專利名稱：高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明屬于醫(yī)療檢測技術(shù)領(lǐng)域，涉及一種參數(shù)的獲取方法，尤其涉及一種高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法。
背景技術(shù)：
原發(fā)性高血壓(primaryhypertension)是以血壓升高為主要臨床表現(xiàn)伴或不伴有多種心血管危險因素的綜合征，通常簡稱為高血壓。高血壓是多種心、腦血管疾病的重要病因和危險因素，影響重要臟器，如心、腦、腎的結(jié)構(gòu)與功能，最終導(dǎo)致這些器官的功能衰竭，迄今仍是心血管疾病死亡的主要原因之一。2010版《中國高血壓防治指南》公布，中國目前高血壓患者已超過2億人，每10個成年人中就有2人患有高血壓，每年還在繼續(xù)新增1，000萬高血壓患者。而中國每年死亡的300萬心血管病患者中，50%都與高血壓有關(guān)。如果不加以控制，2020年預(yù)計中國將有4億高血壓病人。更為重要的是，高血壓不經(jīng)有效控制將會嚴(yán)重影響心、腦、腎的結(jié)構(gòu)與功能，并發(fā)高血壓腎病、高血壓心臟病和高血壓腦卒中等，導(dǎo)致這些器官的功能衰竭，這是最終導(dǎo)致患者致殘和構(gòu)成生命威脅的主要原因，患者及其家庭還將承受巨大的精神和經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)?，F(xiàn)階段，衛(wèi)生部在我國人群特點的基礎(chǔ)上制定了堅持預(yù)防為主，防治結(jié)合的策略。針對正常高值血壓者、高血壓患者或有嚴(yán)重并發(fā)癥患者進(jìn)行全面評估，根據(jù)危險分層，適病癥治療，決定干預(yù)或治療措施。正常高值血壓者、高血壓患者堅持(非)藥物療法，改變不良生活方式；長期平穩(wěn)有效控制高血壓，提高降壓達(dá)標(biāo)率，減少一系列心腦血管病的發(fā)生。對比1991全國高血壓抽樣調(diào)查和2002全國營養(yǎng)調(diào)查數(shù)據(jù)，高血壓患者的知曉率由26.3%提高到了 30.2%，治療率由12.1%提高到24.7%，而控制率則由2.8%提高到6.1%。在許多高血壓防治研究社區(qū)的管理人群中，高血壓控制率已達(dá)60%以上。同期高血壓的最主要并發(fā)癥一腦卒中的死亡率也在我國部分城市中老年人口中以每年3%的速度平穩(wěn)下降。

高血壓及并發(fā)癥是一種多病因的多基因疾病。遺傳學(xué)分析發(fā)現(xiàn)高血壓病人常有家族病史，揭示遺傳因素對高血壓的發(fā)生及發(fā)展有一定作用。從我國高血壓流行狀況來看，控制危險因素包含個人不良生活方式及環(huán)境因素是符合國情的全人群和高危人群及病人相結(jié)合的防治策略。這四種疾病(高血壓、高血壓腎病、高血壓腦卒中和高血壓左心室肥厚)的發(fā)生都是由內(nèi)因和外因共同作用產(chǎn)生的結(jié)果。該表征獲取方法通過基因檢測及遺傳分析(內(nèi)因)確定疾病高易感人群的患病風(fēng)險，采集疾病相關(guān)的逐漸累積的外界風(fēng)險因素(外因)，對高血壓及三種并發(fā)癥進(jìn)行全面準(zhǔn)確的綜合內(nèi)外因風(fēng)險評估。現(xiàn)代科學(xué)的發(fā)展促進(jìn)了高血壓等疾病從常規(guī)體檢向基因檢測的轉(zhuǎn)變，通過基因檢測可以深入細(xì)微之處對疾病進(jìn)行剖析，準(zhǔn)確預(yù)警未來某個生命時段是否存在發(fā)生疾病的可能性或機率，以便及早采取有效的防病措施。單位點或單基因的遺傳分析結(jié)果預(yù)警患病幾率是不充分的，預(yù)測結(jié)果也有較大偏差。因此，通過致病基因、易感基因的篩選或SNP位點的組合來預(yù)警更有優(yōu)勢?；驒z測屬于臨床醫(yī)學(xué)范疇，由醫(yī)療機構(gòu)實施“基因診斷”，診斷致病基因，挖掘病因；基因檢測也屬于疾病預(yù)防保健范疇，由非醫(yī)療的專業(yè)機構(gòu)實施檢測，檢測疾病易感基因，準(zhǔn)確預(yù)警。該表征獲取方法采用的是位點微效累積理論和主要位點決定論的遺傳分析技術(shù)，全面兼顧了疾病遺傳缺陷基因與復(fù)雜疾病顯性遺傳兩方面，既診斷這四種疾病(高血壓、高血壓腎病、高血壓腦卒中和高血壓左心室肥厚)的致病基因，又檢測它們的疾病易感基因，預(yù)警疾病風(fēng)險、提示預(yù)防疾病，從而達(dá)到防止或延緩疾病的發(fā)生、減輕疾病的嚴(yán)重程度。在國內(nèi)，從事商業(yè)化基因檢測產(chǎn)品供應(yīng)的主要是一些生物科技公司，而真正具備大規(guī)模檢測能力的公司大約有10家。