本發(fā)明涉及端粒酶抑制劑篩選系統(tǒng)。更具體地說(shuō),本發(fā)明涉及一種基于SPR技術(shù)的端粒酶抑制劑篩選系統(tǒng)。
背景技術(shù):
端粒酶(telomerase)是一種逆轉(zhuǎn)錄酶,是一種真核生物線性染色體末端的能夠以端粒DNA為底物,對(duì)端粒DNA末端進(jìn)行重復(fù)DNA擴(kuò)增的一種RNA核糖--蛋白復(fù)合體。端粒酶對(duì)端粒DNA的擴(kuò)增能夠使得細(xì)胞無(wú)限分裂而不會(huì)自然凋亡,從而導(dǎo)致癌癥的發(fā)生。目前,在85%以上的癌細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)了端粒酶的過(guò)量表達(dá),研究表明對(duì)端粒酶活性進(jìn)行抑制能夠達(dá)到殺死癌細(xì)胞的作用,所以以端粒酶為靶點(diǎn)的藥物篩選成為癌癥研究治療的熱點(diǎn)。從龐大的化合物庫(kù)中篩選出能夠抑制端粒酶活性的物質(zhì),為開發(fā)新型治療癌癥藥劑提供幫助具有重要的意義。目前,端粒酶抑制劑的篩選主要通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性平衡透析等方法發(fā)現(xiàn)能特異性結(jié)合端粒DNA的物質(zhì),通過(guò)一系列體外方法驗(yàn)證其選擇性結(jié)合效果,然后通過(guò)細(xì)胞實(shí)驗(yàn)檢驗(yàn)該物質(zhì)對(duì)腫瘤細(xì)胞中端粒酶活性的抑制效果。首先,研究人員將選中的化合物溶于緩沖溶液中,然后選擇不同的DNA序列分別放入透析袋,在溶液中平衡24小時(shí)以上,然后取出通過(guò)紫外等方法檢測(cè)該物質(zhì)對(duì)各DNA序列不同的結(jié)合量。第二步,在得到對(duì)端粒DNA有良好選擇性結(jié)合的物質(zhì)后,通過(guò)熒光、紫外、質(zhì)譜等手段研究其與DNA結(jié)合的信息。最后,選擇具有良好抑制端粒酶活性潛力的物質(zhì)進(jìn)行細(xì)胞實(shí)驗(yàn),考察體內(nèi)抑制效果。上述方法是存在工作量大,時(shí)間長(zhǎng),費(fèi)用高昂的缺點(diǎn)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
作為各種廣泛且細(xì)致的研究和實(shí)驗(yàn)的結(jié)果,本發(fā)明的發(fā)明人已經(jīng)發(fā)現(xiàn),將基于表面等離子共振(SPR)生物傳感芯片應(yīng)用于端粒酶抑制劑的篩選系統(tǒng)中,可實(shí)現(xiàn)端粒酶抑制劑的高效篩選,為新型抗癌藥物的研發(fā)開辟新途徑。基于這種發(fā)現(xiàn),完成了本發(fā)明。
本發(fā)明的一個(gè)目的是解決至少上述問(wèn)題和/或缺陷,并提供至少后面將說(shuō)明的優(yōu)點(diǎn)。
本發(fā)明還有一個(gè)目的是提供一種基于SPR技術(shù)的端粒酶抑制劑篩選系統(tǒng),其能夠配合市場(chǎng)上成熟的SPR儀器,能夠?qū)崿F(xiàn)簡(jiǎn)單、快速且穩(wěn)定可靠的端粒酶抑制劑的篩選工作。
為了實(shí)現(xiàn)根據(jù)本發(fā)明的這些目的和其它優(yōu)點(diǎn),提供了一種基于SPR技術(shù)的端粒酶抑制劑篩選系統(tǒng),其包括:
試劑盒,其具有第一反應(yīng)液、第二反應(yīng)液和稀釋液,所述第一反應(yīng)液包含100~120mmol/L的dNTP和dNTP儲(chǔ)備液;所述第二反應(yīng)液包含端粒酶及端粒酶儲(chǔ)備液;所述稀釋液為pH7.3的10~200mmol/L PB或PBS緩沖液;為保持端粒酶活性及dNTP的穩(wěn)定性,端粒酶和DNTP平時(shí)分別儲(chǔ)存于各自的儲(chǔ)備液中,當(dāng)進(jìn)行測(cè)試工作時(shí),試劑盒中的第一反應(yīng)液、第二反應(yīng)液均采用稀釋液稀釋成所需的濃度;
SPR芯片,其具有玻璃片、覆蓋于所述玻璃片上的金屬鍍膜、連接于所述鍍膜的端粒DNA。
利用現(xiàn)有SPR儀器,將上述篩選系統(tǒng)應(yīng)用于端粒酶抑制劑篩選的具體過(guò)程如下:
試劑盒中的第一反應(yīng)液使用稀釋液配制成所需的濃度后,作為檢測(cè)過(guò)程中的流動(dòng)液通過(guò)蠕動(dòng)泵進(jìn)入流通池,由于稀釋液中鈉離子或鉀離子的引入,芯片上的端粒DNA在鈉離子或鉀離子的存在條件下易形成分子內(nèi)四股螺旋結(jié)構(gòu),并形成動(dòng)態(tài)平衡。通過(guò)SPR儀器自帶的控溫模塊控制溫度為37℃,保證流通池內(nèi)的端粒酶活性在最佳狀態(tài)。待穩(wěn)定后,使用試劑盒中的稀釋液將第二反應(yīng)液稀釋成所需濃度的端粒酶測(cè)試液加入體系中。由于端粒酶只能作用于單鏈狀態(tài)的端粒DNA,如果目標(biāo)分子能夠穩(wěn)定端粒DNA形成的四股螺旋結(jié)構(gòu),就能夠有效阻止端粒酶對(duì)端粒DNA的延長(zhǎng),從而達(dá)到抑制端粒酶活性的目的。根據(jù)SPR工作原理,其共振角的變化與芯片上質(zhì)量的改變直接相關(guān),通過(guò)檢測(cè)SPR信號(hào)改變情況,就能檢測(cè)到芯片上修飾的端粒DNA是否有延長(zhǎng),從而得到該目標(biāo)分子對(duì)端粒酶活性的抑制效率。
優(yōu)選的是,其中,所述SPR芯片的構(gòu)建步驟為:
步驟一,將所述玻璃片鍍覆一層金屬薄膜后,得到第一芯片;
步驟二,將所述第一芯片置于5~15μmol/L的所述端粒DNA溶液中,0~10℃溫度條件下保持10~24h,得到第二芯片;
步驟三,將所述第二芯片置于1~3mmol/L的巰基醇類的磷酸緩沖液中封閉2~6h,得到SPR芯片。
優(yōu)選的是,其中,所述所述dNTP具有等摩爾比的dATP、dTTP、dGTP和dCTP,以確保端粒DNA的正確擴(kuò)增。
優(yōu)選的是,所述dNTP儲(chǔ)備液為10~200mmol/L的Tris-HCl緩沖液,所述端粒酶儲(chǔ)備液包括10~200mmol/L的PB或PBS緩沖液、3~15mmol/L的MgCl2以及8~10wt%的甘油,所述dNTP儲(chǔ)備液和端粒酶儲(chǔ)備液的pH均為7.3,所述dNTP儲(chǔ)備液和端粒酶儲(chǔ)備液分別用以保證dNTP在長(zhǎng)期儲(chǔ)存過(guò)程的穩(wěn)定性和端粒酶在長(zhǎng)期儲(chǔ)存過(guò)程中的活性。
優(yōu)選的是,其中,所述鍍膜為金膜或銀膜,金屬元素的性質(zhì)各不相同,對(duì)SPR光譜也將產(chǎn)生較大的影響。金屬材料的選擇需要綜合考慮其反射率及穩(wěn)定性,金、銀、銅、鋁的反射率均較高,但鋁和銅的穩(wěn)定性較差,易被氧化形成氧化層,影響SPR的產(chǎn)生,金和銀較為適合。
