乳腺癌檢測(cè)方法
【專(zhuān)利摘要】本發(fā)明提供診斷乳腺癌的方法。該方法包括分析多個(gè)細(xì)胞中的生物標(biāo)志物的表達(dá)模式以區(qū)分浸潤(rùn)性和非浸潤(rùn)性癌、普通增生和非典型增生，以及基底樣乳腺癌。基于在乳頭抽吸液中發(fā)現(xiàn)的生物標(biāo)志物的不同組合來(lái)診斷乳腺癌。
【專(zhuān)利說(shuō)明】乳腺癌檢測(cè)方法
交叉引用
[0001]本申請(qǐng)要求2011年10月24日提交的美國(guó)臨時(shí)申請(qǐng)?zhí)?1/550，865的權(quán)益，該臨時(shí)申請(qǐng)通過(guò)引用并入本文。
【背景技術(shù)】
[0002]乳腺癌是源自乳腺組織的癌，最常見(jiàn)的是源自乳導(dǎo)管的內(nèi)襯或?yàn)樵搶?dǎo)管供應(yīng)乳的小葉。源自導(dǎo)管的癌稱(chēng)為導(dǎo)管癌；那些源自小葉的癌稱(chēng)為小葉癌。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0003]在某些實(shí)施方案中，本文中公開(kāi)了將乳腺癌分類(lèi)為基底樣乳腺癌的方法，該方法包括:(a)使來(lái)源于乳頭抽吸液(nipple aspirate fluid, NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14、CK7、CK18和p63的第一抗體接觸；以及(b)如果CK5、CK14及任選的抗p63第一抗體與所述多個(gè)細(xì)胞結(jié)合，則將所述癌分類(lèi)為基底樣的；其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞不是組織。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14和p63的第二抗體的第一群體及能結(jié)合CK7和CK18的第二抗體的第二群體接觸。在一些實(shí)施方案中，所述第二抗體的第一群體包含辣根過(guò)氧化物酶(HRP)，且所述第二抗體的第二群體包含堿性磷酸酶(AP)。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞與二氨基聯(lián)苯胺(DAB)和固紅(FR)接觸。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括采用蘇木精對(duì)所述多個(gè)細(xì)胞進(jìn)行復(fù)染色。在一些實(shí)施方案中，采用光學(xué)顯微鏡使所述多個(gè)細(xì)胞可視化。在一些實(shí)施方案中，采用自動(dòng)化系統(tǒng)使所述多個(gè)細(xì)胞可視化。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞在與第二抗體接觸之前與過(guò)氧化物封閉劑(block)接觸。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括收集所述來(lái)源于吸收性紙上的NAF的多個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中,所述方法進(jìn)一步包括收集所述來(lái)源于吸收性紙上的NAF的多個(gè)細(xì)胞，所述吸收性紙包含微纖維素、混合纖維素酯或硝化纖維素。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括清洗所述吸收性紙并收集流出物。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為至少兩個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為多于兩個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，NAF樣品從乳頭抽吸液的典型非分泌者或典型分泌者獲得。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為三陰性的。在一些實(shí)施方案中，所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與第一抗體的接觸是自動(dòng)化的。在一些實(shí)施方案中，所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與第二抗體的接觸是自動(dòng)化的。在一些實(shí)施方案中，其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與二氨基聯(lián)苯胺(DAB)和固紅(FR)的接觸是自動(dòng)化的。
[0004]在某些實(shí)施方案中，本文中公開(kāi)了將乳腺癌分類(lèi)為管腔型的方法，該方法包括:(a)使來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14、CK7、CK18和p63的第一抗體接觸 '及(b)如果(i)抗CK7和抗CK18第一抗體與所述多個(gè)細(xì)胞結(jié)合，并且(ii)抗CK5、抗CK14和抗p63第一抗體不與所述多個(gè)細(xì)胞結(jié)合，則將所述癌分類(lèi)為管腔型；其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞不是組織。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14和p63的第二抗體的第一群體及能結(jié)合CK7和CK18的第二抗體的第二群體接觸。在一些實(shí)施方案中，所述第二抗體的第一群體包含辣根過(guò)氧化物酶(HRP)，且所述第二抗體的第二群體包含堿性磷酸酶(AP)。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞與二氨基聯(lián)苯胺(DAB)和固紅(FR)接觸。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括采用蘇木精對(duì)所述多個(gè)細(xì)胞進(jìn)行復(fù)染色。在一些實(shí)施方案中，采用光學(xué)顯微鏡使所述多個(gè)細(xì)胞可視化。在一些實(shí)施方案中，采用自動(dòng)化系統(tǒng)使所述多個(gè)細(xì)胞可視化。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞在與第二抗體接觸之前與過(guò)氧化物封閉劑接觸。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括收集所述來(lái)源于吸收性紙上的NAF的多個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中,所述方法進(jìn)一步包括收集所述來(lái)源于吸收性紙上的NAF的多個(gè)細(xì)胞，所述吸收性紙包含微纖維素、混合纖維素酯或硝化纖維素。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括清洗所述吸收性紙并收集流出物。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為至少兩個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為多于兩個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，NAF樣品從乳頭抽吸液的典型非分泌者或典型分泌者獲得。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為三陰性的。在一些實(shí)施方案中，所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與第一抗體的接觸是自動(dòng)化的。在一些實(shí)施方案中，所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與第二抗體的接觸是自動(dòng)化的。在一些實(shí)施方案中，其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與二氨基聯(lián)苯胺(DAB)和固紅(FR)的接觸是自動(dòng)化的。