他們主要集中于上海、北京、廣州等大城市，擁有芯片技術(shù)、高通量測序技術(shù)和質(zhì)譜基因檢測技術(shù)等實力，提供著包括疾病易感基因檢測、個體化用藥檢測和兒童天賦基因檢測等技術(shù)服務(wù)，少數(shù)公司推出人體全基因組測序服務(wù)。隨著未來基因健康產(chǎn)業(yè)集中度不斷加強和國家對基因健康產(chǎn)業(yè)的嚴(yán)格監(jiān)管，多數(shù)公司將被淘汰，僅有掌握核心競爭力包括整合優(yōu)勢基因檢測平臺、遺傳分析技術(shù)與疾病風(fēng)險基因預(yù)警技術(shù)、基因?qū)蛳陆】倒芾斫ㄗh技術(shù)方面的專業(yè)機構(gòu)(公司)得以發(fā)展。目前，關(guān)于高血壓及并發(fā)癥病癥預(yù)警或干預(yù)的相關(guān)專利集中于單個疾病的診斷、治療后的評估，少有復(fù)雜疾病單個SNP位點易感性綜合遺傳分析方法的報道。同時，高血壓及并發(fā)癥易感性綜合遺傳分析深入研究不多，基因健康產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化的預(yù)警或干預(yù)類產(chǎn)品單純“拷貝”歐美國家健康管理建議，都缺乏準(zhǔn)確性、系統(tǒng)性和全面性。

發(fā)明內(nèi)容
為了解決背景技術(shù)中存在的上述技術(shù)問題，本發(fā)明提供了一種獲取的表征信息準(zhǔn)確、獲取信息及時以及為后續(xù)治療工作奠定基礎(chǔ)的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法。本發(fā)明的技術(shù)解決方案是:本發(fā)明提供了一種高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法，其特殊之處在于:所述高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法包括以下步驟:I)建立高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫；

2)根據(jù)步驟I)所建立的高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫構(gòu)建個體高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)分析平臺；3)基于步驟2)所建立的分析平臺對個體的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)進(jìn)行分析；4)輸出個體的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)。上述步驟I)的具體實現(xiàn)方式是:1.1)在GWAS網(wǎng)站上初步查詢到與高血壓相關(guān)聯(lián)的基因名稱；1.2)在NCBI的Pubmed數(shù)據(jù)庫里面，篩查出與中國人高血壓相關(guān)的易感基因；1.3)查找與中國人群相關(guān)的關(guān)聯(lián)分析的結(jié)果，確定步驟1.2)中所得到的易感基因的位點；1.4)在NCBI的SNP數(shù)據(jù)庫中驗證步驟1.3)中所確定的易感基因的位點；1.5)編寫易感基因文集；所述易感基因文集包括基因基本信息、功能信息、致病信息、提示信息以及環(huán)境因素等內(nèi)容。上述步驟1.3)中與中國人群相關(guān)的關(guān)聯(lián)分析需要滿足的條件是:樣本是大樣本人群、樣本來源是中國人群、or值大于1、95%CI不包含I以及在統(tǒng)計學(xué)上呈顯著；所述大樣本人群至少包括200人。上述與高血壓相關(guān)聯(lián)的易感基因是NEDD4L、AGT、KLKl、eNOS、RGS2、ACE、ADRB2、ADDl、ZNF652、AGTRl、Renalase、KLKB1、GRK4、TH、GPX4、CDKN2B_ASl、9p21、eNOS、TGF-β 1、⑶F15、ANP以及CYP11B2 ;所述與高血壓相關(guān)聯(lián)的易感基因的位點是rs4149601、rs699、rs5517、rsl799983、rsl042713、rs4961、rsl6948048、rs4253325、rsl801058、rs2070762、rs713041、rs2383207、rsl0757278、rs4808793、rs4343、rs5186、rs5051、rs5050、rs2576178、rsl799998、rsl800471、rs34717272、rsl3447447。上述步驟2)中平臺的構(gòu)建過程是:2.1)獲取步驟I)所建立的高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫中的疾病位點SGR以及疾病群體CGR值；2.2)根據(jù)步驟2.1)所得到的疾病位點SGR值以及疾病群體CGR值獲取個體疾病CGR 值； 2.3)根據(jù)步驟2.2)所得到的個體疾病CGR值建立高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)。