Lammps的計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)方法和裝置制造方法
【專(zhuān)利摘要】本發(fā)明公開(kāi)了一種LAMMPS的計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)方法和裝置，其中，該實(shí)現(xiàn)方法包括：獲取用戶輸入的計(jì)算指令；對(duì)計(jì)算指令進(jìn)行解析，確定計(jì)算的類(lèi)型以及計(jì)算指令中包含的計(jì)算參數(shù)；將計(jì)算參數(shù)代入到預(yù)先配置的與計(jì)算類(lèi)型對(duì)應(yīng)的計(jì)算命令語(yǔ)句中，并執(zhí)行該計(jì)算命令語(yǔ)句。借助于本發(fā)明的技術(shù)方案，能夠?qū)崿F(xiàn)LAMMPS的計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)過(guò)程無(wú)需通過(guò)命令行，只通過(guò)基于圖形界面的簡(jiǎn)單的操作，就能完成計(jì)算任務(wù)，大大降低操作難度，提高執(zhí)行效率，降低出錯(cuò)概率。
【專(zhuān)利說(shuō)明】LA圖PS的計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)方法和裝置
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及科學(xué)計(jì)算領(lǐng)域，并且特別地，涉及一種LAMMPS的計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)方法和裝置。
【背景技術(shù)】
[0002]LAMMPS (Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一款大尺度原子分子大規(guī)模并行模擬程序，主要用于分子動(dòng)力學(xué)相關(guān)的一些計(jì)算和模擬工作，它包含各種勢(shì)，可以用于模擬軟物質(zhì)(生物分子、多聚體)和固體(金屬、半導(dǎo)體)，以及粗?；惴ǖ哪M，在高性能計(jì)算領(lǐng)域，用戶使用它來(lái)做大規(guī)模分析動(dòng)力學(xué)模擬，并行處理獲得非常好的效果。
[0003]在傳統(tǒng)的高性能計(jì)算集群環(huán)境中，用戶要運(yùn)行LAMMPS計(jì)算程序通常需要使用遠(yuǎn)程字符終端在命令行環(huán)境下執(zhí)行一系列操作，一般有以下幾個(gè)流程:
[0004]準(zhǔn)備好LAMMPS計(jì)算程序的可執(zhí)行文件、輸入文件、數(shù)據(jù)文件等，可執(zhí)行文件通常需要放置在全局共享存儲(chǔ)中，讓用戶使用；而輸入文件、數(shù)據(jù)文件等特定任務(wù)所需的文件，由用戶使用文件傳輸工具向集群上傳，一般情況下，還需要做一些前處理操作，如文件編輯和修改。
[0005]明確LAMMPS執(zhí)行的完整命令，確定運(yùn)行計(jì)算程序需要的進(jìn)程數(shù)，以及在哪些節(jié)點(diǎn)上運(yùn)行，LAMMPS執(zhí)行時(shí)的附件參數(shù)等。
[0006]程序運(yùn)行完成后，用戶執(zhí)行后處理操作，查看計(jì)算結(jié)果，再使用FTP、SFTP等文件傳輸工具獲得結(jié)果文件。
[0007]直接運(yùn)行LAMMPS計(jì)算程序過(guò)程復(fù)雜，在實(shí)際情況中，用戶還需要熟悉高性能計(jì)算集群環(huán)境，安裝作業(yè)調(diào)度軟件，這樣用戶才能通過(guò)作業(yè)調(diào)度軟件提供的接口，編寫(xiě)一個(gè)作業(yè)調(diào)度腳本，在腳本中明確計(jì)算資源，再通過(guò)這個(gè)腳本提交任務(wù)，由作業(yè)調(diào)度軟件來(lái)整體監(jiān)控管理資源的分配、任務(wù)的發(fā)起和執(zhí)行。
