本技術(shù)涉及生物信息學(xué),特別是涉及一種胚胎發(fā)育質(zhì)量的評(píng)估方法、裝置、計(jì)算機(jī)設(shè)備、存儲(chǔ)介質(zhì)和計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品。
背景技術(shù):
1、隨著孕齡夫婦不孕不育率的不斷增長(zhǎng),不孕不育患者輔助生殖技術(shù)的需求日益增長(zhǎng)。體外受精-胚胎移植(in?vitro?fertilization?and?embryo?transfer,ivf-et)是一種有效的輔助生殖技術(shù)。它通過(guò)人工方法從女性體內(nèi)取出卵子,與在體外獲得的精子結(jié)合完成受精。在體外培養(yǎng)液中培養(yǎng),并將早期的胚胎移植到女性子宮內(nèi),待其著床實(shí)現(xiàn)妊娠。評(píng)估胚胎質(zhì)量,選擇優(yōu)質(zhì)胚胎進(jìn)行移植,可以提高移植妊娠率。
2、相關(guān)技術(shù)中,采用氣象色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)胚胎培養(yǎng)液的檢測(cè)方法,評(píng)估人體外受精胚胎質(zhì)量及差異,預(yù)測(cè)胚胎質(zhì)量及發(fā)育情況。另一相關(guān)技術(shù)中,將收集的胚胎培養(yǎng)液樣本快速脫水變干,基于固態(tài)樣本的紅外光譜,評(píng)估胚胎質(zhì)量。然而,高效氣相、液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用檢測(cè)技術(shù)需要提前進(jìn)行樣本預(yù)處理,并且檢測(cè)過(guò)程耗時(shí),成本高,操作復(fù)雜。近紅外吸收光譜檢測(cè)含液體樣本對(duì)水分子有極大干擾,影響檢測(cè)結(jié)果。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、基于此,有必要針對(duì)上述技術(shù)問(wèn)題,提供一種能夠準(zhǔn)確評(píng)估胚胎發(fā)育質(zhì)量的評(píng)估方法、裝置、計(jì)算機(jī)設(shè)備、存儲(chǔ)介質(zhì)和計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品。
2、第一方面,本技術(shù)提供了一種胚胎發(fā)育質(zhì)量評(píng)估方法,應(yīng)用于處理器,所述方法包括:
3、獲取拉曼光譜數(shù)據(jù);其中,所述拉曼光譜數(shù)據(jù)為對(duì)胚胎的培養(yǎng)液進(jìn)行拉曼光譜檢測(cè)得到;
4、將所述拉曼光譜數(shù)據(jù)輸入至胚胎質(zhì)量評(píng)估模型,輸出所述胚胎的發(fā)育質(zhì)量類別對(duì)應(yīng)移植結(jié)局;其中,所述胚胎質(zhì)量評(píng)估模型為基于樣本拉曼光譜數(shù)據(jù)與發(fā)育質(zhì)量類別對(duì)應(yīng)移植結(jié)局的對(duì)應(yīng)關(guān)系,對(duì)初始胚胎質(zhì)量評(píng)估模型進(jìn)行訓(xùn)練得到。
5、在一個(gè)具體的實(shí)施例中,所述培養(yǎng)液包括干燥結(jié)晶態(tài)培養(yǎng)液和/或液態(tài)培養(yǎng)液,所述獲取拉曼光譜數(shù)據(jù),包括:
6、將所述干燥結(jié)晶態(tài)培養(yǎng)液置于鍍鋁膜材質(zhì)二氧化硅片容器中,對(duì)所述干燥結(jié)晶態(tài)培養(yǎng)液采用顯微共聚焦拉曼光譜儀進(jìn)行照射,得到拉曼光譜數(shù)據(jù);