上述步驟2.1)的具體實現(xiàn)方式是:疾病位點SGR數(shù)據(jù)的計算方式是:疾病的檢測位點有η個，位點I有三種基因型:AA、AB、BB ;所述三種基因型對應(yīng)發(fā)病風(fēng)險分別為orll、orl2、orl3 ;所述三種基因型對應(yīng)基因型頻率分別為frell、frel2、frel3 ;基因型為AA的SGR值:SGRl=Orll / (orll*frell+or21*fre21+or31*fre31)，SGR2=orl2/ (orl2*frel2+or22*fre22+or32*fre32),以此類推，SGRn=orln (orln*freln+or2n*fre2n+or3n*fre3n)該疾病的群體(綜合)發(fā)病風(fēng)險:CGR=SGR1*SGR2*......*SGRn。上述步驟2.2)中個體疾病CGR值的計算方式是:SGRn=基因型NN的or值/ (位點η的or*fre總和)。CGR=SGRa X SGRb X......X SGRn。上述步驟3)的具體實現(xiàn)方式是:3.1)采集離體血液樣本，并通過分子生物學(xué)手段獲取該離體血液樣本的個體基因檢測數(shù)據(jù)；3.2)將步驟3.1)所得到的個體基因檢測數(shù)據(jù)逐個與高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對，若對比一致，則進(jìn)行步驟3.3);若不一致，則退出表征參數(shù)的獲取過程，重復(fù)進(jìn)行步驟3.1)；3.3)根據(jù)步驟2)所建立的分析平臺計算各種與高血壓相關(guān)聯(lián)疾病的CGR值；3.4)根據(jù)高風(fēng)險判斷標(biāo)準(zhǔn)和步驟3.3)所計算出來的CGR值，得到個體高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)。本發(fā)明的優(yōu)點是:本發(fā)明通過建立基因數(shù)據(jù)庫、建立表征參數(shù)檢測信息平臺以及輸出表征參數(shù)信息等方式構(gòu)建了一種高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法。對于高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫而言，該數(shù)據(jù)庫整合了高血壓、高血壓腎病、高血壓腦卒中和高血壓左心室肥厚最新的24個易感基因27個位點。以目前的科技發(fā)展而言，基因檢測能夠檢測出這些遺傳的易感基因型，檢測準(zhǔn)確率達(dá)到99.9%。雖然將來高血壓及并發(fā)癥的易感基因會不斷發(fā)掘，但是高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫會不斷更新，產(chǎn)品會不斷進(jìn)行升級。第二，本發(fā)明所采用的表征參數(shù)檢測信息平臺(并發(fā)癥分析平臺)可以高效整合、實現(xiàn)系統(tǒng)自動化處理基因檢測數(shù)據(jù)，該平臺引入了 CGR (Combined Genetic Risk,綜合發(fā)病風(fēng)險指數(shù))值為主的疾病風(fēng)險評估模型，依據(jù)疾病易感基因位點檢測結(jié)果，對高血壓及并發(fā)癥做了疾病遺傳風(fēng)險分析和高風(fēng)險疾病深度遺傳分析。第三，本發(fā)明所建立的基因文集(基因信息文庫)，在高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫的指導(dǎo)下，聞血壓及并發(fā)癥的每一種疾病易感基因都編與了基因文集，并信息化導(dǎo)入并發(fā)癥分析平臺。在并發(fā)癥分析平臺上，針對相關(guān)高風(fēng)險疾病深度遺傳分析，分析結(jié)果都會有疾病易感基因重點提示。第四，輸出高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)，該表征參數(shù)是基因?qū)蛳碌慕】倒芾斫ㄗh，高血壓及并發(fā)癥基因檢測是主動預(yù)防疾病的發(fā)生。了解個體在不同疾病上的發(fā)生傾向，并以基因檢測結(jié)果為依據(jù)，進(jìn)行全面的生活調(diào)整或干預(yù)，以期降低風(fēng)險延緩疾病發(fā)生、發(fā)展。高血壓及并發(fā)癥的發(fā)生是基因、環(huán)境共同作用的結(jié)果，若檢測出某種疾病的風(fēng)險，那么基因?qū)蛳碌慕】倒芾斫ㄗh可以針對性的進(jìn)行個體干預(yù)，避開不良的生活方式和環(huán)境因素，做到真正的預(yù)防疾病?；诒景l(fā)明的原理，可以預(yù)測高血壓患者高血壓并發(fā)癥的發(fā)生傾向，延緩疾病的發(fā)生和發(fā)展。本發(fā)明針對以上不足，該表征獲取方法結(jié)合個人家族病史，以權(quán)威的中國人群遺傳基因數(shù)據(jù)庫為基礎(chǔ)，組合了高血壓及三種并發(fā)癥24個易感基因上27個位點，采用有效的遺傳分析模型——CGR分析模型進(jìn)行遺傳分析[P];轉(zhuǎn)化產(chǎn)品結(jié)合了遺傳分析和健康管理，可以早期預(yù)警高血壓及并發(fā)癥重大慢性疾病的轉(zhuǎn)歸方向，指導(dǎo)人們有針對性地進(jìn)行疾病預(yù)防、改善健康狀況、提高生活質(zhì)量。