[0005]在某些實(shí)施方案中，本文中公開(kāi)了將增生分類(lèi)為普通型導(dǎo)管增生的方法，該方法包括:(a)使來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14、CK7、CK18和p63的第一抗體接觸 '及(b)如果CK5、CK14、CK7、CK18和p63第一抗體與所述多個(gè)細(xì)胞結(jié)合，則將所述增生分類(lèi)為普通型導(dǎo)管增生；其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞不是組織。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14和P63的第二抗體的第一群體及能結(jié)合CK7和CK18的第二抗體的第二群體接觸。在一些實(shí)施方案中，所述第二抗體的第一群體包含辣根過(guò)氧化物酶(HRP)，且所述第二抗體的第二群體包含堿性磷酸酶(AP)。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞與二氨基聯(lián)苯胺(DAB)和固紅(FR)接觸。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括采用蘇木精對(duì)所述多個(gè)細(xì)胞進(jìn)行復(fù)染色。在一些實(shí)施方案中，采用光學(xué)顯微鏡使所述多個(gè)細(xì)胞可視化。在一些實(shí)施方案中，采用自動(dòng)化系統(tǒng)使所述多個(gè)細(xì)胞可視化。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞在與第二抗體接觸之前與過(guò)氧化物封閉劑接觸。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括收集所述來(lái)源于吸收性紙上的NAF的多個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括收集所述來(lái)源于吸收性紙上的NAF的多個(gè)細(xì)胞，所述吸收性紙包含微纖維素、混合纖維素酯或硝化纖維素。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括清洗所述吸收性紙并收集流出物。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為至少兩個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為多于兩個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，NAF樣品從乳頭抽吸液的典型非分泌者或典型分泌者獲得。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為三陰性的。在一些實(shí)施方案中，所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與第一抗體的接觸是自動(dòng)化的。在一些實(shí)施方案中，所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與第二抗體的接觸是自動(dòng)化的。在一些實(shí)施方案中，其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與二氨基聯(lián)苯胺(DAB)和固紅(FR)的接觸是自動(dòng)化的。[0006]在某些實(shí)施方案中，本文中公開(kāi)了將增生分類(lèi)為非典型導(dǎo)管增生的方法，該方法包括:(a)使來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14、CK7、CK18和p63的第一抗體接觸 '及(b)如果(i)CK7和CK18及任選的p63第一抗體與所述多個(gè)細(xì)胞結(jié)合，并且(ii) CK5和CK14第一抗體不與所述多個(gè)細(xì)胞結(jié)合，則將所述增生分類(lèi)為非典型導(dǎo)管增生；其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞不是組織。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14和p63的第二抗體的第一群體及能結(jié)合CK7和CK18的第二抗體的第二群體接觸。在一些實(shí)施方案中，所述第二抗體的第一群體包含辣根過(guò)氧化物酶(HRP)，且所述第二抗體的第二群體包含堿性磷酸酶(AP)。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞與二氨基聯(lián)苯胺(DAB)和固紅(FR)接觸。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括采用蘇木精對(duì)所述多個(gè)細(xì)胞進(jìn)行復(fù)染色。在一些實(shí)施方案中，采用光學(xué)顯微鏡使所述多個(gè)細(xì)胞可視化。在一些實(shí)施方案中，采用自動(dòng)化系統(tǒng)使所述多個(gè)細(xì)胞可視化。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞在與第二抗體接觸之前與過(guò)氧化物封閉劑接觸。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括收集所述來(lái)源于吸收性紙上的NAF的多個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括收集所述來(lái)源于吸收性紙上的NAF的多個(gè)細(xì)胞，所述吸收性紙包含微纖維素、混合纖維素酯或硝化纖維素。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括清洗所述吸收性紙并收集流出物。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為至少兩個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為多于兩個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，NAF樣品從乳頭抽吸液的典型非分泌者或典型分泌者獲得。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為三陰性的。在一些實(shí)施方案中，所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與第一抗體的接觸是自動(dòng)化的。在一些實(shí)施方案中，所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與第二抗體的接觸是自動(dòng)化的。在一些實(shí)施方案中，其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與二氨基聯(lián)苯胺(DAB)和固紅(FR)的接觸是自動(dòng)化的。
[0007]在某些實(shí)施方案中，本文中公開(kāi)了將乳腺癌分類(lèi)為浸潤(rùn)性的方法，該方法包括:
(a)使來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14、CK7、CK18和p63的第一抗體接觸；及(b)如果結(jié)合CK5、CK14和p63第一抗體的細(xì)胞與結(jié)合CK7和CK18第一抗體的細(xì)胞的比例小于或等于浸潤(rùn)性對(duì)照，則將所述癌分類(lèi)為浸潤(rùn)性的；其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞不是組織。在一些實(shí)施方案中，沒(méi)有細(xì)胞結(jié)合CK5、CK14和P63。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14和p63的第二抗體的第一群體及能結(jié)合CK7和CK18的第二抗體的第二群體接觸。在一些實(shí)施方案中，所述第二抗體的第一群體包含辣根過(guò)氧化物酶(HRP)，且所述第二抗體的第二群體包含堿性磷酸酶(AP)。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞與二氨基聯(lián)苯胺(DAB)和固紅(FR)接觸。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括采用蘇木精對(duì)所述多個(gè)細(xì)胞進(jìn)行復(fù)染色。在一些實(shí)施方案中，采用光學(xué)顯微鏡使所述多個(gè)細(xì)胞可視化。在一些實(shí)施方案中，采用自動(dòng)化系統(tǒng)使所述多個(gè)細(xì)胞可視化。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞在與第二抗體接觸之前與過(guò)氧化物封閉劑接觸。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括收集所述來(lái)源于吸收性紙上的NAF的多個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括收集所述來(lái)源于吸收性紙上的NAF的多個(gè)細(xì)胞，所述吸收性紙包含微纖維素、混合纖維素酯或硝化纖維素。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括清洗所述吸收性紙并收集流出物。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為至少兩個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為多于兩個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，NAF樣品從乳頭抽吸液的典型非分泌者或典型分泌者獲得。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為三陰性的。在一些實(shí)施方案中，所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與第一抗體的接觸是自動(dòng)化的。在一些實(shí)施方案中，所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與第二抗體的接觸是自動(dòng)化的。在一些實(shí)施方案中，其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與二氨基聯(lián)苯胺(DAB)和固紅(FR)的接觸是自動(dòng)化的。
[0008]在某些實(shí)施方案中，本文中公開(kāi)了將乳腺癌分類(lèi)為非浸潤(rùn)性乳腺癌的方法，該方法包括:(a)使來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14、CK7、CK18和P63的第一抗體接觸；及(b)如果結(jié)合CK5、CK14和p63第一抗體的細(xì)胞與結(jié)合CK7和CK18第一抗體的細(xì)胞的比例大于或等于非浸潤(rùn)性對(duì)照，則將所述癌分類(lèi)為非浸潤(rùn)性的；其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞不是組織。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14和p63的第二抗體的第一群體及能結(jié)合CK7和CK18的第二抗體的第二群體接觸。在一些實(shí)施方案中，所述第二抗體的第一群體包含辣根過(guò)氧化物酶(HRP)，且所述第二抗體的第二群體包含堿性磷酸酶(AP)。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞與二氨基聯(lián)苯胺(DAB)和固紅(FR)接觸。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括采用蘇木精對(duì)所述多個(gè)細(xì)胞進(jìn)行復(fù)染色。在一些實(shí)施方案中，采用光學(xué)顯微鏡使所述多個(gè)細(xì)胞可視化。在一些實(shí)施方案中，采用自動(dòng)化系統(tǒng)使所述多個(gè)細(xì)胞可視化。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括使所述多個(gè)細(xì)胞在與第二抗體接觸之前與過(guò)氧化物封閉劑接觸。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括收集所述來(lái)源于吸收性紙上的NAF的多個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括收集所述來(lái)源于吸收性紙上的NAF的多個(gè)細(xì)胞，所述吸收性紙包含微纖維素、混合纖維素酯或硝化纖維素。在一些實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括清洗所述吸收性紙并收集流出物。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為至少兩個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為多于兩個(gè)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，NAF樣品從乳頭抽吸液的典型非分泌者或典型分泌者獲得。在一些實(shí)施方案中，所述多個(gè)細(xì)胞為三陰性的。在一些實(shí)施方案中，所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與第一抗體的接觸是自動(dòng)化的。在一些實(shí)施方案中，所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與第二抗體的接觸是自動(dòng)化的。在一些實(shí)施方案中，其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與二氨基聯(lián)苯胺(DAB)和固紅(FR)的接觸是自動(dòng)化的。
[0009]本文中提供一種用于對(duì)乳腺癌進(jìn)行分類(lèi)的系統(tǒng)，該系統(tǒng)包括:用于吸收乳頭抽吸液樣品的、包含微纖維素、混合纖維素酯或硝化纖維素的吸收性紙，其中所述吸收性紙的尺寸設(shè)置為覆蓋乳頭，并且其直徑為約1.0至約3.0英寸且厚度為約0.01至約0.1英寸；能與所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗原結(jié)合的抗體，其中所述抗原選自:CK5、CK14、CK7、CK18、p63、CK7和CK18 ;以及光學(xué)顯微鏡或自動(dòng)化系統(tǒng)，其用于對(duì)結(jié)合到所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗體進(jìn)行可視化。該系統(tǒng)可進(jìn)一步包括用于對(duì)結(jié)合到所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗體進(jìn)行可視化的一種或多種工具(means)。在一個(gè)實(shí)施方案中，用于對(duì)結(jié)合到所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗體進(jìn)行可視化的工具為一種或多種染色劑。染色劑包括但不限于:辣根過(guò)氧化物酶、堿性磷酸酶、二氨基聯(lián)苯胺、固紅、蘇木精、曙紅或其組合。該系統(tǒng)還可進(jìn)一步包括用于從所述吸收性紙洗脫所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞的洗滌劑。該系統(tǒng)還可進(jìn)一步包括配置為執(zhí)行可執(zhí)行指令的任選聯(lián)網(wǎng)的計(jì)算機(jī)處理設(shè)備；以及計(jì)算機(jī)程序，所述計(jì)算機(jī)程序包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行以應(yīng)用模型或算法來(lái)分析所述細(xì)胞的軟件模塊。在一個(gè)實(shí)施方案中，所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以為個(gè)體指定治療方案的軟件模塊。在另一實(shí)施方案中，所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將顯微照片存儲(chǔ)于顯微照片的數(shù)據(jù)庫(kù)中的軟件模塊。在另一實(shí)施方案中，所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將分析結(jié)果(analysis)存儲(chǔ)于分析結(jié)果的數(shù)據(jù)庫(kù)中的軟件模塊。在另一實(shí)施方案中，所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞與標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行比較的軟件模塊。在另一實(shí)施方案中，所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將分析結(jié)果傳送至醫(yī)療服務(wù)人員或個(gè)體的軟件模塊。在另一實(shí)施方案中，所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將診斷結(jié)果傳送至醫(yī)療服務(wù)人員或個(gè)體的軟件模塊。在另一實(shí)施方案中，所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以產(chǎn)生包括所述分析結(jié)果的報(bào)告的軟件模塊。在另一實(shí)施方案中，所述吸收性紙為如圖1所示的設(shè)備。
[0010]本文中提供一種編碼有計(jì)算機(jī)程序的非暫時(shí)性計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì)，所述計(jì)算機(jī)程序包括可由計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的指令，以創(chuàng)建應(yīng)用，所述應(yīng)用包括:(a)配置為應(yīng)用模型或算法來(lái)分析吸收在吸收性紙上的乳頭抽吸液樣品的細(xì)胞的軟件模塊，所述吸收性紙的尺寸設(shè)置為覆蓋乳頭，并且其直徑為約1.0至約3.0英寸且厚度為約0.01至約0.1英寸，且其中所述細(xì)胞進(jìn)一步包含能與CK5、CK14、CK7、CK18、p63、CK7和CK18結(jié)合的抗體；以及
(b)配置為為個(gè)體指定治療方案的軟件模塊。在一個(gè)實(shí)施方案中，所述模型或算法將細(xì)胞與標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行比較。在一個(gè)實(shí)施方案中，所述應(yīng)用進(jìn)一步包括顯微照片在計(jì)算機(jī)存儲(chǔ)器中的數(shù)據(jù)庫(kù)。在一個(gè)實(shí)施方案中，所述應(yīng)用進(jìn)一步包括分析結(jié)果在計(jì)算機(jī)存儲(chǔ)器中的數(shù)據(jù)庫(kù)。在一個(gè)實(shí)施方案中，所述應(yīng)用進(jìn)一步包括配置為產(chǎn)生包括分析結(jié)果的報(bào)告的軟件模塊。在一個(gè)實(shí)施方案中，所述吸收性紙為如圖1所示的設(shè)備。
[0011]本文中提供一種用于對(duì)乳腺癌進(jìn)行分類(lèi)的方法，該方法包括:使吸收在吸收性紙上的乳頭抽吸液樣品的細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14、CK7、CK18和p63的抗體接觸，其中所述吸收性紙的尺寸設(shè)置為覆蓋乳頭，并且其直徑為約1.0至約3.0英寸且厚度為約0.01至約0.1英寸；檢測(cè)所述抗體中的一種或多種與所述細(xì)胞的結(jié)合；以及基于第一抗體的結(jié)合模式對(duì)所述癌進(jìn)行分類(lèi)；其中來(lái)源于所述乳頭抽吸液(NAF)樣品的細(xì)胞不是組織。在一個(gè)實(shí)施方案中，檢測(cè)所述一種或多種抗體的結(jié)合進(jìn)一步包括采用染色劑對(duì)細(xì)胞進(jìn)行染色，所述染色劑選自辣根過(guò)氧化物酶、堿性磷酸酶、二氨基聯(lián)苯胺、固紅、蘇木精、曙紅及其組合。在一個(gè)實(shí)施方案中，所述方法進(jìn)一步包括清洗所述吸收性紙并收集流出物。吸收性紙例如可為微纖維素、混合纖維素酯或硝化纖維素。在一個(gè)實(shí)施方案中，所述吸收性紙為如圖1所示的設(shè)備。所述方法可進(jìn)一步包括:如果抗CK5抗體、抗CK14抗體及任選的抗p63第一抗體與該細(xì)胞結(jié)合，則將所述乳腺癌分類(lèi)為基底樣的。所述方法可進(jìn)一步包括:如果(i)抗CK7抗體和抗CK18第一抗體與該細(xì)胞結(jié)合，并且(ii)抗CK5抗體和抗CK14抗體和抗p63抗體不與該細(xì)胞結(jié)合，則將所述乳腺癌分類(lèi)為管腔型。所述方法可進(jìn)一步包括:如果抗CK5抗體、抗CK14抗體、抗CK7抗體、抗CK18抗體和抗p63第一抗體與該細(xì)胞結(jié)合，則將所述乳腺癌分類(lèi)為普通型導(dǎo)管增生。所述方法可進(jìn)一步包括:如果(i)抗CK7抗體和抗CK18抗體和任選的抗P63抗體與該細(xì)胞結(jié)合，并且(ii)抗CK5抗體和抗CK14抗體不與該細(xì)胞結(jié)合，則將所述癌分類(lèi)為非典型導(dǎo)管增生。所述方法可進(jìn)一步包括:如果(i)所述樣品包含多于一個(gè)細(xì)胞，并且(ii)結(jié)合抗CK5抗體、抗CK14抗體和抗p63抗體的細(xì)胞與結(jié)合抗CK7抗體和抗CK18抗體的細(xì)胞的比例小于或等于浸潤(rùn)性對(duì)照，則將所述癌分類(lèi)為浸潤(rùn)性的。所述方法可進(jìn)一步包括:如果所述樣品包含多于一個(gè)細(xì)胞，并且結(jié)合抗CK5抗體、抗CK14抗體和抗p63抗體的細(xì)胞與結(jié)合抗CK7抗體和抗CK18抗體的細(xì)胞的比例大于或等于非浸潤(rùn)性對(duì)照，則將所述癌分類(lèi)為非浸潤(rùn)性的。將在此類(lèi)方法中使用的NAF樣品可從乳頭抽吸液的典型非分泌者或典型分泌者獲得。
[0012]在某些實(shí)施方案中，本文中公開(kāi)一種組合物，該組合物包含:(a)來(lái)源于吸收在吸收性紙上的乳頭抽吸液的至少一個(gè)細(xì)胞，所述吸收性紙包含微纖維素、混合纖維素酯或硝化纖維素，用于吸收乳頭抽吸液樣品，其中所述吸收性紙的尺寸設(shè)置為覆蓋乳頭；及(b)能與所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗原結(jié)合的抗體，其中所述抗原選自:CK5、CK14、CK7、CK18、p63、CK7 和 CK18。
[0013]在某些實(shí)施方案中，本文中公開(kāi)一種用于對(duì)乳腺癌進(jìn)行分類(lèi)的系統(tǒng)，該系統(tǒng)包括:(a)用于吸收乳頭抽吸液樣品的、包含微纖維素、混合纖維素酯或硝化纖維素的吸收性紙，其中所述吸收性紙的尺寸設(shè)置為覆蓋乳頭；及(b)能與所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗原結(jié)合的抗體，其中所述抗原選自:0(5、0(14、0(7、0(18、？63、0(7和0(18。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)進(jìn)一步包括用于對(duì)結(jié)合到所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗體進(jìn)行可視化的光學(xué)顯微鏡或自動(dòng)化系統(tǒng)。在一些實(shí)施方案中，所述吸收性紙的直徑為約1.0至約
3.0英寸且厚度為約0.01至約0.1英寸。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)進(jìn)一步包括用于對(duì)結(jié)合到所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗體進(jìn)行可視化的工具。在一些實(shí)施方案中，用于對(duì)結(jié)合到所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗體進(jìn)行可視化的工具為一種或多種染色劑。在一些實(shí)施方案中，所述染色劑選自辣根過(guò)氧化物酶、堿性磷酸酶、二氨基聯(lián)苯胺、固紅、蘇木精、曙紅或其組合。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)進(jìn)一步包括用于從所述吸收性紙洗脫所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞的洗滌劑。在一些實(shí)施方案中，所述系統(tǒng)進(jìn)一步包括:配置為執(zhí)行可執(zhí)行指令的任選聯(lián)網(wǎng)的計(jì)算機(jī)處理設(shè)備；以及計(jì)算機(jī)程序，所述計(jì)算機(jī)程序包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以應(yīng)用模型或算法來(lái)分析所述細(xì)胞的軟件模塊。在一些實(shí)施方案中，所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以為個(gè)體指定治療方案的軟件模塊。在一些實(shí)施方案中，所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將顯微照片存儲(chǔ)于顯微照片的數(shù)據(jù)庫(kù)中的軟件模塊。在一些實(shí)施方案中，所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將分析結(jié)果存儲(chǔ)于分析結(jié)果的數(shù)據(jù)庫(kù)中的軟件模塊。在一些實(shí)施方案中，所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞與標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行比較的軟件模塊。在一些實(shí)施方案中，所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將分析結(jié)果傳送至醫(yī)療服務(wù)人員或個(gè)體的軟件模塊。在一些實(shí)施方案中，所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將診斷結(jié)果傳送至醫(yī)療服務(wù)人員或個(gè)體的軟件模塊。在一些實(shí)施方案中，所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以產(chǎn)生包括所述分析結(jié)果的報(bào)告的軟件模塊。在一些實(shí)施方案中，所述吸收性紙為如圖1所示的設(shè)備?！緦?zhuān)利附圖】

【附圖說(shuō)明】
[0014]在所附權(quán)利要求書(shū)中詳細(xì)闡明了本公開(kāi)內(nèi)容的特征。通過(guò)參考以下闡明了說(shuō)明性實(shí)施方案的詳細(xì)說(shuō)明(其中利用了本發(fā)明所公開(kāi)的實(shí)施方案的原理)和附圖，將獲得對(duì)本發(fā)明的組合物、試劑盒和方法的特征和優(yōu)點(diǎn)的更好的理解，附圖中:
[0015]圖1A-B顯示本文中描述的代表性吸收性紙或膜的二維圖形。角度尺寸以英寸±lo和度數(shù)來(lái)提供。圖1A顯示該紙或膜的俯視圖。圖1B顯示側(cè)角(side angle)產(chǎn)生。
【具體實(shí)施方式】
[0016]盡管目前存在幾種用于對(duì)乳腺癌進(jìn)行分子亞型分型的方法，但仍需要更靈敏及可靠的方法。優(yōu)選地，這些方法都是非侵入性的，不需要組織樣品，并且可對(duì)被分類(lèi)為乳頭抽吸液(NAF)分泌者或者非分泌者的個(gè)體使用。
[0017]本文中提供的實(shí)施方案的方法可采用合適的吸乳器設(shè)備來(lái)進(jìn)行，該吸乳器設(shè)備可用于樣品收集，例如在美國(guó)專(zhuān)利號(hào)5，798，266、美國(guó)專(zhuān)利號(hào)6，689，073和美國(guó)專(zhuān)利號(hào)6，887，210中描述的設(shè)備，上述各專(zhuān)利均通過(guò)引用并入本文。在一個(gè)實(shí)施方案中，該設(shè)備為MASCT? 設(shè)備。
[0018]在一些實(shí)施方案中，本文中公開(kāi)的方法需要少于10個(gè)細(xì)胞、少于9個(gè)細(xì)胞、少于8個(gè)細(xì)胞、少于7個(gè)細(xì)胞、少于5個(gè)細(xì)胞、少于4個(gè)細(xì)胞、少于3個(gè)細(xì)胞、少于2個(gè)細(xì)胞。更優(yōu)選地，這些方法需要兩個(gè)細(xì)胞。
[0019]在某些實(shí)施方案中，本文中公開(kāi)了將乳腺癌分類(lèi)為基底樣乳腺癌的方法，該方法包括:(a)使來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14、CK7、CK18和P63的第一抗體接觸；以及(b)如果CK5、CK14及任選的抗p63第一抗體與所述多個(gè)細(xì)胞結(jié)合，則將所述癌分類(lèi)為基底樣的；其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞不是組織。
[0020]在某些實(shí)施方案中，本文中公開(kāi)了將乳腺癌分類(lèi)為管腔型的方法，該方法包括:(a)使來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14、CK7、CK18和p63的第一抗體接觸 '及(b)如果(i)抗CK7和抗CK18第一抗體與所述多個(gè)細(xì)胞結(jié)合，并且(ii)抗CK5、抗CK14和抗p63第一抗體不與所述多個(gè)細(xì)胞結(jié)合，則將所述癌分類(lèi)為管腔型；其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞不是組織。
[0021]在某些實(shí)施方案中，本文中公開(kāi)了將增生分類(lèi)為普通型導(dǎo)管增生的方法，該方法包括:(a)使來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14、CK7、CK18和p63的第一抗體接觸 '及(b)如果CK5、CK14、CK7、CK18和p63第一抗體與所述多個(gè)細(xì)胞結(jié)合，則將所述增生分類(lèi)為普通型導(dǎo)管增生；其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞不是組織。
[0022]在某些實(shí)施方案中，本文中公開(kāi)了將增生分類(lèi)為非典型導(dǎo)管增生的方法，該方法包括:(a)使來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14、CK7、CK18和p63的第一抗體接觸 '及(b)如果(i) CK7和CK18及任選的p63第一抗體與所述多個(gè)細(xì)胞結(jié)合，并且(ii) CK5和CK14第一抗體不與所述多個(gè)細(xì)胞結(jié)合，則將所述增生分類(lèi)為非典型導(dǎo)管增生；其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞不是組織。
[0023]在某些實(shí)施方案中，本文中公開(kāi)了將乳腺癌分類(lèi)為浸潤(rùn)性乳腺癌的方法，該方法包括:(a)使來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14、CK7、CK18和p63的第一抗體接觸 '及(b)如果結(jié)合CK5、CK14和p63第一抗體的細(xì)胞與結(jié)合CK7和CK18第一抗體的細(xì)胞的比例小于或等于浸潤(rùn)性對(duì)照，則將所述癌分類(lèi)為浸潤(rùn)性的；其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞不是組織。在一些實(shí)施方案中，沒(méi)有細(xì)胞結(jié)合CK5、CK14和 p63。
[0024]在某些實(shí)施方案中，本文中公開(kāi)了將乳腺癌分類(lèi)為非浸潤(rùn)性乳腺癌的方法，該方法包括:(a)使來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14、CK7、CK18和P63的第一抗體接觸；及(b)如果結(jié)合CK5、CK14和p63第一抗體的細(xì)胞與結(jié)合CK7和CK18第一抗體的細(xì)胞的比例大于或等于非浸潤(rùn)性對(duì)照，則將所述癌分類(lèi)為非浸潤(rùn)性的；其中所述來(lái)源于乳頭抽吸液(NAF)樣品的多個(gè)細(xì)胞不是組織。
定義
[0025]如本文所使用的，在一些實(shí)施方案中，術(shù)語(yǔ)“治療(“treatment”，“treat”或“treating”)”包括實(shí)現(xiàn)治療益處。治療益處意在包括正在治療的潛在病癥或病況的根除或改善。例如，治療益處包括睡眠相關(guān)呼吸障礙的緩解或部分和/或完全終止。治療益處也可通過(guò)一種或多種與潛在病況相關(guān)的生理或心理癥狀的根除或改善來(lái)實(shí)現(xiàn)，以使得在患者身上觀察到改善，盡管事實(shí)上該患者仍然受到該病況的影響。例如，對(duì)于患有睡眠相關(guān)呼吸障礙的個(gè)體，治療益處包括睡眠破碎(sleep fragmentat1n)的緩解或部分和/或完全終止，或覺(jué)醒或喚醒頻率的降低，或喚醒發(fā)生率的降低。在一些實(shí)施方案中，“治療”提供預(yù)防性益處，包括預(yù)防病況，延緩病況的進(jìn)展，或降低病況發(fā)生的可能性(例如，預(yù)防睡眠相關(guān)呼吸障礙)。如本文所使用的，“治療”包括預(yù)防。
[0026]如本文所使用的，“施用”意指提供治療，例如，開(kāi)具治療、施加治療或分配治療。在一些情況下，施用指醫(yī)療專(zhuān)業(yè)人員開(kāi)具患者適用的治療(例如，患者應(yīng)用CPAP設(shè)備、消耗藥物或注射藥物)。醫(yī)學(xué)治療的施用并不需要醫(yī)療專(zhuān)業(yè)人員的即時(shí)或持續(xù)的監(jiān)督。
乳腺病癥
[0027]正常的乳腺由具有雙層結(jié)構(gòu)的導(dǎo)管和小葉組成。腔分泌細(xì)胞圍繞中空內(nèi)腔，并反過(guò)來(lái)被與基底膜直接接觸的肌上皮細(xì)胞層所圍繞。
乳腺增生
[0028]增生(又稱(chēng)上皮增生或增生性乳腺疾病)是指內(nèi)襯于導(dǎo)管或小葉的細(xì)胞的過(guò)度生長(zhǎng)。當(dāng)增生在導(dǎo)管中時(shí)，稱(chēng)為導(dǎo)管增生或?qū)Ч苌掀ぴ錾?。?dāng)增生影響小葉時(shí)，稱(chēng)為小葉增生。
[0029]增生通常采用芯針活檢或手術(shù)活檢來(lái)診斷?；诩?xì)胞在顯微鏡下的外觀，增生可分為:
[0030]輕度增生:這并不會(huì)增加乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)；
[0031]普通類(lèi)型的增生(沒(méi)有異型性)，也稱(chēng)為普通型增生:乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)為沒(méi)有乳腺異常的女性的乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)的約11/2至2倍。
[0032]非典型增生(非典型導(dǎo)管增生[ADH]或非典型小葉增生[ALH]):乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)為沒(méi)有乳腺異常的女性的乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)的約4至5倍。
乳腺癌
[0033]乳腺癌通常開(kāi)始于小葉或?qū)Ч艿募?xì)胞。乳腺癌可能為“混合瘤”，這意味著其包含癌性導(dǎo)管細(xì)胞和小葉細(xì)胞的混合物。在這類(lèi)情況下，癌被視為導(dǎo)管癌。如果乳腺中存在多于一個(gè)腫瘤，則將乳腺癌描述為多灶性或多中心的。在多灶性乳腺癌中，所有的腫瘤均來(lái)自原始腫瘤，并且它們通常位于乳腺的相同部位。如果癌為多中心的，則意味著所有的腫瘤均分別形成，并且它們通常位于乳腺的不同區(qū)域。
浸潤(rùn)性與非浸潤(rùn)性
[0034]非浸潤(rùn)性癌停留在乳腺的導(dǎo)管或小葉內(nèi)。它們沒(méi)有長(zhǎng)入或侵入乳腺之內(nèi)或之外的正常組織。非浸潤(rùn)性癌有時(shí)稱(chēng)為原位癌(“在同一個(gè)地方”)或癌前病變(pre-cancer)。浸潤(rùn)性癌長(zhǎng)入正常、健康的組織內(nèi)。大多數(shù)乳腺癌是浸潤(rùn)性的。癌是非浸潤(rùn)性的還是浸潤(rùn)性的將會(huì)影響對(duì)其的治療選擇和響應(yīng)。 [0035]乳腺癌可以既為浸潤(rùn)性的又為非浸潤(rùn)性的。這意味著，癌的一部分已經(jīng)長(zhǎng)入正常組織內(nèi)，且癌的一部分已停留在乳導(dǎo)管或乳小葉內(nèi)。在這樣的情況下，這些癌將被視為浸潤(rùn)性的。
[0036]在大多數(shù)情況下，乳腺癌被分類(lèi)為以下中的一種:
[0037]DCIS (原位導(dǎo)管癌):DCIS為停留在乳導(dǎo)管內(nèi)的非浸潤(rùn)性癌。
[0038]MIC (微浸潤(rùn)性乳腺癌，MICB和DCISM):MIC為DCIS的一種亞型。它具有小于1.0mm的尺寸，且約10%或更少的MIC細(xì)胞已經(jīng)離開(kāi)導(dǎo)管組織(原始腫瘤部位)。
[0039]LCIS(原位小葉癌):LCIS為停留在小葉內(nèi)的細(xì)胞的過(guò)度生長(zhǎng)。其表明發(fā)展為浸潤(rùn)性癌的風(fēng)險(xiǎn)增加。
[0040]IDC(浸潤(rùn)性導(dǎo)管癌):乳腺癌最常見(jiàn)的類(lèi)型，浸潤(rùn)性導(dǎo)管癌開(kāi)始于乳導(dǎo)管，但已經(jīng)長(zhǎng)入乳腺內(nèi)的周?chē)＝M織。
[0041]ILC (浸潤(rùn)性小葉癌):1LC在小葉內(nèi)開(kāi)始，但已經(jīng)長(zhǎng)入乳腺內(nèi)的周?chē)＝M織。
【權(quán)利要求】
