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一種檢測裝置及系統(tǒng)的制作方法

文檔序號:6484233閱讀:152來源:國知局
專利名稱:一種檢測裝置及系統(tǒng)的制作方法
技術領域
本發(fā)明有關于工控技術領域,尤其是有關于數據的監(jiān)控、分析設備的技 術領域,具體地講是一種檢測裝置及系統(tǒng)。
背景技術
目前,在例如公安、司法鑒定經常使用GeneMarker分析軟件。Gene Marker分析軟件是基于微衛(wèi)星DNA (即短串聯重復序列,STR)多態(tài)性的 分析軟件,可用于法醫(yī)學鑒定,親子鑒定等領域。GeneMarker分析軟件可讀 取多種格式的DNA片段峰值數據,個體鑒定靈敏度極高,性能穩(wěn)定而操作 簡便。
Gene Marker分析軟件主要應用于遺傳學領域遺傳制圖,連鎖性分析; 腫瘤學領域染色體雜合性缺失(LOH)分析,分析腫瘤患者染色體異常情況; 醫(yī)學領域高脂血癥,動脈粥樣硬化性心腦血管,腫瘤等復雜疾病基因定位; 進化生物學領域物種多態(tài)性研究;古生物學相關研究;以及生物學家單核苷 酸延伸法SNP的高通量分析。
而Gene Marker分析軟件的主要功能為讀取多種格式的DNA片段峰 值數據(Trace Data);自動識別每個DNA片段的內標;計算出等位基因 (Allele)的位置(Size);獲得等位基因的Repeat Number 。
Gene Marker分析軟件借助GeneMarker國際領先的STR分析算法,為 司法鑒定人員提供一個精確、快速的分析數據,減少了司法鑒定人員的工作 量,同時也避免了許多由于手工操作可能導致的錯誤。
然而,現有的基于GeneMarker分析軟件的分析平臺,都需要人工來審 核分析結果的準確性,即由于在實驗過程或分析過程中,出現一些誤差,因此由Gene Marker分析軟件分析出的結果很有可能存在一些誤差,此時分析 人員就要考慮采用哪個或哪組分析數據來作為分析結果。而該檢驗工作目前 只能由一些具有多年經驗的檢驗工作者來人工完成,因此檢驗結果不僅存在 誤差,也存在人為的因素,從而無法高效率地、準確地完成對鑒定結果的鑒 定檢驗工作。

發(fā)明內容
本發(fā)明鑒于上述現有技術中存在的問題,其目的在于,提出一種檢測裝 置及系統(tǒng),以對DNA數據進行分析后,自動檢驗該分析結果,以減少司法 鑒定人員的工作量,同時也避免了許多由于人工操作可能導致的錯誤。
為了實現上述本發(fā)明的目的,本發(fā)明的實施例提出一種檢測裝置,所述 檢測裝置包括獲取單元,用于獲取DNA樣本數據,該DNA樣本數據是 由DNA測序儀取樣并生成;分析單元,用于對所述DNA樣本數據進行短 串聯重復序列分析,并生成分析結果數據;校驗單元,用于對所述DNA樣 本數據進行校驗,檢驗所述DNA樣本數據是否存在誤差,并生成校驗結果 數據;輸出單元,用于輸出所述分析結果數據和相應的所述校驗結果數據。
所述校驗單元包括基因峰校驗模塊,用于根據所述DNA樣本數據中 的峰的高度、寬度、形狀和局部信噪比生成所述校驗結果數據。
所述校驗單元包括內標校驗模塊,用于根據標準內標與所述DNA樣 本數據中的樣本內標進行比較,生成所述校驗結果數據。
所述內標校驗模塊根據所述樣本內標與所述標準內標的線性相關性、所 述樣本內標數目與所述標準數目的差別、所述樣本內標的峰的信號質量以及 高度離散度以及所述樣本內標的雜峰的數目來生成所述校驗結果數據。
所述校驗單元包括等位基因階梯校驗模塊,用于根據所述DNA樣本 數據中的等位基因階梯樣本的信號質量生成所述校驗結果數據。
所述等位基因階梯校驗模塊根據熒光分子量內標校驗結果、等位基因峰的信號質量、等位基因峰的間距以及試劑盒等位基因階梯標準分型的比對結 果來生成所述校驗結果數據。