具體實施例方式本發(fā)明提供了一種高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法，該高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法包括以下步驟:I)建立高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫:1.1)在GWAS網(wǎng)站上初步查詢到與高血壓相關(guān)聯(lián)的基因名稱；1.2)在NCBI的Pubmed數(shù)據(jù)庫里面，篩查出與中國人高血壓相關(guān)的易感基因；1.3)查找與中國人群相關(guān)的關(guān)聯(lián)分析的結(jié)果，確定步驟1.2)中所得到的易感基因的位點；與中國人群相關(guān)的關(guān)聯(lián)分析需要滿足的條件是:樣本是大樣本人群、樣本來源是中國人群、or值大于1、95%CI不包含I以及在統(tǒng)計學(xué)上呈顯著；所述大樣本人群至少包括200 人。1.4)在NCBI的SNP數(shù)據(jù)庫中驗證步驟1.3)中所確定的易感基因的位點；1.5)編寫易感基因文集；所述易感基因文集包括基因基本信息、功能信息、致病信息、提示信息以及環(huán)境因素等內(nèi)容。2)根據(jù)步驟I)所建立的高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫構(gòu)建個體高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)分析平臺:2.1)獲取步驟I)所建立的高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫中的疾病位點SGR數(shù)據(jù)以及疾病群體CGR數(shù)據(jù)；疾病位點SGR數(shù)據(jù)的計算方式是:疾病的檢測位 點有η個，位點I有三種基因型:AA、AB、BB ;所述三種基因型對應(yīng)發(fā)病風(fēng)險分別為orll、orl2、orl3 ;所述三種基因型對應(yīng)基因型頻率分別為frell、frel2、frel3;基因型為AA的SGR值:SGRl=Orll / (orll*frell+or21*fre21+or31*fre31)，SGR2=orl2/ (orl2*frel2+or22*fre22+or32*fre32),以此類推，SGRn=orln (orln*freln+or2n*fre2n+or3n*fre3n)該疾病的群體(綜合)發(fā)病風(fēng)險:CGR=SGR1*SGR2*......*SGRn。2.2)根據(jù)步驟2.1)所得到的疾病位點gr數(shù)據(jù)以及疾病群體gr數(shù)據(jù)獲取個體疾病CGR值:其中:個體疾病CGR值的計算方式是:SGRn=基因型NN的or值/ (位點η的or*fre總和)。CGR=SGRa X SGRb X......X SGRn。2.3)根據(jù)步驟2.2)所得到的個體疾病CGR值建立高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)。3)基于步驟2)所建立的分析平臺對個體的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)進(jìn)行分析:3.1)采集離體血液樣本，并通過分子生物學(xué)手段獲取該離體血液樣本的個體基因檢測數(shù)據(jù)；3.2)將步驟3.1)所得到的個體基因檢測數(shù)據(jù)逐個與高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對，若對比一致，則進(jìn)行步驟3.3);若不一致，則退出表征參數(shù)的獲取過程，重復(fù)進(jìn)行步驟3.1)；3.3)根據(jù)步驟2)所建立的分析平臺計算各種與高血壓相關(guān)聯(lián)疾病的CGR值；3.4)根據(jù)高風(fēng)險判斷標(biāo)準(zhǔn)和步驟3.3)所計算出來的CGR值，得到個體高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)。4)輸出個體的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)。