1.一種用于對(duì)乳腺癌進(jìn)行分類(lèi)的系統(tǒng)，其包括: (a)用于吸收乳頭抽吸液樣品的、包含微纖維素、混合纖維素酯或硝化纖維素的吸收性紙，其中所述吸收性紙的尺寸設(shè)置為覆蓋乳頭； (b)能與所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗原結(jié)合的抗體，其中所述抗原選自:CK5、CK14、CK7、CK18、p63、CK7 和 CK18 ；以及 (c)用于對(duì)結(jié)合到所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗體進(jìn)行可視化的光學(xué)顯微鏡或自動(dòng)化系統(tǒng)。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其中所述吸收性紙的直徑為約1.0至約3.0英寸且厚度為約0.01至約0.1英寸。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，進(jìn)一步包括用于對(duì)結(jié)合到所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗體進(jìn)行可視化的工具。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的系統(tǒng)，其中用于對(duì)結(jié)合到所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗體進(jìn)行可視化的工具為一種或多種染色劑。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的系統(tǒng)，其中所述染色劑選自辣根過(guò)氧化物酶、堿性磷酸酶、二氨基聯(lián)苯胺、固紅、蘇木精、曙紅或其組合。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，進(jìn)一步包括用于從所述吸收性紙洗脫所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞的洗滌劑。
7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，進(jìn)一步包括:配置為執(zhí)行可執(zhí)行指令的任選聯(lián)網(wǎng)的計(jì)算機(jī)處理設(shè)備；以及計(jì)算機(jī)程序，所述計(jì)算機(jī)程序包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以應(yīng)用模型或算法來(lái)分析所述細(xì)胞的軟件模塊。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的系統(tǒng)，其中所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以為個(gè)體指定治療方案的軟件模塊。
9.根據(jù)權(quán)利要求7所述的系統(tǒng)，其中所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將顯微照片存儲(chǔ)于顯微照片的數(shù)據(jù)庫(kù)中的軟件模塊。
10.根據(jù)權(quán)利要求7所述的系統(tǒng)，其中所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將分析結(jié)果存儲(chǔ)于分析結(jié)果的數(shù)據(jù)庫(kù)中的軟件模塊。
11.根據(jù)權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其中所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞與標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行比較的軟件模塊。
12.根據(jù)權(quán)利要求7所述的系統(tǒng)，其中所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將分析結(jié)果傳送至醫(yī)療服務(wù)人員或個(gè)體的軟件模塊。
13.根據(jù)權(quán)利要求7所述的系統(tǒng)，其中所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將診斷結(jié)果傳送至醫(yī)療服務(wù)人員或個(gè)體的軟件模塊。
14.根據(jù)權(quán)利要求7所述的系統(tǒng)，其中所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以產(chǎn)生包括所述分析結(jié)果的報(bào)告的軟件模塊。
15.根據(jù)權(quán)利要求7所述的系統(tǒng)，其中所述吸收性紙為如圖1所示的設(shè)備。
16.一種編碼有計(jì)算機(jī)程序的非暫時(shí)性計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì)，所述計(jì)算機(jī)程序包括可由計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的指令，以創(chuàng)建應(yīng)用，所述應(yīng)用包括: (a)配置為應(yīng)用模型或算法來(lái)分析吸收在吸收性紙上的乳頭抽吸液樣品的細(xì)胞的軟件模塊，所述吸收性紙的尺寸設(shè)置為覆蓋乳頭，且其中所述細(xì)胞進(jìn)一步包含能與CK5、CK14、CK7、CK18、p63、CK7和CK18結(jié)合的抗體；以及 (b)配置為為個(gè)體指定治療方案的軟件模塊。
17.根據(jù)權(quán)利要求16所述的存儲(chǔ)介質(zhì)，其中所述吸收性紙的直徑為約1.0至約3.0英寸且厚度為約0.01至約0.1英寸。
18.根據(jù)權(quán)利要求16所述的存儲(chǔ)介質(zhì)，其中所述模型或算法將細(xì)胞與標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行比較。
19.根據(jù)權(quán)利要求16所述的存儲(chǔ)介質(zhì)，其中所述應(yīng)用進(jìn)一步包括顯微照片在計(jì)算機(jī)存儲(chǔ)器中的數(shù)據(jù)庫(kù)。
20.根據(jù)權(quán)利要求16所述的存儲(chǔ)介質(zhì)，其中所述應(yīng)用進(jìn)一步包括分析結(jié)果在計(jì)算機(jī)存儲(chǔ)器中的數(shù)據(jù)庫(kù)。
21.根據(jù)權(quán)利要求16所述的存儲(chǔ)介質(zhì)，其中所述應(yīng)用進(jìn)一步包括配置為產(chǎn)生包括分析結(jié)果的報(bào)告的軟件模塊。
22.根據(jù)權(quán)利要求16所述的存儲(chǔ)介質(zhì)，其中所述吸收性紙為如圖1所示的設(shè)備。
23.一種用于對(duì)乳腺癌進(jìn)行分類(lèi)的方法，其包括: (a)使吸收在吸收性紙上的乳頭抽吸液樣品的細(xì)胞與能結(jié)合CK5、CK14、CK7、CK18和P63的抗體接觸，其中所述吸收性紙的尺寸設(shè)置為覆蓋乳頭； (b)檢測(cè)所述抗體中的一種或多種與所述細(xì)胞的結(jié)合；以及 (c)基于第一抗體的結(jié)合模式對(duì)所述癌進(jìn)行分類(lèi)；其中來(lái)源于所述乳頭抽吸液(NAF)樣品的細(xì)胞不是組織。
24.根據(jù)權(quán)利要求23所述的方法，其中所述吸收性紙的直徑為約1.0至約3.0英寸且厚度為約0.01至約0.1英寸。
25.根據(jù)權(quán)利要求23所述的方法，其中檢測(cè)所述一種或多種抗體的結(jié)合進(jìn)一步包括采用染色劑對(duì)細(xì)胞進(jìn)行染色，所述染色劑選自辣根過(guò)氧化物酶、堿性磷酸酶、二氨基聯(lián)苯胺、固紅、蘇木精、曙紅及其組合。
