技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明涉及一種利用SNP聚類和PAV變異進(jìn)行親本選擇的基因組信息輔助育種方法。本發(fā)明的實(shí)質(zhì)是借助基因組學(xué)和生物信息學(xué)方法，獲得候選親本的基因組測(cè)序信息，一方面通過序列比對(duì)獲得高質(zhì)量SNP數(shù)據(jù)集并計(jì)算候選親本的遺傳距離矩陣，借助聚類樹判斷候選親本間的親緣關(guān)系；另一方面，將Denovo組裝的候選親本contig定位到參考基因組，再根據(jù)物理位置獲取候選親本目標(biāo)性狀相關(guān)基因的PAV變異。結(jié)合PAV變異和基于SNP的親緣關(guān)系信息，從大量候選親本中篩選出親本子集用于表型鑒定；最終結(jié)合親本子集的表型鑒定結(jié)果確定入選育種親本。該方法屬于水稻分子育種領(lǐng)域，能夠從大量的候選親本中有效的縮小用于表型鑒定的材料范圍，減少表型鑒定的工作量，提高育種工作效率。

技術(shù)研發(fā)人員：鄭天清;黎志康;韋朝春;王文生;胡智強(qiáng);余泓;王春超;傅彬英;趙秀琴;高用明;周永力;張帆
受保護(hù)的技術(shù)使用者：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所
文檔號(hào)碼：201610351525
技術(shù)研發(fā)日：2016.05.26
技術(shù)公布日：2016.11.30