專利名稱：用于數(shù)據(jù)提煉的臨床數(shù)據(jù)采集和發(fā)布方法、系統(tǒng)和計算機產(chǎn)品的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
一般地說本公開涉及一種用于數(shù)據(jù)提煉的采集和發(fā)布臨床數(shù)據(jù)的方法，更具體地說涉及一種采集和發(fā)布已編碼的臨床數(shù)據(jù)的方法，已經(jīng)在不同的醫(yī)院中利用不同的臨床數(shù)據(jù)編碼和格式形成這些數(shù)據(jù)。
背景技術(shù)：
醫(yī)院通常利用計算機系統(tǒng)來管理醫(yī)院內(nèi)的各部門。通過多種計算機系統(tǒng)采集有關(guān)每個患者的數(shù)據(jù)。例如，允許患者到醫(yī)院進行胸廓回波(TTE)。通過醫(yī)院信息系統(tǒng)(HIS)能夠獲得有關(guān)患者的信息(例如，人口統(tǒng)計情況和保險)并且存儲在患者檔案中。然后該信息應(yīng)當傳送給心臟病學(xué)部門系統(tǒng)(通常所說的心血管信息系統(tǒng)或者CVIS)。通常，CVIS是一個公司的產(chǎn)品，而HIS是另一個公司的產(chǎn)品。結(jié)果，兩者之間的數(shù)據(jù)庫不同。進一步地，它們將俘獲/保持和發(fā)送數(shù)據(jù)中的不同等級的顆粒。一旦CVIS已經(jīng)接收到患者信息，就在回波實驗室中為患者安排一個TTE。接下來，由聲納圖記錄器執(zhí)行TTE。獲取圖像和測量結(jié)果并且發(fā)送給CVIS服務(wù)器。讀取醫(yī)師(例如心回波描記者)坐在觀察臺前和控制患者的TTE研究。然后心回波描記者開始觀察這些圖像和測量結(jié)果并且在該研究的基礎(chǔ)上創(chuàng)建完整的醫(yī)學(xué)報告。然后該醫(yī)學(xué)報告可以編碼成包括描述報告內(nèi)容的臨床數(shù)據(jù)代碼的結(jié)構(gòu)化的報告(SR)文獻。當心回波描記者完成該醫(yī)療報告時，報告?zhèn)魉徒o存儲它的CVIS服務(wù)器并且通過患者標識數(shù)據(jù)與患者相關(guān)。該已完成的具有臨床數(shù)據(jù)代碼的醫(yī)學(xué)報告是能夠傳送給用于數(shù)據(jù)提煉的數(shù)據(jù)倉庫的這種報告的一個例子。
創(chuàng)建包含來自一個以上醫(yī)院的醫(yī)療數(shù)據(jù)的病歷卡數(shù)據(jù)倉庫從而用于數(shù)據(jù)提煉的能力面臨幾種挑戰(zhàn)。首先，很難得到相容的臨床數(shù)據(jù)，能夠在醫(yī)院之間和之內(nèi)相對比。例如，醫(yī)生W可能縮寫；醫(yī)生X將他的報告標準化，僅僅俘獲他感興趣的具體的一組信息；醫(yī)生Y可能擴充它的報告從而包括大量的與已做出的處理不相關(guān)的數(shù)據(jù)；并且醫(yī)生Z采用僅僅報告可供搜索的一些信息的軟件，與此同時他報告的剩余部分是不能搜索的文本。影響實行醫(yī)療數(shù)據(jù)提煉的能力的另一個挑戰(zhàn)是必須以相容的形式得到醫(yī)療數(shù)據(jù)。例如，醫(yī)院A可以使用記錄一些可供搜索的信息，留下其余的作為不能搜索的文本的軟件；醫(yī)院B利用很難搜索數(shù)據(jù)的口授；和醫(yī)院C使用記錄與在醫(yī)院A中使用的軟件相同信息的軟件，但是所采集的數(shù)據(jù)的標記不同使得數(shù)據(jù)的使用者不得不解釋兩標記以便知道已經(jīng)記錄了什么數(shù)據(jù)。
在試圖產(chǎn)生通用的醫(yī)療數(shù)據(jù)倉庫用來在數(shù)據(jù)提煉所面對的另一個挑戰(zhàn)是很難將采集的數(shù)據(jù)輸入到該數(shù)據(jù)倉庫中。一些數(shù)據(jù)提煉軟件限定特殊的、深度的數(shù)據(jù)用來采集，但是這可能需要使用者重新輸入已經(jīng)報告過的相同數(shù)據(jù)。這對于使用它的醫(yī)師、技師或護士來講非常麻煩和冗長。即使使用者愿意重新輸入一些數(shù)據(jù)，但通過該處理只能得到該數(shù)據(jù)的子集。
發(fā)明概述本發(fā)明的一方面是一種用于數(shù)據(jù)提煉的臨床數(shù)據(jù)采集和發(fā)布方法。該方法包括選擇要采集的本地報告，其中該本地報告是結(jié)構(gòu)化的報告(SR)對象并且包括本地臨床代碼、患者標識數(shù)據(jù)和報告采集狀態(tài)數(shù)據(jù)。通過去除患者標識數(shù)據(jù)對本地報告進行凈化。更新該本地報告采集狀態(tài)從而反映該選擇。將本地報告映射成通用格式報告并且該映射包括訪問包括本地臨床代碼和對應(yīng)的通用格式臨床代碼的知識庫；和利用對應(yīng)的通用格式代碼代替本地臨床代碼。然后將通用格式報告?zhèn)魉徒o包括數(shù)據(jù)倉庫的數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)。
