專利名稱：：評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的方法及系統(tǒng)的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
：本發(fā)明涉及基因工程和生物醫(yī)學(xué)工程領(lǐng)域，更具體地說，涉及一種評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的方法及系統(tǒng)。
背景技術(shù)：
：在目前的醫(yī)療技術(shù)中，一般都能夠?qū)膊∵M(jìn)行確診。但是目前使用中的很多藥物，并不清楚其對疾病是否確定有效，這在腫瘤等疾病中顯得尤為常見。此外，由于病患存在個體差異，也不清楚藥物在不同的情形下是否會產(chǎn)生不良反應(yīng)。由上可知，現(xiàn)有^L術(shù)無法明確藥物的藥理反應(yīng)(包括療效和不良反應(yīng))與疾病之間的相關(guān)性，在后續(xù)的治療過程中只能進(jìn)行經(jīng)驗(yàn)性用藥，而這種方式是基于群體數(shù)據(jù)的結(jié)果，難以指導(dǎo)不同個體的治療。因此需要一種方法，使藥物的藥理反應(yīng)與疾病之間的相關(guān)性得到明確，從而提高后續(xù)治療過程中用藥的針對性。
發(fā)明內(nèi)容本發(fā)明的目的之一在于提供一種評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的系統(tǒng)，旨在解決現(xiàn)有技術(shù)無法對藥物的藥理反應(yīng)與疾病之間的相關(guān)性進(jìn)行評估，導(dǎo)致后續(xù)治療過程中用藥的針對性較差的問題。為了實(shí)現(xiàn)發(fā)明目的，所述評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的系統(tǒng)包括一用于存儲與基因序列對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫，還包括基因序列檢測單元、數(shù)據(jù)處理單元和輸出單元基因序列檢測單元，檢測與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的基因位點(diǎn)的基因序列，并將其發(fā)送給數(shù)據(jù)處理單元；數(shù)據(jù)處理單元，在數(shù)據(jù)庫中查找與檢測到的基因序列具有一致性的基因序列，并提取出對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)，以及根據(jù)所述藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)生成藥物評估結(jié)果；輸出單元，將所述藥物評估結(jié)果輸出。其中，所述基因序列檢測單元對與疾病相應(yīng)的組織或體液標(biāo)本進(jìn)行多個基因位點(diǎn)的平行檢測，得到與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的所有基因位點(diǎn)的基因序列。其中，所述數(shù)據(jù)處理單元進(jìn)一步包括查詢模塊、數(shù)據(jù)提取模塊和數(shù)據(jù)分析模塊查詢模塊，將基因序列檢測單元檢測到的基因序列輸入數(shù)據(jù)庫，查找與其具有一致性的基因序列；數(shù)據(jù)提^:莫塊，將所述具有一致性的基因序列對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)從數(shù)據(jù)庫中提取出來；數(shù)據(jù)分析模塊，對所述藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，生成藥物評估結(jié)果。其中，所述查詢模塊根據(jù)檢索條件對基因序列進(jìn)行檢索，并對檢索結(jié)果進(jìn)行一致性篩選，得到與所述4企測到的基因序列的堿基數(shù)量和排列順序相同的基因序列。其中，所述數(shù)據(jù)分析模塊對量化后的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行加權(quán)運(yùn)算，并根據(jù)運(yùn)算結(jié)果進(jìn)行排序，得出藥物評估結(jié)果。為了更好的實(shí)現(xiàn)發(fā)明目的，本發(fā)明還提供了一種基于前述系統(tǒng)評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的方法，該方法包括以下步驟A.檢測與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的基因位點(diǎn)的基因序列；B.在數(shù)據(jù)庫中查找與檢測到的基因序列具有一致性的基因序列，并提取出對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)；C.根據(jù)所述藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)生成藥物評估結(jié)果，并輸出。