[0008]上面介紹了在傳統(tǒng)的高性能計(jì)算集群環(huán)境中，用戶運(yùn)行LAMMPS計(jì)算程序的基本流程，這些流程通常需要在遠(yuǎn)程字符終端下，通過(guò)命令行的方式來(lái)實(shí)現(xiàn)，對(duì)于廣大的普通用戶來(lái)說(shuō)，操作難度大，執(zhí)行效率低，出錯(cuò)概率大。
[0009]傳統(tǒng)執(zhí)行方式的弊端主要表現(xiàn)在:
[0010]使用難度非常大。想要順利提交一個(gè)LAMMPS計(jì)算任務(wù)，用戶往往需要非常熟悉很多與其專(zhuān)業(yè)背景無(wú)關(guān)的很多知識(shí)和工具，比如Linux操作系統(tǒng)基本操作、Shell腳本語(yǔ)言、作業(yè)調(diào)度軟件的使用等等，這些知識(shí)或工具的學(xué)習(xí)需要花費(fèi)很長(zhǎng)的時(shí)間，對(duì)廣大普通用戶來(lái)說(shuō)使用代價(jià)非常巨大。
[0011]執(zhí)行效率低。想要順利提交一個(gè)LAMMPS計(jì)算任務(wù)，需要執(zhí)行多個(gè)流程，需要使用一些專(zhuān)業(yè)工具，需要在命令行環(huán)境執(zhí)行復(fù)雜繁瑣的操作，從而導(dǎo)致并行計(jì)算任務(wù)的提交費(fèi)時(shí)費(fèi)力，執(zhí)行效率低下。
[0012]出錯(cuò)概率大。對(duì)于大部分普通用戶來(lái)說(shuō)，在命令行環(huán)境執(zhí)行復(fù)雜繁瑣的操作，出現(xiàn)人為操作失誤的概率很大，特別是對(duì)于操作流程不熟悉的用戶，在執(zhí)行的各個(gè)環(huán)節(jié)均容易遇到問(wèn)題。
[0013]另外，對(duì)于高性能計(jì)算集群的管理員來(lái)說(shuō)，對(duì)普通用戶開(kāi)放命令行終端，也存在安全性的風(fēng)險(xiǎn)，用戶的誤操作可能會(huì)影響系統(tǒng)的穩(wěn)定運(yùn)行。
[0014]在現(xiàn)有技術(shù)中，雖然存在一些商業(yè)計(jì)算軟件提供自己的并行計(jì)算任務(wù)通過(guò)圖形化提交界面進(jìn)行指令提交，但都是針對(duì)個(gè)別軟件，沒(méi)有普適性，并且，還需要專(zhuān)門(mén)的客戶端軟件配合完成，與作業(yè)調(diào)度軟件的結(jié)合無(wú)法實(shí)現(xiàn)或存在不同程度的問(wèn)題。
[0015]針對(duì)相關(guān)技術(shù)中用戶運(yùn)行LAMMPS計(jì)算程序時(shí)需要在遠(yuǎn)程字符終端下通過(guò)命令行的方式來(lái)實(shí)現(xiàn)，操作難度大，執(zhí)行效率低，出錯(cuò)概率大的問(wèn)題，目前尚未提出有效的解決方案。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0016]針對(duì)相關(guān)技術(shù)中用戶運(yùn)行LAMMPS計(jì)算程序時(shí)需要在遠(yuǎn)程字符終端下通過(guò)命令行的方式來(lái)實(shí)現(xiàn)，操作難度大，執(zhí)行效率低，出錯(cuò)概率大的問(wèn)題，本發(fā)明提出一種LAMMPS的計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)方法和裝置，能夠使用戶無(wú)需通過(guò)命令行的方式，只通過(guò)簡(jiǎn)單的操作輸入計(jì)算指令，就能得到運(yùn)算結(jié)果。
[0017]本發(fā)明的技術(shù)方案是這樣實(shí)現(xiàn)的:
[0018]根據(jù)本發(fā)明的技術(shù)方案，提供了一種LAMMPS的計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)方法，該實(shí)現(xiàn)方法包括:
[0019]獲取用戶輸入的計(jì)算指令；
[0020]對(duì)計(jì)算指令進(jìn)行解析，確定計(jì)算的類(lèi)型以及計(jì)算指令中包含的計(jì)算參數(shù)；
