相關(guān)申請的交叉引用

本申請要求美國專利申請no.14/926,335，no.14/926,383，no.14/926,528和no.14/926,360(所有申請均于2015年10月29日提交)的權(quán)益和優(yōu)先權(quán)，本申請要求美國臨時申請序列號no.62/097,690，no.62/097,697，no.62/097,713和no.62/097,721(所有申請均于2014年12月30日提交)的權(quán)益和優(yōu)先權(quán)。上述申請的每一個的全部內(nèi)容在此均通過引用并入本文。

本公開涉及一種系統(tǒng)和方法，所述系統(tǒng)和方法用于獲取活檢樣本、獲得關(guān)于活檢樣本的細(xì)胞病理學(xué)信息、獲得關(guān)于活檢樣本的基因信息、確定治療過程、實施治療、觀察治療過程對于從其上獲取活檢樣本的目標(biāo)的效果、以及維護(hù)并且更新關(guān)聯(lián)這些類型的數(shù)據(jù)中的每一種的數(shù)據(jù)庫。

背景技術(shù)：

用于檢查患者的氣道的常用裝置是支氣管鏡。通常，支氣管鏡通過患者的鼻子或嘴插入到患者的氣道中，并且能夠延伸到患者的肺中。典型的支氣管鏡包括細(xì)長柔性管，所述細(xì)長柔性管具有照明組件、成像組件和工作通道，所述照明組件用于照亮支氣管鏡的末端的遠(yuǎn)側(cè)的區(qū)域，所述成像組件用于提供來自支氣管鏡的末端的視頻圖像，通過所述工作通道可以插入器械，所述器械例如為診斷器械，所述診斷器械例如為活檢工具或治療器械，所述治療器械例如為消融導(dǎo)管。

然而，支氣管鏡由于其尺寸而受限于它們可以前進(jìn)穿過氣道多遠(yuǎn)。在支氣管鏡太大以致不能到達(dá)肺深處的目標(biāo)位置的情況下，臨床醫(yī)生可以使用某些實時成像模式(例如熒光鏡檢查)。由于熒光鏡圖像經(jīng)常難以區(qū)分腔通道與實體組織，因此對于導(dǎo)航來說，熒光鏡圖像雖然有用，但也呈現(xiàn)出某些缺陷。此外，由熒光鏡產(chǎn)生的圖像是二維的，而導(dǎo)航患者的氣道需要在三維中進(jìn)行操縱的能力。

為了解決這些問題，已經(jīng)研發(fā)出能夠通常從一系列計算機(jī)斷層掃描(ct)圖像開發(fā)出氣道或其它腔網(wǎng)絡(luò)的三維模型的系統(tǒng)。一個這種系統(tǒng)已經(jīng)被研發(fā)作為目前由covidienlp出售的系統(tǒng)electromagneticnavigation(enb^tm)的一部分。這種系統(tǒng)通常被稱為電磁導(dǎo)航系統(tǒng)或emn系統(tǒng)。這種系統(tǒng)的細(xì)節(jié)在2004年3月29日由gilboa提交的名稱為“endoscopestructuresandtechniquesfornavigatingtoatargetinbranchedstructure”的共同受讓的美國專利no.7,233,820中進(jìn)行了描述，其全部內(nèi)容通過引用并入本文。

不管是否使用支氣管鏡還是emn系統(tǒng)，在識別腫瘤、團(tuán)塊、或感興趣的其它區(qū)域時，臨床醫(yī)生通常將獲取活檢組織以便進(jìn)行病理學(xué)檢測。病理學(xué)檢測的結(jié)果將識別腫瘤或感興趣的區(qū)域是否是癌性的，并且將推動臨床醫(yī)生對于該患者將采取的下一個步驟。本公開涉及用于輔助臨床醫(yī)生確定那些下一個步驟的系統(tǒng)和方法。

技術(shù)實現(xiàn)要素：

在本公開的一方面中，提供一種評估目標(biāo)的方法。所述方法包括：收集患者數(shù)據(jù)；在圖像數(shù)據(jù)集中識別目標(biāo)；準(zhǔn)備達(dá)到目標(biāo)的路徑規(guī)劃；插入醫(yī)療器械并且遵照路徑規(guī)劃從開口達(dá)到目標(biāo)；從目標(biāo)提取第一活檢樣本；對活檢樣本實施細(xì)胞病理學(xué)檢測；從活檢樣本收集基因信息；和基于第一活檢樣本的患者數(shù)據(jù)、細(xì)胞病理學(xué)檢測、和基因信息的關(guān)聯(lián)性以及它們與先前獲得的活檢樣本的患者數(shù)據(jù)、細(xì)胞病理學(xué)檢測和基因信息的對比提出一個或多個治療選項。此外或可替代地，所述方法還可以包括：獲取第二活檢樣本；對第二活檢樣本實施細(xì)胞病理學(xué)檢測；收集第二活檢樣本的基因信息；和基于第二活檢樣本的患者數(shù)據(jù)、細(xì)胞病理學(xué)檢測和基因信息的關(guān)聯(lián)性以及它們與先前獲得的活檢樣本的患者數(shù)據(jù)、細(xì)胞病理學(xué)檢測和基因信息的對比提出一個或多個治療選項。

治療選項的提出可以包括提供第一活檢樣本的細(xì)節(jié)，所述細(xì)節(jié)包括來自圖像數(shù)據(jù)集的圖像、細(xì)胞病理學(xué)檢測結(jié)果、和基因信息中的一種或多種。先前的活檢樣本可以來自同一目標(biāo)、或來自同一患者中的不同目標(biāo)、或來自其它患者。

所述關(guān)聯(lián)度可以確定第一活檢樣本和先前獲取的活檢樣本的細(xì)胞病理學(xué)檢測結(jié)果中的相似性。此外或可替代地，所述關(guān)聯(lián)度可以確定第一活檢樣本和先前獲取的活檢樣本的基因突變的相似性。此外或可替代地，所述關(guān)聯(lián)度可以確定第一活檢樣本和先前獲取的活檢樣本中的細(xì)胞病理學(xué)檢測結(jié)果、基因突變、患者的年齡、種族、性別、病癥、目標(biāo)的位置、和/或觀測的效果中的一種或多種的相似性。

所提出的治療選項可以包括標(biāo)準(zhǔn)治療方案、臨床試驗、臨床研究性治療、和/或以上選項的組合。此外或可替代地，所提出的治療選項可以包括預(yù)期效果，所述預(yù)期效果基于數(shù)據(jù)庫中存儲的與在進(jìn)行關(guān)聯(lián)時所使用的先前活檢樣本相關(guān)的觀測效果。此外或可替代地，所提出的治療選項可以包括治療細(xì)節(jié)，所述治療細(xì)節(jié)包括功率、強(qiáng)度、劑量、持續(xù)時間、循環(huán)數(shù)量、治療方案、組合治療和以上每個細(xì)節(jié)的時間控制中的一個或多個。此外，所提出的治療選項可以由護(hù)理團(tuán)隊經(jīng)由網(wǎng)絡(luò)來訪問。

一方面，所述方法還包括觀察選擇的治療的效果，并且將與所述效果有關(guān)的數(shù)據(jù)存儲在數(shù)據(jù)庫中。此外，在觀察所選擇的治療的效果之后，患者的存儲在數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)可以由其他人訪問以用于對從不同的患者獲取的活檢樣本進(jìn)行不同的關(guān)聯(lián)。觀察所述效果可以包括產(chǎn)生第二圖像數(shù)據(jù)集以及將所述第二圖像數(shù)據(jù)集存儲在數(shù)據(jù)庫中。所述第二圖像數(shù)據(jù)集可以示出在活檢提取期間布置在患者中的一個或多個標(biāo)記。

此外，在本公開的一方面中，提供了一種系統(tǒng)。所述系統(tǒng)包括存儲數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫，所述數(shù)據(jù)與來自多個先前患者的患者數(shù)據(jù)、圖像數(shù)據(jù)集、目標(biāo)數(shù)據(jù)、路徑數(shù)據(jù)、細(xì)胞病理學(xué)數(shù)據(jù)、基因信息數(shù)據(jù)、治療數(shù)據(jù)、和效果觀察數(shù)據(jù)中的一種或多種相關(guān)。所述系統(tǒng)還包括網(wǎng)絡(luò)、顯示器和用戶界面，所述網(wǎng)絡(luò)將數(shù)據(jù)庫連接到電磁導(dǎo)航(emn)系統(tǒng)和/或計算裝置，所述顯示器與所述計算裝置相通信，所述用戶界面在顯示器上呈現(xiàn)與當(dāng)前患者的目標(biāo)相關(guān)的數(shù)據(jù)。所述數(shù)據(jù)可以與當(dāng)前患者的目標(biāo)有關(guān)，所述數(shù)據(jù)包括目標(biāo)的成像數(shù)據(jù)、目標(biāo)的細(xì)胞病理學(xué)數(shù)據(jù)、目標(biāo)的基因信息數(shù)據(jù)、和治療選項數(shù)據(jù)中的一種或多種。所述治療選項基于來自多個先前患者的數(shù)據(jù)和與當(dāng)前患者的目標(biāo)相關(guān)的數(shù)據(jù)的相似性的關(guān)聯(lián)度。

一方面，所述系統(tǒng)還包括電磁導(dǎo)航(emn)系統(tǒng)，所述電磁導(dǎo)航系統(tǒng)使得能夠遵循路徑規(guī)劃到達(dá)當(dāng)前患者的已識別目標(biāo)以及從所述目標(biāo)移除活檢樣本。所述emn系統(tǒng)可以包括計算機(jī)系統(tǒng)，并且可以使得能夠?qū)⒅委熝b置移送到所識別的目標(biāo)以治療目標(biāo)，所述計算機(jī)系統(tǒng)能夠經(jīng)由網(wǎng)絡(luò)連接到服務(wù)器。所述治療裝置可以是微波消融導(dǎo)管或其它合適的裝置。

針對當(dāng)前患者，可以對所述活檢樣本進(jìn)行細(xì)胞病理學(xué)檢測，并且將所述結(jié)果存儲在數(shù)據(jù)庫中。此外，所述基因信息可以來源于在所述活檢樣本上進(jìn)行的基因圖譜檢測，并且所述結(jié)果存儲在用于當(dāng)前患者的數(shù)據(jù)庫中。當(dāng)前患者的圖像數(shù)據(jù)可以導(dǎo)入用于當(dāng)前患者的數(shù)據(jù)庫中。

此外，在本公開的一方面中，提供一種用戶界面。所述用戶界面包括當(dāng)前患者數(shù)據(jù)字段、護(hù)理團(tuán)隊字段、疾病標(biāo)識字段，和提供如下數(shù)據(jù)的多個字段，所述數(shù)據(jù)包括當(dāng)前患者的已識別目標(biāo)的成像數(shù)據(jù)、細(xì)胞病理學(xué)數(shù)據(jù)、基因信息數(shù)據(jù)和治療選項中的一種或多種，其中治療選項基于來自多個先前患者的數(shù)據(jù)和當(dāng)前患者的已識別目標(biāo)的數(shù)據(jù)的相似性的關(guān)聯(lián)度。用戶界面還可以包括診斷字段和/或提供與診斷相關(guān)的文獻(xiàn)或其它信息的字段。此外，用戶界面還可以包括提供當(dāng)前患者的機(jī)能數(shù)據(jù)的字段。機(jī)能數(shù)據(jù)可以提供關(guān)于當(dāng)前患者的健康的細(xì)節(jié)、或關(guān)于目標(biāo)所位于的器官的健康的細(xì)節(jié)。

關(guān)于本文描述的任何系統(tǒng)、方法和用戶界面，所述數(shù)據(jù)庫可以在其中存儲通過網(wǎng)絡(luò)可訪問的患者數(shù)據(jù)、圖像數(shù)據(jù)、細(xì)胞病理學(xué)檢測結(jié)果數(shù)據(jù)和基因信息數(shù)據(jù)中的任何數(shù)據(jù)或全部數(shù)據(jù)。一方面，當(dāng)選擇治療選項時，所選定的治療選項存儲在數(shù)據(jù)庫中。此外或可替代地，當(dāng)執(zhí)行選定的治療時，治療細(xì)節(jié)可以存儲在數(shù)據(jù)庫中，所述治療細(xì)節(jié)包括功率、強(qiáng)度、劑量、持續(xù)時間、循環(huán)數(shù)量、治療方案、組合治療和以上每個細(xì)節(jié)的時間控制中的一個或多個。

此外，在本公開的一方面中，提供一種方法。所述方法包括：在數(shù)據(jù)庫中存儲多個先前患者的數(shù)據(jù)，對于每一個先前患者而言，所述數(shù)據(jù)均包括年齡數(shù)據(jù)、性別數(shù)據(jù)和種族數(shù)據(jù)中的一種或多種；參照從其獲取樣本的先前患者的圖像數(shù)據(jù)集，在數(shù)據(jù)庫中存儲從多個先前患者獲取的每個活檢樣本的位置以及從其獲取活檢樣本的目標(biāo)的尺寸；在數(shù)據(jù)庫中存儲來自先前患者的多個活檢樣本中的每一個的細(xì)胞病理學(xué)數(shù)據(jù)；在數(shù)據(jù)庫中存儲來自先前患者的多個活檢樣本中的每一個的基因信息；和在數(shù)據(jù)庫中存儲與對目標(biāo)實施的治療和所述治療的觀察效果有關(guān)的數(shù)據(jù)。所述方法還包括：接收與新的患者和從新的患者獲取的新的活檢樣本相關(guān)的數(shù)據(jù)，所述數(shù)據(jù)包括年齡、性別、種族、獲取新的活檢樣本的位置、和獲取所述活檢樣本的目標(biāo)的尺寸中的一種或多種；將與新的患者相關(guān)的數(shù)據(jù)與數(shù)據(jù)庫中存儲的來自先前患者的相對應(yīng)的數(shù)據(jù)進(jìn)行對比；識別與新的患者相關(guān)的數(shù)據(jù)和數(shù)據(jù)庫中存儲的來自先前患者的數(shù)據(jù)之間的一個或多個共同點；和基于所述對比和共同點的識別提出一個或多個治療選項。

關(guān)于本文描述的任何系統(tǒng)、方法、和用戶界面，存儲在數(shù)據(jù)庫中的來自先前患者的數(shù)據(jù)可以包括來自新的患者的與先前活檢樣本相關(guān)的數(shù)據(jù)。先前活檢樣本可以從與新的活檢樣本相同的目標(biāo)獲取。可替代地，先前活檢樣本從與新的活檢樣本不同的目標(biāo)獲取。

此外，關(guān)于本文描述的任何系統(tǒng)、方法、和用戶界面，相似性的關(guān)聯(lián)度可以基于存儲在數(shù)據(jù)庫中的細(xì)胞病理學(xué)數(shù)據(jù)和當(dāng)前患者的細(xì)胞病理學(xué)數(shù)據(jù)。此外或可替代地，相似性的關(guān)聯(lián)度可以基于存儲在數(shù)據(jù)庫中的基因信息和當(dāng)前患者的基因信息。相似性的關(guān)聯(lián)度可以基于存儲在數(shù)據(jù)庫中的成像數(shù)據(jù)、細(xì)胞病理學(xué)數(shù)據(jù)、基因信息數(shù)據(jù)、性別數(shù)據(jù)、種族數(shù)據(jù)、和年齡數(shù)據(jù)中的至少一種以及當(dāng)前患者的相對應(yīng)的數(shù)據(jù)。

此外，關(guān)于本文描述的任何系統(tǒng)、方法、和用戶界面，所提供的目標(biāo)的成像數(shù)據(jù)、目標(biāo)的細(xì)胞病理學(xué)數(shù)據(jù)、目標(biāo)的基因信息數(shù)據(jù)能夠由用戶選擇以提供每個數(shù)據(jù)的進(jìn)一步的細(xì)節(jié)。所提出的治療選項可以包括標(biāo)準(zhǔn)治療方案、臨床試驗、臨床研究性治療、和/或以上選項的組合。此外或可替代地，所提出的治療選項可以包括預(yù)期效果，所述預(yù)期效果基于存儲在數(shù)據(jù)庫中的與進(jìn)行關(guān)聯(lián)時所使用的先前活檢樣本相關(guān)的觀察效果。此外或可替代地，所提出的治療選項可以包括治療細(xì)節(jié)，所述治療細(xì)節(jié)包括功率、強(qiáng)度、劑量、持續(xù)時間、循環(huán)數(shù)量、治療方案、組合治療和以上每個細(xì)節(jié)的時間控制中的一種或多種。所述數(shù)據(jù)庫可以在其中存儲經(jīng)由網(wǎng)絡(luò)可訪問的患者數(shù)據(jù)、圖像數(shù)據(jù)、細(xì)胞病理學(xué)檢測結(jié)果數(shù)據(jù)、和基因信息數(shù)據(jù)中的任何數(shù)據(jù)或全部數(shù)據(jù)。此外，所提出的治療選項可以由護(hù)理團(tuán)隊經(jīng)由網(wǎng)絡(luò)訪問。

所述方法還可以包括選擇所提出的治療選項中的一種來治療所述目標(biāo)。此外或可替代地，當(dāng)執(zhí)行選定的治療時，治療細(xì)節(jié)可以存儲在數(shù)據(jù)庫中，所述治療細(xì)節(jié)包括功率、強(qiáng)度、劑量、持續(xù)時間、循環(huán)數(shù)量、治療方案、組合治療和以上每個細(xì)節(jié)的時間控制中的一種或多種。

所述方法還可以包括觀察選定的治療選項的效果，并且將與所述效果相關(guān)的數(shù)據(jù)存儲在數(shù)據(jù)庫中。此外，在觀察選定的治療選項的效果之后，存儲在數(shù)據(jù)庫中的新的患者的數(shù)據(jù)可以由其他人訪問以用于對比不同患者的活檢數(shù)據(jù)并且識別所述活檢數(shù)據(jù)的共同點。觀察效果可以包括在治療之后產(chǎn)生目標(biāo)的圖像數(shù)據(jù)集，并且將圖像數(shù)據(jù)集存儲在數(shù)據(jù)庫中。

關(guān)于本文描述的任何系統(tǒng)、方法、和用戶界面，所提出的治療選項可以是對與當(dāng)前患者具有相同的細(xì)胞病理學(xué)表現(xiàn)的先前患者所采用的最常用的治療方案。此外或可替代地，所提出的治療選項可以是對與當(dāng)前患者具有相同的基因信息的先前患者所采用的最常用的治療方案。此外或可替代地，所提出的治療選項可以包括預(yù)期效果，所述預(yù)期效果基于在進(jìn)行相似性的關(guān)聯(lián)時所使用的先前患者的觀察效果。此外或可替代地，所提出的治療選項可以包括治療細(xì)節(jié)，所述治療細(xì)節(jié)包括功率、強(qiáng)度、劑量、持續(xù)時間、循環(huán)數(shù)量、治療方案、組合治療和以上每個細(xì)節(jié)的時間控制中的一種或多種。

附圖說明

下面參考附圖描述本公開的各個方面，其中：

圖1是描述根據(jù)本公開的方法的流程圖；

圖2是根據(jù)本公開的路徑規(guī)劃裝置的示意圖；

圖3是根據(jù)本公開的電磁導(dǎo)航系統(tǒng)；

圖4是根據(jù)本公開的計算機(jī)網(wǎng)絡(luò)；

圖5是根據(jù)本公開的樣本數(shù)據(jù)庫；以及

圖6是根據(jù)本公開的樣本網(wǎng)頁。

具體實施方式

本公開涉及一種綜合方法，所述綜合方法用于靶向活檢、細(xì)胞病理學(xué)檢測、基因譜檢測(geneprofiling)或基因圖譜檢測(genemapping)、靶向治療、結(jié)果追蹤、生物靶向治療、免疫療法、外部或內(nèi)部放射治療、或以上措施的任何組合。本公開的一個實施例涉及從大量活檢樣本聚集數(shù)據(jù)，所述數(shù)據(jù)包括與每個活檢樣本的細(xì)胞病理學(xué)和其基因譜相關(guān)的數(shù)據(jù)。還收集再次進(jìn)行活檢的數(shù)據(jù)，其中在不同時間對同一目標(biāo)進(jìn)行第二次活檢、第三次活檢等以評估病理、基因譜和其它特性數(shù)據(jù)。在進(jìn)行治療的情況中，治療數(shù)據(jù)也被收集并且被關(guān)聯(lián)到活檢數(shù)據(jù)。治療數(shù)據(jù)可以包括治療的方式(例如，化療、消融、切除、生物靶向療法、免疫療法、外部或內(nèi)部放射療法等)以及更具體的數(shù)據(jù)，所述更具體的數(shù)據(jù)例如為消融的持續(xù)時間和功率水平、化療的藥物的劑量、藥物組合、組合的外科和藥物治療等。此外，積極的和消極的效果均被監(jiān)控作為治療的結(jié)果。隨著該數(shù)據(jù)被收集并且更大量的基因譜被識別且與治療和患者效果進(jìn)行關(guān)聯(lián)，由此提出預(yù)測模型，所述預(yù)測模型可以為臨床醫(yī)生提供為具體的個體定制的多種治療選項，所述具體的個體在其疾病進(jìn)展的具體時間中在其具體的腫瘤中表達(dá)具體類型的基因譜。

圖1中示出了本公開的一個實施例，圖1示出了方法100，所述方法100用于評估和治療患者，并且用于收集數(shù)據(jù)以使得能夠?qū)χ委熀图膊∵M(jìn)行關(guān)聯(lián)，并且產(chǎn)生針對具體的患者的預(yù)測效果。在步驟102中，對患者進(jìn)行成像，所述成像例如為計算機(jī)斷層掃描(ct)成像、核磁共振成像(mri)、熒光鏡檢查成像、x射線成像或其它成像模式。在不偏離本公開的范圍的前提下，可以使用其它成像模式。

一旦已經(jīng)產(chǎn)生圖像(例如ct圖像)，所述圖像就可以被導(dǎo)入路徑規(guī)劃系統(tǒng)200(圖2)，所述路徑規(guī)劃系統(tǒng)200如名稱為“pathwayplanningsystemandmethod”的共同未決的且共同受讓的美國專利申請no.13/838,805中所描述的，其全部內(nèi)容通過引用并入本文。路徑規(guī)劃系統(tǒng)200可以實施(embody)在筆記本電腦、臺式機(jī)、平板電腦、或其它類似裝置上，以上所述裝置均具有顯示器202、存儲器204、一個或多個處理器206、和/或通常存在于計算裝置中的其他類型的部件。路徑規(guī)劃系統(tǒng)還可以是瘦客戶端分布式網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)的一部分，其中，數(shù)據(jù)被遠(yuǎn)程地存儲在位于一個或多個服務(wù)器上的存儲器204中，例如存儲在云端，由處理器206執(zhí)行的軟件在一個或多個服務(wù)器上遠(yuǎn)程地存儲和執(zhí)行，并且顯示器202和用戶輸入裝置(例如鍵盤或鼠標(biāo))是主要的本地部件。如本領(lǐng)域技術(shù)人員將理解的，還需要一些本地處理來接收、傳輸和操作用于例如顯示器202的數(shù)據(jù)。顯示器202可以是觸敏式的和/或語音激活式的，使得顯示器202既能夠用作輸入裝置也能夠用作輸出裝置。可替代地，可以使用鍵盤(未示出)、鼠標(biāo)(未示出)、或其它數(shù)據(jù)輸入裝置。

存儲器204可以是用于存儲數(shù)據(jù)和/或軟件的任何非暫時性的計算機(jī)可讀存儲介質(zhì)，所述數(shù)據(jù)和/或軟件能夠由處理器206執(zhí)行并且控制路徑規(guī)劃系統(tǒng)200的操作。路徑規(guī)劃系統(tǒng)200還可以包括網(wǎng)絡(luò)模塊208，所述網(wǎng)絡(luò)模塊208經(jīng)由有線連接或無線連接連接到分布式網(wǎng)絡(luò)或因特網(wǎng)以用于傳輸數(shù)據(jù)到其他源以及從其他源接收數(shù)據(jù)。例如，計算裝置200可以從服務(wù)器(例如，醫(yī)院服務(wù)器、因特網(wǎng)服務(wù)器、或其它類似的服務(wù)器)接收患者的計算機(jī)斷層掃描(ct)圖像以用于在路徑規(guī)劃期間使用?；颊叩腸t圖像還可以經(jīng)由可移除存儲器(例如usb驅(qū)動器(未示出))被提供到路徑規(guī)劃系統(tǒng)200。

路徑規(guī)劃模塊210包括軟件程序，所述軟件程序存儲在存儲器204中并且由路徑規(guī)劃系統(tǒng)200的處理器206執(zhí)行。如在并入的美國專利申請no.13/838,805中更詳細(xì)地描述的，路徑規(guī)劃模塊210通過一系列步驟引導(dǎo)臨床醫(yī)生制訂用于隨后在醫(yī)療程序期間使用的路徑規(guī)劃。路徑規(guī)劃模塊210與用戶界面模塊211相通信，所述用戶界面模塊211在顯示器202上向臨床醫(yī)生顯示可視化交互特征，并且用于接收臨床醫(yī)生的輸入。

在步驟104中，使用路徑規(guī)劃系統(tǒng)200的工具，并且具體地使用路徑規(guī)劃模塊210，臨床醫(yī)生能夠從存儲器204檢索圖像(例如ct圖像)并且在顯示器202上進(jìn)行瀏覽。在瀏覽期間，如果感興趣的區(qū)域被識別(步驟106)，該感興趣的區(qū)域可以在圖像數(shù)據(jù)中以電子方式被標(biāo)記并且被識別為目標(biāo)。無論在識別目標(biāo)之后或是在完全瀏覽所有圖像數(shù)據(jù)并且識別所有目標(biāo)之后，方法100可以進(jìn)行到步驟110，在步驟110中，可以產(chǎn)生從一個或多個感興趣的區(qū)域到身體的自然開口或到身體的手術(shù)出口位置(例如切口)的路徑規(guī)劃，并且所述路徑規(guī)劃存儲在數(shù)據(jù)庫500(在圖5中示出)中并且與患者進(jìn)行關(guān)聯(lián)。

如果在步驟106中沒有識別感興趣的區(qū)域，則在步驟108中，在步驟102中收集的圖像數(shù)據(jù)可以存儲在數(shù)據(jù)庫500中(如果還沒有存儲在數(shù)據(jù)庫500中)并且與患者進(jìn)行關(guān)聯(lián)，以用于與隨后從同一患者獲取的圖像數(shù)據(jù)進(jìn)行對比以便評估患者隨時間的變化。如圖4所示，數(shù)據(jù)庫500可以本地存儲在路徑規(guī)劃系統(tǒng)200上或遠(yuǎn)程存儲在服務(wù)器212上，所述服務(wù)器212能夠經(jīng)由網(wǎng)絡(luò)模塊208訪問。如下面將更詳細(xì)地描述的，患者的圖像數(shù)據(jù)以及其它相關(guān)數(shù)據(jù)可以經(jīng)由數(shù)據(jù)庫500獲取以用于由其它臨床醫(yī)生研究和分析以便評估其自己的患者的疾病和治療選項。例如，存儲在數(shù)據(jù)庫500中的一些或全部數(shù)據(jù)可以是公開可訪問的以由其它內(nèi)科醫(yī)生、臨床醫(yī)生、或研究人員訪問從而輔助全球治療決策支持。

成像步驟102和瀏覽步驟104可以作為下面描述的效果監(jiān)控步驟138的一部分來進(jìn)行。因此，在步驟102中進(jìn)行的成像可以實施，并且在瀏覽步驟104中與存儲在數(shù)據(jù)庫500中的先前成像比較以確定先前治療是否成功、繼續(xù)“觀察等待”的先前決定是否不再適當(dāng)、所述疾病是否已經(jīng)以一些可觀察的方式變化(例如，尺寸增加)、和/或本領(lǐng)域技術(shù)人員已知的且與疾病的觀察、管理和治療相關(guān)的患者和疾病狀態(tài)的其它變化。

在步驟110中產(chǎn)生路徑規(guī)劃之后，路徑規(guī)劃可以在步驟112中由臨床醫(yī)生瀏覽并且在步驟114中必須被臨床醫(yī)生接受。如果所述路徑是不可接受的，臨床醫(yī)生可以拒絕該路徑規(guī)劃，并且路徑規(guī)劃模塊210返回到步驟108。臨床醫(yī)生可以隨后使用路徑規(guī)劃模塊210的工具來生成新的路徑，或?qū)?dāng)前路徑改變?yōu)楦硐氲穆窂健Ｒ坏┞窂揭?guī)劃在步驟114中已經(jīng)被接受，路徑規(guī)劃就存儲在存儲器204中并且準(zhǔn)備導(dǎo)出以用于使用在圖3中示出的電磁導(dǎo)航系統(tǒng)300(emn)中。路徑規(guī)劃可以使用便攜式存儲器(例如usb驅(qū)動器)被導(dǎo)出到emn系統(tǒng)300，或者存儲器204可以位于如圖4中所示的服務(wù)器212上并且可以由路徑規(guī)劃系統(tǒng)200和emn系統(tǒng)300兩者訪問。

emn系統(tǒng)300可以是目前由covidienlp出售的electromagneticnavigation系統(tǒng)。通常emn系統(tǒng)300包括支氣管鏡302、一個或多個兩種不同類型的導(dǎo)管引導(dǎo)組件304和306、監(jiān)控設(shè)備308、電磁場發(fā)生器310、追蹤模塊312、和計算機(jī)系統(tǒng)314。圖3示出了躺在包括電磁場發(fā)生器310的操作臺316上的患者“p”。患者“p”身上布置了若干傳感器315，所述傳感器315在由電磁場發(fā)生器310產(chǎn)生的磁場中的位置可以由追蹤模塊312確定。

導(dǎo)管引導(dǎo)組件304、306中的每一個均包括延伸工作通道318，所述延伸工作通道318構(gòu)造為接收包括傳感器322的可定位引導(dǎo)導(dǎo)管320?？啥ㄎ灰龑?dǎo)導(dǎo)管320電連接到emn系統(tǒng)300，并且具體地，追蹤模塊312使得傳感器322能夠在腔網(wǎng)絡(luò)(例如患者“p”的肺)內(nèi)導(dǎo)航和追蹤以到達(dá)指定目標(biāo)。延伸工作通道(ewc)318構(gòu)造為接收器械，所述器械包括可定位引導(dǎo)導(dǎo)管320和傳感器322、活檢工具(未示出)和微波消融導(dǎo)管324、以及在不偏離本公開的范圍的前提下的其它器械。鎖定機(jī)構(gòu)321確保可定位引導(dǎo)導(dǎo)管320和延伸工作通道318一致地移動。每一個導(dǎo)管引導(dǎo)組件304、306均包括手柄315以使得能夠移動和導(dǎo)航穿過腔網(wǎng)絡(luò)(例如患者“p”的肺)。

如圖3中所示，微波消融導(dǎo)管324經(jīng)由饋線328電連接到微波發(fā)生器326。微波發(fā)生器326為微波消融導(dǎo)管供應(yīng)微波能量以治療患者“p”內(nèi)的腫瘤和病變。如所述技術(shù)中所已知的，冷卻回路330冷卻微波消融導(dǎo)管324以防止損害設(shè)備以及除了在待治療的那些位置之外對患者造成損害。

導(dǎo)航軟件存儲在計算機(jī)系統(tǒng)314上或可以從計算機(jī)系統(tǒng)314訪問，所述導(dǎo)航軟件使得能夠按照在步驟110-114中形成的路徑規(guī)劃將一個或多個工具導(dǎo)航到患者p內(nèi)。一個這樣的導(dǎo)航軟件在2014年7月2日由brown等人提交的名稱為“systemandmethodfornavigatingwithinthelung”的美國臨時專利申請no.62/020,240中進(jìn)行了詳細(xì)描述，其全部內(nèi)容通過引用并入這里。

如在no.62/020,240申請中所描述的，傳感器322檢測由電磁場發(fā)生器310產(chǎn)生的磁場，并且追蹤模塊312能夠識別傳感器在磁場內(nèi)的位置?；颊咴诖艌鰞?nèi)的位置(并且具體地患者的先前成像的那些部分)與導(dǎo)入到計算機(jī)系統(tǒng)314的先前獲取的圖像和路徑規(guī)劃進(jìn)行配準(zhǔn)。因此，存儲在計算機(jī)系統(tǒng)314上或可以從計算機(jī)系統(tǒng)314訪問的導(dǎo)航軟件能夠描繪出傳感器322在患者p內(nèi)的位置的表示。該所表示的位置可以參考渲染的ct圖像、或參考由ct圖像數(shù)據(jù)生成的3d模型、或如no.62/020,240申請中描述的其它類型的圖像。

一旦路徑規(guī)劃被導(dǎo)入到emn系統(tǒng)，并且具體地被導(dǎo)入到計算機(jī)系統(tǒng)314，臨床醫(yī)生就能夠在步驟120中執(zhí)行emn以通過操縱導(dǎo)管引導(dǎo)組件304、306穿過支氣管鏡302來遵循路徑規(guī)劃。在患者的腔網(wǎng)絡(luò)的圖像和/或3d模型上為臨床醫(yī)生描繪出傳感器322在患者“p”內(nèi)的位置，并且在計算機(jī)系統(tǒng)314的用戶界面中示出到達(dá)目標(biāo)的路徑。臨床醫(yī)生能夠操縱導(dǎo)管引導(dǎo)組件304、306直到傳感器322接近在步驟106中識別的目標(biāo)。

在涉及再次活檢(即，再次評估先前已經(jīng)進(jìn)行活檢的目標(biāo))的實施例中，能夠遵循最初用于接近目標(biāo)的相同的路徑規(guī)劃。然而，考慮到成像成本相對較低，可以想到，通常臨床醫(yī)生每次計劃進(jìn)行活檢時均將實施新的成像過程102和路徑規(guī)劃步驟110-116。目標(biāo)隨著時間的改變(無論是否進(jìn)行了治療)以及鑒于這些改變而需要確認(rèn)導(dǎo)航到適當(dāng)位置可能使得需要進(jìn)行新的成像過程102。

已經(jīng)達(dá)到目標(biāo)位置時，臨床醫(yī)生可以從延伸工作通道318移除可定位引導(dǎo)導(dǎo)管320。同樣如本公開所可以想到的，如果傳感器322位于延伸工作通道上，可以不必移除可定位引導(dǎo)導(dǎo)管。無論如何，已經(jīng)達(dá)到目標(biāo)時，作為步驟120的一部分，將從目標(biāo)獲取一個或多個活檢樣本。作為步驟121的一部分，獲取樣本的位置可以以電子方式記錄在導(dǎo)航文件中。導(dǎo)航文件是計算機(jī)記錄，所述計算機(jī)記錄可以包括路徑規(guī)劃和在emn期間進(jìn)行的實際導(dǎo)航步驟。活檢的圖形表示(例如電子標(biāo)記)可以布置在導(dǎo)航文件中，并且在計算機(jī)系統(tǒng)314的用戶界面上顯示給臨床醫(yī)生。除了活檢的圖形表示外，電子標(biāo)記可以包括注釋，所述注釋指示例如具體的生物數(shù)據(jù)(例如為腫瘤類型和亞型)、細(xì)胞病理學(xué)和組織學(xué)檢測結(jié)果數(shù)據(jù)、基因組/蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)、抗性數(shù)據(jù)等。此外，注釋可以共同記錄解剖細(xì)節(jié)，所述解剖細(xì)節(jié)包括例如到氣道的距離、斜裂(fissure)、血管分布等。

除了電子標(biāo)記外，物理基準(zhǔn)標(biāo)記可以被布置在每個活檢位置處或每個活檢位置附近。這些標(biāo)記使得在將來的ct掃描和其它成像技術(shù)中易于發(fā)現(xiàn)目標(biāo)，并且使得更易于以后在隨后的emn程序中再次訪問所述目標(biāo)，并且更易于再次實施活檢(如在下述效果監(jiān)控步驟中可能是必要的)。

在目標(biāo)處獲取活檢樣本并且將標(biāo)記布置在所述目標(biāo)處之后，臨床醫(yī)生返回到路徑規(guī)劃。在再次插入具有傳感器322的可定位引導(dǎo)導(dǎo)管320之后，臨床醫(yī)生繼續(xù)導(dǎo)航到下一個目標(biāo)。再次從所述下一個目標(biāo)以及每個目標(biāo)獲取樣本，直到所有的目標(biāo)均已經(jīng)被導(dǎo)航到、被以電子方式標(biāo)記、獲取了活檢樣本并且在所述目標(biāo)處布置了物理標(biāo)記。如上所述，在ewc318包括傳感器322的情況中，可定位引導(dǎo)導(dǎo)管320的再次插入是不必要的。

對于每一次活檢，在步驟122必須進(jìn)行細(xì)胞病理學(xué)檢測以確定在活檢中從目標(biāo)獲得的細(xì)胞的疾病狀態(tài)。細(xì)胞病理學(xué)檢測的結(jié)果具有至少兩個用途。第一，細(xì)胞病理學(xué)檢測的結(jié)果識別個體患者是否具有癌癥和癌癥的類型、是否具有另一疾病、或所述目標(biāo)是否為良性生長。第二，每一次活檢均表示數(shù)據(jù)點，所述數(shù)據(jù)點將并入到可能的治療數(shù)據(jù)庫500中并且從數(shù)據(jù)庫500產(chǎn)生預(yù)測效果模型(如下面將更詳細(xì)地描述的)。

可以使用快速現(xiàn)場評估(“rose”)來執(zhí)行細(xì)胞病理學(xué)檢測以用于即時檢測。因此，在一些情況中，甚至可以在提取活檢樣本之后并且在臨床醫(yī)生繼續(xù)到下一個目標(biāo)之前執(zhí)行所述檢測。在一些情況中，這保證從每一個目標(biāo)獲取足夠的樣本以用于活檢，從而允許臨床醫(yī)生如果需要的話立即重復(fù)活檢。此外，在一些情況中，rose程序的使用使得臨床醫(yī)生能夠?qū)嵤τ谀繕?biāo)的即時治療而無需后續(xù)的emn，因此對于患者來說，簡化了治療過程并且減少了程序的數(shù)量和程序之間的時間。在步驟124中，如圖5中所示，細(xì)胞病理學(xué)的結(jié)果被存儲在數(shù)據(jù)庫500中。如下面將更詳細(xì)地描述的，這個數(shù)據(jù)可以由臨床醫(yī)生獲得以用于治療和監(jiān)控具體的患者“p”，以及用于與其它患者相比較來確定治療選項和預(yù)測效果。此外，細(xì)胞病理學(xué)檢測可以是及時現(xiàn)場護(hù)理(例如，臨床序列測定系統(tǒng))的一部分，從而實現(xiàn)了活檢樣本的更快的分析以及與本文描述的系統(tǒng)和方法的互聯(lián)性。

細(xì)胞病理學(xué)可以是作為下述效果監(jiān)控步驟138的一部分的持續(xù)性護(hù)理的一部分。因此，可以進(jìn)行細(xì)胞病理學(xué)檢測并且與先前的細(xì)胞病理學(xué)檢測結(jié)果相比較以確定先前治療是否成功、繼續(xù)“觀察等待”的先前決定是否不再適當(dāng)、根據(jù)最近的細(xì)胞病理學(xué)檢測疾病狀態(tài)是否進(jìn)一步發(fā)展、或者疾病是否已經(jīng)對先前治療產(chǎn)生抗性、以及其它決定。

在步驟126中可以與在步驟122進(jìn)行細(xì)胞病理學(xué)檢測串行地(如所示出的)或并行地進(jìn)行基因檢測?；驒z測可以揭示活檢樣本的基因譜或基因圖譜、或其它信息?；蜃V或基因圖譜可以表達(dá)基因的突變以及本領(lǐng)域技術(shù)人員已知的其它基因標(biāo)記，例如對于表皮生長因子受體(egfr)的突變、間變型淋巴瘤激酶(alk)突變、和kirsten鼠肉瘤(kras)和其它鼠肉瘤(ras)家族成員突變來說，所討論的活檢可以為陽性的。這些突變中的每一種以及其它基因標(biāo)記與多種癌癥相關(guān)聯(lián)并且已經(jīng)在多種癌癥中被觀察到。在步驟126中進(jìn)行基因譜檢測或基因圖譜檢測，并且在步驟128中，數(shù)據(jù)存儲在數(shù)據(jù)庫500中。在步驟126中，對路徑規(guī)劃步驟110-114中識別的每個目標(biāo)均進(jìn)行基因檢測，這是由于盡管突變發(fā)生在同一患者體內(nèi)，但不同的目標(biāo)卻可能表達(dá)不同的突變或不表達(dá)突變。如本領(lǐng)域技術(shù)人員將認(rèn)識到的，本文所能想到的類型的基因譜檢測需要使用專業(yè)的實驗室設(shè)施并且可能需要一些時間來執(zhí)行。因此，在以下步驟之間可能存在延遲：在步驟120中執(zhí)行活檢，在步驟122和126中進(jìn)行細(xì)胞病理學(xué)檢測和基因譜檢測，和方法100的后續(xù)步驟。當(dāng)前的技術(shù)使得結(jié)果最快24小時內(nèi)能夠被處理，但可以想到，隨著技術(shù)的發(fā)展，將發(fā)展出實時基因譜檢測，使得能夠?qū)崟r現(xiàn)場地進(jìn)行基因譜檢測，并且進(jìn)一步簡化疾病的識別和治療的過程。

如同成像和細(xì)胞病理學(xué)檢測，活檢樣本的基因圖譜檢測可以是作為下述的效果監(jiān)控步驟138的一部分的持續(xù)性護(hù)理的一部分。因此，基因圖譜可以被獲取并且與先前的基因圖譜進(jìn)行對比以確定先前治療是否成功、繼續(xù)“觀察等待”的先前決定是否不再適當(dāng)、或者所述疾病是否已經(jīng)以一些方式進(jìn)一步突變。此外，這些基因圖譜中的每一個均存儲在數(shù)據(jù)庫500中。

基因圖譜數(shù)據(jù)可以不僅限于對于具體位置的癌癥(例如肺、肝、胃等)的基因圖譜檢測的數(shù)據(jù)。相反，如果可行，數(shù)據(jù)庫500可以包括多種癌癥的數(shù)據(jù)，許多癌癥與個體患者“p”完全無關(guān)。雖然通常不考慮用于治療，但在例如患者“p”的肺中的腫瘤與取自不同患者的肝的腫瘤表達(dá)相同的突變的情況下，該數(shù)據(jù)可以證實在確定用于患者“p”的治療選項時是有用的。因此，如下面將討論的，與典型的肺癌治療方案相比，患者“p”的治療方案可能更近似于肝癌治療方案。例如，如果微波消融是所期望的治療方案，當(dāng)考慮到該基因圖譜數(shù)據(jù)時，消融的功率和持續(xù)時間設(shè)定可能與肝癌治療方案中的設(shè)定更緊密地相關(guān)，其中該類型的肝癌治療方案已經(jīng)證實在肝癌的治療中是有效的。通過對數(shù)據(jù)庫500中的數(shù)據(jù)進(jìn)行集合(collection)和交叉引用來實現(xiàn)來自具體的活檢樣本的基因譜和細(xì)胞病理學(xué)的數(shù)據(jù)的其他的關(guān)聯(lián)性。

