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北極海洋紅球菌B7740產(chǎn)類異戊二烯的結(jié)構(gòu)鑒定方法與流程

文檔序號:11228777閱讀:974來源:國知局
北極海洋紅球菌B7740產(chǎn)類異戊二烯的結(jié)構(gòu)鑒定方法與流程

本發(fā)明屬于紅球菌b7740產(chǎn)類異戊二烯分析的技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及北極海洋紅球菌b7740產(chǎn)類異戊二烯的結(jié)構(gòu)鑒定方法。



背景技術(shù):

紅球菌屬是一類廣泛分布于自然界的革蘭氏陽性菌,在土壤、海底沉積物和食草動物糞便中含量豐富,且多數(shù)為營腐生生活。紅球菌屬(rhodococcussp.)是在1891年由zoof建立的,從建立至今,分類地位一直不確定。目前,紅球菌歸屬于放線菌門(actinobacteria),放線菌綱(actinobacteria),放線菌亞綱(actinobacteridae),放線菌目(actinomycetales),棒桿菌亞目(croynebacterineae),諾卡氏菌科(nocardiaceae),紅球菌屬(rhodococcus)。

目前,國內(nèi)外對紅平紅球菌的研究較多,主要集中在其生物降解能力研究和分子學(xué)研究,而對紅球菌產(chǎn)類異戊二烯物質(zhì)研究較少,尤其對極地海洋來源的紅球菌所產(chǎn)類異戊二烯物質(zhì)的鑒定與研究尚十分匱乏,紅球菌b7740是我國北極科考隊于第三次北極科考時從b77站點20米的表層海水中發(fā)現(xiàn),對于該菌所產(chǎn)物質(zhì)的研究與傳統(tǒng)類異戊二烯物質(zhì)的鑒定有所不同。常見高等植物來源的類胡蘿卜素按照含氧和不含氧分為兩類,作為動植物生長必需的色素,目前已鑒定出來的約有750種,其中來自于海洋的約有250種,40種出現(xiàn)在人類膳食之中。紅球菌b7740所產(chǎn)類胡蘿卜素因該微生物獨特的代謝通路,與常見高等植物來源類胡蘿卜素相比,結(jié)構(gòu)相差較大,結(jié)構(gòu)種類不單一,其獨特的結(jié)構(gòu)不僅賦予了它獨特的活性,也增大了鑒定其分子結(jié)構(gòu)的難度。



技術(shù)實現(xiàn)要素:

為解決上述現(xiàn)有技術(shù)存在的問題,本發(fā)明提供了北極海洋紅球菌b7740產(chǎn)類異戊二烯的結(jié)構(gòu)鑒定方法,該鑒定方法操作方便快捷,結(jié)果可靠、穩(wěn)定。

實現(xiàn)本發(fā)明上述目的所采用的技術(shù)方案為:

北極海洋紅球菌b7740產(chǎn)類異戊二烯的結(jié)構(gòu)鑒定方法,采用液質(zhì)聯(lián)用法對北極海洋紅球菌b7740產(chǎn)類異戊二烯進行初步鑒定。

北極海洋紅球菌b7740產(chǎn)類異戊二烯的結(jié)構(gòu)鑒定方法,包括如下步驟:

1、類異戊二烯待測樣品的配制:

將類異戊二烯提取液加入8-10wt%的氯化鈉溶液中,類異戊二烯提取液與氯化鈉溶液的體積比為1:1,混合均勻,得混合液,將混合液在3-8℃離心分層,取下層有色層,將有色層干燥,再用甲醇與甲基叔丁基醚體積比為1:1的混合溶劑復(fù)溶,并用微孔濾膜過濾,得到類異戊二烯待測樣品;

2、類異戊二烯待測樣品的檢測:

采用液質(zhì)聯(lián)用儀對類異戊二烯待測樣品進行檢測:

2.1、液相色譜條件:

色譜柱ymcc30,柱溫25℃,紫外吸收檢測器,檢測波長450nm和242nm;

流動相:流動相a為甲醇,流動相b為甲基叔丁基醚,流速:1ml/min;

洗脫程序:

第一階段:采用流動相a和流動相b的混合液洗脫30分鐘,其中流動相a的體積百分含量由95%變?yōu)?0%,流動相b的體積百分含量由5%變?yōu)?0%;

