本發(fā)明涉及糧食作物玉米的成分檢測方法,具體為一種新型玉米轉(zhuǎn)基因成分的物理檢測方法。
背景技術(shù):
農(nóng)作物轉(zhuǎn)基因檢測方法主要有2類:第1類方法在市場監(jiān)管檢測中最為常用,是以外源基因的特定DNA序列為對象的檢測技術(shù);第2類是蛋白質(zhì)檢測技術(shù)。
1.基于DNA序列的檢測方法
(1)PCR檢測方法。依據(jù)其檢測對象不同分為4類:元件特異性PCR、基因特異性PCR、構(gòu)建特異性PCR、轉(zhuǎn)化體特異性PCR。通過PCR技術(shù)檢測轉(zhuǎn)基因轉(zhuǎn)化載體攜帶的啟動子、標記基因、終止子等特定序列,判斷其是否為轉(zhuǎn)基因作物。該方法特異性較好、效率較高、費用低,是目前我國農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因監(jiān)管部門進行轉(zhuǎn)基因監(jiān)管檢測的主要方法,目前已發(fā)布此類檢測標準逾50項。該方法通過普通PCR或?qū)崟r熒光定量PCR對轉(zhuǎn)基因作物通用元件進行檢測,是一種較精確、高效的方法,但缺陷是目前通量較小、周期較長,容易出現(xiàn)假陽性。
(2)基因芯片法?;蛐酒ㄓ址Q為DNA微探針陣列法,其實質(zhì)就是高度集成化的反向斑點雜交技術(shù),通過將外源基因的特異性片斷制成檢測芯片,與待測樣本的DNA進行雜交,反應(yīng)結(jié)果掃描后,通過計算機軟件分析,來判斷出待測樣品是否為轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品。該方法通量高,但是檢測過程繁瑣,尤其是費用很高,對實驗設(shè)備要求高,可普及性較低。
2.基于表達產(chǎn)物蛋白質(zhì)的檢測方法。以抗體、抗原為基礎(chǔ)的免疫學(xué)蛋白質(zhì)檢測方法,通過定性、定量外源基因表達產(chǎn)生的蛋白質(zhì)來判斷作物是否為轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品。外源表達蛋白的檢測方法有3種:生化反應(yīng)檢測法;免疫學(xué)檢測法,主要有Western雜交、ELISA法及免疫沉淀法;外源表達蛋白生物學(xué)活性的檢測。外源表達蛋白的檢測是轉(zhuǎn)基因作物檢測及安全性評價最有效的方法之一,但此種方法只針對某一個轉(zhuǎn)化事件,需要采取逐個排除的方法來達到檢測目的,繁瑣、成本高,不適于大批量盲樣檢測。此外還要考慮轉(zhuǎn)基因后基因表達沉默的問題,易出現(xiàn)漏檢。
玉米轉(zhuǎn)基因成分的檢測,現(xiàn)有技術(shù)主要是生化檢測方法,存在著樣品前處理復(fù)雜、檢測過程繁瑣、動用試劑多、檢測費用昂貴、檢測時間長、易出現(xiàn)假陽性,以及檢測人員專業(yè)水平要求高等技術(shù)問題,
技術(shù)實現(xiàn)要素:
為了克服上述現(xiàn)有技術(shù)中的不足,本發(fā)明提供了一種采用太赫茲光譜檢測方法,通過分析玉米樣品的太赫茲光譜信號檢測其轉(zhuǎn)基因成分是否陽性,具有樣本制備簡單、檢測速度快、精度高、智能化程度高、對檢測人員要求水平低等優(yōu)點,可有效解決傳統(tǒng)生化檢測方法存在的檢測速度慢、檢測過程復(fù)雜的問題。
本發(fā)明的目的是這樣實現(xiàn)的:
一種新型玉米轉(zhuǎn)基因成分的物理檢測方法,包括以下步驟:
1)標樣和樣品的制作;
2)標樣的太赫茲時域光譜數(shù)據(jù)的獲?。?/p>
3)樣品轉(zhuǎn)基因成分的太赫茲光譜檢測;
4)玉米轉(zhuǎn)基因成分的定性分析。
所述的步驟1)的標樣和樣品的制作中,標樣用于建立各品系玉米(包括轉(zhuǎn)基因和非轉(zhuǎn)基因的)的太赫茲標準光譜庫;樣品用于對玉米轉(zhuǎn)基因成分的檢測;制作標樣的標準物質(zhì)原材料來源于各玉米品系的標準物質(zhì),標準物質(zhì)從國家糧食局科學(xué)研究院購買,并具有標準物質(zhì)證書;