在步驟130中，臨床醫(yī)生可以使用計算機(jī)系統(tǒng)314來訪問數(shù)據(jù)庫500以將患者“p”的數(shù)據(jù)與先前已經(jīng)進(jìn)行治療的其它個體的數(shù)據(jù)進(jìn)行對比，所述數(shù)據(jù)庫500可以被存儲在本地或存儲在服務(wù)器212上?？商娲兀R床醫(yī)生可以使用能夠訪問網(wǎng)絡(luò)400(具體地能夠訪問圖4中所示的服務(wù)器212)的任何計算裝置402。這使得臨床醫(yī)生能夠?qū)嵤〆mn，收集活檢樣本，執(zhí)行細(xì)胞病理學(xué)檢測和基因檢測，并且隨后在將來瀏覽該患者“p”的綜合結(jié)果。所述計算裝置402可以是筆記本電腦、平板電腦、智能手機(jī)、臺式機(jī)、或任何其它能夠聯(lián)網(wǎng)的裝置。

通過對基因譜或基因圖譜與細(xì)胞病理學(xué)信息并且進(jìn)一步與如下數(shù)據(jù)進(jìn)行交叉引用，數(shù)據(jù)庫500的字段可以填充有來自人數(shù)不斷增加的患者的實際數(shù)據(jù)，所述細(xì)胞病理學(xué)信息與癌癥的存在(并且更重要地與具體類型的癌癥的存在)相關(guān)，所述如下數(shù)據(jù)例如為患者的年齡、性別、種族、癌癥的位置、醫(yī)療歷史、指定的標(biāo)準(zhǔn)治療方案、采取的治療類型以及效果的觀察。該數(shù)據(jù)隨后當(dāng)治療具體的患者以及用于進(jìn)一步的分析時可以由臨床醫(yī)生訪問以便確定數(shù)據(jù)之間的關(guān)聯(lián)度、確定不同的治療對于多組和多種類型的患者的潛在效果，并且制訂標(biāo)準(zhǔn)治療方案的修改方案。有效地，通過足夠的患者數(shù)據(jù)，可以為臨床醫(yī)生提供越來越強(qiáng)的預(yù)測能力以用于在確定對于尋求治療的具體的患者“p”來說的最佳的治療方案。

在本公開的一個實施例中，服務(wù)器212是能夠?qū)崿F(xiàn)經(jīng)由因特網(wǎng)來訪問的網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器。此外，經(jīng)由連接到計算機(jī)系統(tǒng)314或裝置402，網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器212運行軟件以向臨床醫(yī)生展示一系列網(wǎng)頁，一個這種網(wǎng)頁在圖6中示出。通過在服務(wù)器212上運行的軟件所展示的其它網(wǎng)頁可以包括通過引用并入本文的美國臨時專利和實用新型申請no.62/020,240和no.13/838,805中描述的那些網(wǎng)頁。

圖6是示例性網(wǎng)頁600，所述網(wǎng)頁600在步驟132中顯示為患者“p”確定細(xì)胞病理學(xué)和/或基因譜的類似情況的分析步驟130的結(jié)果。網(wǎng)頁600提供具體患者“p”的數(shù)據(jù)與其它患者(其樣本先前已經(jīng)收集并且分析)的存儲在數(shù)據(jù)庫500中的數(shù)據(jù)進(jìn)行對比的分析。網(wǎng)頁600識別患者姓名和該患者的醫(yī)療記錄號以及該患者“p”的護(hù)理團(tuán)隊的身份。網(wǎng)頁600包括多個字段，所述字段可以使用以下數(shù)據(jù)的組合來填充：數(shù)據(jù)庫500的與具體的患者“p”相關(guān)的數(shù)據(jù)、基于該患者的數(shù)據(jù)與具有某種程度的相似性的其它患者的數(shù)據(jù)的對比而產(chǎn)生的數(shù)據(jù)、和從其它數(shù)據(jù)庫檢索到的數(shù)據(jù)。

在網(wǎng)頁600上，結(jié)果標(biāo)題602可以用于提供患者“p”的診斷的綜述。如圖6所示，該綜述是由病理學(xué)家識別的癌癥的類型(例如腺癌)的標(biāo)識。在結(jié)果標(biāo)題602下方是與患者“p”相關(guān)的數(shù)據(jù)的一系列字段。每一個字段均具有標(biāo)簽604，所述標(biāo)簽604各自呈現(xiàn)為“成像”、“病理學(xué)”、“分子”、和“功能”。在不偏離本公開的范圍的前提下可以提供其它標(biāo)簽604。患者“p”的存在于數(shù)據(jù)庫500中的與每個標(biāo)簽604相關(guān)的內(nèi)容的概述緊鄰這些標(biāo)簽的每一個。針對成像，標(biāo)識出了目標(biāo)的尺寸和位置。針對病理學(xué)，呈現(xiàn)了癌癥的類型和細(xì)胞病理學(xué)檢測的其它信息?；蜃V檢測或基因檢測的結(jié)果(例如，突變的識別)緊鄰標(biāo)注為分子的標(biāo)簽604。在該示例中與患者“p”的肺功能相關(guān)的其它因素的評估緊鄰標(biāo)注為功能的標(biāo)簽。其它標(biāo)簽可以包括對于患者的耐受治療選項(例如化療、放射、和/或外科手術(shù))的嚴(yán)酷性的能力的評估，以及關(guān)于所述患者的其它數(shù)據(jù)。

其他字段606描繪了待治療的目標(biāo)608的示例性圖像。通過點擊圖像或附近的成像按鈕604，網(wǎng)頁600可以展示顯示ct圖像數(shù)據(jù)的新的窗口或網(wǎng)頁、或呈現(xiàn)如路徑規(guī)劃模塊210中所見的形式的圖像數(shù)據(jù)。ct圖像數(shù)據(jù)的這種瀏覽使得臨床醫(yī)生能夠?qū)D像數(shù)據(jù)相對于所述目標(biāo)定向并且確認(rèn)關(guān)于所述目標(biāo)608的信息。類似地，通過點擊或選擇任何按鈕604，可以為臨床醫(yī)生呈現(xiàn)新的網(wǎng)頁，所述新的網(wǎng)頁包括數(shù)據(jù)庫500中的個體患者“p”的詳細(xì)信息。

圖6中的字段610呈現(xiàn)出患者“p”可用的治療選項。這些治療選項可以包括“標(biāo)準(zhǔn)治療方案”，所述“標(biāo)準(zhǔn)治療方案”通常被認(rèn)為是由醫(yī)學(xué)專家接受為對于某種類型的疾病的適當(dāng)治療并且被健康護(hù)理專業(yè)人員廣泛使用的治療方案。這也被稱為最佳實踐、標(biāo)準(zhǔn)醫(yī)療護(hù)理、和標(biāo)準(zhǔn)療法。對于具體的醫(yī)療實踐，標(biāo)準(zhǔn)治療方案可以由例如美國國家衛(wèi)生研究院的國家癌癥研究所、或地方性或區(qū)域性的管理機(jī)構(gòu)設(shè)定。針對具體的癌癥的標(biāo)準(zhǔn)治療方案將取決于癌癥的尺寸、位置和分散，并且可以包括手術(shù)切除、肺葉切除、放射、放射外科手術(shù)、化療、靶向療法、光動力療法、電凝止血、生物靶向療法、免疫療法、外部或內(nèi)部放射療法、和其它療法以及這些療法的有序組合。

雖然具體疾病的標(biāo)準(zhǔn)治療方案是推薦的治療方案，但臨床醫(yī)生將立即認(rèn)識到可以有理由不遵照標(biāo)準(zhǔn)治療方案。例如，如果用于具體疾病的標(biāo)準(zhǔn)治療方案是外科手術(shù)，但患者年老體弱并且可能未必能夠承受外科手術(shù)的壓力，與患者磋商的臨床醫(yī)生可能決定標(biāo)準(zhǔn)治療方案不適合于該具體的患者。為了輔助這些情況，字段610還可以標(biāo)識是否存在正在進(jìn)行的“臨床試驗”，臨床醫(yī)生可能對于所述臨床試驗感興趣并且所述患者可能希望參與所述臨床試驗中以便接受研發(fā)中的治療。特別地如果認(rèn)為所述標(biāo)準(zhǔn)治療方案已經(jīng)無效或在其他方面是不合需要的，這些臨床試驗對于患者來說可以是非常重要的。其他的治療選項是可以使用臨床研究性治療，例如，通過美國食品和藥物管理局?jǐn)U大用藥計劃(expandedaccessprograms)(特許使用治療)。這些臨床研究性治療通常是患者通過臨床試驗所能獲得的相同的療法，但不需要參與試驗，并且不冒有接受安慰劑(對于一部分試驗人員來說是常見的)的風(fēng)險。在網(wǎng)頁600上選擇字段610中的指定治療選項中的一個將為臨床醫(yī)生提供與該選項的細(xì)節(jié)相關(guān)的更多信息。

