技術(shù)特征:
技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開一種預(yù)測蛋白質(zhì)序列的遠(yuǎn)同源性關(guān)系的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)及方法,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)包括:依次連接的輸入層、LSTM層、隨時間分布的全連接層和輸出層,輸入層用于獲取輸入的原始的蛋白質(zhì)序列,將原始的蛋白質(zhì)序列轉(zhuǎn)換為神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)能夠處理的輸入矩陣;LSTM層用于捕捉蛋白質(zhì)序列中子序列間的依賴關(guān)系,在每個時間步上輸出當(dāng)前輸入子序列的特征;隨時間分布的全連接層對LSTM層中的不同memory?cell的輸出以不同的權(quán)重,匯總依賴關(guān)系信息;輸出層根據(jù)隨時間分布的全連接層在每個時間步上輸出連接而成的向量,預(yù)測蛋白質(zhì)序列的遠(yuǎn)同源性關(guān)系。本發(fā)明無需人工構(gòu)建特征和生成序列譜,節(jié)省了大量時間,并提高了預(yù)測的準(zhǔn)確性。
技術(shù)研發(fā)人員:劉濱;王曉龍
受保護(hù)的技術(shù)使用者:哈爾濱工業(yè)大學(xué)深圳研究生院
技術(shù)研發(fā)日:2017.06.16
技術(shù)公布日:2017.11.07