所述校驗單元包括陽性對照樣本校驗模塊,用于所述熒光分子量內標 校驗結果、等位基因峰的質量、與試劑盒陽性對照標準分型的比對結果來對 陽性對照樣本的信號質量進行校驗,生成所述校驗結果數據;陰性對照樣本 校驗模塊,用于根據所述熒光分子量內標校驗結果以及是否出現等位基因來 對陰性對照樣本進行校驗,生成所述校驗結果數據。
為了實現上述本發(fā)明的目的,本發(fā)明的實施例還提供一種檢測系統(tǒng),所
述系統(tǒng)包括DNA測序儀,用于對DNA數據進行取樣并測序,生成DNA 樣本數據;數據采集裝置,用于實時采集所述DNA樣本數據,并發(fā)送;檢
測裝置,該檢測裝置包括獲取單元,用于接收所述數據采集裝置發(fā)送的所
述DNA樣本數據;分析單元,用于對所述DNA樣本數據進行短串聯重復 序列分析,并生成分析結果數據;校驗單元,用于對所述DNA樣本數據進 行校驗,檢驗所述DNA樣本數據是否存在誤差,并生成校驗結果數據;輸 出單元,用于輸出所述分析結果數據和相應的所述校驗結果數據。
所述校驗單元包括基因峰校驗模塊,用于根據所述DNA樣本數據中 的峰的高度、寬度、形狀和局部信噪比生成基因峰校驗數據;內標校驗模塊, 用于根據所述DNA樣本數據中的樣本內標與標準內標的線性相關性、所述 樣本內標數目與所述標準數目的差別、所述樣本內標的峰的信號質量以及高 度離散度以及所述樣本內標的雜峰的數目來生成內標校驗數據;等位基因階 梯校驗模塊,用于根據所述DNA樣本數據中的等位基因階梯樣本的熒光分 子量內標校驗結果、等位基因峰的信號質量、等位基因峰的間距以及試劑盒 等位基因階梯標準分型的比對結果來生成等位基因階梯校驗數據;陽性對照 樣本校驗模塊,用于所述熒光分子量內標校驗結果、等位基因峰的質量、與 試劑盒陽性對照標準分型的比對結果來對陽性對照樣本的信號質量進行校 驗,生成陽性對照樣本校驗數據;陰性對照樣本校驗模塊,用于根據所述熒光分子量內標校驗結果以及是否出現等位基因來對陰性對照樣本進行校驗,
生成陰性對照樣本校驗數據;校驗數據生成模塊,用于根據所述基因峰校驗
數據、內標校驗數據、等位基因階梯校驗數據、陽性對照樣本校驗數據以及 陰性對照樣本校驗數據生成所述校驗結果數據。
數據采集裝置具有USB存儲模塊,用于實時采集所述DNA樣本數據, 并通過無線通信網絡或有線通信網絡將所述DNA樣本數據發(fā)送。
本發(fā)明通過對DNA樣本數據進行短串聯重復序列分析,并生成分析結 果數據的同時還對所述DNA樣本數據進行校驗,檢驗所述DNA樣本數據 是否存在誤差,并生成校驗結果數據,因此無需對校驗結果不好的DNA樣 本數據進行短串聯重復序列分析并輸出,同時取代了由人工來完成校驗的過 程,從而不僅高效率地、準確地完成對鑒定結果的鑒定檢驗工作,而且能省 略對校驗結果不好的DNA樣本數據進行短串聯重復序列分析并輸出的過 程,節(jié)約了成本。


此處所說明的附圖用來提供對本發(fā)明實施例的進一步理解,構成本申請
的一部分,并不構成對本發(fā)明的限定。在附圖中
圖1所示的是本發(fā)明實施例1的檢測裝置的結構框圖。
圖2所示的是本發(fā)明實施例2的校驗單元的結構框圖。
圖3所示的是本發(fā)明實施例2的等位基因峰的詳細信息列表的示意圖。
圖4所示的是本發(fā)明實施例2的熒光分子量內標校驗結果的示意圖。
圖5所示的是本發(fā)明實施例2的等位基因階梯(ladder)樣本的校驗結
果的示意圖。
圖6所示的是本發(fā)明實施例2的陽性對照樣本的熒光峰的示意圖。 圖7所示的是本發(fā)明實施例3的檢測系統(tǒng)的結構框圖。
8
具體實施例方式
為使本發(fā)明實施例的目的、技術方案和優(yōu)點更加清楚明白,下面結合實 施方式和附圖,對本發(fā)明做進一步詳細說明。在此,本發(fā)明的示意性實施方 式及其說明用于解釋本發(fā)明,但并不作為對本發(fā)明的限定。