使用本文所述的系統(tǒng)的臨床醫(yī)生可用的治療選項的一些細(xì)節(jié)僅作為對數(shù)據(jù)庫500中的數(shù)據(jù)進(jìn)行集合、交叉引用和排序的結(jié)果而獲得。由于先前收集的數(shù)據(jù)(包括與用于患者的選定治療方案以及如下詳述的觀察效果相關(guān)的數(shù)據(jù))，為臨床醫(yī)生提供了更多精細(xì)的數(shù)據(jù)以與患者“p”進(jìn)行對比并且提供診斷信息和預(yù)后信息，所述先前收集的數(shù)據(jù)在數(shù)據(jù)庫500中進(jìn)行集合、存儲且交叉引用。包括細(xì)胞病理學(xué)、基因譜、治療選項和觀察的治療效果的信息的增加的精細(xì)度或細(xì)致性(particularity)允許臨床醫(yī)生和患者制訂圖6中所示的個性化的治療規(guī)劃。網(wǎng)頁600上示出的另一字段是個性化規(guī)劃612。該個性化規(guī)劃顯示了在考慮了上述所有信息之后，與患者“p”和護(hù)理團(tuán)隊就如何治療具體患者進(jìn)行商討而決定的治療方案。

如本領(lǐng)域技術(shù)人員將理解的，數(shù)據(jù)庫500中的數(shù)據(jù)(包括成像數(shù)據(jù)、導(dǎo)航數(shù)據(jù)、活檢數(shù)據(jù)、基因數(shù)據(jù)等)可以被單獨地存儲，和/或一起被注釋為復(fù)合報告(包括疊加在成像數(shù)據(jù)集上)。此外，后續(xù)的活檢以及與其相關(guān)聯(lián)的數(shù)據(jù)可以按時序疊加以用于對一個患者或聚集的患者群體(pool)進(jìn)行縱向研究(在時間上參考結(jié)果/效果)。數(shù)據(jù)庫500中的數(shù)據(jù)可以用于制訂新的臨床試驗。在本公開的至少一個實施例中，數(shù)據(jù)庫500中的數(shù)據(jù)可以以開源的形式被提供以用于由其它內(nèi)科醫(yī)生或臨床醫(yī)生訪問，并且將治療選項、決定、和預(yù)測效果通知給更廣泛的臨床醫(yī)生群體。

在一個實施例中，字段612中描繪的個性化規(guī)劃和所推薦的一系列治療方案由在服務(wù)器212上運行的軟件產(chǎn)生。在這種情況中，所述軟件對比數(shù)據(jù)庫500中的數(shù)據(jù)，并且基于所有可用數(shù)據(jù)識別用于患者“p”的足夠數(shù)量的類似情況(analogues)。識別的類似情況的治療選項隨后被匯編，并且可以由軟件選取出現(xiàn)間隔位于預(yù)定閾值之上的治療選項?？商娲?，軟件可以選取選定數(shù)量的最經(jīng)常應(yīng)用的治療選項。在另一替代方案中，所有選定的治療選項均基于觀察的患者效果進(jìn)行排名，并且具有最佳效果的治療選項被提供給臨床醫(yī)生。更進(jìn)一步地，在多種不同治療的治療方案被識別的情況下，在個性化規(guī)劃612中，所述治療方案也被提供給臨床醫(yī)生。此外，基于數(shù)據(jù)庫500中記錄的先前治療的數(shù)據(jù)以及患者“p”與存儲在數(shù)據(jù)庫500中的先前患者的數(shù)據(jù)之間的其他相關(guān)數(shù)據(jù)，對于每一個治療選項，可以提供頻率、功率、持續(xù)時間、劑量、組合治療選項、和其它內(nèi)容的具體細(xì)節(jié)以使得能夠選取非常具體的治療規(guī)劃從而最佳地治療患者“p”，所述先前的治療對于具有最相似的疾病、疾病狀態(tài)的患者具有最成功的效果。

此外，治療選項的排序或排名還可以基于：具體的腫瘤類型和亞型、腫瘤和其它非癌組織的基因圖譜、疾病階段和位置、類似群體的患者數(shù)據(jù)(包括例如種族、民族、年齡、家族歷史)、具體的治療類型的報告治療效果，所述效果包括總體無惡化生存期、總生存期、復(fù)發(fā)時間和/或抗性、和抗性類型(突變類型)。此外，數(shù)據(jù)也可以被反向排序，其中，基于基因突變、治療和效果篩選數(shù)據(jù)。在這種情況中，輸出確定哪個年齡組、種族組、民族組、家族歷史組等具有最佳的反應(yīng)，并且對該組進(jìn)行全基因組測序(在非腫瘤組織上)以識別癌癥和非癌癥相關(guān)的基因以有助于理解預(yù)后/疾病機(jī)理。

作為其他替代方案，數(shù)據(jù)庫500可以由臨床醫(yī)生直接搜索，使得臨床醫(yī)生無論有無軟件參數(shù)限制均能夠作出其自己的評估。例如，臨床醫(yī)生可以使用表單(未示出)實施搜索，其中臨床醫(yī)生輸入或選擇被確定為最重要的數(shù)據(jù)。在一種情況中，該數(shù)據(jù)可以是病理學(xué)、基因譜、和患者的年齡。這種簡單查詢的結(jié)果將使得臨床醫(yī)生能夠瀏覽與患者“p”具有相同的細(xì)胞病理學(xué)和/或基因譜的類似年齡的個體的治療和效果。通過這種數(shù)據(jù)，臨床醫(yī)生和護(hù)理團(tuán)隊可以評估如何對于患者“p”最佳地繼續(xù)治療。可替代地，所述軟件可以考慮所述查詢，并且僅基于所述查詢?yōu)槊看嗡阉鲌蟾婊嘏琶蟮闹委熯x項和期望的治療效果。如將理解的，先前患者和當(dāng)前患者“p”之間的相似程度越大，具有成功效果的治療在當(dāng)前患者“p”中可以被重復(fù)的可信度就越大。因此，臨床醫(yī)生考慮軟件的推薦并且隨后察看位于下面的數(shù)據(jù)并且作出額外的對比的能力可以是非常有用的。所述軟件使得被識別為類似情況的先前患者的整個檔案能夠被臨床醫(yī)生瀏覽以考慮識別的類似情況是否應(yīng)當(dāng)被包括在用于制訂個性化規(guī)劃的組中或從所述組中移除。如將被理解的，臨床醫(yī)生能夠搜索的數(shù)據(jù)庫500中的數(shù)據(jù)(除了在具體的內(nèi)科醫(yī)生的護(hù)理下的那些患者的患者數(shù)據(jù)之外)將被擦除身份證明數(shù)據(jù)，并且不能展示與隱私保護(hù)法規(guī)相抵觸的信息。

圖6中的網(wǎng)頁600還包括標(biāo)簽614，所述標(biāo)簽614將臨床醫(yī)生指引到文獻(xiàn)和其他信息，所述文獻(xiàn)和其他信息在評估診斷和制訂個性化規(guī)劃612中可能與臨床醫(yī)生有關(guān)。標(biāo)簽614可以包括治療方案、具體的治療的潛在副作用、以及其它內(nèi)容。該數(shù)據(jù)可以存在于數(shù)據(jù)庫500中，或者在服務(wù)器212上運行的軟件可以將臨床醫(yī)生指引到能夠獲取到信息的適當(dāng)位置，所述適當(dāng)位置例如美國國家衛(wèi)生研究院或英國國民保健制度(nationalhealthservice)的網(wǎng)站、或這種信息的其它相關(guān)的知識庫。

在瀏覽了與步驟132和網(wǎng)頁600相關(guān)的上述所有可用數(shù)據(jù)之后，護(hù)理團(tuán)隊決定具體的治療規(guī)劃(如在字段612中體現(xiàn)的)，所述治療規(guī)劃存儲在數(shù)據(jù)庫500中并且隨后被實施。在步驟134中進(jìn)行治療。

