本發(fā)明屬于一種定量檢測parp(聚腺苷酸二磷酸核糖基聚合酶)活性的技術(shù),涉及石墨烯復(fù)合材料在臨床檢測的應(yīng)用,具體涉及石墨烯復(fù)合材料定量檢測生物酶的應(yīng)用領(lǐng)域。
背景技術(shù):
parp,也稱聚adp-核糖聚合酶,是一類存在于絕大多數(shù)真核生物中能催化多聚adp核糖基化的細(xì)胞核酶,結(jié)構(gòu)主要包括三個(gè)區(qū)域:dna結(jié)合域、自身修飾域、催化域。parp能夠結(jié)合各種dna結(jié)構(gòu)和核小體,并且具有nad+依賴的催化活性,可在目標(biāo)蛋白上合成聚(adp-核糖)聚合物。聚(adp-核糖)聚合物的形成顯著改變了受體蛋白的電荷特性,引發(fā)了dna損傷的控制和修補(bǔ)過程。parp在基因穩(wěn)定和腫瘤的發(fā)生發(fā)展、炎癥和應(yīng)激反應(yīng)、代謝和能量消耗、晝夜節(jié)律等方面都起重要的調(diào)節(jié)作用。而且parp在惡性腫瘤與正常組織中的表達(dá)存在有差異性,且這種差異性有可能在疾病的發(fā)生發(fā)展中起重要作用。近幾年,parp在dna損傷修復(fù)和維持基因組的穩(wěn)定性的作用引起世人的關(guān)注。在此基礎(chǔ)上,運(yùn)用抑制劑抑制parp參與介導(dǎo)的腫瘤細(xì)胞dna損傷修復(fù),更是當(dāng)前研究熱點(diǎn)之一。
parp活性檢測的傳統(tǒng)技術(shù)主要有酶聯(lián)免疫法,使用抗-par的單克隆抗體、hrp標(biāo)記的羊抗鼠1gg二抗,建立檢測沉積在免疫組蛋白上的par的比色方法或化學(xué)發(fā)光方法;或者采用放射性nad+的方法來測定了parp的酶活性。但此類方法有的需要標(biāo)記,具有成本高、需要樣品量較大、靈敏性差、檢測時(shí)間長的缺點(diǎn),而且有時(shí)候會(huì)得到假陽性結(jié)果。目前,hergenrother等采用化學(xué)定量nad+的方法間接測定了parp-1的酶活性,可用于小分子抑制劑的高通量篩查;并合成了adp-ribose-pnp顯色底物,發(fā)展了簡單、靈敏的比色方法來評(píng)價(jià)parp的活性。然而,這種方法需要繁瑣的合成。因此,該方法存在很多局限性。
近年來,為解決parp分析方法的弊端,研究者們已經(jīng)開發(fā)了許多簡單、可執(zhí)行的分析方法并將之應(yīng)用到parp活性的檢測中,例如比色檢測、熒光檢測、電化學(xué)檢測等。例如,湖南大學(xué)聶舟教授利用par對(duì)熒光蛋白scgfp與陽離子聚合物ccp間熒光共振能量轉(zhuǎn)移效率的調(diào)節(jié)作用,建立了parp活性的熒光檢測方法;南京師范大學(xué)戴志暉教授利用六氨合釕做指示劑,根據(jù)par靜電吸附六氨合釕的量建立了parp的電化學(xué)檢測新方法;南京大學(xué)李根喜教授利用parp引起修飾有輔酶nad金膠的聚集,建立了parp活性的比色檢測法。受以上方法的啟發(fā),我們建立了一種基于hemin-石墨烯復(fù)合材料比色檢測parp活性的方法。此方法無需標(biāo)記,易操作,而且與上述的比色方法相比,具有穩(wěn)定性高、檢測線低、檢測范圍廣的優(yōu)點(diǎn)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
發(fā)明目的:針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的問題,提供了一種基于hemin-石墨烯復(fù)合材料分析檢測parp活性的方法。本發(fā)明中利用parp催化合成的聚adp核糖鏈帶有大量的負(fù)電,會(huì)使在一定鹽濃度下的h-gns發(fā)生分散程度的變化。在tmb和h2o2存在下,通過得到的顯色程度不同的變化來測定parp活性。它具有靈敏度高、準(zhǔn)確性好、無標(biāo)記等優(yōu)點(diǎn)。