實施例1
圖1所示的是本發(fā)明實施例1的檢測裝置的結構框圖。如圖1所示,本 發(fā)明實施例1的檢測裝置包括獲取單元101,用于獲取DNA樣本數據,
該DNA樣本數據是由DNA測序儀取樣并生成;分析單元102,用于對所述 DNA樣本數據進行短串聯重復序列分析,并生成分析結果數據;校驗單元 103,用于對所述DNA樣本數據進行校驗,檢驗所述DNA樣本數據是否存 在誤差,并生成校驗結果數據;輸出單元104,用于輸出所述分析結果數據 和相應的所述校驗結果數據。
在本發(fā)明實施例l中,當DNA測序儀完成某個樣本的實驗時,會在該 批樣本的輸出文件夾內生成該樣本的數據文件,當完成整批樣本的實驗時, 會在測序儀的實驗日志文件中寫入試驗完成標記。獲取單元101時刻監(jiān)控測 序儀實驗數據輸出目錄內的文件變化。只要有新的數據文件生成,軟件馬上 讀取測序儀的實驗日志文件,如果找到實驗完成的標記,便獲取該批實驗數 據。因此,僅當整批樣本的實驗全部完成,獲取單元101才會啟動獲取DNA 樣本數據的功能,避免了重復上傳數據,重復分析數據、重復提交分析結果 的情況。
并且,本發(fā)明實施例1通過對DNA樣本數據進行短串聯重復序列分析, 并生成分析結果數據的同時還對所述DNA樣本數據進行校驗,檢驗所述 DNA樣本數據是否存在誤差,并生成校驗結果數據,因此無需對校驗結果 不好的DNA樣本數據進行短串聯重復序列分析并輸出,同時取代了由人工 來完成校驗的過程,從而不僅高效率地、準確地完成對鑒定結果的鑒定檢驗 工作,而且能省略對校驗結果不好的DNA樣本數據進行短串聯重復序列分析并輸出的過程,節(jié)約了成本。 實施例2
圖2所示的是本發(fā)明實施例2的校驗單元的結構框圖。本發(fā)明實施例2
與上述本發(fā)明實施例1的不同之處在于,本發(fā)明實施例2的校驗單元包括
基因峰校驗模塊201,用于根據所述DNA樣本數據中的峰的高度、寬度、 形狀和局部信噪比生成基因峰校驗數據;內標校驗模塊202,用于根據所述 DNA樣本數據中的樣本內標與標準內標的線性相關性、所述樣本內標數目 與所述標準數目的差別、所述樣本內標的峰的信號質量以及高度離散度以及 所述樣本內標的雜峰的數目來生成內標校驗數據;等位基因階梯校驗模塊 203,用于根據所述DNA樣本數據中的等位基因階梯樣本的熒光分子量內標 校驗結果、等位基因峰的信號質量、等位基因峰的間距以及試劑盒等位基因 階梯標準分型的比對結果來生成等位基因階梯校驗數據;陽性對照樣本校驗 模塊204,用于所述熒光分子量內標校驗結果、等位基因峰的質量、與試劑 盒陽性對照標準分型的比對結果來對陽性對照樣本的信號質量進行校驗,生 成陽性對照樣本校驗數據;陰性對照樣本校驗模塊205,用于根據所述熒光 分子量內標校驗結果以及是否出現等位基因來對陰性對照樣本進行校驗,生 成陰性對照樣本校驗數據;校驗數據生成模塊,用于根據所述基因峰校驗數 據、內標校驗數據、等位基因階梯校驗數據、陽性對照樣本校驗數據以及陰 性對照樣本校驗數據生成校驗結果數據。
圖3所示的是本發(fā)明實施例2的等位基因峰的詳細信息列表的示意圖。 基因峰校驗模塊201根據峰的高度、寬度、形狀和局部信噪比計算出一 個綜合分數,根據閾值進行質量評估。同時,還會考慮基因座內的雜合不平 衡系數。
如圖3所示,第9、 IO個峰質量為'Check,,質量判斷原因為<LS,, 分數小于等于閾值0.3;第5個峰質量為'Undetermined',質量判斷原因為 'OB, 1MB',位置落在等位基因標準范圍之外,雜合不平衡系數為0.14,小于閾值0.6。
圖4所示的是本發(fā)明實施例2的熒光分子量內標校驗結果的示意圖。 內標校驗模塊202根據以下幾個方面對樣本的內標校驗結果進行校驗
