立地置于在背景和其它樣本成分中間。但是，在又一方面，“基線-下降”積分或“下降-基線”積分的特征為指明“肩峰”或次峰的存在，其中，“基線-下降”積分可表明該“肩峰”被布置在選定強度峰的峰尾周圍或另外在其附近，而“下降-基線”積分可表明該肩峰布置該峰的前沿周圍或另外在其附近。因此，為了確定是否可改善初始分析，確定該初始分析是否充分以代表單ー樣本成分的選定強度峰為前提是有幫助的。在實施該操作時，多種積分步驟中的預定積分步驟被選擇作為“基線-下降”和“下降-基線”積分之一(或二者)。然后可按照最初通過處理器裝置130執(zhí)行的特定積分步驟，在所有ニ維數(shù)據(jù)組中對已確定的選定強度峰的面積進行比較并分組。如果在初始分析中存在這樣的“基線-下降”和/或“下降-基線”積分，則對肩峰或次峰的推斷可進ー步表明，在所分析的樣本中存在第二樣本成分(見例如圖9中的步驟930)。但是，本領域技術人員應理解，在所有ニ維數(shù)據(jù)組中，特定的“基線-下降”和/或“下降-基線”積分可能不是始終可識別的。更具體而言，例如，強度峰起始點和強度峰終止點之一可能始終在基線處或其附近，但是強度峰起始點和強度峰終止點中的另ー個可能作為“基線”或“下降”而成為混合型的。在其他情況下，關于是“基線”或是“下降”，強度峰起始點和強度峰終止點都可表示混合或另外不同的結果。在這樣的情況下，關于針對所有ニ維數(shù)據(jù)組中的選定強度峰是否存在第二樣本成分(即，通過“標記”某些峰，以進行主觀/手動檢驗和主觀/手動積分，建立主觀或人為評估的“疑似”峰列表)，可對其進行主觀評估，而且，在此所公開的驗證可繼續(xù)，或者，在此所公開的驗證由于不必要可被終止。正如在圖8中所示，處理器裝置130可被配置成確定用于計算選定強度峰225的面積的特定積分步驟，并且，在處理器裝置130確定積分步驟中的預定積分步驟用于初始分析中的情況下，該處理器裝置130可進ー步被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以便將執(zhí)行該積分步驟的ニ維數(shù)據(jù)組指定為ニ維數(shù)據(jù)組的選定強度峰的第一部分。在實施該操作時，根據(jù)積分步驟中的預定積分步驟(基線-下降和/或下降-基線)而確定的選定強度峰的面積可被指定為表示第一樣本成分的存在和數(shù)量。也就是說，對于該第一部分的ニ維數(shù)據(jù)組，所確定的選定強度峰的面積可被指定為表示第一樣本成分，而各自選定強度峰的面積中被排除的部分可指示第二樣本成分的存在(例如，其為選定強度峰(或“主”峰)的前沿或后緣肩峰)ー見例如圖8的樣本2、3和8)。從另ー個方面看，可在所述多個ニ維數(shù)據(jù)組中對選定強度峰進行比較，以確定其與第一樣本成分相關聯(lián)的任意面積是否是通過這些積分步驟中的預定積分步驟確定的，是否指示了除主峰外的肩峰，是否對應于除第一樣本成分外的第二樣本成分，其中，所述選定強度峰因此將包括ニ維數(shù)據(jù)組的選定強 度峰的第一部分，該選定強度峰所具有的與第一樣本成分相關聯(lián)的面積是通過這些積分步驟中的預定積分步驟確定的。因此，這些ニ維數(shù)據(jù)組的選定強度峰中的第一部分可指示除第一樣本成分以外與之相關聯(lián)的第二樣本成分。在這樣的情況下，用于確定與第一樣本成分相關聯(lián)的第一部分的每ー個選定強度峰的面積的所述積分步驟中的預定積分步驟因此可包括第一樣本成分掩蔽積分步驟。而且，也可使用第二樣本成分掩蔽積分步驟，針對這些ニ維數(shù)據(jù)組的選定強度峰的第一部分，確定對應第二樣本成分的相對量的每ー個選定強度峰的面積(即，到選定強度峰的前沿或后緣肩峰)(見例如圖9中的步驟940)。也就是說，本領域技術人員應理解，按照適當?shù)姆e分步驟，也可以積分先前所忽視的位于選定強度峰下對應第二樣本成分的面積，以便提供對在各自樣本中第二樣本成分相對量的指示。如果積分步驟中的預定積分步驟不被用于確定與選定強度峰的第一部分的第一樣本成分相關聯(lián)的面積，則驗證和調(diào)整步驟將回到先前所公開方面中的ー個方面，例如，使用“多數(shù)”積分步驟，或相比任意其它積分步驟在更多情況下作為模板積分步驟執(zhí)行的特定積分步驟，然后將該模板積分步驟應用于ニ維數(shù)據(jù)組的其余部分的選定強度峰，該ニ維數(shù)據(jù)組的其余部分所具有的選定強度峰的面積是通過所述積分步驟中的不同于模板積分步驟的ー種積分步驟確定的，以便相對于經(jīng)確定為在樣本中對應于所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述已識別部分的樣本成分的相對量，調(diào)整經(jīng)確定為在樣本中對應于所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述剩余部分的樣本成分的相對量。