[0021]將計(jì)算參數(shù)代入到預(yù)先配置的與計(jì)算類(lèi)型對(duì)應(yīng)的計(jì)算命令語(yǔ)句中，并執(zhí)行該計(jì)算命令語(yǔ)句。
[0022]此外，在執(zhí)行代入計(jì)算參數(shù)的語(yǔ)句之前，該實(shí)現(xiàn)方法進(jìn)一步包括:
[0023]判斷用戶輸入的計(jì)算指令是否合法，并在判斷的結(jié)果為否的情況下，禁止執(zhí)行計(jì)算命令語(yǔ)句并進(jìn)行提示；
[0024]其中，判斷用戶輸入的計(jì)算指令是否合法的條件包括以下至少之一:
[0025]計(jì)算指令的格式、計(jì)算指令中計(jì)算參數(shù)的范圍。
[0026]此外，在執(zhí)行代入計(jì)算參數(shù)的語(yǔ)句之前，該實(shí)現(xiàn)方法進(jìn)一步包括:
[0027]獲取用戶輸入的資源請(qǐng)求指令，對(duì)資源請(qǐng)求指令進(jìn)行解析，得到資源參數(shù)，其中，資源參數(shù)用于表示用戶所請(qǐng)求的資源量；
[0028]將資源參數(shù)代入到預(yù)先配置的計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句，并執(zhí)行該計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句。
[0029]此外，在執(zhí)行計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句之前，該實(shí)現(xiàn)方法進(jìn)一步包括:
[0030]判斷用戶輸入的資源請(qǐng)求指令是否合法，并在判斷結(jié)果為否的情況下，禁止執(zhí)行計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句并進(jìn)行提示；
[0031]其中，判斷用戶輸入的資源請(qǐng)求指令是否合法的條件包括以下至少之一:
[0032]計(jì)算資源請(qǐng)求指令的格式、用戶所請(qǐng)求的資源量。
[0033]其中，計(jì)算資源包括以下至少之一:
[0034]計(jì)算節(jié)點(diǎn)、CPU核數(shù)、計(jì)算時(shí)長(zhǎng)、計(jì)算結(jié)果的存儲(chǔ)路徑。[0035]此外，獲取用戶輸入的計(jì)算指令包括:
[0036]通過(guò)預(yù)先提供圖形界面，獲取用戶在圖形界面中的參數(shù)輸入框內(nèi)輸入的計(jì)算參數(shù)、和/或根據(jù)用戶在圖形界面中的路徑輸入框內(nèi)輸入的存儲(chǔ)路徑獲取包含計(jì)算參數(shù)的文件并確定該文件中的輸入?yún)?shù)。
[0037]其中，圖形界面包括web界面。
[0038]根據(jù)本發(fā)明的另一方面，提供了一種LAMMPS的計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)裝置，該實(shí)現(xiàn)裝置包括:
[0039]第一獲取模塊，用于獲取用戶輸入的計(jì)算指令；
[0040]解析模塊，用于對(duì)計(jì)算指令進(jìn)行解析，確定計(jì)算的類(lèi)型以及計(jì)算指令中包含的計(jì)算參數(shù)；
[0041]執(zhí)行模塊，用于將計(jì)算參數(shù)代入到預(yù)先配置的與計(jì)算類(lèi)型對(duì)應(yīng)的計(jì)算命令語(yǔ)句中，并執(zhí)行該計(jì)算命令語(yǔ)句。
[0042]此外，該實(shí)現(xiàn)裝置進(jìn)一步包括:
[0043]判斷模塊，用于在執(zhí)行代入計(jì)算參數(shù)的語(yǔ)句之前，判斷用戶輸入的計(jì)算指令是否合法，并在判斷的結(jié)果為否的情況下，禁止執(zhí)行計(jì)算命令語(yǔ)句并進(jìn)行提示；
[0044]其中，判斷用戶輸入的計(jì)算指令是否合法的條件包括以下至少之一:
[0045]計(jì)算指令的格式、計(jì)算指令中計(jì)算參數(shù)的范圍。
[0046]此外，該實(shí)現(xiàn)裝置進(jìn)一步包括:
