本專利申請要求2014年10月7日提交的美國臨時(shí)專利申請?zhí)?2/060,621的優(yōu)先權(quán)，該專利申請的公開內(nèi)容全文以引用方式并入本文。
背景技術(shù)：
：在一些情況下，檢測復(fù)雜基質(zhì)(如，食物、創(chuàng)傷流出物、唾液、痰、糞便)中的特定細(xì)胞(如，微生物)可能較為困難，因?yàn)榛|(zhì)包含與檢測系統(tǒng)的一種或多種組分干擾的物質(zhì)(如，生物分子、酶、化學(xué)品、離子)。因此，操作人員通常使用各種方法來降低基質(zhì)中所發(fā)現(xiàn)物質(zhì)的抑制作用。一種降低基質(zhì)效應(yīng)的方法是稀釋含基質(zhì)的樣本，以降低抑制物質(zhì)的濃度。然而，此方法可限制測試的總體檢測靈敏度。降低樣本基質(zhì)效應(yīng)的另一種方法是使用免疫磁性分離(IMS)來隔離和/或凈化所關(guān)注的細(xì)胞，如Chen等人在“AutomatedimmunomagneticseparationforthedetectionofEscherichiacoliO157:H7fromspinach”(用于檢測菠菜中大腸桿菌O157:H7的自動(dòng)免疫磁性分離，2014年，國際食品微生物學(xué)雜志，179:33-37)中對此有所描述。此方法已廣為應(yīng)用，因?yàn)椴捎米詣?dòng)化過程，消除了需要操作人員干預(yù)的步驟，以實(shí)現(xiàn)從基質(zhì)物質(zhì)中有用地分離出靶細(xì)胞。此外，使用IMS方法已得到改進(jìn)的檢測靈敏度。盡管在樣本制備上有進(jìn)步，但對于快速簡單地制備用于檢測靶細(xì)胞的樣本的方法，仍然存在需求。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素：總體而言，本公開涉及檢測靶細(xì)胞(如，微生物)的方法和裝置。具體地講，本公開涉及使用色譜分離裝置在色譜分離裝置內(nèi)的預(yù)定位置富集靶細(xì)胞，并隨后從裝置釋放預(yù)定位置和/或靶細(xì)胞。從裝置釋放預(yù)定位置和/或靶細(xì)胞之后，可使用本領(lǐng)域中已知的各種檢測過程中的一種或多種來檢測和任選地識別細(xì)胞。有利的是，本公開的方法和裝置相對于非靶細(xì)胞和其它可能以其它方式干擾靶細(xì)胞檢測的顆?；蚍肿觼砀患屑?xì)胞。此外，通過此方法實(shí)現(xiàn)的富集提供增強(qiáng)的靶細(xì)胞檢測靈敏度，在靶細(xì)胞以低濃度存在于樣本中時(shí)尤其如此。在一個(gè)方面，本公開提供了檢測靶微生物的第一方法。該方法可包括使液體樣本接觸樣本制備裝置的多孔載體，所述裝置包括具有第一開口和第二開口的殼體以及多孔載體。多孔載體包括位于第一預(yù)定位置處的樣本接收區(qū)和位于第二預(yù)定位置處的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)，多孔載體限定從樣本接收區(qū)延伸穿過靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的第一流體通路。第二流體通路穿過殼體從第一開口延伸到第二開口，第二流體通路在靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)與多孔載體相交。第一方法還可包括：使液體樣本的至少一部分從樣本接收區(qū)朝向靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)縱向移動(dòng)穿過多孔載體；在液體的至少一部分移動(dòng)到靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)之后，迫使脫離構(gòu)件穿過第二流體通路從第一開口到達(dá)第二開口，并從而排出靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的一部分；以及處理靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的該部分或從其釋放的細(xì)胞，以檢測靶微生物的指示。在另一方面，本公開提供了檢測靶微生物的第二方法。該方法可包括使液體樣本接觸樣本制備裝置的多孔載體，所述裝置包括具有第一開口和第二開口的殼體，以及多孔載體。多孔載體包括位于第一預(yù)定位置處的樣本接收區(qū)和位于第二預(yù)定位置處的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)，多孔載體限定從樣本接收區(qū)延伸穿過靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的第一流體通路。第二流體通路穿過殼體從第一開口延伸到第二開口，第二流體通路在靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)與多孔載體相交。第二方法還可包括：使液體樣本的至少一部分從樣本接收區(qū)朝向靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)縱向移動(dòng)穿過多孔載體；在液體的至少一部分移動(dòng)到靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)之后，如果存在于第二流體通路中，則迫使靶釋放溶液穿過第二流體通路，并從而將包含靶微生物的靶釋放溶液的一部分排出裝置；以及處理釋放溶液的部分以檢測靶微生物的指示。在第一方法和第二方法的上述任意實(shí)施方案中，在液體的至少一部分移動(dòng)到靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)之后，該方法還包括使洗滌溶劑經(jīng)由第二流體通路穿過多孔載體的步驟。在第一方法和第二方法的上述任意實(shí)施方案中，該方法還可包括鄰近第二開口定位接收器，其中排出靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的一部分或排出釋放溶液的一部分進(jìn)一步包括將靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的該部分或釋放溶液的該部分移動(dòng)到接收器中。在又一方面，本公開提供了裝置。該裝置可包括：包括內(nèi)部、第一開口和第二開口的殼體；以及包括樣本接收區(qū)和靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的多孔載體。多孔載體限定從樣本接收區(qū)延伸至靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的第一流體通路。多孔載體的至少一部分設(shè)置在殼體的內(nèi)部。包括中心軸線的第二流體通路從第一開口和第二開口延伸穿過殼體，第二流體通路在靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)與多孔載體相交。中心軸線可取向成與多孔載體正交。在上述任意實(shí)施方案中，殼體還可包括沿通路從樣本端口延伸至殼體內(nèi)部的第一導(dǎo)管。在上述任意實(shí)施方案中，殼體還可包括沿通路從第一開口延伸至殼體內(nèi)部的第二導(dǎo)管。在上述任意實(shí)施方案中，裝置還可包括鄰近第二開口設(shè)置的吸收主體，其中吸收主體與多孔載體間隔開。在上述任意實(shí)施方案中，裝置還可包括尺寸被設(shè)計(jì)為從第一開口到第二開口橫貫第二流體通路的脫離構(gòu)件，其中脫離構(gòu)件的一部分以可滑動(dòng)的方式接合第二流體通路。在上述任意實(shí)施方案中，脫離構(gòu)件可包括切割結(jié)構(gòu)。在上述任意實(shí)施方案中，脫離構(gòu)件可被構(gòu)造成用于迫使含水液體穿過第二導(dǎo)管。在又一方面，本公開提供了試劑盒。該試劑盒可包括上述任意實(shí)施方案的裝置。在任意實(shí)施方案中，試劑盒還可包括洗滌液體。在任意實(shí)施方案中，試劑盒還可包括釋放溶液。術(shù)語“包括”及其變型形式在說明書和權(quán)利要求中出現(xiàn)這些術(shù)語的地方不具有限制的含義。本文所用的“一種(個(gè))”、“所述(該)”、“至少一種(個(gè))”以及“一種(個(gè))或多種(個(gè))”可互換使用。因此，例如，結(jié)合配體可理解為“一個(gè)或多個(gè)”結(jié)合配體。術(shù)語“和/或”意指所列要素的一個(gè)或全部，或者所列要素的任何兩個(gè)或更多個(gè)的組合。另外，在本文中，通過端點(diǎn)表述的數(shù)值范圍包括該范圍內(nèi)包含的所有數(shù)值(例如，1至5包括1、1.5、2、2.75、3、3.80、4、5等)。本發(fā)明的上述
發(fā)明內(nèi)容并非意圖描述本發(fā)明的每一個(gè)公開的實(shí)施方案或本發(fā)明的每種實(shí)施方式。以下描述更具體地舉例說明示例性實(shí)施方案。在本專利申請的全文的若干處，通過示例列表提供了指導(dǎo)，這些示例可以各種組合使用。在每種情況下，引用的列表都只用作代表性的組，而不應(yīng)理解為排它性列表。這些及其它實(shí)施方案的附加細(xì)節(jié)在下文附圖和描述中示出。通過具體實(shí)施方式、附圖和權(quán)利要求書，其它特征、對象和優(yōu)點(diǎn)將變得顯而易見。附圖說明圖1是根據(jù)本公開的樣本制備裝置的一個(gè)實(shí)施方案的局部分解透視圖。圖2為圖1的裝置的平面圖。圖3為圖1的裝置的底視圖。圖4為圖2的裝置沿線4-4截取的橫截面?zhèn)纫晥D，圖中移除了兩個(gè)蓋元件，以示出延伸穿過殼體的第二流體通路。圖5為根據(jù)本公開的由基底支撐的多孔載體的一個(gè)實(shí)施方案的透視圖。圖6為圖5的由基底支撐的多孔載體的底視圖。圖7為樣本制備裝置的一個(gè)實(shí)施方案的橫截面?zhèn)纫晥D，該樣本制備裝置包括鄰近第二開口設(shè)置的吸收主體。圖8為根據(jù)本公開的樣本制備裝置的一個(gè)實(shí)施方案的分解透視圖，該樣本制備裝置包括用于加載樣本的導(dǎo)管和沿第二流體通路延伸的導(dǎo)管。圖9為圖8的樣本制備裝置的平面圖。圖10為圖9的裝置沿線10-10截取的橫截面?zhèn)纫晥D。圖11A為根據(jù)本公開包括脫離構(gòu)件的樣本制備裝置的局部分解橫截面?zhèn)纫晥D。圖11B為圖11A的脫離構(gòu)件的頂端的細(xì)部圖。圖12A為圖10的樣本制備裝置的局部剖視側(cè)視圖，該裝置包括設(shè)置在其中第一操作位置的脫離構(gòu)件。圖12B為圖10的樣本制備裝置的局部剖視側(cè)視圖，該裝置包括設(shè)置在其中第二操作位置的脫離構(gòu)件。圖12C為圖10的樣本制備裝置的局部剖視側(cè)視圖，該裝置包括設(shè)置在其中第三操作位置的脫離構(gòu)件。圖13為根據(jù)本公開的樣本制備裝置的局部分解透視圖，該裝置包括具有在殼體外部延伸的樣本接收區(qū)的多孔載體。圖14為圖13的裝置的平面圖。