優(yōu)選的是,所述鍍膜為金膜,其具有更強(qiáng)的化學(xué)惰性,確保芯片的長(zhǎng)期使用,所述端粒DNA的5’端修飾有巰基,巰基-SH和金Au之間具有較強(qiáng)的相互作用,所述端粒DNA通過(guò)巰基連接于金膜可自發(fā)的形成有序結(jié)構(gòu),且穩(wěn)定性非常高。
優(yōu)選的是,其中,所述端粒DNA通過(guò)三硫代金剛烷衍生物連接于所述金膜,三硫代金剛烷衍生物具有良好的穩(wěn)定性,通過(guò)三個(gè)硫?qū)鹉け砻孢M(jìn)行鰲合,可獲得極高的金膜表面包被的穩(wěn)定性,從而顯著提高了端粒DNA與金膜連接的穩(wěn)定性。
優(yōu)選的是,其中,所述鍍膜的厚度為43~46nm,,金屬鍍膜的厚度直接影響共振深度,直接影響SPR信號(hào)的靈敏度。
優(yōu)選的是,所述巰基醇類選自巰基乙醇、巰基己醇、巰基十一醇的任意一種。
優(yōu)選的是,所述巰基醇類為巰基乙醇,巰基乙醇優(yōu)異的還原性可保證最佳的封閉效果,避免非特異性吸附的產(chǎn)生。
本發(fā)明至少包括以下有益效果:
(1)不需要進(jìn)行長(zhǎng)時(shí)間的透析、分析、細(xì)胞實(shí)驗(yàn),能夠快速高效的篩選出對(duì)端粒酶有抑制效果的物質(zhì),顯著加快端粒酶抑制劑的篩選研制工作;
(2)根據(jù)SPR信號(hào)的響應(yīng)速度以及強(qiáng)度,還能直接比較各種端粒酶抑制劑抑制端粒酶活性的效果;
(3)通過(guò)改變緩沖液的條件,如離子種類、濃度、分子擁擠試劑等,本端粒酶抑制劑篩選系統(tǒng)可成為研究多種因素對(duì)端粒酶活性影響的平臺(tái)。
本發(fā)明的其它優(yōu)點(diǎn)、目標(biāo)和特征將部分通過(guò)下面的說(shuō)明體現(xiàn),部分還將通過(guò)對(duì)本發(fā)明的研究和實(shí)踐而為本領(lǐng)域的技術(shù)人員所理解。
附圖說(shuō)明
圖1為本發(fā)明一個(gè)實(shí)例中端粒酶延長(zhǎng)單鏈狀態(tài)端粒DNA的過(guò)程;
圖2為本發(fā)明另一實(shí)中抑制劑通過(guò)穩(wěn)定端粒DNA分子內(nèi)四股螺旋結(jié)構(gòu)阻止端粒DNA延長(zhǎng)的過(guò)程。
圖中:1、金屬鍍膜,2、帶有巰基的端粒DNA,3、端粒酶,4、延長(zhǎng)后的端粒DNA,5、端粒DNA分子內(nèi)四股螺旋結(jié)構(gòu),6、端粒酶抑制劑。
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合附圖對(duì)本發(fā)明做進(jìn)一步的詳細(xì)說(shuō)明,以令本領(lǐng)域技術(shù)人員參照說(shuō)明書文字能夠據(jù)以實(shí)施。
應(yīng)當(dāng)理解,本文所使用的諸如“具有”、“包含”以及“包括”術(shù)語(yǔ)并不配出一個(gè)或多個(gè)其它元件或其組合的存在或添加。
參照?qǐng)D1,SPR芯片的金屬鍍膜1表面連有一層端粒DNA分子2,第二反應(yīng)液中的端粒酶3能夠以芯片上的端粒DNA為底物,以第一反應(yīng)液中的dNTP為原料進(jìn)行擴(kuò)增,使結(jié)合在金屬鍍膜表面的端粒DNA延長(zhǎng),從而質(zhì)量增加。
