本發(fā)明涉及醫(yī)療衛(wèi)生技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種同位素稀釋質(zhì)譜法定量檢測(cè)血清低豐度蛋白前處理流程。
背景技術(shù):
同位素稀釋質(zhì)譜法特異性強(qiáng)、復(fù)現(xiàn)性好,因此是血清低豐度蛋白絕對(duì)定量的最佳方法,但是該方法的準(zhǔn)確性顯著依賴于蛋白的前處理優(yōu)劣?,F(xiàn)有的血清低豐度蛋白前處理流程較多,不同流程間差異較大,普遍存在重復(fù)性和復(fù)現(xiàn)性差的缺陷,嚴(yán)重影響了同位素稀釋質(zhì)譜法對(duì)血清低豐度蛋白的準(zhǔn)確定量。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的在于針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的缺陷和不足,提供同位素稀釋質(zhì)譜法定量檢測(cè)血清低豐度蛋白前處理流程。
為了解決背景技術(shù)所存在的問題,本發(fā)明的同位素稀釋質(zhì)譜法定量檢測(cè)血清低豐度蛋白前處理流程,它的步驟如下:
步驟一:高豐度蛋白去除:將100μL血清按試劑說明書步驟用Blue Albumin&IgG Depletion Kit去除絕大部分白蛋白和IgG,取180μL去除高豐度蛋白后的血清,并與70μL 25mM的碳酸氫銨溶液混合;
步驟二:變性:將上述混合樣本首先在100℃水浴下熱變性5min,再冰浴5min冷卻,然后加入約96.1mg尿素進(jìn)行化學(xué)變性,漩渦30s后靜置5min,最后加入250μL 25mM碳酸氫銨溶液稀釋;
步驟三:還原:加入50μL 100mM二硫蘇糖醇,60℃水浴30min,使變性蛋白已打開的二硫鍵保持還原狀態(tài);
步驟四:烷基化:加入50μL 550mM碘乙酰胺,黑暗中室溫下作用30min,使半胱氨酸上的巰基烷基化,防止二硫鍵的形成;
步驟五:終止烷基化:加入185μL 100mM二硫蘇糖醇終止烷基化,且二硫蘇糖醇與碘乙酰胺的摩爾比為1∶2,室溫下作用30min,防止過量的碘乙酰胺烷基化非胱氨酸殘基;
步驟六:胰酶消化:加入1mL 25mM碳酸氫銨溶液稀釋尿素,使其終濃度小于1M,然后加入100μL 1mg/L同位素標(biāo)記肽,再加入胰酶,且胰酶與底物的質(zhì)量比為1∶20,37℃作用30min,使蛋白質(zhì)水解成多肽,最后加入35μL 5%三氟乙酸終止消化;
步驟七:固相萃?。簩⒚附猱a(chǎn)物用Waters Sep-pak C18固相萃取柱純化富集,首先用3mL甲醇和3mL超純水分別活化和平衡柱子,然后加入酶解產(chǎn)物,再用2mL超純水清洗柱子兩次,最后用1mL 100%乙腈萃??;
步驟八:蒸干:將萃取產(chǎn)物用氮吹儀蒸干,氮?dú)饬魉贋?L/min,蒸干溫度為45℃;
步驟九:復(fù)溶:將蒸干產(chǎn)物用400μL含0.1%甲酸的超純水復(fù)溶。
本發(fā)明有益效果為:重復(fù)性和復(fù)現(xiàn)性好,且覆蓋面廣,適用于同位素稀釋質(zhì)譜法檢測(cè)血清中各種低豐度蛋白的前處理。
具體實(shí)施方式
本具體實(shí)施方式采用如下技術(shù)方案:它的步驟如下:
步驟一:高豐度蛋白去除:將100μL血清按試劑說明書步驟用Blue Albumin&IgG Depletion Kit(Sigma-Aldrich)去除絕大部分白蛋白和IgG,取180μL去除高豐度蛋白后的血清,并與70μL 25mM的碳酸氫銨(ABC)溶液混合;
步驟二:變性:將上述混合樣本首先在100℃水浴下熱變性5min,再冰浴5min冷卻,然后加入約96.1mg尿素(終濃度8M)進(jìn)行化學(xué)變性,漩渦30s后靜置5min,最后加入250μL 25mM ABC溶液稀釋;
步驟三:還原:加入50μL 100mM二硫蘇糖醇(DTT)(終濃度10mM),60℃水浴30min,使變性蛋白已打開的二硫鍵保持還原狀態(tài);
步驟四:烷基化:加入50μL 550mM碘乙酰胺(IAM)(終濃度50mM),黑暗中室溫下作用30min,使半胱氨酸上的巰基(-SH)烷基化,防止二硫鍵的形成;
步驟五:終止烷基化:加入185μL 100mM DTT終止烷基化(DTT/IAM(mol/mol)=1∶2),室溫下作用30min,防止過量的IAM烷基化非胱氨酸殘基;
步驟六:胰酶消化:加入1mL 25mM ABC溶液稀釋尿素,使其終濃度小于1M,然后加入100μL 1mg/L同位素標(biāo)記肽,再加入胰酶(胰酶/底物(w/w)=1∶20)37℃作用30min,使蛋白質(zhì)水解成多肽,最后加入35μL 5%三氟乙酸(TFA)終止消化;
步驟七:固相萃?。簩⒚附猱a(chǎn)物用Waters Sep-pak C18固相萃取柱純化富集,首先用3mL甲醇和3mL超純水分別活化和平衡柱子,然后加入酶解產(chǎn)物,再用2mL超純水清洗柱子兩次,最后用1mL 100%乙腈(ACN)萃?。?/p>
步驟八:蒸干:將萃取產(chǎn)物用氮吹儀蒸干,氮?dú)饬魉贋?L/min,蒸干溫度為45℃;
步驟九:復(fù)溶:將蒸干產(chǎn)物用400μL含0.1%甲酸(FA)的超純水復(fù)溶。
以上所述,僅用以說明本發(fā)明的技術(shù)方案而非限制,本領(lǐng)域普通技術(shù)人員對(duì)本發(fā)明的技術(shù)方案所做的其它修改或者等同替換,只要不脫離本發(fā)明技術(shù)方案的精神和范圍,均應(yīng)涵蓋在本發(fā)明的權(quán)利要求范圍當(dāng)中。