1.樣本內標與標準內標的線性相關性;2.樣本內標數目與標準數目的差別;
3.樣本內標峰的信號質量以及高度離散度;4.雜峰的數目。任何一項出現
問題都會顯著降低校驗結果,提醒司法鑒定人員留意內標校驗結果可能出現
錯誤的樣本。
如圖4所示,第一個樣本內標校驗結果沒有任何問題,校驗結果為97 (在本發(fā)明實施例2中,為了直觀的表示校驗的結果,以分數來表示校驗結 果,分數越高其準確性越高),第二個樣本因為出現幾個雜峰,校驗結果為 76,第三個樣本因為內標峰的信號質量較差,校驗結果為52。內標校驗模塊 202具備強大的內標搜索、過濾和匹配功能,即使對于信號較差的樣本,在 絕大部分情況下都能夠自動找出正確的內標。但是考慮到內標校驗結果對分 型結果的重要性,在樣本信號較差的情況下不能保證100%的正確性,內標 校驗模塊202根據不同情況降低分數以提醒司法鑒定人員檢査或修改內標校 驗結果。
圖5所示的是本發(fā)明實施例2的等位基因階梯(ladder)樣本的校驗結 果的示意圖。
等位基因階梯校驗模塊203根據以下幾個方面對ladder樣本的信號質量
進行校驗1.熒光分子量內標校驗結果;2.等位基因峰的信號質量;3.等
位基因峰的間距;4.與試劑盒l(wèi)adder標準分型的比對結果。只要其中一方面 沒有達到相應閾值,等位基因階梯校驗模塊203在分析其他樣本等位基因分 型的過程中,不會將該ladder樣本作為等位基因參照標準。如果沒有一個 ladder樣本通過質量審核,則判定實驗失敗,對所有樣本不進行短串聯重復 序列分析。等位基因階梯校驗模塊203會在熒光峰圖上標記出與相應標準不 匹配的分型。如圖5所示,在基因座D13S317內,標準分型應該是8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, ladder樣本的分型結果是9, 10, 11, 12, 13, 15。
圖6所示的本發(fā)明實施例2的陽性對照樣本的熒光峰的示意圖。
陽性對照樣本校驗模塊204根據以下幾個方面對陽性對照樣本的信號質 量進行評估1.熒光分子量內標校驗結果;2.等位基因峰的信號質量;3. 與試劑盒陽性對照標準分型的比對結果。
而陰性對照樣本校驗模塊205根據熒光分子量內標校驗結果和是否出現 等位基因來進行評估。與ladder—樣,陰性對照樣本校驗模塊205會在熒光 峰圖上標記出與相應標準不匹配的分型.
如圖6,陽性對照樣本在基因座D81179內的等位基因132.5,在基因座 D21SU內的等位基因193.2在標準中不存在。
只要普通樣本的內標校驗結果打分小于一定閾值,或者存在可疑的等位 基因,不進行短串聯重復序列分析,只提交熒光峰片。
并且,本發(fā)明實施例2通過對DNA樣本數據進行短串聯重復序列分析, 并生成分析結果數據的同時還對所述DNA樣本數據進行校驗,檢驗所述 DNA樣本數據是否存在誤差,并生成校驗結果數據,因此無需對校驗結果 不好的DNA樣本數據進行短串聯重復序列分析并輸出,同時取代了由人工 來完成校驗的過程,從而不僅高效率地、準確地完成對鑒定結果的鑒定檢驗 工作,而且能省略對校驗結果不好的DNA樣本數據進行短串聯重復序列分 析并輸出的過程,節(jié)約了成本。
實施例3
圖7所示的是本發(fā)明實施例3的檢測系統(tǒng)的結構框圖。如圖7所示,本 發(fā)明實施例3的檢測系統(tǒng)包括DNA測序儀701,用于對DNA數據進行取 樣并測序,生成DNA樣本數據;數據采集裝置702,用于實時采集所述DNA 樣本數據,并發(fā)送;檢測裝置703,該檢測裝置包括獲取單元704,用于 接收所述數據采集裝置發(fā)送的所述DNA樣本數據;分析單元705,用于對所述DNA樣本數據進行短串聯重復序列分析,并生成分析結果數據;校驗