參照?qǐng)D2,在一定濃度鈉離子或鉀離子的環(huán)境中,端粒DNA可自組裝形成分子內(nèi)四股螺旋結(jié)構(gòu),既保持四股螺旋狀態(tài)的存在,又使其不是特別穩(wěn)定,形成動(dòng)態(tài)平衡。端粒酶只能作用于單鏈狀態(tài)的端粒DNA,若添加的抑制劑能夠穩(wěn)定端粒DNA形成的四股螺旋結(jié)構(gòu),就能夠有效阻止端粒酶對(duì)端粒DNA的延長(zhǎng),從而達(dá)到抑制端粒酶活性的目的。
SPR芯片上端粒DNA的質(zhì)量與端粒酶的活性直接相關(guān),SPR芯片共振角的變化又與芯片表面質(zhì)量的改變具有直接相關(guān)性,通過(guò)SPR儀器檢測(cè)SPR信號(hào)改變情況,就能檢測(cè)到芯片上修飾的端粒DNA是否有延長(zhǎng),從而得到抑制劑對(duì)端粒酶活性的抑制效果。
<實(shí)例1>
1)試劑盒的制備,其具有第一反應(yīng)液、第二反應(yīng)液和稀釋液,所述第一反應(yīng)液包含10mmol/L的磷酸鹽緩沖液和100mmol/L的dNTP,所述緩沖液的pH為7.3;所述第二反應(yīng)液包含100000U/ml的端粒酶及pH為7.3的端粒酶儲(chǔ)備液,端粒酶儲(chǔ)備液包含10mmol/L PB緩沖液、3mmol/L的MgCl2以及8wt%的甘油,所述穩(wěn)定液的pH為7.3;所述稀釋液為pH7.3的10mmol/L PB緩沖液,用以在實(shí)際測(cè)試過(guò)程中,將第一反應(yīng)液和第二反應(yīng)液分別稀釋成合適濃度的dNTP和端粒酶測(cè)試工作液;
2)芯片的構(gòu)建:玻璃片上鍍覆一層厚度為43nm的銀膜后,置于5μmol/L的修飾有巰基的端粒DNA溶液中0℃孵育10小時(shí),將端粒DNA通過(guò)巰基連接于銀膜表面,其中,DNA序列如下:5’-SH-AAA AAA AAA AAA TTA GGG TTA GGG TTA GGG TTA GGG。修飾完成后用1mmol/L的巰基乙醇的磷酸緩沖液封閉2小時(shí),最后將制備好的芯片真空干燥,氮?dú)獗Wo(hù)封存,能夠長(zhǎng)期儲(chǔ)存,測(cè)試時(shí)直接使用;
3)使用:將修飾好的芯片放入雙通道SPR儀,測(cè)試流動(dòng)液為配置好的dNTP測(cè)試工作液,在一個(gè)通道的流動(dòng)液中加入一定濃度的待測(cè)抑制劑,另一通道中不加入抑制劑作為參照。當(dāng)基線穩(wěn)定后,通過(guò)六元閥在兩個(gè)通道中加入等量配制好的端粒酶測(cè)試溶液,通過(guò)對(duì)比不同通道的信號(hào)能夠得到端粒酶抑制劑的效果。
<實(shí)例2>
1)試劑盒的制備,其具有第一反應(yīng)液、第二反應(yīng)液和稀釋液,所述第一反應(yīng)液包含200mmol/L的磷酸鹽緩沖液和120mmol/L的dNTP,所述緩沖液的pH為7.3;所述第二反應(yīng)液包含100000U/ml的端粒酶及pH為7.3的端粒酶儲(chǔ)備液,端粒酶儲(chǔ)備液包含200mmol/L PBS緩沖液、15mmol/L的MgCl2以及10wt%的甘油,所述穩(wěn)定液的pH為7.3;所述稀釋液為pH7.3的200mmol/L PBS緩沖液,用以在實(shí)際測(cè)試過(guò)程中,將第一反應(yīng)液和第二反應(yīng)液分別稀釋成合適濃度的dNTP和端粒酶測(cè)試工作液;
2)芯片的構(gòu)建:玻璃片上鍍覆一層厚度為46nm的金膜后,置于15μmol/L的修飾有三硫代金剛烷衍生物的端粒DNA溶液中10℃孵育24小時(shí),三硫代金剛烷衍生物的結(jié)構(gòu)式如下:
其中,R表示三硫代金剛烷衍生物的功能基團(tuán),
端粒DNA的序列為:5’-X-AAA AAA AAA AAA TTA GGG TTA GGG TTA GGG TTA GGG,其中X為三硫代金剛烷衍生物,將端粒DNA通過(guò)三巰基連接于金膜表面。修飾完成后用3mmol/L的巰基乙醇的磷酸緩沖液封閉6小時(shí),最后將制備好的芯片真空干燥,氮?dú)獗Wo(hù)封存,能夠長(zhǎng)期儲(chǔ)存,測(cè)試時(shí)直接使用;
3)使用:將修飾好的芯片放入雙通道SPR儀,測(cè)試流動(dòng)液為配置好的dNTP測(cè)試工作液,在一個(gè)通道的流動(dòng)液中加入一定濃度的待測(cè)抑制劑,另一通道中不加入抑制劑作為參照。當(dāng)基線穩(wěn)定后,通過(guò)六元閥在兩個(gè)通道中加入等量配制好的端粒酶測(cè)試溶液,通過(guò)對(duì)比不同通道的信號(hào)能夠得到端粒酶抑制劑的效果。
<實(shí)例3>
1)試劑盒的制備,其具有第一反應(yīng)液、第二反應(yīng)液和稀釋液,所述第一反應(yīng)液包含100mmol/L的磷酸鹽緩沖液和110mmol/L的dNTP,所述緩沖液的pH為7.3;所述第二反應(yīng)液包含100000U/ml的端粒酶及pH為7.3的端粒酶儲(chǔ)備液,端粒酶儲(chǔ)備液包含100mmol/L PB緩沖液、10mmol/L的MgCl2以及9wt%的甘油,所述穩(wěn)定液的pH為7.3;所述稀釋液為pH7.3的100mmol/L PBS緩沖液,用以在實(shí)際測(cè)試過(guò)程中,將第一反應(yīng)液和第二反應(yīng)液分別稀釋成合適濃度的dNTP和端粒酶測(cè)試工作液;
2)芯片的構(gòu)建:玻璃片上鍍覆一層厚度為44nm的金膜后,置于10μmol/L的修飾有巰基的端粒DNA溶液中5℃孵育18小時(shí),將端粒DNA通過(guò)巰基連接于金膜表面,其中,DNA序列如下:5’-SH-AAA AAA AAA AAA TTA GGG TTA GGG TTA GGG TTA GGG。修飾完成后用2mmol/L的巰基己醇的磷酸緩沖液封閉4小時(shí),最后將制備好的芯片真空干燥,氮?dú)獗Wo(hù)封存,能夠長(zhǎng)期儲(chǔ)存,測(cè)試時(shí)直接使用;
3)使用:將修飾好的芯片放入雙通道SPR儀,測(cè)試流動(dòng)液為配置好的dNTP測(cè)試工作液,在一個(gè)通道的流動(dòng)液中加入一定濃度的待測(cè)抑制劑,另一通道中不加入抑制劑作為參照。當(dāng)基線穩(wěn)定后,通過(guò)六元閥在兩個(gè)通道中加入等量配制好的端粒酶測(cè)試溶液,通過(guò)對(duì)比不同通道的信號(hào)能夠得到端粒酶抑制劑的效果。
<實(shí)例4>
1)試劑盒的制備,其具有第一反應(yīng)液、第二反應(yīng)液和稀釋液,所述第一反應(yīng)液包含50mmol/L的磷酸鹽緩沖液和105mmol/L的dNTP,所述緩沖液的pH為7.3;所述第二反應(yīng)液包含100000U/ml的端粒酶及pH為7.3的端粒酶儲(chǔ)備液,端粒酶儲(chǔ)備液包含150mmol/L PBS緩沖液、5mmol/L的MgCl2以及8wt%的甘油,所述穩(wěn)定液的pH為7.3;所述稀釋液為pH7.3的150mmol/L PB緩沖液,用以在實(shí)際測(cè)試過(guò)程中,將第一反應(yīng)液和第二反應(yīng)液分別稀釋成合適濃度的dNTP和端粒酶測(cè)試工作液;