但是，如果積分步驟中的預定積分步驟被用于確定與選定強度峰的第一部分中的第一樣本成分相關聯(lián)的面積，一旦確定出這些ニ維數(shù)據(jù)組的選定強度峰的第一部分，則處理器裝置130可進ー步被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以便將第一和第二樣本成分掩蔽積分步驟應用于這些ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的選定強度峰(見例如圖9中的步驟950)。該第二部分例如可以是ニ維數(shù)據(jù)組的其余或任意其余部分，其先前已獲得的選定強度峰面積是通過積分步驟中不同于第一樣本成分掩蔽積分步驟的ー種積分步驟確定的(見例如圖8中的樣本1、4-7和9，初始計算出的選定強度峰的面積由在強度峰起始點和強度峰終止點之間延伸的虛線表示)。這樣，將第一和第二樣本成分掩蔽積分步驟應用于這些ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的選定強度峰(即，先前使用基線-基線或下降-下降積分步驟分析的那些ニ維數(shù)據(jù)組)時，先前在初始分析中被歸于單個樣本成分的其各自面積可進行調(diào)整，以便相對于被確定存在于樣本中對應于這些ニ維數(shù)據(jù)組的第一部分的第一和第二樣本成分的相對量指不出被確定存在于樣本中對應于ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的第一和第二樣本成分的相對量。從另ー個方面看，在確定ニ維數(shù)據(jù)組的選定強度峰的第一部分后，可確定出每ー個選定強度峰的主峰、肩峰和在它們之間的峰間過渡，所述每ー個選定強度峰包括ニ維數(shù)據(jù)組的選定強度峰中的第一部分，該第一部分指示除第一樣本成分以外的第二樣本成分。 作為驗證步驟的ー個方面，通過例如與已知成分庫進行比較，可確定與ニ維數(shù)據(jù)組的選定強度峰的第一部分的肩峰相關聯(lián)的第二樣本成分的身份。在某些情況下，由于ニ維數(shù)據(jù)組的初始分析在用于確定選定強度峰的積分面積的參數(shù)方面可能有某些變化，該第一和第二樣本成分掩蔽積分步驟在第一部分中可各自體現(xiàn)出平均、中間或其它的積分參數(shù)表現(xiàn)，其中，也可將第一樣本成分掩蔽積分步驟與第二樣本成分掩蔽積分步驟比較，以便確定在樣本性質(zhì)維度中在主峰和肩峰之間的代表性峰間過渡，以及在強度維度中的代表性基線強度。此外，在將第一和第二樣本成分掩蔽積分步驟應用到ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的選定強度峰時，可相對于強度維度上的代表性基線強度，使用在樣本性質(zhì)維度上強度峰起始點和代表性峰間過渡，關于選定強度峰的第二部分執(zhí)行該第一樣本成分掩蔽積分步驟，以確定與第一樣本成分相關聯(lián)的第二部分的選定強度峰的面積。類似地，可相對于強度維度上的代表性基線強度，使用在樣本性質(zhì)維度上的代表性峰間過渡和強度峰終止點，關于選定強度峰的第二部分執(zhí)行第二樣本成分掩蔽積分步驟，以確定與該第一樣本成分相關聯(lián)的第二部分的選定強度峰的面積。本領域技術人員應理解，如圖8所示，依據(jù)本公開內(nèi)容中這樣的方面，“重新積分”或驗證步驟可提供關于在所分析的樣本中存在的第一樣本成分的量、關于初始積分以及關于第二樣本成分的顯著(統(tǒng)計學上或另外)不同的結果。在某些情況下，在必要或需要時可提供并實施進ー步程度的驗證。例如，本公開內(nèi)容的方面可提供，可自動確定和/或手動處理ニ維數(shù)據(jù)組中的任意或全部選定數(shù)據(jù)峰。更具體而言，例如，關于在主峰和肩峰之間的峰間過渡，如果存在，則處理裝置130可進ー步被配置成執(zhí)行指令/計算機可讀程序代碼部分，以便允許基于對自動程序結果的主觀評估，在任意或所有的ニ維數(shù)據(jù)組中自動確定的峰間過渡可被手動轉移或以其他方式進行調(diào)整，其中這樣的手動操縱可允許例如專家對分析結果進ー步提煉。因此，本公開內(nèi)容的這些方面著手并降低了在代謝物組學分析的早期階段定量的不精確性，因此可有利地促使在后續(xù)步驟或分析中避免、降低或最小化較大的不精確性。本公開內(nèi)容的方面還提供了分析代謝物組學數(shù)據(jù)的方法，如在圖7和圖9的操作流程圖中大體上所示出的以及先前如在此所討論的。除提供適當?shù)脑O備和方法以外，本公開內(nèi)容的方面還可提供適當?shù)挠嬎銠C程序產(chǎn)品，用于執(zhí)行以上所公開的功能/操作/步驟，其例如以計算機可讀存儲介質(zhì)(即，內(nèi)存裝置140)的形式，該計算機可讀存儲介質(zhì)具有被存儲在其中的特定計算機可讀程序代碼部分，該介質(zhì)響應于處理器裝置130的執(zhí)行，使得該設備至少執(zhí)行在此所公開的步驟。