與高血壓相關(guān)聯(lián)的易感基因是NEDD4L、AGT、KLK1、eNOS、RGS2、ACE、ADRB2、ADD1、ZNF652、AGTRl、Renalase、KLKBl、GRK4、TH、GPX4、CDKN2B-ASl、9p21、eN0S、TGF-P 1、⑶F15、ANP以及CYP11B2 ;所述與高血壓相關(guān)聯(lián)的易感基因的位點是rs4149601、rs699、rs5517、rsl799983、rsl042713、rs4961、rsl6948048、rs4253325、rsl801058、rs2070762、rs713041、rs2383207、rsl0757278、rs4808793、rs4343、rs5186、rs5051、rs5050、rs2576178、rsl799998、rsl800471、rs34717272、rsl3447447。以上與高血壓相關(guān)聯(lián)的易感基因的位點是選自以下單個SNP組成組:rs4149601(AG)其定義風(fēng)險等位基因A;rs699 (CT)其定義風(fēng)險等位基因CC ;rs5517 (AG)其定義風(fēng)險等位基因AA ；rsl799983 (GT)其定義風(fēng)險等位基因T ；rsl042713 (AG)其定義風(fēng)險等位基因G;rs4961 (GT)其定義風(fēng)險等位基因TT ;rsl6948048 (AG)其定義風(fēng)險等位基因AA ;rs4253325(AG)其定義風(fēng)險等位基因A ;rsl801058(CT)其定義風(fēng)險等位基因CC ；rs2070762(CT)其定義風(fēng)險等位基因C ;rs713041 (CT)其定義風(fēng)險等位基因C ;rs2383207 (AG)其定義風(fēng)險等位基因G ；rsl0757278 (AG)其定義風(fēng)險等位基因GG ；rs4808793 (CG)其定義風(fēng)險等位基因CC ；rs4343 (AG)其定乂風(fēng)險等位基因A ；rs5186 (AC)其定乂風(fēng)險等位基因C ；rs5051 (CT)其定義風(fēng)險等位基因CC ;rs5050 (GT)其定義風(fēng)險等位基因GG ;rs2576178(CT)其定義風(fēng)險等位 基因G ;rsl799998 (CT)其定義風(fēng)險等位基因CC ;rsl800471 (CG)其定義風(fēng)險等位基因C ；rs34717272 (ID)其定義風(fēng)險等位基因DD ；rsl3447447 (ID)其定義風(fēng)險等位基因DD。
本發(fā)明采集了高血壓及并發(fā)癥24個基因27個位點的基因檢測，與北京華大中生科技發(fā)展有限公司合作，采用國際上先進(jìn)的ABI3730測序和MassARRAY技術(shù)平臺。ABI3730測序技術(shù)平臺采用毛細(xì)管電泳技術(shù)替代傳統(tǒng)的聚丙烯酰胺平板電泳，精準(zhǔn)的測序質(zhì)量、專業(yè)的生物信息分析，保證樣品每個多態(tài)性位點的精確定位；MassARRAY技術(shù)平臺結(jié)合PCR的高靈敏度和質(zhì)譜的高精密度，自動化分析基因變異。ABI3730測序和MassARRAY兩種自動化平臺極大的降低了人工操作失誤的幾率，完美整合保證基因檢測的高質(zhì)量、高效率。高血壓及并發(fā)癥基因檢測遺傳分析服務(wù)類產(chǎn)品建立了高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫，該數(shù)據(jù)庫整合了中國漢族人高血壓及三種并發(fā)癥(高血壓腎病、高血壓腦卒中和高血壓左心室肥厚)的24個基因27個位點。在《Hypertension Research》、《Journalof Hypertension〉〉等權(quán)威雜志的〈〈The C718T polymorphism in the3> -untranslatedregionof glutathione peroxidase_4gene is a predictor ofcerebral strokein patients with essential hypertension》、《Genetic polymorphisms ofthe renin - angiotensin - aldosterone system and renal insufficiency inessentialhypertension))等文章中，分析了這些多態(tài)性位點與相關(guān)疾病的關(guān)聯(lián)性，證實這些位點是致病位點，與疾病強烈關(guān)聯(lián)。并發(fā)癥分析平臺是高血壓及并發(fā)癥綜合預(yù)警產(chǎn)品的一個獨立的遺傳分析平臺，該平臺可以快速整合、系統(tǒng)處理基因檢測數(shù)據(jù)，自動化導(dǎo)出分析結(jié)果，方便進(jìn)一步深度遺傳分析。