本發(fā)明涉及醫(yī)學(xué)圖像處理領(lǐng)域,尤其涉及基于frangi和多幀累加的nir-ii視頻淋巴管分割方法。
背景技術(shù):
1、淋巴系統(tǒng)是具有交換和運(yùn)輸功能的網(wǎng)絡(luò),由充當(dāng)液體交換場所的盲端血管、收集運(yùn)輸淋巴液的血管、及影響免疫與抗原轉(zhuǎn)運(yùn)的淋巴結(jié)組成。由于淋巴系統(tǒng)沒有驅(qū)動流量循環(huán)的中央泵,它的運(yùn)輸功能主要由收集淋巴管的收縮實(shí)現(xiàn),因此淋巴管的測量對于淋巴系統(tǒng)功能至關(guān)重要。
2、現(xiàn)有的用于體內(nèi)淋巴管可視化的成像方法分為兩類:侵入性手術(shù)暴露和非侵入式成像。侵入式手術(shù)暴露不僅耗時(shí),還會對患者身體造成一定損傷,因此不建議使用。非侵入式成像中,淋巴閃爍成像是臨床上使用時(shí)間最長的方法,但它的空間分辨率較差,放射性保護(hù)要求較高,缺乏對淋巴管收縮功能實(shí)時(shí)成像所需的時(shí)間分辨率,已逐漸被其他成像方法取代。計(jì)算機(jī)斷層掃描(ct)和磁共振淋巴造影(mrl)是目前常用的影像學(xué)方法。ct有相對高的時(shí)空分辨率,但診斷敏感性低,通常與其他方法結(jié)合使用。mrl可用于大面積高分辨率成像,依賴于其相對非侵入性,它有助于識別與淋巴功能障礙相關(guān)的異常,但缺點(diǎn)是靈敏度低,異常淋巴結(jié)的特異性低,不適合淋巴結(jié)異常的檢測。近紅外熒光成像具有采集速度快、空間分辨率高的優(yōu)點(diǎn),能實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)成像,而且它保留了淋巴功能性活動的體內(nèi)環(huán)境,有利于在體研究病理性過程及分子調(diào)節(jié)的影響,應(yīng)用較為廣泛。但光學(xué)成像的缺點(diǎn)是體內(nèi)光子散射和吸收導(dǎo)致激發(fā)光的快速衰減,會影響組織穿透深度,這限制了近紅外熒光成像在淋巴可視化中的應(yīng)用。波長轉(zhuǎn)移到更長的激發(fā)窗口將減少吸收衰減和組織自發(fā)熒光,有效增加光子的穿透深度,從而實(shí)現(xiàn)更高的保真度和空間分辨率。因此隨著硬件系統(tǒng)的升級,近紅外二區(qū)熒光成像成為無創(chuàng)可視化并量化淋巴管的更好選擇。
3、近紅外二區(qū)(nir-ii,1000-1700nm)熒光成像為功能性淋巴成像研究提供了最佳的解決方案,但需要操作者的高水平專業(yè)知識和精心控制的成像環(huán)境來實(shí)現(xiàn)清晰、高分辨率的成像結(jié)果。淋巴管的成像可能具有挑戰(zhàn)性,因?yàn)榇嬖诠鈱W(xué)散射、雜散光干涉和表面聚集的造影劑引起的熒光飽和,這可能導(dǎo)致圖像對比度低、血管亮度不均、形態(tài)不完整和遮擋深層目標(biāo)。這些挑戰(zhàn)會對后續(xù)的定量檢測造成障礙。因此需要一種自動分割方法忽視視頻記錄中微小擾動的影響,從存在熒光干擾的背景中提取可靠的淋巴管。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本發(fā)明意在提供基于frangi和多幀累加的nir-ii視頻淋巴管分割方法,以解決近紅外二區(qū)熒光成像需要操作者的高水平專業(yè)知識和精心控制的成像環(huán)境來實(shí)現(xiàn)清晰、高分辨率成像結(jié)果的問題,該方法針對低對比度近紅外圖像運(yùn)用一系列醫(yī)學(xué)圖像處理方法實(shí)現(xiàn)低對比度淋巴管的自動提取,為淋巴管收縮功能定量測量及其在相關(guān)疾病的診療中奠定了基礎(chǔ)。
2、為達(dá)到上述目的,本發(fā)明提供如下技術(shù)方案:
3、基于frangi和多幀累加的nir-ii視頻淋巴管分割方法,包括以下步驟:
4、s1、對視頻進(jìn)行處理,得到幀圖像序列;
5、s2、對每幀圖像使用clahe算法和3x3鄰域均值濾波進(jìn)行預(yù)處理;
6、s3、通過頂帽處理從暗淡的背景中提取較亮的結(jié)構(gòu)區(qū)域,得到粗糙的前景圖像;
7、s4、將每幀圖像非零像素的均值作為閾值進(jìn)行逐幀圖像的自適應(yīng)分割;
8、s5、讀取圖像序列所包含的所有圖像,重復(fù)步驟s2至s4,累積所有圖像的二值圖像;
9、s6、使用frangi濾波增強(qiáng)所述累積二值圖像中的管狀結(jié)構(gòu),得到精細(xì)的前景圖像;
10、s7、frangi濾波后的圖像經(jīng)過一定形態(tài)學(xué)處理,平滑淋巴管輪廓,并消除其存在的小孔,填補(bǔ)縫隙,得到清晰的淋巴管。
11、進(jìn)一步的,在步驟s2中,對每幀圖像去噪處理,包括以下步驟:
12、s201、將圖像劃分為大小相等的16x16不重疊子塊,計(jì)算每個(gè)不重疊子塊的灰度直方圖和對應(yīng)的變換函數(shù)(累積直方圖):
13、
14、其中,x是離散的灰度圖像,l是圖像中灰度級(通常為256),ni是灰度i的出現(xiàn)次數(shù),px(i)是圖像中出現(xiàn)第i灰度級像素的概率;
15、其累積分布函數(shù)對應(yīng)為:
16、
17、s202、計(jì)算剪切閾值cliplimit,對多余的像素重新進(jìn)行分配;
18、s203、對對比度限制后的直方圖進(jìn)行直方圖均衡獲取映射函數(shù),利用映射函數(shù)處理原圖像;
19、s204、定義3x3鄰域窗口,在經(jīng)過clahe處理后的圖像中滑動,計(jì)算窗口中均值,并進(jìn)行濾波處理去除噪聲。
20、進(jìn)一步的,在步驟s3中,頂帽處理的計(jì)算公式如下:
21、
22、其中,i為輸入圖,thf(x,y)是頂帽濾波后的圖像,b是結(jié)構(gòu)元素,表示開操作。
23、進(jìn)一步的,在步驟s4中,閾值與二值圖像的計(jì)算公式如下:
24、
25、其中n(i)是圖像thf(x,y)中強(qiáng)度值為i的像素的數(shù)量,t是計(jì)算得到的閾值,it(x,y)是閾值分割后的二值圖像。
26、進(jìn)一步的,在步驟s6中,使用高斯濾波函數(shù)對圖像進(jìn)行平滑處理,獲得濾波后圖像i,并計(jì)算偏導(dǎo)函數(shù),通過hessian矩陣構(gòu)造增強(qiáng)濾波器,hessian矩陣的公式如下:
27、
28、根據(jù)hessian矩陣求特征值:
29、
30、特征值及它們對應(yīng)的特征向量表示該點(diǎn)沿某方向的曲率大小及方向;
31、利用特征值構(gòu)建響應(yīng)函數(shù),其公式如下:
32、
33、采用多尺度策略得到不同尺度下的響應(yīng)結(jié)果,當(dāng)尺度和局部結(jié)構(gòu)匹配時(shí)可以得到最大的響應(yīng)結(jié)果,從而判斷該像素點(diǎn)是否屬于血管結(jié)構(gòu)。
34、進(jìn)一步的,在步驟s7中,首先構(gòu)建4x4方形結(jié)構(gòu)元素,運(yùn)用二值形態(tài)學(xué)膨脹運(yùn)算,連接淋巴管斷裂的低亮度區(qū)域;然后計(jì)算二值圖像中各區(qū)域的面積,濾除面積較小的噪聲區(qū)域,并填充二值圖像中的孔和縫隙,獲得最終的淋巴管分割圖像。
35、本技術(shù)方案的原理及有益效果:
36、本發(fā)明采用的基于clahe和鄰域均值濾波的預(yù)處理方法,能有效增強(qiáng)淋巴管的對比度,并去除噪聲,平滑圖像。頂帽處理能從背景中提取較亮的前景區(qū)域,在這一步驟中,頂帽處理能避免圖像中較小的熒光干擾,緩解亮度不均勻問題,并增強(qiáng)較亮區(qū)域的淋巴管。上述處理去除了大部分雜散光和背景噪聲,但淋巴管邊緣對比度低,給分割造成困難,將每幀圖像非零均值作為閾值進(jìn)行逐幀圖像分割可有效去除淋巴管周圍殘留的噪音,累積二值圖像更能去除視頻中微小擾動造成的影響,使分割結(jié)果相對保持穩(wěn)定。frangi濾波和形態(tài)學(xué)處理一方面可以增強(qiáng)圖像中的管狀結(jié)構(gòu),另一方面可以平滑輪廓,消除小孤立區(qū)域和尖峰,消除小孔,填補(bǔ)輪廓存在的間隙,可得到形態(tài)完整的淋巴管。整體來看,本發(fā)明所提出的方法對于噪聲有較強(qiáng)的魯棒性,對昏暗且亮度不均的淋巴管有良好的檢測和分割能力,分割得到的淋巴管的輪廓較貼合原始圖像淋巴管形態(tài)。
1.基于frangi和多幀累加的nir-ii視頻淋巴管分割方法,其特征在于,包括以下步驟:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于frangi和多幀累加的nir-ii視頻淋巴管分割方法,其特征在于,在步驟s2中,對每幀圖像去噪處理,包括以下步驟:
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于frangi和多幀累加的nir-ii視頻淋巴管分割方法,其特征在于,在步驟s3中,頂帽處理的計(jì)算公式如下:
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于frangi和多幀累加的nir-ii視頻淋巴管分割方法,其特征在于,在步驟s4中,閾值與二值圖像的計(jì)算公式如下:
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于frangi和多幀累加的nir-ii視頻淋巴管分割方法,其特征在于,在步驟s6中,使用高斯濾波函數(shù)對圖像進(jìn)行平滑處理,獲得濾波后圖像i,并計(jì)算偏導(dǎo)函數(shù),通過hessian矩陣構(gòu)造增強(qiáng)濾波器,hessian矩陣的公式如下:
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于frangi和多幀累加的nir-ii視頻淋巴管分割方法,其特征在于,在步驟s7中,首先構(gòu)建4x4方形結(jié)構(gòu)元素,運(yùn)用二值形態(tài)學(xué)膨脹運(yùn)算,連接淋巴管斷裂的低亮度區(qū)域;然后計(jì)算二值圖像中各區(qū)域的面積,濾除面積較小的噪聲區(qū)域,并填充二值圖像中的孔和縫隙,獲得最終的淋巴管分割圖像。