技術(shù)方案:為了解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明提供了一種基于hemin-石墨烯復(fù)合材料分析檢測parp活性的方法,包括以下步驟:
(1)選取激活dna激活parp(聚腺苷酸二磷酸核糖基聚合酶);
(2)合成h-gns(hemin-石墨烯)復(fù)合材料;
(3)將激活dna、parp、nad+(煙酰胺腺嘌呤二核苷酸)混合反應(yīng),合成了帶大量負(fù)電荷的par(聚adp-核糖)聚合物;
(4)將所述h-gns復(fù)合材料與所述par聚合物混合反應(yīng),加入鹽溶液,記錄h-gns與par聚合物產(chǎn)物的團(tuán)聚變化;
(5)利用紫外-可見光譜儀對(duì)步驟(4)獲得的產(chǎn)物溶液進(jìn)行定量檢測。
作為本發(fā)明改進(jìn)的技術(shù)方案,還可以采用如下技術(shù)措施:步驟(1)中所述激活dna的序列選自上海生物工程有限公司:
單鏈dna1:5’-cccgtgcgtgcgcgagtgagttggtgtgtgtgtgtgtgtgt-3’
單鏈dna2:5’-caactcactcgcgcacgcacggg-3’
形成激活雙鏈dna的方法為:激活dna單鏈在95℃水浴反應(yīng)3-10分鐘后,冷卻至室溫,形成雜交的雙鏈dna,所述雙鏈dna與所述parp進(jìn)行反應(yīng),以激活parp的活性。
作為本發(fā)明改進(jìn)的技術(shù)方案,還可以采用如下技術(shù)措施:所述步驟(2)具體如下:稱取10mg氧化石墨溶于10-40ml二次水中所述氧化石墨的濃度為0.2-1mg/ml,超聲分散2~4h進(jìn)行機(jī)械剝離,2000~4000rpm轉(zhuǎn)速下離心20~30min,除去未剝離的氧化石墨,取上清液在透析袋(mw:8000~12000)中透析一周除去雜質(zhì)小分子得分散均勻的氧化石墨烯;將上述氧化石墨烯溶液與10-40ml溶于0.1mnaoh溶液的hemin在燒瓶中充分混合,所述hemin的濃度為0.2-1mg/ml;之后緩慢加入150~200μl氨溶液,最后加入20~50μl水合肼,劇烈攪拌混合溶液30~60min,將燒瓶置于60℃水浴中反應(yīng)3~24h,得到穩(wěn)定分散的黑色溶液;將上述黑色溶液在12000~13000rpm轉(zhuǎn)速下離心30~60min得黑色沉淀物,水洗3~5次得到容易重新分散在水中的h-gns復(fù)合材料。
作為本發(fā)明改進(jìn)的技術(shù)方案,還可以采用如下技術(shù)措施:所述步驟(3)具體如下:用反應(yīng)緩沖溶液將所述parp配置成不同的濃度,在含有所述激活dna、所述nad+的反應(yīng)緩沖溶液中滴加不同濃度的parp,于30~38℃條件下反應(yīng)1~2h。
作為本發(fā)明改進(jìn)的技術(shù)方案,還可以采用如下技術(shù)措施:所述激活dna濃度為100~200nm。
作為本發(fā)明改進(jìn)的技術(shù)方案,還可以采用如下技術(shù)措施:所述nad+濃度為100~500μm。
作為本發(fā)明改進(jìn)的技術(shù)方案,還可以采用如下技術(shù)措施:所述反應(yīng)緩沖溶液為含有kcl、mgcl2、zn(oac)2的ph7.2~7.4的50mmtris-hcl,所述kc1初始濃度為50mm,mgcl2初始濃度為2mm,zn(oac)2初始濃度為50μm。
作為本發(fā)明改進(jìn)的技術(shù)方案,還可以采用如下技術(shù)措施:所述步驟(4)具體如下:將所述h-gns復(fù)合材料加入到所述parp催化反應(yīng)合成的所述par聚合物混合反應(yīng)溶液中,反應(yīng)20~40min,之后加入nacl溶液,在20~30℃條件下反應(yīng)30~50min,離心取上層清液加入到磷酸緩沖溶液中,在tmb和h2o2存在下,對(duì)其溶液進(jìn)行記錄和紫外-可見光譜檢測。