第二階段:采用流動相a和流動相b的混合液洗脫20分鐘,其中流動相a的體積百分含量由70%變?yōu)?0%,流動相b的體積百分含量由30%變?yōu)?0%;

第三階段:采用流動相a和流動相b的混合液洗脫10分鐘,其中流動相a的體積百分含量由50%變?yōu)?5%,流動相b的體積百分含量由50%變?yōu)?%;

2.2、質(zhì)譜條件:

apci離子源,正離子模式,離子源溫度300℃,毛細管電壓350v,電暈電壓1v,干燥氣流7l/min,霧化室溫度350℃,霧化器壓力10psi,質(zhì)荷比掃描范圍50-1200。

進一步,步驟2.1中,離心的轉(zhuǎn)速為7000rpm,時間為10min。

進一步,步驟2.1中,微孔濾膜的孔徑為0.22μm。

與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明的優(yōu)點和有益效果在于:

1、類異戊二烯包括類異戊二烯醌與類胡蘿卜素,是自然界中廣泛存在的一類天然活性物質(zhì)。目前,對于植物和部分海洋動物來源的類異戊二烯的研究逐漸完善,已達到廣泛應(yīng)用階段,但微生物(特別是海洋微生物)作為類異戊二烯物質(zhì)的巨大來源,尚未有廣泛的報道與研究。紅球菌b7740作為我國第三次北極科考首次發(fā)現(xiàn)的菌種,其所產(chǎn)類異戊二烯物質(zhì)含量較高,種類豐富,需要我們用化學(xué)分析的方法對其進行結(jié)構(gòu)的鑒定與主要產(chǎn)物的純化。本發(fā)明所用agilent1100serieslc-msd-trap-xct初步鑒定方法,分析快速,結(jié)果可靠、穩(wěn)定,適合作為分析紅球菌b7740所產(chǎn)類胡蘿卜素的初步鑒定方法。

2、本發(fā)明可初步鑒定出紅球菌b7740產(chǎn)類異戊二烯物質(zhì)中包含9種類胡蘿卜素和14種類異戊二烯醌。

說明書附圖

圖1為北極海洋紅球菌b7740產(chǎn)類異戊二烯物質(zhì)在242nm處的液相圖譜。

圖2為北極海洋紅球菌b7740產(chǎn)類異戊二烯物質(zhì)在450nm處的液相圖譜。

圖3a為1號峰的紫外吸收圖譜。

圖3b為1號峰的二級質(zhì)譜圖譜。

圖4a為11號峰的紫外吸收圖譜。

圖4b為11號峰的二級質(zhì)譜圖譜。

圖5a為17號峰的紫外吸收圖譜。

圖5b為17號峰的二級質(zhì)譜圖譜。

圖6a為20號峰的紫外吸收圖譜。

圖6b為20號峰的二級質(zhì)譜圖譜。

圖7a為21號峰的紫外吸收圖譜。

圖7b為21號峰的二級質(zhì)譜圖譜。

具體實施方式

下面結(jié)合具體實施例對本發(fā)明進行詳細說明。

北極海洋紅球菌b7740,是發(fā)明人于2008年7-9月中國第三次北極科學(xué)考察期間,用seabird911plusctd系統(tǒng)從北冰洋b77站點(146°49.28′w,76°58.08′n)25m深的表層海水樣品中分離得到,寧波市微生物與環(huán)境工程重點實驗室通過16srdna序列blast在線比對,判定該菌為紅球菌屬。

實施例1

北極海洋紅球菌b7740產(chǎn)類異戊二烯的結(jié)構(gòu)鑒定實驗

1、實驗材料

1.1、實驗試劑

溶菌酶(20000u/mg)購自國藥集團化學(xué)試劑有限公司,醋酸鋅、氯化鈉、甲醇和二氯甲烷購自國藥集團化學(xué)試劑有限公司,色譜級甲醇購自賽默飛世爾科技(中國)有限公司,色譜級甲基叔丁基醚購自上海阿拉丁生化科技股份有限公司,β-胡蘿卜素標(biāo)準品(97%)購于美國sigma公司。

1.2、實驗儀器

agilent1100serieslc-msd-trap-xct液質(zhì)聯(lián)用儀購自安捷倫公司;centrifuge5810r臺式低溫離心機購自德國eppendorf公司。

1.3、實驗原料

按照中國專利(一種紅球菌b7740類胡蘿卜素的微膠囊制備方法、201510016005.8)公開的方法制備類異戊二烯提取液:

稱取0.8g北極海洋紅球菌b7740凍干菌粉(浙江萬里學(xué)院提供)置于離心管中,加入16ml溶菌酶溶液(1mg/ml),將離心管置于37℃水浴中,避光放置1h,然后加入24ml飽和醋酸鋅溶液使已破壁的紅球菌沉降,將該離心管于7000rpm、4℃下離心10min,丟棄上清液,再將64ml混合有機溶劑(甲醇:二氯甲烷=4:1,體積比)加入到紅球菌沉淀中,用玻璃棒攪拌均勻,離心,分離出上清液,繼續(xù)向離心管中加入混合有機溶劑(甲醇:二氯甲烷=4:1,體積比),如此反復(fù)提取2-3次,合并上清液,得到類異戊二烯提取液。

2、實驗方法

2.1、類異戊二烯待測樣品的配制:

將60ml類異戊二烯提取液加入60ml10wt%氯化鈉溶液中,混合均勻,得混合液,將混合液在7000rpm、4℃離心分層,取下層有色層,將有色層用氮氣吹干,再用2ml甲醇與甲基叔丁基醚的混合溶劑(甲醇與甲基叔丁基醚的體積比為1:1)復(fù)溶,并用0.22μm微孔濾膜過濾,得到約1.5ml待測樣品。

2.2、類異戊二烯待測樣品的檢測:

采用液質(zhì)聯(lián)用儀對類異戊二烯待測樣品進行檢測:

2.2.1、液相色譜條件:

色譜柱ymcc30(5um×4.6mm×150mm),柱溫25℃,紫外吸收檢測器,檢測波長450nm,進樣量10ul;

流動相:流動相a為甲醇,b為甲基叔丁基醚;

洗脫程序:

第一階段:采用流動相a和流動相b的混合液洗脫30分鐘,其中流動相a的體積百分含量由95%變?yōu)?0%,流動相b的體積百分含量由5%變?yōu)?0%;

第二階段:采用流動相a和流動相b的混合液洗脫20分鐘,其中流動相a的體積百分含量由70%變?yōu)?0%,流動相b的體積百分含量由30%變?yōu)?0%;

第三階段:采用流動相a和流動相b的混合液洗脫10分鐘,其中流動相a的體積百分含量由50%變?yōu)?5%,流動相b的體積百分含量由50%變?yōu)?%;

2.2.2、質(zhì)譜條件:

apci離子源,正離子模式,離子源溫度300℃,毛細管電壓350v,電暈電壓1v,干燥氣流7l/min,霧化室溫度350℃,霧化器壓力10psi,質(zhì)荷比掃描范圍50-1200。

3、實驗結(jié)果:

在檢測波長242和450nm下,分別出現(xiàn)了兩張液相色譜圖,圖1為242nm下紅球菌b7740產(chǎn)類異戊二烯物質(zhì)的液相色譜圖譜,圖2為450nm下紅球菌b7740產(chǎn)類異戊二烯物質(zhì)的液相色譜圖譜,按照出峰順序分別編號,圖1中出現(xiàn)了10個峰,分別為1、2、3、4、5、6、9、11、13和15號峰,圖2中出現(xiàn)了14個峰,分別為7、8、10、11、12、13、16、17、18、19、20、21、22和23號峰。

3.1、類異戊二烯醌的分析鑒定:

1號峰經(jīng)分析,從圖3a、圖3b和表1中可以看出,其二級質(zhì)譜圖中有m/z=197的特征碎片離子,其紫外特征吸收峰258nm處,且加氫分子離子峰m/z=455,因此,判斷1號峰為泛醌類物質(zhì)uq4。

2、3號峰經(jīng)分析,從表1中可以看出,其二級質(zhì)譜圖中都有m/z=187(甲基萘醌)的特征碎片離子峰,它們的加氫分子離子峰m/z分別為717、649,同時紫外特征吸收峰都集中在242nm處,因此,判定2、3號峰分別為甲基萘醌mk8、mk7。

4、6、7和13號峰經(jīng)分析,從表1中可以看出,其二級質(zhì)譜圖中都有m/z=187(甲基萘醌)的特征碎片離子峰,與2號峰相比,其紫外特征吸收峰有所紅移,分別為248nm、244nm、244nm、248nm,它們的氫分子離子峰m/z均為717,因此,判定4、6、7和13號峰均為2號峰的同分異構(gòu)體,均為甲基萘醌mk8。

8號峰經(jīng)分析,從表1中可以看出,其二級質(zhì)譜圖有m/z=187(甲基萘醌)的特征碎片離子峰,與3號峰相比,其紫外特征吸收峰有所紅移,為246nm,其氫分子離子峰m/z為649,因此,判定8號峰為3號峰的同分異構(gòu)體,為甲基萘醌mk7。

5和11號峰經(jīng)分析,從表1、圖4a和圖4b中可以看出,其二級質(zhì)譜圖都有m/z=187(甲基萘醌)的特征碎片離子峰,與3號峰相比,其紫外特征吸收峰有所紅移,分別為248nm、244nm,其加氫分子離子峰m/z分別增加了4、2da,分別為653、651,因此,我們推斷其為mk7異戊二烯鏈上的加氫產(chǎn)物,分別為mk7(h4)、mk7(h2)。

9和15號峰經(jīng)分析,從表1可以看出,其二級質(zhì)譜圖有m/z=187(甲基萘醌)的特征碎片離子峰,與2號峰相比,其紫外特征吸收峰有所紅移,分別為254nm、248nm,其加氫分子離子峰m/z分別增加了4、2da,推斷其為mk8異戊二烯鏈上的加氫產(chǎn)物,mk8異戊二烯鏈上的加氫產(chǎn)物,分別為mk8(h4)、mk8(h2)。

14、18號峰從檢測數(shù)據(jù)初步判定其也為類異戊二烯醌。

上述峰的液質(zhì)聯(lián)用儀檢測數(shù)據(jù)如表1所示:

表1:紅球菌b7740產(chǎn)類異戊二烯醌的出峰時間,紫外特征峰及質(zhì)譜數(shù)據(jù)

由上述可知,1、2、3、4、5、6、7、8、9、11、13、14、15和18號峰所對應(yīng)的物質(zhì)均為類異戊二烯醌。

3.2、類胡蘿卜素的分析鑒定:

17號峰經(jīng)分析,從表2、圖5a、圖5a可以看出,其二級質(zhì)譜圖都有m/z=163(c10h12o2+h)的特征碎片離子峰,其紫外特征吸收峰分別在274nm、452nm、468nm處,其加氫離子峰m/z=589,因此,判定17號峰為all-trans-synechoxanthin(χ,χ-caroten-18,18'-dioicacid)。

10、12號峰經(jīng)分析,從表2可以看出,其二級質(zhì)譜碎片與17號峰一致,因其紫外吸收圖譜中含有在340左右的順式結(jié)構(gòu)特征吸收峰,判斷其為cis-synechoxanthin。

19號峰經(jīng)分析,具體數(shù)據(jù)見表2,將19號峰與β-胡蘿卜素標(biāo)準品的紫外吸收圖譜、液相圖譜和二級質(zhì)譜圖進行對比,發(fā)現(xiàn)兩者的圖譜基本保持一致,因此,判定19號峰為β-胡蘿卜素。

16號峰經(jīng)分析,從表2可以看出,其二級質(zhì)譜碎片與19號峰一致,因其紫外吸收圖譜中含有在340左右的順式結(jié)構(gòu)特征吸收峰,判斷其為cis-β-carotene。

20號峰經(jīng)分析,從表2、圖6a、圖6a可以看出,其二級質(zhì)譜圖有m/z=413[m+h-c9h12]的特征碎片離子峰,紫外特征吸收峰在460nm處,加氫分子離子峰m/z=533,因此,判定20號峰為chlorobactene(φ,ψ-carotene)。

21號峰經(jīng)分析,從表2、圖7a、圖7a可以看出,其二級質(zhì)譜圖有m/z=409[m+h-c9h12]的特征碎片離子峰,紫外可見特征吸收峰在282nm、452nm、476nm處,加氫分子離子峰為m/z=529,因此,判定21號峰為isorenieratene(φ,φ-carotene)。

22、23號峰從檢測數(shù)據(jù)初步判定其也為類胡蘿卜素。

上述峰的液質(zhì)聯(lián)用儀檢測數(shù)據(jù)如表2所示:

由上述可知,10、12、16、17、19、21、22、23號峰所對應(yīng)的物質(zhì)均為類胡蘿卜素。

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