其中，所述步驟A包括對與疾病相應(yīng)的組織或體液標(biāo)本進(jìn)行多個基因位點(diǎn)的平行檢測，得到與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的所有基因位點(diǎn)的基因序列。其中，所述步驟B包括Bl.將檢測到的基因序列輸入數(shù)據(jù)庫，查找與其具有一致性的基因序列；B2.將所述具有一致性的基因序列對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)從數(shù)據(jù)庫中提取出來。其中，所述步驟B1包括Bll.根據(jù)檢索條件對基因序列進(jìn)行檢索；B12.對檢索結(jié)果進(jìn)行一致性篩選，得到與所述檢測到的基因序列的堿基數(shù)量和排列順序相同的基因序列。其中，所述步驟C中根據(jù)所述藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)生成藥物評估結(jié)果的過程包括Cl.對藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行量化；C2對量化后的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行加權(quán)運(yùn)算；03.對運(yùn)算結(jié)果排序，并根據(jù)排序情況得出藥物評估結(jié)果。由上可知，本發(fā)明使藥物的藥理反應(yīng)與疾病之間的相關(guān)性得到明確，從而提高了后續(xù)治療過程中用藥的針對性。圖l是本發(fā)明一個實(shí)施例中評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的系統(tǒng)結(jié)構(gòu)示意圖2是圖1所示實(shí)施例中數(shù)據(jù)處理單元20的結(jié)構(gòu)示意圖；圖3是本發(fā)明一個實(shí)施例中評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的方5法流程圖4是圖3所示實(shí)施例中步驟S32的方法流程圖。具體實(shí)施例方式為了使本發(fā)明的目的、技術(shù)方案及優(yōu)點(diǎn)更加清楚明白，以下結(jié)合附圖及實(shí)施例，對本發(fā)明進(jìn)行進(jìn)一步詳細(xì)說明。圖l示出了本發(fā)明一個實(shí)施例中評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的系統(tǒng)結(jié)構(gòu)，該系統(tǒng)包括基因序列檢測單元IO、數(shù)據(jù)處理單元20、數(shù)據(jù)庫30和輸出單元40。需要說明的是，各功能模塊之間的通信方式可以采取多種，本發(fā)明的保護(hù)范圍不應(yīng)限定為某種特定類型的通信方式。其中(1)基因序列檢測單元IO，檢測與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的基因位點(diǎn)的基因序列，并將檢測到的基因序列發(fā)送給數(shù)據(jù)處理單元20。(2)數(shù)據(jù)處理單元20，在數(shù)據(jù)庫30中查找與檢測到的基因序列具有一致性的基因序列，并從數(shù)據(jù)庫30中提取出對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)，以及根據(jù)該藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)生成藥物評估結(jié)果，然后將藥物評估結(jié)果發(fā)送給輸出單元40。(3)數(shù)據(jù)庫30，用于存儲與基因序列對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)，供數(shù)據(jù)處理單元20進(jìn)行查找和提取。(4)輸出單元40，將數(shù)據(jù)處理單元20生成的藥物評估結(jié)果輸出。在本發(fā)明中，上述基因序列檢測單元10可通過多種方式檢測與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的基因位點(diǎn)的基因序列。關(guān)于"與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的基因，，，需要說明的是人類存在3萬多個基因，而人類的多數(shù)疾病，尤其是腫瘤，是一個多基因、多步驟的過程，在疾病的不同階段，涉及不同的基因表達(dá)和相互關(guān)聯(lián)，某些互相協(xié)同，某些互相遏制。與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的基因，屬于藥物遺傳學(xué)或藥物基因組學(xué)的范疇。在一個優(yōu)選實(shí)施例中，檢測方式是根據(jù)不同的疾病，獲W目應(yīng)的組織或體液標(biāo)本進(jìn)行多個基因位點(diǎn)的平行檢測，得到與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的所有基因位點(diǎn)的基因序列，從而在投藥前獲知相關(guān)的藥物遺傳學(xué)背景。