2)芯片的構(gòu)建:玻璃片上鍍覆一層厚度為44nm的銀膜后,置于12μmol/L的修飾有巰基的端粒DNA溶液中4℃孵12小時(shí),將端粒DNA通過(guò)巰基連接于銀膜表面,其中,DNA序列如下:5’-SH-AAA AAA AAA AAA TTA GGG TTA GGG TTA GGG TTA GGG。修飾完成后用1mmol/L的巰基乙醇的磷酸緩沖液封閉3小時(shí),最后將制備好的芯片真空干燥,氮?dú)獗Wo(hù)封存,能夠長(zhǎng)期儲(chǔ)存,測(cè)試時(shí)直接使用;
3)使用:將修飾好的芯片放入雙通道SPR儀,測(cè)試流動(dòng)液為配置好的dNTP測(cè)試工作液,在一個(gè)通道的流動(dòng)液中加入一定濃度的待測(cè)抑制劑,另一通道中不加入抑制劑作為參照。當(dāng)基線穩(wěn)定后,通過(guò)六元閥在兩個(gè)通道中加入等量配制好的端粒酶測(cè)試溶液,通過(guò)對(duì)比不同通道的信號(hào)能夠得到端粒酶抑制劑的效果。
<實(shí)例5>
1)試劑盒的制備,其具有第一反應(yīng)液、第二反應(yīng)液和稀釋液,所述第一反應(yīng)液包含150mmol/L的磷酸鹽緩沖液和115mmol/L的dNTP,所述緩沖液的pH為7.3;所述第二反應(yīng)液包含100000U/ml的端粒酶及pH為7.3的端粒酶儲(chǔ)備液,端粒酶儲(chǔ)備液包含150mmol/L PB緩沖液、12mmol/L的MgCl2以及8wt%的甘油,所述穩(wěn)定液的pH為7.3;所述稀釋液為pH7.3的150mmol/L PB緩沖液,用以在實(shí)際測(cè)試過(guò)程中,將第一反應(yīng)液和第二反應(yīng)液分別稀釋成合適濃度的dNTP和端粒酶測(cè)試工作液;
2)芯片的構(gòu)建:玻璃片上鍍覆一層厚度為45nm的金膜后,置于7μmol/L的修飾有三硫代金剛烷衍生物的端粒DNA溶液中8℃孵20小時(shí),三硫代金剛烷衍生物的結(jié)構(gòu)式如下:
其中,R表示三硫代金剛烷衍生物的功能基團(tuán),
端粒DNA的序列為:5’-X-AAA AAA AAA AAA TTA GGG TTA GGG TTA GGG TTA GGG,其中X為三硫代金剛烷衍生物,將端粒DNA通過(guò)三巰基連接于金膜表面。修飾完成后用3mmol/L的巰基十一醇的磷酸緩沖液封閉5小時(shí),最后將制備好的芯片真空干燥,氮?dú)獗Wo(hù)封存,能夠長(zhǎng)期儲(chǔ)存,測(cè)試時(shí)直接使用;
3)使用:將修飾好的芯片放入雙通道SPR儀,測(cè)試流動(dòng)液為配置好的dNTP測(cè)試工作液,在一個(gè)通道的流動(dòng)液中加入一定濃度的待測(cè)抑制劑,另一通道中不加入抑制劑作為參照。當(dāng)基線穩(wěn)定后,通過(guò)六元閥在兩個(gè)通道中加入等量配制好的端粒酶測(cè)試溶液,通過(guò)對(duì)比不同通道的信號(hào)能夠得到端粒酶抑制劑的效果。
盡管本發(fā)明的實(shí)施方案已公開如上,但其并不僅僅限于說(shuō)明書和實(shí)施方式中所列運(yùn)用。它完全可以被適用于各種適合本發(fā)明的領(lǐng)域。對(duì)于熟悉本領(lǐng)域的人員而言,可容易地實(shí)現(xiàn)另外的修改。因此在不背離權(quán)利要求及等同范圍所限定的一般概念下,本發(fā)明并不限于特定的細(xì)節(jié)和這里示出與描述的圖例。