本發(fā)明的另一方面是一種用于數(shù)據(jù)提煉的臨床數(shù)據(jù)采集和發(fā)布方法。該方法包括在數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)接收通用格式報告，其中通用格式報告是SR對象并且包括臨床編碼的醫(yī)療數(shù)據(jù)。該數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)包括數(shù)據(jù)倉庫。利用XML模式將通用格式報告的內(nèi)容映射成數(shù)據(jù)倉庫中的字段。響應(yīng)該映射將通用格式報告的內(nèi)容添加到數(shù)據(jù)倉庫中。
本發(fā)明的另一方面是一種用于數(shù)據(jù)提煉的臨床數(shù)據(jù)采集和發(fā)布系統(tǒng)。該系統(tǒng)包括網(wǎng)絡(luò)和與該網(wǎng)絡(luò)進行通信的醫(yī)院計算機系統(tǒng)。醫(yī)院計算機系統(tǒng)包括用來執(zhí)行一種方法的軟件。該方法包括選擇位于用來采集的醫(yī)院計算機系統(tǒng)上的本地報告，其中該本地報告是結(jié)構(gòu)化的報告(SR)對象并且包括本地臨床代碼、患者標識數(shù)據(jù)和報告采集狀態(tài)數(shù)據(jù)。通過去除患者標識數(shù)據(jù)對本地報告進行凈化。更新該本地報告采集狀態(tài)從而反映該選擇。將本地報告映射成通用格式報告并且該映射包括訪問位于醫(yī)院計算機系統(tǒng)上的包括本地臨床代碼和對應(yīng)的通用格式臨床代碼的知識庫；和利用對應(yīng)的通用格式代碼代替本地臨床代碼。然后通用格式報告通過網(wǎng)絡(luò)傳送給包括數(shù)據(jù)倉庫的數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)。
本發(fā)明的另一方面是一種用于數(shù)據(jù)提煉的臨床數(shù)據(jù)采集和發(fā)布系統(tǒng)。該系統(tǒng)包網(wǎng)絡(luò)和包括數(shù)據(jù)倉庫的存儲裝置。該系統(tǒng)還包括與該網(wǎng)絡(luò)和存儲裝置進行通信的數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)。數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)包括用來執(zhí)行一種方法的軟件，該方法包括通過網(wǎng)絡(luò)在存儲裝置中的數(shù)據(jù)倉庫中接收通用格式報告，在此該通用格式報告是SR對象并且包括臨床編碼的醫(yī)療數(shù)據(jù)。利用XML模式將通用格式報告的內(nèi)容映射到數(shù)據(jù)倉庫中的字段。響應(yīng)該映射將通用格式報告的內(nèi)容添加到數(shù)據(jù)倉庫中。
本發(fā)明的另一方面是一種用于數(shù)據(jù)提煉的臨床數(shù)據(jù)采集和發(fā)布的計算機程序產(chǎn)品。該計算機程序產(chǎn)品包括能夠由處理電路讀取的存儲媒體，該媒體存儲有通過處理電路執(zhí)行從而實現(xiàn)一種方法的指令。該方法包括選擇要采集的本地報告，其中該本地報告是結(jié)構(gòu)化的報告(SR)對象并且包括本地臨床代碼、患者標識數(shù)據(jù)和報告采集狀態(tài)數(shù)據(jù)。通過去除患者標識數(shù)據(jù)對本地報告進行凈化。更新該本地報告采集狀態(tài)從而反映該選擇。將本地報告映射成通用格式報告并且該映射包括訪問包括本地臨床代碼和對應(yīng)的通用格式臨床代碼的知識庫；和利用對應(yīng)的通用格式代碼代替本地臨床代碼。然后將通用格式報告?zhèn)魉徒o包括數(shù)據(jù)倉庫的數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)。
這里公開了本發(fā)明的其他各個部分。本領(lǐng)域普通技術(shù)人員從下面更詳細的描述和附圖中將清楚和理解本發(fā)明的上面討論的和其他特征和優(yōu)點。
附面的簡要說明參照下面的示意圖，其中幾個圖中的相似部件采用同樣的附圖標記。


圖1是用于數(shù)據(jù)提煉的臨床數(shù)據(jù)采集和發(fā)布系統(tǒng)的示意圖；圖2表示將臨床報告轉(zhuǎn)換成用于數(shù)據(jù)倉庫的通用格式的示意圖；和圖3表示用于公共提煉的采集和格式化一個報告的處理的示意圖。
優(yōu)選實施例的詳細說明本發(fā)明的一個實施例提供一種用于采集臨床數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)和處理。采集已經(jīng)作為結(jié)構(gòu)化的報告(SR)對象(例如，DICOM SR，HL-7和XML)存儲的臨床數(shù)據(jù)用來在數(shù)據(jù)提煉中使用。本發(fā)明的一個實施例將新興DICOM SR標準與其他SR標準一同使用從而不再需要數(shù)據(jù)的重新輸入。為了數(shù)據(jù)提煉而采集的臨床數(shù)據(jù)已經(jīng)以限定的和已知的格式存儲在每個醫(yī)院中。然后該醫(yī)院的具體的臨床數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化成通用格式并且存儲在用于數(shù)據(jù)提煉的數(shù)據(jù)倉庫中使用。本發(fā)明的一個實施例還為這些通用SR對象的采集建立基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)。作為該基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)的一部分，凈化傳送給數(shù)據(jù)倉庫的臨床數(shù)據(jù)，使得患者的身份保持匿名。另外，沒有復(fù)制和沒有工作流程禁止地采集臨床數(shù)據(jù)記錄或報告。通過利用基于環(huán)球網(wǎng)的界面創(chuàng)建用戶定義的搜索，本發(fā)明的一個實施例還建立了用來發(fā)布SR對象的基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)或者提供基于SR對象的數(shù)據(jù)提煉。另外，凈化后的醫(yī)療報告數(shù)據(jù)包提供給一些公司，從而進行它們自己的數(shù)據(jù)提煉研究。
圖1是為數(shù)據(jù)提煉而采集和發(fā)布臨床數(shù)據(jù)發(fā)布的實例性系統(tǒng)。位于不同醫(yī)院中的醫(yī)院計算機系統(tǒng)110與網(wǎng)絡(luò)106連接。醫(yī)院計算機系統(tǒng)110向與數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104連接的存儲裝置108中的數(shù)據(jù)倉庫發(fā)送醫(yī)療數(shù)據(jù)。醫(yī)院計算機系統(tǒng)110通常包括用來與將編碼后的臨床報告數(shù)據(jù)存儲為SR對象的一個或多個存儲裝置一同執(zhí)行編碼后的臨床報告的應(yīng)用軟件。另外，醫(yī)院計算機系統(tǒng)包括用來將存儲為SR對象的臨床報告數(shù)據(jù)從醫(yī)院格式轉(zhuǎn)換成通用格式的應(yīng)用軟件。然后通用格式的SR對象沉積在位于存儲裝置108中的用于數(shù)據(jù)提煉的數(shù)據(jù)倉庫中使用。下面將要描述，圖2表示將臨床報告轉(zhuǎn)換成用于數(shù)據(jù)倉庫的通用格式的示意圖。
圖1中的系統(tǒng)包括一個或多個用戶系統(tǒng)102，終端用戶或消費者通過用戶系統(tǒng)可以向數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104上的應(yīng)用程序發(fā)出請求，從而訪問存儲在位于存儲裝置108中的數(shù)據(jù)倉庫中的具體記錄。在一個示例性的實施例中，消費者可以包括研究醫(yī)院工作人員、制藥公司研究隊員和來自制造醫(yī)療產(chǎn)品的公司的人員。在一個示例性的實施例中，數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104執(zhí)行向包含在位于存字儲裝置108中的數(shù)據(jù)倉庫中的數(shù)據(jù)提供訪問的程序。用戶系統(tǒng)102可以直接與數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104連接或者通過網(wǎng)絡(luò)106與數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104耦合。利用執(zhí)行計算機程序的通用目的計算機可以實現(xiàn)每個用戶系統(tǒng)102，從而實現(xiàn)這里所描述的處理。用戶系統(tǒng)102可以是個人計算機或附加有終端的主機。如果用戶系統(tǒng)102是個人計算機，通過向用戶系統(tǒng)102提供小程序(Applet)，可以由用戶系統(tǒng)102和數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104共享這里所描述的處理。
網(wǎng)絡(luò)106可以是包括局域網(wǎng)(LAN)、廣域網(wǎng)(WAN)、企業(yè)內(nèi)部互聯(lián)網(wǎng)或全球網(wǎng)(例如，因特網(wǎng))的任何類型的已知網(wǎng)絡(luò)。用戶系統(tǒng)102可以通過多個網(wǎng)絡(luò)(例如，企業(yè)內(nèi)部互聯(lián)網(wǎng)和全球網(wǎng))與數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104耦合，使得不需要所有用戶系統(tǒng)102通過同樣的網(wǎng)絡(luò)與數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104耦合。一個或多個用戶系統(tǒng)102和數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104以無線方式與網(wǎng)絡(luò)106連接并且該網(wǎng)絡(luò)106可以是無線網(wǎng)絡(luò)。在一個示例性的實施例中，網(wǎng)絡(luò)106是因特網(wǎng)并且每個用戶系統(tǒng)102執(zhí)行用戶界面應(yīng)用從而與數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104直接連接。在另一個實施例中，用戶系統(tǒng)102可以執(zhí)行全球網(wǎng)瀏覽器，從而通過網(wǎng)絡(luò)106與數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104接觸?？商鎿Q的是，利用原來編程的裝置可以實現(xiàn)該用戶系統(tǒng)102，用來訪問例如WebTV等網(wǎng)絡(luò)106。
