本發(fā)明涉及生物分析研究領(lǐng)域，具體地，涉及一種生物分析平臺(tái)中的工程項(xiàng)目發(fā)布系統(tǒng)。

背景技術(shù)：

生物信息分析是在生命科學(xué)的研究中，以計(jì)算機(jī)為工具對(duì)生物信息進(jìn)行儲(chǔ)存、檢索和分析，分析基因序列中表達(dá)的結(jié)構(gòu)功能的生物信息。從事生命科學(xué)的科研人員在闡述生物信息分析目標(biāo)時(shí)，沒(méi)有一個(gè)成熟、準(zhǔn)確、專(zhuān)門(mén)針對(duì)生物信息分析，并能智能收集用戶(hù)操作習(xí)慣的項(xiàng)目發(fā)布方法。

現(xiàn)有的生物信息分析工程項(xiàng)目發(fā)布方法為：用戶(hù)根據(jù)自己的習(xí)慣或者需要，通過(guò)粗糙的描述進(jìn)行任務(wù)發(fā)布，一方面不便于用戶(hù)使用，增加了相應(yīng)的工作量，另一方面容易導(dǎo)致任務(wù)信息發(fā)布不準(zhǔn)確，并且不便于工程項(xiàng)目實(shí)施者準(zhǔn)確的獲得項(xiàng)目信息，導(dǎo)致工程項(xiàng)目無(wú)法順利完成。

綜上所述，本申請(qǐng)發(fā)明人在實(shí)現(xiàn)本申請(qǐng)發(fā)明技術(shù)方案的過(guò)程中，發(fā)現(xiàn)上述技術(shù)至少存在如下技術(shù)問(wèn)題：

在現(xiàn)有技術(shù)中，現(xiàn)有的生物工程項(xiàng)目發(fā)布存在效率和準(zhǔn)確率較低，項(xiàng)目信息不完善，容易導(dǎo)致項(xiàng)目無(wú)法順利完成的技術(shù)問(wèn)題。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素：

本發(fā)明提供了一種生物分析平臺(tái)中的工程項(xiàng)目發(fā)布系統(tǒng)，解決了現(xiàn)有的生物工程項(xiàng)目發(fā)布存在效率和準(zhǔn)確率較低，項(xiàng)目信息不完善，容易導(dǎo)致項(xiàng)目無(wú)法順利完成的技術(shù)問(wèn)題，實(shí)現(xiàn)了通過(guò)本申請(qǐng)中系統(tǒng)，用戶(hù)通過(guò)簡(jiǎn)單的選擇和輸入能夠快速高效的完成工程項(xiàng)目的發(fā)布，且發(fā)布的信息完善準(zhǔn)確，有助于項(xiàng)目順利完成技術(shù)效果。

為解決上述技術(shù)問(wèn)題，本申請(qǐng)?zhí)峁┝艘环N生物分析平臺(tái)中的工程項(xiàng)目發(fā)布系統(tǒng)，所述系統(tǒng)包括：

第一選擇單元，所述第一選擇單元用于選擇生物信息分析的物種、樣本來(lái)源、分析類(lèi)型；

第二選擇單元，所述第二選擇單元用于選擇測(cè)序產(chǎn)品或發(fā)布數(shù)據(jù)分析需求；

第三選擇單元，所述第三選擇單元用于選擇項(xiàng)目信息，包括：項(xiàng)目周期、預(yù)算，第三選擇單元用于輸入：研究分析背景、目標(biāo)、分析要求；

生成單元，所述生成單元用于基于第一選擇單元、第二選擇單元、第三選擇單元的選擇信息和輸入信息，生成工程項(xiàng)目信息；

發(fā)布單元，所述發(fā)布單元用于將生成的工程項(xiàng)目信息在生物分析平臺(tái)中發(fā)布。

其中，本申請(qǐng)技術(shù)方案的原理為：當(dāng)用戶(hù)需要發(fā)布工程項(xiàng)目時(shí)，首先利用第一選擇單元提供的選項(xiàng)，進(jìn)行選擇生物信息分析的物種、樣本來(lái)源、分析類(lèi)型，并對(duì)用戶(hù)選擇的信息進(jìn)行保存，然后利用第二選擇單元，用戶(hù)進(jìn)一步選擇測(cè)序產(chǎn)品或發(fā)布數(shù)據(jù)分析需求，并對(duì)用戶(hù)的選擇或發(fā)布的內(nèi)容進(jìn)行保存；然后利用第三選擇單元用戶(hù)選擇項(xiàng)目信息，包括：項(xiàng)目周期、預(yù)算，或者輸入：研究分析背景、目標(biāo)、分析要求；并對(duì)用戶(hù)的選擇和輸入內(nèi)容進(jìn)行保存；然后系統(tǒng)中的生成單元會(huì)根據(jù)用戶(hù)選擇的信息或者輸入的信息，生成一個(gè)完整的工程項(xiàng)目信息，最后利用發(fā)布單元在生物分析平臺(tái)中發(fā)布，便于相應(yīng)的生物工程師進(jìn)行完成。

