本發(fā)明涉及一種n-糖鏈標(biāo)志物預(yù)測(cè)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者生存預(yù)后方法、預(yù)測(cè)評(píng)分系統(tǒng)和用途,屬于分子生物醫(yī)藥。
背景技術(shù):
1、彌漫大b細(xì)胞淋巴瘤(dlbcl)是血液淋巴造血系統(tǒng)惡性腫瘤,全球每年約有15萬新發(fā)病例,占所有非霍奇金淋巴瘤(nhl)的30%左右,患者通常表現(xiàn)為進(jìn)行性淋巴結(jié)腫大和/或淋巴結(jié)外病變,大多數(shù)患者就診時(shí)已為晚期。dlbcl具有高度異質(zhì)性,患者的5年生存率僅為63.9%,極早發(fā)現(xiàn)患者的生存預(yù)后情況,及時(shí)調(diào)整治療方案,將極大的改善患者生存質(zhì)量和生存時(shí)間。然而目前尚無標(biāo)志物能高效并獨(dú)立地預(yù)測(cè)dlbcl患者的生存預(yù)后,因此,發(fā)現(xiàn)有效預(yù)測(cè)dlbcl患者生存預(yù)后是臨床亟需解決的問題。
2、人體內(nèi)血液中n-糖蛋白上的糖鏈(glycan)參與了細(xì)胞和機(jī)體生物過程的各個(gè)方面,是機(jī)體發(fā)揮正常功能和病變過程的物質(zhì)基礎(chǔ)。n-糖蛋白上的糖鏈結(jié)構(gòu)與數(shù)量變化被發(fā)現(xiàn)與dlbcl的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。本發(fā)明申請(qǐng)通過一系列的探究發(fā)現(xiàn),重點(diǎn)探究了n-糖鏈標(biāo)志物預(yù)測(cè)生存預(yù)后評(píng)分系統(tǒng)在dlbcl患者中的應(yīng)用價(jià)值,在dlbcl患者確診時(shí)血液樣本中的n-糖鏈標(biāo)志物可以預(yù)測(cè)患者的生存預(yù)后,為臨床dlbcl患者提供了一種新的預(yù)測(cè)生存預(yù)后的n-糖鏈標(biāo)志物及預(yù)測(cè)評(píng)分系統(tǒng)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的局限性,本發(fā)明的目的在于提供一種n-糖鏈標(biāo)志物及其評(píng)分系統(tǒng),用于預(yù)測(cè)dlbcl患者確診后的生存預(yù)后,從而通過一種新的技術(shù)手段為預(yù)測(cè)dlbcl患者生存預(yù)后提供一種新的生物標(biāo)志物及其評(píng)分系統(tǒng)。
2、為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提供一種n-糖鏈標(biāo)志物預(yù)測(cè)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者生存預(yù)后方法、預(yù)測(cè)評(píng)分系統(tǒng)和用途。
3、本發(fā)明采用的技術(shù)方案如下:
4、一種n-糖鏈標(biāo)志物預(yù)測(cè)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者生存預(yù)后方法,其特征在于,包括如下步驟:
5、步驟一?收集樣本
6、收集彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者的血液樣本;
7、步驟二?樣本糖鏈的檢測(cè)和數(shù)據(jù)采集
8、采用毛細(xì)管電泳法(ce法)檢測(cè)n-糖鏈的技術(shù)平臺(tái),將血液樣本中n-糖鏈圖譜進(jìn)行檢測(cè),獲得n-糖鏈圖譜,得到n-糖鏈數(shù)據(jù);
9、步驟三?預(yù)后評(píng)估
10、將各個(gè)單獨(dú)n-糖鏈標(biāo)志物的檢測(cè)數(shù)據(jù)作為自變量,預(yù)測(cè)生存預(yù)后作為因變量,構(gòu)建分類器,進(jìn)行模型的訓(xùn)練后得到分類模型,再根據(jù)分類模型對(duì)待測(cè)樣本進(jìn)行生存預(yù)后的預(yù)測(cè)。
11、優(yōu)選的,所述步驟一種血液樣本類型為靜脈血或外周血的血液、血清或血漿。
12、優(yōu)選的,所述步驟三中n-糖鏈標(biāo)志物包括nga2f(無半乳糖基α-1,6核心巖藻糖基化二天線n-糖鏈)、nga2fb(無半乳糖基α-1,6核心巖藻糖基化平分型n-糖鏈)、ng1a2f(單支鏈半乳糖基α-1,6核心巖藻糖基化二天線n-糖鏈)、na2(半乳糖基化二天線n-糖鏈)、na2f(半乳糖基化α-1,6核心巖藻糖基化二天線n-糖鏈)、na2fb(無半乳糖基α-1,6核心巖藻糖基化平分型n-糖鏈)、na3(半乳糖基化三天線n-糖鏈)、na3fb(半乳糖基化α-1,3支鏈巖藻糖基化三天線n-糖鏈)和na4(半乳糖基化四天線n-糖鏈)、na4fb(半乳糖基化α-1,3支鏈巖藻糖基化四天線n-糖鏈)。
13、優(yōu)選的,所述步驟三中分類器是通過cox(cox?regression)回歸算法構(gòu)建的分類器。
14、優(yōu)選的,所述步驟三中生存預(yù)后是指患者診斷后的總生存期。
15、一種組合物在預(yù)測(cè)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者生存預(yù)后試劑中的應(yīng)用,所述組合物由n-糖鏈標(biāo)志物中nga2f、nga2fb、ng1a2f、na2、na2f、na2fb、na3、na3fb、na4、na4fb組成,所述組合物通過分類模型的計(jì)算公式dlbcl-gpss=0.153×nga2f+1.356×nga2fb+0.313×ng1a2f-0.068×na2-0.013×na2f-0.008×na2fb-0.104×na3+0.146×na3fb-0.110×na4+0.628×na4fb來預(yù)測(cè)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者生存預(yù)后。