標準物質(zhì)原材料在充分粉碎、研磨后,取120mg,加入40mg聚乙烯粉末,經(jīng)搖勻器充分混合后,放置壓片機進行壓片。壓片時保持壓力10MPa三分鐘,取出壓片,用電子螺旋測微器測量厚度(精確到0.01mm)后,放置密封袋封好,密封袋貼標簽注明品系名稱和厚度,至此,標樣制作完畢;樣品制作過程同標樣制作過程;
標樣或樣品需在半小時內(nèi)測試完畢,以避免標樣放置在空氣中發(fā)生的理化變化;標樣或樣品原材料在使用前保持水分含量在12%-15%左右,若水分過高,會影響樣品對太赫茲輻射的吸收,因此需要使用烘干機進行烘干后再進行制樣。12%-15%的水分參數(shù)確定來源于糧食安全儲藏相關(guān)國家標準;
所述的步驟2)標樣的太赫茲時域光譜數(shù)據(jù)的獲取中:將標樣放置于太赫茲時域光譜儀中,采用透射方式獲取標樣的太赫茲時域光譜數(shù)據(jù)。檢測的環(huán)境條件設(shè)置為:環(huán)境溫度:20℃,環(huán)境濕度:≤10%;每種玉米品系制作3個標樣,每個標樣測量3次,總共對每種玉米品系測得9組時域光譜數(shù)據(jù),取0.2T-1.2T波段作為有效數(shù)據(jù)進行平均,得到該標樣9次平均的時域光譜數(shù)據(jù),再利用光譜儀本身的隨機軟件,獲取該標樣的吸收譜數(shù)據(jù)和波形,存儲到數(shù)據(jù)庫中;對各品系標樣重復(fù)上述檢測過程,建立玉米各品系太赫茲吸收光譜標準數(shù)據(jù)庫;
所述的步驟3)樣品轉(zhuǎn)基因成分的太赫茲光譜檢測中,對于需檢測的玉米樣品,首先需進行去雜質(zhì)、清洗,烘干,取小部分進行水分測定,待水分穩(wěn)定在12%-15%之間時,再進行粉碎、研磨、壓片。將壓片放置于太赫茲光譜儀中按步驟2)進行光譜測定;
所述的步驟4)玉米轉(zhuǎn)基因成分的定性分析中:(1)以0.01T為頻率間隔,取0.2T-1.2T太赫茲波段吸收譜的100個數(shù)據(jù)點。對于樣品數(shù)據(jù),記為Xi(i=1,2,…,100);對于標準光譜庫中的數(shù)據(jù),記為Yi(i=1,2,…,100);
(2)按以下公式計算樣品數(shù)據(jù)與對應(yīng)光譜庫標樣數(shù)據(jù)的相關(guān)系數(shù);
上式中,n=100,為樣品數(shù)據(jù)平均值,為相應(yīng)光譜庫中標樣數(shù)據(jù)平均值,r是計算得到的相關(guān)系數(shù);
對標準光譜庫中的每一個標樣計算相關(guān)系統(tǒng)r1,r2,…,rn,…;
從r1,r2,…,rn,…中選取最大的r值,并把對應(yīng)的標樣作為玉米轉(zhuǎn)基因成分的鑒定結(jié)果。
積極有益效果:本發(fā)明采用太赫茲光譜檢測方法,通過分析玉米樣品的太赫茲光譜信號檢測其轉(zhuǎn)基因成分是否陽性,具有樣本制備簡單、檢測速度快、精度高、智能化程度高、對檢測人員要求水平低等優(yōu)點,可有效解決傳統(tǒng)生化檢測方法存在的檢測速度慢、檢測過程復(fù)雜的問題。
附圖說明
圖1為實施例的四種玉米品系的太赫茲時域光譜;
圖2為實施例的四種玉米品系的太赫茲吸收譜。
具體實施方式
下面結(jié)合實施例,對本發(fā)明做進一步的說明:
一種新型玉米轉(zhuǎn)基因成分的物理檢測方法,包括以下步驟:
1.標樣和樣品制備方案:
標樣用于建立各品系玉米(包括轉(zhuǎn)基因和非轉(zhuǎn)基因的)的太赫茲標準光譜庫;樣品用于對玉米轉(zhuǎn)基因成分的檢測。
制作標樣的標準物質(zhì)原材料來源于各玉米品系的標準物質(zhì),標準物質(zhì)從國家糧食局科學(xué)研究院購買,并具有標準物質(zhì)證書。
標準物質(zhì)原材料在充分粉碎、研磨后,取120mg,加入40mg聚乙烯粉末,經(jīng)搖勻器充分混合后,放置壓片機進行壓片。壓片時保持壓力10MPa三分鐘,取出壓片,用電子螺旋測微器測量厚度(精確到0.01mm)后,放置密封袋封好,密封袋貼標簽注明品系名稱和厚度,至此,標樣制作完畢;樣品制作過程同標樣制作過程。