單元706,用于對所述DNA樣本數據進行校驗,檢驗所述DNA樣本數據是 否存在誤差,并生成校驗結果數據;輸出單元707,用于輸出所述分析結果 數據和相應的所述校驗結果數據。
并且,本發(fā)明實施例3的校驗單元包括基因峰校驗模塊,用于根據所 述DNA樣本數據中的峰的高度、寬度、形狀和局部信噪比生成基因峰校驗 數據;內標校驗模塊,用于根據所述DNA樣本數據中的樣本內標與標準內 標的線性相關性、所述樣本內標數目與所述標準數目的差別、所述樣本內標 的峰的信號質量以及高度離散度以及所述樣本內標的雜峰的數目來生成內 標校驗數據;等位基因階梯校驗模塊,用于根據所述DNA樣本數據中的等 位基因階梯樣本的熒光分子量內標校驗結果、等位基因峰的信號質量、等位 基因峰的間距以及試劑盒等位基因階梯標準分型的比對結果來生成等位基 因階梯校驗數據;陽性對照樣本校驗模塊,用于所述熒光分子量內標校驗結 果、等位基因峰的質量、與試劑盒陽性對照標準分型的比對結果來對陽性對 照樣本的信號質量進行校驗,生成陽性對照樣本校驗數據;陰性對照樣本校 驗模塊,用于根據所述熒光分子量內標校驗結果以及是否出現等位基因來對 陰性對照樣本進行校驗,生成陰性對照樣本校驗數據;校驗數據生成模塊, 用于根據所述基因峰校驗數據、內標校驗數據、等位基因階梯校驗數據、陽 性對照樣本校驗數據以及陰性對照樣本校驗數據生成所述校驗結果數據。
在本發(fā)明實施例3中,數據采集裝置702能夠時時監(jiān)控DNA測序儀701 輸出的原始數據,并且能夠判斷DNA測序儀是否已完成整批樣本。
當DNA測序儀701完成某個樣本的實驗時,會在該批樣本的輸出文件 夾內生成該樣本的數據文件,當完成整批樣本的實驗時,會在DNA測序儀 701的實驗日志文件中寫入試驗完成標記。
數據采集裝置702時刻監(jiān)控測序儀實驗數據輸出目錄內的文件變化。只 要有新的數據文件生成,數據采集裝置702馬上讀取測序儀的實驗日志文件,
13如果找到實驗完成的標記,便向檢測裝置703上傳該批實驗數據。因此,僅
當整批樣本的實驗全部完成,數據采集裝置702才會啟動上傳DNA采樣數 據的功能,避免了重復上傳數據,重復分析數據、重復提交分析結果的情況。
獲取單元704獲取上述數據采集裝置702發(fā)送的DNA采樣數據,并按 照DNA測序儀701的編號保存到各個目錄,同時根據原始數據實驗所用的 試劑盒提交相應的自動分析參數配置文件。
其中,每種試劑盒都創(chuàng)建一個Results Group,并在建立獨立的數據輸出 目錄,每個輸出目錄內放置一個與試劑盒對應的分析參數配置文件。在數據 采集裝置702向獲取單元704提交完整批實驗數據后,分析單元705向數據 所在文件夾的上層目錄中尋找并上傳分析參數配置文件,并使用該配置文件 中的參數來分析數據,這樣保證了參數的正確性。
檢測裝置703能夠時時監(jiān)控DNA測序儀701上傳的原始數據,并且分 析單元705調用GeneMarker自動分析軟件分析數據。
分析單元705檢測到新的分析參數配置文件(文本格式),馬上調用 GeneMarker自動分析軟件,按照配置文件中的參數對DNA采樣數據進行短 串聯重復序列分析(STR分析)。
分析單元705能夠自動辨別并評估Ladder, Positive Control, Negative Control等特殊樣本,并在普通樣本中識別出混合樣本。并且,本發(fā)明實施 例3中,校驗單元706對每個樣本都會進行熒光分子量內標校驗效果評估, 等位基因峰圖質量評估,基因座內雜合不平衡評估等等,方便司法鑒定人員 進行質量監(jiān)控。
分析單元705分析完數據以后,輸出單元707自動將分析結果數據和相 應的校驗結果數據提交到實驗室管理系統(tǒng)(即客戶端)。
