本發(fā)明涉及深度學(xué)習(xí)及計算機(jī)斷層掃描,特別涉及一種基于深度學(xué)習(xí)的ct全鏈條智能重建方法。
背景技術(shù):
1、計算機(jī)斷層成像技術(shù)(ct)因具備非侵入性三維高分辨率成像能力被廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)成像、安全檢查、工業(yè)檢測等重要領(lǐng)域。但是,醫(yī)學(xué)ct成像過高的輻射劑量使得人們對x射線帶來的潛在癌癥風(fēng)險擔(dān)擾。在保證圖像質(zhì)量的前提下,盡可能低的輻射劑量原則成為大家共同追求的目標(biāo)。降低掃描劑量不可避免在重建圖像中引入嚴(yán)重的噪聲偽影,進(jìn)而影響臨床診斷性能。因此,提高低劑量ct圖像質(zhì)量一直是醫(yī)學(xué)成像領(lǐng)域研究的關(guān)鍵技術(shù)之一。
2、近年來,深度學(xué)習(xí)技術(shù)已廣泛應(yīng)用醫(yī)學(xué)圖像重建并取得了前所未有的成功?;谏疃葘W(xué)習(xí)的低劑量ct數(shù)據(jù)重建算法已經(jīng)被大量開發(fā),通過數(shù)據(jù)驅(qū)動的方式學(xué)習(xí)ct重建管道中的關(guān)鍵模塊來增強(qiáng)圖像質(zhì)量,包括弦圖域網(wǎng)絡(luò)、圖像域網(wǎng)絡(luò)和雙域網(wǎng)絡(luò)。其中,弦圖域網(wǎng)絡(luò)直接恢復(fù)受噪聲影響的弦圖數(shù)據(jù),再通過濾波反投影重建ct圖像;圖像域網(wǎng)絡(luò)屬于圖像后處理技術(shù),通過學(xué)習(xí)低劑量圖像到目標(biāo)圖像的非線性映射實現(xiàn)噪聲的抑制;雙域網(wǎng)絡(luò)通過在弦圖域和圖像域之間構(gòu)建可微的濾波反投影層,實現(xiàn)弦圖子網(wǎng)絡(luò)和圖像子網(wǎng)絡(luò)的聯(lián)合優(yōu)化,充分利用弦圖數(shù)據(jù)的積分信息和圖像數(shù)據(jù)的組織結(jié)構(gòu)信息,進(jìn)一步提高圖像質(zhì)量。盡管上述方法均能較好地抑制圖像噪聲,但仍面臨著以下缺陷:第一,由于低劑量原始測量數(shù)據(jù)的隱私保護(hù),現(xiàn)有方法都是基于對數(shù)變換后的弦圖數(shù)據(jù)進(jìn)行仿真和校正,沒有充分考慮低劑量原始測量數(shù)據(jù)統(tǒng)計特性,這極大限制了其在真實臨床場景下的成像性能;第二,現(xiàn)有模型沒有充分考慮商業(yè)ct重建管道的數(shù)據(jù)校正和重建過程,模型可解釋性較差,缺乏一個魯棒的ct全鏈條智能重建模型。
3、因此,針對現(xiàn)有技術(shù)不足,提供一種基于深度學(xué)習(xí)的ct全鏈條智能重建方法以解決現(xiàn)有技術(shù)不足甚為必要。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明的目的在于避免現(xiàn)有技術(shù)的不足之處而提供一種基于深度學(xué)習(xí)的ct全鏈條智能重建方法。該基于深度學(xué)習(xí)的ct全鏈條智能重建方法能夠在降低掃描劑量的同時保證圖像質(zhì)量。
2、本發(fā)明的上述目的通過以下技術(shù)措施實現(xiàn):
3、提供一種基于深度學(xué)習(xí)的ct全鏈條智能重建方法,包括如下步驟:
4、s1、將原始測量數(shù)據(jù)輸入訓(xùn)練后逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)通過校正處理,得到校正后測量數(shù)據(jù);所述原始測量數(shù)據(jù)設(shè)置有二維投影數(shù)據(jù)和三維投影數(shù)據(jù);
5、s2、將s1得到的校正后測量數(shù)據(jù)通過負(fù)對數(shù)變換處理,得到弦圖數(shù)據(jù);
6、s3、將s2得到的弦圖數(shù)據(jù)輸入訓(xùn)練后逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)通過濾波處理,得到濾波后弦圖數(shù)據(jù);
7、s4、將s3得到的濾波后弦圖數(shù)據(jù)通過逐角度反投影處理,得到反投影張量數(shù)據(jù);
8、s5、將s4得到的反投影張量數(shù)據(jù)通過角度方向排序處理,得到排序后反投影張量數(shù)據(jù);
9、s6、將s5得到的排序后反投影張量數(shù)據(jù)輸入訓(xùn)練后反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行重建處理,得到最終ct重建圖像。
10、優(yōu)選的,上述校正處理由式(1)至式(4)表示;
11、σ=pnet(i,θp)……式(1);
12、k=k(σ)……式(2);
13、
14、其中,為二維投影數(shù)據(jù),u為探測器通道的個數(shù),v為投影角度的個數(shù),i3d為三維投影數(shù)據(jù),θp為逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)pnet的網(wǎng)絡(luò)參數(shù),σ為逐像素高斯濾波核的標(biāo)準(zhǔn)差,k為高斯濾波核的窗寬映射函數(shù),k為逐像素高斯濾波核的窗寬,為逐像素三維高斯濾波核,為校正后測量數(shù)據(jù),x、y和z為空間坐標(biāo),u為在探測器通道方向的坐標(biāo),v為在角度方向的坐標(biāo)。