在這一點上，圖7和圖9為依據(jù)本公開內(nèi)容的方面，與特定方法、設備和計算機程序產(chǎn)品相關聯(lián)的操作流程圖。應理解，該操作流程圖中的每ー個框或步驟，或在該操作流程圖中的框的組合可通過由處理器裝置130執(zhí)行的適當?shù)挠嬎銠C程序指令來實現(xiàn)。這些計算機程序指令可被加載到計算機裝置上，或其它可編程設備上，以用于執(zhí)行在該操作流程圖中所指定的、與在此所公開的方法相關的功能。這些計算機程序指令還可被存儲在計算機可讀內(nèi)存(即，內(nèi)存裝置140)中，以便可被計算機裝置或其它可編程設備以特定的方式訪問，使得存儲在該計算機可讀內(nèi)存中的可執(zhí)行指令可產(chǎn)生或促進對能夠引導或另外執(zhí)行這些指令的制造產(chǎn)品的操作，這些指令實現(xiàn)在操作流程圖中所指定的、與在此所公開的方法相關的功能。計算機程序指令還可被加載到計算機裝置上或其它可編程設備上，以使一系列的操作性步驟在計算機裝置或其它可編程設備上執(zhí)行，以產(chǎn)生計算機實現(xiàn)的處理，使得通過計算機裝置或其它可編程設備執(zhí)行的指令提供或另外引導適當?shù)牟襟E，用于實現(xiàn)在操作流程圖所指定的、與在此所公開的方法相關的功能/步驟。還應理解，該操作流程圖中的每ー個步驟，或在該操作流程圖中的步驟的組合，可通過執(zhí)行特定功能或步驟的基于特殊目的硬件的計算機系統(tǒng)或特殊目的硬件和計算機指令(軟件)的組合而被實現(xiàn)。在此闡述的本公開內(nèi)容的許多變化和其它方面將提醒本公開內(nèi)容所屬領域的技術人員具有前述說明書和相關附圖中所體現(xiàn)的啟示的好處。因此，應該理解，本公開內(nèi)容將 不被限制在所公開的這些特定方面中，并且，那些變化和其它方面g在被包括在隨附的權利要求書的范圍內(nèi)。雖然在此采用了專用的術語，但是它們僅以普通的以及說明性的意義被使用，而非為了限制的目的。
權利要求
1.ー種分析從成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)的方法，其包括 針對多個樣本中的每個樣本，在多個ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個中確定出選定離子峰，所述ニ維數(shù)據(jù)組包括從成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)，所述ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個由各自的三維數(shù)據(jù)組確定，所述三維數(shù)據(jù)組包括從所述成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)；針對所述ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個，使用多種積分步驟中的ー種積分步驟，確定與所述選定離子峰相關聯(lián)的面積； 確定與所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述選定離子峰相關聯(lián)的樣本成分的身份，所述與每ー個選定離子峰相關聯(lián)的面積還對應于所述樣本成分在各自樣本中的相對量； 在所述多個ニ維數(shù)據(jù)組中比較所述選定離子峰，以確定所述積分步驟中的所述ー種積分步驟，該積分步驟被用于確定所述ニ維數(shù)據(jù)組的第一部分的選定離子峰的面積，所確定的所述積分步驟中的ー種積分步驟包括模板積分步驟；以及 將所述模板積分步驟應用于所述ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的選定離子峰，以便相對于經(jīng)確定為在樣本中對應于所述ニ維數(shù)據(jù)組的第一部分的樣本成分的相對量，調(diào)整經(jīng)確定為在樣本中對應于所述ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的樣本成分的相對量，所述ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分先前已獲得由所述積分步驟中不同于所述模板積分步驟的ー種積分步驟確定的其選定離子峰的面積。