分析結果數據和相應的校驗結果數據包括該批實驗數據的樣本總數,特 殊的樣本數,實驗失敗的樣本數,存在可疑分型的樣本數,樣本的STR分 型結果,以及樣本熒光峰圖的圖片等。如果樣本存在可疑的STR分型,只提交該樣本的熒光峰圖,在第一個關卡就保證了有疑問的分析結果不會被應 用于司法鑒定。
另外,本發(fā)明實施例3的數據采集裝置702可以具有USB存儲模塊, 用于實時采集所述DNA樣本數據,并可以通過無線通信網絡或有線通信網 絡將所述DNA樣本數據發(fā)送。該數據采集裝置702可以插入到DNA測序 儀,并且可以具有射頻模塊,從而一方面實時采集所述DNA樣本數據,另 一方面可以將該DNA樣本數據通過射頻發(fā)送出去。
本發(fā)明實施例3 —體化全自動解決方案(自動監(jiān)控原始數據,自動上傳, 自動分析,自動提交分析結果),從實驗結束,到產生首次分析結果,無需 任何人工操作,大大減少了司法鑒定人員的工作量,提供他們的工作效率。
數據采集裝置的時時監(jiān)控機制,保證了檢測系統(tǒng)的高效性。實驗結束后 很短時間內(由實驗樣本數量決定,不超過2分鐘),司法鑒定人員便可以 在實驗室管理系統(tǒng)中看到分析結果。
自動分析參數配置文件方案,保證第一次分析就采用了與實驗所用試劑 盒匹配的參數,以及司法鑒定人員預先設定的參數,避免了在GeneMarker 客戶端內重復設置參數進行二次分析。
GeneMarker分析軟件具有強大的專家系統(tǒng),分別對特殊樣本和普通樣本 的各個方面進行質量評估,通過豐富的界面提醒司法鑒定人員,并提供方便 的操作功能來修改分析結果。最后在上傳分析結果部分進行把關,防止有疑 問的分析結果進入實驗室管理系統(tǒng),被用于司法鑒定。
本發(fā)明通過對DNA樣本數據進行短串聯重復序列分析,并生成分析結 果數據的同時還對所述DNA樣本數據進行校驗,檢驗所述DNA樣本數據 是否存在誤差,并生成校驗結果數據,因此無需對校驗結果不好的DNA樣 本數據進行短串聯重復序列分析并輸出,同時取代了由人工來完成校驗的過 程,從而不僅高效率地、準確地完成對鑒定結果的鑒定檢驗工作,而且能省略對校驗結果不好的DNA樣本數據進行短串聯重復序列分析并輸出的過 程,節(jié)約了成本。
以上所述的具體實施方式
,對本發(fā)明的目的、技術方案和有益效果進行 了進一步詳細說明,所應理解的是,以上所述僅為本發(fā)明的具體實施方式
而 已,并不用于限定本發(fā)明的保護范圍,凡在本發(fā)明的精神和原則之內,所做 的任何修改、等同替換、改進等,均應包含在本發(fā)明的保護范圍之內。
權利要求
1.一種檢測裝置,其特征在于,所述檢測裝置包括獲取單元,用于獲取DNA樣本數據,該DNA樣本數據是由DNA測序儀取樣并生成;分析單元,用于對所述DNA樣本數據進行短串聯重復序列分析,并生成分析結果數據;校驗單元,用于對所述DNA樣本數據進行校驗,檢驗所述DNA樣本數據是否存在誤差,并生成校驗結果數據;輸出單元,用于輸出所述分析結果數據和相應的所述校驗結果數據。
2. 根據權利要求1所述的檢測裝置,其特征在于,所述校驗單元包括 基因峰校驗模塊,用于根據所述DNA樣本數據中的峰的高度、寬度、形狀和局部信噪比生成所述校驗結果數據。
3. 根據權利要求1所述的檢測裝置,其特征在于,所述校驗單元包括 內標校驗模塊,用于根據標準內標與所述DNA樣本數據中的樣本內標進行比較,生成所述校驗結果數據。
4. 根據權利要求3所述的檢測裝置,其特征在于,所述內標校驗模塊根 據所述樣本內標與所述標準內標的線性相關性、所述樣本內標數目與所述標 準數目的差別、所述樣本內標的峰的信號質量以及高度離散度以及所述樣本 內標的雜峰的數目來生成所述校驗結果數據。
5. 根據權利要求3所述的檢測裝置,其特征在于,所述校驗單元包括 等位基因階梯校驗模塊,用于根據所述DNA樣本數據中的等位基因階梯樣本的信號質量生成所述校驗結果數據。