利用根據(jù)存儲在服務(wù)器可以訪問的存儲媒體中的計算機程序工作的服務(wù)器實現(xiàn)數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104。數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104可以作為網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器(通常稱之為Web服務(wù)器)工作，從而與用戶系統(tǒng)102進行通信。數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104控制從用戶系統(tǒng)102到醫(yī)院計算機系統(tǒng)110之間的發(fā)送和接收信息并且能夠執(zhí)行相關(guān)的任務(wù)。數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104還可以包括防火墻，用來防止對數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104的未經(jīng)過授權(quán)的訪問和強化對授權(quán)的訪問的任何限制。例如，管理者能夠訪問整個系統(tǒng)和具有改變部分系統(tǒng)的權(quán)利，而消費者僅僅能訪問觀看用于具體產(chǎn)品的數(shù)據(jù)倉庫記錄的子集。在一個示例性的例子中，管理者具有添加新用戶、刪除用戶和編輯用戶特權(quán)的能力?？梢岳帽绢I(lǐng)域中已知的常用硬件和/或軟件實現(xiàn)該防火墻。
數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104還可以用來作為應(yīng)用服務(wù)器。數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104執(zhí)行用來提供對位于存儲裝置108上的數(shù)據(jù)倉庫的訪問的一個或多個應(yīng)用程序，以及用來接收SR對象和建立用于數(shù)據(jù)提煉的數(shù)據(jù)倉庫的應(yīng)用程序。通過為用戶系統(tǒng)102提供應(yīng)用程序(例如，java小程序)，可以由用戶系統(tǒng)102和數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104共同分擔該處理。可替換的是，用戶系統(tǒng)102可以包括用來執(zhí)行這里所描述的部分處理的獨立應(yīng)用軟件。類似地，通過為醫(yī)院計算機系統(tǒng)110提供應(yīng)用程序，可以由醫(yī)院計算機系統(tǒng)110和數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104共同分擔該處理，并且可替換的是，醫(yī)院計算系統(tǒng)110可以包括用來執(zhí)行這里所描述的部分處理的獨立應(yīng)用軟件。應(yīng)當理解可以采用分開的服務(wù)器來實現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器功能和應(yīng)用服務(wù)器功能?？商鎿Q的是，可以通過執(zhí)行計算機程序來實現(xiàn)所需要功能的單個服務(wù)器來實現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器、防火墻和應(yīng)用服務(wù)器。
利用用來存儲電子信息的多種裝置例如文件傳送協(xié)議(FTP)服務(wù)器可以實施該存儲裝置108。應(yīng)當理解利用包含在數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104中的存儲器可以實施存儲裝置108或者它可以是單獨的物理裝置。存儲裝置108包含多種信息，這些信息包括包含來自一個或多個醫(yī)院的通用格式(例如，利用同樣的臨床編碼)的醫(yī)療報告的數(shù)據(jù)倉庫，和描述通用格式和數(shù)據(jù)庫設(shè)計的模式。數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104可以作為數(shù)據(jù)庫服務(wù)器工作并且協(xié)調(diào)對包括存儲在存儲裝置108中的數(shù)據(jù)的應(yīng)用數(shù)據(jù)的訪問。數(shù)據(jù)倉庫可以物理地存儲為具有以用戶特征為基礎(chǔ)的訪問受限制的單獨數(shù)據(jù)庫，或者物理地存儲在包括位于用戶系統(tǒng)102或數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104上的部分數(shù)據(jù)庫的不同數(shù)據(jù)庫中。在一個示例性的實施例中，利用相關(guān)的數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)實現(xiàn)該數(shù)據(jù)倉庫，并且數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)根據(jù)消費者特征為不同的消費者提供不同角度的數(shù)據(jù)。