本發(fā)明涉及高血壓及并發(fā)癥(高血壓腎病、高血壓腦卒中和高血壓左心室肥厚)的24個基因27個位點的基因檢測，以及并發(fā)癥分析平臺，最后，產(chǎn)品針對基因檢測和遺傳分析結(jié)果，給出基因?qū)蛳碌膫€性化健康管理建議。具體而言，本發(fā)明的原理是:①易感基因檢測在ABI3730測序和MassARRAY技術(shù)平臺上綜合檢測了高血壓及其三種并發(fā)癥相關(guān)的24個基因上27個位點，并依據(jù)檢測結(jié)果對基因位點進(jìn)行基因分型。②疾病遺傳風(fēng)險分析采用疾病風(fēng)險評估模型，結(jié)合高血壓患病史和家族病史，綜合判斷疾病遺傳風(fēng)險。③高風(fēng)險疾病深度遺傳分析從基因檢測位點分析、綜合發(fā)病風(fēng)險分布、群體發(fā)病風(fēng)險、個體發(fā)病風(fēng)險和風(fēng)險 基因相關(guān)危險因素等方面對高血壓疾病進(jìn)行了深度遺傳分析，從基因檢測位點方面對高血壓的三種并發(fā)癥進(jìn)行了深度遺傳分析，詳細(xì)闡釋了導(dǎo)致高血壓腎病和聞血壓二種并發(fā)癥風(fēng)險增聞的遺傳基因和與突變遺傳基因相關(guān)的危險因素。④聞風(fēng)險疾病內(nèi)外因綜合評估高血壓及并發(fā)癥都是遺傳因素(內(nèi)因)和生活方式與環(huán)境危險因素(外因)的共同作用的結(jié)果。本對高血壓及并發(fā)癥風(fēng)險狀態(tài)進(jìn)行內(nèi)外因綜合評估，找到與疾病相關(guān)的遺傳因素和生活方式與環(huán)境危險因素。⑤基因?qū)蛳碌膫€性化健康管理建議通過基因檢測、預(yù)測分析，根據(jù)個體的基因組信息和個體差異性(年齡、膳食構(gòu)成、運動等)有針對性地制定個性化健康管理。比如，可以進(jìn)行有針對性的營養(yǎng)保健，選擇適合自己遺傳體質(zhì)的保健品；可以對日常生活等進(jìn)行科學(xué)指導(dǎo)，制定適應(yīng)每個人不同特點的保健方案；同時可以根據(jù)基因組信息對重大疾病的預(yù)防進(jìn)行指導(dǎo)。表I是本高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫的24個易感基因上27個檢測位點。
權(quán)利要求
1.一種高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法，其特征在于:所述高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法包括以下步驟: 1)建立高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫； 2)根據(jù)步驟I)所建立的高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫構(gòu)建個體高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)分析平臺； 3)基于步驟2)所建立的分析平臺對個體的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)進(jìn)行分析； 4)輸出個體的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法，其特征在于:所述步驟I)的具體實現(xiàn)方式是: 1.1)在GWAS網(wǎng)站上初步查詢到與高血壓相關(guān)聯(lián)的基因名稱； 1.2)在NCBI的Pubmed數(shù)據(jù)庫里面，篩查出與中國人高血壓相關(guān)的易感基因； 1.3)查找與中國人群相關(guān)的關(guān)聯(lián)分析的結(jié)果，確定步驟1.2)中所得到的易感基因的位占.1.4)在NCBI的SNP數(shù)據(jù)庫中驗證步驟1.3)中所確定的易感基因的位點； 1.5)編寫易感基因文集；所述易感基因文集包括基因基本信息、功能信息、致病信息、提示信息以及環(huán)境因素等內(nèi)容。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法，其特征在于:所述步驟1.3)中與中國人群相關(guān)的關(guān)聯(lián)分析需要滿足的條件是:樣本是大樣本人群、樣本來源是中國人群、or值大于1、95%CI不包含I以及在統(tǒng)計學(xué)上呈顯著；所述大樣本人群至少包括200人。