[0047]第二獲取模塊，用于在執(zhí)行代入計(jì)算參數(shù)的語(yǔ)句之前，獲取用戶輸入的資源請(qǐng)求指令，對(duì)資源請(qǐng)求指令進(jìn)行解析，得到資源參數(shù)，其中，資源參數(shù)用于表示用戶所請(qǐng)求的資
源量；
[0048]第二執(zhí)行模塊，用于將資源參數(shù)代入到預(yù)先配置的計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句，并執(zhí)行該計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句。
[0049]本發(fā)明通過(guò)從用戶輸入的計(jì)算指令中解析得到的計(jì)算參數(shù)和計(jì)算類(lèi)型，并將計(jì)算參數(shù)代入到預(yù)先配置好的與該計(jì)算類(lèi)型相對(duì)應(yīng)的計(jì)算命令語(yǔ)句，并執(zhí)行該計(jì)算命令語(yǔ)句，能夠使用戶只需輸入簡(jiǎn)單的計(jì)算指令，無(wú)需進(jìn)行復(fù)雜的命令行操作，就能完成計(jì)算，降低了用戶使用LAMMPS計(jì)算程序的難度，提高了執(zhí)行效率，降低了出錯(cuò)概率。
【專(zhuān)利附圖】

【附圖說(shuō)明】
[0050]為了更清楚地說(shuō)明本發(fā)明實(shí)施例或現(xiàn)有技術(shù)中的技術(shù)方案，下面將對(duì)實(shí)施例中所需要使用的附圖作簡(jiǎn)單地介紹，顯而易見(jiàn)地，下面描述中的附圖僅僅是本發(fā)明的一些實(shí)施例，對(duì)于本領(lǐng)域普通技術(shù)人員來(lái)講，在不付出創(chuàng)造性勞動(dòng)的前提下，還可以根據(jù)這些附圖獲得其他的附圖。
[0051]圖1是根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例的LAMMPS的計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)方法流程圖；
[0052]圖2是根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例的LAMMPS的計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)裝置框圖。
【具體實(shí)施方式】
[0053]下面將結(jié)合本發(fā)明實(shí)施例中的附圖，對(duì)本發(fā)明實(shí)施例中的技術(shù)方案進(jìn)行清楚、完整地描述，顯然，所描述的實(shí)施例僅僅是本發(fā)明一部分實(shí)施例，而不是全部的實(shí)施例?；诒景l(fā)明中的實(shí)施例，本領(lǐng)域普通技術(shù)人員所獲得的所有其他實(shí)施例，都屬于本發(fā)明保護(hù)的范圍。
[0054]根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，提供了一種LAMMPS的計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)方法。
[0055]如圖1所示，該實(shí)現(xiàn)方法包括:
[0056]步驟S101，獲取用戶輸入的計(jì)算指令；
[0057]步驟S103，對(duì)計(jì)算指令進(jìn)行解析，確定計(jì)算的類(lèi)型以及計(jì)算指令中包含的計(jì)算參數(shù)；
[0058]步驟S105，將計(jì)算參數(shù)代入到預(yù)先配置的與計(jì)算類(lèi)型對(duì)應(yīng)的計(jì)算命令語(yǔ)句中，并執(zhí)行該計(jì)算命令語(yǔ)句。
[0059]此外，在執(zhí)行代入計(jì)算參數(shù)的語(yǔ)句之前，該實(shí)現(xiàn)方法進(jìn)一步包括:
[0060]判斷用戶輸入的計(jì)算指令是否合法，并在判斷的結(jié)果為否的情況下，禁止執(zhí)行計(jì)算命令語(yǔ)句并進(jìn)行提示；
[0061]其中，判斷用戶輸入的計(jì)算指令是否合法的條件包括以下至少之一:
[0062]計(jì)算指令的格式、計(jì)算指令中計(jì)算參數(shù)的范圍。
[0063]此外，在執(zhí)行代入計(jì)算參數(shù)的語(yǔ)句之前，該實(shí)現(xiàn)方法進(jìn)一步包括:
[0064]獲取用戶輸入的資源請(qǐng)求指令，對(duì)資源請(qǐng)求指令進(jìn)行解析，得到資源參數(shù)，其中，資源參數(shù)用于表示用戶所請(qǐng)求的資源量；
[0065]將資源參數(shù)代入到預(yù)先配置的計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句，并執(zhí)行該計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句。
[0066]此外，在執(zhí)行計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句之前，該實(shí)現(xiàn)方法進(jìn)一步包括:
[0067]判斷用戶輸入的資源請(qǐng)求指令是否合法，并在判斷結(jié)果為否的情況下，禁止執(zhí)行計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句并進(jìn)行提示；
[0068]其中，判斷用戶輸入的資源請(qǐng)求指令是否合法的條件包括以下至少之一:
[0069]計(jì)算資源請(qǐng)求指令的格式、用戶所請(qǐng)求的資源量。
[0070]其中，計(jì)算資源包括以下至少之一:
[0071]計(jì)算節(jié)點(diǎn)、CPU核數(shù)、計(jì)算時(shí)長(zhǎng)、計(jì)算結(jié)果的存儲(chǔ)路徑。
[0072]此外，獲取用戶輸入的計(jì)算指令包括:
[0073]通過(guò)預(yù)先提供圖形界面，獲取用戶在圖形界面中的參數(shù)輸入框內(nèi)輸入的計(jì)算參數(shù)、和/或根據(jù)用戶在圖形界面中的路徑輸入框內(nèi)輸入的存儲(chǔ)路徑獲取包含計(jì)算參數(shù)的文件并確定該文件中的輸入?yún)?shù)。
[0074]其中，圖形界面包括web界面。
[0075]根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，還提供了一種LAMMPS的計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)裝置。
[0076]如圖2所示，該實(shí)現(xiàn)裝置包括:
[0077]第一獲取模塊21，用于獲取用戶輸入的計(jì)算指令；
[0078]解析模塊22，用于對(duì)計(jì)算指令進(jìn)行解析，確定計(jì)算的類(lèi)型以及計(jì)算指令中包含的計(jì)算參數(shù)；
[0079]第一執(zhí)行模塊23，用于將計(jì)算參數(shù)代入到預(yù)先配置的與計(jì)算類(lèi)型對(duì)應(yīng)的計(jì)算命令語(yǔ)句中，并執(zhí)行該計(jì)算命令語(yǔ)句。
[0080]此外，該實(shí)現(xiàn)裝置進(jìn)一步包括:
[0081]判斷模塊(未示出)，用于在執(zhí)行代入計(jì)算參數(shù)的語(yǔ)句之前，判斷用戶輸入的計(jì)算指令是否合法，并在判斷的結(jié)果為否的情況下，禁止執(zhí)行計(jì)算命令語(yǔ)句并進(jìn)行提示；
[0082]其中，判斷用戶輸入的計(jì)算指令是否合法的條件包括以下至少之一:
[0083]計(jì)算指令的格式、計(jì)算指令中計(jì)算參數(shù)的范圍。
[0084]此外，該實(shí)現(xiàn)裝置進(jìn)一步包括:
[0085]第二獲取模塊(未示出)，用于在執(zhí)行代入計(jì)算參數(shù)的語(yǔ)句之前，獲取用戶輸入的資源請(qǐng)求指令，對(duì)資源請(qǐng)求指令進(jìn)行解析，得到資源參數(shù)，其中，資源參數(shù)用于表示用戶所請(qǐng)求的資源量；