標樣或樣品需在半小時內(nèi)測試完畢,以避免標樣放置在空氣中發(fā)生的理化變化。
標樣或樣品原材料在使用前保持水分含量在12%-15%左右,若水分過高,會影響樣品對太赫茲輻射的吸收,因此需要使用烘干機進行烘干后再進行制樣。12%-15%的水分參數(shù)確定來源于糧食安全儲藏相關(guān)國家標準。
2.標樣的太赫茲時域光譜數(shù)據(jù)的獲取
將標樣放置于太赫茲時域光譜儀中,采用透射方式獲取標樣的太赫茲時域光譜數(shù)據(jù)。檢測的環(huán)境條件設(shè)置為:環(huán)境溫度:20℃,環(huán)境濕度:≤10%。每種玉米品系制作3個標樣,每個標樣測量3次,總共對每種玉米品系測得9組時域光譜數(shù)據(jù),取0.2T-1.2T波段作為有效數(shù)據(jù)進行平均,得到該標樣9次平均的時域光譜數(shù)據(jù),在利用光譜儀本身的隨機軟件,獲取該標樣的吸收譜數(shù)據(jù)和波形,存儲到數(shù)據(jù)庫中。對各品系標樣重復(fù)上述檢測過程,建立玉米各品系太赫茲吸收光譜標準數(shù)據(jù)庫
3.樣品轉(zhuǎn)基因成分的太赫茲光譜檢測
對于需檢測的玉米樣品,首先需進行去雜質(zhì)、清洗,烘干,取小部分進行水分測定,待水分穩(wěn)定在12%-15%之間時,再進行粉碎、研磨、壓片。將壓片放置于太赫茲光譜儀中按步驟2進行光譜測定。
4.玉米轉(zhuǎn)基因成分的定性分析
(1)以0.01T為頻率間隔,取0.2T-1.2T太赫茲波段吸收譜的100個數(shù)據(jù)點。對于樣品數(shù)據(jù),記為Xi(i=1,2,…,100);對于標準光譜庫中的標樣數(shù)據(jù),記為Yi(i=1,2,…,100)。
(2)按以下公式計算樣品數(shù)據(jù)與對應(yīng)光譜庫中標樣數(shù)據(jù)的相關(guān)系數(shù)。
上式中,n=100,為樣品數(shù)據(jù)平均值,為相應(yīng)光譜庫中標樣數(shù)據(jù)平均值,r是計算得到的相關(guān)系數(shù)。
對標準光譜庫中的每一個標樣計算相關(guān)系統(tǒng)r1,r2,…,rn,…。
從r1,r2,…,rn,…中選取最大的r值,并把對應(yīng)的標樣作為玉米轉(zhuǎn)基因成分的鑒定結(jié)果。
術(shù)語解釋:
1.太赫茲波:太赫茲波是指頻率在0.1THz到10THz(1T=1012Hz)范圍的電磁波,波長大概在0.03到3mm范圍,介于微波與紅外之間。
2.太赫茲時域光譜(THz-TDS):是一種新型的、非常有效的相干光譜探測技術(shù)。特征有:(1)對黑體輻射不敏感,信噪比遠高于傅里葉變換紅外光譜技術(shù)。(2)可探測材料在太赫茲波段的物理和化學(xué)信息。(3)可測得電介質(zhì)材料、半導(dǎo)體材料、生物大分子的振幅和相位信息。(4)可進行時間分辨的測量。
太赫茲波透射性強,其透射能力遠強于紅外,因此可以采用透射方式獲得關(guān)于樣品的太赫茲光譜,太赫茲透射光譜必然攜帶了更多的關(guān)于樣品內(nèi)部的物理化學(xué)性能,因而太赫茲光譜比紅外光譜更能反映樣品內(nèi)部理化信息,利用太赫茲光譜對樣品進行定性鑒別也就具有了更高的精確性。
實施例
通過本方法對玉米轉(zhuǎn)基因品系MIR162、Bt-11、MON810和非轉(zhuǎn)基因玉米品系Jinboshi781的太赫茲時域光譜圖如圖1所示,和如圖2所示吸收譜圖。
本發(fā)明采用太赫茲光譜檢測方法,通過分析玉米樣品的太赫茲光譜信號檢測其轉(zhuǎn)基因成分是否陽性,具有樣本制備簡單、檢測速度快、精度高、智能化程度高、對檢測人員要求水平低等優(yōu)點,可有效解決傳統(tǒng)生化檢測方法存在的檢測速度慢、檢測過程復(fù)雜的問題。
以上實施案例僅用于說明本發(fā)明的優(yōu)選實施方式,但本發(fā)明并不限于上述實施方式,在所述領(lǐng)域普通技術(shù)人員所具備的知識范圍內(nèi),本發(fā)明的精神和原則之內(nèi)所作的任何修改、等同替代及改進等,均應(yīng)視為本申請的保護范圍。