技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明提供了一種基于模塊化因子圖的骨髓瘤信號(hào)通路機(jī)制確認(rèn)方法,該方法包括:步驟1、獲取RPPA數(shù)據(jù);步驟2、對(duì)所述RPPA數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理,粗粒度篩選關(guān)鍵蛋白質(zhì);步驟3、基于所述粗粒度篩選的關(guān)鍵蛋白質(zhì),構(gòu)建在細(xì)胞剛性環(huán)境下,細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的相互作用通路,形成信號(hào)通路;步驟4、采用常微分方程描述所述信號(hào)通路,并將所述信號(hào)通路分解成多個(gè)小模塊,針對(duì)每個(gè)所述小模塊,進(jìn)行參數(shù)優(yōu)化,建立系統(tǒng)生物學(xué)模型;步驟5、對(duì)所述系統(tǒng)生物學(xué)模型進(jìn)行參數(shù)分析,所述參數(shù)分析包括穩(wěn)定性分析和敏感性分析。本發(fā)明的方法有效降低了信號(hào)通路檢測(cè)中系統(tǒng)模型的計(jì)算成本,提高了計(jì)算效率。
技術(shù)研發(fā)人員:章樂(lè);孔美靜
受保護(hù)的技術(shù)使用者:西南大學(xué)
文檔號(hào)碼:201610846098
技術(shù)研發(fā)日:2016.09.23
技術(shù)公布日:2017.03.15