15、優(yōu)選的,上述負(fù)對數(shù)變換處理由式(5)表示;
16、
17、其中,s為弦圖數(shù)據(jù)。
18、優(yōu)選的,上述濾波處理由式(6)至式(9)表示;
19、
20、rv(w)=hv(w).*r(w)……式(8);
21、
22、其中,為弦圖數(shù)據(jù)沿探測器方向的一維傅里葉變換,θs為逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)snet的網(wǎng)絡(luò)參數(shù),hv(w)為弦圖數(shù)據(jù)濾波核的窗函數(shù),p(w)為ramp濾波核,wm為ramp濾波核的帶寬,rv(w)為逐角度濾波核,為弦圖數(shù)據(jù)沿探測器方向的一維逆傅里葉變換,為濾波后弦圖數(shù)據(jù),且
23、優(yōu)選的,上述逐角度反投影處理由式(10)表示;
24、
25、其中,為反投影張量數(shù)據(jù),且i為圖像的寬,j為圖像的高,int為線性插值操作,θv為第v個角度投影對應(yīng)的旋轉(zhuǎn)角度,為反投影加權(quán)因子。
26、優(yōu)選的,上述角度方向排序處理為:將反投影張量數(shù)據(jù)在角度方向按照反投影張量數(shù)值由小到大進(jìn)行排序,由式(11)表示;
27、
28、其中,為排序后反投影張量數(shù)據(jù),為排序操作,:為角度方向的所有反投影張量。
29、優(yōu)選的,上述重建處理由式(12)表示;
30、
31、其中,μ為最終ct重建圖像,且θr為反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)rnet的網(wǎng)絡(luò)參數(shù)。
32、優(yōu)選的,上述逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)、所述逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)和所述反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)通過預(yù)先建立的訓(xùn)練數(shù)據(jù)庫通過端到端訓(xùn)練,得到訓(xùn)練后的逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)、訓(xùn)練后的逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)和訓(xùn)練后的反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)。
33、優(yōu)選的,上述訓(xùn)練數(shù)據(jù)庫設(shè)置有多對配對的正常劑量測量數(shù)據(jù)、低劑量測量數(shù)據(jù),以及根據(jù)所述正常劑量測量數(shù)據(jù)進(jìn)行重建得到的正常劑量圖像數(shù)據(jù),一個低劑量測量數(shù)據(jù)與一個正常劑量測量數(shù)據(jù)組成一個配對數(shù)據(jù),且所述低劑量數(shù)據(jù)的劑量均低于所述正常劑量數(shù)據(jù),其中每個低劑量測量數(shù)據(jù)包括有二維投影數(shù)據(jù)和三維投影數(shù)據(jù),所有低劑量測量數(shù)據(jù)的劑量并不全部相同。
34、優(yōu)選的,上述端到端訓(xùn)練通過如下步驟進(jìn)行:首先經(jīng)第一訓(xùn)練方法對逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行預(yù)訓(xùn)練,得到預(yù)訓(xùn)練逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò);然后根據(jù)所述預(yù)訓(xùn)練逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)及第二訓(xùn)練方法對逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行預(yù)訓(xùn)練,得到預(yù)訓(xùn)練逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò);再根據(jù)所述預(yù)訓(xùn)練逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)和所述預(yù)訓(xùn)練逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)及第三訓(xùn)練方法對反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行預(yù)訓(xùn)練,得到預(yù)訓(xùn)練反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò);最后通過第四訓(xùn)練方法對所述預(yù)訓(xùn)練逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)、所述預(yù)訓(xùn)練逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)和預(yù)訓(xùn)練反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行再訓(xùn)練,得到訓(xùn)練后的逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)、訓(xùn)練后的逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)和訓(xùn)練后的反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)。
35、優(yōu)選的,上述第一訓(xùn)練方法通過如下步驟進(jìn)行:
36、a1、將所述訓(xùn)練數(shù)據(jù)庫中同一低劑量測量數(shù)據(jù)的二維投影數(shù)據(jù)和三維投影數(shù)據(jù)輸入逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)通過校正處理,得到校正后測量數(shù)據(jù);
37、a2、通過第一損失函數(shù)對a1的逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)的參數(shù)進(jìn)更新,所述第一損失函數(shù)由式(13)表示;
38、
39、在式(13)中,lossp為第一損失函數(shù)的損失值,n為訓(xùn)練樣本數(shù)量,為a1得到的校正后測量數(shù)據(jù),為同一配對數(shù)據(jù)中的正常劑量測量數(shù)據(jù);
40、a3、判斷訓(xùn)練epoch是否達(dá)到ω1次,當(dāng)是時,進(jìn)入a4;當(dāng)否時返回a1,且ω1為大于2的整數(shù);
41、a4、lossp的最小值作為預(yù)訓(xùn)練逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)的參數(shù),結(jié)束訓(xùn)練。
42、優(yōu)選的,上述第二訓(xùn)練方法通過如下步驟進(jìn)行:
43、b1、將所述訓(xùn)練數(shù)據(jù)庫中的低劑量測量數(shù)據(jù)的二維投影數(shù)據(jù)和三維投影數(shù)據(jù)輸入所述預(yù)訓(xùn)練逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)通過校正處理,得到校正后測量數(shù)據(jù);
44、b2、將b1得到的校正后測量數(shù)據(jù)通過負(fù)對數(shù)變換處理,得到弦圖數(shù)據(jù);
45、b3、將b2得到的弦圖數(shù)據(jù)輸入逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)通過濾波處理,得到濾波后弦圖數(shù)據(jù);
46、b4、通過第二損失函數(shù)對b3的逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)的參數(shù)進(jìn)更新,所述第二損失函數(shù)由式(14)表示;
47、
48、在式(14)中,losss為第二損失函數(shù)的損失值,為b3得到弦圖數(shù)據(jù),為正常劑量濾波后的弦圖數(shù)據(jù);
49、b5、判斷訓(xùn)練epoch是否達(dá)到ω2次,當(dāng)是時,進(jìn)入b6;當(dāng)否時返回b1,且ω2為大于2的整數(shù);
50、b6、將所有損失值losss中最小值作為預(yù)訓(xùn)練逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)的參數(shù),結(jié)束訓(xùn)練。
51、優(yōu)選的,上述第三訓(xùn)練方法通過如下步驟進(jìn)行:
52、c1、將所述訓(xùn)練數(shù)據(jù)庫中的低劑量測量數(shù)據(jù)的二維投影數(shù)據(jù)和三維投影數(shù)據(jù)輸入所述預(yù)訓(xùn)練逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)通過校正處理,得到校正后測量數(shù)據(jù);
53、c2、將c1得到的校正后測量數(shù)據(jù)通過負(fù)對數(shù)變換處理,得到弦圖數(shù)據(jù);
54、c3、將c2得到的弦圖數(shù)據(jù)輸入所述逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)通過濾波處理,得到濾波后弦圖數(shù)據(jù);
55、c4、將c3得到的濾波后弦圖數(shù)據(jù)通過逐角度反投影處理,得到反投影張量數(shù)據(jù);
56、c5、將c4得到的反投影張量數(shù)據(jù)通過角度方向排序處理,得到排序后反投影張量數(shù)據(jù);
57、c6、將c5得到的排序后反投影張量數(shù)據(jù)輸入反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行重建,得到ct重建圖像;
58、c7、通過第三損失函數(shù)對c6的反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)的參數(shù)進(jìn)更新,所述第三損失函數(shù)由式(15)表示;
59、
60、在式(15)中,lossr為第三損失函數(shù)的損失值,為c6得到的ct重建圖像,為同一配對數(shù)據(jù)中正常劑量測量數(shù)據(jù)對應(yīng)的正常劑量圖像數(shù)據(jù);
61、c8、判斷訓(xùn)練epoch是否達(dá)到ω3次,當(dāng)是時,進(jìn)入c9;當(dāng)否時返回c1,且ω3為大于2的整數(shù);