在本發(fā)明的一個示例性的實施例中，利用不同知識庫編碼的臨床數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成通用/規(guī)范的表達形式。醫(yī)院和臨床醫(yī)生采用工具來產(chǎn)生臨床報告，其描述通過患者訪問到的結(jié)果。這些工具利用臨床代碼來代表臨床術(shù)語并且這些臨床代碼對于不同的工具和不同的醫(yī)院各不相同。另外，用來存儲臨床數(shù)據(jù)的SR對象的類型可能由于不同的工具和不同的醫(yī)院而各不相同?？梢岳帽景l(fā)明的一個示范性的實施例來將臨床報告映射成通用的表達方式(例如，通用的臨床代碼和SR對象類型)。這能夠提供查詢或提煉由不同的臨床和醫(yī)院以同樣的方式產(chǎn)生的數(shù)據(jù)并且分辨這些對消費者例如研究人員和臨床醫(yī)生有用的模式的能力。
圖2表示將利用醫(yī)院的特殊臨床代碼存儲為SR對象的臨床報告轉(zhuǎn)換為用于數(shù)據(jù)倉庫的通用格式的示例。首先，為了將醫(yī)院報告映射成通用表達方式，對臨床術(shù)語的代碼進行分類和定義。可以利用XML模式來定義這些代碼和格式。這些臨床代碼和分類既可以是內(nèi)部產(chǎn)生的也可以是以標準為基礎(chǔ)的(例如，SNOMED)。圖2中的醫(yī)院數(shù)據(jù)庫202包括存儲在用于醫(yī)院A的醫(yī)院計算機系統(tǒng)中的數(shù)據(jù)。它包括本地XML模式(schema)知識庫，利用該知識庫來將在醫(yī)院A中使用的本地臨床代碼和本地格式映射成由數(shù)據(jù)倉庫210使用的通用報告格式。例如，醫(yī)院A利用代碼“743.18”表示胸廓回波處理而通用XML模式知識庫利用代碼“600”表示胸廓回波處理。利用由數(shù)據(jù)倉庫使用的通用代碼“600”，轉(zhuǎn)換成通用格式報告的部分將代替在醫(yī)院A中使用的本地代碼“743.18”。類似地，醫(yī)院數(shù)據(jù)庫202包括醫(yī)院B的本地XML模式知識庫和醫(yī)院B的臨床報告，將它們轉(zhuǎn)換成具有通用臨床數(shù)據(jù)代碼的通用格式報告。位于數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104中的通用數(shù)據(jù)庫206包括由轉(zhuǎn)換引擎208使用的通用XML模式知識庫。另外，利用通用數(shù)據(jù)庫206來為每個醫(yī)院創(chuàng)建本地的XML模式知識庫，因為它包含所有臨床代碼的超集。連同臨床代碼轉(zhuǎn)換和SR對象轉(zhuǎn)換一起，通用XML模式知識庫還包括數(shù)據(jù)倉庫布局信息，確定在數(shù)據(jù)倉庫210中如何表示通用格式報告。
如圖2中所示，通過利用例如Extensible Style Language Transformation(XSLT)工具等轉(zhuǎn)換引擎208，將位于醫(yī)院數(shù)據(jù)庫202中的來自醫(yī)院A的本地臨床報告映射成通用格式報告，由位于通用數(shù)據(jù)庫206上的通用XML模式知識庫所限定。XSLT是一種編程語言，可以用來指定從一個XML文檔到另一個XML文檔的轉(zhuǎn)換原則。這些轉(zhuǎn)換專用于在產(chǎn)生臨床報告中使用的知識庫。XSLT是在XSL樣式表中使用的語言，用來將XML文檔轉(zhuǎn)換成其他XML文檔。在本發(fā)明的一個示例性的實施例中，XSL處理器讀取XML文檔和遵從XSL樣式表中的指令，并且然后其輸出一個新的XML文檔或XML文檔片段。因此，如圖2中所示，對于每個本地知識庫存在一組映射規(guī)則或本地XML模式知識庫。這些規(guī)則可以由為報告產(chǎn)生者提供知識庫的銷售商或者理解基礎(chǔ)知識庫的任何人建立。
利用包含在醫(yī)院數(shù)據(jù)庫202中的本地模式知識庫，通過位于醫(yī)院計算機系統(tǒng)110中的軟件實現(xiàn)用通用臨床代碼替代本地臨床代碼從而創(chuàng)建通用格式的報告。然后所得到的包含通用臨床代碼的通用格式報告?zhèn)鬏斀o數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104，從而與醫(yī)院數(shù)據(jù)庫202中的相關(guān)的本地XML模式數(shù)據(jù)庫和通用數(shù)據(jù)庫206中的通用XML模式知識庫一同輸入給轉(zhuǎn)換引擎208。來自轉(zhuǎn)換引擎208的輸出是用于位于存儲裝置108的數(shù)據(jù)倉庫的格式化的通用格式報告。在另一個示例性的實施例中，轉(zhuǎn)換引擎208的全部或部分功能和相關(guān)的輸入位于醫(yī)院計算機系統(tǒng)110中，并且為數(shù)據(jù)倉庫而格式化的通用格式化報告?zhèn)鬏斀o數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104用來輸入給數(shù)據(jù)倉庫210。單個醫(yī)院可能具有一個以上的本地XML模式知識庫，如果它對于不同格式的臨床報告利用不同的系統(tǒng)。映射規(guī)則不需要表示為XML模式知識庫但是可以本領(lǐng)域中已知的任何方式描述。