2.ー種分析從成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)的方法，其包括 針對多個樣本中的每個樣本，在多個ニ維數(shù)據(jù)組的每ー個中確定選定離子峰，所述ニ維數(shù)據(jù)組從各自的三維數(shù)據(jù)組確定，所述三維數(shù)據(jù)組包括從所述成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)； 針對所述ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個，使用多種積分步驟中的多種積分步驟，確定與所述選定離子峰相關聯(lián)的面積； 確定與所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述選定離子峰相關聯(lián)的第一樣本成分的身份，與所述第一樣本成分相關聯(lián)的每ー個選定離子峰的面積還對應于所述第一樣本成分在各自樣本中的相對量； 在所述多個ニ維數(shù)據(jù)中比較所述選定離子峰，以確定所述積分步驟中預定的積分步驟是否被用于確定與所述ニ維數(shù)據(jù)組的選定離子峰的第一部分的第一樣本成分相關聯(lián)的面積，所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述選定離子峰的所述第一部分指示除所述第一樣本成分以外與之相關聯(lián)的第二樣本成分，所述積分步驟中的所述預定的積分步驟被用于確定與所述第一樣本成分相關聯(lián)的所述第一部分中的每ー個選定離子峰的面積，所述預定的積分步驟包括第一祥本成分掩蔽積分步驟； 如果使用所述積分步驟中的所述預定的積分步驟來確定與所述選定離子峰的第一部分中的第一樣本成分相關聯(lián)的面積，則針對所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述選定離子峰中的第一部分，使用第二樣本成分掩蔽積分步驟，確定對應于所述第二樣本成分的相對量的每ー個選定離子峰的面積；以及 將所述第一和第二樣本成分掩蔽積分步驟應用于所述ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的選定離子峰，以便相對于經(jīng)確定為在樣本中對應于所述ニ維數(shù)據(jù)組的第一部分的第一和第二樣本成分的相對量，調(diào)整經(jīng)確定為在對應于所述ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的所述樣本中的第一和第二樣本成分的相對量，所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述第二部分先前已獲得由所述積分步驟中不同于所述第一樣本成分掩蔽積分步驟的ー種積分步驟確定的其所述選定離子峰的面積。
3.如權利要求2所述的方法，進ー步包括 如果積分步驟中所述預定的積分步驟未用于確定與所述選定離子峰的第一部分的第一祥本成分相關聯(lián)的面積，則在所述多個ニ維數(shù)據(jù)組中比較所述選定離子峰，以確定所述積分步驟中的ー種積分步驟，該積分步驟用于針對所述ニ維數(shù)據(jù)組的已識別部分確定每個選定離子峰的面積，該經(jīng)確定的所述積分步驟中的積分步驟包括模板積分步驟；以及 將所述模板積分步驟應用于所述ニ維數(shù)據(jù)組的剩余部分的選定離子峰，以便相對于經(jīng)確定為在樣本中對應于所述ニ維數(shù)據(jù)組的已識別部分的樣本成分的相對量，調(diào)整經(jīng)確定為在樣本中對應于所述ニ維數(shù)據(jù)組的剰余部分的樣本成分的相對量，所述ニ維數(shù)據(jù)組的剰余部分先前已獲得由所述積分步驟中不同于所述模板積分步驟的一種積分步驟確定的其所述選定離子峰的面積。
4.如權利要求I或2所述的方法，其中，所述ニ維數(shù)據(jù)組被配置成表示在一個維度中的樣本性質(zhì)對另一維度中另ー樣本性質(zhì)的選定值的強度，并且確定與所述選定離子峰相關聯(lián)的面積，其還包括 確定在樣本性質(zhì)維度上的強度峰起始點和強度峰終止點； 確定所述強度峰起始點和所述強度峰終止點中每ー個相對于強度維度中基線強度的關系；以及 相對于在所述樣本性質(zhì)維度上的所述強度峰起始點和所述強度峰終止點與所述強度維度上基線強度的關系，積分在所述樣本性質(zhì)維度上的所述強度峰起始點與所述強度峰終止點之間的所述選定離子峰，以便確定與所述選定離子峰相關聯(lián)的面積。
5.如權利要求4所述的方法，其中，確定在樣本性質(zhì)維度上的強度峰起始點和強度峰終止點進ー步包括，確定在時間維度上的強度峰起始點和強度峰終止點。
6.如權利要求4所述的方法，其中，確定所述強度峰起始點和所述強度峰終止點的每ー個相對于在所述強度維度上的基線強度的關系進一歩包括以下步驟中的至少ー個確定所述強度峰起始點和所述強度峰終止點的任一方是否對應于所述基線強度；以及 確定所述強度峰起始點和所述強度峰終止點中任一方是否與所述基線強度間隔開。