圖15為圖14的裝置沿線15-15截取的橫截面?zhèn)纫晥D。圖16為圖15的裝置的側(cè)視圖。具體實(shí)施方式在詳細(xì)解釋本發(fā)明的任何實(shí)施方案之前，應(yīng)當(dāng)了解，本發(fā)明在其應(yīng)用中不僅限于下文說明中所提及或下文附圖中所示出的構(gòu)造細(xì)節(jié)和部件布置方式。本發(fā)明能夠具有其它實(shí)施方案，并且能夠通過各種方式實(shí)踐或進(jìn)行。另外，應(yīng)當(dāng)理解，本文使用的措詞和術(shù)語是用于說明目的而不應(yīng)被視為限制性的。本文使用的“包括”、“包含”或“具有”及其變型形式意在涵蓋其后列出的項(xiàng)目及其等同形式以及附加的項(xiàng)目。除非另外說明或限定，否則術(shù)語“連接”和“聯(lián)接”及其變型形式均按廣義使用，并且涵蓋直接和間接這兩方面的連接和聯(lián)接。此外，“連接”和“聯(lián)接”不限于物理或機(jī)械連接或聯(lián)接。應(yīng)當(dāng)理解，在不脫離本公開范圍的情況下，可采用其它實(shí)施方案并且可進(jìn)行結(jié)構(gòu)性或邏輯性變更。此外，術(shù)語例如“前面”“后面”“頂部”“底部”等僅用于描述與另一個(gè)元件相關(guān)的元件，但絕非意圖說明裝置的具體方位，表明或暗示裝置必需或需要的方位，或指定在應(yīng)用中如何使用、安裝、展示或放置本文所述的發(fā)明。本公開整體涉及有利于檢測靶細(xì)胞(如，靶微生物或微生物組)的方法和裝置。如本文所用，“靶細(xì)胞”是指在樣本中的存在(或不存在)情況待確定的特定細(xì)胞(如，普通細(xì)胞、癌細(xì)胞)。如本文所用，“靶微生物”是指在樣本中的存在(或不存在)情況待確定的特定微生物。靶微生物可能是病原生物體，或也可能是存在情況與其它生物體(其中一些可能為病原性生物體)的存在情況相關(guān)聯(lián)的非病原生物體。具體地講，本公開涉及采用色譜分離裝置的方法，其中色譜分離裝置被構(gòu)造成有利于去除在其中捕獲的靶細(xì)胞，且不必拆卸或部分拆卸色譜分離裝置。有利的是，本公開的方法和裝置允許操作人員釋放捕獲細(xì)胞中的至少一個(gè)，以供進(jìn)一步分析之用。甚至更有利的是，至少一個(gè)捕獲的細(xì)胞可輕松直接地釋放并進(jìn)入接收器(如，反應(yīng)管)，且不會(huì)不當(dāng)?shù)貙⒃摬糠直┞兜娇赡艿奈廴驹础１竟_的一個(gè)方面是，其可用于檢測各種樣本物質(zhì)上存在的靶細(xì)胞的方法。本發(fā)明的裝置和方法可用于希望檢測樣本物質(zhì)(如，食物樣本、土壤樣本、水樣本、臨床樣本)上存在的細(xì)胞(如，微生物)的多種應(yīng)用。在任意實(shí)施方案中，樣本物質(zhì)可得自各種表面，包括但不限于食物表面(如，牛胴體、生產(chǎn)的外表面)、食物處理表面、水或水膜表面、患者表面、患者治療表面、醫(yī)院環(huán)境表面、臨床環(huán)境表面和法醫(yī)環(huán)境表面。這些樣本可大致由單獨(dú)的或成多種組合的固體、半固體、凝膠狀或液態(tài)材料組成。在本公開方法的任意實(shí)施方案中，樣本懸浮在能夠移動(dòng)(如，通過毛細(xì)作用力)穿過多孔載體的液體(如，含水液體)中。本公開的裝置以及本發(fā)明的方法可用于定性或定量地測定來自初始樣本的一種或多種所關(guān)注的細(xì)胞的存在。要在樣本中檢測的所關(guān)注的示例性細(xì)胞是金黃色葡萄球菌(“S.aureus”)。這是致使廣譜感染的病原體，廣譜感染包括：表面損傷，諸如小面積的皮膚膿腫和傷口感染；系統(tǒng)性病癥和危及生命的病癥，諸如心內(nèi)膜炎、肺炎和敗血病；以及中毒癥，例如食物中毒和中毒性休克綜合征。一些菌株(例如，耐甲氧西林金黃色葡萄球菌，也稱MRSA)能夠耐受除少數(shù)幾種抗生素以外的幾乎所有抗生素。要在食物加工區(qū)域和樣本中檢測的所關(guān)注的示例性分析物是李斯特菌屬的成員。李斯特菌被分類為革蘭氏陽性桿狀細(xì)菌，并包括如下：單核細(xì)胞增多性李斯特菌(Listeriamonocytogenes)、無害李斯特菌(L.innocua)、威氏李斯特菌(L.welshimeri)、斯氏李斯特菌(L.seeligeri)、綿羊李斯特菌(L.ivanovii)和格雷氏李斯特菌(L.grayi)。其中，單核細(xì)胞增多性李斯特菌是造成大多數(shù)人李斯特菌病例的原因，并且免疫失能者、孕婦、老年人和新生兒具有增加的易受感染性。李斯特菌病的最普通癥狀是敗血病、腦膜炎和流產(chǎn)。特別關(guān)注用于分析目的的其他微生物包括原核生物和真核生物，特別是革蘭氏陽性細(xì)菌、革蘭氏陰性細(xì)菌、真菌、支原體和酵母。具體地講，相關(guān)的生物體包括以下科或?qū)俚某蓡T：腸桿菌科、或微球菌科或葡萄球菌屬、鏈球菌屬、假單胞菌屬、腸球菌屬、沙門氏菌屬、軍團(tuán)桿菌屬、志賀菌屬、耶爾森氏鼠疫桿菌屬、腸桿菌屬、大腸桿菌屬、芽孢桿菌屬、弧菌屬、梭菌屬、棒狀桿菌屬、曲霉菌屬、鐮刀菌屬和念珠菌屬。具體地講，致命生物體包括：金黃色葡萄球菌(包括耐藥菌株，諸如耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA))、表皮葡萄球菌、肺炎鏈球菌、無乳鏈球菌、化膿性鏈球菌、糞腸球菌、耐萬古霉素腸球菌(VRE)、耐萬古霉素金黃色葡萄球菌(VRSA)、萬古霉素中介耐藥的金黃色葡萄球菌(VISA)、炭疽桿菌、綠膿桿菌、大腸桿菌、黑曲霉菌、煙曲霉菌、棒曲霉菌、腐皮鐮刀菌、尖孢鐮刀菌、厚孢鐮刀菌、霍亂弧菌、副溶血性弧菌、豬霍亂沙門氏菌、傷寒沙門氏菌、鼠傷寒沙門氏菌、白色念珠菌、光滑念珠菌、克柔氏念珠菌、阪崎腸桿菌、大腸桿菌O157、含ESBL的微生物、以及多種耐藥革蘭氏陰性桿菌(MDR)。圖1至圖4示出根據(jù)本公開的樣本制備裝置1000的一個(gè)實(shí)施方案的各種視圖。樣本制備裝置1000包括包圍多孔載體30的至少一部分的殼體100。在任意實(shí)施方案中，殼體100可為中空的(即，可包括其中設(shè)置有多孔載體30的空隙空間)。如圖1至圖4的例示的實(shí)施方案所示，任選的隔件40側(cè)面相接多孔載體30的至少一部分或圍繞全部多孔載體。盡管在文本例示的實(shí)施方案中顯示為一體部件，但設(shè)想隔件可包括可能或可能沒有互連的多個(gè)部件(未示出)。隔件40的功能是將殼體100的部件間隔開，并從而形成其中設(shè)置有多孔載體30的空隙空間。多孔載體30包括樣本接收區(qū)32和與樣本接收區(qū)間隔開的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34。因此，多孔載體30限定從樣本接收區(qū)延伸至靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的第一流體通路70。這樣，當(dāng)液體樣本(如，含水液體樣本(未示出))接觸多孔載體30(如，在樣本接收區(qū)32處)，樣本中的至少一部分液體從樣本接收區(qū)移動(dòng)到靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34。在任意實(shí)施方案中，液體例如通過毛細(xì)管作用力、重力、離心力或前述力中任意兩種或更多種的組合移動(dòng)穿過多孔載體30。在任意實(shí)施方案中，多孔載體30可為大致平坦的(即，片狀)，并由此限定平面。在圖1至圖4的例示的實(shí)施方案中，殼體100包括兩個(gè)單獨(dú)形成的部件的組件，該部件包括限定殼體的第一側(cè)的第一件10和限定與殼體的第一側(cè)相對的第二側(cè)的第二件20。第一件10包括面向外部的第一側(cè)12和面向內(nèi)部的第二側(cè)14。第二側(cè)14面向多孔載體30。第二件20包括面向外部的第四側(cè)24和面向內(nèi)部的第三側(cè)22。第三側(cè)22面向多孔載體30。例示的實(shí)施方案的殼體100還包括有助于包封多孔載體30的任選隔件40。在任意實(shí)施方案中，第一件10可包含使用本領(lǐng)域已知的工藝(如，擠出、模塑、澆注、壓印)形成的金屬、玻璃或聚合物材料(如，聚烯烴、聚酯、聚苯乙烯或它們的組合)。在任意實(shí)施方案中，第二件20可包含使用本領(lǐng)域已知的工藝(如，擠出、模塑、澆注、壓印、3D打印)形成的金屬、玻璃或聚合物材料(如，聚烯烴、聚酯、聚苯乙烯或它們的組合)。在任意實(shí)施方案中，第一件10可包含與第二件20相同的材料和/或與第二件20不同的材料。在任意實(shí)施方案中，殼體100的第一件10的一部分或全部以及第二件20的一部分或全部由光可透射的材料(如，聚合物材料)制成。因此，可通過觀察光穿過殼體100，以光學(xué)方式(如，目視)檢測設(shè)置在多孔載體30上和/或中的光學(xué)可檢測型指示劑。優(yōu)選地，第一件10和第二件20兩者均包含防水材料，和/或還包含分別設(shè)置在第二側(cè)14和第三側(cè)22上的防水涂層(如，疏水性粘合劑涂層，未示出)。如果第二側(cè)14上存在任選的疏水性粘合劑，則其可將第一件10聯(lián)接到隔件40、多孔載體30和/或第二件20。類似地，如果第三側(cè)22上存在任選的疏水性粘合劑(粘合劑層26)，則其可將第二件20聯(lián)接到隔件40、多孔載體30和/或第一件10。在任意實(shí)施方案中，隔件40在任一或全部兩側(cè)上涂覆任選的粘合劑層(未示出)，以有利于將隔件40聯(lián)接到第一件10和/或第二件20。設(shè)想在任意實(shí)施方案中，裝置的殼體可為一體部件(未示出)。一體殼體可例如使用本領(lǐng)域熟知的工藝(如，注塑)通過模塑熱塑性聚合物形成。一體殼體可包括開口(如，可密封的開口)，多孔載體的一部分或全部可穿過該開口插入殼體中。返回附圖，殼體100包括樣本端口50、與樣本端口間隔開的第一開口60和與第一開口相對的第二開口64。第一開口60和第二開口64優(yōu)選地對準(zhǔn)或部分對準(zhǔn)，使得物體可沿穿過第一開口60和第二開口64兩者的大致直線(未示出)傳遞。第一開口60與第二開口64的尺寸可以相同或不同。樣本端口50鄰近第一流體通路(本文所述的第一流體通路70)的起點(diǎn)設(shè)置，第一流體通路延伸穿過多孔載體30，從樣本端口50到達(dá)并超出第一開口60。樣本端口50和第一開口60任選地設(shè)置在同一側(cè)，并且在殼體100的同一件上。樣本端口50提供進(jìn)入多孔載體的樣本接收區(qū)32附近的多孔載體30的路徑。因此，在圖1至圖4例示的實(shí)施方案中，樣本接收區(qū)32設(shè)置在殼體100的內(nèi)部。第一開口和第二開口(分別為第一開口60和第二開口64)限定延伸穿過殼體100的第二流體通路的終點(diǎn)。第二流體通路74(圖4)包括中心軸線75并且在預(yù)定位置處(即，在本文所述的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34處)與多孔載體30相交。在任意實(shí)施方案中，第二流體通路74的路徑為大致直的。