圖3表示用于公共提煉的采集和格式化一個報告的處理的示意圖。該處理應(yīng)當通常發(fā)生在醫(yī)院中的醫(yī)院計算機系統(tǒng)110上，它的輸出發(fā)送給數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)104。在步驟302中，選擇存儲在醫(yī)院計算機系統(tǒng)110中的報告從而發(fā)送給數(shù)據(jù)倉庫。該報告包括報告采集字段，如果報告還沒有發(fā)送，則字段中包含值“NO”并且如果已經(jīng)發(fā)送，包含值“YES”。這避免了在數(shù)據(jù)倉庫中的復(fù)制報告的問題，因為只有在報告采集字段中包含值“NO”的報告才發(fā)送給數(shù)據(jù)倉庫。在步驟304中，刪除可能用來跟蹤醫(yī)療報告返回到具體患者的任何數(shù)據(jù)項目從而凈化該報告。去除數(shù)據(jù)項目可以包括以下之一或全部利用別名代替去除的數(shù)據(jù)項目用來在與同一患者有關(guān)的集體報告中使用；和去除該數(shù)據(jù)項目并且保持該數(shù)據(jù)項目空白。在步驟306中，報告采集字段設(shè)定為“YES”從而避免將該報告發(fā)送給數(shù)據(jù)倉庫一次以上。然后，在步驟308中，如參照圖2所描述的，報告映射成通用格式。在步驟310中，已經(jīng)映射成通用格式的報告發(fā)送給在數(shù)據(jù)提煉中使用的數(shù)據(jù)倉庫。通過經(jīng)過規(guī)則的基于全球網(wǎng)的提交的脫機管理運輸或物理郵遞服務(wù)實現(xiàn)該采集處理，從而避免影響工作流程。
為了在數(shù)據(jù)提煉中使用，本發(fā)明的一個實施例允許采集利用不同編碼系統(tǒng)和不同格式已經(jīng)創(chuàng)建的臨床數(shù)據(jù)報告。來自每個醫(yī)院的報告從本地格式轉(zhuǎn)換成通用格式，該通用格式輸入給在數(shù)據(jù)提煉中使用的通用數(shù)據(jù)倉庫。通過依靠新興的DICOM SR標準與醫(yī)院用來存儲臨床數(shù)據(jù)的其他SR標準一同使用，可以實現(xiàn)而不需要重新輸入任何數(shù)據(jù)。能夠查詢臨床數(shù)據(jù)報告的統(tǒng)一的數(shù)據(jù)倉庫將帶來更好的患者護理和為醫(yī)療裝置和制藥公司提供更多信息。例如，廢石(stent)開發(fā)公司將利用該數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)對于它們的廢石隱藏的設(shè)計問題和他們能夠利用這些數(shù)據(jù)創(chuàng)建新的廢石設(shè)計。制藥公司能夠利用該數(shù)據(jù)倉庫形成他們的藥物與執(zhí)行的處理之間的相關(guān)性。另外，醫(yī)學(xué)研究者將利用該數(shù)據(jù)作出用來處理復(fù)雜的醫(yī)療問題的更好的處理，并且保險公司將得到更詳細的臨床信息，從而更快地確定較好的保險項目。
如上面所描述的，本發(fā)明的實施例可以具體表現(xiàn)為計算機執(zhí)行的程序和用來實現(xiàn)這些程序的裝置的形式。本發(fā)明的實施例還可以具體表現(xiàn)為計算機編程代碼，其包含具體表現(xiàn)在有形媒體例如軟盤、CD-ROM、硬盤或者任何其它計算機可讀取的存儲媒體中的指令，其中當該計算機編程代碼裝載到計算機中并且由計算機執(zhí)行時，計算機成為用來實踐本發(fā)明的裝置。本發(fā)明的實施例還可以具體表現(xiàn)為計算機編程代碼，例如或者存儲在存儲媒體中，裝載到計算機中/由計算機執(zhí)行，或者通過一些傳輸媒體例如通過電線或電纜、通過光纖器件或者通過電磁輻射傳輸，其中當該計算機編程代碼裝載到計算機中并且由計算機執(zhí)行時，計算機成為用來實踐本發(fā)明的裝置。當在通常目的的微處理機上實現(xiàn)時，計算機編程代碼片段為微處理機配置從而創(chuàng)建特殊的邏輯電路。
雖然已經(jīng)參照幾個示范性的實施例描述了本發(fā)明，但本領(lǐng)域的技術(shù)人員應(yīng)當理解在不脫離本發(fā)明的范圍的情況下，可以做出各種改變和用等價物代替其中的各部分。另外，根據(jù)本發(fā)明的教導(dǎo)，可以做出多種改進來適應(yīng)具體的條件或材料，而不會脫離本發(fā)明的實質(zhì)范圍。因此，不打算將本法明限制到作為實現(xiàn)本發(fā)明提出的最佳方式而公開的具體實施例中，但是本發(fā)明將包括落入到所附權(quán)利要求的范圍內(nèi)的所有實施例。另外，第一、第二等術(shù)語的使用不意味著任何順序或重要性，而寧可說是采用第一、第二等術(shù)語來將一個元件與另一個元件區(qū)分開。