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法，其特征在于:所述與高血壓相關(guān)聯(lián)的易感基因是 NEDD4L、AGT、KLKl、eNOS、RGS2、ACE、ADRB2、ADDl、ZNF652、AGTRU Renalase、KLKBU GRK4、TH、GPX4、CDKN2B_ASl、9p21、eNOS、TGF-β 1、⑶F15、ANP以及CYP11B2 ;所述與高血壓相關(guān)聯(lián)的易感基因的位點是rs4149601、rs699、rs5517、rsl799983、rsl042713、rs4961、rsl6948048、rs4253325、rsl801058、rs2070762、rs713041、rs2383207、rsl0757278、rs4808793、rs4343、rs5186、rs5051、rs5050、rs2576178、rsl799998、rsl800471、rs34717272、rsl3447447。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法，其特征在于:所述步驟2)中平臺的構(gòu)建過程是: 2.1)獲取步驟I)所建立的高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫中的疾病位點SGR以及疾病群體CGR值； 2.2)根據(jù)步驟2.1)所得到的疾病位點SGR值以及疾病群體CGR值獲取個體疾病CGR值； 2.3)根據(jù)步驟2.2)所得到的個體疾病CGR值建立高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法，其特征在于:所述步驟2.1)的具體實現(xiàn)方式是: 疾病位點SGR數(shù)據(jù)的計算方式是: 疾病的檢測位點有η個，位點I有三種基因型:ΑΑ、ΑΒ、ΒΒ ;所述三種基因型對應(yīng)發(fā)病風(fēng)險分別為orll、orl2、orl3 ;所述三種基因型對應(yīng)基因型頻率分別為frell、frel2、frel3 ;基因型為AA的SGR值:SGRl=Orll/(orll*frell+or21*fre21+or31*fre31)，SGR2=orl2/(orl2*frel2+or22*fre22+or32*fre32),以此類推，SGRn=orln (orln*freln+or2n*fre2n+or3n*fre3n)該疾病的群體(綜合)發(fā)病風(fēng)險:CGR=SGR1*SGR2*......*SGRn。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法，其特征在于:所述步驟2.2)中個體疾病CGR值的計算方式是: SGRn=基因型NN的or值/ (位點η的or*fre總和)； CGR=SGRa X SGRb X......X SGRn。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法，其特征在于:所述步驟3)的具體實現(xiàn)方式是: .3.1)采集離體血液樣本,并通過分子生物學(xué)手段獲取該離體血液樣本的個體基因檢測數(shù)據(jù)； .3.2)將步驟3.1)所得到的個體基因檢測數(shù)據(jù)逐個與高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對，若對比一致，則進(jìn)行步驟3.3);若不一致，則退出表征參數(shù)的獲取過程，重復(fù)進(jìn)行步驟3.1)； .3.3)根據(jù)步驟2)所建立的分析平臺計算各種與高血壓相關(guān)聯(lián)疾病的CGR值； .3.4)根據(jù)高風(fēng)險判斷標(biāo)準(zhǔn)和步驟3.3)所計算出來的CGR值，得到個體高血壓及并發(fā)癥的表征參 數(shù)。
全文摘要
本發(fā)明涉及一種高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法，該方法包括以下步驟1)建立高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫；2)根據(jù)步驟1)所建立的高血壓及并發(fā)癥易感基因數(shù)據(jù)庫構(gòu)建個體高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)分析平臺；3)基于步驟2)所建立的分析平臺對個體的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)進(jìn)行分析；4)輸出個體的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)。本發(fā)明提供了一種獲取的表征信息準(zhǔn)確、獲取信息及時以及為后續(xù)治療工作奠定基礎(chǔ)的高血壓及并發(fā)癥的表征參數(shù)的獲取方法。
文檔編號G06F19/00GK103226667SQ20131018530
公開日2013年7月31日 申請日期2013年5月17日 優(yōu)先權(quán)日2013年5月17日
發(fā)明者楊進(jìn), 董靖, 徐博特, 賀紅娟, 蔡丹, 張偉, 許嘉玲, 李林, 趙東 申請人:西安時代基因健康科技有限公司