[0086]第二執(zhí)行模塊(未示出)，用于將資源參數(shù)代入到預(yù)先配置的計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句，并執(zhí)行該計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句。
[0087]例如，在一個(gè)實(shí)施例中，根據(jù)本發(fā)明的技術(shù)方案，針對(duì)LAMMPS計(jì)算程序進(jìn)行了 web封裝，并編寫(xiě)了相應(yīng)軟件界面實(shí)現(xiàn)具體功能。
[0088]通過(guò)封裝，將LAMMPS計(jì)算程序的任務(wù)提交流程隱藏在底層，提供給用戶一個(gè)簡(jiǎn)單直觀的web界面，用戶只需要在web界面上執(zhí)行簡(jiǎn)單的操作，例如:輸入計(jì)算所需參數(shù)，選擇計(jì)算類(lèi)型，輸入計(jì)算所需要的資源，選擇計(jì)算結(jié)果的存儲(chǔ)路徑，等等，本發(fā)明的實(shí)施例所提供的LAMMPS計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)方法和裝置，可以獲取上述用戶輸入的計(jì)算參數(shù)和計(jì)算類(lèi)型，并將獲取得到的計(jì)算參數(shù)代入到預(yù)先配置的與該計(jì)算類(lèi)型相對(duì)應(yīng)的計(jì)算命令語(yǔ)句，執(zhí)行該計(jì)算命令語(yǔ)句并返回計(jì)算結(jié)果，而且，用戶可以根據(jù)自己申請(qǐng)的計(jì)算結(jié)果的存儲(chǔ)路徑查看計(jì)算結(jié)果。
[0089]并且，根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例所提供的LAMMPS計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)方法和裝置，還可以對(duì)用戶輸入的計(jì)算指令進(jìn)行合法性判斷，如果用戶輸入的計(jì)算指令格式不能被預(yù)先配置好的計(jì)算命令語(yǔ)句識(shí)別，則拒絕執(zhí)行該語(yǔ)句，并發(fā)出提示消息，從而避免了用戶錯(cuò)誤操作或者對(duì)軟件的惡意攻擊。
[0090]此外，在用戶申請(qǐng)計(jì)算資源的過(guò)程中，只需要將欲申請(qǐng)的計(jì)算資源的數(shù)量、和/或資源類(lèi)型在相應(yīng)的文本框中輸入，或者在相應(yīng)的下拉菜單中進(jìn)行選擇，本發(fā)明實(shí)施例中提供的LAMMPS計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)方法可以獲取用戶輸入的資源請(qǐng)求內(nèi)容，將服務(wù)器中的資源進(jìn)行調(diào)度，提供給用戶，同時(shí)，如果用戶所申請(qǐng)的計(jì)算資源數(shù)量超出了服務(wù)器目前能夠提供的資源總量，則拒絕用戶的申請(qǐng)，并發(fā)出提示消息。
[0091]通過(guò)上述實(shí)施例提供的web封裝方法，就能實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)文件準(zhǔn)備、計(jì)算資源申請(qǐng)、計(jì)算任務(wù)提交、計(jì)算結(jié)果查看等整套流程，無(wú)需通過(guò)命令行的方式，大大降低用戶的使用門(mén)檻，提高使用效率，減小出錯(cuò)概率。
[0092]在本實(shí)施例中，針對(duì)LAMMPS計(jì)算程序進(jìn)行web封裝，為用戶帶來(lái)全新的使用方式，效果主要體現(xiàn)在:
[0093]1.大大降低使用難度。用戶不再需要熟練掌握Linux操作系統(tǒng)基本操作、Shell腳本語(yǔ)言、常用的文本編輯和字符處理工具、MPI環(huán)境的調(diào)用、作業(yè)調(diào)度軟件等與其專(zhuān)業(yè)背景無(wú)關(guān)的知識(shí)和工具，就能輕松完成LAMMPS計(jì)算任務(wù)的準(zhǔn)備、執(zhí)行等工作，大大降低了使用門(mén)檻。