其中，本申請(qǐng)中的系統(tǒng)首先進(jìn)行生物信息分析的物種、樣本來(lái)源、分析類(lèi)型，便于從整體上對(duì)生物分析項(xiàng)目奠定基調(diào)，然后選擇測(cè)序產(chǎn)品或發(fā)布數(shù)據(jù)分析需求，進(jìn)一步對(duì)項(xiàng)目的具體類(lèi)型進(jìn)行確定，最后選擇項(xiàng)目的具體信息，便于發(fā)布人員從整體到具體的細(xì)節(jié)進(jìn)行選擇，便于準(zhǔn)確的對(duì)項(xiàng)目信息進(jìn)行體現(xiàn)，邏輯清晰且符合生命科學(xué)人員的闡述路徑。

其中，分析的物種包括：人、動(dòng)物、植物、微生物、病毒；樣本來(lái)源包括：組織、器官、血液、根、莖、葉、花、果；分析類(lèi)型包括：DNA、RNA、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)。

其中，所述第二選擇單元具體包括：

形成模塊，所述形成模塊用于：根據(jù)歷史數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)不同分析類(lèi)型下選擇測(cè)序或數(shù)據(jù)分析的概率分布，形成不同分析類(lèi)型下的轉(zhuǎn)移概率矩陣；

選擇模塊，所述選擇模塊用于：讀取轉(zhuǎn)移概率矩陣中當(dāng)前分析類(lèi)型概率最大的測(cè)序或數(shù)據(jù)分析選項(xiàng)，并將讀取的選項(xiàng)內(nèi)容供用戶(hù)進(jìn)行選擇。

其中，當(dāng)四川用戶(hù)選擇“真核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序”的分析類(lèi)型后，系統(tǒng)自動(dòng)讀取當(dāng)前四川用戶(hù)在該分析類(lèi)型下各選項(xiàng)的轉(zhuǎn)移概率矩陣，發(fā)現(xiàn)在當(dāng)前其中選擇“標(biāo)準(zhǔn)化分析+個(gè)性化分析”的概率最大，并且其中個(gè)性化分析中選擇“qPCR驗(yàn)證結(jié)果分析”的概率最大，則默認(rèn)選中“標(biāo)準(zhǔn)化分析+個(gè)性化分析”，其中標(biāo)準(zhǔn)化分析內(nèi)容包括：1.數(shù)據(jù)過(guò)濾質(zhì)控及統(tǒng)計(jì)；2.與參考序列比對(duì)及統(tǒng)計(jì)、評(píng)估；3.基因和轉(zhuǎn)錄本表達(dá)定量分析；4.基因差異表達(dá)分析；5.差異基因的功能富集分析；6.差異基因?qū)哟尉垲?lèi)分析等，個(gè)性化分析內(nèi)容包括qPCR驗(yàn)證結(jié)果分析。用戶(hù)也可以選擇其他分析內(nèi)容。

進(jìn)一步的，當(dāng)用戶(hù)選擇測(cè)序產(chǎn)品時(shí)，所述第二選擇單元還用于引導(dǎo)用戶(hù)選擇測(cè)序品牌、打包產(chǎn)品或自定義產(chǎn)品。

進(jìn)一步的，所述第二選擇單元具體還用于：

根據(jù)歷史數(shù)據(jù)，統(tǒng)計(jì)不同地區(qū)的用戶(hù)在選擇測(cè)試產(chǎn)品時(shí)，選擇各個(gè)品牌的概率分布；

讀取品牌概率轉(zhuǎn)換矩陣中概率最大的品牌作為用戶(hù)的默認(rèn)品牌，引導(dǎo)用戶(hù)操作，并提供人工選擇其他品牌的功能。

例如：當(dāng)四川用戶(hù)選擇“真核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序”的類(lèi)型進(jìn)行測(cè)序時(shí)，系統(tǒng)自動(dòng)讀取當(dāng)前四川用戶(hù)在該分析類(lèi)型下選擇各測(cè)序品牌的轉(zhuǎn)移概率矩陣，發(fā)現(xiàn)選擇“華大基因”的概率最大，則默認(rèn)選擇華大基因的品牌。用戶(hù)也可以選擇其他品牌進(jìn)行調(diào)整。