16、優(yōu)選的,所述分類模型dlbcl-gpss是以生存預(yù)后的風(fēng)險(xiǎn)高低作為輸出值。
17、優(yōu)選的,所述分類模型dlbcl-gpss預(yù)測(cè)評(píng)分為生存預(yù)后的風(fēng)險(xiǎn)高低值。
18、優(yōu)選的,當(dāng)dlbcl-gpss預(yù)測(cè)評(píng)分≥0.80時(shí)具有更差的生存預(yù)后,dlbcl-gpss預(yù)測(cè)評(píng)分<0.80時(shí)具有更好的生存預(yù)后。
19、一種預(yù)測(cè)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者生存預(yù)后的評(píng)分系統(tǒng),包括:
20、n-糖鏈檢測(cè)模塊,用于對(duì)獲得的彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者確診時(shí)的血液樣本進(jìn)行n-糖鏈檢測(cè);
21、分析模塊,用于將各種n-糖鏈數(shù)值作為自變量,生存預(yù)后作為因變量,構(gòu)建分類器,進(jìn)行模型的訓(xùn)練后得到分類模型,再根據(jù)分類模型對(duì)待測(cè)樣本進(jìn)行生存預(yù)后的預(yù)測(cè)。
22、本發(fā)明具有以下有益效果:
23、(1)本發(fā)明首次發(fā)現(xiàn)dlbcl患者診斷時(shí)的血液中n-糖鏈標(biāo)志物與生存預(yù)后呈現(xiàn)相關(guān)性,并首次提出n-糖鏈標(biāo)志物可以作為預(yù)測(cè)dlbcl患者生存預(yù)后的指標(biāo)。
24、(2)本發(fā)明提供的n-糖鏈標(biāo)志物預(yù)后預(yù)測(cè)評(píng)分系統(tǒng),該系統(tǒng)用于預(yù)測(cè)dlbcl患者的生存預(yù)后,為預(yù)測(cè)dlbcl患者生存預(yù)后提供了新的技術(shù)手段。
1.一種n-糖鏈標(biāo)志物預(yù)測(cè)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者生存預(yù)后方法,其特征在于,包括如下步驟:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的n-糖鏈標(biāo)志物預(yù)測(cè)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者生存預(yù)后方法,其特征在于,所述步驟一種血液樣本類型為靜脈血或外周血的血液、血清或血漿。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的n-糖鏈標(biāo)志物預(yù)測(cè)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者生存預(yù)后方法,其特征在于,所述步驟三中n-糖鏈標(biāo)志物包括nga2f、nga2fb、ng1a2f、na2、na2f、na2fb、na3、na3fb、na4和na4fb。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的n-糖鏈標(biāo)志物預(yù)測(cè)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者生存預(yù)后方法,其特征在于,所述步驟三中分類器是通過cox回歸算法構(gòu)建的分類器。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的n-糖鏈標(biāo)志物預(yù)測(cè)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者生存預(yù)后方法,其特征在于,所述步驟三中生存預(yù)后是指患者診斷后的總生存期。
6.一種組合物在預(yù)測(cè)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者生存預(yù)后試劑中的應(yīng)用,其特征在于,所述組合物由n-糖鏈標(biāo)志物中nga2f、nga2fb、ng1a2f、na2、na2f、na2fb、na3、na3fb、na4、na4fb組成,所述組合物通過分類模型的計(jì)算公式
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的組合物在預(yù)測(cè)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者生存預(yù)后試劑中的應(yīng)用,其特征在于,所述分類模型dlbcl-gpss是以生存預(yù)后的風(fēng)險(xiǎn)高低作為輸出值。
8.根據(jù)權(quán)利要求6所述的組合物在預(yù)測(cè)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者生存預(yù)后試劑中的應(yīng)用,其特征在于,所述分類模型dlbcl-gpss預(yù)測(cè)評(píng)分為生存預(yù)后的風(fēng)險(xiǎn)高低值。
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的組合物在預(yù)測(cè)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者生存預(yù)后試劑中的應(yīng)用,其特征在于,當(dāng)dlbcl-gpss預(yù)測(cè)評(píng)分≥0.80時(shí)具有更差的生存預(yù)后,dlbcl-gpss預(yù)測(cè)評(píng)分<0.80時(shí)具有更好的生存預(yù)后。
10.一種預(yù)測(cè)彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤患者生存預(yù)后的評(píng)分系統(tǒng),其特征在于,包括: