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一種檢測尿外泌體荷載miRNAs的試劑盒和方法與流程

文檔序號:11771795閱讀:214來源:國知局
一種檢測尿外泌體荷載miRNAs的試劑盒和方法與流程

本發(fā)明涉及一種檢測尿外泌體荷載mirnas的試劑盒和方法。



背景技術(shù):

腎纖維化(renalfibrosis,rf),包括腎間質(zhì)纖維化和腎小球硬化,是一個(gè)動(dòng)態(tài)發(fā)展的過程,標(biāo)志著不可逆性腎損傷,是影響各類腎臟疾病的治療及預(yù)后的重要因素之一。[羅海清,梁冬,劉華鋒.腎間質(zhì)纖維化的形成機(jī)制及中醫(yī)藥防治作用.中國中西醫(yī)結(jié)合腎病雜志,2004,5(7):432-434.]因此,延緩和阻斷腎纖維化是防治腎損害的關(guān)鍵,也是目前國內(nèi)外腎臟病研究的熱點(diǎn)。能否及時(shí)、準(zhǔn)確地判斷是否存在腎纖維化及其程度,有助于臨床醫(yī)生合理制定治療方案及較準(zhǔn)確地判斷預(yù)后。

臨床上腎纖維化診斷有賴于腎臟病理學(xué)診斷,而腎活檢是一種有創(chuàng)性檢查,對于有腎活檢禁忌證的患者則無法施行;無法廣泛的在基層醫(yī)院開展。并且,鑒于醫(yī)學(xué)倫理學(xué),難以通過重復(fù)腎活檢對病情作動(dòng)態(tài)監(jiān)測,而且患者也不易接受。因此,尋找一組無創(chuàng)性診斷指標(biāo)對腎纖維化的診斷、病情動(dòng)態(tài)觀察、療效的客觀評價(jià),有著積極的臨床意義。

過去,一些血、尿蛋白被用于腎纖維化的診斷,如透明質(zhì)酸、層粘蛋白、ⅲ型前膠原、ⅳ型膠原等[許筠,張少山,程保智,等.測定血清等對腎纖維化診斷的意義.蘭州大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版),2011,37(4):24-27、32.],可以在一定程度上反應(yīng)腎纖維化的進(jìn)程,但這些蛋白直接暴露于體液中,容易降解而使結(jié)果不穩(wěn)定,不能實(shí)時(shí)的反應(yīng)病變。mirnas分子是近年研究的熱點(diǎn),但目前還沒有得到公認(rèn)的用于檢測腎纖維化的mirnas分子診斷標(biāo)志物。

近年來,液體活檢方法診斷腎纖維化的價(jià)值日益受到人們的重視。尿外泌體(exosome)膜中包含特征性蛋白和核酸,比裸露的蛋白、核酸更穩(wěn)定的反映腎小球和腎小管細(xì)胞損傷和修復(fù)情況、間質(zhì)炎癥、基質(zhì)沉積等,從而反應(yīng)纖維化和疾病進(jìn)程。同時(shí),由于尿液取樣方便,無創(chuàng)且可反復(fù)取樣,因此,檢測尿外泌體中標(biāo)志性分子,成為液體活檢研究中的熱點(diǎn),可以實(shí)時(shí)了解腎纖維化的進(jìn)程。

比如,[lvll,caoyh,nihf,etal.microrna-29cinurinaryexosome/microvesicleasabiomarkerofrenalfibrosis[j].amjphysiolrenalphysiol,2013,305(8):f1220-f1227.]等研究發(fā)現(xiàn)腎纖維化患者尿液中的mir-29c較健康人呈低表達(dá),能有效預(yù)測腎小球?yàn)V過率估算值(egfr)和小管間質(zhì)性纖維化程度,且能特異性區(qū)別輕度、中度和重度腎纖維化。因而,尿液exosome中的mir-29c與腎功能和纖維化程度的相關(guān)性,可以作為一種新的非侵入性腎纖維化指示分子。

但是,目前提取分離外泌體的方法多樣,包括超速離心、密度梯度離心、免疫磁珠、超濾或試劑盒等方法,這些方法各有優(yōu)缺點(diǎn),超速離心法需要超速離心機(jī),過程比較費(fèi)時(shí),且回收率不穩(wěn)定(可能與轉(zhuǎn)子類型有關(guān)),純度也受到質(zhì)疑;此外,重復(fù)離心操作還有可能對囊泡造成損害,從而降低其質(zhì)量。密度梯度離心法獲得的外泌體純度較高,但步驟繁瑣,耗時(shí)。超濾離心法簡單高效,且不影響外泌體的生物活性,是提取細(xì)胞外泌體的一種新方法。磁珠法具有特異性高、操作簡便、不影響外泌體形態(tài)完整等優(yōu)點(diǎn),但是效率低,外泌體生物活性易受ph和鹽濃度影響,不利于下游實(shí)驗(yàn),難以廣泛普及。試劑盒價(jià)格昂貴,不適合大規(guī)模檢測。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

本發(fā)明提供了一種檢測尿外泌體中的mir-29c的試劑盒和方法。

本發(fā)明檢測尿外泌體荷載mirnas的試劑盒,它包括外泌體提取試劑和mirnas檢測試劑,其中,提取試劑為聚乙二醇和氯化鈉的混合溶液。

優(yōu)選地,所述聚乙二醇和氯化鈉的混合溶液中,聚乙二醇的濃度為0.16~0.24g/ml,所述氯化鈉的濃度為0.0584g/ml。

優(yōu)選地,所述聚乙二醇和氯化鈉的混合溶液中,聚乙二醇的濃度為0.16g/ml。

優(yōu)選地,所述mirnas檢測試劑為qpcr檢測試劑,優(yōu)選地,所述qpcr檢測試劑為基于莖環(huán)法的m-mlvfriststrandcdnasynthesiskit(omega)和greenpcrmastermix(appliedbiosystems)試劑盒。

優(yōu)選地,它還包括rna提取試劑,所述rna提取試劑為trizol試劑。

本發(fā)明還提供了一種檢測尿外泌體荷載mirnas的方法,步驟如下:

(1)取尿液,采用權(quán)利要求1~4任意一項(xiàng)所述試劑盒中的提取試劑提取尿外泌體;

(2)提取尿外泌體中的總rna,采用權(quán)利要求1~5任意一項(xiàng)所述試劑盒中的檢測試劑檢測,即可。

步驟(1)中,所述提取的方法如下:

1)取待檢樣品,離心,取上清;

2)將提取試劑加入步驟1)的上清中,混勻,反應(yīng)12h以上,離心,棄上清,收集沉淀,即可。

步驟1)中,所述離心是在4℃、2000g條件下離心10分鐘。

步驟2)中,反應(yīng)的溫度是4℃;離心是在4℃、3580g條件下離心1h。

本發(fā)明還提供了前述試劑盒在制備腎纖維化檢測試劑中的用途。

本發(fā)明采用試劑盒包含提取外泌體的試劑以及mir-29c的檢測試劑,本發(fā)明外泌體提取試劑可以有效提取外泌體,收率高,制備得到的產(chǎn)品純度也較高,可以有效檢測外泌體中的mir-29c,同時(shí)操作簡便,不需要超速離心,易于推廣應(yīng)用,成本低廉,臨床應(yīng)用前景良好。

下面通過具體實(shí)施方式對本發(fā)明做進(jìn)一步詳細(xì)說明,但是并不是對本發(fā)明的限制,根據(jù)本發(fā)明的上述內(nèi)容,按照本領(lǐng)域的普通技術(shù)知識和慣用手段,在不脫離本發(fā)明上述基本技術(shù)思想前提下,還可以做出其它多種形式的修改、替換或變更。

附圖說明

圖1外泌體檢測結(jié)果:a.外泌體電鏡(×15.0k),b.外泌體westernblot結(jié)果,c.nta分析外泌體粒徑分布。

圖2mirna-29c水平roc曲線。

具體實(shí)施方式

實(shí)施例1本發(fā)明檢測試劑盒的組成

(1)外泌體提取試劑

取聚乙二醇0.8g;氯化鈉0.292g,加雙蒸水,混勻,定容到5ml,得聚乙二醇-氯化鈉混合溶液。

(2)rna提取試劑

可以采用常規(guī)的rna提取試劑,如trizol試劑(invitrogen)。

(3)檢測試劑

基于poly-a加尾法的midetectatracktmmirnaqrt-pcr試劑盒(廣州銳博)。

實(shí)施例2本發(fā)明檢測試劑盒的組成

(1)外泌體提取試劑

取聚乙二醇0.8g;氯化鈉0.292g,加雙蒸水,混勻,定容到5ml,得聚乙二醇-氯化鈉混合溶液即。

(2)rna提取試劑

可以采用常規(guī)的rna提取試劑,如trizol試劑(invitrogen)。

(3)檢測試劑

m-mlvfriststrandcdnasynthesiskit(omega)和greenpcrmastermix(appliedbiosystems)試劑盒。

實(shí)施例3本發(fā)明檢測試劑盒的組成

(1)外泌體提取試劑

取聚乙二醇1.2g;氯化鈉0.292g,加雙蒸水,混勻,定容到5ml,得聚乙二醇-氯化鈉混合溶液。

(2)rna提取試劑

可以采用常規(guī)的rna提取試劑,如trizol試劑(invitrogen)。

(3)檢測試劑

m-mlvfriststrandcdnasynthesiskit(omega)和greenpcrmastermix(appliedbiosystems)試劑盒。

實(shí)施例4本發(fā)明mir-29c的檢測方法

一、尿液收集與保存

1.研究對象:選取2016年10月至2017年2月成都中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院和四川省人民醫(yī)院腎病內(nèi)科住院的經(jīng)腎穿刺診斷為腎纖維化的患者25例設(shè)為研究組。其中男20例,女19例。年齡31~72歲,平均(61.3±10.3)歲。腎組織均經(jīng)he、masson染色檢查證實(shí),符合腎纖維化診斷標(biāo)準(zhǔn)。排除①年齡<18歲者或伴有尿路感染、sle、器官移植的患者。②因心血管疾病具有明顯癥狀、體征的嚴(yán)重合并癥而使用糖皮質(zhì)激素和免疫抑制劑的患者。③孕婦及哺乳期患者。④合并惡性腫瘤患者。⑤有明顯其他器官纖維化患者(如肝纖維化、肺纖維化、大面積纖維疤痕等)。⑥其他研究者認(rèn)為不適合納入研究的患者。將同期醫(yī)院體檢中心確診的的健康志愿者15例設(shè)為對照組,其中男12例、女8例,年齡46~79歲,平均(60.25±8.0)歲。本研究獲醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn)。

2.尿液收集與保存:健康志愿者于體檢中心采清晨第一次晨尿標(biāo)本,腎纖維化患者于腎穿刺術(shù)后7日內(nèi)收集晨尿標(biāo)本20ml以上,加入蛋白酶抑制劑后,-80℃凍存。收集患者近期血尿常規(guī)及肝腎功結(jié)果,及其他一些異常檢查結(jié)果。

研究組和對照組在性別、年齡間無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(p>0.05);血中尿素氮、肌苷的表達(dá)較對照組增高,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.05)。詳見表1。

表1研究對象的臨床、實(shí)驗(yàn)室結(jié)果情況表

二.尿外泌體的分離

分離方法:將保存于-80度的尿在冰上融化,3000g,4℃離心10min。將上清轉(zhuǎn)移至新的ep管中,加入5/7體積的聚乙二醇-氯化鈉混合溶液,輕輕顛倒混勻,4℃孵育過夜,4000g離心60min,去除上清,保留沉淀備用。

檢測:

①分析外泌體的粒徑和濃度:采用nanoparticle-trackinganalysis(nta)分析顆粒的數(shù)量和粒徑分布。將上述沉淀用30μl無顆粒pbs重懸,測試前再稀釋1000倍。

②透射電鏡觀察外泌體的形態(tài):醋酸雙氧鈾負(fù)染外泌體后,80kv-120kv成像觀察外泌體電鏡結(jié)構(gòu)。

③westenblot檢測外泌體標(biāo)志物:采用sds上樣緩沖液充分提取外泌體蛋白,考馬斯亮藍(lán)染色觀察蛋白分布情況,10%sds-page分離蛋白,濕轉(zhuǎn)法將蛋白轉(zhuǎn)移到pvdf膜上,5%脫脂奶粉室溫封閉1h,分別加入cd63(abcam,usa)和cd9(abcam,usa)抗體(1:1000),4℃封閉過夜,tbs-t洗3次,加入hrp標(biāo)記的2抗(1:1000),室溫孵育1h,增強(qiáng)化學(xué)發(fā)光法顯色,膠片記錄。

本實(shí)驗(yàn)獲得的血清外泌體大致呈圓形、部分有凹陷,粒徑在100nm以下(圖1a),表達(dá)cd9,cd63等外泌體的標(biāo)志分子,且研究組和對照組間無明顯差異(圖1b)。進(jìn)一步的nta分析顯示,分離到的外泌體粒徑并不均一,主要分布在40和100nm附近(圖1c),說明成功分離了人尿外泌體。

三.外泌體rna抽提和定量及實(shí)時(shí)定量pcr

采用trizol抽提尿外泌體的總rna。

采用基于莖環(huán)法的m-mlvfriststrandcdnasynthesiskit(omega)和greenpcrmastermix(appliedbiosystems)試劑盒和7500realtimepcrsystem(appliedbiosystems)檢測mir-29c和內(nèi)參基因snrna-u6,各樣本重復(fù)檢測3次。

研究組尿外泌體中mir-29c的表達(dá):采用qpcr檢測尿外泌體中mir-29c,其相對表達(dá)水平以方程2-△ct計(jì)算,其中△ct=(ctmirna-ctu6)。詳見表2。

表2腎纖維化患者和健康志愿者尿外泌體源mirna-29c水平情況表

尿外泌體中的mir-29c表達(dá)量與腎纖維化程度的關(guān)系:為評價(jià)尿外泌體中mir-29c的水平與腎纖維化程度之間的關(guān)系,以均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示mirna表達(dá)情況,兩組比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),p<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。以受試者工作特征曲線(receiveroperatingcharacteristiccurve,簡稱roc曲線)評估m(xù)ir-29c對腎纖維化診斷的特異度和敏感度。詳見圖2。

實(shí)驗(yàn)結(jié)果:腎纖維化病例中mir-29c在所有病例中均顯著降低,說明腎組織特異性mir-29c以外泌體形式進(jìn)入尿液,其水平較對照組顯著降低,且表達(dá)量與腎纖維化的程度呈負(fù)相關(guān),roc曲線分析顯示曲線下面積(auc)分別為0.947,因此,可以準(zhǔn)確檢測腎纖維化的程度。

實(shí)驗(yàn)結(jié)果說明,本發(fā)明方法可以有效提取尿液外泌體,并且準(zhǔn)確檢測尿液中的mir-29c,進(jìn)而用于腎纖維化的診斷,臨床應(yīng)用前景良好。

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