胰腺癌相關(guān)癌基因突變信息收集分析系統(tǒng)及分析方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明屬于生物醫(yī)學領(lǐng)域，涉及一種胰腺癌相關(guān)癌基因突變信息收集分析系統(tǒng)及分析方法。
【背景技術(shù)】
[0002]胰腺癌為消化道常見腫瘤，早期診斷困難且預(yù)后極差，其侵襲性強，惡性度高，手術(shù)切除率低，五年生存率極低。其起病隱匿，缺乏典型臨床癥狀，，成為目前國內(nèi)外腫瘤專家的研究熱點，胰腺癌的早期診斷和早期治療是提高和改善胰腺癌預(yù)后的關(guān)鍵。
[0003]胰腺癌是一種基因變異性疾病，目前研究證明許多基因的突變與胰腺癌的發(fā)生發(fā)展有關(guān)，如KRAS、SMAD4、CDKN2A、TP53、ZIP4、PDX-1基因等，但是單獨的基因診斷或者少量的基因組合的診斷往往準確略不高，目前仍缺乏一種行之有效的胰腺癌診斷或預(yù)測方法。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0004]為了彌補現(xiàn)有技術(shù)的不足，本發(fā)明的目的在于提供一種胰腺癌相關(guān)癌基因突變的信息收集分析系統(tǒng)及分析方法，所述的信息收集系統(tǒng)整合了目前報道的胰腺癌相關(guān)癌基因的突變信息，能預(yù)測患者患胰腺癌的風險，為醫(yī)生提供診斷參考，從而實現(xiàn)早發(fā)現(xiàn)早治療，提高患者的生存率。
[0005]為了實現(xiàn)上述目的，本發(fā)明采用如下技術(shù)方案:
[0006]本發(fā)明提供了一種胰腺癌相關(guān)癌基因突變的信息收集分析系統(tǒng)，所述的信息收集分析系統(tǒng)包括:信息收集模塊1、用戶模塊2、數(shù)據(jù)庫模塊3、基因風險分析模塊4和報告輸出模塊5。
[0007]所述的信息收集模塊1包括數(shù)據(jù)庫端口子模塊11、數(shù)據(jù)檢索子模塊12、數(shù)據(jù)分析子模塊13、數(shù)據(jù)傳輸子模塊14、數(shù)據(jù)更新子模塊15。
[0008]所述的用戶模塊2為用戶所使用的界面，該界面實現(xiàn)用戶與系統(tǒng)的交互，并接受來自報告輸出模塊的結(jié)果。
[0009]所述的數(shù)據(jù)庫模塊3包括標準數(shù)據(jù)庫模塊31和待檢測數(shù)據(jù)庫模塊32。標準數(shù)據(jù)庫模塊31用來存儲已經(jīng)確診的胰腺癌的基因突變數(shù)據(jù)及來自各數(shù)據(jù)庫的胰腺癌的基因突變數(shù)據(jù)；待檢測數(shù)據(jù)庫子模塊32用來存儲未確診患者的基因檢驗數(shù)據(jù)；
[0010]所述的基因風險分析模塊4包括診斷規(guī)則模塊41、患病概率模塊42和報告生成子模塊43。
[0011]所述的報告輸出模塊5是用來存儲來自基因風險分析模塊4的數(shù)據(jù)并輸出到用戶豐旲塊2。
[0012]進一步，所述的數(shù)據(jù)庫端口子模塊11與各數(shù)據(jù)庫相連，所述的數(shù)據(jù)庫包括英文數(shù)據(jù)庫和中文數(shù)據(jù)庫。所述的英文數(shù)據(jù)庫包括NCB1、nature、science等，所述的中文數(shù)據(jù)庫包括萬方、知網(wǎng)等。
[0013]進一步，所述的數(shù)據(jù)更新子模塊15與數(shù)據(jù)檢索子模塊12相連，用于發(fā)出指令，開啟新一輪的信息收集任務(wù)。
[0014]進一步，所述的報告輸出模塊5包括健康綜合評估報告單元51和醫(yī)學建議報告單元52，用于存儲患者的健康綜合評估報告和醫(yī)學建議報告。
[0015]本發(fā)明提供了一種上述的信息收集分析系統(tǒng)收集分析胰腺癌相關(guān)癌基因突變的方法，所述的方法包括以下步驟:
[0016]1)所述信息收集模塊1收集信息，包括已經(jīng)確診的胰腺癌的基因突變數(shù)據(jù)及來自各數(shù)據(jù)庫的胰腺癌的基因突變數(shù)據(jù)；
[0017]2)所述用戶模塊2收集用戶相關(guān)信息，并上傳到所述信息收集模塊1 ;
[0018]3)將所述信息收集模塊1中的數(shù)據(jù)上傳到所述數(shù)據(jù)庫模塊3的相應(yīng)的標準數(shù)據(jù)庫子模塊31或待檢測數(shù)據(jù)庫子模塊32 ;
[0019]4)所述基因風險分析模塊4調(diào)取所述數(shù)據(jù)庫模塊3中的數(shù)據(jù)，并對待檢測數(shù)據(jù)進行胰腺癌風險評估；
[0020]5)將風險評估結(jié)果輸出到所述報告輸出模塊5 ;
[0021]6)將所述報告輸出模塊5中的報告反饋給用戶，使用戶知道患者患胰腺癌的概率，從而有所警覺，實現(xiàn)胰腺癌的早期治療。
[0022]上述步驟1)信息的收集包括以下步驟:
[0023]1)所述數(shù)據(jù)庫端口子模塊11連接各數(shù)據(jù)庫；