因此，第一開口60和第二開口64中的每一者提供經(jīng)由第二流體通路74直接進(jìn)入靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34附近的多孔載體30的路徑。在根據(jù)本公開的裝置的任意實(shí)施方案中，第二流體通路74的中心軸線75取向成與由多孔載體30限定的第一流體通路正交。第二流體通路74起到至少兩種功能：i)提供流體通路，使液體(如，含水液體，諸如緩沖液)經(jīng)過多孔載體的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34；以及ii)提供入口(如，第一開口60)，本文所述的脫離構(gòu)件可通過該入口插入裝置1000并被迫使穿過第二流體通路74，由此脫離多孔載體30的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34的至少一部分或另選地全部，以及提供出口(如，第二開口64)，靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的脫離部分可通過該出口排出裝置。另選地，設(shè)想第二開口64可用作入口并且第一開口60可用作出口。在任意實(shí)施方案中，第一開口60和第二開口64中的任一者或兩者的形狀和尺寸可被設(shè)計(jì)為接收液體分配器械(如，注射器)。一個(gè)或多個(gè)開口的尺寸還可被設(shè)計(jì)為與液體分配器械聯(lián)接(例如，通過摩擦配合)，使得聯(lián)接大致密封，以免出現(xiàn)液體泄漏。有利的是，具有此構(gòu)造的裝置有利于使用正壓、負(fù)壓或它們的組合使液體(例如，緩沖溶液)經(jīng)過多孔載體30的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34。在任意實(shí)施方案中，樣本制備裝置1000任選地還可包括一個(gè)或多個(gè)蓋元件(如，分別為第一蓋元件68c、第二蓋元件68a和第三蓋元件68b)，這些蓋元件可移除地分別覆蓋樣本端口50、第一開口60和/或第二開口64。蓋元件68a-68c可由合適的材料(如，塑料)制成，并且尺寸和形狀可被設(shè)計(jì)為例如提供摩擦配合、按扣配合或擰入式連接到端口或開口。另選地，在任意實(shí)施方案中，蓋元件的尺寸可被設(shè)計(jì)為提供例如摩擦配合、按扣配合或擰入式連接到延伸穿過端口或開口的凸緣(未示出)。另選地，在任意實(shí)施方案中，蓋元件68a-68c可包括一薄層塑料膜、金屬箔等，該層覆蓋開口，并任選地包括可移除地將蓋元件固定到殼體100的粘合劑涂層(未示出)，如圖1至圖4中所示。在任意實(shí)施方案中，一個(gè)或多個(gè)蓋元件(蓋元件68a-68c)可能為易碎的。因此，如上所述驅(qū)使脫離構(gòu)件穿過第二流體通路還包括驅(qū)使脫離構(gòu)件穿過第二蓋元件68a和/或第三蓋元件68b。多孔載體30允許液體樣本的增溶和/或懸浮組分(如，細(xì)胞、蛋白質(zhì)、核酸、鹽)從樣本接收區(qū)朝向靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)縱向(如，側(cè)向)芯吸或流動(dòng)。通常，側(cè)向流裝置呈多孔材料條的形式(如，尺寸為4-8mm×40-80mm)。優(yōu)選的是，多孔材料例如由硝化纖維素膜、聚偏氟乙烯(PVDF)、尼龍或單一多孔材料基質(zhì)(如，F(xiàn)usion5TM(可購自英國米德爾塞克斯的沃特曼公司(Whatman,Middlesex,UK))，并如美國專利申請公布號2006/0040408中所述)構(gòu)成。樣本接收區(qū)32為其上施用有含樣本液體(未示出)的多孔載體30的區(qū)域，并且一旦施用，含樣本液體穿過載體30朝向靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34從其縱向移動(dòng)(如，通過毛細(xì)作用)。相對于垂直流動(dòng)穿過膜過濾器，例如樣本縱向移動(dòng)穿過多孔載體30有利地改善從顆粒(如，土壤、灰塵、食物顆粒、非靶細(xì)胞)和/或分子(如，蛋白質(zhì)、脂肪、鹽、螯合劑)中分離樣本中的靶細(xì)胞(如，微生物)，這些顆粒和分子可能以其它方式抑制或干擾靶細(xì)胞或與其相關(guān)的靶分子的檢測。如本文所用，“靶分子”和“靶生物分子”是指指示樣本中是否存在靶細(xì)胞的分子。在圖1至圖4例示的實(shí)施方案中，可經(jīng)由樣本端口50觸及樣本接收區(qū)。在使用中，例如，蓋元件68c(如果存在的話)被移動(dòng)或移除以露出樣本端口50，并且一定容量(如，預(yù)定容量)的含樣本液體可傾倒或吸移到多孔載體30的露出樣本接收區(qū)32中。另選地，樣本端口50可浸入樣本(未示出)一段足夠長的時(shí)間，使得一部分樣本吸收到多孔載體中。靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34為包括固定的結(jié)合配體(如，抗體、結(jié)合蛋白、凝集素、寡核苷酸)的多孔載體30的預(yù)定區(qū)域。結(jié)合配體(未示出)優(yōu)先結(jié)合鏈接到靶細(xì)胞(如，靶微生物)的靶分子(如，表面蛋白質(zhì)、脂多糖、肽聚糖)。這樣，通過形成與靶分子的鍵，固定的結(jié)合配體在多孔載體30的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34處固定靶細(xì)胞。使用本領(lǐng)域中熟知的方法將結(jié)合配體固定到多孔載體30上和/或固定在其中。隨著攜帶靶細(xì)胞(未示出)穿過靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34并且液體遷移穿過多孔載體30，靶分子結(jié)合到結(jié)合配體，致使靶細(xì)胞變?yōu)楣潭ㄔ诎屑?xì)胞結(jié)合區(qū)34。這樣，靶細(xì)胞有效地濃縮在樣本制備裝置1000的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)。在任意實(shí)施方案中，本公開的多孔載體可由基底支撐。在任意實(shí)施方案中，多孔載體還可聯(lián)接(如，粘合聯(lián)接)到基底。有利的是，將多孔載體固定到基底可有利于組裝裝置，并有利于將多孔載體的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)與殼體的第一開口和第二開口對準(zhǔn)。此外，在多孔載體接觸液體樣本之后，基底有助于保持靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)與殼體的第一開口和第二開口對準(zhǔn)，這可能致使多孔載體溶脹。圖5和圖6示出由基底35支撐的多孔載體30的一個(gè)實(shí)施方案的各種視圖。基底35可使用不吸水的材料制成。合適的材料包括例如玻璃、塑料膜、金屬箔或它們的組合。在任意實(shí)施方案中，多孔載體30可聯(lián)接(如，通過粘合劑，未示出)到基底35。在任意實(shí)施方案中，基底35可包括鄰近多孔載體30的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34的弱區(qū)36。弱區(qū)36可包括一個(gè)或多個(gè)有刻痕的段、一個(gè)或多個(gè)薄弱的接合點(diǎn)、或有利于分離基底35的部分37的穿孔。在組裝好的裝置中，弱區(qū)優(yōu)選地對準(zhǔn)第二流體通路，使得當(dāng)脫離構(gòu)件被迫使穿過第二流體通路時(shí)，脫離構(gòu)件沿多孔載體30的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34(在圖5中顯示為陰影區(qū)域)的一部分(未示出)或全部脫離基底35的部分37。返回圖1，在任意實(shí)施方案中，本公開的樣本制備裝置可任選地包括流動(dòng)指示劑80，以指示液體樣本已移動(dòng)穿過多孔載體30，從樣本接收區(qū)32移動(dòng)到或超出靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34。流動(dòng)指示劑80為本領(lǐng)域中已知的側(cè)向流免疫診斷裝置，并可包括例如微粒。微?？砂軌蚪Y(jié)合到固定在流動(dòng)指示劑控制區(qū)38處的對應(yīng)結(jié)合配體(如，抗生物素蛋白)的表面分子(如，生物素)。將結(jié)合配體固定到多孔載體30的方法在本領(lǐng)域中是熟知的。此外，微?？砂軌蚩梢暤赜^察的著色或熒光染料或顏料。流動(dòng)指示劑80可由液體樣本攜帶穿過多孔載體30到達(dá)流動(dòng)指示劑控制區(qū)38。流動(dòng)指示劑控制區(qū)38為預(yù)定區(qū)域，通常設(shè)置在多孔載體30上和/或其中的某一位置處，其中靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34設(shè)置在樣本接收區(qū)32與流動(dòng)指示劑控制區(qū)38之間。在使用過程中，液體樣本遷移穿過多孔載體30，從樣本接收區(qū)32朝向并超出靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34，并由此移動(dòng)流動(dòng)指示劑80朝向流動(dòng)指示劑控制區(qū)38。當(dāng)流動(dòng)指示劑80到達(dá)流動(dòng)指示劑控制區(qū)38時(shí)，它們結(jié)合到對應(yīng)的結(jié)合配體，從而致使流動(dòng)指示劑80出現(xiàn)可觀測到的積聚(如，積聚為著色或熒光線條或點(diǎn))。返回圖1，在根據(jù)本公開的樣本制備裝置1000的任意實(shí)施方案中，裝置任選地包括一個(gè)或多個(gè)標(biāo)記15。標(biāo)記15可對準(zhǔn)多孔載體30的任選流動(dòng)指示劑控制區(qū)38，從而指示流動(dòng)指示劑控制區(qū)38的某個(gè)位置，在該位置，可能無法以其它方式從多孔載體30的其它部分區(qū)分開來直至流動(dòng)指示劑80結(jié)合到流動(dòng)指示劑控制區(qū)38。在任意實(shí)施方案中，樣本制備裝置的殼體可包括鄰近流動(dòng)控制結(jié)合區(qū)的任選觀察窗口(未示出)，以有利于觀察結(jié)合到其的流動(dòng)指示劑。在任意實(shí)施方案中，本公開的樣本制備裝置可任選地包括鄰近第二開口設(shè)置的吸收主體。圖7示出了包括吸收主體85的樣本制備裝置1001的一個(gè)實(shí)施方案。裝置1001包括殼體100，殼體具有第一件10、第二件20和任選的隔件40，各自如本文所述。裝置1001還包括樣本端口50、第一開口60、第二開口64和第二流體通路74，各自如本文所述。吸收主體85鄰近第二開口64設(shè)置，并且與第二流體通路74流體連通。因此，隨著液體(如，洗滌溶液)被迫使經(jīng)由第二流體通路74穿過多孔載體30的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)(圖7中未示出)，液體被吸收主體85吸收并保留。在任意實(shí)施方案中，吸收主體85可任選地聯(lián)接(如，經(jīng)由粘合劑，未示出)到殼體100。除此之外或另選地，吸收主體85可由覆蓋第二開口64的蓋元件(如，圖1例示的實(shí)施方案中所示的第三蓋元件68b)保持在合適位置以及任選地聯(lián)接到蓋元件。吸收主體85與多孔載體30間隔開，使得吸收主體不與經(jīng)過由多孔載體限定的第一流體通路70的液體流體連通。然而，吸收主體85與第二流體通路74流體連通，并因此接收被迫使經(jīng)由第二流體通路穿過裝置1001的液體。吸收主體85可使用能夠吸收被迫使經(jīng)由第二流體通路74穿過裝置1001的液體(如，含水液體)的任何吸收材料制成。合適材料的非限制性示例包括泡沫(如，開孔泡沫)、海綿、紗布、棉花等。在任意實(shí)施方案中，該材料可包含超吸收聚合物(如，聚丙烯酸酯/聚丙烯酰胺共聚物)和/或它們的顆粒。在任意實(shí)施方案中，本公開的樣本制備裝置任選地可包括從開口延伸到多孔載體的至少一個(gè)導(dǎo)管。圖8至圖10示出包括多個(gè)導(dǎo)管的樣本制備裝置1002的一個(gè)實(shí)施方案，每個(gè)導(dǎo)管從殼體101中的開口延伸至多孔載體30。殼體101包括第一件10'、第二件20和任選的隔件40，如本文所述。多孔載體30包括樣本接收區(qū)32和靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34，并且限定從樣本接收區(qū)32延伸至并超出靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34的第一流體通路70。第二件20具有第三側(cè)22和與第一側(cè)相對的第四側(cè)24。第二件20還包括第二開口64和可將第二件聯(lián)接到第一件10'和/或隔件40的任選粘合劑層26，各自如本文所述。裝置1002還包括鄰近殼體101外部的第二開口64設(shè)置的吸收主體85。樣本制備裝置1002的第一件10'包括從其延伸的兩個(gè)導(dǎo)管(如，分別為第一導(dǎo)管52和第二導(dǎo)管62)。任選的第一導(dǎo)管52在殼體101的遠(yuǎn)側(cè)端部包括樣本端口50。第一導(dǎo)管52具有其中可沉積(如，通過傾倒或吸移)液體樣本的內(nèi)部體積。內(nèi)部體積由第一導(dǎo)管52的長度和直徑限定，并因此能夠保持操作人員希望傳遞經(jīng)過多孔載體30的任何液體體積。有利的是，第一導(dǎo)管52允許操作人員將樣本分配到導(dǎo)管中然后走開，同時(shí)液體遷移進(jìn)入多孔載體30。在任意實(shí)施方案中，任選的第三導(dǎo)管(未示出)可從第二開口64延伸。任選的第二導(dǎo)管62在殼體101的遠(yuǎn)側(cè)末端包括第一開口60。第二導(dǎo)管62也具有其中可沉積(如，通過傾倒或吸移)液體的內(nèi)部體積。可使用洗滌溶液例如沖洗非靶生物分子、碎屑和/或化學(xué)品，這些物質(zhì)存在于靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34處，但未具體結(jié)合到在靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)處固定的結(jié)合配體。內(nèi)部體積由第二導(dǎo)管62的長度和直徑限定，并因此能夠保持操作人員希望傳遞經(jīng)過多孔載體30的任何液體體積。有利的是，第二導(dǎo)管62允許操作人員將液體(如，洗滌溶液、指示試劑)分配到第一開口60，并使液體經(jīng)由第二流體通路74經(jīng)過多孔載體30。例如，液體可通過負(fù)壓和重力流經(jīng)過多孔載體30，或者另選地可使用本文所述的脫離構(gòu)件通過正壓迫使液體經(jīng)過多孔載體。特別有利的是，包括與第二流體通路對準(zhǔn)的第二導(dǎo)管的本公開的裝置允許操作人員采用活塞流方法使大量洗滌溶劑(相對于多孔載體的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的空隙體積)經(jīng)過靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)。例如，如果多孔載體為約0.2mm厚并且靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)設(shè)置在約6mm2的區(qū)域中，靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的空隙體積可為約5-25μL。在該示例中，使500μL洗滌溶劑經(jīng)過多孔載體的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)導(dǎo)致用約20-100倍液體體積洗滌多孔載體。這進(jìn)而導(dǎo)致顯著稀釋和/或從靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)移除未結(jié)合的物質(zhì)。在任意實(shí)施方案中，本公開的樣本制備裝置還包括任選的脫離構(gòu)件。圖11A為根據(jù)本公開包括脫離構(gòu)件500的樣本制備裝置1003的一個(gè)實(shí)施方案。脫離構(gòu)件500以可滑動(dòng)的方式接合第二流體通路74，并可用于脫離多孔載體30的一部分(如，包括靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的一部分，未示出)并將該部分排出裝置1003，如本文所述。脫離構(gòu)件500包括具有頂端592的軸591。軸591的尺寸被設(shè)計(jì)為橫貫第二流體通路74至少從第一開口60到第二開口64的長度。此外，脫離構(gòu)件500任選地包括可用于迫使軸591的頂端592(如，使用手動(dòng)壓力)穿過裝置1003的第二流體通路74的柄部595。脫離構(gòu)件500可使用本領(lǐng)域中熟知的方法(如，擠出或模塑工藝)由多種材料形成，材料包括但不限于塑料、玻璃、木材、金屬以及它們的組合。圖11B示出了圖11A的脫離構(gòu)件500的頂端592的細(xì)部圖。在任意實(shí)施方案中，頂端可被構(gòu)造成用于形成與裝置的第二導(dǎo)管62的大致不透液密封。有利的是，在這些實(shí)施方案中，可使用脫離構(gòu)件500迫使位于第二導(dǎo)管62中的液體(未示出)穿過第二流體通路74。在任意實(shí)施方案中，脫離構(gòu)件500的軸591可包括任選的密封件593(如，橡膠O形環(huán))，以有利于脫離構(gòu)件500與第二導(dǎo)管62的壁之間的可滑動(dòng)接觸。在任意實(shí)施方案中，脫離構(gòu)件500的頂端592可被構(gòu)造成有利于樣本制備裝置的一部分多孔載體的脫離(即，頂端592可包括切割結(jié)構(gòu))。例如，頂端592可呈凹形(未示出)，從而形成有利于切割多孔載體的周邊邊緣。另選地，頂端592可包括有利于切割多孔載體的切割特征結(jié)構(gòu)(如，鋸齒形邊，未示出)。另選地，頂端592可大致缺乏切割特征結(jié)構(gòu)(即，頂端592可為鈍的)。脫離構(gòu)件可用于在本公開的樣本處理裝置中執(zhí)行多種功能。因此，可通過相對于樣本制備裝置的殼體將脫離構(gòu)件從一個(gè)操作位置移動(dòng)到另一個(gè)操作位置來實(shí)現(xiàn)多種功能。圖12A至圖12C示出了本公開的樣本處理裝置中脫離構(gòu)件的若干操作位置。圖12A示出了設(shè)置在相對于樣本制備裝置1003的第一操作位置中的脫離構(gòu)件500的一個(gè)實(shí)施方案。例示的實(shí)施方案的裝置1003包括包圍多孔載體30的殼體101，如本文所公開。殼體101包括位于一側(cè)的第一開口60和與第一開口相對的第二開口64，如本文所述。第一開口設(shè)置在從殼體101延伸的第二導(dǎo)管62的端部處，如本文所述。在該實(shí)施方案中，脫離構(gòu)件500的頂端(即，軸591的頂端592，如圖11A所示)以可滑動(dòng)的方式接合裝置1003的第一開口60中。在第一操作位置，脫離構(gòu)件用作閉合件，用于防止外部物質(zhì)通過第一開口60進(jìn)入裝置1003，從而防止可能污染或以其它方式干擾樣本制備裝置1003的多孔載體30的一部分(如，靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)，未示出)。圖12B示出了圖12A的樣本制備裝置1003，其中脫離構(gòu)件500設(shè)置在第二操作位置(即，脫離構(gòu)件的頂端鄰近多孔載體30設(shè)置)。脫離構(gòu)件500從第一操作位置移動(dòng)到第二操作位置可實(shí)現(xiàn)至少兩個(gè)功能：i)移動(dòng)脫離構(gòu)件可將脫離構(gòu)件500鄰近多孔載體30定位，之后再使用脫離構(gòu)件來切割和/或脫離多孔載體的一部分；以及ii)如果第二導(dǎo)管62的內(nèi)部體積中存在液體(如，如本文所述的洗滌液體)，則移動(dòng)脫離構(gòu)件可迫使該液體經(jīng)由第二流體通路(如圖11A中所示的第二流體通路74)穿過多孔載體。通過迫使液體經(jīng)由第二流體通路穿過多孔載體，操作人員可稀釋或洗掉可能以其它方式抑制或干擾在方法的后續(xù)步驟中檢測靶細(xì)胞的非靶顆粒和/或分子(如，蛋白質(zhì)、脂肪、核酸、鹽、螯合劑。)圖12C示出了圖12A的樣本制備裝置1003，其中脫離構(gòu)件500設(shè)置在第三操作位置(即，脫離構(gòu)件的頂端鄰近第二開口64設(shè)置)。脫離構(gòu)件500從第一操作位置或第二操作位置到第三操作位置的移動(dòng)起到脫離多孔載體的一部分(脫離部分30a，例如，其可包括多孔載體30的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的至少一部分或全部)的作用。此外，脫離構(gòu)件500到第三操作位置的移動(dòng)任選地從殼體101中排出多孔載體的脫離部分30a，供進(jìn)一步處理以檢測與靶細(xì)胞相關(guān)聯(lián)的靶分子。圖12C還示出了可鄰近第二開口64定位的接收器600(如，反應(yīng)管)，并且脫離部分30a可由脫離構(gòu)件500排出并進(jìn)入該接收器。在任意實(shí)施方案中，樣本制備裝置可通過僅將樣本接收部分浸入液體樣本來具體地調(diào)節(jié)以便獲得樣本。圖13至圖16示出樣本制備裝置1004的一個(gè)實(shí)施方案的各種視圖，該裝置通過浸漬來具體地調(diào)節(jié)以便獲得樣本。裝置1004包括殼體102，殼體具有第一件10和第二件20(兩者均如在本文中所述)和任選的隔件41。任選的隔件41包括開口端42。裝置1004包括具有靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)34的多孔載體30，如本文所述。