62、c9、將所有損失值lossr中最小值作為預(yù)訓(xùn)練反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)的參數(shù),結(jié)束訓(xùn)練。
63、優(yōu)選的,上述第四訓(xùn)練方法通過如下步驟進(jìn)行:
64、d1、將所述訓(xùn)練數(shù)據(jù)庫中的低劑量測量數(shù)據(jù)的二維投影數(shù)據(jù)和三維投影數(shù)據(jù)輸入所述預(yù)訓(xùn)練逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)通過校正處理,得到校正后測量數(shù)據(jù);
65、d2、將d1得到的校正后測量數(shù)據(jù)通過負(fù)對數(shù)變換處理,得到弦圖數(shù)據(jù);
66、d3、將d2得到的弦圖數(shù)據(jù)輸入所述預(yù)訓(xùn)練逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)通過濾波處理,得到濾波后弦圖數(shù)據(jù);
67、d4、將d3得到的濾波后弦圖數(shù)據(jù)通過逐角度反投影處理,得到反投影張量數(shù)據(jù);
68、d5、將d4得到的反投影張量數(shù)據(jù)通過角度方向排序處理,得到排序后反投影張量數(shù)據(jù);
69、d6、將d5得到的排序后反投影張量數(shù)據(jù)輸入所述預(yù)訓(xùn)練反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行重建,得到ct重建圖像;
70、d7、通過第四損失函數(shù)分別對d1的預(yù)訓(xùn)練反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)的參數(shù)、d3的預(yù)訓(xùn)練逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)的參數(shù)和d6的預(yù)訓(xùn)練反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)的參數(shù)進(jìn)行更新,所述第四損失函數(shù)由式(16)表示;
71、
72、在式(16)中,loss為第四損失函數(shù)的損失值,為d1得到的校正后測量數(shù)據(jù),為同一配對數(shù)據(jù)中的正常劑量測量數(shù)據(jù),為d3得到弦圖數(shù)據(jù),為同一配對數(shù)據(jù)中正常劑量測量數(shù)據(jù)濾波后的弦圖數(shù)據(jù);為d6得到的ct重建圖像,為同一配對數(shù)據(jù)中正常劑量測量數(shù)據(jù)對應(yīng)的正常劑量圖像數(shù)據(jù);
73、d8、判斷訓(xùn)練epoch是否達(dá)到ω4次,當(dāng)是時,進(jìn)入d9;當(dāng)否時返回d1,且ω4為大于2的整數(shù);
74、d9、將所有損失值loss中最小值作為預(yù)訓(xùn)后反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)的參數(shù)、預(yù)訓(xùn)后逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)的參數(shù)和預(yù)訓(xùn)后反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)的參數(shù),結(jié)束訓(xùn)練。
75、本發(fā)明的一種基于深度學(xué)習(xí)的ct全鏈條智能重建方法,包括如下步驟:s1、將原始測量數(shù)據(jù)輸入訓(xùn)練后逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)通過校正處理,得到校正后測量數(shù)據(jù);所述原始測量數(shù)據(jù)設(shè)置有二維投影數(shù)據(jù)和三維投影數(shù)據(jù);s2、將s1得到的校正后測量數(shù)據(jù)通過負(fù)對數(shù)變換處理,得到弦圖數(shù)據(jù);s3、將s2得到的弦圖數(shù)據(jù)輸入訓(xùn)練后逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)通過濾波處理,得到濾波后弦圖數(shù)據(jù);s4、將s3得到的濾波后弦圖數(shù)據(jù)通過逐角度反投影處理,得到反投影張量數(shù)據(jù);s5、將s4得到的反投影張量數(shù)據(jù)通過角度方向排序處理,得到排序后反投影張量數(shù)據(jù);s6、將s5得到的排序后反投影張量數(shù)據(jù)輸入訓(xùn)練后反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行重建處理,得到最終ct重建圖像。本發(fā)明提供的逐像素智能校正網(wǎng)絡(luò)通過學(xué)習(xí)每個像素點(diǎn)的方差,能夠?qū)Φ蛣┝吭紲y量數(shù)據(jù)進(jìn)行逐像素自適應(yīng)高斯濾波。而且逐角度智能濾波網(wǎng)絡(luò)通過學(xué)習(xí)每個投影角度的濾波核,能夠?qū)ο覉D數(shù)據(jù)進(jìn)行逐角度自適應(yīng)濾波。最后反投影張量智能重建網(wǎng)絡(luò)通過學(xué)習(xí)反投影張量到目標(biāo)圖像的映射,能夠在降低掃描劑量的同時保證圖像質(zhì)量。