[0094]2.大大提高使用效率。繁瑣復(fù)雜的命令行操作全部隱藏在底層，在底層自動(dòng)批量執(zhí)行，可以節(jié)省大量的人為操作時(shí)間，提高使用效率。
[0095]3.提高任務(wù)提交的成功率。根據(jù)實(shí)施例所提供的web封裝方法，會(huì)對(duì)用戶在web界面提交的參數(shù)和數(shù)據(jù)進(jìn)行不同緯度的合法性檢查。比如，檢查用戶申請(qǐng)的計(jì)算資源是否超過(guò)其權(quán)限，用戶輸入的參數(shù)是否合法，用戶的輸入文件格式是否正確等，如果判斷出錯(cuò)誤，會(huì)在web界面給出相應(yīng)提示。通過(guò)這些合法性檢查可以大大提高并行任務(wù)提交的成功率。
[0096]4.提高高性能計(jì)算集群的使用安全性。將普通用戶的任務(wù)提交操作封裝在web界面后，用戶執(zhí)行的都是封閉式的操作，很大程度上避免了影響系統(tǒng)穩(wěn)定或安全的用戶非法操作。
[0097]綜上所述，借助于本發(fā)明的上述技術(shù)方案，通過(guò)獲取用戶在圖形界面中的參數(shù)輸入框內(nèi)輸入的計(jì)算指令、和/或資源申請(qǐng)指令，并將從指令中解析得到的參數(shù)信息代入到相應(yīng)的命令語(yǔ)句，并執(zhí)行該命令語(yǔ)句，能夠使LAMMPS的計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)過(guò)程無(wú)需通過(guò)命令行，大大降低操作難度，提高執(zhí)行效率，降低出錯(cuò)概率，并且，通過(guò)對(duì)用戶輸入信息的合法性判斷，能夠很好地保證LAMMPS計(jì)算程序的安全穩(wěn)定運(yùn)行。
[0098]以上所述僅為本發(fā)明的較佳實(shí)施例而已，并不用以限制本發(fā)明，凡在本發(fā)明的精神和原則之內(nèi)，所作的任何修改、等同替換、改進(jìn)等，均應(yīng)包含在本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。
【權(quán)利要求】
1.一種大規(guī)模原子分子并行模擬器LAMMPS的計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)方法，其特征在于，包括: 獲取用戶輸入的計(jì)算指令； 對(duì)所述計(jì)算指令進(jìn)行解析，確定計(jì)算的類(lèi)型以及所述計(jì)算指令中包含的計(jì)算參數(shù)；將所述計(jì)算參數(shù)代入到預(yù)先配置的與所述計(jì)算類(lèi)型對(duì)應(yīng)的計(jì)算命令語(yǔ)句中，并執(zhí)行該計(jì)算命令語(yǔ)句。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的實(shí)現(xiàn)方法，其特征在于，在執(zhí)行代入計(jì)算參數(shù)的語(yǔ)句之前，所述實(shí)現(xiàn)方法進(jìn)一步包括: 判斷所述用戶輸入的計(jì)算指令是否合法，并在所述判斷的結(jié)果為否的情況下，禁止執(zhí)行計(jì)算命令語(yǔ)句并進(jìn)行提示； 其中，判斷所述用戶輸入的計(jì)算指令是否合法的條件包括以下至少之一: 所述計(jì)算指令的格式、所述計(jì)算指令中計(jì)算參數(shù)的范圍。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的實(shí)現(xiàn)方法，其特征在于，執(zhí)行代入計(jì)算參數(shù)的語(yǔ)句之前，所述實(shí)現(xiàn)方法進(jìn)一步包括: 獲取用戶輸入的資源請(qǐng)求指令，對(duì)所述資源請(qǐng)求指令進(jìn)行解析，得到資源參數(shù)，其中，所述資源參數(shù)用于表示用戶所請(qǐng)求的資源量； 