具體的檢測過程如下首先，從組織或體液標(biāo)本提取基因表達(dá)物或基因組材料，通過反轉(zhuǎn)錄、鏈?zhǔn)骄酆厦笖U(kuò)增等方法得到與疾病相關(guān)的多基因片段；然后，將這些多基因片段通過分子生物學(xué)的文庫制備過程處理制備成短片段基因庫；最后，利用高通量基因測序設(shè)備，對這些短片段基因庫中的基因片段進(jìn)行測序，得到測序結(jié)果。需要說明的是，本專利檢測基因序列的方式并不局限于上述實(shí)施例，其他方式均包含在本專利的保護(hù)范圍之內(nèi)。圖2是圖1所示實(shí)施例中數(shù)據(jù)處理單元20的結(jié)構(gòu)示意圖。該數(shù)據(jù)處理單元20包括(1)查詢模塊201，將基因序列檢測單元10檢測到的基因序列輸入數(shù)據(jù)庫30,查找與其具有一致性的基因序列。在一個實(shí)施例中，查詢模塊201的查詢過程具體包括首先輸入檢測到的基因序列并根據(jù)一定的檢索條件在數(shù)據(jù)庫30中查找；然后對查找到的所有基因序列進(jìn)行一致性篩選。所述的一致性，是指檢測到的基因序列與數(shù)據(jù)庫30中存儲的基因序列相比，在堿基數(shù)量和排列順序上都相同。查詢模塊201中設(shè)置有一定的檢索條件，當(dāng)輸入檢測到的基因序列后，則按照該檢索條件在數(shù)據(jù)庫30中進(jìn)行查找。該檢索條件可以設(shè)置為多種類型，例如是一段典型的與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的基因序列。另外，在實(shí)際應(yīng)用中，該檢索條件也存在多種設(shè)置方式，例如可以采用系統(tǒng)默認(rèn)的檢索條件，或者將用戶自定義的檢索條件導(dǎo)入該查詢模塊201中。(2)數(shù)據(jù)提取模塊202，將數(shù)據(jù)庫30中與該具有一致性的基因序列對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)提取出來。在本發(fā)明的一個實(shí)施例中，數(shù)據(jù)提取模塊202發(fā)送一個提取命令給數(shù)據(jù)庫30，該提取命令中包含提取目標(biāo)，即該具有一致性的基因序列。當(dāng)數(shù)據(jù)庫30收到該提取命令后，則將與其對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)發(fā)送給數(shù)據(jù)提取模塊202。若基因序列檢測單元10中檢測到多個基因序列，則查詢模塊201將查找到對應(yīng)數(shù)量的具有一致性的基因序列，數(shù)據(jù)提取模塊202也將會從數(shù)據(jù)庫30中提取出對應(yīng)數(shù)量的多份藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)。(3)數(shù)據(jù)分析模塊203，對所提取出的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，生成藥物評估結(jié)果。需要說明的是，如果基因序列檢測單元10只檢測到一個基因序列，數(shù)據(jù)提^^莫塊202最終只會提取出一份對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)，那么數(shù)據(jù)分析模塊203僅僅根據(jù)這一份藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)生成藥物評估結(jié)果；如果基因序列檢測單元10檢測到多個基因序列，數(shù)據(jù)提^^莫塊202將提取出多份對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)，那么數(shù)據(jù)分析模塊203對多份藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合分析，生成藥物評估結(jié)果。在本發(fā)明中，數(shù)據(jù)分析模塊203可以根據(jù)多種算法對藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。在本發(fā)明的一個實(shí)施例中，數(shù)據(jù)分析模塊203采取的一種算法就是首先對藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行量化，具體是將療效、不良反應(yīng)等因子進(jìn)行量化，例如按照等級賦不同的數(shù)值；然后對量化后的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行加權(quán)運(yùn)算;最后根據(jù)運(yùn)算結(jié)果進(jìn)行排序，得出最佳的藥物配伍方案，即為藥物評估結(jié)果。7當(dāng)然，本發(fā)明并不限于上述的分析方法，還可以采取其他類似的算法。