26.根據(jù)權(quán)利要求23所述的方法，進(jìn)一步包括清洗所述吸收性紙并收集流出物。
27.根據(jù)權(quán)利要求23所述的方法，其中所述吸收性紙包含微纖維素、混合纖維素酯或硝化纖維素。
28.根據(jù)權(quán)利要求23所述的方法，其中所述吸收性紙為如圖1所示的設(shè)備。
29.根據(jù)權(quán)利要求23所述的方法，進(jìn)一步包括:如果抗CK5抗體、抗CK14抗體及任選的抗P63第一抗體與所述細(xì)胞結(jié)合，則將所述乳腺癌分類(lèi)為基底樣的。
30.根據(jù)權(quán)利要求23所述的方法，進(jìn)一步包括:如果⑴抗CK7抗體和抗CK18第一抗體與所述細(xì)胞結(jié)合，并且(ii)抗CK5抗體和抗CK14抗體和抗p63抗體不與所述細(xì)胞結(jié)合，則將所述乳腺癌分類(lèi)為管腔型。
31.根據(jù)權(quán)利要求23所述的方法，進(jìn)一步包括:如果抗CK5抗體、抗CK14抗體、抗CK7抗體、抗CK18抗體和抗p63第一抗體與所述細(xì)胞結(jié)合，則將所述乳腺癌分類(lèi)為普通型導(dǎo)管增生。
32.根據(jù)權(quán)利要求23所述的方法，進(jìn)一步包括:如果⑴抗CK7抗體和抗CK18抗體和任選的抗p63抗體與所述細(xì)胞結(jié)合,并且(ii)抗CK5抗體和抗CK14抗體不與所述細(xì)胞結(jié)合，則將所述癌分類(lèi)為非典型導(dǎo)管增生。
33.根據(jù)權(quán)利要求23所述的方法，進(jìn)一步包括:如果(i)所述樣品包含多于一個(gè)細(xì)胞，并且(i)結(jié)合抗CK5抗體、抗CK14抗體和抗p63抗體的細(xì)胞與結(jié)合抗CK7抗體和抗CK18抗體的細(xì)胞的比例小于或等于浸潤(rùn)性對(duì)照，則將所述癌分類(lèi)為浸潤(rùn)性的。
34.根據(jù)權(quán)利要求23所述的方法，進(jìn)一步包括:如果(i)所述樣品包含多于一個(gè)細(xì)胞，并且(ii)結(jié)合抗CK5抗體、抗CK14抗體和抗p63抗體的細(xì)胞與結(jié)合抗CK7抗體和抗CK18抗體的細(xì)胞的比例大于或等于非浸潤(rùn)性對(duì)照，則將所述癌分類(lèi)為非浸潤(rùn)性的。
35.根據(jù)權(quán)利要求23所述的方法，其中所述NAF樣品從乳頭抽吸液的典型非分泌者或典型分泌者獲得。
36.一種組合物，其包含:(a)來(lái)源于吸收到吸收性紙上的乳頭抽吸液的至少一個(gè)細(xì)胞，所述吸收性紙包含微纖維素、混合纖維素酯或硝化纖維素，用于吸收乳頭抽吸液樣品，其中所述吸收性紙的尺寸設(shè)置為覆蓋乳頭 '及(b)能與所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗原結(jié)合的抗體，其中所述抗原選自:CK5、CK14、CK7、CK18、p63、CK7和CK18。
37.一種用于對(duì)乳腺癌進(jìn)行分類(lèi)的系統(tǒng)，其包括: (a)用于吸收乳頭抽吸液樣品的、包含微纖維素、混合纖維素酯或硝化纖維素的吸收性紙，其中所述吸收性紙的尺寸設(shè)置為覆蓋乳頭 '及 (b)能與所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗原結(jié)合的抗體，其中所述抗原選自:CK5、CK14、CK7、CK18、p63、CK7 和 CK18。
38.根據(jù)權(quán)利要求37所述的系統(tǒng)，進(jìn)一步包括用于對(duì)結(jié)合到所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗體進(jìn)行可視化的光學(xué)顯微鏡或自動(dòng)化系統(tǒng)。
39.根據(jù)權(quán)利要求37所述的系統(tǒng)，其中所述吸收性紙的直徑為約1.0至約3.0英寸且厚度為約0.01至約0.1英寸。
40.根據(jù)權(quán)利要求37所述的系統(tǒng)，進(jìn)一步包括用于對(duì)結(jié)合到所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗體進(jìn)行可視化的工具。
41.根據(jù)權(quán)利要求40所述的系統(tǒng)，其中用于對(duì)結(jié)合到所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞上的抗體進(jìn)行可視化的工具為一種或多種染色劑。
42.根據(jù)權(quán)利要求41所述的系統(tǒng)，其中所述染色劑選自辣根過(guò)氧化物酶、堿性磷酸酶、二氨基聯(lián)苯胺、固紅、蘇木精、曙紅或其組合。
43.根據(jù)權(quán)利要求37所述的系統(tǒng)，進(jìn)一步包括用于從所述吸收性紙洗脫所述乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞的洗滌劑。
44.根據(jù)權(quán)利要求37所述的系統(tǒng)，進(jìn)一步包括:配置為執(zhí)行可執(zhí)行指令的任選聯(lián)網(wǎng)的計(jì)算機(jī)處理設(shè)備；以及計(jì)算機(jī)程序，所述計(jì)算機(jī)程序包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以應(yīng)用模型或算法來(lái)分析所述細(xì)胞的軟件模塊。
45.根據(jù)權(quán)利要求44所述的系統(tǒng)，其中所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以為個(gè)體指定治療方案的軟件模塊。
46.根據(jù)權(quán)利要求44所述的系統(tǒng)，其中所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將顯微照片存儲(chǔ)于顯微照片的數(shù)據(jù)庫(kù)中的軟件模塊。
47.根據(jù)權(quán)利要求44所述的系統(tǒng)，其中所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將分析結(jié)果存儲(chǔ)于分析結(jié)果的數(shù)據(jù)庫(kù)中的軟件模塊。
48.根據(jù)權(quán)利要求44所述的系統(tǒng)，其中所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將乳頭抽吸液樣品中的細(xì)胞與標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行比較的軟件模塊。
49.根據(jù)權(quán)利要求44所述的系統(tǒng)，其中所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將分析結(jié)果傳送至醫(yī)療服務(wù)人員或個(gè)體的軟件模塊。
50.根據(jù)權(quán)利要求44所述的系統(tǒng)，其中所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以將診斷結(jié)果傳送至醫(yī)療服務(wù)人員或個(gè)體的軟件模塊。
51.根據(jù)權(quán)利要求44所述的系統(tǒng)，其中所述計(jì)算機(jī)程序進(jìn)一步包括由所述計(jì)算機(jī)處理設(shè)備執(zhí)行的、以產(chǎn)生包括所述分析結(jié)果的報(bào)告的軟件模塊。
52.根據(jù)權(quán)利 要求44所述的系統(tǒng)，其中所述吸收性紙為如圖1所示的設(shè)備。
【文檔編號(hào)】G01N33/574GK104040346SQ201280064297
【公開(kāi)日】2014年9月10日 申請(qǐng)日期:2012年10月24日 優(yōu)先權(quán)日:2011年10月24日
【發(fā)明者】史蒂文·C·夸伊, 書(shū)志·陳 申請(qǐng)人:阿托薩遺傳學(xué)公司