7、和/或,將所述液態(tài)培養(yǎng)液置于鍍金涂層銅鎳合金質(zhì)容器中,對(duì)所述液態(tài)培養(yǎng)液采用光纖拉曼光譜儀進(jìn)行照射,得到拉曼光譜數(shù)據(jù)。
8、在一個(gè)具體的實(shí)施例中,所述對(duì)所述干燥結(jié)晶態(tài)培養(yǎng)液采用顯微共聚焦拉曼光譜儀進(jìn)行照射,得到拉曼光譜數(shù)據(jù),包括:
9、對(duì)所述干燥結(jié)晶態(tài)培養(yǎng)液采用顯微共聚焦拉曼光譜儀進(jìn)行照射,照射參數(shù)包括:入射激發(fā)功率選擇4-6mw,曝光時(shí)間選擇3-5s,累計(jì)n次?,對(duì)多個(gè)采樣點(diǎn)的拉曼光譜數(shù)據(jù)求平均值,得到拉曼光譜數(shù)據(jù)。
10、在一個(gè)具體的實(shí)施例中,所述對(duì)所述液態(tài)培養(yǎng)液采用光纖拉曼光譜儀進(jìn)行照射,得到拉曼光譜數(shù)據(jù),包括:
11、對(duì)所述液態(tài)培養(yǎng)液采用光纖拉曼光譜儀進(jìn)行照射,照射參數(shù)包括:入射激發(fā)功率選擇300-350mw,曝光時(shí)間選擇30-50s,累計(jì)m次,對(duì)多個(gè)采樣點(diǎn)的拉曼光譜數(shù)據(jù)求平均值,得到拉曼光譜數(shù)據(jù)。
12、在一個(gè)具體的實(shí)施例中,在所述獲取拉曼光譜數(shù)據(jù)之前,還包括:
13、獲取處于卵裂期的胚胎所在的初始培養(yǎng)液;
14、對(duì)所述初始培養(yǎng)液進(jìn)行混勻和離心處理,得到處理的培養(yǎng)液;
15、提取所述處理的培養(yǎng)液中的上清液作為所述胚胎的培養(yǎng)液。
16、在一個(gè)具體的實(shí)施例中,所述胚胎質(zhì)量評(píng)估模型為基于樣本拉曼光譜數(shù)據(jù)與發(fā)育質(zhì)量類別對(duì)應(yīng)移植結(jié)局的對(duì)應(yīng)關(guān)系,對(duì)初始胚胎質(zhì)量評(píng)估模型進(jìn)行訓(xùn)練得到,包括:
17、獲取樣本集合,所述樣本集合中包括拉曼光譜數(shù)據(jù)樣本,所述拉曼光譜數(shù)據(jù)樣本上標(biāo)注有發(fā)育質(zhì)量類別對(duì)應(yīng)移植結(jié)局;
18、將所述拉曼光譜數(shù)據(jù)樣本輸入至初始胚胎質(zhì)量評(píng)估模型,輸出預(yù)測(cè)結(jié)果;
19、基于所述預(yù)測(cè)結(jié)果與標(biāo)注的發(fā)育質(zhì)量類別對(duì)應(yīng)移植結(jié)局之間的差異,對(duì)所述初始胚胎質(zhì)量評(píng)估模型中的訓(xùn)練參數(shù)進(jìn)行迭代調(diào)整,得到胚胎質(zhì)量評(píng)估模型。
20、在一個(gè)具體的實(shí)施例中,所述發(fā)育質(zhì)量類別對(duì)應(yīng)移植結(jié)局包括下述中的至少一種:
21、活產(chǎn)、生化妊娠或早期流產(chǎn)、未具有妊娠潛力。
22、在一個(gè)具體的實(shí)施例中,所述獲取拉曼光譜數(shù)據(jù),包括:
23、獲取初始的拉曼光譜數(shù)據(jù);
24、對(duì)所述初始的拉曼光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理操作,得到拉曼光譜數(shù)據(jù);其中,所述預(yù)處理操作包括下述中的至少一種:質(zhì)量控制、去除尖峰、光譜截取、平滑濾波、基線校正和歸一化。
25、在一個(gè)具體的實(shí)施例中,對(duì)所述初始的拉曼光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理操作,得到拉曼光譜數(shù)據(jù),包括:
26、對(duì)所述初始的拉曼光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理操作,得到中間拉曼光譜數(shù)據(jù);
27、基于主成分分析算法,對(duì)所述中間拉曼光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行降維處理,得到拉曼光譜數(shù)據(jù)。
28、第二方面,本技術(shù)還提供了一種胚胎發(fā)育質(zhì)量評(píng)估裝置,所述裝置包括:
29、獲取模塊,用于獲取拉曼光譜數(shù)據(jù);其中,所述拉曼光譜數(shù)據(jù)為對(duì)胚胎的培養(yǎng)液進(jìn)行拉曼光譜檢測(cè)得到;
30、評(píng)估模塊,用于將所述拉曼光譜數(shù)據(jù)輸入至胚胎質(zhì)量評(píng)估模型,輸出所述胚胎的發(fā)育質(zhì)量類別對(duì)應(yīng)移植結(jié)局;其中,所述胚胎質(zhì)量評(píng)估模型為基于樣本拉曼光譜數(shù)據(jù)與發(fā)育質(zhì)量類別對(duì)應(yīng)移植結(jié)局的對(duì)應(yīng)關(guān)系,對(duì)初始胚胎質(zhì)量評(píng)估模型進(jìn)行訓(xùn)練得到。
31、在一個(gè)具體的實(shí)施例中,所述獲取模塊還用于:
32、將所述干燥結(jié)晶態(tài)培養(yǎng)液置于容器中,對(duì)所述干燥結(jié)晶態(tài)培養(yǎng)液采用顯微共聚焦拉曼光譜儀進(jìn)行照射,得到拉曼光譜數(shù)據(jù);
33、和/或,將所述液態(tài)培養(yǎng)液置于容器中,對(duì)所述液態(tài)培養(yǎng)液采用光纖拉曼光譜儀進(jìn)行照射,得到拉曼光譜數(shù)據(jù)。
34、在一個(gè)具體的實(shí)施例中,所述獲取模塊還用于:
35、對(duì)所述干燥結(jié)晶態(tài)培養(yǎng)液采用顯微共聚焦拉曼光譜儀進(jìn)行照射,照射參數(shù)包括:入射激發(fā)功率選擇4-6mw,曝光時(shí)間選擇3-5s,累計(jì)n次,對(duì)多個(gè)采樣點(diǎn)的拉曼光譜數(shù)據(jù)求平均值,得到拉曼光譜數(shù)據(jù)。
36、在一個(gè)具體的實(shí)施例中,所述獲取模塊還用于:
37、對(duì)所述液態(tài)培養(yǎng)液采用光纖拉曼光譜儀進(jìn)行照射,照射參數(shù)包括:入射激發(fā)功率選擇300-350mw,曝光時(shí)間選擇30-50s,累計(jì)m次,對(duì)多個(gè)采樣點(diǎn)的拉曼光譜數(shù)據(jù)求平均值,得到拉曼光譜數(shù)據(jù)。
38、在一個(gè)具體的實(shí)施例中,所述裝置還包括生成模塊,所述生成模塊用于:
39、獲取處于卵裂期的胚胎所在的初始培養(yǎng)液;
40、對(duì)所述初始培養(yǎng)液進(jìn)行混勻和離心處理,得到處理的培養(yǎng)液;
41、提取所述處理的培養(yǎng)液中的上清液作為所述胚胎的培養(yǎng)液。
42、在一個(gè)具體的實(shí)施例中,所述裝置還包括訓(xùn)練模塊,所述訓(xùn)練模塊用于:
43、獲取樣本集合,所述樣本集合中包括拉曼光譜數(shù)據(jù)樣本,所述拉曼光譜數(shù)據(jù)樣本上標(biāo)注有發(fā)育質(zhì)量類別對(duì)應(yīng)移植結(jié)局;
44、將所述拉曼光譜數(shù)據(jù)樣本輸入至初始胚胎質(zhì)量評(píng)估模型,輸出預(yù)測(cè)結(jié)果;
45、基于所述預(yù)測(cè)結(jié)果與標(biāo)注的發(fā)育質(zhì)量類別對(duì)應(yīng)移植結(jié)局之間的差異,對(duì)所述初始胚胎質(zhì)量評(píng)估模型中的訓(xùn)練參數(shù)進(jìn)行迭代調(diào)整,得到胚胎質(zhì)量評(píng)估模型。