在一個示例中，微波消融導(dǎo)管324被插入ewc318中并且進(jìn)入目標(biāo)，并且施加微波消融能量以治療所述目標(biāo)?？梢圆捎枚喾N功率設(shè)定、持續(xù)時間、循環(huán)信息、和其它治療選項以最有效地治療腫瘤而不會不必要地影響鄰近的組織。此外，隨后可實施多種組合治療選項，包括在消融之后進(jìn)行化療、放射、或其它療法。治療134的發(fā)生被記錄到數(shù)據(jù)庫500中，所記錄的內(nèi)容包括與所述治療有關(guān)的任何相關(guān)因素。例如，如果確定將通過微波消融來進(jìn)行治療，則其它因素可以包括功率、持續(xù)時間、治療的循環(huán)數(shù)量、被治療的位置的數(shù)量等。類似地，如果通過外科手術(shù)來進(jìn)行治療，所包括的額外因素可以到達(dá)手術(shù)部位的途徑(從前部或從后部)、外科手術(shù)的持續(xù)時間等?；蛘呷绻M(jìn)行組合治療，則所包括的額外因素可以為藥物療法的類型和劑量和相關(guān)放射參數(shù)。這些數(shù)據(jù)又被記錄在數(shù)據(jù)庫500中以便用于包括在個體患者“p”的記錄中、并且在為隨后的患者制定治療規(guī)劃時用于對比和使用。

在進(jìn)行了治療134，并且在步驟136將治療數(shù)據(jù)存儲到數(shù)據(jù)庫500之后，患者的醫(yī)生將對患者進(jìn)行嚴(yán)格管理的后續(xù)復(fù)查以觀察所述治療的有效性由此允許實施效果監(jiān)控138。這可以包括對被治療的目標(biāo)進(jìn)行成像。這些圖像將存儲在數(shù)據(jù)庫500中以使得它們能夠由患者“p”的護(hù)理團(tuán)隊獲得，并且允許其他臨床醫(yī)生當(dāng)對其患者做出治療決定時考慮治療的有效性(如上關(guān)于步驟132所述)。作為后續(xù)觀察的一部分的圖像可以與臨床醫(yī)生對于治療的其他觀察結(jié)果一起存儲在數(shù)據(jù)庫500中，使得治療的所有這種經(jīng)驗數(shù)據(jù)可以由這些其他患者及其內(nèi)科醫(yī)生獲得并且考慮，所述其他觀察結(jié)果包括對于患者來說的不適應(yīng)之處，例如惡心、虛弱、脫發(fā)等。

當(dāng)患者第二次和隨后多次經(jīng)歷這些步驟時，這些效果監(jiān)控步驟138可以與步驟102-106相分離，或者可以是步驟102-106的一部分。由此對于患者進(jìn)行持續(xù)性護(hù)理，其中，所述患者的具體治療是為其個性化制定的并且基于具體地影響其自身和其癌癥的可能的最廣泛的知識，并且此外能夠用于其它患者以及由臨床醫(yī)生獲得以在其治療其他患者時做出考慮。

持續(xù)性治療的其他益處是收集與病變突變的頻率和時機(jī)相關(guān)的統(tǒng)計數(shù)據(jù)。每當(dāng)無論進(jìn)行細(xì)胞病理學(xué)檢測或是進(jìn)行基因譜檢測時，都會捕捉所討論的疾病的額外的數(shù)據(jù)點。該數(shù)據(jù)可以在數(shù)據(jù)庫中聚集以確定所述疾病的變化和突變是否存在任何規(guī)律性。此外，基于額外的數(shù)據(jù)，可以評估突變的可能性。例如，可以確定在老年患者中發(fā)現(xiàn)的團(tuán)塊即使不進(jìn)行治療也將不會顯著地突變或變?yōu)閷@著影響患者的預(yù)期壽命的更致命的形式，而兒童中的表達(dá)相同的基因譜和細(xì)胞病理學(xué)譜的相同的團(tuán)塊可以預(yù)期將突變并且快速發(fā)展并且因此需要非常不同的治療方案。

此外，存儲在數(shù)據(jù)庫500中的數(shù)據(jù)可以限定至今未知的早期檢測的團(tuán)塊和晚期癌癥之間的關(guān)聯(lián)性。這種關(guān)聯(lián)性允許通過更好地限定如與可以接受更漸進(jìn)的治療方案而不會增加的死亡可能性的那些表現(xiàn)型相比，即使目前是良性的也需要立即采取積極治療的那些表現(xiàn)型來實現(xiàn)更高水平的積極效果。

本文描述的是用于獲取目標(biāo)的樣本并且治療疾病的幾個選項。emn系統(tǒng)300對于通過活檢針或活檢鉗來進(jìn)行活檢取樣特別有用。此外，還想到使用emn系統(tǒng)300以便使用如圖3所示的柔性微波導(dǎo)管324對目標(biāo)進(jìn)行微波消融。然而，在本公開的范圍內(nèi)，還可以想到其它已知的技術(shù)以用于數(shù)據(jù)產(chǎn)生和治療。例如，已知腫瘤組織與周圍組織相比通常具有不同的細(xì)胞結(jié)構(gòu)和組成。因此，腫瘤和病變與健康組織相比呈現(xiàn)不同的光譜響應(yīng)，即，腫瘤組織與周圍組織發(fā)出不同的能量。因此，光譜響應(yīng)的這種差異可以被測量并且用于提供關(guān)于腫瘤的位置、界限(meetsandbounds)的更大的清晰度，并且保證布置。在這個方面，腫瘤或病變具有光譜指紋圖譜，所述光譜指紋圖譜可以用于區(qū)分腫瘤或病變與周圍組織。因此，本公開的一個實施例使用電磁信號發(fā)射器(例如，微波信號發(fā)射器、紅外線信號發(fā)射器等)，所述電磁信號發(fā)射器發(fā)射非治療水平的信號。腫瘤或病變將吸收所述信號(健康組織也將吸收)，但腫瘤或病變與健康組織相比對這種能量將發(fā)射非常不同的響應(yīng)。響應(yīng)的這種差異(例如，吸收的能量的發(fā)射率)可以使用接收器(例如，微波天線接收器或光纖束(fiberopticstrand)接收器)來測量并且分析接收的信號以區(qū)分組織。該所接收的發(fā)射信號隨后可以存儲在數(shù)據(jù)庫500中以用于與該腫瘤相關(guān)的又一數(shù)據(jù)點，所述數(shù)據(jù)點在后續(xù)程序中可以用于具體的患者以及用于其它患者的疾病的進(jìn)行比較目的。在本公開的一個方面中，這種“光譜指紋圖譜(fingerprint)”可以用于為細(xì)胞病理學(xué)家提供引導(dǎo)或作為對于細(xì)胞病理學(xué)結(jié)果的確認(rèn)。此外，隨著更多的數(shù)據(jù)被收集并且光譜指紋圖譜的置信區(qū)間增加，臨床醫(yī)生可以充分地信賴這種數(shù)據(jù)使得甚至在接收到細(xì)胞病理學(xué)檢測結(jié)果和基因檢測結(jié)果之前，也可以基于這種數(shù)據(jù)開始治療。

本公開的另一實施例涉及標(biāo)記的使用。如上所述，在emn系統(tǒng)300的使用期間，現(xiàn)實的和虛擬的基準(zhǔn)標(biāo)記可以被布置在患者或圖像數(shù)據(jù)文件中。然而，在不偏離本公開的范圍的前提下，也可以使用多種其它類型的標(biāo)記。例如，在基因檢測之后，可以確定所期望的行動步驟是“觀察等待”方法。在這種情況中，可能希望在可能的范圍內(nèi)將腫瘤與健康的組織隔離開。實現(xiàn)該目的的一種方法是使用交聯(lián)劑，所述交聯(lián)劑對特定的基因突變具有特定的親和力。這些材料可以經(jīng)由活檢針被注射到腫瘤中，并且隨著時間的推移將會交聯(lián)以基本上硬化所述團(tuán)塊或腫瘤。這可能有利于實現(xiàn)腫瘤的觸診，或者增加腫瘤的可見性。在本公開的一個方面中，交聯(lián)劑具有與其相關(guān)聯(lián)的著色劑，例如，熒光鏡檢查染料或自發(fā)熒光染料。這些技術(shù)也使得所述腫瘤或團(tuán)塊在后續(xù)emn程序中更容易被發(fā)現(xiàn)，并且實現(xiàn)腫瘤的可視化?？梢杂糜趯⒛[瘤與周圍組織隔離開并且使得腫瘤更容易識別的其它材料包括對腫瘤進(jìn)行染色的磁性顆?；旌衔铩?/p>

雖然為了說明和描述的目的已經(jīng)參考附圖詳細(xì)地描述了實施例，但應(yīng)當(dāng)理解，本發(fā)明的方法和裝置將不被解釋為限制性的。對本領(lǐng)域技術(shù)人員來說將顯而易見的是，在不偏離本公開的范圍的前提下，可以做出對前述實施例的各種修改。