權(quán)利要求
1.一種用于數(shù)據(jù)提煉的臨床數(shù)據(jù)采集和發(fā)布方法，該方法包括選擇要采集的本地報告，其中所述本地報告是結(jié)構(gòu)化的報告對象并且包括本地臨床代碼、患者標識數(shù)據(jù)和報告采集狀態(tài)數(shù)據(jù)；通過去除所述患者標識數(shù)據(jù)對所述本地報告進行凈化；更新所述本地報告采集狀態(tài)從而反映所述選擇；將所述本地報告映射成通用格式報告，其中所述映射包括訪問包括所述本地臨床代碼和對應(yīng)的通用格式臨床代碼的知識庫；和利用所述對應(yīng)的通用格式代碼代替所述本地臨床代碼；和將所述通用格式報告?zhèn)魉徒o數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)(104)，其中所述數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)(104)包括數(shù)據(jù)倉庫(210)。
2.根據(jù)權(quán)利要求1的方法，進一步包括在所述數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)(104)接收所述通用格式報告；將所述通用格式報告的內(nèi)容映射成所述數(shù)據(jù)倉庫(210)中的字段；和響應(yīng)對所述通用格式報告的內(nèi)容進行的映射，將所述通用格式報告的內(nèi)容增加到所述數(shù)據(jù)倉庫(210)中。
3.根據(jù)權(quán)利要求1的方法，進一步包括接收來自消費者的請求來訪問包含在所述數(shù)據(jù)倉庫(210)中的數(shù)據(jù)，其中所述請求包括數(shù)據(jù)查詢；核實所述消費者具有到所述數(shù)據(jù)的入口；和響應(yīng)所述核實將所述數(shù)據(jù)傳送給所述消費者。
4.根據(jù)權(quán)利要求1的方法，其中所述消費者是研究醫(yī)院工作人員。
5.根據(jù)權(quán)利要求1的方法，其中所述消費者是制藥公司研究隊員。
6.根據(jù)權(quán)利要求1的方法，其中所述消費者來自制造醫(yī)療產(chǎn)品的公司。
7.根據(jù)權(quán)利要求1的方法，其中所述結(jié)構(gòu)化的報告對象是XML對象。
8.根據(jù)權(quán)利要求1的方法，其中所述結(jié)構(gòu)化的報告對象是DICOM結(jié)構(gòu)化的報告對象。
9.根據(jù)權(quán)利要求1的方法，其中所述結(jié)構(gòu)化的報告對象是HL-7信息對象。
10.一種用于數(shù)據(jù)提煉的臨床數(shù)據(jù)采集和發(fā)布方法，該方法包括在數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)(104)接收通用格式報告，其中所述數(shù)據(jù)提煉系統(tǒng)(104)包括數(shù)據(jù)倉庫(210)，并且其中所述通用格式報告是包括臨床編碼的醫(yī)療數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)化的報告對象；利用XML模式將所述通用格式報告的內(nèi)容映射成數(shù)據(jù)倉庫(210)中的字段；和根據(jù)所述映射將所述通用格式報告的內(nèi)容添加到所述數(shù)據(jù)倉庫(210)中。
11.根據(jù)權(quán)利要求10的方法，進一步包括接收來自消費者的請求來訪問包含在所述數(shù)據(jù)倉庫(210)中的數(shù)據(jù)，其中所述請求包括數(shù)據(jù)查詢；核實所述消費者具有到所述數(shù)據(jù)的入口；和響應(yīng)所述核實將所述數(shù)據(jù)傳送給所述消費者。
12.根據(jù)權(quán)利要求11的方法，其中所述消費者是研究醫(yī)院工作人員。
13.根據(jù)權(quán)利要求11的方法，其中所述消費者是制藥公司研究隊員。
14.根據(jù)權(quán)利要求11的方法，其中所述消費者來自制造醫(yī)療產(chǎn)品的公司。
15.根據(jù)權(quán)利要求10的方法，其中所述結(jié)構(gòu)化的報告對象是XML對象。
16.根據(jù)權(quán)利要求10的方法，其中所述結(jié)構(gòu)化的報告對象是DICOM結(jié)構(gòu)化的報告對象。
17.根據(jù)權(quán)利要求10的方法，其中所述結(jié)構(gòu)化的報告對象是HL-7信息對象。