7.如權利要求6所述的方法，進ー步包括，依據(jù)已確定的所述強度峰起始點與所述基線強度的關系與已確定的所述強度峰終止點與所述基線強度的關系的組合，確定所述多種積分步驟的ー種積分步驟，其被用于確定與所述ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個的選定離子峰相關聯(lián)的面積。
8.如權利要求I或2所述的方法，進ー步包括，從多個樣本中每ー個的各自的三維數(shù)據(jù)組確定所述ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個，每ー個三維數(shù)據(jù)組包括樣本成分質(zhì)量維度、強度維度和時間維度。
9.如權利要求8所述的方法，其中，在多個ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個中確定選定離子峰進ー步包括，針對在相應的三維數(shù)據(jù)組的樣本成分質(zhì)量維度上的選定樣本成分，在多個ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個中確定選定離子峰，其中每ー個ニ維數(shù)據(jù)組包括時間維度和強度維度。
10.如權利要求9所述的方法，進ー步包括，在所述多個ニ維數(shù)據(jù)組中比較所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述選定離子峰，并且在所有ニ維數(shù)據(jù)組中依據(jù)各自的強度特性校準所述選定離子峰。
11.如權利要求I或2所述的方法，其中，確定與所述ニ維數(shù)據(jù)組中每ー個的所述選定離子峰相關聯(lián)的面積進一歩包括，結合相對標準偏差百分比，確定與所述ニ維數(shù)據(jù)組中每一個的所述選定離子峰相關聯(lián)的面積。
12.如權利要求I或2所述的方法，其中，在多個ニ維數(shù)據(jù)組的每ー個中確定選定離子峰進ー步包括 在所述ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個中識別出多個候選強度峰； 在所述多個ニ維數(shù)據(jù)組中比較所述候選強度峰；以及 將在所述多個ニ維數(shù)據(jù)組明顯的，且對應于化合物數(shù)據(jù)庫中的公知化合物的所述候選強度峰之ー選擇作為選定離子峰。
13.如權利要求3所述的方法，其中，在所述多個ニ維數(shù)據(jù)組中比較所述選定離子峰進一歩包括在所述多個ニ維數(shù)據(jù)組中比較所述選定離子峰，以確定其與所述第一樣本成分相關聯(lián)的面積中的任一面積是否是通過所述積分步驟中的所述預定積分步驟確定，該面積指示除主峰以外的肩峰，該肩峰對應于除所述第一樣本成分以外的第二樣本成分，所述選定離子峰具有的面積與所述第一樣本成分相關且通過所述積分步驟中所述預定積分步驟確定，該選定離子峰包括所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述選定離子峰的所述第一部分。
14.如權利要求13所述的方法，進ー步包括，針對所述選定離子峰中的每ー個，確定主峰、肩峰和在所述主峰與所述肩峰之間的峰間過渡，所述選定離子峰包括所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述選定離子峰的第一部分，該第一部分指示除所述第一樣本成分以外的第二樣本成分。
15.如權利要求14所述的方法，進ー步包括，確定與所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述選定離子峰的第一部分的肩峰相關聯(lián)的所述第ニ樣本成分的身份。
16.如權利要求15所述的方法，進ー步包括，將所述第一樣本成分掩蔽積分步驟與所述第二樣本成分掩蔽積分步驟進行比較，以便確定在所述樣本性質(zhì)維度上所述主峰和所述肩峰之間的代表性峰間過渡，以及強度維度上的代表性基線強度。
17.如權利要求16所述的方法，其中，將所述第一和第二樣本成分掩蔽積分步驟應用到所述ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的選定離子峰上進ー步包括 相對于在強度維度上的所述代表性基線強度，使用在樣本性質(zhì)維度上的強度峰起始點和所述代表性峰間過渡，執(zhí)行針對選定離子峰的第二部分的第一樣本成分掩蔽積分步驟，以確定與所述第一樣本成分相關聯(lián)的所述第二部分的選定離子峰的面積；以及 相對于在強度維度上的所述代表性基線強度，使用在樣本性質(zhì)維度上的所述代表性峰間過渡和強度峰終止點，執(zhí)行針對選定離子峰的第二部分的第二樣本成分掩蔽積分步驟，以確定與所述第一樣本成分相關聯(lián)的所述第二部分的選定離子峰的面積。
18.一種用于分析從成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)的設備，該設備包括處理器和存儲可執(zhí)行指令的內(nèi)存，所述可執(zhí)行指令響應于所述處理器的執(zhí)行，使得所述設備至少執(zhí)行以下步驟 針對多個樣本中的每個樣本，在多個ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個中確定出選定離子峰，所述ニ維數(shù)據(jù)組包括從成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)，所述ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個由各自的三維數(shù)據(jù)組確定，所述三維數(shù)據(jù)組包括從所述成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)；針對所述ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個，使用多種積分步驟中的ー種積分步驟，確定與所述選定離子峰相關聯(lián)的面積； 確定與所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述選定離子峰相關聯(lián)的樣本成分，所述與每ー個選定離子峰相關聯(lián)的面積還對應于所述樣本成分在各自樣本中的相對量； 在所述多個ニ維數(shù)據(jù)組中比較所述選定離子峰，以確定所述積分步驟中的所述ー種積分步驟，該積分步驟被用于確定所述ニ維數(shù)據(jù)組的第一部分的選定離子峰的面積，所確定的所述積分步驟中的ー種積分步驟包括模板積分步驟；以及 將所述模板積分步驟應用于所述ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的選定離子峰，以便相對于經(jīng)確定為在樣本中對應于所述ニ維數(shù)據(jù)組的第一部分的樣本成分的相對量，調(diào)整經(jīng)確定為在樣本中對應于所述ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的樣本成分的相對量，所述ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分先前已獲得由所述積分步驟中不同于所述模板積分步驟的ー種積分步驟確定的其選定離子峰的面積。
19.一種用于分析從成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)的設備，該設備包括處理器和存儲可執(zhí)行指令的內(nèi)存，所述可執(zhí)行指令響應該處理器的執(zhí)行，使得該設備至少實現(xiàn)以下步驟 針對多個樣本中的每個樣本，在多個ニ維數(shù)據(jù)組的每ー個中確定選定離子峰，所述ニ維數(shù)據(jù)組從各自的三維數(shù)據(jù)組確定，所述三維數(shù)據(jù)組包括從所述成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)獲得的數(shù)據(jù)； 針對所述ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個，使用多種積分步驟中的ー個積分步驟，確定與所述選定離子峰相關聯(lián)的面積； 確定與所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述選定離子峰相關聯(lián)的第一樣本成分的身份，與所述第一樣本成分相關聯(lián)的每ー個選定離子峰的面積還對應于所述第一樣本成分在各自樣本中的相對量； 在所述多個ニ維數(shù)據(jù)中比較所述選定離子峰，以確定所述積分步驟中預定的積分步驟是否被用于確定與所述ニ維數(shù)據(jù)組的選定離子峰的第一部分的第一樣本成分相關聯(lián)的面積，所述ニ維數(shù)據(jù)組的選定離子峰的第一部分指示除所述第一樣本成分以外與之相關聯(lián)的第二樣本成分，所述積分步驟中的所述預定的積分步驟被用于確定與所述第一樣本成分相關聯(lián)的所述第一部分中的每ー個選定離子峰的面積，所述預定的積分步驟包括第一樣本成分掩蔽積分步驟； 如果使用所述積分步驟中的所述預定的積分步驟來確定與所述選定離子峰的第一部分中的第一樣本成分相關聯(lián)的面積，則針對所述ニ維數(shù)據(jù)組的選定離子峰中的第一部分，使用第二樣本成分掩蔽積分步驟，確定對應于所述第二樣本成分的相對量的每ー個選定離子峰的面積；以及 將所述第一和第二樣本成分掩蔽積分步驟應用于所述ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的選定離子峰，以便相對于經(jīng)確定為在樣本中對應于所述ニ維數(shù)據(jù)組的第一部分的第一和第二樣本成分的相對量，調(diào)整經(jīng)確定為在對應于所述ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的所述樣本中的第一和第二樣本成分的相對量，所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述第二部分先前已獲得由所述積分步驟中不同于所述第一樣本成分掩蔽積分步驟的ー種積分步驟確定的其所述選定離子峰的面積。
20.如權利要求19所述的設備，其中，所述內(nèi)存存儲可執(zhí)行指令，其響應所述處理器的執(zhí)行，使得該設備進ー步執(zhí)行一下步驟 如果積分步驟中所述預定的積分步驟未用于確定與所述選定離子峰的第一部分的第一祥本成分相關聯(lián)的面積，則在所述多個ニ維數(shù)據(jù)組中比較所述選定離子峰，以確定所述積分步驟中的ー種積分步驟，該積分步驟用于針對所述ニ維數(shù)據(jù)組的已識別部分確定每個選定離子峰的面積，該經(jīng)確定的所述積分步驟中的積分步驟包括模板積分步驟；以及 將所述模板積分步驟應用于所述ニ維數(shù)據(jù)組的剩余部分的選定離子峰，以便相對于經(jīng)確定為在樣本中對應于所述ニ維數(shù)據(jù)組的已識別部分的樣本成分的相對量，調(diào)整經(jīng)確定為在樣本中對應于所述ニ維數(shù)據(jù)組的剰余部分的樣本成分的相對量，所述ニ維數(shù)據(jù)組的剰余部分先前已獲得由所述積分步驟中不同于所述模板積分步驟的一種積分步驟確定的其所述選定離子峰的面積。
21.如權利要求18或19所述的設備，其中，所述ニ維數(shù)據(jù)組被配置成表示在一個維度 中的樣本性質(zhì)對另一維度中另ー樣本性質(zhì)的選定值的強度，并且確定與所述選定離子峰相關聯(lián)的面積，其還包括 確定在樣本性質(zhì)維度上的強度峰起始點和強度峰終止點； 確定所述強度峰起始點和所述強度峰終止點中每ー個相對于強度維度中基線強度的關系；以及 相對于在所述樣本性質(zhì)維度上的所述強度峰起始點和所述強度峰終止點與所述強度維度上基線強度的關系，積分在所述樣本性質(zhì)維度上的所述強度峰起始點與所述強度峰終止點之間的所述選定離子峰，以便確定與所述選定離子峰相關聯(lián)的面積。
22.如權利要求21所述的設備，其中，確定在樣本性質(zhì)維度上的強度峰起始點和強度峰終止點進ー步包括，確定在時間維度上的強度峰起始點和強度峰終止點。
23.如權利要求21所述的設備，其中，確定所述強度峰起始點和所述強度峰終止點的每ー個相對于在所述強度維度上的基線強度的關系進一歩包括以下步驟中的至少ー個 確定所述強度峰起始點和所述強度峰終止點的任一方是否對應于所述基線強度；以及 確定所述強度峰起始點和所述強度峰終止點中任一方是否與所述基線強度間隔開。
24.如權利要求23所述的設備，其中，所述內(nèi)存存儲可執(zhí)行指令，其響應所述處理器的執(zhí)行，使所述設備進ー步實施以下步驟 依據(jù)已確定的所述強度峰起始點與所述基線強度的關系與已確定的所述強度峰終止點與所述基線強度的關系的組合，確定所述多種積分步驟的ー種積分步驟，其被用于確定與所述ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個的選定離子峰相關聯(lián)的面積。
25.如權利要求18或19所述的設備，其中，所述內(nèi)存存儲可執(zhí)行指令，其響應所述處理器的執(zhí)行，使所述設備進ー步實施以下步驟 從多個樣本中每ー個的各自的三維數(shù)據(jù)組確定所述ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個，每ー個三維數(shù)據(jù)組包括樣本成分質(zhì)量維度、強度維度和時間維度。
26.如權利要求25所述的設備，其中，在包括得自成分分離和質(zhì)譜儀系統(tǒng)的數(shù)據(jù)的多個ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個中確定選定離子峰進ー步包括，針對在相應的三維數(shù)據(jù)組的樣本成分質(zhì)量維度上的選定樣本成分，在多個ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個中確定選定離子峰，其中每ー個ニ維數(shù)據(jù)組包括時間維度和強度維度。
27.如權利要求25所述的設備，其中，所述內(nèi)存存儲可執(zhí)行指令，其響應所述處理器的執(zhí)行，使所述設備進ー步實施以下步驟 在所述多個ニ維數(shù)據(jù)組中比較所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述選定離子峰，并且在所有ニ維數(shù)據(jù)組中依據(jù)各自的強度特性校準所述選定離子峰。
28.如權利要求18或19所述的設備，其中，確定與所述ニ維數(shù)據(jù)組中每ー個的所述選定離子峰相關聯(lián)的面積進一歩包括，結合相對標準偏差百分比，確定與所述ニ維數(shù)據(jù)組中每ー個的所述選定離子峰相關聯(lián)的面積。
29.如權利要求18或19所述的設備，其中，在多個ニ維數(shù)據(jù)組的每ー個中確定選定離子峰進ー步包括 在所述ニ維數(shù)據(jù)組中的每ー個中識別出多個候選強度峰； 在所述多個ニ維數(shù)據(jù)組中比較所述候選強度峰；以及 將在所述多個ニ維數(shù)據(jù)組明顯的，且對應于化合物數(shù)據(jù)庫中的公知化合物的所述候選強度峰之ー選擇作為選定離子峰。
30.如權利要求19所述的設備，其中，在所述多個ニ維數(shù)據(jù)組中比較所述選定離子峰進ー步包括在所述多個ニ維數(shù)據(jù)組中比較所述選定離子峰，以確定其與所述第一樣本成分相關聯(lián)的面積中的任一面積是否是通過所述積分步驟中的所述預定積分步驟確定，該面積指示除主峰以外的肩峰，該肩峰對應于除所述第一樣本成分以外的第二樣本成分，所述選定離子峰具有的面積與所述第一樣本成分相關且通過所述積分步驟中所述預定積分步驟確定，該選定離子峰包括所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述選定離子峰的所述第一部分。
31.如權利要求30所述的設備，其中，所述內(nèi)存存儲可執(zhí)行指令，其響應所述處理器的執(zhí)行，使所述設備進ー步實施以下步驟 針對所述選定離子峰中的每ー個，確定主峰、肩峰和在所述主峰與所述肩峰之間的峰間過渡，所述選定離子峰包括所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述選定離子峰的第一部分，該第一部分指示除所述第一樣本成分以外的第二樣本成分。
32.如權利要求31所述的設備，其中，所述內(nèi)存存儲可執(zhí)行指令，其響應所述處理器的執(zhí)行，使得所述設備進一步實現(xiàn)以下步驟 確定與所述ニ維數(shù)據(jù)組的所述選定離子峰的第一部分的肩峰相關聯(lián)的所述第二樣本成分的身份。
33.如權利要求32所述的設備，其中，所述內(nèi)存存儲可執(zhí)行指令，其響應所述處理器的執(zhí)行，使所述設備進ー步實現(xiàn)以下步驟 將所述第一樣本成分掩蔽積分步驟與所述第二樣本成分掩蔽積分步驟進行比較，以便確定在所述樣本性質(zhì)維度上所述主峰和所述肩峰之間的代表性峰間過渡，以及強度維度上的代表性基線強度。
34.如權利要求33所述的設備，其中，將所述第一和第二樣本成分掩蔽積分步驟應用到所述ニ維數(shù)據(jù)組的第二部分的選定離子峰上進ー步包括 相對于在強度維度上的所述代表性基線強度，使用在樣本性質(zhì)維度上的強度峰起始點和所述代表性峰間過渡，執(zhí)行針對選定離子峰的第二部分的第一樣本成分掩蔽積分步驟，以確定與所述第一樣本成分相關聯(lián)的所述第二部分的選定離子峰的面積；以及 相對于在強度維度上的所述代表性基線強度，使用在樣本性質(zhì)維度上的所述代表性峰間過渡和強度峰終止點，執(zhí)行針對選定離子峰的第二部分的第二樣本成分掩蔽積分步驟，以確定與所述第一樣本成分相關聯(lián)的所述第二部分的選定離子峰的面積。全文摘要
提供了一種方法、設備，以及計算機可讀存儲介質(zhì)，用于分析來自成分分離/質(zhì)譜儀(CS-MS)的數(shù)據(jù)，其中，確定了在每一個二維數(shù)據(jù)組中的強度峰，其面積使用積分步驟(integration procedure)確定。該強度峰指示了樣本成分，并且，其面積指示了該樣本成分的相對量。積分步驟確定與第一樣本成分相關的二維數(shù)據(jù)組中第一部分的選定峰的面積，并且，將該積分步驟應用于其面積并非通過該積分步驟確定的第二部分的強度峰，以便相對于在第一部分樣本中的第一樣本成分的相對量來調(diào)整該第二部分樣本中的第一樣本成分的相對量。該重新積分還可包括確定第二樣本成分是否由該強度峰顯示。
文檔編號G01N33/50GK102667789SQ201080054995
公開日2012年9月12日 申請日期2010年10月1日 優(yōu)先權日2009年10月2日
發(fā)明者C.D.德哈文, H.戴 申請人:梅塔博隆有限公司