將所述資源參數(shù)代入到預(yù)先配置的計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句，并執(zhí)行該計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的實(shí)現(xiàn)方法，其特征在于，在執(zhí)行計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句之前，所述實(shí)現(xiàn)方法進(jìn)一步包括: 判斷所述用戶輸入的資源請(qǐng)求指令是否合法，并在所述判斷結(jié)果為否的情況下，禁止執(zhí)行計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句并進(jìn)行提示； 其中，判斷所述用戶輸入的資源請(qǐng)求指令是否合法的條件包括以下至少之一: 所述計(jì)算資源請(qǐng)求指令的格式、用戶所請(qǐng)求的資源量。
5.根據(jù)權(quán)利要求3所述的實(shí)現(xiàn)方法，其特征在于，所述計(jì)算資源包括以下至少之一: 計(jì)算節(jié)點(diǎn)、CPU核數(shù)、計(jì)算時(shí)長(zhǎng)、計(jì)算結(jié)果的存儲(chǔ)路徑。
6.根據(jù)權(quán)利要求1至5中任意一項(xiàng)所述的實(shí)現(xiàn)方法，其特征在于，獲取用戶輸入的計(jì)算指令包括: 通過(guò)預(yù)先提供圖形界面，獲取用戶在所述圖形界面中的參數(shù)輸入框內(nèi)輸入的計(jì)算參數(shù)、和/或根據(jù)用戶在所述圖形界面中的路徑輸入框內(nèi)輸入的存儲(chǔ)路徑獲取包含計(jì)算參數(shù)的文件并確定該文件中的輸入?yún)?shù)。
7.根據(jù)權(quán)利要求1至5中任意一項(xiàng)所述的實(shí)現(xiàn)方法，其特征在于，所述圖形界面包括web界面。
8.一種大規(guī)模原子分子并行模擬器LAMMPS的計(jì)算任務(wù)的實(shí)現(xiàn)裝置，其特征在于，包括: 第一獲取模塊，用于獲取用戶輸入的計(jì)算指令； 解析模塊，用于對(duì)所述計(jì)算指令進(jìn)行解析，確定計(jì)算的類(lèi)型以及所述計(jì)算指令中包含的計(jì)算參數(shù)； 第一執(zhí)行模塊，用于將所述計(jì)算參數(shù)代入到預(yù)先配置的與所述計(jì)算類(lèi)型對(duì)應(yīng)的計(jì)算命令語(yǔ)句中，并執(zhí)行該計(jì)算命令語(yǔ)句。
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的實(shí)現(xiàn)裝置，其特征在于，進(jìn)一步包括: 判斷模塊，用于在執(zhí)行代入計(jì)算參數(shù)的語(yǔ)句之前，判斷所述用戶輸入的計(jì)算指令是否合法，并在所述判斷的結(jié)果為否的情況下，禁止執(zhí)行計(jì)算命令語(yǔ)句并進(jìn)行提示； 其中，判斷所述用戶輸入的計(jì)算指令是否合法的條件包括以下至少之一: 所述計(jì)算指令的格式、所述計(jì)算指令中計(jì)算參數(shù)的范圍。
10.根據(jù)權(quán)利要求8所述的實(shí)現(xiàn)裝置，其特征在于，進(jìn)一步包括: 第二獲取模塊，用于在執(zhí)行代入計(jì)算參數(shù)的語(yǔ)句之前，獲取用戶輸入的資源請(qǐng)求指令，對(duì)所述資源請(qǐng)求指令進(jìn)行解析，得到資源參數(shù)，其中，所述資源參數(shù)用于表示用戶所請(qǐng)求的資源量； 第二執(zhí)行模塊，用于將所述資源參數(shù)代入到預(yù)先配置的計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句，并執(zhí)行該計(jì)算資源調(diào)度語(yǔ)句。
【文檔編號(hào)】G06F9/44GK103544017SQ201310528907
【公開(kāi)日】2014年1月29日 申請(qǐng)日期:2013年10月30日 優(yōu)先權(quán)日:2013年10月30日
【發(fā)明者】李斌, 馬少杰, 曹振南, 楊亮, 何滄平, 田相桂, 姜金良, 范娟, 沈杰, 易成, 苗春寶, 趙明坤, 陸川, 曹征 申請(qǐng)人:曙光信息產(chǎn)業(yè)(北京)有限公司