在本發(fā)明的一個實(shí)施例中，上述數(shù)據(jù)庫30內(nèi)部的數(shù)據(jù)存儲方式，是利用數(shù)據(jù)表的形式存儲與各種不同基因序列對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)。該數(shù)據(jù)庫30的構(gòu)建過程包括首先選擇多個樣本，即患有同種疾病的病患。然后針對各個樣本(l)檢測與該疾病有關(guān)的所有基因位點(diǎn)的基因序列；(2)在用藥過程中，測各個基因位點(diǎn)的基因序列類型與某種藥物的藥理反應(yīng)之間的相關(guān)性，該藥理反應(yīng)包括藥效和各種不良反應(yīng)，統(tǒng)稱為藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)；(3)將所測得的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)統(tǒng)計起來，存儲到數(shù)據(jù)庫30中。需要說明的是，本發(fā)明并不涉及數(shù)據(jù)庫30本身的構(gòu)建過程，而是在評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性時需要基于該數(shù)據(jù)庫30來實(shí)現(xiàn)。該數(shù)據(jù)庫30內(nèi)部的數(shù)據(jù)存儲方式可參考現(xiàn)有技術(shù)，例如采用數(shù)據(jù)表的方式等，此處不進(jìn)行贅述。在本發(fā)明的一個實(shí)施例中，上述輸出單元40有多種存在形式，例如計算機(jī)顯示屏等。另外該輸出單元40有多種數(shù)據(jù)輸出方式，例如直接打印、將數(shù)據(jù)顯示到顯示屏等。關(guān)于輸出單元40的存在形式和數(shù)據(jù)輸出方式可參考現(xiàn)有技術(shù)中的各種可實(shí)現(xiàn)情形，并不限于上述實(shí)施例。圖3是本發(fā)明一個實(shí)施例中評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的方法流程圖。具體過程如下在步驟S31中，檢測與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的基因位點(diǎn)的基因序列。在步驟S32中，在數(shù)據(jù)庫30中查找并提取出與檢測到的基因序列具有一致性的基因序列，并提取出對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)。在步驟S33中，才艮據(jù)藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)生成藥物評估結(jié)果，并輸出。在本發(fā)明的一個實(shí)施例中，上迷步驟S31可通過多種方式檢測與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的基因位點(diǎn)的基因序列。在一個實(shí)施例中，檢測方式是根據(jù)不同的疾病，獲取相應(yīng)的組織或體液標(biāo)本進(jìn)行多個基因位點(diǎn)的平行檢測，得到與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的所有基因位點(diǎn)的基因序列，從而在投藥前獲知相關(guān)的藥物遺傳學(xué)背景。具體的檢測過程如下首先，從組織或體液標(biāo)本提取基因表達(dá)物或基因組材料，通過反轉(zhuǎn)錄、鏈?zhǔn)骄酆厦笖U(kuò)增等方法得到與疾病相關(guān)的多基因片段；然后，將這些多基因片段通過分子生物學(xué)的文庫制備過程處理制備成短片段基因庫；最后，利用高通量基因測序設(shè)備，對這些短片段基因庫中的基因片段進(jìn)行測序，得到測序結(jié)果。需要說明的是，本專利檢測基因序列的方式并不局限于上述實(shí)施例，其他方式均包含在本專利的保護(hù)范圍之內(nèi)。圖4是圖3所示實(shí)施例中步驟S32的方法流程圖。該步驟的具體過程如下在步驟S321中，將檢測到的基因序列輸入數(shù)據(jù)庫30,查找與其具有一致性的基因序列。在一個實(shí)施例中，數(shù)據(jù)庫30內(nèi)部的數(shù)據(jù)存儲方式可采用數(shù)據(jù)表的方式等。該步驟S321的查詢過程具體包括首先輸入檢測到的基因序列并根據(jù)一定的檢索條件在數(shù)據(jù)庫30中查找；然后對查找到的所有基因序列進(jìn)行一致性篩選。所述的一致性，是指檢測到的基因序列與數(shù)據(jù)庫30中存儲的基因序列相比，在堿基數(shù)量和排列順序上都相同。在上述步驟S321之前，設(shè)置有一定的檢索條件，當(dāng)輸入檢測到的基因序列后，則按照該檢索條件在數(shù)據(jù)庫30中進(jìn)行查找。該檢索條件可以設(shè)置為多種類型，例如是一^R典型的與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的基因序列。另外，在實(shí)際應(yīng)用中，該檢索條件也存在多種設(shè)置方式，例如可以采用系統(tǒng)默認(rèn)的檢索條件，或者將用戶自定義的檢索條件導(dǎo)入前述的評估系統(tǒng)中。在步驟S322中，將所述具有一致性的基因序列對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)從數(shù)據(jù)庫30中提取出來。在本發(fā)明的一個實(shí)施例中，提取過程包括首先發(fā)送一個提取命令給數(shù)據(jù)庫30，該提取命令中包含提取目標(biāo)，即該具有一致性的基因序列；當(dāng)數(shù)據(jù)庫30收到該提取命令后，則反饋與其對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)。在本發(fā)明的一個實(shí)施例中，前述圖3中的步驟S33對所述藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，生成藥物評估結(jié)果。需要說明的是，如果在步驟S31中只檢測到一個基因序列，則只會提取出一份對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)，那么僅僅根據(jù)這一份藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)生成藥物評估結(jié)果；如果在步驟S31中檢測到多個基因序列，則將提取出多份對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)，那么需要對多份藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合分析，生成藥物評估結(jié)果。在上述步驟S33中，可以根據(jù)多種算法對藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。在一個優(yōu)選實(shí)施例中所采取的算法是首先對藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行量化，具體是將療效、不良反應(yīng)等因子進(jìn)行量化，例如按照等級賦不同的數(shù)值；然后對量化后的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行加權(quán)運(yùn)算；最后根據(jù)運(yùn)算結(jié)果進(jìn)行排序，得出最佳的藥物配伍方案，即為藥物評估結(jié)果。當(dāng)然，本發(fā)明并不限于上述的分析方法，還可以采取其他類似的算法。在本發(fā)明的一個實(shí)施例中，上述步驟S33將藥物評估結(jié)果輸出可采取多種方式。例如直接打印、將數(shù)據(jù)顯示到顯示屏等。應(yīng)該說明的是，本發(fā)明并不局限于某種特定類型的數(shù)據(jù)輸出方式。實(shí)例以晚期結(jié)直腸腫瘤為例對本專利方案進(jìn)行詳述。具體過程如下1、檢測與該結(jié)直腸腫瘤的治療藥物的療效相關(guān)的所有基因位點(diǎn)的基因序列。目前已知該結(jié)直腸腫瘤的常用藥物包括3大類化療藥物(氟尿嘧啶類、奧沙利鉑、伊立替康)和2種單克隆抗體(針對EGFR的西妥昔單抗和帕尼單抗、針對VEGF的貝伐單抗)。臨床常用的方案包括上述各種藥物的任何一種組合。與上述各種藥物的療效相關(guān)的基因如下表所示:<table>tableseeoriginaldocumentpage10</column></row><table>表達(dá)水平，HIF1,Glut-l，VEGFR基因表達(dá)而在本實(shí)施例中，步驟ut測到了與其中四種藥物的療效相關(guān)的基因位點(diǎn)的基因序列，包括3類，共6個子類型，即與氟尿嘧啶類藥物療效和毒性均相關(guān)的DPD(包括DPD高、DPD低)，與伊立替康毒性相關(guān)的UGT1A"28(包括UGT1A"28野生型、UGT1A"28變異體)，與西妥昔單抗/帕尼單抗的療效相關(guān)的K-RAS突變(包括K-RAS野生型與K-RAS突變型)。2、將檢測到的上述基因序列輸入數(shù)據(jù)庫30，查找與其具有一致性的基因序列。在本實(shí)施例中，在數(shù)據(jù)庫30中查找到與上述基因序列中的4個對應(yīng)完全一致的基因序列UGT1A"28野生型、UGT1AP28變異體、K-RAS野生型與K-RAS突變型。3、將數(shù)據(jù)庫30中這些基因序列對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)提取出來，該藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)也即基因序列與某種藥物的藥理反應(yīng)之間的相關(guān)性，藥理反應(yīng)包括藥效和不良反應(yīng)等。在本實(shí)施例中，數(shù)據(jù)庫30中所存儲的這些基因序列對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)如下表所示<table>tableseeoriginaldocumentpage11</column></row><table>需要說明的是，上表中部分藥物的療效或不良反應(yīng)在臨床中還未得到完全確認(rèn)，因此暫用N/A(NotApplicable,不適用)標(biāo)識。本實(shí)施例中療效欄中標(biāo)識為N/A的項(xiàng)可等同于一般，不良反應(yīng)欄中標(biāo)識為N/A的項(xiàng)可等同于輕微，從而在后面的計算過程中不構(gòu)成偏向性的影響。4、對上表中的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，生成藥物評估結(jié)果。分析采取的算法是將藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)(包括療效和不良反應(yīng))進(jìn)行量化，例如將療效的較好、一般、無效分別賦值為2、1、0,將不良反應(yīng)的無、輕微、嚴(yán)重也分別賦值為2、1、0，對這兩項(xiàng)進(jìn)行簡單的疊加運(yùn)算。以下是各個藥物對應(yīng)的分析及運(yùn)算之后的排序及評估結(jié)果<table>tableseeoriginaldocumentpage11</column></row><table>其中，V表示該藥物為可選藥物，x表示該藥物不可選。在該實(shí)施例的上述結(jié)果中，則可選兩種藥物針對UGT1A"28野生型的伊立替康，和針對K-RAS野生型的西妥昔單抗/帕尼單抗。5、將該藥物評估結(jié)果顯示到計算機(jī)顯示屏上，供用戶查看。應(yīng)當(dāng)說明的是，上述實(shí)例中涉及的數(shù)據(jù)及算法僅為闡明本專利技術(shù)方案的需要，并不對保護(hù)范圍構(gòu)成限制，本發(fā)明可以根據(jù)實(shí)際情況變換算法和代入數(shù)據(jù)。另外，本發(fā)明典型的應(yīng)用于上述對腫瘤相關(guān)基因位點(diǎn)的基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性進(jìn)行評估，但并不限定于此，在其他類似的情形中也可以應(yīng)用本發(fā)明所闡述的方法。以上所述僅為本發(fā)明的較佳實(shí)施例而已，并不用以限制本發(fā)明，凡在本發(fā)明的精神和原則之內(nèi)所作的任何修改、等同替換和改進(jìn)等，均應(yīng)包含在本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。權(quán)利要求1、一種評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的系統(tǒng)，包括一用于存儲與基因序列對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫，其特征在于，所述系統(tǒng)還包括基因序列檢測單元、數(shù)據(jù)處理單元和輸出單元基因序列檢測單元，檢測與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的基因位點(diǎn)的基因序列，并將其發(fā)送給數(shù)據(jù)處理單元；數(shù)據(jù)處理單元，在數(shù)據(jù)庫中查找與檢測到的基因序列具有一致性的基因序列，并提取出對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)，以及根據(jù)所述藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)生成藥物評估結(jié)果；輸出單元，將所述藥物評估結(jié)果輸出。2、根據(jù)權(quán)利要求1所述的評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的系統(tǒng)，其特征在于，所述基因序列檢測單元對與疾病相應(yīng)的組織或體液標(biāo)本進(jìn)行多個基因位點(diǎn)的平行檢測，得到與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的所有基因位點(diǎn)的基因序列。3、根據(jù)權(quán)利要求l所述的評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的系統(tǒng)，其特征在于，所述數(shù)據(jù)處理單元進(jìn)一步包括查詢才莫塊、數(shù)據(jù)提^#塊和數(shù)據(jù)分析模塊查詢模塊，將基因序列檢測單元檢測到的基因序列輸入數(shù)據(jù)庫，查找與其具有一致性的基因序列；數(shù)據(jù)提取模塊，將所述具有一致性的基因序列對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)從數(shù)據(jù)庫中提取出來；數(shù)據(jù)分析模塊，對所述藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，生成藥物評估結(jié)果。4、根據(jù)權(quán)利要求3所述的評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的系統(tǒng)，其特征在于，所述查詢模塊根據(jù)檢索條件對基因序列進(jìn)行檢索，并對檢索結(jié)果進(jìn)行一致性篩選，得到與所述檢測到的基因序列的堿基數(shù)量和排列順序相同的基因序列。5、根據(jù)權(quán)利要求3或4所述的評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的系統(tǒng)，其特征在于，所述數(shù)據(jù)分析模塊對量化后的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行加權(quán)運(yùn)算，并根據(jù)運(yùn)算結(jié)果進(jìn)行排序，得出藥物評估結(jié)果。6、一種基于權(quán)利要求1所述系統(tǒng)評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的方法，所述系統(tǒng)包括一用于存儲與基因序列對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫，其特征在于，所述方法包括以下步驟A.檢測與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的基因位點(diǎn)的基因序列；B.在數(shù)據(jù)庫中查找與檢測到的基因序列具有一致性的基因序列，并提取出對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)；C.根據(jù)所述藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)生成藥物評估結(jié)果，并輸出。7、根據(jù)權(quán)利要求6所述的評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的方法，其特征在于，所述步驟A包括對與疾病相應(yīng)的組織或體液標(biāo)本進(jìn)行多個基因位點(diǎn)的平行檢測，得到與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的所有基因位點(diǎn)的基因序列。8、根據(jù)權(quán)利要求6所述的評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的方法，其特征在于，所述步驟B包括B1.將檢測到的基因序列輸入數(shù)據(jù)庫，查找與其具有一致性的基因序列；B2.將所述具有一致性的基因序列對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)從數(shù)據(jù)庫中提取出來。9、根據(jù)權(quán)利要求8所述的評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的方法，其特征在于，所述步驟B1包括B11.根據(jù)檢索條件對基因序列進(jìn)行檢索；B12對檢索結(jié)果進(jìn)行一致性篩選，得到與所述檢測到的基因序列的堿基數(shù)量和排列順序相同的基因序列。10、根據(jù)權(quán)利要求6至9中任一項(xiàng)所述的評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的方法，其特征在于，所述步驟C中根據(jù)所述藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)生成藥物評估結(jié)果的過程包括Cl.對藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行量化；C2,對量化后的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)進(jìn)行加權(quán)運(yùn)算；C3.對運(yùn)算結(jié)果排序，并根據(jù)排序情況得出藥物評估結(jié)果。全文摘要本發(fā)明涉及基因工程和生物醫(yī)學(xué)工程領(lǐng)域，提供了一種評估基因序列與藥物藥理反應(yīng)的相關(guān)性的方法及系統(tǒng)。所述方法包括以下步驟A.檢測與疾病和/或其治療藥物的藥理反應(yīng)相關(guān)的基因位點(diǎn)的基因序列；B.在數(shù)據(jù)庫中查找與檢測到的基因序列具有一致性的基因序列，并提取出對應(yīng)的藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)；C.根據(jù)所述藥物相關(guān)性數(shù)據(jù)生成藥物評估結(jié)果，并輸出。所述系統(tǒng)包括數(shù)據(jù)庫、基因序列檢測單元、數(shù)據(jù)處理單元和輸出單元。本發(fā)明使藥物的藥理反應(yīng)與疾病之間的相關(guān)性得到明確，從而提高后續(xù)治療過程中用藥的針對性。文檔編號G06F17/30GK101603088SQ200910108699公開日2009年12月16日申請日期2009年7月16日優(yōu)先權(quán)日2009年7月16日發(fā)明者俊張,朱正綱,盛司潼,駿計申請人:張俊;盛司潼;朱正綱;計駿