18.一種用于數(shù)據(jù)提煉的臨床數(shù)據(jù)采集和發(fā)布系統(tǒng)，該系統(tǒng)包括網(wǎng)絡(luò)(106)；和與所述網(wǎng)絡(luò)(106)進行通信的醫(yī)院計算機系統(tǒng)(110)；所述醫(yī)院計算機系統(tǒng)(110)包括用來執(zhí)行一種方法的軟件；該方法包括選擇位于用來采集的所述醫(yī)院計算機系統(tǒng)(110)上的本地報告，其中所述本地報告是結(jié)構(gòu)化的報告對象并且包括本地臨床代碼、患者標識數(shù)據(jù)和報告采集狀態(tài)數(shù)據(jù)；通過去除所述患者標識數(shù)據(jù)對所述本地報告進行凈化；更新所述本地報告采集狀態(tài)從而反映所述選擇；將所述本地報告映射成通用格式報告，其中所述映射包括訪問包括所述本地臨床代碼和所述對應(yīng)的通用格式臨床代碼的位于所述醫(yī)院計算機系統(tǒng)(110)上的知識庫；和利用所述對應(yīng)的通用格式代碼代替所述本地臨床代碼；和將所述通用格式報告通過所述網(wǎng)絡(luò)(106)傳送給數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)(104)，其中數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)(104)包括數(shù)據(jù)倉庫(210)。
19.根據(jù)權(quán)利要求18的系統(tǒng)，其中所述網(wǎng)絡(luò)(106)是因特網(wǎng)。
20.根據(jù)權(quán)利要求18的系統(tǒng)，其中所述網(wǎng)絡(luò)(106)是內(nèi)聯(lián)網(wǎng)。
21.一種用于數(shù)據(jù)提煉的臨床數(shù)據(jù)采集和發(fā)布系統(tǒng)，該系統(tǒng)包括網(wǎng)絡(luò)(106)；包括數(shù)據(jù)倉庫(210)的存儲裝置(108)；和與所述網(wǎng)絡(luò)(106)和所述存儲裝置(108)進行通信的數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)(104)，所述數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)(104)包括用來執(zhí)行一種方法的軟件，該方法包括通過所述網(wǎng)絡(luò)(106)在所說的數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)(104)上接收通用格式報告，在此該通用格式報告是包括臨床編碼的醫(yī)療數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)化的報告對象；利用XML模式將所說的通用格式報告的內(nèi)容映射到所說的數(shù)據(jù)倉庫(210)中的字段；和響應(yīng)所述映射將所述通用格式報告的內(nèi)容添加到所述數(shù)據(jù)倉庫(210)中。
22.根據(jù)權(quán)利要求21的系統(tǒng)，其中所述網(wǎng)絡(luò)(106)是因特網(wǎng)。
23.根據(jù)權(quán)利要求21的系統(tǒng)，其中所述網(wǎng)絡(luò)(106)是內(nèi)聯(lián)網(wǎng)。
24.根據(jù)權(quán)利要求21的系統(tǒng)，其中所述數(shù)據(jù)倉庫(210)是關(guān)系數(shù)據(jù)庫。
25.一種用于數(shù)據(jù)提煉的臨床數(shù)據(jù)采集和發(fā)布的計算機程序產(chǎn)品，該產(chǎn)品包括能夠由處理電路讀取并存儲有通過處理電路執(zhí)行從而實現(xiàn)如下的步驟的指令的存儲媒體選擇位于用來采集的所述醫(yī)院計算機系統(tǒng)(110)上的本地報告，其中該本地報告是結(jié)構(gòu)化的報告對象并且包括本地臨床代碼、患者標識數(shù)據(jù)和報告采集狀態(tài)數(shù)據(jù)；通過去除患者標識數(shù)據(jù)對本地報告進行凈化；更新該本地報告采集狀態(tài)從而反映該選擇；將本地報告映射成通用格式報告并且該映射包括訪問包括本地臨床代碼和對應(yīng)的通用格式臨床代碼的知識庫；和利用對應(yīng)的通用格式代碼代替本地臨床代碼；和將所說的通用格式報告?zhèn)魉徒o數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)(104)，其中該數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)(104)包括數(shù)據(jù)倉庫(210)。
全文摘要
一種用于數(shù)據(jù)提煉的臨床數(shù)據(jù)采集和發(fā)布方法。該方法包括選擇要采集的本地報告，其中所述本地報告是結(jié)構(gòu)化的報告對象并且包括本地臨床代碼、患者標識數(shù)據(jù)和報告采集狀態(tài)數(shù)據(jù)。通過去除所述患者標識數(shù)據(jù)對所述本地報告進行凈化。更新所述本地報告采集狀態(tài)從而反映所述選擇。將所述本地報告映射成通用格式報告，其中所述映射包括訪問包括所述本地臨床代碼和對應(yīng)的通用格式臨床代碼的知識庫；和利用所述對應(yīng)的通用格式代碼代替所述本地臨床代碼。然后將通用格式報告?zhèn)魉徒o包括數(shù)據(jù)庫(210)的數(shù)據(jù)提煉主機系統(tǒng)(104)。
文檔編號G06F17/40GK1501290SQ200310120330
公開日2004年6月2日 申請日期2003年10月24日 優(yōu)先權(quán)日2002年10月25日
發(fā)明者C·布拉克特, C 布拉克特, V·J·阿南, 阿南 申請人:Ge醫(yī)療系統(tǒng)信息技術(shù)公司