多孔載體30的樣本接收區(qū)32延伸穿過隔件41的開口端42和殼體102的外部。因此，樣本接收區(qū)32易于浸入液體樣本(未示出)，以便樣本移動(dòng)到并穿過多孔載體30。裝置1004包括形成第二流體通路74的終點(diǎn)的第一開口60和第二開口64，如本文所述。在另一方面，本公開提供用于檢測樣本中的靶細(xì)胞的試劑盒。該試劑盒包括本文所述樣本制備裝置的任意實(shí)施方案。在任意實(shí)施方案中，試劑盒還包括本文所述脫離構(gòu)件的任意實(shí)施方案。脫離構(gòu)件的尺寸被設(shè)計(jì)為從第一開口到第二開口橫貫側(cè)向通道，如本文所述。在任意實(shí)施方案中，脫離構(gòu)件以可滑動(dòng)的方式接合樣本制備裝置的第二流體通路。在任意實(shí)施方案中，脫離構(gòu)件被構(gòu)造成用于迫使含水液體穿過殼體(如，穿過殼體的第二導(dǎo)管)。在任意實(shí)施方案中，試劑盒還包括用于核酸擴(kuò)增的洗滌液體和/或試劑(如，引物、核糖核苷酸三磷酸腺苷、脫氧核糖核苷酸三磷酸腺苷、聚合酶)。在任意實(shí)施方案中，試劑盒可包括釋放溶液，如下文所述。在另一方面，本公開提供用于檢測樣本中靶細(xì)胞(如，靶微生物)的第一方法。第一方法包括將液體樣本與本文所公開樣本制備裝置的任意實(shí)施方案的多孔載體接觸。在第一方法的任意實(shí)施方案中，樣本制備裝置包括具有第一開口、第二開口和多孔載體的殼體。多孔載體包括位于第一預(yù)定位置處的樣本接收區(qū)和位于與第一預(yù)定位置間隔開的第二預(yù)定位置處的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)。此外，多孔載體限定在樣本接收區(qū)與靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)之間延伸的第一流體通路。多孔載體的至少一部分設(shè)置在殼體中。第二流體通路從第一開口和第二開口延伸穿過殼體，第二流體通路在靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)與多孔載體相交。在第一方法的任意實(shí)施方案中，將液體樣本與多孔載體接觸包括將液體樣本與多孔載體的樣本接收區(qū)接觸，如本文所述。在第一方法的任意實(shí)施方案中，將液體樣本與多孔載體接觸包括將得自富集培養(yǎng)物的液體樣本與多孔載體(在樣本接收區(qū)處)接觸。有利的是，富集培養(yǎng)物的一部分可直接加載到樣本制備裝置中，并且富集培養(yǎng)物中存在的靶細(xì)胞(如，微生物)可在靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)捕獲以供進(jìn)一步分析，如本文所述。第一方法還包括如下步驟：使液體樣本的至少一部分從至少樣本接收區(qū)向靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)(如，縱向)移動(dòng)穿過多孔載體；在液體的至少一部分移動(dòng)到靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)之后，迫使脫離構(gòu)件穿過第二流體通路從第一開口到達(dá)第二開口，從而排出靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的一部分或全部；以及處理靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的該部分，以檢測靶微生物的指示。隨著液體移動(dòng)到靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)，如果樣本中存在靶細(xì)胞，液體即攜帶靶細(xì)胞穿過多孔載體。此外，液體可攜帶與靶細(xì)胞無關(guān)的其它顆粒(如，土壤、灰塵、食物顆粒、非靶細(xì)胞)和分子(如，蛋白質(zhì)、脂肪、核酸、鹽、螯合劑)。這些非靶顆粒和分子可能可干擾后續(xù)可用于檢測樣本中是否存在靶細(xì)胞的分析過程(如，核酸擴(kuò)增過程)。隨著液體樣本遷移穿過多孔載體的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)，靶細(xì)胞(如果存在的話)可結(jié)合到在靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)附接到多孔載體的結(jié)合配體(如，抗體、凝集素、核酸)，如本文所述。樣本中存在的至少一些非靶顆粒和分子可相對于靶細(xì)胞被阻釋，原因是液體穿過多孔載體，并因此不在靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)與靶細(xì)胞共聚積。此外，至少一些非靶顆粒和分子繼續(xù)隨液體流動(dòng)穿過靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)，從而將這些非靶顆粒和分子從靶細(xì)胞分離開來。因此，第一方法將靶細(xì)胞(如果存在的話)從可能干擾或以其它方式抑制用于檢測靶細(xì)胞的流程(如，核酸擴(kuò)增檢測流程)的非靶顆粒和分子分離開來。在第一方法的任意實(shí)施方案中，在液體的至少一部分移動(dòng)穿過樣本制備裝置到達(dá)靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)之后，該方法包括迫使脫離構(gòu)件穿過第二流體通路從第一開口到達(dá)第二開口，從而脫離并排出靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的一部分。在第一方法的任意實(shí)施方案中，脫離并排出靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的一部分可包括脫離并排出全部靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)。處理靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的該部分以檢測靶微生物的指示可使用本領(lǐng)域已知的任何合適檢測過程執(zhí)行，包括但不限于培養(yǎng)方法、生物化學(xué)方法(如，檢測與靶微生物相關(guān)聯(lián)的酶活動(dòng))、免疫方法(如，免疫染色、ELISA)、組織學(xué)方法(如，組織學(xué)染色)和基因方法(如，核酸擴(kuò)增、雜交)。在任意實(shí)施方案中，擴(kuò)增核酸序列可包括擴(kuò)增與靶微生物相關(guān)聯(lián)的核苷酸序列。核酸擴(kuò)增的特別優(yōu)選方法包括用3MTM分子檢測系統(tǒng)(購自明尼蘇達(dá)州圣保羅的3M公司(3MCompany,St.Paul,MN))實(shí)現(xiàn)的等溫DNA擴(kuò)增和生物發(fā)光檢測方法。在第一方法的任意實(shí)施方案中，在液體的至少一部分移動(dòng)到靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)之后，該方法任選還可包括使洗滌溶劑經(jīng)由第二流體通路穿過多孔載體。洗滌溶液的用途是從靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)洗掉與靶細(xì)胞無關(guān)的任何未結(jié)合雜質(zhì)(如，顆粒(如，土壤、灰塵、食物顆粒、非靶細(xì)胞))和/或分子(如，蛋白質(zhì)、脂肪、核酸、鹽、螯合劑)?？衫缤ㄟ^迫使(如，經(jīng)由注射器或吸移管)洗滌溶劑(如，無菌水、緩沖溶液)穿過第二流體通路，使洗滌溶液穿過多孔載體。有利的是，由于樣本制備裝置的第二流體通路取向成與第一流體通路正交，因此洗滌溶劑將未結(jié)合的材料(如，蛋白質(zhì)、核酸、細(xì)胞片段、食物顆粒、鹽)從多孔載體的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)洗掉，從而消除可能以其它方式干擾結(jié)合到靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的靶分析物的檢測的材料。當(dāng)如本文所述裝置中存在第二導(dǎo)管時(shí)，洗滌溶劑可裝載到第二導(dǎo)管中，并且可迫使該溶劑穿過多孔載體，例如通過重力流，或利用柱塞或本文所述的脫離構(gòu)件經(jīng)由施加在液體上的正壓。此任選的步驟可顯著減少初始樣本中某些物質(zhì)的數(shù)量，這些物質(zhì)可能干擾或以其它方式降低用于處理靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的部分以檢測靶微生物指示的后續(xù)流程的靈敏度。在第一方法的任意實(shí)施方案中，洗滌溶劑經(jīng)由第二流體通路穿過多孔載體可在從樣本處理裝置頂出多孔載體的部分之前或之后執(zhí)行。在另選的實(shí)施方案(未示出)中，將負(fù)壓源(如，真空軟管)可操作地施加于第二開口，以抽吸穿過第二流體通路的洗滌溶劑。在本公開第一方法的任意實(shí)施方案中，該方法任選地包括處理多孔載體的排出部分或任何從其釋放的細(xì)胞，以致使細(xì)胞裂解。多種致使細(xì)胞裂解的合適方法在本領(lǐng)域中是已知的，并且包括但不限于物理裂解方法(如，煮沸、超聲處理、弗氏細(xì)胞壓碎器空化)和化學(xué)裂解方法(如，使樣本接觸洗滌劑、表面活性劑、季胺、離液劑或有機(jī)溶劑)。因此，多孔載體的排出部分或任何從其洗脫的細(xì)胞可以致使細(xì)胞裂解的方式處理，以釋放指示是否存在靶細(xì)胞的可檢測生物分子(如，內(nèi)部或外部生物分子，諸如蛋白質(zhì)、酶、多糖、核酸)，或?yàn)榱藵B透細(xì)胞以便接觸檢測部分(如，引物、聚合酶、標(biāo)記抗體)從而與細(xì)胞內(nèi)的可檢測分子交互。有利的是，靶細(xì)胞可原位(即，在多孔載體的頂出部分)裂解，或者另選地，細(xì)胞可從多孔載體的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)釋放，之后再進(jìn)行處理以致使細(xì)胞裂解?？赏ㄟ^本領(lǐng)域中已知的任何合適方法從靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)釋放細(xì)胞。例如，如果捕獲靶細(xì)胞的結(jié)合配體為抗體，則可通過使靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的頂出部分與合適的釋放溶液(如，具有可致使結(jié)合到抗體的靶細(xì)胞抗原釋放的合適pH值和/或離子強(qiáng)度的含水溶液)接觸來釋放靶細(xì)胞。因此，隨著釋放溶液穿過結(jié)合有靶細(xì)胞的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)，靶細(xì)胞即釋放到釋放溶液中。在任意實(shí)施方案中，第一方法還可包括鄰近第二開口定位接收器。在任意實(shí)施方案中，接收器可大致不含生物材料。在任意實(shí)施方案中，迫使脫離構(gòu)件穿過第二流體通路以脫離靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的至少一部分進(jìn)一步可包括將多孔載體的一部分(如，靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的至少一部分或全部)移入接收器，如圖12C所示。有利的是，以此方式執(zhí)行多孔載體的部分的傳輸可消除多孔載體的部分與殼體外部的生物材料潛在源之間發(fā)生接觸的可能性。處理靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的頂出部分的優(yōu)選方法包括使用購自明尼蘇達(dá)州圣保羅的3M公司(3MCompany,St.Paul,MN)的分子檢測系統(tǒng)(在下文中稱為“MDS”)處理該部分。因此，靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的該部分可直接排出到MDS裂解管中，并且可處理所得溶胞產(chǎn)物的等分試樣以擴(kuò)展和檢測用于指示是否存在靶微生物的核酸。在另一方面，本公開提供檢測樣本中靶細(xì)胞(如，靶微生物)的第二方法。第二方法包括將液體樣本與本文所公開樣本制備裝置的任意實(shí)施方案的多孔載體接觸。在第二方法的任意實(shí)施方案中，樣本制備裝置包括具有第一開口、第二開口和多孔載體的殼體。多孔載體包括位于第一預(yù)定位置處的樣本接收區(qū)和位于與第一預(yù)定位置間隔開的第二預(yù)定位置處的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)。此外，多孔載體限定在樣本接收區(qū)于靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)之間延伸的第一流體通路。多孔載體的至少一部分設(shè)置在殼體中。第二流體通路從第一開口和第二開口延伸穿過殼體，第二流體通路在靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)與多孔載體相交。在第二方法的任意實(shí)施方案中，將液體樣本與多孔載體接觸包括將液體樣本與多孔載體的樣本接收區(qū)接觸，如本文所述。在第二方法的任意實(shí)施方案中，將液體樣本與多孔載體接觸包括將得自富集培養(yǎng)物的液體樣本與多孔載體(在樣本接收區(qū)處)接觸。有利的是，富集培養(yǎng)物的一部分可直接加載到樣本制備裝置中，并且富集培養(yǎng)物中存在的靶細(xì)胞(如，微生物)可在靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)捕獲以供進(jìn)一步處理和分析，如本文所述。第二方法還可包括如下步驟：使液體樣本的至少一部分從至少樣本接收區(qū)向靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)(如，縱向)移動(dòng)穿過多孔載體；在液體的至少一部分移動(dòng)到靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)之后，如果存在于第二流體通路中，則迫使釋放溶液穿過第二流體通路，并從而將包含靶微生物的釋放溶液的一部分排出裝置；以及處理靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的該部分以檢測靶微生物的指示。隨著液體移動(dòng)到靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)，如果樣本中存在靶細(xì)胞，液體即攜帶靶細(xì)胞穿過多孔載體。此外，液體可攜帶與靶細(xì)胞無關(guān)的其它顆粒(如，土壤、灰塵、食物顆粒、非靶細(xì)胞)和分子(如，蛋白質(zhì)、脂肪、核酸、鹽、螯合劑)。這些非靶顆粒和分子可能可干擾后續(xù)可用于檢測樣本中是否存在靶細(xì)胞的分析過程(如，核酸擴(kuò)增過程)。隨著液體樣本遷移穿過多孔載體的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)，靶細(xì)胞(如果存在的話)可結(jié)合到在靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)處附接到多孔載體的結(jié)合配體(如，抗體、凝集素、核酸)，如本文所述。樣本中存在的至少一些非靶顆粒和分子可相對于靶細(xì)胞被阻釋，原因是液體穿過多孔載體，并因此不在靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)處與靶細(xì)胞共聚積。此外，至少一些非靶顆粒和分子繼續(xù)隨液體流動(dòng)穿過靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)，從而將這些非靶顆粒和分子從靶細(xì)胞分離開來。因此，第二方法將靶細(xì)胞(如果存在的話)從可能干擾或以其它方式抑制用于檢測靶細(xì)胞的流程(如，核酸擴(kuò)增檢測流程)的非靶顆粒和分子分離開來。這樣，在第二方法的任意實(shí)施方案中，在液體的至少一部分移動(dòng)到靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)之后，該方法任選地包括使洗滌溶劑經(jīng)由第二流體通路穿過多孔載體。洗滌溶液的用途是從靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)洗掉與靶細(xì)胞無關(guān)的任何未結(jié)合雜質(zhì)(如，顆粒(如，土壤、灰塵、食物顆粒、非靶細(xì)胞)和/或分子(如，蛋白質(zhì)、脂肪、核酸、鹽、螯合劑))?？衫缤ㄟ^迫使(如，經(jīng)由注射器或吸移管)洗滌溶劑(如，無菌水、緩沖溶液)穿過第二流體通路，使洗滌溶液穿過多孔載體。有利的是，由于樣本制備裝置的第二流體通路取向成與第一流體通路正交，因此洗滌溶劑將未結(jié)合的材料(如，蛋白質(zhì)、核酸、細(xì)胞片段、食物顆粒、鹽)從多孔載體的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)洗掉，從而消除可能以其它方式干擾對結(jié)合到靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的靶細(xì)胞的檢測的材料。當(dāng)如本文所述裝置中存在第二導(dǎo)管時(shí)，洗滌溶劑可裝載到第二導(dǎo)管中，并且可迫使該溶劑穿過多孔載體，例如通過重力流，或利用柱塞或本文所述的脫離構(gòu)件經(jīng)由施加在液體上的正壓。此任選的步驟可顯著減少初始樣本中某些物質(zhì)的數(shù)量，這些物質(zhì)可能干擾或以其它方式降低用于處理靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的部分以檢測靶微生物指示的后續(xù)流程的靈敏度。在另選的實(shí)施方案(未示出)中，將負(fù)壓源(如，真空軟管)可操作地施加于第二開口，以抽吸穿過第二流體通路的洗滌溶劑。本公開的第二方法包括迫使釋放溶液穿過第二流體通路并因此將包含靶微生物(如果存在于第二流體通路中的話)的釋放溶液的一部分排出裝置。使用本領(lǐng)域中已知的任何合適釋放溶液從靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)釋放細(xì)胞。例如，如果捕獲靶細(xì)胞的結(jié)合配體為抗體，靶細(xì)胞的釋放方式可為：迫使(如，通過正壓、負(fù)壓或重力流)合適的釋放溶液(如，具有可致使結(jié)合到抗體的靶細(xì)胞抗原釋放的合適pH值和/或離子強(qiáng)度的含水溶液)穿過第二流體通路，以及收集(如，收集在反應(yīng)管中)經(jīng)由第二開口離開第二流體通路的釋放溶液的該部分。因此，隨著釋放溶液穿過結(jié)合有靶細(xì)胞的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)，靶細(xì)胞即釋放到釋放溶液中并與經(jīng)由第二開口離開裝置的釋放溶液一起被收集。在任意實(shí)施方案中，第二方法還可包括鄰近第二開口定位接收器。在任意實(shí)施方案中，接收器可大致不含生物材料。在任意實(shí)施方案中，迫使釋放溶液穿過第二流體通路并因此將包含靶微生物(如果存在于第二流體通路中的話)的釋放溶液的一部分排出裝置還可包括在釋放溶液的一部分經(jīng)由第二開口(未示出)離開樣本處理裝置時(shí)收集釋放溶液的該部分。有利的是，以此方式收集釋放溶液的一部分可消除離開樣本制備裝置的釋放溶液與裝置殼體外部的生物材料潛在源之間發(fā)生接觸的可能性。處理收集到的釋放溶液的優(yōu)選方法包括使用購自明尼蘇達(dá)州圣保羅的3M公司(3MCompany,St.Paul,MN)的分子檢測系統(tǒng)(在下文中稱為“MDS”)處理收集到的溶液(以及其中的靶細(xì)胞)。因此，收集到的釋放溶液可直接排出到MDS裂解管中，并且可處理所得溶胞產(chǎn)物的等分試樣以擴(kuò)展和檢測用于指示是否存在靶微生物的核酸。在本公開第二方法的任意實(shí)施方案中，該方法任選地包括裂解由釋放溶液釋放的細(xì)胞。致使細(xì)胞裂解的多種合適方法在本領(lǐng)域中是已知的，并包括但不限于物理裂解方法(如，煮沸、超聲處理、弗氏細(xì)胞壓碎器空化)和化學(xué)裂解方法(如，使樣本接觸洗滌劑、表面活性劑、季胺、離液劑或有機(jī)溶劑)。因此，由釋放溶液釋放的細(xì)胞可以致使細(xì)胞裂解的方式處理，以釋放指示是否存在靶細(xì)胞的可檢測生物分子(如，內(nèi)部或外部生物分子，諸如蛋白質(zhì)、酶、多糖、核酸)，或?yàn)榱藵B透細(xì)胞以便接觸檢測部分(如，引物、聚合酶、標(biāo)記抗體)從而與細(xì)胞內(nèi)的可檢測分子交互。在第二方法的任意實(shí)施方案中，處理由釋放溶液釋放的細(xì)胞以檢測靶微生物的指示可使用本領(lǐng)域已知的任何合適檢測過程執(zhí)行，包括但不限于培養(yǎng)方法、生物化學(xué)方法(如，檢測與靶微生物相關(guān)聯(lián)的酶活動(dòng))、免疫方法(如，免疫染色、ELISA)、組織學(xué)方法(如，組織學(xué)染色)和基因方法(如，核酸擴(kuò)增、雜交)。在任意實(shí)施方案中，擴(kuò)增核酸序列可包括擴(kuò)增與靶微生物相關(guān)聯(lián)的核苷酸序列。核酸擴(kuò)增的特別優(yōu)選方法包括用3MTM分子檢測系統(tǒng)(購自明尼蘇達(dá)州圣保羅的3M公司(3MCompany,St.Paul,MN))實(shí)現(xiàn)的等溫DNA擴(kuò)增和生物發(fā)光檢測方法。示例性實(shí)施方案實(shí)施方案A為一種檢測靶細(xì)胞的方法，包括：使液體樣本接觸樣本制備裝置的多孔載體，該裝置包括：包括第一開口和第二開口的殼體；和多孔載體；其中多孔載體包括位于第一預(yù)定位置處的樣本接收區(qū)和位于第二預(yù)定位置處的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)，多孔載體限定從樣本接收區(qū)延伸穿過靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的第一流體通路；其中多孔載體的至少一部分設(shè)置在殼體中；其中第二流體通路穿過殼體從第一開口延伸到第二開口，第二流體通路在靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)與多孔載體相交；使液體樣本的至少一部分從樣本接收區(qū)朝向靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)縱向移動(dòng)穿過多孔載體；在液體的至少一部分移動(dòng)到靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)之后，迫使脫離構(gòu)件穿過第二流體通路從第一開口到達(dá)第二開口，并從而排出靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的一部分；以及處理靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的該部分或從其釋放的細(xì)胞，以檢測靶細(xì)胞的指示。實(shí)施方案B為根據(jù)實(shí)施方案A所述的方法，其中裝置還包括覆蓋第一開口的第一蓋元件或覆蓋第二開口的第二蓋元件，其中迫使脫離構(gòu)件穿過第二流體通路包括迫使脫離構(gòu)件穿過第一蓋元件或第二蓋元件。實(shí)施方案C為根據(jù)前述實(shí)施方案中任一項(xiàng)所述的方法，其中載體由基底支撐，其中迫使脫離構(gòu)件穿過第二流體通路以脫離靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的至少一部分進(jìn)一步包括使用脫離構(gòu)件脫離基底的一部分。實(shí)施方案D為一種檢測靶細(xì)胞的方法使液體樣本接觸樣本制備裝置的多孔載體，該裝置包括：包括第一開口和第二開口的殼體；和多孔載體；其中多孔載體包括位于第一預(yù)定位置處的樣本接收區(qū)和位于第二預(yù)定位置處的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)，多孔載體限定從樣本接收區(qū)延伸穿過靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的第一流體通路；其中多孔載體的至少一部分設(shè)置在殼體中；其中第二流體通路從第一開口和第二開口延伸穿過殼體，第二流體通路在靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)與多孔載體相交；使液體樣本的至少一部分從樣本接收區(qū)朝向靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)縱向移動(dòng)穿過多孔載體；在液體的至少一部分移動(dòng)到靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)之后，迫使釋放溶液穿過第二流體通路并因此將包含靶微生物(如果存在于第二流體通路中的話)的釋放溶液的一部分排出裝置；以及處理釋放溶液的部分，以檢測靶微生物的指示。實(shí)施方案E為根據(jù)前述實(shí)施方案中任一項(xiàng)所述的方法，其中在液體的至少一部分移動(dòng)到靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)之后，該方法還包括使洗滌溶劑經(jīng)由第二流體通路穿過多孔載體的步驟。實(shí)施方案F為根據(jù)前述實(shí)施方案中任一項(xiàng)所述的方法，還包括鄰近第二開口定位接收器，其中排出靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的一部分或排出釋放溶液的一部分進(jìn)一步包括將靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的該部分或釋放溶液的該部分移動(dòng)到接收器中。實(shí)施方案G為根據(jù)前述實(shí)施方案中任一項(xiàng)所述的方法，其中將液體樣本與多孔載體接觸包括將得自富集培養(yǎng)物的液體樣本與多孔載體接觸。實(shí)施方案H為根據(jù)前述實(shí)施方案中任一項(xiàng)所述的方法，其中處理分析物結(jié)合區(qū)的該部分或處理釋放溶液的部分以檢測靶微生物的指示進(jìn)一步包括處理分析物結(jié)合區(qū)的該部分或釋放溶液的該部分以檢測與靶細(xì)胞相關(guān)聯(lián)的生物分子。實(shí)施方案I為根據(jù)實(shí)施方案G所述的方法，其中檢測與靶細(xì)胞相關(guān)聯(lián)的生物分子包括檢測核酸、酶或抗原生物分子。實(shí)施方案J為根據(jù)前述實(shí)施方案中任一項(xiàng)所述的方法，其中處理靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的該部分或處理釋放溶液的部分包括擴(kuò)增核酸序列，其中核酸序列包括與靶細(xì)胞相關(guān)聯(lián)的核苷酸序列。實(shí)施方案K為根據(jù)前述實(shí)施方案中任一項(xiàng)所述的方法，其中檢測靶細(xì)胞的方法為檢測靶微生物的方法。實(shí)施方案L為一種裝置，包括：包括內(nèi)部、第一開口和第二開口的殼體；和包括樣本接收區(qū)和靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的多孔載體；其中多孔載體限定從樣本接收區(qū)延伸至靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的第一流體通路；其中多孔載體的至少一部分設(shè)置在殼體的內(nèi)部；其中包括中心軸線的第二流體通路從第一開口和第二開口延伸穿過殼體，第二流體通路在靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)與多孔載體相交；其中中心軸線取向成與第一流體通路正交。實(shí)施方案M為根據(jù)實(shí)施方案L所述的裝置，還包括能夠觸及樣本接收區(qū)的樣本端口，其中樣本接收區(qū)設(shè)置在殼體的內(nèi)部。實(shí)施方案N為實(shí)施方案L或?qū)嵤┓桨窶所述的裝置，其中殼體還包括從樣本端口延伸至殼體的內(nèi)部的第一導(dǎo)管。實(shí)施方案O為根據(jù)實(shí)施方案L至N中任一項(xiàng)所述的裝置，其中殼體還包括從第一開口延伸至殼體的內(nèi)部的第二導(dǎo)管。實(shí)施方案P為根據(jù)實(shí)施方案L至O中任一項(xiàng)所述的裝置，還包括在第一流體通路中設(shè)置在多孔載體中的流動(dòng)指示劑。實(shí)施方案Q為根據(jù)實(shí)施方案P所述的裝置，還包括流動(dòng)指示劑控制區(qū)，其中流動(dòng)指示劑控制區(qū)設(shè)置在第一流體通路的多孔載體中，其中靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)設(shè)置在樣本接收區(qū)與流動(dòng)指示劑控制區(qū)之間的第一流體通路中。實(shí)施方案R為根據(jù)實(shí)施方案L至Q中任一項(xiàng)所述的裝置，還包括可移除地覆蓋第一開口的可移除的第一蓋元件。實(shí)施方案S為根據(jù)實(shí)施方案L至R中任一項(xiàng)所述的裝置，還包括可移除地覆蓋第二開口的可移除的第二蓋元件。實(shí)施方案T為根據(jù)實(shí)施方案L至S中任一項(xiàng)所述的裝置，還包括可移除地覆蓋樣本端口的可移除的第三蓋元件。實(shí)施方案U為根據(jù)實(shí)施方案L至T中任一項(xiàng)所述的裝置，還包括鄰近第二開口設(shè)置的吸收主體。實(shí)施方案V為根據(jù)實(shí)施方案U所述的裝置，如依賴于實(shí)施方案S，其中吸收主體聯(lián)接到第二蓋元件。實(shí)施方案W為根據(jù)實(shí)施方案T或?qū)嵤┓桨窾所述的裝置，其中吸收主體與多孔載體間隔開。實(shí)施方案X為根據(jù)前述實(shí)施方案中任一項(xiàng)所述的裝置，該裝置還可包括尺寸被設(shè)計(jì)為從第一開口到第二開口橫貫第二流體通路的脫離構(gòu)件，其中脫離構(gòu)件的一部分以可滑動(dòng)的方式接合第二流體通路。實(shí)施方案Y為根據(jù)實(shí)施方案X所述的裝置，其中脫離構(gòu)件包括切割結(jié)構(gòu)。實(shí)施方案Z為根據(jù)實(shí)施方案X或?qū)嵤┓桨竃所述的裝置，其中脫離構(gòu)件被構(gòu)造成用于迫使含水液體穿過第二導(dǎo)管。實(shí)施方案AA為包括根據(jù)實(shí)施方案L至W中任一項(xiàng)所述的裝置的試劑盒。實(shí)施方案AB為根據(jù)實(shí)施方案AA所述的試劑盒，還包括尺寸被設(shè)計(jì)為從第一開口到第二開口橫貫第二流體通路的脫離構(gòu)件。實(shí)施方案AC為根據(jù)實(shí)施方案AB所述的試劑盒，其中脫離構(gòu)件包括切割結(jié)構(gòu)。實(shí)施方案AD為根據(jù)實(shí)施方案AB或?qū)嵤┓桨窤C所述的試劑盒，其中脫離構(gòu)件被構(gòu)造成用于迫使含水液體穿過殼體。實(shí)施方案AE為根據(jù)實(shí)施方案AA至AD中任一項(xiàng)所述的試劑盒，還包括洗滌液。實(shí)施方案AF為根據(jù)實(shí)施方案AA至AE中任一項(xiàng)所述的試劑盒，還包括釋放溶液。實(shí)施方案AG為根據(jù)實(shí)施方案AA至AF中任一項(xiàng)所述的試劑盒，還包括用于核酸擴(kuò)增的試劑。實(shí)施例通過下面的實(shí)施例進(jìn)一步說明了本發(fā)明的目的和優(yōu)點(diǎn)，但這些實(shí)施例中列舉的具體材料及其量以及其它條件和細(xì)節(jié)不應(yīng)被理解為是對本發(fā)明的不當(dāng)限制。除非另外指明，否則所有的份數(shù)和百分比以重量計(jì)，所有的水為蒸餾水并且所有的分子量為重均分子量。參照實(shí)施例1從在側(cè)向流多孔支承體中捕獲的微生物中檢測核酸?？焖偕抽T氏菌屬側(cè)向流試紙(部件號3000034)購自密蘇里州聯(lián)合城的羅莫實(shí)驗(yàn)室公司(RomerLabs,Union,MO)。沙門氏菌屬的菌株在緩沖蛋白胨水中生長過夜，然后在巴特菲爾德緩沖液中稀釋(即，連續(xù)10倍稀釋)。使用一毫升10-7稀釋液接種PETRIFILMTM腸桿菌計(jì)數(shù)板(購自尼蘇達(dá)州圣保羅的3M公司(3MCompany,St.Paul,MN))。按照制造商的說明溫育該板，并發(fā)現(xiàn)該板包括110個(gè)菌落形成單位數(shù)。將一片試紙放入沙門氏菌屬培養(yǎng)物的10-3、10-4、10-5、10-6和10-7連續(xù)稀釋液中的每一個(gè)中，并且試紙按照制造商的說明進(jìn)行處理。使用剃刀刀片從每張?jiān)嚰埳锨邢隆皩φ铡本€和“靶”線(結(jié)合有沙門氏菌屬微生物)。使用新的手套和剃刀刀片切下每條線以避免交叉感染。將每條切下的線再懸浮在1.5mL微量離心管中的100μL的SS2緩沖液(KCl，3.19g/L；(NH4)2SO4，1.41g/L；Tris堿，2.72g/L；950，0.526g/L；聚乙烯吡喀烷酮，0.43g/L；TritonTMX-100，80g/L)中。將該管置于加熱塊中，在100℃下放置10分鐘，以裂解任何結(jié)合到線的細(xì)胞。沸騰之后，(使用微量吸移管)混合樣本，并抽吸20μL等分試樣并將其用于重構(gòu)3M分子檢測系統(tǒng)的單獨(dú)沙門氏菌屬試劑片(部件號MDAS96NA，購自明尼蘇達(dá)州圣保羅的3M公司(3MCompany,St.Paul,MN))。為了進(jìn)行比較，使用沙門氏菌屬培養(yǎng)物的10-3、10-4、10-5、10-6和10-7連續(xù)稀釋液的20μL等分試樣重構(gòu)3M分子檢測系統(tǒng)的單獨(dú)沙門氏菌屬試劑片。所有重構(gòu)的測得物均使用3M分子檢測系統(tǒng)器械(購自明尼蘇達(dá)州圣保羅的3M公司(3MCompany,St.Paul,MN))根據(jù)制造商的說明進(jìn)行處理。每次測定中是否存在可檢測沙門氏菌屬示于表1中。表1：檢測結(jié)合到側(cè)向流試紙的沙門氏菌屬?！?”(加號)代表樣本中陽性檢測出沙門氏菌屬微生物?！?”(減號)代表樣本中未檢測出沙門氏菌屬微生物。結(jié)果指示用于濃縮側(cè)向流裝置的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)中的靶微生物的方法在靶微生物的檢測中提供至少約10倍的增強(qiáng)。實(shí)施例1：構(gòu)造側(cè)向流樣本制備裝置。構(gòu)造類似于圖11A中所示裝置的裝置，不同之處在于在殼體的第一件與間隔元件之間插入一層3M雙面膠帶。在雙面膠帶上切出孔，使得孔可與第一導(dǎo)管和第二導(dǎo)管對準(zhǔn)，從而允許液體從第一導(dǎo)管和第二導(dǎo)管流向多孔載體。間隔元件為PET膜(0.254mm厚)的條，其具有可覆蓋多孔載體的足夠大的開口。殼體的第一件使用PET膜(0.254mm厚)制成。鉆出兩個(gè)穿過第一件的孔。將反向微離心管的開口粘合(使用3MTM粘合轉(zhuǎn)移帶6035PC，購自明尼蘇達(dá)州圣保羅的3M公司(3MCompany,St.Paul,MN))到其中一個(gè)孔，以形成第一導(dǎo)管。切斷管的底部，以將該管反轉(zhuǎn)到中空圓柱體中。將1毫升一次性塑料注射器的筒體粘合(使用3MTM粘合轉(zhuǎn)移帶6035PC)到另一個(gè)孔，以形成第二導(dǎo)管。一次性注射器的柱塞用作脫離構(gòu)件。多孔載體為購自沃特曼公司(Whatman)的FUSION5TM側(cè)向流材料的條(4mm寬)。第二件為涂覆有粘合劑(3MTM粘合轉(zhuǎn)移帶6035PC)的PET膜(0.254mm厚)的條，該粘合劑將第二件粘合到間隔元件。第二件具有與第二導(dǎo)管對準(zhǔn)的鋸齒形孔，由此使得當(dāng)脫離構(gòu)件被迫使穿過第二導(dǎo)管直至頂端接觸多孔支承體時(shí)，脫離構(gòu)件上的進(jìn)一步壓力迫使多孔載體抵靠鋸齒形邊緣，從而切割多孔載體的一部分并將該部分穿過鋸齒形孔排出。組裝好裝置之后，制備每個(gè)多孔載體的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)。將兩微升BACTRACETM抗大腸桿菌O157乳膠凝集微球(購自馬里蘭州蓋瑟斯堡的KPL(KPL,Gaithersburg,MD))的兩微升懸浮液加入500μL去離子水中，進(jìn)行混合，然后添加到裝置的第二導(dǎo)管(即，注射器筒體)中。將脫離構(gòu)件(即，注射器柱塞)插入導(dǎo)管并慢慢壓下，從而迫使微球進(jìn)入多孔載體。從裝置抽出柱塞，然后在真空環(huán)境中于40℃下干燥裝置兩小時(shí)，從而將微球固定在多孔基體中。實(shí)施例2：在制備樣本和檢測所述制備樣本中的微生物的方法中使用側(cè)向流樣本制備裝置。根據(jù)實(shí)施例1制備樣本制備裝置。將大腸桿菌O157(采集自血瓊脂板)的菌落懸浮在巴特非爾德氏緩沖液中并在巴特非爾德氏緩沖的初始懸浮液中連續(xù)稀釋(10倍稀釋)，以此制備細(xì)菌懸浮液。使用3M分子檢測系統(tǒng)按照制造商的說明，分析10-2稀釋液至10-6稀釋液中每一種的六個(gè)20微升等分試樣中是否存在大腸桿菌O157。結(jié)果示于表2中，顯示從細(xì)菌懸浮液的10-2至10-5稀釋液中取出的等分試樣中可再現(xiàn)檢測大腸桿菌O157。結(jié)果還顯示從細(xì)菌懸浮液的10-6稀釋液中取出的等分試樣中無法可再現(xiàn)檢測大腸桿菌O157。表2：在細(xì)菌懸浮液的連續(xù)稀釋液中對大腸桿菌O157的存在進(jìn)行檢測。分子顯示每種稀釋液中大腸桿菌O157檢測呈陽性的樣本數(shù)。分母顯示每種稀釋液測試的樣本數(shù)。將10-5、10-6和10-7連續(xù)稀釋液的250微升等分試樣裝載到單個(gè)樣本處理裝置的第一導(dǎo)管中，該裝置被構(gòu)造成用于檢測大腸桿菌O157，并使樣本液體流過多孔載體10分鐘。10分鐘之后，使用脫離構(gòu)件(即，柱塞)將多孔載體的靶細(xì)胞結(jié)合部分頂出每個(gè)裝置。每個(gè)靶細(xì)胞結(jié)合部分被頂入到單獨(dú)的反應(yīng)管中。將100微升的SS2溶液加入到每個(gè)反應(yīng)管中，然后將管放置在加熱塊上于100℃下保持10分鐘以裂解結(jié)合到靶細(xì)胞結(jié)合部分的任何細(xì)胞。冷卻該管之后，從反應(yīng)管中取出20μL，并用來重構(gòu)3M分子檢測系統(tǒng)的大腸桿菌O157試劑片。所有重構(gòu)的溶液均使用3M分子檢測系統(tǒng)器械根據(jù)制造商的說明進(jìn)行處理。每次測定中是否存在可檢測大腸桿菌O157示于表3中。表3：在實(shí)施例2中測試從樣本處理裝置頂出的靶細(xì)胞結(jié)合部分中對大腸桿菌O157的存在的檢測?！?”(加號)代表樣本中陽性檢測出大腸桿菌微生物?！?”(減號)代表樣本中未檢測出大腸桿菌微生物。測試的稀釋液結(jié)果10-5+10-6+10-7-將表2中所示的結(jié)果與表3中所示的結(jié)果進(jìn)行比較，指出使用本公開樣本處理裝置檢測微生物的方法比常規(guī)檢測方法更靈敏。實(shí)施例3：在包括側(cè)向流裝置中洗滌步驟的樣本制備方法中使用側(cè)向流樣本制備裝置。如實(shí)施例1中所述制備樣本制備裝置。使用靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的抗大腸桿菌O157乳膠凝集微球(購自KPL)制備一個(gè)裝置，并使用靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的抗大腸桿菌O26乳膠凝集微球(購自KPL)制備另一個(gè)裝置。如實(shí)施例2所述的那樣分別制備并稀釋大腸桿菌O157和大腸桿菌O26的無菌懸浮液。將每種細(xì)菌懸浮液的10-5稀釋液的250微升等分試樣加載到被構(gòu)造成用于檢測對應(yīng)的細(xì)菌的樣本處理裝置中，并使樣本滲透穿過多孔載體10分鐘。10分鐘之后，將500μL的洗滌溶劑(巴特非爾德氏緩沖液)吸移到第二導(dǎo)管中，并隨后使用脫離構(gòu)件(即，柱塞)迫使洗滌溶劑穿過多孔載體的靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)。在洗滌溶劑通過多孔構(gòu)件之后，迫使脫離構(gòu)件抵靠多孔構(gòu)件，直至將多孔構(gòu)件的一部分(靶細(xì)胞結(jié)合區(qū))從裝置中頂出到反應(yīng)管中。將100微升的SS2溶液加入到每個(gè)反應(yīng)管中，然后將管放置在加熱塊上于100℃下保持10分鐘以裂解結(jié)合到靶細(xì)胞結(jié)合部分的任何細(xì)胞。冷卻該管之后，從反應(yīng)管中取出20μL，并用來重構(gòu)3M分子檢測系統(tǒng)的對應(yīng)試劑片(即，大腸桿菌O157試劑片或大腸桿菌O26試劑片)。所有重構(gòu)的溶液均使用3M分子檢測系統(tǒng)器械根據(jù)制造商的說明進(jìn)行處理。每次測定中是否存在可檢測大腸桿菌示于表4中。表4：在實(shí)施例3中測試從樣本處理裝置頂出的靶細(xì)胞結(jié)合部分中對大腸桿菌的存在的檢測。“+”(加號)代表樣本中陽性檢測出大腸桿菌微生物?！?”(減號)代表樣本中未檢測出大腸桿菌微生物。結(jié)果指示即使在樣本處理裝置中原位洗滌靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)之后，裝置仍然能夠檢測結(jié)合到靶細(xì)胞結(jié)合區(qū)的大腸桿菌O157微生物。本文引用的所有專利、專利申請和專利公開的全部公開內(nèi)容以及可供使用的電子版材料均以引用方式并入。在本專利申請的公開內(nèi)容和以引用方式并入本文的任何文獻(xiàn)的一個(gè)或多個(gè)公開內(nèi)容之間存在任何矛盾的情況下，應(yīng)以本專利申請的公開內(nèi)容為準(zhǔn)。上述具體實(shí)施方式和實(shí)施例僅為清楚理解本發(fā)明而給出。而不應(yīng)被理解為不必要的限制。本發(fā)明不限于上述的具體細(xì)節(jié)，本領(lǐng)域所屬技術(shù)人員可在權(quán)利要求書限定的本發(fā)明內(nèi)作出各種變化。所有的標(biāo)題是為了閱讀者方便，而不應(yīng)該用于限制該標(biāo)題后面的正文的含義，除非如此規(guī)定。本文說明性地描述的本發(fā)明可在不存在本文未具體公開的任何元件的情況下進(jìn)行適當(dāng)?shù)貙?shí)踐。因此，例如，在本文的每個(gè)實(shí)例中，術(shù)語“包括”、“基本上由......組成”和“由......組成”中的任一個(gè)可被替換為其它兩個(gè)術(shù)語中的任一個(gè)。盡管將已采用的術(shù)語和表達(dá)用作描述而非限制術(shù)語，并且非旨在使用此類術(shù)語和表達(dá)而排出所示和所描述的特征或其部分的任何等同物，但是已經(jīng)認(rèn)識到，在所要求保護(hù)的本發(fā)明的范圍內(nèi)的各種修改是可能的。因此，應(yīng)當(dāng)理解，盡管本發(fā)明已通過優(yōu)選的實(shí)施方式和任選的特征而具體公開，但是本領(lǐng)域的技術(shù)人員可推出本文所公開的概念的修改和變型，并且此類修改和變型被視為在由所附的權(quán)利要求所限定的本發(fā)明的范圍內(nèi)。當(dāng)前第1頁1 2 3