6. 根據權利要求5所述的檢測裝置,其特征在于,所述等位基因階梯校 驗模塊根據熒光分子量內標校驗結果、等位基因峰的信號質量、等位基因峰 的間距以及試劑盒階梯標準分型的比對結果來生成所述校驗結果數據。
7. 根據權利要求3所述的檢測裝置,其特征在于,所述校驗單元包括 陽性對照樣本校驗模塊,用于所述熒光分子量內標校驗結果、等位基因峰的質量、與試劑盒陽性對照標準分型的比對結果來對陽性對照樣本的信號 質量進行校驗,生成所述校驗結果數據;陰性對照樣本校驗模塊,用于根據所述熒光分子量內標校驗結果以及是 否出現等位基因來對陰性對照樣本進行校驗,生成所述校驗結果數據。
8. —種檢測系統(tǒng),其特征在于,所述系統(tǒng)包括DNA測序儀,用于對DNA數據進行取樣并測序,生成DNA樣本數據; 數據采集裝置,用于實時采集所述DNA樣本數據,并發(fā)送;檢測裝置,該檢測裝置包括獲取單元,用于接收所述數據采集裝置發(fā)送的所述DNA樣本數據;分析單元,用于對所述DNA樣本數據進行短串 聯重復序列分析,并生成分析結果數據;校驗單元,用于對所述DNA樣本 數據進行校驗,檢驗所述DNA樣本數據是否存在誤差,并生成校驗結果數 據;輸出單元,用于輸出所述分析結果數據和相應的所述校驗結果數據。
9. 根據權利要求8所述的檢測系統(tǒng),其特征在于,所述校驗單元包括 基因峰校驗模塊,用于根據所述DNA樣本數據中的峰的高度、寬度、形狀和局部信噪比生成基因峰校驗數據;內標校驗模塊,用于根據所述DNA樣本數據中的樣本內標與標準內標 的線性相關性、所述樣本內標數目與所述標準數目的差別、所述樣本內標的 峰的信號質量以及高度離散度以及所述樣本內標的雜峰的數目來生成內標 校驗數據;等位基因階梯校驗模塊,用于根據所述DNA樣本數據中的等位基因階 梯樣本的熒光分子量內標校驗結果、等位基因峰的信號質量、等位基因峰的 間距以及試劑盒等位基因階梯標準分型的比對結果來生成等位基因階梯校 驗數據;陽性對照樣本校驗模塊,用于所述熒光分子量內標校驗結果、等位基因峰的質量、與試劑盒陽性對照標準分型的比對結果來對陽性對照樣本的信號 質量進行校驗,生成陽性對照樣本校驗數據;陰性對照樣本校驗模塊,用于根據所述熒光分子量內標校驗結果以及是 否出現等位基因來對陰性對照樣本進行校驗,生成陰性對照樣本校驗數據;校驗數據生成模塊,用于根據所述基因峰校驗數據、內標校驗數據、等 位基因階梯校驗數據、陽性對照樣本校驗數據以及陰性對照樣本校驗數據生 成所述校驗結果數據。
10.根據權利要求8或9所述的檢測系統(tǒng),其特征在于,數據采集裝置具 有USB存儲模塊,用于實時采集所述DNA樣本數據,并通過無線通信網絡 或有線通信網絡將所述DNA樣本數據發(fā)送。
全文摘要
本發(fā)明提供一種檢測裝置及系統(tǒng),該檢測裝置包括獲取單元,用于獲取DNA樣本數據,該DNA樣本數據是由DNA測序儀取樣并生成;分析單元,用于對所述DNA樣本數據進行短串聯重復序列分析,并生成分析結果數據;校驗單元,用于對所述DNA樣本數據進行校驗,檢驗所述DNA樣本數據是否存在誤差,并生成校驗結果數據;輸出單元,用于輸出所述分析結果數據和相應的所述校驗結果數據。本發(fā)明取代了由人工來完成校驗的過程,從而不僅高效率地、準確地完成對鑒定結果的鑒定檢驗工作,而且能省略對校驗結果不好的DNA樣本數據進行短串聯重復序列分析并輸出的過程,節(jié)約了成本。
文檔編號G06F19/00GK101560564SQ20091008147
公開日2009年10月21日 申請日期2009年4月8日 優(yōu)先權日2009年4月8日
發(fā)明者寧 萬 申請人:北京華生恒業(yè)科技有限公司
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