[0024]2)所述數(shù)據(jù)檢索子模塊12中設(shè)定關(guān)鍵詞，自動檢索各數(shù)據(jù)庫的相關(guān)信息；
[0025]3)所述數(shù)據(jù)分析子模塊13對步驟2)中的信息進一步提取，去除冗余的信息，將所需信息進行格式的統(tǒng)一；
[0026]4)所述數(shù)據(jù)傳輸子模塊14連接所述數(shù)據(jù)庫模塊3，將來自步驟3)的信息上傳到所述數(shù)據(jù)庫模塊3 ;
[0027]5)所述數(shù)據(jù)更新子模塊15定期發(fā)出指令，重復(fù)步驟1) -4)，以更新數(shù)據(jù)。
[0028]所述的用戶相關(guān)信息上傳到所述數(shù)據(jù)檢索子模塊12，然后進行數(shù)據(jù)分析及傳輸上傳到所述數(shù)據(jù)庫模塊3。如果相關(guān)信息來自已經(jīng)確診的胰腺癌患者則上傳到所述標準數(shù)據(jù)庫子模塊31，如果相關(guān)信息來自未診斷的患者則上傳到所述待檢測數(shù)據(jù)庫子模塊32。
[0029]上述的基因風險分析模塊4基因進行胰腺癌風險評估的具體步驟如下:
[0030]1)所述診斷規(guī)則子模塊41調(diào)取所述數(shù)據(jù)庫模塊3中的標準數(shù)據(jù)庫子模塊31中的數(shù)據(jù)進行分析，生成胰腺癌的診斷規(guī)則，作為診斷患者患胰腺癌風險的標準；
[0031]2)所述患病概率子模塊42調(diào)取所述數(shù)據(jù)庫模塊3中的待檢測數(shù)據(jù)庫子模塊32中的數(shù)據(jù)，以所述診斷規(guī)則子模塊41生成的診斷規(guī)則為標準分析患者患胰腺癌的概率；
[0032]3)所述報告生成子模塊43接受經(jīng)所述患病概率子模塊42分析的數(shù)據(jù)，生成健康綜合評估報告和/或醫(yī)學建議報告。
[0033]本發(fā)明的優(yōu)點和有益效果:
[0034]本發(fā)明中的胰腺癌相關(guān)癌基因突變信息的收集分析系統(tǒng)能自動更新數(shù)據(jù)庫，使得數(shù)據(jù)庫信息更全面，進而使得基因風險分析模塊的診斷規(guī)則更為優(yōu)化，從而提高胰腺癌風險評估的準確率。
[0035]本發(fā)明中的胰腺癌相關(guān)癌基因突變信息的收集分析系統(tǒng)綜合了已經(jīng)報道的與胰腺癌有關(guān)的基因突變的信息，能夠?qū)颊叩臋z查數(shù)據(jù)進行更全面的分析，提高診斷率。從而能實現(xiàn)胰腺癌的早期發(fā)現(xiàn)，進而進行早期治療，提高患者的生存率。
【附圖說明】
[0036]圖1顯示了胰腺癌相關(guān)癌基因突變信息的收集分析系統(tǒng)；
[0037]圖2顯示了信息收集模塊的結(jié)構(gòu)圖；
[0038]具體的實施方式
[0039]下面結(jié)合附圖和實施例對本發(fā)明作進一步詳細的說明，以下實施例僅用于說明本發(fā)明而不用于限制本發(fā)明的范圍。
[0040]實施例1 一種胰腺癌相關(guān)癌基因突變的信息收集分析系統(tǒng)
[0041]—種胰腺癌相關(guān)癌基因突變的信息收集分析系統(tǒng)，包括:信息收集模塊1、用戶模塊2、數(shù)據(jù)庫模塊3、基因風險分析模塊4和報告輸出模塊5。
[0042]信息收集模塊1包括數(shù)據(jù)庫端口子模塊11、數(shù)據(jù)檢索子模塊12、數(shù)據(jù)分析子模塊13、數(shù)據(jù)傳輸子模塊14、數(shù)據(jù)更新子模塊15。數(shù)據(jù)庫模塊3包括標準數(shù)據(jù)庫模塊31和待檢測數(shù)據(jù)庫模塊32。數(shù)據(jù)庫端口子模塊11與各數(shù)據(jù)庫相連，所述的數(shù)據(jù)庫包括英文數(shù)據(jù)庫和中文數(shù)據(jù)庫。其中，英文數(shù)據(jù)庫包括NCB1、nature、science等，中文數(shù)據(jù)庫包括萬方、知網(wǎng)等。數(shù)據(jù)檢索模塊12通過設(shè)定關(guān)鍵詞，自動檢索各數(shù)據(jù)庫的相關(guān)信息，數(shù)據(jù)分析模塊13分析來自數(shù)據(jù)檢索模塊12的數(shù)據(jù)，對數(shù)據(jù)進一步提取，去除冗余的數(shù)據(jù)，統(tǒng)一所需要的數(shù)據(jù)的格式，然后經(jīng)數(shù)據(jù)傳輸模塊14上傳到數(shù)據(jù)庫模塊3的標準數(shù)據(jù)庫模塊31。數(shù)據(jù)更新模塊15會定期發(fā)出指令，啟動數(shù)據(jù)檢索、分析的任務(wù)，以更新數(shù)據(jù)庫。
[0043]數(shù)據(jù)檢索模塊12還可以接受來自用戶模塊2的數(shù)據(jù)，通過設(shè)定的關(guān)鍵詞，檢索相關(guān)信息并上傳到數(shù)據(jù)分析模塊13進行進一步的分析加工，生成統(tǒng)一格式的數(shù)據(jù)經(jīng)數(shù)據(jù)傳輸模塊1