46、在一個(gè)具體的實(shí)施例中,所述發(fā)育質(zhì)量類別對(duì)應(yīng)移植結(jié)局包括下述中的至少一種:
47、活產(chǎn)、生化妊娠或早期流產(chǎn)、未具有妊娠潛力。
48、在一個(gè)具體的實(shí)施例中,所述獲取模塊還用于:
49、獲取初始的拉曼光譜數(shù)據(jù);
50、對(duì)所述初始的拉曼光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理操作,得到拉曼光譜數(shù)據(jù);其中,所述預(yù)處理操作包括下述中的至少一種:質(zhì)量控制、去除尖峰、光譜截取、平滑濾波、基線校正和歸一化。
51、在一個(gè)具體的實(shí)施例中,所述獲取模塊還用于:
52、對(duì)所述初始的拉曼光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理操作,得到中間拉曼光譜數(shù)據(jù);
53、基于主成分分析算法,對(duì)所述中間拉曼光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行降維處理,得到拉曼光譜數(shù)據(jù)。
54、第三方面,本技術(shù)還提供了一種計(jì)算機(jī)設(shè)備。所述計(jì)算機(jī)設(shè)備包括存儲(chǔ)器和處理器,所述存儲(chǔ)器存儲(chǔ)有計(jì)算機(jī)程序,所述處理器執(zhí)行所述計(jì)算機(jī)程序時(shí)實(shí)現(xiàn)本公開實(shí)施例任一項(xiàng)所述的方法的實(shí)施例。
55、第四方面,本技術(shù)還提供了一種計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì)。所述計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì),其上存儲(chǔ)有計(jì)算機(jī)程序,所述計(jì)算機(jī)程序被處理器執(zhí)行時(shí)實(shí)現(xiàn)本公開實(shí)施例任一項(xiàng)所述的方法的實(shí)施例。
56、第五方面,本技術(shù)還提供了一種計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品。所述計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品,包括計(jì)算機(jī)程序,該計(jì)算機(jī)程序被處理器執(zhí)行時(shí)實(shí)現(xiàn)本公開實(shí)施例任一項(xiàng)所述的方法的實(shí)施例。
57、上述胚胎發(fā)育質(zhì)量的評(píng)估方法、裝置、計(jì)算機(jī)設(shè)備、存儲(chǔ)介質(zhì)和計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品,通過(guò)獲取胚胎培養(yǎng)液的拉曼光譜數(shù)據(jù),其中,拉曼光譜數(shù)據(jù)記錄了散射光頻率發(fā)生變化的散射位移和強(qiáng)度,能夠反應(yīng)培養(yǎng)液中物質(zhì)分子的性質(zhì)信息。在本實(shí)施例中,培養(yǎng)液的物質(zhì)分子主要是代謝物,而代謝物是評(píng)估細(xì)胞發(fā)育質(zhì)量的重要指標(biāo)。因此,基于樣本拉曼光譜數(shù)據(jù)與發(fā)育質(zhì)量類別的對(duì)應(yīng)關(guān)系,構(gòu)建胚胎質(zhì)量評(píng)估模型,通過(guò)胚胎質(zhì)量評(píng)估模型能夠高效、準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)胚胎的發(fā)育質(zhì)量與移植結(jié)局。