作為本發(fā)明改進(jìn)的技術(shù)方案,還可以采用如下技術(shù)措施:所述磷酸緩沖溶液為ph5~6的25~50mm的磷酸緩沖溶液。
作為本發(fā)明改進(jìn)的技術(shù)方案,還可以采用如下技術(shù)措施:所述nacl的濃度為0.01~1.0m,所述tmb和h2o2的最終濃度分別為0.1~1.0mm和5~30mm。
相對(duì)于現(xiàn)有技術(shù),本發(fā)明具有以下有益效果:
(1)本發(fā)明無需標(biāo)記,簡化了檢測方法,避免了標(biāo)記dna探針而導(dǎo)致檢測成本高、操作煩瑣,重現(xiàn)性差的缺陷。
(2)本發(fā)明利用hemin-石墨烯復(fù)合材料具有內(nèi)在的類過氧化氫酶活性、在鹽溶液中具有可調(diào)控的分散性,而且通過ii-ii作用可吸附單鏈dna,是一種具有很大潛力的檢測材料。
(3)本發(fā)明有效利用了納米材料的特性,不需要借助精密儀器檢測,簡化了檢測方法,極大地降低了病毒檢測成本,本發(fā)明具有成本低、快速、簡便、敏感且特異性好的優(yōu)點(diǎn)。
(4)本方法可成功檢測加入血清中的parp的活性,具有一定的臨床意義。
附圖說明
圖1基于h-gns比色檢測parp活性的流程圖。
圖2顯示了h-gns紫外吸收光譜表征圖:a.hemin紫外吸收曲線,b.氧化石墨紫外吸收曲線,c.h-gns紫外吸收曲線。
圖3h-gns的溶解度與nacl溶液濃度(mol)的關(guān)系圖。
圖4顯示了端粒酶活性檢測實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證圖:a.h-gns與parp、nad+混合溶液的紫外吸收強(qiáng)度;b.h-gns與parp、dsdna混合溶液的紫外吸收強(qiáng)度;c.h-gns與dsdna、nad+的紫外吸收強(qiáng)度;d.parp催化合成的產(chǎn)物與h-gns混合時(shí)的紫外吸收強(qiáng)度。
圖5顯示了檢測parp活性的紫外吸收值變化圖:a.在不同的parp濃度下,得到的紫外-可見光曲線圖(parp濃度(u,1u=45ng):(a)0(b)0.05(c)0.1(d)0.3(e)0.5(f)0.75(g)1(h)2(i)3;b.紫外吸收強(qiáng)度與parp濃度的標(biāo)準(zhǔn)曲線,以及紫外吸收強(qiáng)度與parp濃度之間的線性關(guān)系;從圖中可以看出parp在0.05u到1u呈良好的線性關(guān)系。
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合附圖對(duì)本發(fā)明作更進(jìn)一步的說明。
本實(shí)驗(yàn)中用到的試劑和儀器:
parp(聚腺苷酸二磷酸核糖基聚合酶),nad+(煙酰胺腺嘌呤二核苷酸),hemin(氯化血紅素),tmb(3,3′,5,5′-四甲基聯(lián)苯胺),h2o2,水合肼,氨水,nacl,紫外-可見光光譜儀。
激活dna序列(選自上海生物工程有限公司):
單鏈dna1:5’-cccgtgcgtgcgcgagtgagttggtgtgtgtgtgtgtgtgt-3’
單鏈dna2:5’-caactcactcgcgcacgcacggg-3’
實(shí)施例1:
基于h-gns復(fù)合材料分析檢測parp活性的分析方法,檢測步驟是:
h-gns復(fù)合材料合成步驟:稱取10mg氧化石墨溶于20ml二次水中(0.5mg/ml),超聲分散2h進(jìn)行機(jī)械剝離,3000rpm離心30min,除去未剝離的氧化石墨,取上清液在透析袋(mw:8000-12000)中透析一周除去雜質(zhì)小分子得分散均勻的氧化石墨烯。將所得氧化石墨烯溶液與20ml溶于0.1mnaoh溶液的hemin(0.5mg/ml)在燒瓶中充分混合。完成之后,緩慢加入200μl氨溶液,最后加入30μl水合肼。劇烈攪拌混合溶液60分鐘,把燒瓶置于水浴中(60℃)反應(yīng)20h,得到穩(wěn)定分散的黑色溶液。將所得黑色溶液在13000rpm離心30分鐘得黑色沉淀物,水洗三次得到h-gns。得到的h-gns能很容易地重新分散在水中。
dna雜交步驟:在dna雜交緩沖溶液(10mmtris-hcl,ph7.4,0.1mnacl)中加入兩條激活dna單鏈,95℃水浴5分鐘慢慢冷卻至室溫,形成雜交的激活dna。
parp催化合成par的步驟:用反應(yīng)緩沖溶液將parp配置成不同的濃度,在含有激活dna、nad+的反應(yīng)緩沖溶液(50mmtris-hcl,ph7.4,50mmkcl,2mmmgcl2,50μmzn(oac)2)中滴加0.1uparp,37℃反應(yīng)1h。
parp活性檢測步驟:取150μl50μg/mlh-gns復(fù)合材料加入到已生成par的溶液中,加入0.4mnacl溶液,在28℃反應(yīng)30min。反應(yīng)結(jié)束后,離心,取上層清液加入到磷酸緩沖溶液(25mmph5.0)中,在0.8mmtmb和25mmh2o2存在下,對(duì)其溶液進(jìn)行記錄和紫外-可見光譜檢測。實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖4d顯示,parp在0.05~1u呈良好的線性關(guān)系,檢測限為0.034u。
參考例
氧化石墨紫外吸收曲線,hemin紫外吸收曲線和h-gns紫外吸收曲線分別如圖2a-c所示。
對(duì)比例
為了證明激活dna對(duì)parp活性測試的必須性,進(jìn)行空白實(shí)驗(yàn)測試,與實(shí)施例1不同的是,在其他條件不變的情況下,在缺少激活dna時(shí)進(jìn)行parp的紫外吸收(也就是進(jìn)行h-gns與parp、nad+混合溶液的紫外吸收),測試結(jié)果如圖4a所示。
為證明nad+對(duì)parp活性測試的必須性,進(jìn)行空白實(shí)驗(yàn)測試,與實(shí)施例1不同的是,在其他條件不變的情況下,在缺少nad+時(shí)進(jìn)行parp的紫外吸收(也就是進(jìn)行h-gns與parp、激活dna混合溶液的紫外吸收),測試結(jié)果如圖4b所示。
缺少反應(yīng)檢測物parp得空白實(shí)驗(yàn)測試紫外吸收測試結(jié)果如圖4c所示。
實(shí)施例2
與實(shí)施例1不同的是:選用不同濃度的parp(u,1u=45ng):(a)0(b)0.05(c)0.1(d)0.3(e)0.5(f)0.75(g)1(h)2(i)3,得到的紫外-可見光曲線如圖5所示,可見,在0-3u范圍內(nèi)parp在0.05u到1u呈良好的線性關(guān)系。
綜上可見,h-gns復(fù)合材料可以定量檢測parp,緣于h-gns復(fù)合材料具有內(nèi)在的類過氧化氫酶活性、在鹽溶液中具有可調(diào)控的分散性,有效利用了納米材料的特性,不需要借助精密儀器檢測,簡化了檢測方法,極大地降低了病毒檢測成本,本發(fā)明可成功檢測加入血清中的parp的活性,具有良好的臨床意義。
盡管上面對(duì)本發(fā)明的實(shí)施例進(jìn)行了描述,但本發(fā)明不局限于上述具體的實(shí)施方式,上述具體的實(shí)施方式僅僅是示意性的,并不是限制性的,本領(lǐng)域技術(shù)人員在本發(fā)明的啟示下,在不脫離本發(fā)明宗旨和權(quán)利要求所請(qǐng)求保護(hù)的范圍情況下,還可以作出多種衍生形式,這些構(gòu)思均屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。