進(jìn)一步的，當(dāng)用戶(hù)選擇數(shù)據(jù)分析時(shí)，所述第二選擇單元還用于引導(dǎo)用戶(hù)選擇測(cè)序品牌、打包產(chǎn)品或自定義產(chǎn)品。

進(jìn)一步的，所述第二選擇單元具體還用于：

根據(jù)歷史數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)在選擇該分析類(lèi)型時(shí)選擇標(biāo)準(zhǔn)化、個(gè)性化、定制化分析的概率分布；

讀取概率轉(zhuǎn)換矩陣中最大的選項(xiàng)作為用戶(hù)的默認(rèn)選擇，引導(dǎo)用戶(hù)操作，并提供人工切換的功能。

本申請(qǐng)?zhí)峁┑囊粋€(gè)或多個(gè)技術(shù)方案，至少具有如下技術(shù)效果或優(yōu)點(diǎn)：

實(shí)現(xiàn)了通過(guò)本申請(qǐng)中系統(tǒng)，用戶(hù)通過(guò)簡(jiǎn)單的選擇和輸入能夠快速高效的完成工程項(xiàng)目的發(fā)布，且發(fā)布的信息完善準(zhǔn)確，有助于項(xiàng)目順利完成技術(shù)效果。

附圖說(shuō)明

此處所說(shuō)明的附圖用來(lái)提供對(duì)本發(fā)明實(shí)施例的進(jìn)一步理解，構(gòu)成本申請(qǐng)的一部分，并不構(gòu)成對(duì)本發(fā)明實(shí)施例的限定；

圖1是本申請(qǐng)中生物分析平臺(tái)中的工程項(xiàng)目發(fā)布系統(tǒng)的組成示意圖；

圖2是本申請(qǐng)中有限狀態(tài)轉(zhuǎn)換示意圖；

圖3是本申請(qǐng)中有限狀態(tài)轉(zhuǎn)換示意圖；

圖4是本申請(qǐng)中有限狀態(tài)轉(zhuǎn)換示意圖。

具體實(shí)施方式

本發(fā)明提供了一種生物分析平臺(tái)中的工程項(xiàng)目發(fā)布系統(tǒng)，解決了現(xiàn)有的生物工程項(xiàng)目發(fā)布存在效率和準(zhǔn)確率較低，項(xiàng)目信息不完善，容易導(dǎo)致項(xiàng)目無(wú)法順利完成的技術(shù)問(wèn)題，實(shí)現(xiàn)了通過(guò)本申請(qǐng)中系統(tǒng)，用戶(hù)通過(guò)簡(jiǎn)單的選擇和輸入能夠快速高效的完成工程項(xiàng)目的發(fā)布，且發(fā)布的信息完善準(zhǔn)確，有助于項(xiàng)目順利完成技術(shù)效果。

為了能夠更清楚地理解本發(fā)明的上述目的、特征和優(yōu)點(diǎn)，下面結(jié)合附圖和具體實(shí)施方式對(duì)本發(fā)明進(jìn)行進(jìn)一步的詳細(xì)描述。需要說(shuō)明的是，在相互不沖突的情況下，本申請(qǐng)的實(shí)施例及實(shí)施例中的特征可以相互組合。

在下面的描述中闡述了很多具體細(xì)節(jié)以便于充分理解本發(fā)明，但是，本發(fā)明還可以采用其他不同于在此描述范圍內(nèi)的其他方式來(lái)實(shí)施，因此，本發(fā)明的保護(hù)范圍并不受下面公開(kāi)的具體實(shí)施例的限制。

實(shí)施例一：

請(qǐng)參考圖1-圖4，本申請(qǐng)?zhí)峁┝艘环N生物分析平臺(tái)中的工程項(xiàng)目發(fā)布系統(tǒng)，所述系統(tǒng)包括：

第一選擇單元，所述第一選擇單元用于選擇生物信息分析的物種、樣本來(lái)源、分析類(lèi)型；

第二選擇單元，所述第二選擇單元用于選擇測(cè)序產(chǎn)品或發(fā)布數(shù)據(jù)分析需求；

第三選擇單元，所述第三選擇單元用于選擇項(xiàng)目信息，包括：項(xiàng)目周期、預(yù)算，第三選擇單元用于輸入：研究分析背景、目標(biāo)、分析要求；

生成單元，所述生成單元用于基于第一選擇單元、第二選擇單元、第三選擇單元的選擇信息和輸入信息，生成工程項(xiàng)目信息；

發(fā)布單元，所述發(fā)布單元用于將生成的工程項(xiàng)目信息在生物分析平臺(tái)中發(fā)布。

本發(fā)明系統(tǒng)采用引導(dǎo)的形式，通過(guò)智能采集用戶(hù)操作習(xí)慣，針對(duì)生物信息分析項(xiàng)目引導(dǎo)科研人員發(fā)布快捷、專(zhuān)業(yè)的項(xiàng)目需求。

生物分析平臺(tái)中項(xiàng)目發(fā)布系統(tǒng)的引導(dǎo)過(guò)程描述：

1、首先系統(tǒng)引導(dǎo)選擇生物信息分析的物種和分析類(lèi)型；

2、針對(duì)不同類(lèi)型，系統(tǒng)引導(dǎo)用戶(hù)選擇測(cè)序或者數(shù)據(jù)分析內(nèi)容。本階段根據(jù)所選類(lèi)型的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)(當(dāng)前采用轉(zhuǎn)移概率矩陣)，引導(dǎo)用戶(hù)默認(rèn)選擇測(cè)序產(chǎn)品或者發(fā)布分析需求(提供人工切換功能)；

3、當(dāng)用戶(hù)選擇測(cè)序產(chǎn)品時(shí)，系統(tǒng)引導(dǎo)用戶(hù)選擇測(cè)序品牌、打包產(chǎn)品或自定義產(chǎn)品。本階段根據(jù)不同地區(qū)用戶(hù)不同類(lèi)型的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)，采用數(shù)理統(tǒng)計(jì)方法(當(dāng)前采用轉(zhuǎn)移概率矩陣)，引導(dǎo)用戶(hù)默認(rèn)選擇最可能的品牌、打包產(chǎn)品或自定義產(chǎn)品(提供人工切換功能)；

4、當(dāng)用戶(hù)選擇發(fā)布數(shù)據(jù)分析需求時(shí)，系統(tǒng)引導(dǎo)用戶(hù)選擇標(biāo)準(zhǔn)化、個(gè)性化、定制化分析內(nèi)容。本階段根據(jù)不同地區(qū)用戶(hù)不同類(lèi)型的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)，采用數(shù)理統(tǒng)計(jì)方法(當(dāng)前采用轉(zhuǎn)移概率矩陣)，引導(dǎo)用戶(hù)默認(rèn)選擇最可能的標(biāo)準(zhǔn)化、個(gè)性化、定制化分析內(nèi)容(提供人工切換功能)；

5、系統(tǒng)引導(dǎo)用戶(hù)選擇項(xiàng)目周期、預(yù)算，輸入研究分析背景、目標(biāo)、分析要求等信息。

系統(tǒng)中工程項(xiàng)目具體發(fā)布過(guò)程如下：

步驟1：選擇生物信息分析的物種和分析類(lèi)型；

(1)選擇物種及樣本來(lái)源，物種包括人、動(dòng)物、植物、微生物、病毒、其他等，樣本來(lái)源包括組織、器官、血液、根、莖、葉、花、果、其他等；

(2)選擇分析類(lèi)型，分析類(lèi)型包括DNA、RNA、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)4種大類(lèi)，每種大類(lèi)包括多個(gè)具體小的類(lèi)型，例如DNA大類(lèi)下包括動(dòng)植物de novo測(cè)序、微生物de novo測(cè)序、人全基因組重測(cè)序、動(dòng)植物全基因組重測(cè)序、目標(biāo)區(qū)域測(cè)序、全外顯子組測(cè)序、ChIP-seq、簡(jiǎn)化基因組-RAD等。

步驟2：針對(duì)不同類(lèi)型，引導(dǎo)用戶(hù)選擇測(cè)序或者數(shù)據(jù)分析內(nèi)容；

(1)根據(jù)歷史數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)不同分析類(lèi)型下選擇測(cè)序或者分析的概率分布，形成不同分析類(lèi)型下的轉(zhuǎn)移概率矩陣；有限狀態(tài)轉(zhuǎn)換如圖2所示。

(2)讀取轉(zhuǎn)移概率矩陣中當(dāng)前分析類(lèi)型概率最大的選項(xiàng)(測(cè)序或者數(shù)據(jù)分析)，引導(dǎo)用戶(hù)默認(rèn)進(jìn)入選擇測(cè)序產(chǎn)品或者發(fā)布數(shù)據(jù)分析需求，并提供人工切換的方式重新選擇測(cè)序產(chǎn)品或者發(fā)布數(shù)據(jù)分析需求。

步驟3：當(dāng)用戶(hù)選擇測(cè)序產(chǎn)品時(shí)，引導(dǎo)用戶(hù)選擇測(cè)序品牌、打包產(chǎn)品或自定義產(chǎn)品；

(1)根據(jù)歷史數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)不同地區(qū)的用戶(hù)在選擇測(cè)試產(chǎn)品時(shí)選擇各個(gè)品牌的概率分布；

(2)讀取概率轉(zhuǎn)換矩陣中概率最大的品牌作為用戶(hù)的默認(rèn)品牌，引導(dǎo)用戶(hù)操作，并提供人工選擇其他品牌的功能；有限狀態(tài)轉(zhuǎn)換如圖3所示。：

(3)根據(jù)歷史數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)在選擇各個(gè)品牌后選擇不同打包產(chǎn)品或自定義產(chǎn)品的概率分布，例如選擇“真核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序”的分析類(lèi)型后，再選擇“華大基因”品牌后，根據(jù)統(tǒng)計(jì)的概率轉(zhuǎn)換矩陣默認(rèn)選擇“真核鏈特異轉(zhuǎn)錄組”、“真核單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組”、“真核常規(guī)轉(zhuǎn)錄組”中概率最大的“真核鏈特異轉(zhuǎn)錄組”作為默認(rèn)選擇的產(chǎn)品，引導(dǎo)用戶(hù)進(jìn)行操作。

步驟4：當(dāng)用戶(hù)選擇數(shù)據(jù)分析時(shí)，引導(dǎo)用戶(hù)選擇測(cè)序品牌、打包產(chǎn)品或自定義產(chǎn)品；

(1)根據(jù)歷史數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)在選擇該分析類(lèi)型時(shí)選擇“標(biāo)準(zhǔn)化”、“個(gè)性化”、“定制化”分析的概率分布；

(2)讀取概率轉(zhuǎn)換矩陣中最大的選項(xiàng)作為用戶(hù)的默認(rèn)選擇，引導(dǎo)用戶(hù)操作，并提供人工切換的功能；有限狀態(tài)轉(zhuǎn)換如圖4所示。

(3)根據(jù)歷史數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)在選擇各個(gè)品牌后選擇“個(gè)性化”、“定制化”后用戶(hù)選擇不同模板內(nèi)容的概率分布，例如選擇“表達(dá)譜”的分析類(lèi)型后，根據(jù)統(tǒng)計(jì)概率默認(rèn)顯示標(biāo)準(zhǔn)化分析內(nèi)容“1.數(shù)據(jù)過(guò)濾質(zhì)控及統(tǒng)計(jì)；2.測(cè)序評(píng)估；3.基因表達(dá)注釋?zhuān)?.差異基因表達(dá)分析；5.組間差異基因表達(dá)分析；6.差異基因表達(dá)模式聚類(lèi)；7.GO功能分類(lèi)及富集分析；8.Pathway分類(lèi)及富集分析……”，并默認(rèn)選擇個(gè)性化分析中的“與其他組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)合分析；功能驗(yàn)證定制分析”這兩項(xiàng)。

步驟5：引導(dǎo)用戶(hù)選擇項(xiàng)目周期、預(yù)算，輸入研究分析背景、目標(biāo)、分析要求等信息

本申請(qǐng)?zhí)峁┑囊粋€(gè)或多個(gè)技術(shù)方案，至少具有如下技術(shù)效果或優(yōu)點(diǎn)：

實(shí)現(xiàn)了通過(guò)本申請(qǐng)中系統(tǒng)，用戶(hù)通過(guò)簡(jiǎn)單的選擇和輸入能夠快速高效的完成工程項(xiàng)目的發(fā)布，且發(fā)布的信息完善準(zhǔn)確，有助于項(xiàng)目順利完成技術(shù)效果。

盡管已描述了本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施例，但本領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)人員一旦得知了基本創(chuàng)造性概念，則可對(duì)這些實(shí)施例作出另外的變更和修改。所以，所附權(quán)利要求意欲解釋為包括優(yōu)選實(shí)施例以及落入本發(fā)明范圍的所有變更和修改。

顯然，本領(lǐng)域的技術(shù)人員可以對(duì)本發(fā)明進(jìn)行各種改動(dòng)和變型而不脫離本發(fā)明的精神和范圍。這樣，倘若本發(fā)明的這些修改和變型屬于本發(fā)明權(quán)利要求及其等同技術(shù)的范圍之內(nèi)，則本發(fā)明也意圖包含這些改動(dòng)和變型在內(nèi)。