本發(fā)明涉及醫(yī)療人工智能，具體涉及一種組織病理切片圖像的定位方法及系統(tǒng)。

背景技術(shù)：

1、近年來，三維重建技術(shù)已廣泛應(yīng)用于肝膽外科、整形外科、頜面外科、骨科等臨床診療。三維重建技術(shù)能夠獲得全方位、立體、智能的動、靜態(tài)影像，清晰地顯示病變的空間位置、形態(tài)結(jié)構(gòu)以及其與周圍臟器解剖關(guān)系，有助于術(shù)前規(guī)劃、測量、計算、模擬手術(shù)操作，也有助于制定個體化治療方案和提高手術(shù)準(zhǔn)確率和安全性。

2、組織的三維重建過程中，在對各組織病理切片的切片圖像進(jìn)行一系列處理后，需要對各切片圖像進(jìn)行定位，定位的精度將影響組織三維重建的準(zhǔn)確性。發(fā)明人團(tuán)隊在專利cn117011462a公開了一種基于腫瘤浸潤區(qū)標(biāo)記的組織三維重建方法。該方法中，利用病理掃描儀獲得組織病理切片的切片圖像后，在切片圖像上確定三個標(biāo)記點(diǎn)，根據(jù)三個標(biāo)記點(diǎn)的位置關(guān)系旋轉(zhuǎn)、翻轉(zhuǎn)各切片圖像，使得各切片圖像的角度大致相同，從而實(shí)現(xiàn)各切片圖像的定位。

3、為了觀察到組織更多的斷面信息，組織病理切片可以切割得足夠薄(例如2μm)，這使得需要定位的切片圖像的數(shù)量顯著增加。但是，現(xiàn)有的切片圖像的定位方式需要先在各切片圖像上經(jīng)過一系列算法以生成三個標(biāo)記點(diǎn)，降低了定位的效率。此外，各切片圖像上的三個標(biāo)記點(diǎn)不是基于相同的坐標(biāo)系調(diào)整切片圖像，而是根據(jù)三個標(biāo)記點(diǎn)之間的相對位置調(diào)整切片圖像，因此會不可避免地產(chǎn)生誤差。當(dāng)切片圖像數(shù)量較大時，累積誤差將嚴(yán)重地影響定位的精度，進(jìn)而影響三維重建的準(zhǔn)確性。所以，現(xiàn)有的切片圖像定位方法的效率和精度難以適用于大批量的切片圖像處理，組織三維重建的準(zhǔn)確性有待進(jìn)一步提高。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、本發(fā)明的一個目的在于提供一種用于腫瘤組織三維重建的組織病理切片圖像的定位方法，以解決現(xiàn)有技術(shù)中切片圖像的定位方法在用于大批量的切片圖像處理時效率低、累計誤差大、精度差的問題，實(shí)現(xiàn)切片圖像的高效、高精度的定位，允許組織切割時獲得大量的、更薄的組織病理切片，顯著地提高組織三維重建的準(zhǔn)確性。

2、本發(fā)明通過下述技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)：

3、一種組織病理切片圖像的定位方法，包括以下步驟：

4、s1：將組織固定于石蠟中形成石蠟包塊；

5、s2：切割所述石蠟包塊得到若干組織切片，在切割過程中，利用激光在每片組織切片上燒蝕形成至少三個標(biāo)記點(diǎn)，并記錄各標(biāo)記點(diǎn)的第一坐標(biāo)；

6、s3：采集帶有標(biāo)記點(diǎn)的組織切片的切片圖像；

7、s4：獲取所述切片圖像中各標(biāo)記點(diǎn)的第二坐標(biāo)，比較所述第二坐標(biāo)和第一坐標(biāo)，基于比較結(jié)果定位所述切片圖像。

8、本技術(shù)方案中，用石蠟包裹需要進(jìn)行三維重建的組織得到石蠟包塊。在一個或多個實(shí)施例中，可以對石蠟包塊進(jìn)行預(yù)處理，例如，切除石蠟包塊上多余的石蠟部分，直至在石蠟包塊的端面上露出組織。

9、本技術(shù)方案中，利用切片機(jī)切割石蠟包塊以得到若干組織切片。在切割過程中，采用激光在每片組織切片上燒蝕形成若干標(biāo)記點(diǎn)。在部分實(shí)施例中，激光燒蝕石蠟包塊的端面或者切割后的截面，并在端面或截面上燒蝕出標(biāo)記點(diǎn)后，從石蠟包塊上切割得到帶有標(biāo)記點(diǎn)的組織切片。在一個或多個實(shí)施例中，激光燒蝕的深度，也即沿垂直于所述截面的方向上的長度，為待切割的組織切片的厚度的整數(shù)倍，從而提高標(biāo)記的效率。在部分優(yōu)選的實(shí)施例中，激光燒蝕的深度等于待切割的組織切片的厚度，這樣確保每片組織切片上的標(biāo)記點(diǎn)都能夠位于組織輪廓線內(nèi)。

10、本技術(shù)方案中，能夠控制激光器或者激光器的發(fā)射單元移動，以在石蠟包塊的截面上燒蝕出位置不同的標(biāo)記點(diǎn)。激光器的控制單元或者激光器自身具有二維坐標(biāo)系，以基于二維坐標(biāo)系移動激光至第一坐標(biāo)點(diǎn)。激光在第一坐標(biāo)點(diǎn)處燒蝕得到標(biāo)記點(diǎn)，并記錄標(biāo)記點(diǎn)對應(yīng)的第一坐標(biāo)。

11、本技術(shù)方案中，在每片組織切片上形成標(biāo)記點(diǎn)后，可以利用病理掃描儀掃描各組織切片，得到各組織切片對應(yīng)的切片圖像，并按照切割的順序編號。在部分實(shí)施例中，也可以對切片圖像進(jìn)行一系列的操作，例如，cn117011462a中在切片圖像上標(biāo)記出封閉的浸潤區(qū)。

12、本技術(shù)方案中，識別切片圖像中的組織切片上的標(biāo)記點(diǎn)的第二坐標(biāo)。第二坐標(biāo)采用的第二坐標(biāo)系可以與第一坐標(biāo)采用的第一坐標(biāo)系相同，也可以不同。若第二坐標(biāo)系與第一坐標(biāo)系相同，可直接比對第二坐標(biāo)和第一坐標(biāo)。若第二坐標(biāo)系與第一坐標(biāo)系不同，則基于兩個坐標(biāo)系的空間關(guān)系，將第二坐標(biāo)系中的第二坐標(biāo)換算到第一坐標(biāo)系中，再將第二坐標(biāo)與第一坐標(biāo)進(jìn)行比較。本技術(shù)方案中，通過切片圖像上的第二坐標(biāo)與記錄的第一坐標(biāo)一一比對，將各第二坐標(biāo)移動至與其接近或者相同的第一坐標(biāo)處，完成切片圖像的旋轉(zhuǎn)、翻轉(zhuǎn)，實(shí)現(xiàn)對切片圖像的準(zhǔn)確定位。

13、本技術(shù)方案中，利用激光直接在各組織切片上精確地?zé)g出若干標(biāo)記點(diǎn)，標(biāo)記的效率高、準(zhǔn)確度高；更重要的是，不同組織切片上的標(biāo)記點(diǎn)的第一坐標(biāo)共用相同的二維坐標(biāo)系，所以，在切片圖像上識別出第二坐標(biāo)后，能夠通過比對第二坐標(biāo)與第一坐標(biāo)，使得切片圖像基于二維坐標(biāo)系旋轉(zhuǎn)、翻轉(zhuǎn)，從而定位至組織切片被切割前的位置，大幅地降低了累計誤差，提高了定位效率，有利于在組織切割時獲得大量的、更薄的組織病理切片，顯著地提高組織三維重建的準(zhǔn)確性。

14、進(jìn)一步地，所述步驟s2中，每次切割所述石蠟包塊之前，采集所述石蠟包塊的待切割部分的橫截面的截面圖像，從所述截面圖像中提取組織輪廓線，在所述組織輪廓線內(nèi)確定第一坐標(biāo)，激光在第一坐標(biāo)處燒蝕形成標(biāo)記點(diǎn)，切割所述待切割部分得到帶有標(biāo)記點(diǎn)的組織切片。

15、本技術(shù)方案中，在每次從石蠟包塊上切下組織切片之前，可以利用攝像機(jī)拍攝石蠟包塊的待切割部分，即組織切片的橫截面，得到橫截面的截面圖像。隨后，從截面圖像中提取組織輪廓線，組織輪廓線為組織和石蠟的分界線。

16、本技術(shù)方案中，在組織輪廓線內(nèi)確定待形成的標(biāo)記點(diǎn)的第一坐標(biāo)。各標(biāo)記點(diǎn)的第一坐標(biāo)可以是隨機(jī)的，也可以存在一定的關(guān)聯(lián)性，例如，連接各標(biāo)記點(diǎn)構(gòu)成的多邊形的幾何中心與組織輪廓線的質(zhì)心重合。在部分優(yōu)選的實(shí)施例中，各標(biāo)記點(diǎn)靠近組織切片的中心。這是因?yàn)?，相較于組織切片的邊緣區(qū)域，組織切片的中心及附近區(qū)域在切割過程中的變形更小，從而能夠減小標(biāo)記點(diǎn)在切割過程中出現(xiàn)的偏移或者形變。

17、本技術(shù)方案中，激光在確定的第一坐標(biāo)處燒蝕一定的深度，該燒蝕深度優(yōu)選與待切割的組織切片的厚度相同，或者燒蝕深度略小于組織切片的厚度，進(jìn)而允許每片組織切片上的標(biāo)記點(diǎn)的位置可以不同。在形成標(biāo)記點(diǎn)后，將組織切片從石蠟包塊上切下，即得到帶有標(biāo)記點(diǎn)的組織切片。

18、本技術(shù)方案中，基于組織輪廓線選擇第一坐標(biāo)，能夠使所有標(biāo)記點(diǎn)位于組織切片上，克服了由于石蠟需要在采集切片圖像前熔化，而造成的部分形成于石蠟上的標(biāo)記點(diǎn)難以在切片圖像上采集的問題。

19、進(jìn)一步地，所述步驟s2中，確定第一坐標(biāo)的方式包括以下步驟：

20、獲取所述組織輪廓線的質(zhì)心，圍繞所述質(zhì)心確定用于形成標(biāo)記點(diǎn)的第一坐標(biāo)，各第一坐標(biāo)的連線構(gòu)成的多邊形的幾何中心位于所述質(zhì)心附近。

21、本技術(shù)方案中，同一組織切片上的標(biāo)記點(diǎn)的位置存在關(guān)聯(lián)性。具體地，在獲取組織輪廓線后，基于所述組織輪廓線上的若干點(diǎn)的坐標(biāo)計算組織輪廓線的質(zhì)心。質(zhì)心xm的計算公式為其中，xi為組織輪廓線上任一點(diǎn)的坐標(biāo)，mi為組織輪廓線上任一點(diǎn)的權(quán)重，在部分實(shí)施例中，組織輪廓線上各點(diǎn)的權(quán)重相同。

22、本技術(shù)方案中，可以在組織輪廓線內(nèi)隨機(jī)生成至少三個第一坐標(biāo)。連接各第一坐標(biāo)能夠得到多邊形，多邊形的頂點(diǎn)即位于第一坐標(biāo)。多邊形的幾何中心位于質(zhì)心附近。在部分實(shí)施例中，多邊形的幾何中心可以與質(zhì)心重合。

23、本技術(shù)方案中，通過將各標(biāo)記點(diǎn)構(gòu)成的多邊形的幾何中心設(shè)置在組織輪廓線的質(zhì)心附近，能夠使各標(biāo)記點(diǎn)均勻地分布在組織切片上，避免標(biāo)記點(diǎn)集中導(dǎo)致的組織切片局部損毀嚴(yán)重。

24、作為本發(fā)明中第一坐標(biāo)選擇的優(yōu)選實(shí)施方式，所述步驟s2中，確定第一坐標(biāo)的方式包括以下步驟：

25、對于第一片組織切片，獲取第一組織輪廓線的第一質(zhì)心，圍繞所述第一質(zhì)心確定用于形成標(biāo)記點(diǎn)的第一坐標(biāo)，各第一坐標(biāo)的連線構(gòu)成的多邊形的幾何中心與所述第一質(zhì)心重合；

26、對于后續(xù)的其他組織切片，獲取相鄰的前一片組織切片的各標(biāo)記點(diǎn)的第一坐標(biāo)，將各第一坐標(biāo)向同一方向移動相同距離后，判斷移動后的第一坐標(biāo)是否全部位于當(dāng)前組織切片的第二組織輪廓線內(nèi)；

27、若是，則將移動后的各第一坐標(biāo)作為當(dāng)前組織切片的第一坐標(biāo)；

28、若否，則獲取第二組織輪廓線的第二質(zhì)心，將多邊形的幾何中心移動至與第二質(zhì)心重合，旋轉(zhuǎn)多邊形，將多邊形的各頂點(diǎn)的坐標(biāo)作為當(dāng)前組織切片的第一坐標(biāo)。

29、本技術(shù)方案中，在確定第一片組織切片上的第一坐標(biāo)時，在第一組織輪廓線內(nèi)隨機(jī)生成第一坐標(biāo)，第一坐標(biāo)連線構(gòu)成的多邊形的幾何中心與第一組織輪廓線的第一質(zhì)心重合。

30、本技術(shù)方案中，在確定第二片至最后一片組織切片時，首先獲取前一片組織切片選取的第一坐標(biāo)，再通過前一片組織切片選取的第一坐標(biāo)確定當(dāng)前組織切片的第一坐標(biāo)。例如，在確定第二片組織切片時，先獲取第一片組織切片采用的第一坐標(biāo)，將各第一坐標(biāo)向相同的方向移動相同的距離后，得到移動后的第一坐標(biāo)。隨后，判斷移動后的第一坐標(biāo)是否全部位于第二片組織切片的組織輪廓線內(nèi)。如果是，則將移動后的第一坐標(biāo)作為第二片組織切片的第一坐標(biāo)。如果至少有一個第一坐標(biāo)位于組織輪廓線外，則獲取第二片組織切片的組織輪廓線的第二質(zhì)心，并將多邊形的幾何中心與第二質(zhì)心重合，之后將多邊形旋轉(zhuǎn)一定角度，再將多邊形的各個頂點(diǎn)選做第二片組織切片的第一坐標(biāo)。

31、本技術(shù)方案中，基于前一片組織切片上的第一坐標(biāo)選擇后一片組織切片上的第一坐標(biāo)，確保了相鄰的兩片組織切片上的第一坐標(biāo)不重合，能夠有效地減小激光燒蝕到組織切片的癌變區(qū)域的幾率。例如，如果第一片組織切片上的一個第一坐標(biāo)位于癌變區(qū)域中，通過將第二片組織切片上的第一坐標(biāo)移動一段距離，可以避免第二片組織切片上的癌變區(qū)域的相同位置被再一次燒蝕，有效地減少了激光燒蝕對癌變區(qū)域的損壞。

32、進(jìn)一步地，相鄰兩片組織切片中，若前一片組織切片的第一坐標(biāo)沿第一方向移動后，全部位于第二組織輪廓線內(nèi)，則后一片組織切片的第一坐標(biāo)繼續(xù)沿第一方向移動。

33、為了使相鄰兩片組織切片的第一坐標(biāo)更加規(guī)律的變化，以有序地避開癌變區(qū)域。本技術(shù)方案中，如果沿第一方向移動第一坐標(biāo)后，第一坐標(biāo)仍然位于當(dāng)前組織切片的組織輪廓線內(nèi)，則后一片組織切片在移動第一坐標(biāo)時，仍然沿著第一方向。

34、例如，在第一片組織切片的第一坐標(biāo)沿第一方向移動后，移動后的第一坐標(biāo)仍然位于第二片組織切片的組織輪廓線內(nèi)，則將移動后的第一坐標(biāo)作為第二片組織切片的第一坐標(biāo)。接下來，在確定第三片組織切片的第一坐標(biāo)時，將第二片組織切片的第一坐標(biāo)繼續(xù)沿第一方向移動。以此類推，直至在確定某一片組織切片時，沿第一方向移動的第一坐標(biāo)位于當(dāng)前組織切片的組織輪廓線外，則將第一坐標(biāo)構(gòu)成的多邊形的幾何中心移動至當(dāng)前組織切片的組織輪廓線的質(zhì)心處。

35、進(jìn)一步地，所述步驟s2中，在切割所述組織切片之前，在組織切片上貼附薄膜。

36、由于從石蠟包塊上切下的組織切片非常薄，因此在切割過程中，組織切片會出現(xiàn)不同程度的形變、卷邊，不利于后續(xù)提取切片圖像中的標(biāo)記點(diǎn)。

37、本技術(shù)方案中，通過在組織切片上貼附薄膜，能夠有效地提高組織切片的強(qiáng)度，進(jìn)而減少切割過程中出現(xiàn)的形變、卷邊、褶皺，降低后續(xù)標(biāo)記點(diǎn)出現(xiàn)偏移的幾率。在部分實(shí)施例中，可以先在組織切片上貼附薄膜，再利用激光燒蝕標(biāo)記點(diǎn)。在一個或多個實(shí)施例中，也可以先利用激光在組織切片上燒蝕標(biāo)記點(diǎn)，再在組織切片上貼附薄膜。

38、進(jìn)一步地，所述步驟s4中，基于所述第一坐標(biāo)和第二坐標(biāo)獲得切片圖像對應(yīng)的仿射變換矩陣，采用所述仿射變換矩陣修正所述切片圖像，獲取修正后的切片圖像中各標(biāo)記點(diǎn)的第三坐標(biāo)，比較所述第三坐標(biāo)和第一坐標(biāo)，基于比較結(jié)果定位修正后的切片圖像。

39、組織切片在被切割時，刀具的外力會使組織切片產(chǎn)生拉伸、旋轉(zhuǎn)等變形。并且，這種變形還會隨著組織切片厚度的降低而更加明顯。組織切片的變形不僅造成切片圖像上的第二標(biāo)記點(diǎn)與第一標(biāo)記點(diǎn)無法完全對應(yīng)，只能通過第一標(biāo)記點(diǎn)和第二標(biāo)記點(diǎn)的相似度大致定位切片圖像，而且組織切片的變形還會影響后續(xù)三維重建的質(zhì)量和準(zhǔn)確性。

40、為了解決上述問題，本技術(shù)方案中，在識別了切片圖像上各標(biāo)記點(diǎn)的第二坐標(biāo)后，基于第二坐標(biāo)和第一坐標(biāo)獲得切片圖像對應(yīng)的仿射變換矩陣。其中，所述仿射變換矩陣的計算公式為：

41、

42、式中，x和y為第一坐標(biāo)(x，y)，x’和y’為第二坐標(biāo)(x’，y’)，仿射變換矩陣的六個變量中，sx和sy分別為控制沿x軸和y軸縮放、翻轉(zhuǎn)的變量，αx和αy分別為控制沿x軸和y軸旋轉(zhuǎn)的變量，tx和ty分別為控制沿x軸和y軸平移的變量。

43、基于組織切片上的標(biāo)記點(diǎn)的第一坐標(biāo)和第二坐標(biāo)，即可求解六元一次方程得到仿射變換矩陣中的六個變量。將仿射變換矩陣應(yīng)用于切片圖像中的每個像素點(diǎn)，即可修正所述切片圖像。接下來，在修正后的切片圖像中識別各標(biāo)記點(diǎn)的第三坐標(biāo)，經(jīng)過修正的第三坐標(biāo)能夠更好地與第一坐標(biāo)進(jìn)行匹配，從而實(shí)現(xiàn)切片圖像的準(zhǔn)確定位。此外，基于第一坐標(biāo)修正的切片圖像能夠更好地還原組織切片被切割前的形態(tài)，有利于提高后續(xù)三維重建的質(zhì)量和準(zhǔn)確性。

44、進(jìn)一步地，若切片圖像上具有至少四個標(biāo)記點(diǎn)，將所述至少四個標(biāo)記點(diǎn)構(gòu)成的多邊形區(qū)域劃分為至少兩個三角形區(qū)域，獲得每個三角形區(qū)域的仿射變換矩陣；

45、對于切片圖像上位于三角形區(qū)域內(nèi)的像素點(diǎn)，利用該三角形區(qū)域?qū)?yīng)的仿射變換矩陣處理所述像素點(diǎn)；

46、對于切片圖像上位于三角形區(qū)域外的像素點(diǎn)，利用與該像素點(diǎn)距離最近的三角形區(qū)域?qū)?yīng)的仿射變換矩陣處理所述像素點(diǎn)。

47、當(dāng)組織切片上具有三個標(biāo)記點(diǎn)時，利用三個標(biāo)記點(diǎn)的第一坐標(biāo)、第二坐標(biāo)即可計算得到仿射變換矩陣的六個變量，實(shí)現(xiàn)切片圖像的修正。為了提高修正的精度，可以設(shè)置更多的標(biāo)記點(diǎn)。

48、本技術(shù)方案中，在切片圖像上具有至少四個標(biāo)記點(diǎn)。至少四個標(biāo)記點(diǎn)能夠形成四邊形、五邊形、六邊形等多邊形。在求解仿射變換矩陣前，可以將多邊形區(qū)域劃分為多個三角形區(qū)域。例如，四邊形能夠劃分為兩個三角形區(qū)域，五邊形能夠劃分為三個三角形區(qū)域。劃分后，采用每個三角形區(qū)域的三個標(biāo)記點(diǎn)的第一坐標(biāo)、第二坐標(biāo)計算仿射變換矩陣。接下來，利用三角形區(qū)域?qū)?yīng)的仿射變換矩陣修正位于該三角形區(qū)域內(nèi)的像素點(diǎn)。而對于不屬于任一三角形區(qū)域的像素點(diǎn)，則采用距離該像素點(diǎn)最近的三角形區(qū)域的仿射變換矩陣來修正該像素點(diǎn)，從而完成對整張切片圖像的修正。

49、本技術(shù)方案中，通過采用更多的標(biāo)記點(diǎn)圈定更多的三角形區(qū)域，允許不同的三角形區(qū)域能夠應(yīng)用不同的仿射變換矩陣進(jìn)行修正，可以應(yīng)對組織變形更加復(fù)雜的變形情況，進(jìn)一步提高了修正的精度。

50、進(jìn)一步地，采用不同的劃分方式將所述多邊形區(qū)域劃分為多組三角形區(qū)域，獲取各組三角形區(qū)域的仿射變換矩陣組，采用仿射變換矩陣組修正切片圖像，獲取修正后的切片圖像上的修正組織輪廓線，基于修正組織輪廓線選擇仿射變換矩陣組。

51、本技術(shù)方案中，采用不同的方式來將多邊形區(qū)域劃分為若干三角形區(qū)域。例如，可以連接四邊形不同的兩條對角線，將四邊形劃分為第一組三角形區(qū)域和第二組三角形區(qū)域。之后，對第一組三角形區(qū)域中的兩個三角形區(qū)域分別計算仿射變換矩陣，應(yīng)用仿射變換矩陣處理切片圖像，得到第一種修正圖像；對第二組三角形區(qū)域中的兩個三角形區(qū)域分別計算仿射變換矩陣，應(yīng)用仿射變換矩陣處理切片圖像，得到第二種修正圖像。提取第一種、第二種修正圖像的修正組織輪廓線，將其與截面圖像的組織輪廓線進(jìn)行比對，將修正組織輪廓線的形狀更接近截面圖像的組織輪廓線的修正圖像作為修正后的切片圖像。通過采用不同的三角形區(qū)域劃分方式，并利用截面圖像的組織輪廓線進(jìn)行選擇，能夠進(jìn)一步提高切片圖像修正的精度。

52、本發(fā)明的另一個目的在于提供一種組織病理切片圖像的定位系統(tǒng)，該定位系統(tǒng)包括：

53、激光器，用于發(fā)射激光，在石蠟包塊的待切割的組織切片上形成至少三個標(biāo)記點(diǎn)，并記錄各標(biāo)記點(diǎn)的第一坐標(biāo)；

54、切片機(jī)，用于從石蠟包塊上切割得到帶有標(biāo)記點(diǎn)的組織切片；

55、病理掃描儀，用于采集帶有標(biāo)記點(diǎn)的組織切片的切片圖像；

56、圖像處理單元，獲取所述切片圖像中各標(biāo)記點(diǎn)的第二坐標(biāo)，比較所述第二坐標(biāo)和第一坐標(biāo)，基于比較結(jié)果定位所述切片圖像。

57、本發(fā)明與現(xiàn)有技術(shù)相比，具有如下的優(yōu)點(diǎn)和有益效果：

58、1、本發(fā)明利用激光直接在各組織切片上精確地?zé)g出若干標(biāo)記點(diǎn)，標(biāo)記的效率高、準(zhǔn)確度高；不同組織切片上的標(biāo)記點(diǎn)的第一坐標(biāo)共用相同的二維坐標(biāo)系，因此在切片圖像上識別出第二坐標(biāo)后，能夠通過比對第二坐標(biāo)與第一坐標(biāo)，使得切片圖像基于二維坐標(biāo)系旋轉(zhuǎn)、翻轉(zhuǎn)，從而定位至組織切片被切割前的位置，大幅地降低了累計誤差，提高了定位效率，有利于在組織切割時獲得大量的、更薄的組織病理切片，顯著地提高組織三維重建的準(zhǔn)確性。

59、2、本發(fā)明基于組織輪廓線選擇第一坐標(biāo)，能夠使所有標(biāo)記點(diǎn)位于組織切片上，克服了由于石蠟需要在采集切片圖像前熔化，而造成的部分形成于石蠟上的標(biāo)記點(diǎn)難以在切片圖像上采集的問題；

60、3、本發(fā)明通過將各標(biāo)記點(diǎn)構(gòu)成的多邊形的幾何中心設(shè)置在組織輪廓線的質(zhì)心附近，能夠使各標(biāo)記點(diǎn)均勻地分布在組織切片上，避免標(biāo)記點(diǎn)集中導(dǎo)致的組織切片局部損毀嚴(yán)重；

61、4、本發(fā)明基于前一片組織切片上的第一坐標(biāo)選擇后一片組織切片上的第一坐標(biāo)，確保了相鄰的兩片組織切片上的第一坐標(biāo)不重合，能夠有效地減小激光燒蝕到組織切片的癌變區(qū)域的幾率；

62、5、本發(fā)明基于第一坐標(biāo)和第二坐標(biāo)計算仿射變換矩陣，并利用仿射變換矩陣修正切片圖像，修正后的切片圖像的第三坐標(biāo)能夠更好地與第一坐標(biāo)進(jìn)行匹配，從而實(shí)現(xiàn)切片圖像的準(zhǔn)確定位；此外，基于第一坐標(biāo)修正的切片圖像能夠更好地還原組織切片被切割前的形態(tài)，有利于提高后續(xù)三維重建的質(zhì)量和準(zhǔn)確性；

63、6、本發(fā)明通過采用更多的標(biāo)記點(diǎn)圈定更多的三角形區(qū)域，允許不同的三角形區(qū)域能夠應(yīng)用不同的仿射變換矩陣進(jìn)行修正，可以應(yīng)對組織變形更加復(fù)雜的變形情況，進(jìn)一步提高了修正的精度。